Analyse de données GBS - Inra

Reads -> Tags -> Aligned Tags-> SNPs/INDELs•Identification et comptages des Tags à partir des reads.•Regroupements des tags et du comptage dans un seul fichier « tag count».•A cet étape il est possible d’exclure les tags avec de faible effectifs… erreurde séquencage.Tag 1n=5Tag 2n=3Tag 3n=1CAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGCGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCGTGTAGACGGGCCAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGCGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCGTGTAGACGGGCCAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGCGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCGTGTAGACGGGCCAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGCGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCGTGTAGACGGGCCAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGCGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCGTGTAGACGGGCCAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGGGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCGTGTAGACGGGCCAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGGGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCGTGTAGACGGGCCAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGGGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCGTGTAGACGGGCCAGCAAAAAAAAAAAAGAGGGATGGGGCGGCTTGCGTGCATGGGACACAAGCATGTAGACGGGC…………………………………