METINIS PRANEÅ IMAS 2008 - Biotechnologijos institutas

Metinis pranešimas – 20086. Konferencijos, seminarai, vizitai6.1. Dalyvavimas konferencijose, simpoziumuose, parodose užInstituto ribų 456.2. Vizitai į užsienio institucijas 526.3. Bendrainstitutiniai seminarai 536.4. Instituto svečių paskaitos 536.5. Svečių vizitai 547. Laboratorijų veikla7.1. Baltymų – nukleorūgščių sąveikos tyrimo laboratorija (BNSTL) 567.2. DNR modifikacijos tyrimų laboratorija (DMTL) 577.3. Prokariotų genų inžinerijos laboratorija (PGIL) 597.4. Eukariotų genų inžinerijos laboratorija (EGIL) 607.5. Biotermodinamikos ir vaistų tyrimo laboratorija (BVTL) 637.6. Imunologijos ir ląstelės biologijos laboratorija (ILBL) 657.7. Bioinformatikos laboratorija (BI) 688. Finansai 698.1. Pajamos 698.2. Išlaidos 708.3. Sąmatos įvykdymas 738.4. Laboratorijų iniciatyvinės lėšos 749. Ūkinė veikla9.1. Aptarnaujančios tarnybos 759.2. Ūkinės sutartys 769.3. Pagrindiniai ūkiniai darbai 76© Biotechnologijos institutas 3

Metinis pranešimas – 20081. STATUSAS, STRUKTŪRA, ADMINISTRAVIMAS1.1. StatusasLR Vyriausybės 1997 m. gruodžio 31 d. nutarimu Nr. 1501 Biotechnologijos institutuipratęstas valstybinio mokslo instituto statusas, nenurodant pratęsimo terminų. LR Vyriausybė,svarstydama klausimą „Dėl valstybinių mokslo ir studijų institucijų sistemos restruktūrizavimoplano“, 2001 m. spalio 1 d. protokoliniu nutarimu Nr. 45 nusprendė: „... nereorganizuoti šiųvalstybinių mokslo institutų: ... 2. Biotechnologijos instituto ...“. Tai reiškia, kad Institutas irtoliau išlaiko valstybinio mokslo instituto statusą.1.2. StruktūraInstituto struktūra pateikta lentelėje 1.1.EilNr.Direktorius prof.Direktoriaus pavaduotojasMokslo sekretorius.Vyr. buhalterėPersonalo vadovėPirkimų vadybininkasProjektų vadovėSekretorėLaboratorijaInstituto taryba1. AdministracijaK. SasnauskasL. PašakarnisJ. MakariūnaitėO. ŠiurkutėJ. ŽiūkaitėL. KanapienisG. ŠipailaitėR. Pranskūnienė, O. Mejerytė2. Mokslo darbuotojaiSutrumpintaspavadinimasKrypties vadovai – prof. habil. dr. S. Klimašauskas ir prof. dr. V. Šikšnys1. Baltymų-nukleorūgščių sąveikos tyrimųlaboratorijaBNSTLVedėjasLentelė 1.1.prof. dr. V. Šikšnys2. DNR modifikacijos tyrimų laboratorija DMTL prof. habil. dr.S. Klimašauskas3. Prokariotų genų inžinerijos laboratorija,instituto tarybos 2008-04-09 sprendimu,panaikinta nuo 2008-05-01PGILdr. K. Stankevičius© Biotechnologijos institutas 4

Metinis pranešimas – 2008Krypties vadovas – dr. G. Žvirblis.4. Eukariotų genų inžinerijos laboratorija EGIL dr. G. ŽvirblisKrypties vadovas – prof. habil. dr. K. Sasnauskas5. Biotermodinamikos ir vaistų tyrimų laboratorija BVTL dr. D. Matulis6. Imunologijos ir ląstelės biologijos laboratorija ILBL dr. A. Žvirblienė7. Bioinformatikos laboratorija BL dr. Č. Venclovas3. Aptarnaujančios tarnybos3.1 Buhalterija D. Noreikienė3.2 Info. sistemos K. Žvaigždinas3.3 Biblioteka R. Misiūnienė3.4 Technikos tarnyba J. Potecki3.5 Transporto ūkis V. Kosevičius3.6 Kitos tarnybos -1.3. ValdymasPagal Instituto Statutą, patvirtintą LR Vyriausybės 2003 m. gegužės 27 d. nutarimuNr. 669 “Dėl valstybės mokslo institutų statutų patvirtinimo”, aukščiausias Instituto savivaldosorganas yra 5 metams sudaryta taryba iš 12 narių. Instituto mokslininkai slaptu balsavimu renka7 tarybos narius, Švietimo ir mokslo ministerija skiria 4 tarybos narius. Instituto direktorius yratarybos narys pagal pareigas.2008 m. gegužės 22 d. Instituto mokslininkų susirinkime slaptu balsavimu buvo išrinktišie Instituto tarybos nariai:1. dr. S. Gražulis2. prof. habil. dr. S. Klimašauskas (2008-09-10 išrinktas Tarybos pirmininkopavaduotoju)3. dr. D. Matulis4. prof. dr. V. Šikšnys (2008-09-10 išrinktas Tarybos pirmininku)5. dr. Č. Venclovas6. dr. A. Žvirblienė7. dr. G. ŽvirblisLR Švietimo ir mokslo ministro 2008 m. rugpjūčio 29 d. įsakymu Nr. ISAK-2469 paskirtišie tarybos nariai:© Biotechnologijos institutas 5

Metinis pranešimas – 20081. prof. habil. dr. V. Butkus (UAB Fermentas valdybos pirmininkas)2. L. Domarkienė (ŠMM ministerijos sekretorė)3. dr. G. Valinčius (Biochemijos instituto vyresnysis mokslo darbuotojas)4. dr. S. Grigiškis (UAB Biocentras direktorius)Instituto direktorius prof. Kęstutis Sasnauskas yra Tarybos narys pagal pareigas.Naujos sudėties Instituto taryba 2008 m. rugsėjo 10 d. įvykusio tarybos posėdžio metupirmininku (slaptas balsavimas) išrinko prof. dr. V. Šikšnį, o tarybos pirmininko pavaduotoju(atviras balsavimas) - prof. S. Klimašauską.Tarybos sekretoriaus funkcijas vykdo Instituto mokslo sekretorė dr. J. Makariūnaitė.Administracija:Direktorius- K. SasnauskasDirektoriaus pav. plėtrai- L. PašakarnisMokslo sekretorė- J. MakariūnaitėVyriaus. buhalterė- O. ŠiurkutėPersonalo vadovė- J. ŽiūkaitėProjektų vadybininkė- G. ŠipalaitėPirkimų vadybininkė- L. KanapieniusSekretorė - R. Pranskūnienė nuo 2007-10-30- O. Mejerytė nuo 2008-05-14Profsąjungos pirmininkėProfsąjungos pirmininkės pavaduotoja- R. Rekešienė(profsąjungoje 2 darbuotojai)- R. Jonaitytė© Biotechnologijos institutas 6

Metinis pranešimas – 20082. PERSONALAS2.1. Darbuotojų skaičiaus kitimasInstituto darbuotojų skaičiaus kitimas parodytas lentelėje 2.1.Darbuotojų grupė1. Mokslo darbuotojai*,plius laborantai (įskaitantstudentus - laborantus)2. AptarnaujančiostarnybosLentelė 2.1.2008.VII 2007.VII Skirtumas 08-07Iš viso Fakt.** Iš viso Fakt.** Iš viso Fakt.**105,75 101,75 105 102 +0,75 -0,2535,5 35,5 34,5 34,5 +1 +13. Administracija 9 9 8 8 +1 +1Iš viso 150,25 146,25 147,5 144,5 +2,75 +1,75Mokslininkų***skaičius 46 42 37 33 +9 +9*Mokslo darbuotojai – darbuotojai, užimantys pareigas, nurodytas lentelėje 2.4.**Fakt.: faktiškai dirbančiųjų skaičius, t.y. neįskaitant išvykusių į ilgalaikes stažuotes iresančių ilgalaikėse atostogose.***Mokslininkai - darbuotojai, turintys mokslinius laipsnius (dr., habil. dr.).Lentelėje 2.2. pateiktas laboratorijų darbuotojų dalies kitimas per penkerius metus.Lentelė 2.2.MetaiDarbuotojųskaičius (fakt.)Laboratorijų darbuotojųdalis, % (fakt.)2000 105 62,92001 107,5 63,72002 115,25 64,42003 110,75 62,12004 111,0 63,22005 118,0175 64,62006 123 69,12007 144,5 70,62008 146,25 69,62.2. Mokslinių laboratorijų personalasMokslo darbuotojų skaičius laboratorijose 2008 m. pateiktas lentelėse 2.3 ir 2.4.© Biotechnologijos institutas 7

Metinis pranešimas – 2008Mokslinių laboratorijų įvairių kategorijų darbuotojų skaičiusLentelė 2.3.LaboratorijaMokslodarbuotojų*Faktiškai dirbančiųIš visofaktiškaidirbančiųBioinžinieriųLaborantųStudentųlaborantųIlgalaikėsestažuot.IlgalaikėseatostogoseMokslo darbuotojaiBNSTL 18,5 16 - 1 3 x 0,5 - -DMTL 17 14 1 1 2 x 0,5 2 -EGIL 26,75 18,25 1 1,75 10 x 0,51x 0,75BVTL 22,0 16,5 11 x 0,5- 11 8 x 0,5 - 1ILBL 11,5 8 1 0,5 2 x 0,5 - -BL 6 4 1 - 2 x 0,5 - -Iš viso: 101,75 76,75 5,5 5,25 14,25 2 2*Žr. pastabą prie lentelės 2.1.Lentelė 2.4.Mokslinių laboratorijų faktiškai dirbančių mokslo darbuotojų statuso detalizavimasIšvisoVyriaus.m. d.Vyresn.m. d.Pagal pareigasMokslodarb.Jaun. m.darb.LaboratojaDoktorantaiStažuotojaiPagal mokslolaipsnįhabil.dr.hab.proc.BNSTL 16 1 2 4 4 5 - 1 7DMTL 14 1 1 4 3 5 - 1 5EGIL 18,25 2 4,25 3 6 3 - 1 1 10BVTL 16,5 1 2,5 5 6 2 1 11ILBL 8 1 1 2 2 2 - - 1 4BL 4 1 2 - - 1 - - 3Iš viso 76,75 7 12,75 18 21 18 3 3 40dr.© Biotechnologijos institutas 8

Metinis pranešimas – 2008Institutui, kaip ir visam Lietuvos mokslui, yra svarbus mokslinio personalo atjauninimas.Lentelėje 2.5 pateikti duomenys apie 2008 m. dirbusių mokslo darbuotojų amžių.Lentelė 2.5.LaboratorijaMokslo darbuotojųamžiaus vidurkis, m.Mokslo darbuotojų iki35 m. dalis, %Priimta jaunų mokslodarbuotojų2008 2007 2008 2007 2008 20071. BNSTL 33,5 35,7 78,5 62,5 2 -2. DMTL 32,1 33,5 75 62,5 - 13. EGIL 35,7 37,3 56,2 41,6 1 44. PGIL - 36,7 - 50 - 15. BVTL 38,1 42,6 62,5 40 1 -6. ILBL 40,4 41,5 40 33,3 1 17. BL 38,5 37,7 50 50 - -Institutas 36,4 37,6 60,4 48,5 5 7Iš pateiktų duomenų matyti, jog Institutas yra jaunas kolektyvas - mokslinio personalo(įskaitant doktorantus) amžiaus vidurkis nesiekia 40 metų.2.3. DoktorantūraLR Vyriausybės 2003 liepos 15 d. nutarimu Nr. 926 Biotechnologijos institutui kartu suVilniaus universitetu suteikta doktorantūros teisė biochemijos krypties (04 P) mokslo šakose:P 310 baltymai, enzimologija;P 320 nukleino rūgštys, baltymų sintezė.Tuo pačiu nutarimu Biotechnologijos institutui kartu su Vilniaus Gedimino technikosuniversitetu suteikta doktorantūros teisė chemijos inžinerijos mokslo krypties (05 T) mokslošakoje:T 490 biotechnologija.Instituto doktorantūroje 2008 m. studijavo 15 doktorantų; iš jų 3 doktorantai 2008 užbaigėdoktorantūros studijas. Nuo 2008-10-01 priimti 6 nauji doktorantai (lentelė 2.6.).Lentelė 2.6.Eil.Nr.LaboratorijaDoktorantai, doktorantūroslaikotarpisMokslošakaVadovasPastabos1. R. Sukackaitė,2004-10-01–2008-10-01P 310V. Šikšnys2. D. Golovenko,2004-10-01–2008-10-01P 310S. Gražulis© Biotechnologijos institutas 9

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.LaboratorijaDoktorantai, doktorantūroslaikotarpis3. BNSTL N. Laurikietytė,2005-10-01–2009-10-014. G. Gasiūnas,2007-09-17-2011-09-175. A. Baranauskas,2008-10-01-2012-10-016. S. Palikša,2008-10-01-2012-10-017.8.M. Gudeliauskaitė,2006-09-01-2010-09-019. Z. Liutkevičiūtė,2007-09-17-2011-09-1710. T. Radzvilavičius,2007-09-17-2011-09-1711. E. Kulberkytė,2008-10-01-2012-10-0112.DMTLS. Jachimovičiūtė,2008-10-01-2012-10-0113. M. Juozapaitis,2004-10-01–2008-10-0114. E. Aleksaitė,2005-10-01–2009-10-0115.EGILE. Čiplys,2007-09-17-2011-09-1716.R. Vorobjovienė,2008-10-01-2012-10-01MokslošakaP 310VadovasV. ŠikšnysPastabosP 310 V. Šikšnys G. SasnauskaskonsultantasP 310P 310P 320P 320P 320P 320P 320P 320P 320P 310P 320G. SasnauskasG. SasnauskasS. KlimašauskasS. KlimašauskasS. KlimašauskasS. KlimašauskasG. VilkaitisK. SasnauskasA. GedvilaitėK. SasnauskasA. Ražanskienė17. BVTL L. Baranauskienė,2006-09-01–2010-09-0118. E. Kazlauskas,2007-09-17-2011-09-1719. E. Kučinskaitė,2005-10-01–2009-10-0120. I. Vainikonytė-Pečiulienė,ILBL2005-10-01–2009-10-0121.M. Laime,2008-10-01-2012-10-0122. BL J. Višinskienė,2007-09-17-2011-09-17P 320P 310T 490T 490P 310P 310D. MatulisG. DienysA. ŽvirblienėD. MatulisA. ŽvirblienėČ. Venclovas© Biotechnologijos institutas 10

