Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
vizsgálati módszerré vált, és így elınyeit nem szabad figyelmen kívül hagyni. Ezek az<br />
elınyök a következık:<br />
- Rendkívül gyors, vagyis beállított, mőködı rendszerek mellett a minta-elıkészítés, a<br />
tényleges vizsgálat és a vizualizáció folyamata néhány órán belül eredményt ad. A<br />
módszertıl függıen a diagnosztikában elsıdleges „igen - nem” (fertızött - nem fertızött)<br />
válasz mellett a vizsgálat bizonyos kórokozók esetében még tipizálásra is képes.<br />
- Mindemellett érzékeny is, hiszen akár már 5-10 kópiát is képes kimutatni a keresett<br />
nukleinsavból. Tisztában kell lennünk emellett azzal is, hogy ez az érzékenység még hátrányt<br />
is jelenthet a pozitív eredmény megállapítása és a tényleges kórkép kialakulása közötti<br />
összefüggés mérlegelésekor. Ugyanis gyakran a PCR pozitivitás nem jelenti egyértelmően a<br />
tünetek kialakulásával kísért megbetegedés megjelenését, mivel ez utalhat akár rövid idıvel a<br />
mintavétel elıtt végzett állatorvosi preventív tevékenységre (vakcinázásra) is.<br />
A primertervezés, a PCR vizsgálatok, a klónozás és a többi molekuláris biológiai<br />
módszer, valamint az elımunkálatok és eredményértékelés elvégzéséhez egyre jobb<br />
szoftverek, vegyszerek, sıt kitek kaphatók megkönnyítve ezzel a kutató és a diagnoszta<br />
munkáját, nem is említve az interneten fellelhetı hatalmas adatmennyiséget.<br />
A feladat elvégzéséhez a kórokozó - szerencsés esetben a génbankban rendelkezésre<br />
álló - szekvenciája alapján olyan genomszakaszt kell keresni, amely specifikus a kórokozóra,<br />
ugyanakkor nincs jelen az adott állatfaj genomjában. A választás során mindenképpen<br />
figyelembe kell venni, hogy a kiválasztott szekvencia megfelelı konzervativitással<br />
rendelkezzen, hogy az esetleges mutációk ellenére az adott kórokozó genotípusainak széles<br />
skáláját ki tudja mutatni. Mindezek a munkálatok fıként irodalomkutatásra és számítógépes<br />
összehasonlító vizsgálatokra alapozódnak. Majd sor kerül a primerek szintetizáltatására és az<br />
optimális reakciókörülmények kidolgozására. A pozitív kontroll minta többféle módon<br />
elıállítható: természetes esetbıl, ha a kiválasztott régióból származó termék szekvenálásával<br />
igazolást nyer a genom nagymértékő hasonlósága vagy egyezése, a referencia törzs<br />
felhasználásával, illetve pl. szövettenyészeten izolált vírus pozitív kontrollként való<br />
alkalmazásával. A pozitív PCR termékeket agaróz-gél elektroforézissel mutatjuk ki. A pozitív<br />
kontrollal azonos mérettartományban futó DNS darabkákat például szekvenálással lehet<br />
félreérthetetlenül azonosítani a téves diagnózis elkerülése érdekében.<br />
A PCR alapú diagnosztikai módszerek felhasználását baromfiállományokban a kedvezı<br />
költség/haszon-elemzés is támogatja. Bár a polimeráz láncreakció kivitelezése fejlett<br />
10