Journal N°21.indd - INRA Montpellier

n°21 /2012BrevetL’activité scientifiqueJulio E, Dorlhac de Borne F, Hermand V. 2012. Tobaccowith reduced cadmium contents. Brevet internationalWO/2012/041913ContratEquipe Adaptation des plantes aux métaux- Programme Blanc de l’ANRProjet : Analyses évolutive et fonctionnelle du rôle dela famille multigénique MTP1 dans l’acquisition de latolérance au zinc chez Arabidopsis halleri (EVOFUN)Responsable scientifique pour B&PMP : Pierre Berthomieu(partenariat avec GEPV – Villeneuve d’Ascq – UMR CNRS8198 – Pierre Saumitou-Laprade).Equipe Aquaporines- Contrat privé en partenariat avec SyngentaProjet : Regulation of aquaporins (and more specifi callyPIP2 ;1 from the model plant Arabidopsis thaliana) as acritical regulatory pathway of water transport in plants.(AQUAPARTNER)Responsable scientifi que pour B&PMP : ChristopheMaurelResponsable scientifi que pour Syngenta : RaymondeFonné-Pfi ster.Missions, Congrès & SéminairesPour toute information concernant cette rubrique, adressez-vousdirectement aux personnes citées.• Christophe Maurel à Pont-Royal (France) du 3 au 5avril a participé au «Plant genomics 2012». Christophe aprésenté un poster intitulé «Phosphorylation responsesof the Arabidopsis root to biotic, abiotic and nutritionalstimuli».• Geneviève Conéjéro du 23 au 25 avril 2012 a présentéles travaux du groupe de travail « Imagerie Fonctionnellede la Plante » du Groupe de Recherche 2588 lors duworkshop « Microscopie de La Plante » à l’Institut deBiologie Moléculaire des Plantes de Strasbourg.• Karl Ravet du 10 au 15 juin 2012 à SteamboatSprings dans le Colorado a été selectionné pour donnerune conférence intitulée «Iron and ROS control of theDownSTream mRNA decay pathway is essential for plantfi tness» à l’occasion de la FASEB sur le theme «SummerResearch Conference on Trace Elements in Biology andMedicine».• Geneviève Conéjéro du 13 juin au 15 juin 2012 aparticipé au séminaire 1 de la Commission Nationale desOutils Collectifs de l’INR (CNOC) à St Raphaël : Dispositifd’animation métier du réseau des plates-formes 2012-2013.• 16 th International Symposium on Iron Nutrition andInteractions in Plants à Amherst, Massachusetts, USA.Plusieurs membres de B&PMP ont participé du 17au 22 juin à ce congrès pour des conférences et uneprésentation de poster.Les communications :- Equipe Nutrition Minérale et Stress OxydatifJean-François Briat (chairman d’une session) a présentél’exposé introductif intitulé «Cellular iron homeostasis : anoverview».Marc Bournier «Molecular interaction of iron, phosphate,light and circadian clock signaling pathways on the ferritinAtFer1 gene promoter».- Equipe Transport et Signalisation du FerCathy Curie (conférencière invitée) «Playing Hide andSeek with Iron Pools».Louis Grillet (conférencier sélectionné) «Iron loading inthe seed : identifi catio of a new strategy of Fe acquisitionat the embryo surface».Poster :- Equipe Transport et Signalisation FerStéphane Mari «A new pool of iron in the nucleolus».• Christophe Maurel à Edmonton (Canada) du 25 au 27juin 2012, a été invité à donner une conférence intitulée«Molecular bases of hydraulic regulations in responseto hormonal and environmental stimuli» à l’occasion duCanadian Society of Plant Biologists Annual MeetingAquaporins.• Manuel Nieves-Cordones et Christelle Taochy à Hong-Kong du 24 au 29 juin 2012, ont été sélectionnéspour donner une conférence à l’occasion de la GordonResearch Conference «Salt & Water Stress in Plants».Manuel a donné la conférence intitulée “The C-linkerof Arabidopsis Shaker inward channels plays a crucialrole in both surface expression and channel activity”et Christelle la conférence intitulée «The ArabidopsisNO 3-effl ux transporter NAXT2 is involved in root-to-shootNO 3-translocation and contributes to plant tolerance tosalt stress». Manuel a aussi présenté un poster intitulé«Control of K + channel activity and transport in plants:the C-linker of Arabidopsis Shaker inward channels playsa crucial role in both surface expression and channelactivity».• Philippe Nacry à l’Université de Dundee en Ecosse,du 26 au 29 juin 2012, a été invité à donner uneconférence intitulée «Spatio-Temporal expression patternof NRT1.1 in lateral root development of Arabidopsisthaliana seedlings» à l’occasion des 8 th Symposium of theInternational Society of Root Research 2012.• Elza Ronzier à Manchester (UK), du 2 au 4 juillet, aprésenté un poster intitulé «Regulation by Calciumdependentprotein kinases of Skaker channels expressedin guard» lors du congré «29 th New Phytologist Symposium:Stomata».• Olivier Rodrigues à Grenoble, du 4 au 6 juillet 2012,a été sélectionné pour donner une conférence intituléeDirecteur de la publication : Alain GojonDirectrice la rédaction : Chantal Baracco - Courriel : baracco@supagro.inra.fr - Tél. : 0 499 613 138 - Fax : 0 467 525 737IBIP Bât 7, 2 place Pierre Viala - 34060 MONTPELLIER CEDEX 2http://www.montpellier.inra.fr/ibip/bpmp/Page 3