Metinis pranešimas – 20082.4. Stažuotės užsienyjeDalis mokslo darbuotojų 2008 m. buvo stažuotėse užsienio laboratorijose. Duomenys apieužsienio stažuotes pateikti lentelėje 2.7.Lentelė 2.7.Eil.Nr.LaboratorijaPareigos, v., pavardė1. vyresnysis mokslodarbuotojasG. Sasnauskas2. mokslo darbuotojasM. ZarembaBNSTL3.mokslo darbuotojaG. Tamulaitienė4. doktorantėE. Kulberkytė5.DMTLdoktorantėM. Gudeliauskaitė6. doktorantėE. Aleksaitė7.8.EGILILBLdoktorantasM. JuozapaitisdoktorantėI. PečiulienėStažuotės vieta, trukmėLaser Centre Vrije Universiteit, Amsterdam,Olandija,2008.11.03-15EMBL Hinxton, EMBO kursai"Computational Aspects of the ProteinTarget Selection, Protein ProductionManagement and Structure AnalysisPipeline“, Cambridge, Didžioji Britanija,2008.09.21-28Life and Health Sciences Research Institute(ICVS),University of Minho, Braga, Portugalija,2008.09.08-13Université Paul Sabatier, Laboratoire deMicrobiologie et de Génétique Moléculaire,Toulouse, Prancūzija,2008.11.03-262008.05.24-06.24Friedrich-Loeffler-Institute, Boddenblick 5a,D-17493 Greifswald - Insel Riems,Vokietija,2008.11.16-12.31Dept. of Virology, University of Freiburg,Freiburg, Vokietija,2008.05.24-06.24Karolinska Institute, Nobel MedicineInstitute, Stockholm, Švedija,2008.04.09-06.09© Biotechnologijos institutas 11

Metinis pranešimas – 20082.5. Personalo sveikatingumo rodikliaiInstituto medicinos punktas pagal Sveikatos apsaugos ministerijos patvirtintą tarptautinęligų klasifikaciją vykdo laikinojo nedarbingumo priežasčių apskaitą (žr. lentelę 2.8.). Lentelėjepateikti pastarųjų 5 metų duomenys.Lentelė 2.8.Rodiklis 2008 2007 2006 2005 20041. Nedarbingumo dėl ligų irtraumų atvejų skaičius100-ui darbuotojų22,3 27,0 19,4 22,1 18,42. Nedarbo dėl ligų ir traumųkalendorinių dienų skaičius100-ui darbuotojų375,9 419,6 299,3 395,7 225,42008 m. nedarbingumo atvejų dėl darbuotojų ligų ir traumų sumažėjo 17,4%, onedarbingumo kalendorinių dienų skaičius sumažėjo 10,4%.© Biotechnologijos institutas 12

Metinis pranešimas – 20083. MOKSLINĖ VEIKLA3.1. Biudžeto tiesiogiai finansuojami moksliniai tyrimai2008 m. iš valstybės biudžeto finansuojami moksliniai tyrimai Biotechnologijos institutebuvo tęsiami pagal LR Vyriausybės 1998 m. liepos 2 d. nutarimu Nr. 825 (nauja nutarimoredakcija 2002 m. liepos 10 d. nutarimas Nr. 1102) patvirtintas veiklos kryptis:I kryptis: Įvairios paskirties rekombinantinių baltymų cheminiai, biologiniai irtechnologiniai tyrimai. Vadovas prof. habil. dr. K. Sasnauskas.II kryptis: Genų veiklos tyrimai mielėse. Vadovas dr. G. ŽvirblisIII kryptis: Restrikcijos ir modifikacijos reiškinio molekuliniai genetiniai tyrimai.Vadovai: prof. habil. dr. S. Klimašauskas ir prof. dr. V. Šikšnys.2008 m. buvo vykdoma 11 mokslinių projektų (lentelė 3.1.).Lentelė 3.1.ProjektoNr.KryptisPavadinimasProjekto vadovas (-ai)1/08 I Monokloninių ir rekombinantinių antikūnų kūrimas A. Žvirblienė2/08 I HIF-3α/IPAS pre-iRNR splaisingas reguliacija A. Kanopka3/08 I Tuberkuliozės molekulinės epidemiologijos tyrimai. P. Stakėnas4/08 I Aktyvių junginių paieška biotermodinaminiaismetodais5/08 II Chimerinių ir natyvių virusinių baltymų sintezėmielėse ir jų panaudojimas6/08 II DNR metiltransferazių struktūriniai funkciniaityrimai (tęsiamas)D. MatulisK. SasnauskasS. Klimašauskas7/08 III Restrikcijos endonukleazių mechanizmai V. Šikšnys8/08 III Restrikcijos endonukleazių erdvinės struktūrostyrimas9/08 III IIB tipo restrikcijos endonukleazės AloI polipeptidų,specifiškai sąveikaujančių su DNR taikiniu,identifikavimas10/08 III MbiI restrikcijos endonukleazės struktūrinėsfunkcinėsorganizacijos tyrimas (iki 2008-06-30)11/08 III Restrikcijos-modifikacijos sistemų komponentųstruktūriniai, evoliuciniai ir funkciniai tyrimai.V. ŠikšnysR. ŠapranauskasK. StankevičiusČ. Venclovas© Biotechnologijos institutas 13

Metinis pranešimas – 20083.2. LVMSF subsidijuojami projektaiLietuvos valstybinis mokslo ir studijų fondas (LVMSF) 2008 m. finansavo šiuosBiotechnologijos instituto darbuotojų pateiktus mokslinių tyrimų projektus:Aukštųjų technologijų plėtros programos projektai1. sutartis B-36/2008 : „Humanizuotų mielių raiškos sistemos kūrimas, panaudojantproteomikos ir genų inžinerijos metodus (Mielių humanizacija)“, vadovas prof. habil. dr.Kęstutis Sasnauskas, EGIL. Lėšos 240,0 tūkst. Lt.Pramoninės biotechnologijos projektai2. sutarties Nr. N-03/07 pakeitimo sutartis Nr. N-03/08: „Naujų biokuro komponentų paieška irantrosios kartos biodegalų gamybos technologiniai tyrimai“, vadovė dr. B. Surinėnaitė,BVTL. Lėšos 98,0 tūkst. Lt.3. sutarties Nr. N-05/07 pakeitimo sutartis Nr. N-05/08: „Prolonguoto veikimo terapinėspaskirties rekombinantinių baltymų technologijų kūrimas“, vadovas dr. G. Žvirblis, EGIL.Lėšos 310,0 tūkst. Lt.4. sutarties Nr. N-06/07 pakeitimo sutartis Nr. N-06/08: „Junginių, specifiškai slopinančiųžmogaus karboanhidrazes, paieška biotechnologiniais metodais“, vadovas dr. D. Matulis,BVTL. Lėšos 280,0 tūkst. Lt.5. sutarties Nr.N-08/07 pakeitimo sutartis Nr. N-08/2008: „Metagenominiai Lietuvos karštųpožeminių vandenų ekstremofilų virusų tyrimai naujų fermentų paieškai“, vadovėdr. A. Gedvilaitė, EGIL. Lėšos 135,0 tūkst. Lt.6. sutarties Nr. N-15/07 pakeitimo sutartis Nr. N-15/08: „Viroidų ir fitoplazmų detekcija irpašalinimas iš biotechnologijos pramonei vertingų augalų“, vadovas dr. R. Abraitis, EGIL.Lėšos 90,0 tūkst. Lt.7. sutartis N-17/2008: „Terapinės ir diagnostinės paskirties baltymų (antikūnų),neutralizuojančių bakterinius citolizinus, technologijos kūrimas“, vadovė dr. E. Mištinienė,EGIL. Lėšos 300,0 tūkst. Lt.Prioritetinių Lietuvos mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros krypčių programosprojektai8. sutartis C-01/08-2: „Fago T4 replisomos struktūriniai ir funkciniai tyrimai (REPLISOMA)“,vadovas prof. dr. V. Šikšnys, BNSTL. Lėšos 220,0 tūkst. Lt.Projektai pagal inicijuojamų mokslo programų kryptį:9. Sutarties Nr. P-03/07 pakeitimo sutartis P-03/08:„Nauji fermentai ir technologijos epigenomoanalizei“, vadovas prof. habil. dr. S. Klimašauskas, DMTL. Lėšos 301,0 tūkst. Lt.Mokslininkų grupių projektai:10. sutartis Nr. T–17/08: „Fosfolipazių D superšeimos fermentų katalizės mechanizmo tyrimas“,vadovas dr. G. Sasnauskas, BNSTL. Lėšos 40,0 tūkst. Lt.11. sutartis Nr. T-24/08 : „Kryptinga restrikcijos endonukleazės Eco31I evoliucija“, vadovas dr.A. Jakubauskas, PGIL. 30,0 tūkst.12. sutartis Nr. T-27/08: „Restrikcijos fermentų, išsukančių nukleotidus iš DNR, mechanizmotyrimas“, vadovas dr. M. Zaremba, BNSTL. Lėšos 33,0 tūkst. Lt.© Biotechnologijos institutas 14

Metinis pranešimas – 200813. sutartis Nr. T-42/08: „Baltymų sekų palyginių vertinimo sistema, paremta struktūriniaismodeliais“, vadovas dr. Č. Venclovas, BL. Lėšos 37,0 tūkst. Lt.Projektai pagal tarptautines sutartis14. sutartis Nr. V-03/08: „Molekuliniai įrankiai programuojamam RNR žymėjimui specifinėsesekose“, vadovas prof. S. Klimašauskas, DMTL. Lėšos 55,0 tūkst. Lt.Ūkio subjektų užsakymu vykdomi projektai:15. sutartis Nr. G-03/08: „Monokloninių antikūnų prieš tikslinius peptidus kūrimas“, vadovasdr. A. Žvirblienė, ILBL. Lėšos 50,0 tūkst. Lt.16. sutartis Nr. G-07/08: „Baltymų raiškos sistemų kūrimas mielėse Saccharomyces cerevisiae irKluyveromyces lactis”, vadovas dr. R. Slibinskas, EGIL. Lėšos 50,0 tūkst. Lt.17. sutartis Nr.G-21: „Termofilinės DNR polimerazės kristalizacijos sąlygų paieška”, vadovėdr. G. Tamulaitienė, BNSTL. Lėšos 30,0 tūkst. Lt.Taip pat LVMSF 2008 m. finansavo projektus, kuriuose instituto darbuotojai dalyvavokaip partneriai:18. sutartis Nr. N-16/08-2: „Kontroliuojamo degumo ir atsparių senėjimui bioskalių esteriųkūrimas ir įvertinimas“, vadovė dr. B. Surinėnaitė, BVTL. Lėšos 83,0 tūkst. Lt. (ChIkoordinatorius).19. sutartis Nr. C-07022: „Genetinių ir genominių lūpos ir (arba) gomurio nesuaugimo pagrindųtyrimai (GENOLOG)“, vadovas dr. A. Timinskas, BL. Lėšos 17,5 tūkst. Lt.(VU koordinatorius).20. sutarties Nr. C-01/2007-2 pakeitimo sutartis pakeitimo sutartis Nr. C-01/2008-2: „Lietuvojepaplitusių patogeniškų bakterijų atsparumas antibiotikams: molekulinė epidemiologija irplitimo prevencija (LIETANTIBAKTAS)", vadovas dr. P. Stakėnas, ILBL. Lėšos49,5 tūkst. Lt. (KMU koordinatorius).21. sutartis Nr. B-38/2008: „Patogeninių beta-amiloido oligomerų detekcija Alzheimerio ligosdiagnostikai (AMILOIDE)“, vadovė dr. A. Žvirblienė, EGIL. Lėšos 9,6 tūkst. Lt.(BchI koordinatorius).22. sutartis Nr. PBP-01/2008-C:„Vaisiniai augalai – natūralių antocianinų producentai“(ANTOCIANINAI)“,. vadovė dr. A. Ražanskienė, EGIL. Lėšos 60,0 tūkst. Lt.(LSDI koordinatorius).23. sutartis Nr. PBP-01/2008 „Augalų atsparumo šalčiui padidinimas biotechnologinėmispriemonėmis“ (Atsparumas šalčiui), vadovė dr. A. Ražanskienė, EGIL. Lėšos 123,0 tūkst. Lt.((LSDI koordinatorius).24. sutartis Nr. 100P-04/2008-BTI: „Funkciniai baltymų nanodomenai (BaltNano)“,vadovas prof. habil. dr. S. Klimašauskas, DMTL. Lėšos 87,5 tūkst. Lt. (FI koordinatorius).25. sutartis Nr. B-37/2008-2: „Rinovirusų vaidmens alerginių ligų patogenezėje tyrimai irdiagnostika (RINOVIRUSAI IR ALERGIJA)“, vadovas prof. K. Sasnauskas, EGIL. Lėšos90,0 tūkst. Lt. (VU koordinatorius).26. sutartis Nr. N-10/08-2:”Biokatalizatorių imobilizavimo ir jų panaudojimobiotechnologiniuose procesuose tyrimai“, vadovė dr. A. Zubrienė, BVTL. Lėšos 70,0 tūkst.Lt. (VU koordinatorius).© Biotechnologijos institutas 15

