31.07.2013 Views

cache

cache

cache

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

สําหรับเชื้อ<br />

R. solanacearum มีรายงานการใชเทคนิค restriction fragment length<br />

polymorphism (RFLP) ในการศึกษาวิวัฒนาการและวิเคราะหความสัมพันธทางพันธุกรรมของเชื้อ<br />

R. solanacearum โดยใชดีเอ็นเอตัวตรวจที่มีความจําเพาะตอยีนที่เกี่ยวของกับความรุนแรงและการ<br />

ตอบสนองแบบเฉียบพลัน (virulence and the hypersensitive response) พบวาสามารถแบงเชื้อออก<br />

เปน 2 ดิวิชั่น<br />

(division) ตามแหลงที่มาคือ<br />

division I Asiaticum ประกอบดวยไบโอวาร 3, 4 และ 5<br />

ซึ่งพบในแถบทวีปเอเชีย<br />

และ division II Americanum ประกอบดวยเชื้อไบโอวาร<br />

1, 2 และ N2 ซึ่ง<br />

พบในแถบทวีปอเมริกา (Cook et al., 1989; Cook and Sequeira, 1994) ตอมามีการศึกษาโดยใชขอ<br />

มูลลําดับเบสของยีน 16S rRNA ในการจัดกลุม<br />

พบวาใหผลสอดคลองกับการจัดแบงกลุมของ<br />

Cook<br />

et al. (1989) (Li et al., 1993; Seal et al., 1993; Tagavi et al., 1996) นอกจากนี้ยังมีรายงานการออก<br />

แบบไพรเมอร (primer) จากลําดับเบสของยีนตางๆ เพื่อใชในการวิเคราะหความสัมพันธทาง<br />

พันธุกรรมของเชื้อ<br />

R. solanacearum เชน ไพรเมอรที่ออกแบบจากลําดับเบสที่อยูระหวางยีน<br />

(intergenic spacer region; ITS) 16S rRNA และ 23S rRNA ลําดับเบสของยีนโพลีกาแลคตูโรเนส<br />

(polygalacturonase) และเอ็นโดกลูคาเนส (endoglucanase) พบวาสามารถจัดแบงเชื้อออกเปน<br />

2<br />

ดิวิชั่น<br />

เชนเดียวกับ Cook et al. (1989) และแบงเปนดิวิชั่นยอย<br />

(subdivision) ที่ประกอบดวยเชื้อ<br />

R. solanacearum สายพันธุจากประเทศอินโดนีเซีย<br />

(Gillings and Fahy, 1993; Fegan et al., 1998)<br />

การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ<br />

R. solanacearum สายพันธุจากประเทศ<br />

แถบแอฟริกา อเมริกา และเอเชีย ดวยเทคนิค AFLP และ PCR-RFLP โดยใชไพรเมอรที่ออกแบบ<br />

จากลําดับเบสของยีน hrp ของ Poussier et al. (1999, 2000) ยืนยันผลการจัดแบงกลุมของ<br />

Cook et<br />

al. (1989) ซึ่งแบงเชื้อออกเปน<br />

2 ดิวิชั่น<br />

และในการทดลองนี้สามารถจัดเชื้อไบโอวาร<br />

1 สายพันธุ<br />

จากแอฟริการวมอยูในดิวิชั่น<br />

Asiaticum ดังนั้นเชื้อสายพันธุจากแอฟริกานาจะมีการแยกสาย<br />

วิวัฒนาการมาจากเชื้อไบโอวาร<br />

1 อื่นๆ<br />

ซึ่งมีสายพันธุดั้งเดิมมาจากอเมริกา<br />

รายงานการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ<br />

R. solanacearum race 1 ใน<br />

ไตหวัน โดย Jaunet and Wang (1999) ใชเทคนิค rep-PCR และ random amplified polymorphic<br />

DNA (RAPD) จัดกลุมเชื้อได<br />

14 และ 13 กลุม<br />

ตามลําดับ การจัดกลุมเชื้อไมมีความสัมพันธกับ<br />

ไบโอวาร แหลงที่มา<br />

และ aggressiveness ในป 2001 Lee et al. ใชเทคนิค RFLP ศึกษาความหลาก<br />

หลายทางพันธุกรรมของเชื้อ<br />

โดยใช insertion sequence เปนตัวตรวจ พบวา R. solanacearum<br />

race 1 ในไตหวันมีความผันแปรทางพันธุกรรมสูง<br />

13

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!