«Role and regulation of the AtPIP2;1 aquaporin duringABA induced-stomatal closure» à l’occasion du 7 èmeColloque Jeunes Chercheurs de la Société Française deBiologie Végétale.• Manuel Nieves-Cordones à South Hadley dans leMassachusetts, du 8 au 13 juillet 2012, a présenté unposter intitulé «Site-directed analyses of the C-linkerdomain of plant K + Shaker channels reveal structuralsimilarities with animal HCN channels and provide cluesabout the plant channel structure-function relationship»lors de la Gordon Research Conference «Ion Channels».• Victor Hermand à Austin au Texas, du 20 au 24 juillet2012, a participé au «Plant Biology 2012». Victor aprésenté un poster intitulé «Functional analysis of twoHeavy Metal ATPases (HMA) in tobacco».• Eléonor Bouguyon à l’Université de Freibourg(Allemagne), du 29 juillet au 3 août 2012, a participéau congrés FESPB «Plant biology Congress». Eléonora présenté un poster intitulé «The Nitrate TransceptorNRT1.1 Governs Two Distinct Signalling Pathways inArabidopsis thaliana».• Jean-François Briat a été invité à donner une conférenceintitulée «Arabidopsis ferritins as an integrative modellinking iron metabolism to light, clock and oxidativestress signaling» à Autrans du 19 au 21 septembre 2012,au Metal Homeostasis 5 th International Meeting of theInstitute of Metals in Biology of Grenoble (IMBG).• Ali Sassi à la Presqu’île de Giens, du 23 au 26 septembre2012, a présenté un poster intitulé «Plant adaptation tosalt stress: Functional characterisation and expressionregulation of a rice K + transporter» au 23 ème colloque«Canaux ioniques ».• Après une interview de Christophe Maurel 2 articlessont parus :- Dans la revue Biofutur de novembre 2012 : Luu D. T.,Maurel C. «La genèse des racines secondairesexpliquée».- Dans le journal l’Hérault du Jour du dimanche 23septembre «Remonter aux racines de la croissance».• Pierre Berthomieu a donné une conférence intitulée«Functional analysis of HMA genes in tobacco andproduction of low-cadmium tobacco lines» et ZaighamShahzad a présenté un poster intitulé «The metaltolerance protein 1 (MTP1) gene family in the zinc tolerantand hyper-accumlulating species Arabidopsis halleri:inference on potential use as a molecular target for cerealbiofortifi cation», à l’occasion du «3 rd annual workshop ofthe COST Action FA 0905» on «Mineral Improved CropProduction for Healthy Food and Feed» qui s’est tenu àLisbonne, du 14 au 15 octobre 2012.• Stéphane Mari a participé, le 17 octobre 2012, àla Journée Scientifi que de la Société de Biologie deMontpellier, et le 18 octobre 2012, au Colloque France-Brésil 2012 « Des recherches pour l’agronomie, labiodiversité et la santé » qui s’est tenu à Montpellier.Lors de ces journées Stéphane a donné une conférenceintitulée « Iron loading in the seed: identifi cation of thenew strategy of Fe acquisition at the embryo surface».• Philippe Nacry, du 25 au 26 octobre 2012 à AgropolisMontpellier, a été invité à donner une conférenceintitulée «The Arabidopsis NRT1.1 transporter actsas a nitrate sensor and governs root colonization viamodifi cation of local auxin concentration» lors des « 2 émejournées thématiques transversales » de l’UMR DIADE« Métabolisme, Environnement, Développement ».• Jean François Briat, à Montpellier du 15 au 16novembre 2012, a été invité à donner une conférenceintitulée : «Pourquoi et comment améliorer la nutritionen fer des plantes» lors des Rencontres 2012 du Pôle deCompétitivité Qualiméditerranée qui se sont tenues sur leCampus de Montpellier Supagro.• 3 ème journées scientifi ques et techniques du réseaudes microscopistes Inra : « De l’imagerie multiple àl’imagerie multimodale » du 28 au 30 novembre 2012 àMontpellier.Plusieurs membres de B&PMP ont participé à ce congrèspour des conférences et une présentation de poster :- Stéphane Mari a été invité à donner une conférenceintitulée « Identifi cation d’un nouveau pool de fer dans lenoyau de la cellule végétale par imagerie multiple ».- Guillhem Reyt a présenté un poster intitulé «Subcellularlocalization of ferritin mRNA in Arabidopsis thalianamutants impaired in mRNA decay».• Laurence Marquès a été invitée à donner uneconférence intitulée « les défensines de plantes de lafamille 1 confèrent une tolérance cellulaire au zinc »le 19 novembre 2012 aux « 4 ème journées du RéseauThématique Transversal Interactions Micro-organismesHôtes » à Montpellier.• Pierre Berthomieu a participé le 19 octobre 2012à la projection-débat sur les OGMs au Foyer rural deMontarnaud dans l’Hérault.• Kévin Garcia à Nancy, du 5 au 7 septembre 2012, aparticipé à la « 3 ème édition des Journées Francophonesdes Mycorhizes ». Kévin a donné une conférence intitulée« Localisation et analyse des systèmes de transportfongiques impliqués dans le transfert du potassium au seindu modèle ectomycorhizien Hebeloma cylindrosporum -Pinus pinaster ».• Pierre Berthomieu et Françoise Gosti à Lisbonne, du 14au 15 octobre 2012, ont participé au 3 rd annual workshopof the COST Action FA 0905 on «Mineral Improved CropProduction for Healthy Food and Feed». Pierre a donnéune conférence intitulée «Functional analysis of HMAgenes in tobacco and production of low-cadmium tobaccolines», Françoise a présenté un poster intitulé «Themetal tolerance protein 1 (MTP1) gene family in the zinctolerant and hyper-accumlulating species Arabidopsishalleri: inference on potential use as a molecular targetfor cereal biofortifi cation».• Hatem Rouached,à Mehdia en Tunisie du 19 au 22décembre 2012, a été invité à donner une conférenceintitulée «Regulation of phosphate starvation responses inplants: The emergence of a new signaling player»lors desJournées de l’Association Tunisienne de Biotechnologie.PublicationsBouguyon E., Gojon A., Nacry P. (2012) Nitrate sensingand signaling in plants. Seminars Cell Dev Biol. 23: 648-654.Galland M., Gamet L., Varoquaux F., Touraine B., Touraine B,Desbrosses G. (2012) The ethylene pathway contributesto root hair elongation induced by the benefi cial bacteriaPhyllobacterium brassicacearum STM196. Plant Sci.190: 74-81.Hacke U.G., Jacobsen A.L., Pratt R.B., Maurel C.,Lachenbruch B., Zwiazek J. (2012) New research onplant–water relations examines the molecular, structural,and physiological mechanisms of plant responses to theirenvironment. New Phytol. 196: 345-348.Le Journal de l’IBIP - n°21 / 2012Page 4

