POS Ed 2006 (PDF 1004.1 kb) - Ixarm

ORIENTATIONS SCIENTIFIQUES
1 > Microbiologie, toxicologie
Les mécanismes physiopathologiques de beaucoup de toxiques (par extension, on y inclut les
toxiques industriels, les armes non létales), toxines ou agents infectieux viraux, bactériens ou
parasitaires du risque NRBC sont encore très mal connus. Il y a donc un fort besoin défense dans
cette discipline. En microbiologie, il est nécessaire pour la défense de soutenir une recherche sur
les mécanismes de la régulation des gènes des micro-organismes pathogènes, notamment ceux
impliqués dans la virulence, et sur les mécanismes contribuant à la mobilité de ses gènes. En
priorité, il est important de mieux connaître les mécanismes de pathogénicité, de toxinogenèse et
de résistance aux anti-infectieux des agents pathogènes. L'amélioration de la connaissance des
biofilms apporterait une aide à la décontamination des matériaux. En épidémiologie, la
modélisation mathématique de l'évolution de cas initiaux de maladies infectieuses ne permet des
prédictions que sur quelques agents. Il conviendrait de soutenir cet axe, en particulier pour valider
et affiner le choix et la pertinence des paramètres, ainsi que les modèles mathématiques
proposées, du fait de fortes attentes de la défense en matière d'alerte épidémiologique.
2 > Immunologie
Les mécanismes d'échappement au système immunitaire de micro-organismes tels que le parasite
Plasmodium falciparum, sont responsables de l'échec des candidats vaccins élaborés jusqu'à ce
jour. Ils restent encore très mal connus et sont à prendre en compte par la défense. La recherche
de moyens d'obtenir une immunostimulation (y compris en s’adressant aux cytokines), peu
développée à l'heure actuelle, est à promouvoir pour maintenir la capacité opérationnelle en
conditions de stress opérationnel. L'amélioration de l'efficacité et de l’innocuité des vaccins contre
des agents d'intérêt défense est à prendre en compte. Elle passe par la meilleure caractérisation
de la nature de la réponse immunitaire aux agents du risque biologique, et du type d'anticorps
suscités par l'agent.
3 > Génomique
La génomique intervient dans plusieurs sous-domaines clés de la biologie :
• Politique et Objectifs Scientifiques • DGA 2006
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Diagnostic et détection par biologie moléculaire.
Des avancées significatives sont attendues en ce qui concerne la génomique comparative de
souches et d'espèces. La génomique est actuellement tirée par le civil, mais la défense est un
utilisateur obligé et doit donc s'intéresser aux agents pathogènes et aux technologies innovantes
permettant la manipulation ou la synthèse d'agents infectieux. En effet, les défauts d'alerte (faux
positifs/faux négatifs) pourraient avoir des conséquences très importantes sur l'effet de panique,
l'incapacitation et les pertes humaines.
Pour la détection, il convient d'ajouter qu'à l'avenir la liste des agents infectieux potentiellement
détectables risque d'évoluer avec par exemple de nouveaux virus non listés habituellement dans les
armes biologiques (SARS, grippe aviaire...) ou des micro-organismes pathogènes totalement
nouveaux. Ceci met l'accent sur l'importance de développer des méthodes de détection non
spécifiques de 1 ère intention (spectrographie de masse...) permettant de définir à partir d'un bruit
de fond l'apparition de phénomènes insolites, orientant dans un 2 ème temps vers une détection
utilisant des techniques conventionnelles ou des techniques génomiques beaucoup plus spécifiques.
Ceci implique des avancées dans les techniques de séquençage, vers une amélioration notamment
de leur fiabilité et de leur coût afin d'avoir la possibilité de pouvoir comparer les génomes de
différentes souches d'une même espèce et des différentes espèces proches du pathogène
d'intérêt, et d'ainsi déterminer les séquences génomiques pertinentes comme sondes de
diagnostic, et de confirmer l'origine d'une souche. Augmenter la rapidité du séquençage
permettrait d'identifier plus rapidement un nouvel agent issu du génie génétique.
Recherche de nouvelles cibles thérapeutiques par la connaissance du génome de l'agent
pathogène (Cf. partie 4 du POS, § 4.4).