imtssa - Institut de Cancérologie et d'Immunologie de Marseille
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3 ème rencontres <strong>de</strong>s plateformes protéomiques<br />
Protéo-Paca<br />
25-26 septembre 2008<br />
I.M.T.S.S.A.<br />
<strong>Institut</strong> <strong>de</strong> Mé<strong>de</strong>cine Tropicale<br />
du Service <strong>de</strong> Santé <strong>de</strong>s Armées<br />
Parc du Pharo, <strong>Marseille</strong><br />
ALMERAS Lionel, PhD
Département d’Épidémiologie<br />
<strong>et</strong> <strong>de</strong> Santé Publique Sud<br />
-Surveillance épidémiologique<br />
-Veille sanitaire<br />
-Entomologie médicale<br />
Unités & thématiques <strong>de</strong> recherches:<br />
Unités <strong>de</strong> Recherche<br />
en Parasitologie:<br />
- URBEP<br />
- URPPP<br />
Unité <strong>de</strong> Recherche<br />
en Virologie<br />
-Diagnostic<br />
-Arbovirus<br />
-Pharmacocinétique d’antipaludiques<br />
-Marqueurs moléculaires du paludisme<br />
-Réponses immunes moustiques/Plasmodium<br />
Unité du<br />
Méningocoque:<br />
-Surveillance épidémiologique<br />
<strong>de</strong> méningites<br />
-Orientation <strong>de</strong>s programmes<br />
<strong>de</strong> vaccination<br />
Soutient <strong>de</strong>s forces lors d’OPEX (opérations extérieures en zones intertropicales )
Les vecteurs<br />
Anophèles gambiae<br />
funestus<br />
albimanus<br />
stephensi …<br />
Ae<strong>de</strong>s aegypti<br />
albopictus<br />
Culex pipiens …<br />
Les parasites/virus<br />
Paludisme<br />
(P. falciparum, P. ovale, P. vivax, P. malariae)<br />
Arbovirose<br />
(West Nile, SLEv, Chikungunya, …)<br />
Objectifs<br />
• I<strong>de</strong>ntification <strong>de</strong> marqueurs d’exposition<br />
• Conséquences d’un traitement / d’une infection<br />
• Mécanismes d’action <strong>de</strong> nouvelles molécules<br />
• Virulence <strong>de</strong> souches…
Differential Gel Analysis (DiGE)<br />
Fusaï T.<br />
Almeras L.<br />
Briolant S.<br />
Fontaine A.<br />
Boucomont E.<br />
Échantillons<br />
Plateforme protéomique<br />
Typhoon<br />
Decy<strong>de</strong>r v6.5 / SameSpot<br />
Chromatographie<br />
Akta FPLC<br />
Ettan 2D-LC<br />
Outils BioInformatiques<br />
Fractionnement<br />
Spectrométrie <strong>de</strong> Masse<br />
Trappe à ions<br />
MALDI-TOF<br />
Lafitte D.<br />
Villard C.<br />
Bougis P.<br />
Belghazi M.<br />
Pophilat M.<br />
Granjeau S.<br />
Fac. <strong>de</strong> Pharmacie<br />
Fac. Méd. Nord (CAPM)<br />
LC-Q-TOF<br />
MALDI-TOF/TOF<br />
DiGE<br />
BioInformatique<br />
Convention<br />
Convention<br />
Luminy (CIML)<br />
MALDI-TOF<br />
Trappe à ions<br />
Fourqu<strong>et</strong> P<br />
Au<strong>de</strong>bert S.<br />
Convention
•Electrophorèse 2D<br />
SDS-PAGE<br />
IEF<br />
pH range, format <strong>de</strong> gels<br />
•Marquage métabolique<br />
SDS-PAGE<br />
IEF<br />
M<strong>et</strong> –S 35<br />
•Système DIGE<br />
SDS-PAGE<br />
IEF<br />
1D – 2D<br />
•CyDye Immunoblotting<br />
α-Tubulin<br />
(FITC)<br />
α-Vimentin<br />
(Cy-2)<br />
α-Enolase<br />
(Cy-5)<br />
ECL-Plex<br />
•Outils BioInformatiques: Mascot Data Parser, MyDec<br />
(E. Boucomont, B. Laporte, S. Granjeau)<br />
•Immuno-proteomic<br />
IEF<br />
SDS-PAGE<br />
WB 2D<br />
•Analyses quantitatives<br />
basées sur la MS<br />
iTRAQ: coll. entre S.<br />
Briolant & M. Belghazi<br />
Atelier 2D-DIGE<br />
Coll. M. Pophilat<br />
2 sessions / an<br />
15-17/10/08
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