Krouk G., Gojon K. (2012) Améliorer l’utilisation du nitratepar les plantes. Biofutur. 330 : 41.Laohavisit A., Shang Z., Rubio L., Cuin T.A., Véry A.A.,Wang A., Mortimer J.C., Macpherson N., Coxon K.M.,Battey N.H., Brownlee C., O.K. P., Sentenac H., Shabala S.,Webb A.A.R., Davies J.M. (2012) Arabidopsis annexin1mediates the radical-activated plasma membrane Ca 2+ -and K + -permeable conductance in root cells. Plant Cell.24: 1522-1533.Martinière A., Li X., Runions J., Lin J., Maurel C., Luu D.T.(2012) Salt stress triggers enhanced cycling of Arabidopsisroot plasma-membrane aquaporins. Plant Signal Behav7: 529-532.Martinière A., Lavagi I., Nageswaran G., Rolfe D.J.,Maneta-Peyret L., Luu D.T., Botchway S.W., Webb S.E.D.,Mongrand S., Maurel C., Martin-Fernandez M.L., Kleine-Vehn J., Friml J., Moreau P., Runions J. (2012) Cell wallconstrains lateral diffusion of plant plasma-membraneproteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 109: 12805-12810.Oomen R.J.F.J., Benito B., Sentenac H., Rodríguez-Navarro A., Talón M., Véry A.-A., Domingo C. (2012)HKT2;2/1, a K + -permeable transporter identifi ed in a salttolerant rice cultivar through surveys of natural geneticpolymorphism. Plant J. 71: 750-762.Péret B., Li G., Zhao J., Band L.R., Voÿ U., Postaire O.,Luu D.T., Da Ines O., Casimiro I., Lucas M., Lazzerini L.,Nacry P., King J.R., Jensen O.E., Schaffner A.R., Maurel C.,Bennett M.J. (2012) Auxin regulates aquaporin functionto facilitate lateral root emergence. Nat Cell Biol. 14: 991-998.Sassi A., Mieulet D., Khan I., Moreau B., Gaillard I.,Sentenac H., Véry A.-A., 2012. The rice monovalent cationtransporter OsHKT2;4: revisited ionic selectivity. PlantPhysiol. 160: 498-510.Sivitz A., Hermand V., Curie C., Vert G. ArabidopsisbHLH100 and bHLH101 control iron homeostasis via aFIT-independent pathway. PLoS ONE. 7: e44843.OuvrageSergey Shabala and Tracey Ann Cuin (2012) PlantSalt Tolerance Methods and Protocols in Methods inMolecular Biology (Humana Press Eds). P.640. ISBN9781617799853.Chapitres d’ouvragesLuu D.T. , Maurel C. (2012) Dynamic behavior andinternalization of aquaporins at the surface of plant cells.In Endocytosis in Plants, pp. 185-199.Shabala S., Cuin T. A., Shabala L., Newman I. (2012)Quantifying Kinetics of Net Ion Fluxes from Plant Tissues byNon-invasive Microelectrode Measuring MIFE TechniqueIn Plant Salt Tolerance Methods and Protocols. 913: 119-134 (Chapter 7).B&PMP et la formationEcole thématique «MISTRAL»B&PMP a organisé, du 2 au 14 juillet 2012, la premièreédition de l’école thématique MISTRAL (MontpellierInternational School on ion and water TRAnsport inpLants), en direction des doctorants, post-doctorantset chercheurs intéressés par la biologie des transportsmembranaires chez les plantes. Dix-sept auditeurs dedifférentes origines (Italie, Allemagne, Chine, France,Autriche, Espagne, Japon et Suède: 5, 4, 2, 2, 1, 1, 1 et 1participants(es), respectivement), ont suivi cette premièresession. L’école a été préparée par un Comité Pédagogiquecomposé de Pierre Berthomieu, Alain Gojon, StéphaneMari, Christophe Maurel, Nadine Paris, Hervé Sentenac& Jean-Baptiste Thibaud, tous membres de B&PMP. Ellea été organisée avec le concours du Service « FormationPermanente » (Christophe Lebègue et Candie Lacroce) ducentre INRA et la Cité de SupAgro (Pascale Ramos). Lecomité d’organisation a été constitué de Alain Gojon etHervé Sentenac pour B&PMP, et Christophe Lebègue etCandi Lacroce pour le Service Formation Permanente.L’école s’est déroulée sur deux semaines.La première semaine a été consacrée à des enseignementsthéoriques dans le domaine de la Biologie destransports membranaires. Ces cours, préparés pour latrès grande majorité par des chercheurs de B&PMP, ontété donnés en anglais:- History of concepts and approaches in Plant Membranetransport and mineral nutrition,- Biophysics of ion diffusion in water and across amembrane- Biophysics of water transport-Tools and techniques used in electrophysiology- Heterologous expression systems- Cell imaging of transport proteins- Identifi cation of regulating partner proteins & interactionnetworks- Structure/function relationship of transport systems- Functional categories of membrane transport proteins- Genomics of plant membrane transport proteins- Dynamics of membrane transport proteins- Post-translational modifi cations- Symbiosis : Nutrient exchange and signaling in plantfungalinteractions- Long-distance transport in vascular tissues- Metal homeostasis and bio-remediation- Water transport : from aquaporins to whole planthydraulics- Guard cell movements: roles of ion transport systems- Roles of Ion transporters in signal propagation: calcium,pH and electrical activitiesLa deuxième semaine a été consacrée à des enseignementspratiques, sous la forme d’ateliers. Chaqueparticipant a pu choisir 2 « ateliers », de deux jours etdemi chacun, parmi 9 possibilités :- Molecular physiology and cell biology of iron acquisitionand localization in Arabidopsis thaliana- Heterologous expression and functional characterisationof ion transport systems in Xenopus oocytes (two-electodevoltage clamp or patch clamp)- Functional imaging and localisation of membraneproteins within the cell- Use of stable isotopes for functional studies of iontransport in plants- Mass spectrometry analysis of membrane proteins- Hydraulic conductivity of membranes, cells and organs- Identifi cation of proteins interacting with membraneLe Journal de l’IBIP - n°21 / 2012Page 5