Metinis pranešimas – 20082008 iš Aukštųjų technologijų plėtros programos projektų gauta (1) 240,0 tūkst. Lt., išPramoninės biotechnologijos (2-7) 1,213 mln Lt., Prioritetinių Lietuvos mokslinių tyrimų ireksperimentinės plėtros krypčių programos projektų (8) – 301,0 tūkst. Lt., projektų pagalinicijuojamų mokslo programų kryptis (9) - 220,0 tūkst. Lt., mokslininkų grupių (10-13 projektai)– 140 tūkst. Lt, projektų pagal tarptautines sutartis (14) - 55,0 tūkst. Lt., ūkio subjetų užsakymu(18-21 projektai) – 130 tūkst. Lt., partnerių projektuose (18-26) – 590,1 tūkst. Lt. Viso kartu supartneriais gauta (1-26 projektai) 2889,1 tūkst. Lt. (2007– 2200,3 tūkst. Lt.), be to,kontraagentams pagal vykdytus 2008 projetus išmokėta 917,5 tūkst. Lt. (2007– 583,0 tūkst. Lt.).3.3. Mokslinės sutartys su Lietuvos partneriaisInstitutas kiekvienais metais sudaro sutartis su Lietuvos nebiudžetiniais ir biudžetiniaissubjektais moksliniams tyrimams ir/ar eksperimentinei plėtrai vykdyti. Duomenys apieužsakovus ir sutarčių objektus pateikti lentelėje 3.2.Lentelė 3.2.Sut.Nr.11/07 UABFermentas711 UABFermentas738 UABFermentas766 UABFermentas01/07 UABProfarma03/080923 UABProfarma04/081201 UABProfarmaUžsakovas Vykdytojas –grupės vadovasSutarties objektasA. Žvirblienė Monokloninių antikūnų prieštikslinius peptidus kūrimas.2007.04.01-2008.06.30V.ŠikšnysNaujų DNR-metilinimuispecifinių endonukleazių tyrimai2007.11.27-2008.12.31R. Slibinskas Baltymų raiškos sistemų kūrimasSaccharomyces cerevisiae irKluyveromyces lactis2008.03.01-2008..08.30G. Tamulaitienė Termofilinės DNR polimerazėskristalizacijos sąlygų paieška2008.05.26-2008.10.30R. Slibinskas Įvairios kilmės virusųrekombinantinių baltymųgeneravimas heteroliginėseekspresijos sistemose.2007.07.16-2008.12.31R. Slibinskas Humanizuotos mielių raiškossistemos sukūrimas, panaudojantproteomikos ir genų inžinerijosmetodus2008.09.23-2008-12.31M. Plečkaitytė Oligomerinių rekombinantiniųbaltymų kamienų konstravimas2008.12.01-2008.12.15Suma,tūkst. Lt.05/081201 UAB M. Plečkaitytė Rekombinantinių citolizinų 5,050,0050,030,06,020,05,0© Biotechnologijos institutas 16

Metinis pranešimas – 2008Sut.Nr.ML180Užsakovas Vykdytojas –grupės vadovasProfarmaMuitinėslaboratorijaSutarties objektasklonavimas ir ekspresija2008.12.01-2008.12.15A. Žvirblienė Galvijų lyties nustatymas mėsosbandiniuose, gautuose išUžsakovo.2008.01.03-2009.06.30Suma,tūkst. Lt.2,6Pagal šias sutartis 2008 gauta 168,6 tūkst. Lt.3.4. Dalyvavimas tarptautinėse mokslo programoseDuomenys apie 2008 m. Instituto mokslininkų užsienio grantus pateikiami (lentelėje 3.3.)Lentelė 3.3.Eil.Nr.FinansuojantiorganizacijaVykdytojas -gr. vadovasGranto objektas Trukmė Suma 2008tūkst. Lt.1.EuroposKomisija, FP7HEALTH-2007-2.3.3-7:Supportinghighlyinnovativeinterdisciplinaryresearch oninfluenzaG. Žvirblis(EGIL)Small MoleculeInhibitors of theTrimeric InfluenzaVirus PolymeraseComplex(FLUNHIBIT)2008/04/01-2010/04/01351,82.FP7 COSTBM0703„Cancer andControl ofGenomicIntegrity”Klimašauskas irG. Vilkaitis(DMTL)2008 – 2012 03.Commission ofEuropeanCommunities,6 th FrameworkProgramme,Integrating andstrengtheningthe Europeanresearch areaV. Šikšnys(BNSTL)Meganucleases forgene replacement,MenuG2006-2009 318,1© Biotechnologijos institutas 17

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.FinansuojantiorganizacijaVykdytojas -gr. vadovasGranto objektas Trukmė Suma 2008tūkst. Lt.4.Commission ofEuropeanCommunities,Marie CurieActions,ResearchTrainingNetworkAmultidisciplinaryapproach to thestudy of DNAenzymes down tothe singlemolecule level2005-2009 274,95.EuroposSąjungos FP6LaserLabEuropeDNA loopingdynamics by typeII restrictionendonucleases2008-2009 -6.7.Commission ofEuropeanCommunities,6 th FrameworkProgramme,integratedprojectK. Sasnauskas(EGIL)A. Kanopka(ILBL)Rational designand comparativeevaluation ofnovel geneticvaccinesTargeting newlydiscoveredoxygen-sensingcascades for novelcancer treatments:Effect of oxygentension on splicing2004-2008 41,22004-2008 65,88.Commission ofEuropeanCommunities,Marie CurieInternationalRe-integrationProgrammeJ. Matulienė(BVTL)Inhibition ofCancer byDisruptingInteractionBetween Polo-likeKinase 1 Polo-boxDomain andSpindle Targets2006-2008 26,99.HowardHughesMedicalInstitute (JAV),Internationalscholarshipprogram forBaltics, Centraland EasternEurope, Russia,and UkraineČ. Venclovas(BL)Structuralcharacterization ofproteininteractions inDNA replication,repair andrecombinationprocesses throughmolecularmodeling2006-2010 234,6© Biotechnologijos institutas 18

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.10.11.12.FinansuojantiorganizacijaNationalInstitute ofHealthLietuvosRespublikosšvietimo irmoksloministerija(Mokslo irtechnologijųdepartamentas)ir PrancūzijosRespublikosužsienio reikalųministerijakartu suPrancūzijostarptautiniųmainų centruEGIDE;„Žiliberas“PrancūzijaEuroposekonominėserdvėsfinansiniomechanizmoprojektasVykdytojas -gr. vadovasS. Klimašauskas,DMTLS. Klimašauskas,DMTLD. Matulis,BVTLGranto objektas Trukmė Suma 2008tūkst. Lt.MethylomeProfiling via DNAMethyltransferasedirected LabellingMolecular toolsfor programmablesequence-specificlabeling of RNAPriešvėžiniųjunginių kūrimasstruktūrinėstermodinamikosmetodais2008/03/20-2010/02/282007/01/-2008/122008/06-2010/10101,015,7gautos ne perbuhalteriją372,9be kofinansvimo65,8Pagal lentelėje pateiktus tarptautinius projektus Instituto mokslininkai 2008 m. gavo 1802,9tūkst. Lt. (1430,0 tūkst. Lt., neįskaičiuojant EEE projekto), 2007 m. pagal vykdytus tarptautiniusprojektus gauta - 1711,9 tūkst. Lt.© Biotechnologijos institutas 19

Metinis pranešimas – 20083.5. Mokslinės sutartys (kontraktai) su užsienio partneriaisSutartys su užsienio subjektais moksliniams tyrimams ir eksperimentinei plėtrai vykdytisvarbus Instituto mokslininkų finansavimo šaltinis. Duomenys apie 2008 m. pasirašytas sutartissu užsienio subjektais pateikti lentelėje 3.4.Eil.Nr.1. Euroimmune AG,Liubeck, VokietijaUžsakovas Vykdytojas –grupės vadovas2. Abcam Ltd., CambridgeScience Park,Cambridge, D. Britanija3. Santa CruzBiotechnology, JAVSutarties objektasA. Ražanskienė Rekombinantiniai hantavirusųPuumala, Dobrava, Hantaannukleokapsidės baltymaiA. Žvirblienė Distributorship agreement formarketing and distribution ofproductsA. Žvirblienė Monokloninių antikūnųtiekimas4. DiaSorin, JAV G. Žvirblis Rekombinantiniai virusiniaibaltymaiLentelė 3.4.Suma,tūkst.LtPagal 2008 sutartis su užsienio partneriais iš viso gauta 75,4 tūkst. Lt., 2007 gauta284,2 tūkst. Lt.15,550,01,68,33.6. Mokslinio bendradarbiavimo partneriaiInstituto darbuotojai bendradarbiauja su Lietuvos ir užsienio mokslininkais. Tai atspindilentelės 3.6. duomenys.Lentelė 3.6.BTI darbuotojas Mokslinis partneris Bendradarbiavimo sritisV. ŠikšnysV. Šikšnys,S. Gražulis,Prof. Dr. S.E.Halford,Bristolio Universitetas, JungtinėKaralystėProf. Dr. B.A. Connolly,Newcastle universitetasDr. P. Horvath,DANISCO, PrancūzijaDr. M. Bochtler,Varšuvos IICMB, LenkijaRestrikcijos fermentųmechanizmaiCRISPR sistemų tyrimaiRestrikcijos endonukleaziųstruktūriniai tyrimai© Biotechnologijos institutas 20

Metinis pranešimas – 2008BTI darbuotojas Mokslinis partneris Bendradarbiavimo sritisV Šikšnys,G. Sasnauskas,M. ZarembaV. ŠikšnysG.TamulaitisProf. Dr. G. Wuite,Amsterdamo Vrije universitetasProf. D. Dryden,Edinburgh Universitetas, JungtinėKaralystėDr. Penny Beuning,North Eastern University, Bostonas,Masačiusetso valstija, JAVČ. Venclovas Prof. Valerie Mizrahi,University of Witwatersrand,Johanesburgas, Pietų AfrikaA. TiminskasProf. habil.dr. Vaidutis Kučinskas,Žmogaus genomo tyrimo centras,Vilniaus Universitetas,Vilnius, LietuvaRestrikcijos fermentųmechanochemijaLaiko sklaidos fluorescencijaDNR replikacijos irreparacijos baltymų tyrimaiTuberkuliozės sukėlėjo M.tuberculosis DNRreplikacijos ir reparacijosmechanizmų tyrimaikompiuteriniais metodaisGenetinių pokyčių žmogujetyrimaiProf. Dr. Elmar Weinhold,Institut für Organische Chemie derRWTH, Aachen, VokietijaProf. Artūras Petronis,Centre for Addiction and Mental Health,University of Toronto, Toronto, KanadaDr. Yoshitaka Bessho,GSC RIKEN, Yokohama, JaponijaNauji kofaktoriai DNRmetilazėmsŽmogaus DNR metilinimotyrimaiRNR metilazių tyrimaiS. KlimašauskasDr. J. Bujnicki,International Institute of Cellular andMolecular Biology, Warsaw, LenkijaProf. Jaanus Remme,Estonian Biocenter, Tartu, EstijaDr. Andrey Kulbachinkiy,Institute of Molecular Genetics, Moscow,RusijaDr. R.Valiokas,Fizikos institutas, VilniusProf. S. Tumkevičius,Chemijos fakultetas, VilniausuniversitetasMetilazių kompjuterinismodeliavimasRNR kovalentinėmodifikacijaRNR polimerazėsmechanizmo tyrimaiBaltymų nanodomenaiMetilazių kofaktorių cheminėsintezė© Biotechnologijos institutas 21

Metinis pranešimas – 2008BTI darbuotojas Mokslinis partneris Bendradarbiavimo sritisHabil. dr. N. Čėnas,Biochemijos institutas, VilniusPolifenolių oksidacijosreakcijų kinetikaM.Gudeliauskaitė/S. KlimašauskasK. SasnauskasK. SasnauskasR. Petraitytė,A. RažanskienėK. Sasnauskas,R. SlibinskasK. Sasnauskas,A. GedvilaitėA. Gedvilaitė,E. AleksaitėK. Sasnauskas,M. JuozapaitisK. Sasnauskas,M. JuozapaitisK. Sasnauskas,M. JuozapaitisDr. Beatrice Clouet-d‘Orval,Université Paul Sabatier, CNRS-UMR5100, Bat IBCG, Toulouse, PrancūzijaProf. J. Dilner,Malmo University, Malmo, ŠvedijaDr. Li Jin,HPA, London, JKDr. D. Samuel,HPA, London, JKE.Shikova,Bulgarija, Sofija. The Institute ofExperimental Pathology and ParasitologyDr. Ulrike Blohm,Institute for Novel and EmergingInfectious Diseases Greifswald - InselRiems, GermanyDr. M. Coiras, Dr. P.Perez-Brena,Virology Service,Virology Service, Instituto de SaludCarlos III, Madrid, IspanijaProf. W. Michalski,CSIRO Livestock Industries, Geelong,AustralijaDr. Dietmar,Becher MICROMUN GmbH,Privates Institut für MikrobiologischeForschung, Greifswald, VokietijaDr. Rainer G. Ulrich,Friedrich-Loeffler-InstitutBundesforschungsinstitut fürTiergesundheit, Federal ResearchInstitute for Animal Health OIECollaborating Centre for Zoonoses inEuropeProgramuojamų RNRmetilazių tyrimaiPolyomos virusų diagnostikaRubella ir Hantaan virusųdiagnostikaTymų ir kiaulytės virusųdiagnostikaPolyomos ir papilomosvirusų testavimasPriešvėžinių vakcinų kūrimasKvėpavimo virusų PIV irRSV baltymų sintezė mielėseNipah, Hendra ir Menanglevirusų baltymų sintezėmielėseGripo viruso glikoproteinųtyrimai ir vakcinų parametrųįvertinimo sistemosParagripo virusų NP baltymųtyrimai© Biotechnologijos institutas 22

