17.08.2013 Views

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

Mándoki - Állatorvostudományi Doktori Iskola - Szent István ...

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

vizsgálati módszerré vált, és így elınyeit nem szabad figyelmen kívül hagyni. Ezek az<br />

elınyök a következık:<br />

- Rendkívül gyors, vagyis beállított, mőködı rendszerek mellett a minta-elıkészítés, a<br />

tényleges vizsgálat és a vizualizáció folyamata néhány órán belül eredményt ad. A<br />

módszertıl függıen a diagnosztikában elsıdleges „igen - nem” (fertızött - nem fertızött)<br />

válasz mellett a vizsgálat bizonyos kórokozók esetében még tipizálásra is képes.<br />

- Mindemellett érzékeny is, hiszen akár már 5-10 kópiát is képes kimutatni a keresett<br />

nukleinsavból. Tisztában kell lennünk emellett azzal is, hogy ez az érzékenység még hátrányt<br />

is jelenthet a pozitív eredmény megállapítása és a tényleges kórkép kialakulása közötti<br />

összefüggés mérlegelésekor. Ugyanis gyakran a PCR pozitivitás nem jelenti egyértelmően a<br />

tünetek kialakulásával kísért megbetegedés megjelenését, mivel ez utalhat akár rövid idıvel a<br />

mintavétel elıtt végzett állatorvosi preventív tevékenységre (vakcinázásra) is.<br />

A primertervezés, a PCR vizsgálatok, a klónozás és a többi molekuláris biológiai<br />

módszer, valamint az elımunkálatok és eredményértékelés elvégzéséhez egyre jobb<br />

szoftverek, vegyszerek, sıt kitek kaphatók megkönnyítve ezzel a kutató és a diagnoszta<br />

munkáját, nem is említve az interneten fellelhetı hatalmas adatmennyiséget.<br />

A feladat elvégzéséhez a kórokozó - szerencsés esetben a génbankban rendelkezésre<br />

álló - szekvenciája alapján olyan genomszakaszt kell keresni, amely specifikus a kórokozóra,<br />

ugyanakkor nincs jelen az adott állatfaj genomjában. A választás során mindenképpen<br />

figyelembe kell venni, hogy a kiválasztott szekvencia megfelelı konzervativitással<br />

rendelkezzen, hogy az esetleges mutációk ellenére az adott kórokozó genotípusainak széles<br />

skáláját ki tudja mutatni. Mindezek a munkálatok fıként irodalomkutatásra és számítógépes<br />

összehasonlító vizsgálatokra alapozódnak. Majd sor kerül a primerek szintetizáltatására és az<br />

optimális reakciókörülmények kidolgozására. A pozitív kontroll minta többféle módon<br />

elıállítható: természetes esetbıl, ha a kiválasztott régióból származó termék szekvenálásával<br />

igazolást nyer a genom nagymértékő hasonlósága vagy egyezése, a referencia törzs<br />

felhasználásával, illetve pl. szövettenyészeten izolált vírus pozitív kontrollként való<br />

alkalmazásával. A pozitív PCR termékeket agaróz-gél elektroforézissel mutatjuk ki. A pozitív<br />

kontrollal azonos mérettartományban futó DNS darabkákat például szekvenálással lehet<br />

félreérthetetlenül azonosítani a téves diagnózis elkerülése érdekében.<br />

A PCR alapú diagnosztikai módszerek felhasználását baromfiállományokban a kedvezı<br />

költség/haszon-elemzés is támogatja. Bár a polimeráz láncreakció kivitelezése fejlett<br />

10

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!