transporters in yeast- Investigation of heavy metals transport using fl uorescentprobes in proteoliposomesTous ces ateliers ont été organisés par BPMP, dans seslaboratoires et plateformes.A l’issue de l’école, le service « Formation Permanente »a effectué « une enquête de satisfaction » en interrogeantde façon anonyme, avec un questionnaire très détaillé,chaque participant, de façon a bien préciser ce qu’avaitapporté l’école, par rapport aux demandes et souhaitsinitiaux.Financièrement, l’école a bénéfi cié du soutien de laFondation Agropolis International, dans le cadre du grandprogramme fédérateur «Rhyzopolis», du programmeEuropéen COST FA0905, du Département « BiologieVégétale » de l’INRA et de B&PMP.Devant le succès de cette école, B&PMP va préparer uneseconde session. En 2013 ou 2014 ? C’est en cours dediscussion...Les étudiants en stage à B&PMPStages de thèseSiwar Ben Amar en stage du 02/04/2012 au 30/06/2012dans l’équipe Canaux ioniques sous la responsabilitéd’Hervé Sentenac. Le sujet de thèse de Siwar porte surl’étude d’une famille de transport de K + et Na + de typeHKT impliqués dans la tolérance au stress salin chez leriz et le blé.Patricia Siso Terraza en stage du 02/04/2012 au30/06/2012 dans l’équipe Nutrition Minérale et StressOxydatif sous la responsabilité de Pierre Fourcroy. Lesujet de thèse de Patricia porte sur le rôle des composésphénoliques dans l’acquisition du fer par les racinesd’Arabidopsis.Aurélie Evrard en stage du 30/04/2012 au 23/06/2012dans l’équipe Canaux ioniques sous la responsabilitéd’Anne-Aliènor Véry. Le sujet de thèse d’Aurélie Evrards’intitule «Salinity tolerance at the cell type specifi c levelin Arabidopsis and rice».Muhammad Rizwan en stage du 23/04/2012 au18/05/2012 dans l’équipe Physiologie moléculaire dusoufre sous la responsabilité du Professeur Jean-ClaudeDavidian. Le sujet de thèse de Muhammad porte surl’analyse d’anions dans des échantillons de plants deblé.Sana Tounsi en stage du 07/05/2012 au 07/06/2012dans l’équipe Canaux ioniques sous la responsabilitéd’Hervé Sentenac. Le sujet de thèse de Sana porte sur lacaractérisation fonctionnelle des systèmes de transportmembranaire de potassium chez l’engrain.Mohamed Farissi en stage du 04/06/2012 au30/07/2012 dans l’équipe Canaux ioniques sous laresponsabilité d’Hervé Sentenac. Le sujet de thèse deMohamed porte sur l’étude des mécanismes de tolérancedes plantes au stress salin.Maryam Ben Chikha en stage du 17/09/2012 au17/11/2012 dans l’équipe Canaux ioniques sous laresponsabilité d’Hervé Sentenac. Le sujet de thèse deMaryam porte sur l’étude de l’expression génétique chezquelques écotypes d’orge.Minh Hoang Thi Than en stage du 10/12/2012 au30/09/2015 dans l’équipe Transport et Signalisation duFer sous la responsabilité de Stéphane Mari. Le sujet dethèse de Minh porte sur la caractérisation de nouveauxsystèmes de transport du fer.Mohamed Farissi en stage du 04/06/2012 au30/07/2012 dans l’équipe Canaux ioniques sous laresponsabilité d’Hervé Sentenac. Le sujet de thèse deMohamed porte sur l’étude des mécanismes de tolérancedes plantes au stress.Muhammad Rizwan en stage du 23/04/2012 au18/05/2012 dans l’équipe Physiologie moléculaire dusoufre sous la responsabilité du Professeur Jean-ClaudeDavidian. Le sujet de thèse de Muhammad porte surl’analyse d’anions dans des échantillons de plants deblé.Stages L3Witold Trinquier en stage du 26/03/2012 au 15/06/2012dans l’équipe Adaptation des plantes aux métaux. Witoldtravaille sur la tolérance au plomb chez Arabidopsisthaliana sous la responsabilité de Patrick Doumas.Anaïs Ducher en stage du 04/06/2012 au 26/07/2012dans l’équipe Canaux ioniques. Anaïs travaille sur lacaractérisation fonctionnelle de transporteurs HKT sousla responsabilité d’Anne-Aliénor Véry.Stages BAC Pro SENClément Monino en stage du 23/04/2012 au 18/05/2012dans l’équipe Services communs. Clément travaille sur lesystème électronique numérique sous la responsabilitéd’Henrique Afonso.ArrivéesLa vie dans B&PMP• Hatem Rouached, recruté lors du concours Chargé deRecherche de l’INRA, est arrivé dans l’Unité le 1 er juin2012. Hatem travaille sur l’interaction phosphate-zincdans l’équipe Adaptation des plantes aux métaux.• Cécile Abauzit est arrivée dans l’équipe Servicescommuns le 1 er septembre à B&PMP après avoir réussi leconcours externe INRA de TR en gestion administrative.Dans l’équipe Aquaporines :• Mikaël Lucas, chercheur postdoctoral (Contrat ANRHydroRoot) à partir du 02/04/2012• Zaigham Shazhad, chercheur postdoctoral (ContratANR HydroRoot) à partir du 8/05/2012• Jorge Bellatti, chercheur postdoctoral (Contrat INRAAquaPartner) à partir du 25/05/2012• Beatriz Sanchez-Romera, doctorante Université deGrenade (Espagne) du 02/09/2012 au 19/12/2012• Ayako Tsuchihira, post-doctorante à l’Université deNagoya (Japon) travaille sur le sujet «Mechanisms of rootwater transport» du 01/09/2012 au 27/11/2012• Hoang Thi Giang Chercheuse invitée du 26/10/2012au 18/12/2012• Galina Novikova, chercheuse invitée du 10/11/2012au 13/12/2012Dans l’équipe Canaux ioniques:• Khaled Masmoudi, Professeur invité du 10/09/2012au 31/10/2012• Damien Lightfoot assistant professeur du 26/11/2012au 23/12/2012Le Journal de l’IBIP - n°21 / 2012Page 6