Metinis pranešimas – 2008BTI darbuotojas Mokslinis partneris Bendradarbiavimo sritisK. Sasnauskas,L. Antoniukas,G. Žvirblis,M. JuozapaitisProf. M. Schwemmle,Dept. of Virology, University ofFreiburg, Freiburg, VokietijaProf. Paul Pumpens,Biomedical Research and Study Centre,Riga, LatvijaGripo viruso baltymaiVirusus primenančios dalelėsir jų taikymasK. Sasnauskas,A. BulavaitėR. AbraitisL. AntoniukasK. Sasnauskas,A. Ražanskienė,R. PetraitytėR. SlibinskasA. ŽvirblienėDr. E.Verschoor,Department of Virology, BiomedicalPrimate Research Centre, Rijswijk,OlandijaProf. F-L. Cosset,Ecole Normale Superiore, Lyon,PrancūzijaDr. Rasa Jomantienė,dr. Deividas Valiūnas, D. Kulbienė, A.Ivanauskas, D. Šneideris,Botanikos institutasDr. Gražina Stanienė,dr. Danguolė Kavaliauskaitė,J. Vinskienė, Z. KajatienėLietuvos sodininkystės ir daržininkystėsinstitutasProf. U.Reichel, H.Grammel,Max Plank Institute for Dynamics ofComplex Technical Systems, Magdeburg,VokietijaDr. Li Jin,HPA, London, UKDr. Hanns-Rüdiger Graack,Dr. T.Pohl,WITA GmbH, Teltow, VokietijaDr. V. Gorboulev,Wurzburg University, Wurzburg,VokietijaDr. R. Ulrich,Friedrich-Loeffler-Institute, Greifswald,Insel-Riems, VokietijaPoliomos virusai ir jųtestavimasVSV-G ir HCV virusųepitopų ekspozicija daleliųpaviršiujeViroidų ir fitoplazmų paieškasodo augaluoseHantavirusų nukleokapsidųgryninimo technologijosRubella ir Hantaan virusųdiagnostikaDvikryptės elektroforezėstaikymas proteominiuosetyrimuoseOrganinių katijonųreceptoriaus (hOCT)imunocheminiai tyrimaiVirusinių antigenųimunologiniai tyrimai© Biotechnologijos institutas 23

Metinis pranešimas – 2008BTI darbuotojas Mokslinis partneris Bendradarbiavimo sritisA. KanopkaP. StakėnasD. MatulisProf. L. Poellinger,Karolinska Institute, Stockholm, ŠvedijaDr. J. Makino,Tokyo University, Tokyo, JaponijaProf. E. Pettersen,Oslo University, Oslo, NorvegijaProf. P. Ebbesen,Aalborg University, Aalborg, DanijaDr. B. Wouters,Mastricht University, Mastricht, OlandijaProf. F. Drobniewsky,Queen Mary and WestfieldCollege,University of London, JungtinėKaralystėDr. D. M Cirillo,Fondazione Centro San Raffaele del MonteTabor, Milan, ItalijaDr. A. Sosnovskaja, dr. E. Davidavičienė,Respublikinė tuberkuliozės ir infekciniųligų universitetinė ligoninė, Vilnius,LietuvaProf. Seppo Parkkila,University of Tampere, Tampere, FinlandProf. Claudiu Supuran,Universita Degli Studi Di Firenze,Dipartimento Di Chimica, ItalijaProf. Jukka Westermarck,Tampere University, SuomijaiRNR pokyčiai susidarędioksino receptoriaus mRNAbrendimo metu bei ląsteliųatsakas į stresąLąstelių atsakas į stresąDeguonies sensoriaiDeguonies sensoriaiLąstelių atsakas į stresąTuberkuliozės tyrimaiKarboanhidrazių sritisProf. M. Maier,University of Tubingen, VokietijaDr. Dietmar Appelhans,Leibniz-Institut für PolymerforschungDresden e.V., Dresden, VokietijaProf. M. Zylicz,International Institute of Molecular andCell Biology, LenkijaRadisikolo analogų sintezėHSA baltymų ir dendrimerųsąveikos tyrimasRekombinantiniai baltymaip53, Hdm2, Hsp90β© Biotechnologijos institutas 24

Metinis pranešimas – 2008BTI darbuotojas Mokslinis partneris Bendradarbiavimo sritisS. Garalevičius,Kompjuterinės programosAmerica Hears, Inc., Philadelphia, JAVDr. V. Kairys,Madeiros universitetas, Funchau,PortugalijaProf. S. Tumkevičius,Vilniaus universitetasDr. R. Meškys,Biochemijos institutas, VilniusKompjuterinis modeliavimasOrganinė sintezėRekombinantinių baltymųrefoldavimas3.7. Disertacijų gynimasFizinių mokslų srities biochemijos krypties habilitacijos procedūrą įvykdė:Alma Gedvilaitė. Darbų apžvalga “Genų raiška ir biosintezė mielėse: molekuliniai tyrimai irpanaudojimas”. 2008-05-14. VU Gamtos mokslų fakultetas, VilniusAurelija Žvirblienė. Darbų apžvalga “Monokloninių antikūnų kūrimas ir taikymas. 2008-05-28.VU Gamtos mokslų fakultetas, Vilnius.Fizinių mokslų srities biochemijos krypties daktaro laipsniui gauti disertacijas apgynė:Rasa Petraitytė. Virusinių baltymų sintezė mielėse ir jų naudojimas diagnostikai. Mokslinisvadovas prof. habil. dr. K. Sasnauskas, dr. A. Ražanskienė. 2008-03-27. Biotechnologijosinstitutas, Vilnius.Aistė Bulavaitė. Poliomos virusų MPyV, SV40 ir hepatito B viruso chimerinių paviršiausbaltymų sintezė mielėse ir savybių tyrimas. 2008-04-17. Mokslinis vadovasprof. habil. dr. K. Sasnauskas. Biotechnologijos institutas, Vilnius.Linas Antoniukas. Hantaviruso nukleokapsidės baltymo vakcinoms ir diagnostikai sintezėmielėse Saccharomyces cerevisiae ir gryninimas gamybinėmis sąlygomis („Large-scaleproduction and purification of hantavirus nucleocapsid protein in yeast Saccharomycescerevisiae for diagnostics and vaccine applications). Mokslinis vadovas prof. habil. dr.K. Sasnauskas, konsultantai prof. dr. U. Reichl, habil. dr. R. Ulrich. 2008-05-09.Biotechnologijos institutas, Vilnius.Sonata Jurėnaitė-Urbanavičienė. Naujo specifiškumo bifunkcinių restrikcijos endonukleaziųkonstravimas. Mokslinis konsultantas dr. A. Lubys. 2008-06-27. Biotechnologijos institutas,Vilnius.Rimantas Šapranauskas. IIS potipio restrikcijos endonukleazės BfiI domeninės organizacijostyrimas, panaudojant naują geno atsitiktinio padalinimo metodą. Mokslinis konsultantas dr.A.Lubys. 2008-06-28. Biotechnologijos institutas, Vilnius.Gintautas Tamulaitis. Restrikcijos endonukleazių Ecl18kI ir EcoRII, sąveikaujančių supertrauktomis palindrominėmis sekomis, struktūriniai ir funkciniai tyrimai. ("Structural andFunctional Studies of the Ecl18kI and EcoRII Restriction Enzymes Specific for InterruptedPalindromic Sites“). Mokslinis konsultantas prof. dr. V. Šikšnys. 2008-11-28.. Biotechnologijosinstitutas, Vilnius.© Biotechnologijos institutas 25

Metinis pranešimas – 2008Inga Matijošytė. Mechanistic studies of laccase/TEMPO catalyzed aerobic oxidation ofalcohols. Moksliniai vadovai: prof. R.A. Sheldon, prof. I.W.C.E. Arends, prof. S. De Vries.2008-12-02. Delfto Technologinis Universitetas, Nyderlandai (Delft University of Technology,The Netherlands).3.8. Mokslinės veiklos pripažinimo ženklaiLietuvos jaunųjų mokslininkų sąjungos (LJMS) inciatyva skelbtoje 2007 disertacijųatrankoje pagrindinis prizas fizinių, biomedicinos ir technologijos mokslų sekcijoje skirtasdr. Gražvydui Lukinavičiui už disertaciją "Metiltransferazių katalizuojamas funkcinių grupiųįvedimas specifinėse DNR sekose". Šio konkurso laureate tapo ir dr. Giedrė Tamulaitienė,apgynusi daktaro disertaciją „Kristalografiniai ir funkciniai restrikcijos endonukleazių Eco57I irSdaI tyrimai“.Lietuvos mokslų akademijos premija už studento mokslinį darbą „Tetrameriniairestrikcijos fermentai: plėtra į GIY-YIG šeimą“ paskirta Giedriui Gasiūnui.FEBS ilgalaikės stažuotės stipendiją laimėjo (FEBS Long Term Fellowship)dr. Gražvydas Lukinavičius.© Biotechnologijos institutas 26

Metinis pranešimas – 20084. MOKSLINĖ PRODUKCIJA4.1. Mokslinė produkcija: kiekybiniai rodikliai2008-ųjų metų mokslinė produkcija, ir jos palyginimas su 2007 m. rezultatais pateikti4.1 lentelėje.Lentelė 4.1.Rezultatai1. Monografijos2. Straipsniaižurnaluose, kuriereferuojamiMokslinėsinformacijosinstituto (ISI)Mokslo citavimoindeksųpagrindiniųrecenzuojamųleidinių sąraše irturi IF3. Straipsniaikituose užsienioleidiniuose4. StraipsniaiLietuvosžurnaluose5. Užsienyje gautipatentai6. Lietuvospatentai7. Parduotalicenzijų8. ApgintadisertacijųNatūrineišraiška*2008 2007 Skirtumas 08-07BTI autoriųindėlispagal ofic.skaičiavimą*Natūrineišraiška*BTI autoriųindėlispagal ofic.skaičiavimą**Natūrineišraiška*BTIautoriųindėlispagal ofic.skaičiavimą*23 12,35 24 10,835 -1 +1,5156 3,65 2 1,67 +4 +1,984 1,725 5 2,18 -1 -0,455- - - - - -1 1 1 0,75 0 +0,251 -6 - 4 - 2 -© Biotechnologijos institutas 27

Metinis pranešimas – 2008*Natūrine išraiška: visi Instituto darbuotojų paskelbti straipsniai, patentai, neatsižvelgiantį tai ar Institutas paminėtas tarp autorių institucijų ar ne, bei neatmetant kitų institucijų autoriųdalies;**Pagal SKVC taisykles: tik publikacijos, kuriose paminėtas BTI, atmetant kitųinstitucijų autorių dalį.Instituto laboratorijų mokslinių publikacijų rodikliai pateikti lentelėje 4.2.Lentelė 4.2.Mokslo darbuotojųPublikacijų skaičius *2Laboratorijaskaičius *1 Iš viso Vienam mokslodarbuotojui2008 2007 2008 2007 2008 2007BNSTL 16 12 5,235 2,92 0,33 0,24DMTL 14 11 1,08 1,835 0,08 0,17EGIL 18,25 17,25 2,03 1,8 0,11 0,1BVTL 16,5 13,5 2,7 1,16 0,16 0,09ILBL 8 8 0,465 1,654 0,06 0,18BL 4 5 0,84 0,33 0,21 0,07Iš viso: 76,75 72,75 12,35 10,835 0,16 0,15* 1 Faktiškai dirbančių mokslo darbuotojų skaičius, žr. lentelę 2.3.* 2 Publikacijos – straipsniai užsienio spaudoje ir užsienio patentai, vertinant juos pagalSKVC taisykles.Publikacijų skaičius vienam mokslo darbuotojui, vertinant pagal SKVC taisykles,paskutiniais metais nežymiai svyruoja. Paskirų laboratorijų publikacijų skaičiaus rodikliai yragrynai dėl statistikos, nes lentelės 4.2. duomenys neatspindi publikacijų kokybės.4.2. Straipsniai ISI žurnaluoseBaltymų nukleorūgščių sąveikos tyrimo laboratorija1. Giedrius Gasiunas, Giedrius Sasnauskas, Gintautas Tamulaitis, Claus Urbanke, DaliaRazaniene, and Virginijus Siksnys. Tetrameric restriction enzymes: expansion to theGIY-YIG nuclease family. Nucleic Acids Research 2008, 36(3):938-49.IF 6,954/4,225 AIF2. Rasa Sukackaite, Saulius Grazulis, Matthias Bochtler and Virginijus Siksnys. TheRecognition Domain of the BpuJI Restriction 2 Endonuclease in Complex with CognateDNA at 1.3-Å Resolution. J. Mol. Biol. 2008 378(5):1084-93.IF 4,89/4,225 AIF3. Giedre Tamulaitiene and Virginijus Siksnys. NotI is not boring. Structure. 2008,16(4):497-8.IF 5,231/2,996 AIF© Biotechnologijos institutas 28

Metinis pranešimas – 20084. Sasnauskas G, Connolly BA, Halford SE, Siksnys V. Template-directed addition ofnucleosides to DNA by the BfiI restriction enzyme. Nucleic Acids Res. 2008,36(12):3969-3977.IF 6,954/4,225 AIF5. Tamulaitis G., Zaremba M., Szczepanowski R.H., Bochtler M., Siksnys V. How PspGI,catalytic domain of EcoRII and Ecl18kI acquire specificities for different DNA targets.Nucleic Acids Res. 2008, 36 (19), 6101-8.IF 6,954/4,225 AIF6. Szczepanowski RH, Carpenter MA, Czapinska H, Zaremba M, Tamulaitis G,Siksnys V, Bhagwat AS, Bochtler M. Nucleic Acids Res. Central base pair flipping anddiscrimination by PspGI, 2008, 36 (19), 6109-17.IF 6,954/4,225 AIF7. Jakubauskas A 1 ., Sasnauskas G., Giedriene J., and Janulaitis 2 A. DomainOrganization and Functional Analysis of Type IIS Restriction Endonuclease Eco31I.Biochemistry 2008, 47(33):8546-8556. (3 prieskyros)IF 3,368/4,225 AIFDNR modifikacijos tyrimų laboratorija8. Daujotyte D., Liutkeviciute Z., Tamulaitis G., Klimasauskas S. Chemical mapping ofcytosines enzymatically flipped out of the DNA helix.Nucleic Acids Res. 2008,36(10):e57.IF 6,954/4,225 AIF9. Jakubauskas A 3 , Kriukiene E, Trinkunaite L, Sapranauskas R, Jurenaite-Urbanaviciene S, Lubys A 4 . Bioinformatic and partial functional analysis of pEspA andpEspB, two plasmids from Exiguobacterium arabatum sp. nov. RFL1109. Plasmid, 200961(1):52-64. (2 prieskyros)IF 2,0416/4,406 AIFEukariotų genų inžinerijos laboratorija10. David C. Dorn, Robert Lawatscheck, Aurelija Zvirbliene, Egle Aleksaite, GabrielePecher, Kestutis Sasnauskas, Muhsin Özel, Martin Raftery, Günther Schönrich, RainerG. Ulrich and Alma Gedvilaite. Cellular and humoral immunogenicity of hamsterpolyomavirus-derived virus-like particles harboring a mucin 1 cytotoxic T-cell epitope.Viral Immunol., 2008, 21, 12-27.IF 1,816/3,732 AIF Virology.11. Petraitytė R., Yang H, Hunjan R, Ražanskienė A, Dhanilall P, Ulrich RG, SasnauskasK, Jin L. Development and evaluation of serological assays for detection of Hantaanvirusspecificantibodies in human sera using yeast-expressed nucleocapsid protein. J Virol.Methods. 2008, 148(1-2):89-95.IF 1,933/3,732AIF Virology.1 Dvi prieskyros – BTI ir VU Santariškių klininkos2 Dvi prieskyros – BTI ir UAB Fermentas3 Dvi prieskyros – BTI ir VU Gamtos mokslų fakultetas4 Dvi prieskyros – BTI ir UAB Fermentas© Biotechnologijos institutas 29

