Penelitian Bioteknologi dan Marka Molekuler untuk ... - Hortikultura

Contoh Output Genome Sequencer+C@CFFFFFGHHHHJIJJCAAHFGAD@HWI-ST429:142:817WRABXX:5:1101:12596:7058 1:N:0:GTACAGTAAAAATGCGCGCCTTGTTTATTAAAGCCAAAATTTGCGATATGCAATATTTTCATTCTAAACTCTATAATTCCATCAATTCTGGAGATGAACT+@@@FFFEDHHHHFIIJ8@FFHIHEHGIJGIIIICGHGJEHJIGGHHG@BFGEAE@EECCEEHEFHHEDDDCEBC@ADDECEDC@@@ACDC@CBCDCC:>>@HWI-ST429:142:817WRABXX:5:1101:13146:7087 1:N:0:ACTCACACTTCTTCCAGCGTTATTATCATTAATTGGTAAACGAATATTAAAAAAGAATCAAGTAGCACATACGCCAGCAAAGGCATGGCGTACATTTGC+CCCFFFFFHHHHDIGFGGIIIJJHIIIIJIJJIIIEFHFEBHIEGIIIBHHCF@C?39?AAACCCD?@HWI-ST429:142:817WRABXX:5:1101:17766:7104 1:N:0:CGAAAGTACCAGTATAATCCTCTAATTTATGAGAAGGTGTAGTTCCTTTAATTTGTTCTGGAATGGATTCAGTTGCTTCTTTTATCATTTCCTTCATTTTT• Output di atas adalah data mentah 3 fragmen DNAukuran 100 basa dari mesin HiSeq 2000• Mesin HiSeq 2000 di BB Biogen kini menghasilkan 3milyar fragmen seperti di atas setiap kali dijalankan• Milyaran fragmen ini kemudian harus disusun ulangmenjadi genom utuh, berdasarkan overlap kesamaanurutan basa masing-masing fragmen