Dans l’équipe Adaptation des plantes aux métaux• Iliana Ribeiro, CDD IE, du 01/10/2012 au 30/09/2013Dans l’équipe Intégration des fonctions nutritives dans laplante entière• Juliette Rochette CDD IE du 19/11/2012 au 18/04/2014Arrivée des titulaires au 1 er septembre 2012B&PMP accueille la nouvelle équipe de Pascal Genschik(DR CNRS) avec Nathalie Berger (Ingénieur d’Etude INRA)et Lien Bach (Maître de conférence UM2). Ester IzquierdoAlegre CR-INRA est arrivée dans l’équipe le 1 er décembre2012.Christian DUBOS (CR INRA) est arrivé dans l’équipeNutrition Minérale et Stress Oxydatif.Antoine Martin (CR CNRS) est arrivé dans l’équipeIntégration des fonctions nutritives dans la plante entière.Son travail de recherche porte sur la dynamique de lachromatine en réponse aux variations de l’environnementnutritionnel chez Arabidopsis.MobilitéDoan LUU est depuis le 3 mai 2012 au Laboratoiremixte international RICE (https://sites.google.com/site/lmiricevn/), dirigé par le Pr. Pascal Gantet. Ce laboratoireest basé à Hanoï (Vietnam) et a été fondé par desinstitutions françaises et vietnamiennes.Cette mobilité d’un an s’effectue dans le cadre du projetde recherche ORYZAQUA, fi nancé par une bourse «MarieCurie - International outgoing fellowship» qui comprenddeux phases successives et de même durée, au LMI-RICEet à B&PMP. Le sujet de ce projet porte sur la biologiecellulaire des aquaporines de riz sous stress salin ethydrique. A terme, l’équipe Aquaporines disposera d’unecollection de plants de riz exprimant des aquaporinesde riz étiquetées avec des protéines fl uorescentes, afi nd’en étudier leur trafi c endomembranaire sous des stressenvironnementaux. Cette analyse au niveau subcellulaires’effectuera en relation avec une analyse des propriétésde transport d’eau racinaire.Les événementsChangement de direction - NominationsA compter du 1 er avril 2012Alain Gojon est le nouveau directeur d’unité du laboratoireB&PMP.Christophe Maurel rejoint la direction comme nouveaudirecteur adjoint.Le personnel de B&PMP présente tous ses vœux deréussite à cette nouvelle équipe de direction.PromotionsNos félicitations à :- Cécile Abauzit qui a été reçue au concours TR INRA.- Chantal Baracco qui a été reçue au concours interne surplace de TR.- Sophie Gelin pour son avancement de Grade ATP1.- Hatem Rouached qui a été reçu au concours CR INRAUM2 B&PMP.Finaliste au Prix Georges Frêche - UniversitéSud de FranceDoan-Trung Luu a représenté l’Unité, mercredi 27 juin,en présentant son projet « Biologie cellulaire du transportd’eau chez le riz : étude du trafi c intracellulaire desAquaporines en réponse aux contraintes hydriques et desalinité». Il faisait partie des 6 fi nalistes du prix GeorgesFrêche - Université Sud de France. Le Prix de 3000€ a étéfi nalement décerné au Pôle de Chimie Balard.Soutenances de thèsesVictor Hermand. 2012. «Analyse fonctionnelle des HeavyMetal ATPases de Nicotiana tabacum».Thèse de Doctorat de l’Ecole Nationale SupérieureAgronomique de Montpellier. Directeur de thèse : PierreBerthomieu \ CoDirectrice de thèse Françoise Gosti.Thèse soutenue le 25 juin 2012.Marc Bournier. 2012. «Identifi cation d’acteurs moléculairesimpliqués dans la voie de signalisation de l’homéostasiedu fer chez A. thaliana».Thèse de Doctorat de l’Ecole Nationale SupérieureAgronomique de Montpellier. Directeur de thèse : FrédéricGaymard.Thèse soutenue le 17 décembre 2012.Louis Grillet. 2012. «Bases moléculaires de la circulationdu fer dans la plante».Thèse de Doctorat de l’Ecole Nationale Supérieure Agronomiquede Montpellier. Directeur de thèse : Stéphane Mari.Thèse soutenue le jeudi 13 décembre 2012.Florence Auguy. 2012. «Identifi cation de gènes impliquésdans la tolérance au plomb chez la brassicacéeHirschfeldia incana».Thèse de Doctorat Université Montpellier II. Directeur dethèse : Patrick Doumas.Thèse soutenue le 14 décembre 2012.Farrukh Azeem. 2012. «Les canaux potassiques de typeShaker: Régulation transcriptionnelle et rôle physiologiquein planta».Thèse de Doctorat de l’Ecole Nationale SupérieureAgronomique de Montpellier. Directrice de Thèse : IsabelleGaillard.Thèse soutenue le 20 décembre 2012.Christelle Taochy. 2012. «Transport membranaire de NO 3-sous contrainte saline : Rôle de NAXT2 dans la translocationdu nitrate vers les feuilles chez Arabidopsis».Thèse de Doctorat de l’Ecole Nationale SupérieureAgronomique de Montpellier. Co-Directeurs de thèse :Hervé Sentenac ; Thierry Simonneau. Encadrants : Jean-Christophe Boyer et Rémy Gibrat.Thèse soutenue le Vendredi 07 décembre 2012.Cécile Lefoulon. 2012. «Régulation des canauxpotassiques Shaker par différents partenaires protéiqueschez Arabidopsis thaliana : Rôle de la phophatase AtPP2CAet des transporteurs d’infl ux d’auxine AUX/LAX».Thèse de Doctorat de l’Ecole Nationale Supérieure Agronomiquede Montpellier. Directrice de thèse : Isabelle Chérel.Thèse soutenue le 20 décembre 2012.Aurélie Evrard. 2012. Analyses transcriptionnelles de latolérance à la salinite chez deux types cellulaires de laracine et chez 2 plantes modèles, Arabidopsis et riz».Titre anglais : «Cell type-specifi c transcriptional responsesof plants to salinity».Thèse de Doctorat Université Montpellier II. Co-Directeursde thèse Mark Tester et Hervé Sentenac.Thèse soutenue le 12 décembre 2012.Le Journal de l’IBIP - n°21 / 2012Page 7