Metinis pranešimas – 200812. Linas Antoniukas 5 , Hartmut Grammel, Kestutis Sasnauskas and Udo Reichl. Profilingof external metabolites during production of hantavirus nucleocapsid protein withrecombinant Saccharomyces cerevisiae". Biotechnology Letters, 2008, 30(3):415-20. (2prieskyros)IF 1,222/2,940 AI Biotechnology and Applied Microbiology13. Juozapaitis M., Zvirbliene A., Kucinskaite I., Sezaite I., Slibinskas R., Coiras M., deOry Manchon F., López-Huertas M.R., Pérez-Breña P. Staniulis J., Narkeviciute I.,Sasnauskas K. Synthesis of recombinant human parainfluenza virus 1 and 3 nucleocapsidproteins in yeast Saccharomyces cerevisiae and application for detection of specificantibodies. Virus Res., 2008, 133:178-186.IF 2,810/3,732 AIF14. Skrastinia D., Bulavaite A., Sominskaja I., Kovalevska L., Ose V., Priede D., PumpensP., Sasnauskas K. Immunological behaviour of immunodominant hepatitis B virusenvelope exposed on the surface of two different virus-like particle carriers. Vaccine,2008, 26, 1972-1981.IF 3,16/1,038 AIF15. Verschoor EJ, Niphuis H, Fagrouch Z, Christian P, Sasnauskas K, Pizarro MC, HeeneyJL. Seroprevalence of SV40-like polyomavirus infections in captive and free-rangingmacaque species. J Med Primatol. 2008 37(4):196-201IF 1,301/ 1,124 AIF16. Y. Sidorenko, L. Antoniukas 6 , J. Schulze-Horsel, A. Kremling, U. Reichl. MathematicalModel of Growth and Heterologous Hantavirus Protein Production of the RecombinantYeast Saccharomyces cerevisiae. Eng. Life Sci. 2008, 8, No. 4, 399–414. (2 prieskyros)IF 0,969/2,940 AIF17. Asta Abraitienė 7 , Yan Zhao, Rosemarie Hammond. Nuclear targeting by fragmentationof the Potato spindle tuber viroid genome. Biochemical and Biophysical ResearchCommunications. 2008, 368:470-475.IF 2,749/ 2,996 AIF (2 prieskyros)18. P. Ramirez, E. Hernandez, F. Mora, R. Abraitis R. and R.W. Hammond. LimitedGeographic Distribution Of Beet Pseudo-Yellows Virus In Costa Rican Cucurbits. Journalof Plant Pathology (2008), 90 (2), 331-335.IF 0,974/2,287 AIFBiotermodinamikos ir vaistų tyrimo laboratorija19. Baranauskienė L., Matulienė J., Matulis D. Determination of the thermodynamics ofcarbonic anhydrase acid-unfolding by titration calorimetry. J Biochem Biophys Methods,2008, 70(6):1043-77.IF 1,338/2,996 AIF20. Cimmperman P., Baranauskiene L., Jachimoviciute S., Jachno J., Torresan J.,Michailoviene V., Matuliene J., Sereikaite J, Bumelis V, Matulis D. A QuantitativeModel of Thermal Stabilization and Destabilization of Proteins by Ligands. Biophys J.5 Dvi prieskyros – BTI ir Max-Planck-Institut für Dynamik Komplexer Technischer Probleme, Magdeburg6 Dvi prieskyros – BTI ir Max-Planck-Institut für Dynamik Komplexer Technischer Probleme, Magdeburg7 Dvi prieskyros – BTI ir US Department of Agriculture© Biotechnologijos institutas 30

Metinis pranešimas – 20082008, 95(7):3222-31.IF 4,627/2,996 AIF21. Hilvo M., Baranauskiene L., Salzano A.M., Scaloni A., Matulis D., Innocenti A.,Scozzafava A., Monti S.M., Di Fiore A., De Simone G., Lindfors M., Jänis J., Valjakka J.,Pastoreková S., Pastorek J., Kulomaa M.S., Nordlund H.R., Supuran C.T., Parkkila S.Biochemical characterization of CA IX: one of the most active carbonic anhydrase. J BiolChem. 2008, 283 (41):27799-27809]IF 5,581/4,225 AIF22. Vida Bendikienė, Birutė Surinėnaitė 8 , Irina Bachmatova, Liucija Marcinkevičienė,Benediktas Juodka. Tweens and ionic detergents in the hydrolytic activity ofPseudomonas mendocina 3121-1 Lipase. Biologija 54(4): 242–246.23. Vida Bendikienė, Benediktas Juodka, Birutė Surinėnaitė, Gervydas Dienys. Lipases inconversion of oils. Experimental screening of enzymes and substrates for biodieselproduction. Biologija 54(4): 247–252.Imunologijos ir ląstelės biologijos laboratorija24. M. Pleckaityte, G. Zvirblis. Genetic organization of the Meiothermus ruber Hsp70/ClpBchaperone system. Biologija. 2008, 54 (3):156-160.25. Sventoraityte J., Zvirbliene A., Kiudelis G., Zalinkevicius R. Zvirbliene A., PraskeviciusA., Kupcinskas L., Tamosiūnas V. Immune system alterations in patients withinflammatory bowel disease during remission. Medicina (Kaunas). 2008, 44(1):27-33.Bioinformatikos laboratorija26. Repsys V. 9 , Margelevicius M., Venclovas C. 10 Re-searcher: a system for recurrentdetection of homologous protein sequences. BMC Bioinformatics. 2008, 9:296. (2prieskyros)IF 3,617/2,996 AIF27. McCauley M.J., Shokri L. Sefcikova J., Venclovas C., Beuning P.J., Williams M.C.Distinct Double- and Single-Stranded DNA Binding of E. coli Replicative DNAPolymerase III alpha Subunit. ACS Chem Biol. 2008, 3 (9):577-587.IF 4,741/ 4,225 AIFBiotermodinamikos ir vaistų tyrimo laboratorija4.3 Patentai, patentinės paraiškos28. D. Matulis, V. Dudutienė, J. Matulienė, L. Mištinaitė. Benzimidazo[1,2-c][1,2,3]thiadiazolo—sulfonamidai – karboanhidrazių slopikliai ir tarpiniai junginiaijiems gauti. LT 5504 B.29. D. Matulis, V. Dudutienė, J. Matulienė, L. Mištinaitė. Benzimidazo[1,2-C][1,2,3]Thiadiazol-7-Sulfonamides As Inhibitors Of Carbonic Anhydrase And TheIntermediates For Production Thereof. WO2008/016288 (A1).8 Dvi prieskyros – BTI ir VU Gamtos fakultetas9 Dvi prieskyros – BTI ir VU Matematikos ir informatikos falultetas10 Dvi prieskyros – BTI ir VU Matematikos ir informatikos falultetas© Biotechnologijos institutas 31

Metinis pranešimas – 2008DNR modifikacijos tyrimų laboratorija4.4 Medžiaga knygose, enciklopedijose30. Saulius Klimašauskas and Gražvydas Lukinavičius. Chemistry of AdoMet-DependentMethyltransferases. Wiley Encyclopedia of Chemical Biology, 2008 John Wiley & Sons,Inc. doi: 10.1002/9780470048672.wecb335.31. S. Klimašauskas. Nukleorūgščių chemija. Mokomoji knyga aukštosioms mokykloms.Technologija, Vilnius, 2008, 130 p.Eukariotų genų inžinerijos laboratorija32. Pumpens P., Ulrich R.G., Sasnauskas K., Kazaks A., Ose V., Grens E. Construction ofnovel vaccines on the basis of virus-like particles. Hepatitis B virus proteins as vaccinecarriers. Khudyakov YE, editor. Medicinal protein engineering. 2008. Boca Raton, CRCPress LLC, p.p. 205-248.33. Ulrich, R.G., Gedvilaite, A., Voronkova, T., Kazaks, A., Johne, R., Sasnauskas, K.Polyomavirus – derived virus – like particles. Khudyakov YE, editor. Medicinal proteinengineering. 2008. Boca Raton, CRC Press LLC, p.p. 249-275.Biotermodinamikos ir vaistų tyrimo laboratorija34. D. Matulis. Baltymų fizikinė chemija: mokomoji knyga. Kaunas, 2008, 149 p.4.5 Konferencijų, simpoziumų medžiaga2008 m. Instituto darbuotojai pateikė įvairių konferencijų ar simpoziumų organizatoriamspranešimų tezes (abstracts), kurios buvo atspausdintos konferencijų ar simpoziumų medžiagoje,nepriklausomai nuo to ar autorius dalyvavo konferencijoje ar ne. Žemiau pateikiamas tokiųpranešimų tezių sąrašas.Baltymų – nukleorūgščių sąveikos tyrimo laboratorija1. SiksnysV., Tamulaitis G., Zaremba M., Szczepanowski R., Bochtler M. How dorestriction enzymes acquire specificities for different target sites? FEBS J. 2008 275 S1,p.10.2. S. Grazulis, L. Baranauskiene, E. Manakova, R. Sukackaite, D. Golovenko, G.Tamulaitiene, D. Matulis. Novel Thiadiazole Inhibitors of Human Carbonic Anhydrases.7th ScanBalt Forum&ScanBalt Biomaterials Days, p. 79, 2008.3. Siksnys V., Golovenko D., Grazulis S., Tamulaitis G., Zaremba M. Novel structuresand mechanisms of restriction enzymes. FASEB Summer Research Conferences, Nucleicacid enzymes. Vermont Academy, Saxtons River, Vermont, USA, June 8-13, 2008.4. Sasnauskas G., Connolly, B.A., Halford S.E., and Siksnys V. The BfiI restrictionenzyme can both cut DNA and fill in the resultant staggered ends; FASEB SummerResearch Conferences, Nucleic acid enzymes. Vermont Academy, Saxtons River,Vermont, USA, June 8-13, 2008, p. 27.5. M. Zaremba. Restriction endonuclease BfiI – a platform for protein engineering. FASEBSummer Research Conference „Nucleic Acid Enzymes“, Saxton‘s River, Vermont, JAV,birželio 8-13, 2008.6. R. Sukackaite, S. Grazulis, V. Siksnys. The recognition domain of the BpuJI restriction© Biotechnologijos institutas 32

Metinis pranešimas – 2008endonuclease in complex with cognate DNA at 1.3 Å resolution. Abstracts of the 40 thcrystallographic meeting “From molecules to medicines: Integrating crystallography indrug discovery”, Erice, Italy, 2008, May 29 – June 8, p. 388.7. D. Golovenko, E. Manakova, S. Grazulis and Siksnys, V. Crystallographic studies ofEcoRII-DNA complex: one enzyme - two DNA recognition mechanisms; 10thInternational EMBL PhD Student Symposium: Decision-Making in Biology - Nature atthe Crossroads; EMBL, Heidelberg, Vokietija 2008, 10 23-25, p. 678. Tamulaitis G., Zaremba M., Szczepanowski, Roman H. Bochtler, M., & Siksnys V.How PspGI/EcoRII-C and Ecl18kI restriction enzymes acquire specificities for differenttargets. 3rd Annual Meeting of the MARIE CURIE Research Training Network “DNAEnzymes”, September 3-5, 2008, Berlin, Germany, p.16.DNR modifikacijos tyrimų laboratorija9. Saulius Klimašauskas, Ruta Gerasimaite, Giedre Urbanaviciute, Edita Kriukiene,Gražvydas Lukinavičius, Arturas Petronis. Epigenome profiling via DNAmethyltransferase-directed labeling. Cellular Oncology, 2008, 30 (3): 232.10. Lukinavičius G., Lapienė V., Lapinaitė A., Weinhold E. and Klimašauskas S.Methyltransferase-directed Transfer of Activated Groups (mTAG) for Targeted covalentlabeling of DNA. FEBS J., 2008 275: (S1) 456.11. Gudeliauskaite M., Clouet d’Orval B., Lukinavicius G. and Klimasauskas S.Reconstitution Of Archaeal C/D Box sRNPs: Towards Synthetically ProgrammableSequence-Specific Labelling Of RNA. FEBS J., 2008 275: (S1) 123.12. Darius Kavaliauskas, Alexandra Plotnikova, Gražvydas Lukinavičius, SauliusKlimašauskas ir Giedrius Vilkaitis “MikroRNR modifikacija naudojant metiltransferazęHEN1”. X Lietuvos biochemikų draugijos suvažiavimas-konferencija "Biochemija irsistemų biologija", Tolieja, Lietuva, 2008, birželio 20 – 22, p. 38.13. S. Klimasauskas, G. Lukinavicius, E. Kriukiene, G. Urbanaviciute, R. Gerasimaite,Z. Stasevskij, A. Plotnikova, G. Vilkaitis, E. Weinhold. SAM-dependentmethyltransferases: A new tool for biotechnology. 7th ScanBalt Forum&ScanBaltBiomaterials Days, 2008. p. 48-49.14. A. Plotnikova, D. Kavaliauskas A. Osipenko S., Klimasauskas, G. Vilkaitis.MicroRNA modification using Hen1 methyltransferase. 7th ScanBalt Forum&ScanBaltBiomaterials Days, 2008, p. 86.15. Gudeliauskaitė M., Clouet d’Orval B., Lukinavičius G. ir Klimašauskas S.Programuojama RNR molekulių modifikacija archėjų C/D sRNP pagalba. LietuvosBiochemikų Draugijos X suvažiavimo-konferencijos "Biochemija ir sistemų biologija”tezių rinkinys. 2008, p. 34-35.16. Liutkevičiūtė Z., Daujotytė D., Tamulaitis G., Klimašauskas S. "Cheminis išsuktų(ekstraspiralinių) citozinų identifikavimas baltymo-DNR kompleksuose". Lietuvos„Biochemikų draugijos X-tojo suvažiavimo-konferencijos “Biochemija ir sistemųbiologija” tezių rinkinys. 2008, p. 43.© Biotechnologijos institutas 33

