cache
cache
cache
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
สําหรับเชื้อ<br />
R. solanacearum มีรายงานการใชเทคนิค restriction fragment length<br />
polymorphism (RFLP) ในการศึกษาวิวัฒนาการและวิเคราะหความสัมพันธทางพันธุกรรมของเชื้อ<br />
R. solanacearum โดยใชดีเอ็นเอตัวตรวจที่มีความจําเพาะตอยีนที่เกี่ยวของกับความรุนแรงและการ<br />
ตอบสนองแบบเฉียบพลัน (virulence and the hypersensitive response) พบวาสามารถแบงเชื้อออก<br />
เปน 2 ดิวิชั่น<br />
(division) ตามแหลงที่มาคือ<br />
division I Asiaticum ประกอบดวยไบโอวาร 3, 4 และ 5<br />
ซึ่งพบในแถบทวีปเอเชีย<br />
และ division II Americanum ประกอบดวยเชื้อไบโอวาร<br />
1, 2 และ N2 ซึ่ง<br />
พบในแถบทวีปอเมริกา (Cook et al., 1989; Cook and Sequeira, 1994) ตอมามีการศึกษาโดยใชขอ<br />
มูลลําดับเบสของยีน 16S rRNA ในการจัดกลุม<br />
พบวาใหผลสอดคลองกับการจัดแบงกลุมของ<br />
Cook<br />
et al. (1989) (Li et al., 1993; Seal et al., 1993; Tagavi et al., 1996) นอกจากนี้ยังมีรายงานการออก<br />
แบบไพรเมอร (primer) จากลําดับเบสของยีนตางๆ เพื่อใชในการวิเคราะหความสัมพันธทาง<br />
พันธุกรรมของเชื้อ<br />
R. solanacearum เชน ไพรเมอรที่ออกแบบจากลําดับเบสที่อยูระหวางยีน<br />
(intergenic spacer region; ITS) 16S rRNA และ 23S rRNA ลําดับเบสของยีนโพลีกาแลคตูโรเนส<br />
(polygalacturonase) และเอ็นโดกลูคาเนส (endoglucanase) พบวาสามารถจัดแบงเชื้อออกเปน<br />
2<br />
ดิวิชั่น<br />
เชนเดียวกับ Cook et al. (1989) และแบงเปนดิวิชั่นยอย<br />
(subdivision) ที่ประกอบดวยเชื้อ<br />
R. solanacearum สายพันธุจากประเทศอินโดนีเซีย<br />
(Gillings and Fahy, 1993; Fegan et al., 1998)<br />
การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ<br />
R. solanacearum สายพันธุจากประเทศ<br />
แถบแอฟริกา อเมริกา และเอเชีย ดวยเทคนิค AFLP และ PCR-RFLP โดยใชไพรเมอรที่ออกแบบ<br />
จากลําดับเบสของยีน hrp ของ Poussier et al. (1999, 2000) ยืนยันผลการจัดแบงกลุมของ<br />
Cook et<br />
al. (1989) ซึ่งแบงเชื้อออกเปน<br />
2 ดิวิชั่น<br />
และในการทดลองนี้สามารถจัดเชื้อไบโอวาร<br />
1 สายพันธุ<br />
จากแอฟริการวมอยูในดิวิชั่น<br />
Asiaticum ดังนั้นเชื้อสายพันธุจากแอฟริกานาจะมีการแยกสาย<br />
วิวัฒนาการมาจากเชื้อไบโอวาร<br />
1 อื่นๆ<br />
ซึ่งมีสายพันธุดั้งเดิมมาจากอเมริกา<br />
รายงานการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ<br />
R. solanacearum race 1 ใน<br />
ไตหวัน โดย Jaunet and Wang (1999) ใชเทคนิค rep-PCR และ random amplified polymorphic<br />
DNA (RAPD) จัดกลุมเชื้อได<br />
14 และ 13 กลุม<br />
ตามลําดับ การจัดกลุมเชื้อไมมีความสัมพันธกับ<br />
ไบโอวาร แหลงที่มา<br />
และ aggressiveness ในป 2001 Lee et al. ใชเทคนิค RFLP ศึกษาความหลาก<br />
หลายทางพันธุกรรมของเชื้อ<br />
โดยใช insertion sequence เปนตัวตรวจ พบวา R. solanacearum<br />
race 1 ในไตหวันมีความผันแปรทางพันธุกรรมสูง<br />
13