n°21 /2012ContratL’activité scientifiqueLe contrat UE Water 4 Crops a été accepté. Le Lepse estpartenaire de ce projet qui fi nance une approche comparativeentre le maïs, le mil et le sorgho, en collaborationavec l’ICRISAT (centre international basé en Inde).Angélique Christophe (LEPSE, équipe ETAP) et Aurélie Métay(UMR SYSTEM) démarrent un projet incitatif fi nancépar Montpellier SupAgro pour une durée de 2 ans sur lacroissance et le rendement de la vigne en conditions destress azoté.Missions, Congrès & SéminairesPour toute information concernant cette rubrique, adressez-vousdirectement aux personnes citées.• Francois Tardieu a participé à la réunion ANR du GISBV dans le cadre du projet Dromadair les 3, 4 et 5 avril àPont Royal.• Justine Bresson (en 2 ème année de thèse dans l’équipeSPIC) a séjourné au MPI de Golm, en Allemagne du 17 avrilau 17 mai. Justine a réalisé des dosages de tréhalose afi nd’étudier le rôle de ce métabolite dans les interactionsplantes-bactéries en lien avec le stress hydrique.• François Tardieu a participé au congrès de EuropeanGeoscience Union à Vienne en Autriche, les 25, 26 et 27avril, avec présentation invitée intitulée «Has the geneticvariability in shoots any role for soil-plant-atmosphere modelsof water transfer ?».• François Tardieu a participé à une journée INRA – Académied’Agriculture sur la sélection génomique et aprésenté un exposé intitulé « Les plates-formes de phénotypage: prise en compte de l’interaction génotype xenvironnement en sélection génomique ».• Claude Welcker a été invité par l’ESALQ - Piracicaba(SP Brésil) dans le cadre de la collaboration initiée avecle séjour sabbatique au Lepse de R. Oliveira (Pr. physiologie)et de la thèse en cours de C Frois. A l’occasion de cevoyage au Brésil (7-11 mai) Claude a animé un séminairesur le phénotypage pour la tolérance à la sécheresse aucentre EMBRAPA d’amélioration du riz à Goiania (GO).• Eric Lebon a participé à la réunion GIS Vigne le 11 maià Bordeaux.• Le 11 juin, Bertrand Muller a présenté à la direction généralede l’INRA un exposé intitulé « Sécheresse et hautestempératures : quels effets sur le métabolisme carbonéet sur la croissance des plantes ? Quelles conséquencespour les formalismes des modèles ? ».Myriam Dauzat, Claude Welcker et Bertrand Muller ontparticipé au séminaire organisé par la CNOC à Fréjus du13 au 15 juin. La CNOC, Commission Nationale des OutilsCommuns, est un organisme de l’INRA qui coordonne lesappels d’offre équipement lourd et labélise des platesformesd’intérêt général.• Du 25 au 27 juin, Christian Fournier et Maryline Lièvre(en 1 ère année de thèse dans l’équipe SPIC) ont participéau séminaire annuel de l’équipe Virtual Plants organisé àSaint Martin de Londres, au titre de leurs collaborationsétroites avec cette équipe.• Du 26 au 29 juin, Bertrand Muller a participé au congrès«Roots to the future» à Dundee où il a donné deuxconférences intitulées (1) Exploring the intertwined geneticbases of root and shoot growth and their responsesto soil water defi cit, (2) Lateral root elongation : defi ninga framework for analysing the variability among growthpatterns and the possible roles of auxin and carbon.• L’équipe SPIC du LEPSE était fortement représentée àla 23 ème conférence internationale sur Arabidopsis thaliana(ICAR 2012) à Vienne en Autriche du 4 au 7 Juillet2012. Christine Granier a présenté un exposé intitulé :Taking full advantages of systematic phenotyping of leafgrowth in A. thaliana. Denis Vile, François Vasseur, MarylineLièvre ; Marie Bouteillé et Justine Bresson ont présentédes posters.• François Tardieu a donné une conférence invitée à laEuropean Society of Agronomy le 24 septembre avec letitre «Plant Phenotyping, a new fi eld and opportunity forcrop scientists».• François Tardieu a donné une conférence invitée àlaCrop Science Society of America (Cincinati, 22 Oct) avecle titre «Model assisted dissection of the genotype x environmentinteraction».• Bertrand Muller a représenté en septembre et octobrele campus INRA-Supagro au cours des ateliers «Donnerune nouvelle ambition pour la recherche» aux cours desassises territoriales de l’Enseignement Supérieur et de laRecherche.• L’unité a été représentée lors des journées Qualimed,(15-16 noembrev), notamment autour du projet Disp’eau,conduit par Eric Lebon.• Francois Tardieu a présenté le 7 décembre un exposéà la journée « gestion de masses de données », CNRS -INRIA, projet Mastodons «Data management in phenotyping».PublicationsBaerenfaller K, Massonnet C, Walsh S, Baginsky S, BühlmannP, Hennig L, Hirsch-Hoffmann M, Howell K A, KahlauS, Radziejwoski A, Russenberger D, Rutishauser D,Small I, Stekhoven D, Sulpice R, Svozil J, Wuyts N, StittM, Hilson P, Granier C, Wilhelm G. 2012. «Systems-basedanalysis of Arabidopsis leaf growth reveals adaptation toLe Journal de l’IBIP - n°21 / 2012Directrice la rédaction : Gaëlle Rolland - Courriel : rolland@supagro.inra.fr - Tél. : 0 499 612 636 - Fax : 0 467 522 116IBIP Bât 7, 2 place Pierre Viala - 34060 MONTPELLIER CEDEX 2http://www.montpellier.inra.fr/ibip/lepsePage 8