Metinis pranešimas – 2008Eukariotų genų inžinerijos laboratorija17. K. Sasnauskas, A. Gedvilaite, R. Slibinskas, M. Juozapaitis, A. Zvirbliene, R.Ulrich.Generation of viral proteins as virus-like particles in yeast. 7th ScanBalt Forum&ScanBaltBiomaterials Days, 2008, p.47-48.18. Juozapaitis M., Sasnauskas K. “Yeast expression system is an excellent tool for thedevelopment for human virus diagnostics”,“PepCon 2008“ konferencija, 2008 m.balandžio 28-30d. Shen Zhen (Kinija) Abstracts p. 22.19. Gedvilaite A., Slibinskas R., Juozapaitis M., Zvirbliene A., Sasnauskas K. Generationof viral proteins in yeast. 12th International Congress on Yeasts. Kyiv, Ukraine, August11-15, 2008. Abstracts, book p.250.20. Gedvilaite A., Slibinskas R., Zvirbliene A., Sasnauskas K. Recombinant virus-likeparticles and their application for vaccine development and diagnostics. EHRLICH II –2nd World Conference on Magic Bullets Celebrating the 100th Anniversary of the NobelPrize Award to Paul Ehrlich Nürnberg, October 3-5, 2008. Abstracts book p.102.Biotermodinamikos ir vaistų tyrimo laboratorija21. D. Matulis, E. Kazlauskas, L. Baranauskiene, I. Cikotiene, V. Dudutiene, J.Matuliene, A. Zubriene, J. Jachno, J. Torresan, V. Michailoviene, P. Cimmperman,D. Lingė, M. Zaveckas, V. Petrikaite, H. Sebeka, L. Grinius. Chaperone Hsp90 andcarbonic anhydrase IX inhibitors as anticancer agents. 7th ScanBalt Forum&ScanBaltBiomaterials Days. p. 41.22. Cimmperman P., Baranauskienė L., Matulienė J. and Matulis D. A general model todescribe protein thermal stabilization and destabilization by ligands. 2 nd InternationalSymposium on Biothermodynamics, Book of Abstracts, Frankfurt am Main, Germany,February 21-22, 2008, p.45.23. I. Matijošytė. A first quantitative and complete presentation of all reaction steps involvedin aerobic alcohol oxidation by the laccase/TEMPO system. IX Netherlands Catalysis andChemistry Conference, 2008.03.03-05, Noordwijkerhout, Nyderlandai.24. I. Matijošytė. Aerobic oxidation of alcohols catalyzed by Laccase from Trametesversicolor and mediated by TEMPO. 4 th European Meeting in Oxizymes, 2008.06.16-18.Helsinki, Suomija.25. B. Surinėnaitė. Lipolytic enzymes as tool for biotechnology. Gordon ResearchConference „Biocatalysis“, 2008.09, Shmitfield, Rod Island, JAV.26. E. Kazlauskas, I. Cikotiene, J. Matuliene, A. Zubriene, J. Jachno, J. Torresan,V. Michailoviene, D. Matulis. Resorcinol class Hsp90 inhibitor binding thermodynamicsand the effect on cancerous cells. The 4 th International Conference on the Hsp90Chaperone Machine, 2008 m. spalio 2-6 d. Bavaria, Vokietija, p. 36.27. B. Surinėnaitė „Lipoliziniai fermentai biotechnologijoje“. Lietuvos biochemikų draugijossuvažiavimas-konferencija "Biochemija ir sistemų biologija", (Molėtai, 2008.06.20-22)medžiaga, p. 62.Imunologijos ir ląstelės biologijos laboratorija28. I. Šėžaitė, I. Kučinskaitė, M. Juozapaitis, K. Sasnauskas, A. Žvirblienė„Monokloniniai antikūnai prieš paragripo trečio tipo viruso nukleokapsidės baltymą“,© Biotechnologijos institutas 34

Metinis pranešimas – 2008Lietuvos Biochemikų draugijos konferencijos „Biochemija ir sistemų biologija“ (Molėtai,2008.06.20-22) medžiaga, p. 62-63.29. Zvirbliene, R Petraityte, I. Kucinskaite, K. Sasnauskas. Development of serologicalassays for the detection of viral infections using yeast-expressed viral antigens andmonoclonal antibodies. II Symposium. Standartization in immunology/Standartyzacja wimmunologii, Poznan 27-29.11.2008. p. 13.30. Zvirbliene, I. Kucinskaite, A. Gedvilaite, I. Sezaite, R. Ulrich, K Sasnauskas. ChimericVLPs are highly efficient immunogens to generate monoclonal antibodies of desiredspecificity. PepCon-2008, BIT Life Sciences, Shenzhen, April 22-24 2008, p. 259.31. E. Markauskaitė, Y. Makino, L. Poellinger, A. Kanopka. Regulation of HIF-3α premRNAsplicing by SR proteins. Abstracts of the meeting: Keystone symposia, Molecular,cellular, physiological, and pathogenic responses to hypoxia. 2008, p. 154.32. Y. Makino, A. Kanopka, K. Okamoto, L. Poellinger, M. Haneda Role of the RNAbinding protein p75 in hypoxia-inducible IPAS mRNA splicing. Abstracts of the meeting:Keystone symposia, Molecular, cellular, physiological, and pathogenic responses tohypoxia. 2008, p.165.© Biotechnologijos institutas 35

Metinis pranešimas – 20085. EDUKACINĖ IR VISUOMENINĖ VEIKLAVienas iš svarbiausių Lietuvos mokslo politikos elementų yra mokslo ir studijųintegracija, t.y. valstybinių mokslo institutų darbuotojų dalyvavimas universitetų edukacinėjeveikloje ir aktyvesnis universitetų dėstytojų dalyvavimas moksliniuose tyrimuose.5.1. Paskaitos ir pratybos universitetuose2008 m. šie instituto mokslininkai skaitė paskaitas ar vedė laboratorinius darbusuniversitetuose (lentelė 5.1.)Lentelė 5.1.Eil.Nr.1.Lektorius Kurso pavadinimas Universitetas,specialybė; kursasV. Šikšnys Baltymų-DNR sąveikosmechanizmaiVal. sk.VU, biochemija;magistrai, I k. 402.D. Matulis Baltymų biofizikinė chemijapaskaitos/pratybosVU, biochemija;magistrai, II k. 483.A. Gedvilaitė Molekulinė biologija sumolekulinės genetikospagrindais4. Genų inžinerijaVGTU, bioinžinerija;magistrai, I k. 90KTU,biotechnologija;magistrai, I k.325.Genų inžinerija, laboratoriniaidarbai6. Biotechnologija7.8.A. KanopkaBiotechnologija, laboratoriniaidarbaiKTU,biotechnologija;magistrai, I k.KTU, taikomojichemija;bakalaurai, IV k.KTU, taikomojichemija;bakalaurai, IV kS. Klimašauskas Nukleorūgščių chemija VU, biochemija;magistrai, I k.9. R. Gerasimaitė Nukleorūgščių chemijaVGTU, bioinžinerija;magistrai, I k.3232323232paskaitos,32pratybos© Biotechnologijos institutas 36

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Lektorius Kurso pavadinimas Universitetas,specialybė; kursasA. TiminskasBioinformatikateorinis/praktinis kursasVal. sk.VU, biochemija;magistrai, II k. 4810.Genoinformatikateorinis/praktinis kursasVU, genetika;magistrai, II k. 48Bioinformatikateorinis/praktinis kursasVGTU, bioinžinerija;magistrai, II k.4811.BioinformatikaKTU, biocheminėstechnologijos;magistrai, I k.7412.13.V. Michailovienė Chromatografijos pagrindai VGTU, bioinžinerija;bakalaurai, III k.M. Zaveckas Chromatografijos pagrindai VGTU, bioinžinerija;bakalaurai, III k.Molekulinė biologija12832VU, biochemija;magistrai, I k. 6414. K. SasnauskasGenų inžinerijaVU, biochemija;magistrantai, I k. 64Genų inžinerijos teoriniaipagrindai15. S. Gražulis Rentgenostruktūrinė analizė16. R. SukackaitėBaltymų chemija17. A. Žvirblienė ImunologijaBiochemijos laboratoriniaidarbai18. G. Žvirblis Genų inžinerijos pagrindaiVU, biologija;bakalaurai, IV k.VU, MIF,bioinformatika;bakalaurai, III k.VGTU, bioinžinerija;magistrai, I k.VU, biologija;bakalaurai, II k.323220264VGTU, bioinžinerija;bakalaurai, IV k. 32VU, biochemija;bakalaurai, IV k.32VU, biologija;bakalaurai, IV k. 32© Biotechnologijos institutas 37

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Lektorius Kurso pavadinimas Universitetas,specialybė; kursasVal. sk.19. E. Jachno20.Molekulinės biologijospagrindų laboratoriniai darbaiV. Petrikaitė Vaistų chemija (paskaitos irpraktikos darbai)VPU, biologija;bakalaurai, III k. 96KMU, farmacija;magistrai4865.2. Studentų laboratorinės pratybos InstituteInstituto laboratorijos yra geriau įrengtos negu universitetinės ir jis talkina universitetams,organizuodamas kai kuriuos biocheminio ar biologinio profilio laboratorinius darbus Institutolaboratorijose (lentelė 5.2).Lentelė 5.2Eil.Nr.Laboratorinių darbų pavadinimas(kuratorius)Studentai:universitetas,specialybė;kursasDarbųkuratorius (-ai);laboratorijaVal. sk.1. Genų inžinerijos praktika(darbų vadovai A. Bulavaitė,A. Ražanskienė, M. Plečkaitytė,N. Laurikietytė, R. Sukackaitė,R. Šapranauskas)VU,genetika,magistrai Ik.G. ŽvirbliskuratoriusEGIL905.3 Studentų mokslinė praktika InstituteInstituto mokslo darbuotojai dalyvavo Lietuvos mokslo tarybos kartu su ŠMM Mokslo irstudijų departamentu parengtame ESF projekte “Studentų mokslinės praktikos” (SMP) projekte,kurio tikslas skatinti akademinį jaunimą domėtis moksliniais tyrinėjimais, atskleisti mokslininkoprofesijos bei mokslininko karjeros perspektyvas, sudaryti galimybę įvairių Lietuvos regionų beiaukštųjų mokylų studentams susipažinti su moksliniais tyrimais geriausiose Lietuvosmokslininkų grupėse, kolektyvuose ir centruose. Duomenys apie studentus atlikusius mokslinępraktiką 2008 m. BTI, jų vadovus ir vykdytus darbus pateikti lentelėje 5.3.Lentelė 5.3Nr. Studento v. pavardėUniversitetas,specialybė1. Marius Rutkauskas,VU,biochemija, IB2. Ignas Černiauskas,VU,biochemija, IIBDarbo pavadinimasDNR rišančių baltymų raiška,gryninimas ir kristalizacijaNR metiltransferazių inžinerijaDarbo vadovas (-ai),laboratorijaGiedrė Tamulaitienė,BNSTLSaulius Klimašauskas,DMTLData07.01-08.3107.04-09.04© Biotechnologijos institutas 38

Metinis pranešimas – 20083. Andrius Ivanovas,VU,biochemija, IIB4. AleksandrOsipenko,VU, molekulinėbiologija, IIIB5. GabrielisKundrotas,VU, molekulinėbiologija, IIIB6. Jonas Dabrišius,VU,biochemija, IIIB7. Georgij Kostiuk,VU,biochemija, IVB8. Lina Malinauskaitė,VU,biochemija, IVB9. Simona Vasytė,VU, molekulinėbiologija, IIB10. Vaida Žilaitytė,VU, molekulinėbiologija, IIIB11. MindaugasLaganeckas,VU,MIF, IIIB12. Aliona Voroncova,VGTU,bioinžinerija, IVB13. Tomas Šinkūnas,VU,biochemija, IM14. Milda Žilinskaitė,VU, molekulinėbiologija, IM15. Agnė Valinčiūtė,VU, GMF,genetika, IMFermentų imobilizavimas antbaltyminių nešikliųMetodo mikroRNR žymėjimuikūrimasRaudonukės viruso sutrumpintokapsidės baltymo sintezė mielėseir antigeninių savybių tyrimaiPožeminių vandenų DNR virusųmetagenomų padauginiams,klonavimas ir sekvenavimasRestrikcijos endonukleazės BcnIsąveikos su DNR tyrimasBaltymų-ligandų sąveikosenergetikos tyrimas izoterminiutitravimo metoduFago T4 replikacijos sistemosgp41 baltymo analogai iš kitųgiminingų fagųHibridomų selekcija, klonavimasir specifiškumo tyrimaiCheminės bei struktūrinėsinformacijos susiejimas su mažųmolekulių rentgenostruktūriniųduomenų bazeBaltymų-ligandų sąveikosenergetikos tyrimas terminioposlinkio metoduChimerinės krienų peroksidazės,susintetintos mielėse S.cerevisiae, aktyvumo irpanaudojimo diagnostikaityrimaiNaujų fagų genų klonavimas irraiška E.coli ląstelėseParotito (kiaulytės) virusonukleokapsido baltymųfragmentų sintezė mielėse,gryninimas bei panaudojimasmonokloninių antikūnųkonstravimuiGervydas Dienys,BVTLGiedrius Vilkaitis,DMTLRasa Petraitytė,EGILAlma Gedvilaitė,EGILGiedrius Sasnauskas,BNSTLDaumantas Matulis,BVTLElena Manakova,BNSTLAurelija Žvirblienė,ILBLSaulius Gražulis,BNSTLDaumantas Matulis,BVTLAušra Ražanskienė,EGILAlma Gedvilaitė,EGILLinas Antoniukas,EGIL07.08-09.0507.14-09.1307.02-09.0207.01-08.3007.01-08-3107.01-08.3107.15-09.3007.01-08.3107.01-09.007.01-08.3107.01-08.3107.01-08.3007.01-08.31© Biotechnologijos institutas 39

