Marie-Christine LE PASLIER - Inra

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Paired-ends HiSeq HiSeq MiSeqcluster/seq_versionAnalyse d’imagesIllumina-HiSeq 2000V1V3Lectures/run 1500 x 10 6 5 x 10 6Longueur de lecture 100 bases 100 bases 36 to 150 basesOutput/run ~200 Gb ~300 Gb 1 – 1,5 GbOutput/canal 25 Gb 35 Gb -Tps de run 11 jrs 11 jrs ~ 1 jrFlexibilitéExtrémités appariéesLectures appariéesMultiplexage/adressageAvantages /Inconvénients2*8 canaux200 à 5 kb24 tags TruSeq IlluminaProfondeur / assemblagePas defractionnementEvolutions96 tags Nextera IlluminaEPGV Unité 1279_GAP20
Roche-Genome Sequenceur (GS)technologie 454GS-FLX GS-FLX GS-JuniorSeq chimie LR70 Titanium XLR70 ? Titanium XLR70Lectures/run 400 x 10 3 1 x 10 6 1 x 10 6 90-100 x 10 3Longueur de lecture 250 bases 400 bases 600 bases 400 basesBases/run 100 Mb 400-600 Mb 35-40 MbTps de run(simple lecture)FlexibilitéExtrémités appariéesLectures appariéesMultiplexage/adressageAvantages /InconvénientsEvolutions7,5 h 10 h 10 h2-4-8-16 fractionnements(avec réduction nb lectures liée au masque)3kb, 8 kb, 20 kb12 MIDs = tags/régionLongueur / Homopolymèreslecture à 5001000 basesautomatisation des étapes de préparationPas defractionnementEPGV Unité 1279_GAP21
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Page 11 and 12: • cf. présentation A.Berard (Amp
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Page 17 and 18: NGSde nombreuses applications• qu
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Page 23 and 24: GAHiSeqEPGV Unité 1279_GAP23
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Page 27 and 28: Illumina sequencing : ADN dataEPGV
Page 29 and 30: PerspectivesE P G VEtude du Polymor
Page 31 and 32: De nouveaux formats surdes technolo
Page 33 and 34: De nouvelles technologies associée
Page 35 and 36: Multiple Shotgun Genotyping (MSG)EP
Page 37: Merci de votre attentiondiscussion

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