water defi cit» Molecular Systems Biology. 8: 606.Plant Cell & Environment 35: 1631-1646.Bonhomme L, Valot B, Tardieu F, Zivy M. 2012. PhosphoproteomeDynamics Upon Changes in Plant Water StatusReveal Early Events Associated With Rapid Growth Adjustmentin Maize Leaves. Molecular & Cellular Proteomics11: 957-972.Chapuis R, Delluc C, Debeuf R, Tardieu F, Welcker C. 2012.Resiliences to water defi cit in a phenotyping platform andin the fi eld: How related are they in maize? European Journalof Agronomy 42: 59-67.Marshall A, Aalen R, Audenaert D, Beeckman T, BroadleyMR, Butenkob MA, Caño-Delgado AI, de Vries S,Dresselhaus T, Felix G, Graham NS, Foulkes J, Granier C,Greb T, Grossniklaus U, Hammond JP, Heidstra R, HodgmanC, Hothorn M, Inzé D, Østergaard L, Russinova E, Simon R,Skirycz A, Stahl Y, Zipfel C & De Smet Y. 2012. Tacklingdrought stress: RECEPTOR-LIKE KINASES present newapproaches. Plant Cell 24: 2262-2278.Pantin F, Monnet F, Jannaud D, Costa JM, Renaud J,Muller B, Simonneau T, Genty B. 2012. The dual effect ofabscisic acid on stomata. New Phytologist 197: 65-72.Pantin F, Simonneau T, Muller B.2012. Coming of leaf age:control of growth by hydraulics and metabolics during leafontogeny. New Phytologist 196: 349–366.Parent B, Tardieu F. 2012. Temperature responses ofdevelopmental processes have not been affected bybreeding in different ecological areas for 17 crop species.New Phytologist 194: 760-774.Poorter H, Fiorani F, Stitt M, Schurr U, Finck A, Gibon Y,Usadel B, Munns R, Atkin OK, Tardieu F, Pons TL. 2012.The art of growing plants for experimental purposes: apractical guide for the plant biologist. Functional PlantBiology 39: 821-838.Prieto JA, Louarn G, Perez Pena J, Ojeda H, Simonneau T,Lebon E. 2012. A leaf gas exchange model that accountsfor intra-canopy variability by considering leaf nitrogencontent and local acclimation to radiation in grapevine(Vitis vinifera L.). Plant, Cell & Environment 35: 1313-28.Radanielson AM, Lecoeur J, Christophe A, Guilioni L.2012. Use of water extraction variability to screen forsunfl ower genotypes well adapted to soil water limitation.Functional Plant Biology 39: 999-1008.Rienth M, Dauzat M, Pellegrino A, Lopez G, Torregrosa L,Romieu C. 2012. First observations of the microvinedevelopment under 100% LED (light emitting diodes)illumination. Vitis: Journal of Grapevine Research 51:167-173.Tardieu F, Hammer G. 2012. Designing crops for newchallenges. European Journal of Agronomy 42: 1-2.Taylor JA, Acevedo-Opazo C, Pellegrino A, Ojeda H, TisseyreB. 2012. Can within-season grapevine predawn leaf waterpotentials be predicted from meteorological data in nonirrigatedmediterranean vineyards? Journal Internationaldes Sciences de la Vigne et du Vin 46 : 221-232.Vasseur F, Violle C, Enquist BJ, Granier C, Vile D. 2012. Acommon genetic basis to the origin of the leaf economicsspectrum and metabolic scaling allometry. EcologyLetters, 15: 1149-1157.Wuyts N, Massonnet C , Dauzat M, Granier C. 2012.Structural assessment of the impact of environmentalconstraints on Arabidopsis leaf growth: a 3D approach.ArrivéesLe Journal de l’IBIP - n°21 / 2012La vie du LEPSEErwan Suard a été accueilli dans l’équipe MAGE, en tantque MOO en appui technique au développement desplateformes de phénotypage jusqu’ à fi n juillet 2012.Son contrat a été reconduit en Septembre dans l’équipeSPIC jusqu’à fi n Juin 2013 dans le cadre du contratDURAVITIS.Guillaume Aillaud a été recruté en MOO puis CDD demai à août pour venir en appui aux expérimentations del’équipe ETAP.Sarah Nicollini a été recrutée en MOO pour deux moisdans l’équipe MAGE pour faire l’inventaire des matérielset petits équipements rassemblés sur les plates-formesPhenoArch et PhenoDyn. Elle est venu également enappui aux expérimentations conduites sur ces platesformes,encadrée par Llorenç Cabrera.Yvan Peirronnenche a été recruté en MOO en juin pourapporter son concours au suivi de culture, aux mesureset échantillonnage de tissus sur les expérimentationsdans PhenoArch, encadré par Olivier Turc et Vincent Oury.Son contrat a été reconduit de septembre à décembre.Rémi Pérard a été recruté en CDD pour venir en appui auxexpérimentations menées dans le cadre du projet EPPNlors de l’ouverture de la plate-forme PHENOPSIS. Il vientégaelment en appui aux mesures en analyses d’imagesde l’équipe SPIC. (de septembre 2012 à février 2013).Adel Méziane a été recruté en MOO pour venir en appuiaux expérimentations sur la plate-forme PhenoDyn etparticiper à la rédaction de protocoles d’expérimentationen plate-forme (EPPN) (de septembre 2012 à décembre2012).Antonin Grau a été recruté en CDD-IE à partir deseptembre 2012 et pour une durée d’un an, en appuiau pilotage de la plateforme de phénotypage PhénoArch,le développement d’applications pour les utilisateurs etl’encadrement des expérimentations.Johanna Molenaar a été accueillie dans l’équipe SPIC àpartir du 3 septembre 2012 pour une durée de 4 mois.Elle prépare une thèse au laboratoire de génétique del’Université de Wageningen encadrée par Joost Keurentjes.Son projet porte sur la variabilité naturelle de la réponseaux stress abiotiques chez A. thaliana (génétiqued’association). Elle a effectué 4 mois d’expérimentationssur la plate-forme PHENOPSIS en bénéfi ciant de l’appuitechnique de l’équipe SPIC. Cette ouverture de la plateformes’est réalisée dans le cadre du projet EPPN (http://www.plant-phenotyping-network.eu/).Le LEPSE et la formationFormation des étudiantsFaïza Cikilli, en formation Bac Professionnel secrétariat etcomptabilité, a effectué son stage du 21 mai au 29 juinsous la responsabilité de Marie Françoise Gouraud.Charlène Carayol étudiante à l’IUT en génie biologique(option agronomie) d’ Auch a rejoint l’équipe MAGE pourPage 9