Metinis pranešimas – 20085.4. Studentų baigiamieji darbaiGrupė universitetų studentų parengė baigiamuosius magistro arba bakalauro darbusInstitute (lentelė 5.4.). 2008 m. Institute parengta 18 baigiamųjų darbų - 3 magistro ir15 bakalauro, 2007 m. - 14 magistro ir 13 bakalauro, 2006 m. - 9 magistro ir 7 bakalauro, 2005m. - 11 magistro ir 15 bakalauro, 2004 m. - 15 baigiamųjų darbų - 7 magistro ir 8 bakalauro,2003 m. – 19 baigiamųjų darbų (8 magistro ir 11 bakalauro), 2002 m. – 20 baigiamųjų darbų (10magistro, 10 bakalauro).Lentelė 5.4MagistroEil.Nr.Studento v.pavardėUniversitetas,specialybė1. A. Petuškaitė VU,biochemija2. E. Čapkauskaitė VU,chemija3. I. Kairytė VGTU,bioinžinerijaDarbo pavadinimasNaujų galimybių tyrimaspritaikant žiurkėno poliomosviruso į virusus panašiasdaleles svetimų peptidųnešikliaisChinolino darinių,slopinančių karboanhidrazę,sintezėMonokloninių antikūnų priešHendra ir Nipah virusųnukleokapsidės baltymusgavimas ir charakterizavimasDarbo vadovas (-ai),laboratorijaA. Gedvilaitė,EGILV. Dudutienė,D. Matulis,BVTLA. Žvirblienė,ILBLBakalauroEil.Nr.Studento v.pavardėUniversitetas,specialybė1. G. Kostiuk VU,biochemija2. D. Kavaliauskas VU,biochemija3. M. Žilinskaitė VU,genetika,4. A. Valinčiūtė VU,molekulinėbiologijaDarbo pavadinimasRestrikcijos ebdonukleazesBcnI cpecifiškumas centrineibaziu porai: mutantukonstravimas ir analizėMikroRNR modifikacijanaudojant sintetinius AdoMetkofaktoriaus analogusMielių Saccharomycescerevisiae kamieno su hsp26geno delecija konstravimasKiaulytės virusonukleokapsidės baltymofragmentų sintezėDarbo vadovas (-ai),laboratorijaG. Tamulaitienė,V. Šikšnys,BNSTLG. Vilkaitis,DMTLA. Gedvilaitė,EGILL. Antoniukas,R. Slibinskas,EGIL© Biotechnologijos institutas 40

Metinis pranešimas – 2008BakalauroEil.Nr.Studento v.pavardėUniversitetas,specialybė5. D. Gritėnaitė VU, molekulinėbiologija6. D. Vaičaitytė VGTU,bioinžinerijaDarbo pavadinimasmonokloninių antikūnųatpažinimo vietų nustatymuiMielių sistemos, skirtoschimerinių į virusųnukleokapsidę panašių daleliųgamybai, konstravimasTermofilinių bakterijų recAgeno klonavimas ir ekspresija7. E. Biveinytė VU, biochemija Brasica napus šalčio atsakogenų BnICE, BnCBF3 irBnMYB15 raiškos analizė8. L. Malinauskaitė VU, biochemija Rekombinantinės žmogauskarboanhidrazės III gavimasir jungimosi susulfonamidiniais slopikliaistyrimas9. J. Vaitekūnas VU, biochemija Kviečių krakmolofermentinės hidrolizėstyrimas10. J. Kamarauskaitė VU, biochemija Kai kurių lipazių katalizėsįvairiose fazinėse sistemosetyrimas11. A. Voroncova VGTU,bioinžinerija12. D. Kazlauskas VU, molekulinėbiologija13. E. Bartaševičiūtė VU,biofizikaGlutationo-S-transferazėssistemos panaudojimas į Polopanašių kinazių ekspresijaiEscherichia coliDNR replikacijosprocesyvumo veiksniųįvairovės dvigrandės DNRvirusuose tyrimasbioinformatikos metodaisBaltymų sekų motyvų,atsakingų už sąveiką sueukariotų replikacijosprocesyvumo faktoriumiPCNA, tyrimas14. D. Jakovlevas VU, biochemija Restrikcijos modifikacijosfermento EcoR57IDarbo vadovas (-ai),laboratorijaM. Juozapaitis,EGILG. Žvirblis,M. Plečkaitytė,EGIL ir ILBLV. Kazanavičiūtė,EGILJ. Matulienė,D. Matulis,BVTLM. Meizeraitytė,G. Dienys,BVTLB. Surinėnaitė,BVTLJ. Matulienė,BVTLČ. Venclovas,BLČ. Venclovas,BLČ. Venclovas,A. Timinskas,© Biotechnologijos institutas 41

Metinis pranešimas – 2008BakalauroEil.Nr.Studento v.pavardėUniversitetas,specialybėDarbo pavadinimasstruktūrinis-funkcinischarakterizavimaskompiuteriniais metodais15. A. Tamulionis VU, biochemija DNR metiltransferaziųklasifikavimasDarbo vadovas (-ai),laboratorijaBLA. Timinskas,BL5.5. Parama kitoms įstaigoms, konsultacijosInstituto mokslininkai teikia metodinę paramą įvairių sričių darbuotojams, konsultuojajuos, sudaro galimybes padirbėti Instituto laboratorijose, susipažinti su naujausiais tyrimųmetodais, aparatūra ir t.t.Prof. dr. V. Šikšnys surengė seminarus tema „Restrikcijos endonukleazių struktūros irfunkcijos ryšys“ Vilniaus Universiteto Medžiagotyros ir taikomųjų tyrimų institute ir VUBiochemijos studijų programos II-o kurso studentams.Prof. S. Klimašauskas vykdo projektų 7BP People programme ekspertizes. Jis taip patyra Central European Journal of Biology ir Proceedings of the Estonian Academy of Sciencie,redakcinių kolegijų narys.Prof. K. Sasnauskas dalyvavo Nacionalinės mokslevių akademijos vasaros sesijoje(2008.06.22-07.07), kurioje perskaitė paskaitas „Eukariotų genomas ir jo tyrimas“ (4 val) ir„Augalų ir gyvūnų transgenezė“ (2 val.).Kartu su Švietimo ir mokslo ministerija, UAB „Fermentas“ irLMITKC sausio 3 d. surengta konferencija-seminaras chemijos mokytojams „Šiuolaikinėbiotechnologija“, 105 dalyviai. Joje instituto darbuotojai perskaitė tokius pranešimus:prof. K. Sasnauskas „Žmogaus genomo tyrimai“.dr. D. Matulis „Naujų vaistų paieška Lietuvoje ir JAV“.doktorantė R. Sukackaitė „Žalioji biotechnologija“.prof. G. Dienys „Pramoninė biotechnologija.“„Apvalaus stalo pasitarimas apie Pramoninę biotechnologiją Lietuvoje“ rugsėjo 4 d. organizuotaskartu su Europos biotechnologinių įmonių susivienijimu EuropaBio, Ūkio ministerija, Švietimo irmokslo ministerija; 55 dalyviai iš Lietuvos, 7 dalyviai iš užsienio šalių.prof. K. Sasnauskas joje perskaitė pranešimą „Biotechnologija Lietuvoje. Bendra apžvalga apiepramonę, mokslą ir studijas“.Seminaras biocheminės pakraipos moksleiviams, organizuotas kartu su UAB „Fermentas“;2008.11.25-26. Dalyvavo 46 Vilniaus Licėjaus ir Panevėžio J. Balčikonio gimnazijosmoksleiviai. Jie klausė paskaitas ir atliko praktikos darbus. Paskaitos, skaitytos BTI darbuotojų:dr. S. Gražulis „Baltymų struktūros tyrimai ir taikymai“.dr. A. Žvirblienė „Imunofermentinė analizė“.prof. G. Dienys „Biotechnologijos institutas ir Lietuvos biotechnologija“.© Biotechnologijos institutas 42

Metinis pranešimas – 2008Keturi BTI darbuojai paruošė praktikos darbus moksleiviams ir jiems vadovavo: dr. A.Timinskas, doktorantai R. Sukackaitė, I. Šežaitė ir E. Kazlauskas.prof. G. Dienys skaitė paskaitą „Lietuvos biotechnologija“, Panevėžio rajono biologijos irchemijos mokytojams; 2008.02.25, (apie 20 dalyvių) ir „Lietuvos moksleivių akademijosbiochemikų grupei, 2008.04.04 ( 14 moksleivių).prof. G. Dienys skaitė paskaitą „Paviršinio aktyvumo medžiagos“, Utenos apskrities moksleiviųklubo VIOLA dalyviams, Drūkšių ekolog. stotyje; 2008.06.26, 15 moksleivių.I. Matijošytė skaitė paskaitą „Biotechnologija skinasi kelią“, Linkuvos gimnazijos 90-mečiuiskirtoje konferencijoje; 2008.10.24, apie 300 dalyviųdr. B. Surinėnaitė skaitė paskaitą tema „Lipolytic Enzymes As Tool For Biotechnology“ studentųtarptautinėje konferencijoje COINS, 2008.03.11–15 VU GF, Vilnius. Apie 60 dalyvių.dr. A. Žvirblienė dalyvavo TPA seminare „7 BP paraiškų vertinimas“, 2008.06.10.dr. A. Žvirblienė dalyvavo ES 7BP Innovative Medicine Initiative projektų paraiškų vertinime2008.rugpjūtis-rugsėjis.dr. A. Žvirblienė dalyvavo dr. V. Borutaitės habilitacijos procedūros komisijoje, KMU,2008.10.24.dr. Č. Venclovas nuolat konsultuoja UAB „Fermentas“ darbuotojus baltymų sekų ir struktūrųanalizės bei jų modifikavimo klausimais.5.6. Visuomeninė veiklaV. Šikšnys yra:- Europos sąjungos 7-osios bendrosios mokslinių tyrimų programos ekspertas.LR švietimo ir mokslo ministro įsakymas Nr. ISAK-2198, 2006-11-21.- V. Šikšnys. Lietuvos mokslinių tyrimų infrastruktūrų plėtros strategijos darbo grupėsnarys. LR Švietimo ir mokslo ministro 2008-06-19 įsakymas Nr. ISAK-1841.- V. Šikšnys. Lietuvos mokslo premijų komisijos narys. LRV 2008-12-03 nutarimasNr. 1264.S. Klimašauskas yra:- Lietuvos mokslo premijų komiteto narys, Fizinių mokslų sekcija. LRV2003-02-07 nutarimas Nr. 205.S. Klimašauskas, Central European Journal of Biology, redakcinės kolegijos narys.S. Klimašauskas, Proceedings of the Estonian Academy of Sciencies, redakcinės kolegijos narys.A. Gedvilaitė yra:- Genetiškai modifikuotų organizmų priežiūros komiteto narė. LR Aplinkos ministroįsakymas 2003-03-20 Nr. 127.A. Ražanskienė yra:- Genetiškai modifikuotų organizmų ekspertų komiteto narė. LR Aplinkos ministroįsakymas 2003-04-25 Nr. 198.© Biotechnologijos institutas 43

Metinis pranešimas – 2008R. Abraitis yra:- Lietuvos ŠMM atstovas Europos žinių bioekonomikos tinkle. LR švietimo ir moksloministro įsakymai Nr.ISAK-313, 2006-02-21 ir Nr.ISAK-1379, 2006-06-29.D. Matulis yra:- visuomeninis LR Prezidento V. Adamkaus konsultantas emigracijos klausimais.- Ūkio Ministerijos MTEP Lisabonos strategijos darbo grupės narys.- Ūkio Ministerijos Verslo Lisabonos strategijos darbo grupės narys.K. Sasnauskas yra:- SKVC tudijų programų apeliacinės komisijos narys.G. Dienys yra:- Pramoninės biotechnologijos plėtros Lietuvoje 2007-2010 m. programos tarybos narysČ. Venclovas yra:- Darbo grupės, kurios tikslas - parengti Lietuvos mokslinių tyrimų infrastruktūrų plėtros2008-2018 metų gairių projektą, narys; LR švietimo ir mokslo ministro įsakymas Nr. ISAK-1841, 2008.06.19.- Darbo grupės, kurios tikslas – pateikti vertinimus ir siūlymus Lietuvos moksliniųskaičiavimų infrastruktūros plėtrai, narys; LR švietimo ir mokslo ministro įsakymas Nr. ISAK-2470, 2008.08.29.- LR Švietimo ir mokslo ministerijos sprendimu paskirtas į Matematikos ir informatikosinstituto tarybą; LR švietimo ir mokslo ministro įsakymas Nr. ISAK-3075, 2008.11.04.5.7. Mokslo populiarinimo ir publicistiniai straipsniaiVienas mokslo ir technologijų populiarinimo kelių – mokslininkų skaitomos viešospaskaitos ar skelbiami straipsniai šalies laikraščiuose ir žurnaluose.Leonas Grinius, Daumantas Matulis, Saulius Serva, Dalius Misiūnas, Ramūnas Valiokas.Modernios biotechnologijos saugaus naudojimo ir vystymo perspektyvos Lietuvoje. Vilnius,2007 [LT] [EN] (išspausdinta 2008).G. Dienys, I. Matijošytė. Biotechnologija Lietuvoje ir Europoje. Mokslas ir gyvenimas,Nr. 10, 2008.G. Dienys, I. Matijošytė. Apžvalginė diena apie biotechnologiją Lietuvoje ir Europoje.Mokslas ir technika, Nr. 9, 2008.M. Plečkaitytė. Gyvybės kodo tvarka. Problemos, Nr. 74, 2008.V. Šikšnys dalyvavo LTV laidoje „Negali būti“.S. Klimašauskas, interviu žurnalui „Chemical and Engineering News“© Biotechnologijos institutas 44