3 mois à compter du 2 avril. Son stage porte sur le test denouvelles méthodes de phénotypage de la réponse desplantes au défi cit hydrique. Elle est encadrée par LlorençCabrera et Claude Welcker.Célia Pequignot a rejoint l’équipe MAGE d’avril àseptembre dans le cadre de son stage de Licence Pro enBiotechnologie (Amélioration Génétique des Plantes) àToulouse.Son sujet de stage porte sur la recherche d’événementsmoléculaires associés au maintien de la croissance desovaires et jeunes grains en situation de défi cit hydrique.Célia est encadrée par Vincent Oury et Olivier Turc.Cédric Ouvray, étudiant en Licence Pro BAEMOVA, à Angerseffectue son stage avec l’équipe ETAP d’avril à août. Cédrictravaille sur la population Syrah X Grenache (ANR VitSec)et la caractérisation des propriétés photosynthétiques. Ilest encadré par Angélique Christophe.Chloé Check, étudiante en L3 BFP, a effectué son stagesous la direction de Denis Vile, Fabrice Varoquaux (UM2)et Justine Bresson. Elle a étudié l’acquisition d’unetolérance à un stress hydrique sévère chez A. thalianasuite à l’inoculation par des rhizobactéries.Jose Ribeiro Da Silva Junior, étudiant en 2 ème année d’écoleingénieur à l’université fédérale rurale de Pernambuco(Brésil) fait un stage dans le cadre d’un échange Bafragridans l’équipe SPIC (15 juin – 15 septembre). Jose travaillesur les réponses de la photosynthèse et de la respirationde la microvigne à l’élévation de la T°C.Beatriz Moreno est arrivée au LEPSE dans l’équipe SPICfi n août 2012 pour travailler avec Bertrand Muller surla modélisation des cinétiques de croissance des racineslatérales chez Arabidopsis.Beatriz a fait un stage volontaire d’une durée de 4 mois(l’équivalent espagnol d’un M2).Aude Coupel-Ledru, diplômée de Montpellier SupAgro, adémarré une thèse sur le déterminisme de la transpirationchez la vigne au sein de l’équipe ETAP, en collaborationavec l’UMR AGAP.Landry Rossdeutsch a démarré une thèse à l’UMR EGFV(Bordeaux) sur le rôle du porte-greffe dans l’adaptationde la vigne à la sécheresse. Landry est co-encadrée parThierry Simonneau (co-fi nancement département EA-LEPSE/région Aquitaine-EGFV).Les événementsLes 3 plateaux de phénotypage du LEPSE (PHENODYN,PHENOARCH et PHENODYN) sont maintenant regroupésdans un ensemble commun baptisé M3P pour MontpellierPlant Phenotyping Platform. Le responsable en estBertrand Muller, assisté de Claude Welcker et ChristineGranier. Il est identifi é comme tel auprès de la CNOC(Commission Nationale des Outils Communs INRA), deIBISA et du projet Investissements d’Avenir PHENOME. Undes chantiers lancés maintenant concerne la certifi cationISO9001 de la plate-forme, chantier pris en charge parMyriam Dauzat et Stéphane Berthézène.Félicitations à Alexis Bédiée et Frédéric Bouvery qui onttous les deux intégrer l’INRA au 1 er Septembre 2012, suiteà leur réussite à des concours externes :Alexis Bédiée a réussi le concours externe ATA07 et estdonc recruté en tant qu’Adjoint Technique au LEPSE, dansl’équipe SPIC. Frédéric Bouvery a réussi le concours externeTRA05 et a donc rejoint l’Unité de Recherche Planteset Systèmes de Culture Horticoles à Avignon en tant queTechnicien de Recherche. Bravo à tous les deux !Félicitations à Stéphane Berthézène, Adjoint Techniquedans l’équipe MAGE depuis 2006, et qui a réussi le ConcoursInterne de Promotion sur Poste et est passé Techniciende Recherche. Bravo !VisitesJoos Keurentjes et Johanna Molenaar de l’Université deWageningen, Département Genetics and Plant Sciencesont visité le LEPSE le 26 avril pour préparer une demanded’accès à la plate-forme PHENOPSIS dans le cadre duprojet EPPN (European Plant Phenotyping Platform). Leurprojet ayant été retenu, Johanna viendra cet automnefaire une expérimentation dans PHENOPSIS.Guy Richard, Chef de Département Environnement etAgronomie a rendu visite au LEPSE le 29 mai. Etaient présentsAlain Gojon et Christophe Maurel, respectivementDU et DU adjoint de B&PMP, Bruno Blondin, DirecteurScientifi que de Supagro ainsi que Marc Voltz et PhilippeDebaecke, Chargés de Mission au département.Tout le personnel de l’unité a pu suivre et participer auxéchanges qui se sont organisés autour d’une présentationgénérale de l’unité, des présentations de chacunedes trois équipes et d’une visite des plateaux de phénotypage.Phil Benfey (Prof Biology Duke center for System BiologyUniversity) a visité le LEPSE le 21 mai pour des échangessur le phénotypage.Denis Dochain de l’Université de Louvain la Neuve estvenu visiter le LEPSE et les plateformes de phénotypage le7 Juin, suite à l’expérimentation menée dans PHENOPSIScet hiver par son étudiante en thèse, Heather MacLean.John Lunn (Max Planck Golm) a visité le LEPSE le 23 novembreet a échangé avec les chercheurs et Justine Bressondans le cadre de sa thèse.Plusieurs visites de la plate-forme de phénotypage ont eulieu, parmi lesquelles celle d’une délégation de l’INTA (29novembre) ainsi qu’une délégation chinoise autour duvice-ministre de l’agriculture (3 décembre).NaissancesMattis, fi ls de Vincent Nègre (IE LEPSE) est né le vendredi17 Août 2012 à Montpellier. Lui, ses parents et sa grandesœur se portent très bien même si quelques nuits sontencore diffi ciles.Mohamed Mahdid a soutenu sa thèse le 17 mai à l’Universitédes Sciences et de la Technologie Houari Boumédienneà Alger. Mohamed était co-encadré par le ProfesseurAbdelkrim Kameli de l’ENS Kouba à ALger et ThierrySimonneau au LEPSE et avait réalisé une partie des travauxde sa thèse au LEPSE sur la « Relation entre l’ajustementosmotique et la croissance chez quelques variétésde blé dur (Triticum durum L.) cultivées en Algérie ».Le Journal de l’IBIP - n°21 / 2012Page 10