Metinis pranešimas – 20086. KONFERENCIJOS, SEMINARAI, VIZITAI6.1. Dalyvavimas konferencijose, simpoziumuose, parodose už Instituto ribų2008 m. šie Instituto darbuotojai skaitė pranešimus konferencijose ir seminaruose užsienyje(lentelė 6.1.).Lentelė 6.1Eil.Nr.Darbuotojo v.pavardėPranešimo pavadinimas, konferencijos vietaData1.“Novel structures and mechanisms of restrictionenzymes”. FASEB Summer Research Conferences,Nucleic acid enzymes, Vermont Academy, SaxtonsRiver, Vermont, USA; (kviest.)06.08-132.“How do restriction enzymes acquire specificitiesfor different target sites?” 33 FEBS congress/11IUBMB meeting, Athens, Greece; (kviest.)06.28-07.033.V. Šikšnys4.“Restriction modification systems”. CRISPRresearch mini-meeting, Berkeley, CA; (kviest.)07.24-255.“How PspGI/EcoRII-C and Ecl18kI restrictionenzymes acquire specificities for different targets”.3rd Annual Meeting of the MARIECURIEResearch Training Network “DNAEnzymes” Berlin, Germany; (kviest.)09.03-056.„Novel thaidiazole inhibitors of human carbonicanhydrases“. 21st Congress of IUcr, Japonija,Osaka; (stend.) 08.23-317.„A Tale of COD (selection, curation andmaintainance of the Crystallography OpenDatabase)“. 21st Congress of IUcr pre-congressworkshop „On New Routes to CrystallographicData Publication“, Osaka, Japonija ; (žod.)08.23© Biotechnologijos institutas 45

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Darbuotojo v.pavardė8. S. GražulisPranešimo pavadinimas, konferencijos vieta„A Tale of COD (selection, curation andmaintainance of the Crystallography OpenDatabase). Kyoto Crystallographic ComputingSchool, Kioto, Japonija; (žod.)Data08.18-239.„Engineering of restriction endonuclease BfiI withredirected substrate specificity by domain fusion“.MenuG meeting, Paryžius, Prancūzija; (žod.) 06.1910.M. Zaremba„Restriction endonuclease BfiI – a platform forprotein engineering“. FASEB Summer ResearchConference „Nucleic Acid Enzymes“, Saxton‘sRiver, Vermont, JAV; (stend.)06.08-1311.G. TamulaitisM. Zaremba„Target site discrimination by Ecl18kI andEcoRII-C/PspGI restriction enzymes“. FASEBSummer Research Conference „Nucleic AcidEnzymes“, Saxton‘s River, Vermont, JAV; (stend.)06.08-1312.G. SasnauskasB.A. Connolly,S.E.Halford,V. Siksnys,„The BfiI restriction enzyme can both cut DNA andfill in the resultant staggered ends“. FASEBSummer Research Conference, Nucleic acidenzymes, Vermont Academy, Saxton‘s River,Vermont, USA; (stend.)06.08-1313.D. Golovenko,S. Gražulis,E. Manakova,R. Sukackaitė„Novel thiadiazole inhibitors of human carbonicanhydrases“ konferencijoje „ScanBalt Forum andScanBalt biomaterials days“, Vilnius, Lietuva;(stend.)09.24-2614. D. Golovenko„Crystallographic studies of EcoRII-DNAcomplex: one enzyme - two DNA recognitionmechanisms“. 10th International EMBL PhDStudent Symposium: Decision-Making in Biology -Nature at the Crossroads, EMBL, Heidelberg,Vokietija; (stend.)10.23-25© Biotechnologijos institutas 46

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Darbuotojo v.pavardėPranešimo pavadinimas, konferencijos vietaData15.„MunI-TFO conjugate for mouse GAA genetargeting: an update“, Groningen, Olandija; (žod.)01.1916.A. Šilanskas„Restriction endonucleases for gene replacement“,Paris, Prancūzija; (žod.)06.1917. N. Laurikietytė18. A. Owsicka„The phage display of the BfiI DNA-bindingdomain: analysis of engineered proteins “,Groningen, Olandija; (žod.)01.19“Ecl18kI: structure-function relationships”. Off-Spring Meeting MCRTN “DNA Enzymes”,Newcastle, UK; (žod.) 04.08-1219. A.Owsicka„Ecl18kI: structure-function relationships”. 3rdAnnual Berlin Meeting MCRTN “DNA Enzymes”,Berlin, Vokietja; (žod.) 09.03-0520. A. OwsickaFASEB Summer Research Conferences, Nucleicacid enzymes; Vermont Academy, Saxtons River,Vermont, USA; (stend.) 06.08-1321. R Sukackaitė22.M. Gudeliauskaitė23.„The recognition domain of the BpuJI restrictionendonuclease in complex with cognate DNA at1.3 Å resolution“. 40 th crystallographic meeting“From molecules to medicines: Integratingcrystallography in drug discovery”, Erice, Italy;(stend.)„Reconstitution of Archaeal C/D Box sRNPs:Towards Synthetically Programmable Sequence-Specific Labelling of RNA“. 33rd FEBS Congress& 11th IUBMB Conference „Biochemistry of CellRegulation“; FEBS, Athens; Graikija; (stend.)„Programuojama RNR molekulių modifikacijaarchėjų C/D sRNP pagalba“. Lietuvos Biochemikų05.29–06.0806.28-07.0306.20-22© Biotechnologijos institutas 47

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Darbuotojo v.pavardėPranešimo pavadinimas, konferencijos vietaDraugijos X suvažiavimas-konferencija„Biochemija ir sistemų biologija“;LBD, Molėtai,Lietuva; (stend.)Data24. E. Kulberkytė25. S. Klimašauskas26. G. Lukinavičius27. Z. Liutkevičiūtė28. D. Kavaliauskas29. A. Plotnikova30. Z. Staševskij“Investigation of Genetic Interactions in DNARepair Pathways; training “course Genomebioinformatics techniques”. Life and HealthSciences Research Institute (ICVS), University ofMinho, Braga, Portugalija; (žod.)„Epigenome profiling via DNA methyltransferasedirectedlabeling”. MC-GARD conference“Interplay between genetics, epigenetics andmicroRNA”, Madrid, Ispanija; (žod.)„Targeted labeling of DNA via methyltransferasedirectedTransfer of Activated Groups (mTAG)”.33rd FEBS Congress & 11th IUBMB Conference„Biochemistry of Cell Regulation“, FEBS, Athens;Graikija; (stend.)„Cheminis išsuktų (ekstraspiralinių) citozinųidentifikavimas baltymo-DNR kompleksuose.Lietuvos Biochemikų draugijos X-asissuvažiavimas-konferencija “Biochemija ir sistemųbiologija”, Lietuvos biochemikų draugija, Lietuva;(stend.)“MikroRNR modifikacija naudojantmetiltransferazę HEN1”. X Lietuvos biochemikųdraugijos suvažiavimas-konferencija "Biochemijair sistemų biologija", Tolieja, Lietuva; (stend.)“HEN1-directed labeling of microRNA”. 7thScanBalt forumas ir Biomedžiagų dienos, Vilnius,Lietuva; (stend.)„Roles of two conserved arginines in a DNAcytosine-5 methyltransferase“; 7th ScanBalt Forum& Biomaterials Days 2008, Vilnius, Lietuva;(stend.)09.08-1305.04-0706.28-07.0306.20-2206.20-2209.24-2609.24-2631.A. Gedvilaitė“Generation of viral proteins in yeast”. 12thInternational Congress on Yeasts. Kyiv, Ukraine;(žod.)08.11-1532.„Recombinant virus-like particles and their 10.03-05© Biotechnologijos institutas 48

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Darbuotojo v.pavardėPranešimo pavadinimas, konferencijos vietaapplication for vaccine development anddiagnostics“. EHRLICH II –2nd WorldConference on Magic Bullets Celebrating the 100thAnniversary of the Nobel Prize Award to PaulEhrlich Nürnberg, Vokietija; (žod.)Data33.34.35.M. Juozapaitis,G. ŽvirblisA. Žvirblienė36. I. Šėžaitė37. A. Kanopka38. I. Pečiulienė39. I. Šėžaitė40. D. Bakonytė“Yeast expression system is an excellent tool forthe development for human virus diagnostics”.“PepCon 2008“ konferencija, Shen Zhen, Kinija;(stend.)„Development of serological assays for thedetection of viral infections using yeast-expressedviral antigens and monoclonal antibodies”. IISymposium. Standartization in Immunology,Poznan (Lenkija); (žod.)“Chimeric VLPs are highly efficient immunogensto generate monoclonal antibodies of desiredspecificity”. PepCon-2008, BIT Life Sciences,Shenzhen (Kinija); (stend.)“Monokloniniai antikūnai prieš paragripo trečiotipo viruso nukleokapsidės baltymą“. LietuvosBiochemikų draugijos konferencija „Biochemija irsistemų biologija“, Molėtai; (stend.)Regulation of HIF-3α pre-mRNA splicing by SRproteins. Keystone symposia „ Molecular, cellular,physiological, and pathogenic responses tohypoxia“, Vankuveris, Kanada; (stend.)“Molekulinių šaperonų įtaka hipoksijosinicijuojamo transkripcijos faktoriaus HIF-1αaktyvumo reguliacijai”, Lietuvos jaunųjųmokslininkų konferencija “Bioateitis – gamtos irgyvybės mokslų perspektyvos”, Lietuvos Mokslųakademija, Biologijos, medicinos ir geomokslųskyrius, Vilnius; (žod.)„Paramiksovirusų antigeninės struktūros tyrimai“.Lietuvos jaunųjų mokslininkų konferencija“Bioateitis – gamtos ir gyvybės mokslųperspektyvos”, Lietuvos Mokslų akademija,Biologijos, medicinos ir geomokslų skyrius,Vilnius; (žod.)“Lietuvoje cirkuliuojančios M. tuberculosispopuliacijos tyrimas, atliekant genotipavimąIS6110 RFIP ir spoligotipavimo analizės metodai”.„Lietuvoje paplitusių patogeniškų bakterijųatsparumas antibiotikams: molekulinė04.28-3011.27-2904.22-2406.20-2201.15-2012.0512.0512.23© Biotechnologijos institutas 49

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.41.42.43.44.45.Darbuotojo v.pavardėE. Kazlauskas,I. Cikotiene,J. Matuliene,A. Zubriene,J. Jachno,J. Torresan,V. Michailoviene,D. MatulisP. Cimmperman,L. Baranauskienė,J. Matulienė,D. MatulisD. Matulis,E. Kazlauskas,L. Baranauskienė,I. Čikotienė,V. DudutienėJ. Matulienė,A. Zubrienė,J. Jachno,J. Torresan,V. Michailovienė,P. Cimmperman,D. Lingė,M. Zaveckas,V. Petrikaitė,H. Šebėka,L. GriniusS. Gražulis,L. Baranauskienė,E. Manakova,R. Sukackaitė,D. Golovenko,G. Tamulaitienė,D. MatulisE. Kazlauskas,I. Cikotiene,J. Matuliene,A. Zubriene,J. Jachno,J. Torresan,V. Michailoviene,D. Matulis46. E. Kazlauskas,Pranešimo pavadinimas, konferencijos vietaepidemiologija ir plitimo prevencija” 2008 m.ataskaitinė konferencija, Vilniaus Universitetas,Vilnius; (žod.)„Resorcinol class Hsp90 inhibitor bindingthermodynamics and the effect on cancerous cells“.The 4 th International Conference on the Hsp90Chaperone Machine, Bavaria, Vokietija; (stend.)“A general model to describe protein thermalstabilization and destabilization by ligands”. 2ndInternational Symposium on Biothermodynamics“,Frankfurtas prie Maino, Vokietija; (stend.)“Chaperone Hsp90 and carbonic anhydrase IXinhibitors as anticancer agents“. 7th ScanBaltForum & Biomaterial Days, Vilnius; (žod.)„Novel thiadiazoles inhibitors of human carbonicanhydrases“. 7th ScanBalt Forum & BiomaterialDays, Vilnius, Lietuva; (stend.)„Resorcinol class Hsp90 inhibitor bindingthermodynamics and the effect on cancerous cells.The 4 th International Conference on the Hsp90Chaperone Machine, Bavaria; (žod.)„Resorcinol class Hsp90 inhibitor bindingData10.02-0602.21-2209.24-2609.24-2610.02-0610.02-06© Biotechnologijos institutas 50

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.47.48.49.Darbuotojo v.pavardėI. Cikotiene,J. Matuliene,A. Zubriene,J. Jachno,J. Torresan,V. Michailoviene,V. Petrikaite,L. Grinius,D. MatulisB. Surinėnaitė,V. Bendikienė,G. DienysB. Surinėnaitė,V. Bendikienė,J. Kamarauskaitė,G. DienysB. Surinenaite,G. Prasmickienė,E. Stratilatovas,J. Didžiapetrienė50. Č. Venclovas51.52.53.54.55.A. Timinskas,Č. VenclovasM. Margelevičius,Č. VenclovasA.Timinskas,Č. VenclovasM. Margelevičius,Č. VenclovasM. Margelevičius,Č. VenclovasPranešimo pavadinimas, konferencijos vietathermodynamics and the effect on cancerous cells“.The 4 th International Conference on the Hsp90Chaperone Machine, Bavaria, Vokietija; (stend.)Data„Lipoliziniai fermentai biotechnologijoje“. LBD Xsuvažiavimas-konferencija “Biochemija ir sistemų 06.20-22biologija“, Molėtai; (žod.)„Lipolytic enzymes as tool for biotechnology“.Gordon Research Conference „Biocatalysis“,Shmitfield, RI, JAV; (stend.) 07.06-11“Antioxidative System Status of Colorectal CancerPatients under Surgical Treatment and BloodTransfusion”. European MultidisciplinaryColorectal Cancer Congress, Berlin, Germany;(stend.)„Template-based modeling using automatic toolsand human expertise“, The 8th Meeting on CriticalAssessment of Techniques for Protein StructurePrediction (CASP8), Cagliari, Italija; (žod.)„Computational analysis of putative Type I and IIIrestriction-modification systems in bacterialgenomes“; Bioinformatics 2008 Conference,Varšuva, Lenkija; (stend.)„A novel protein homology detection method basedon the analytical theory of profile comparisons“;Bioinformatics 2008, SocBiN, Varšuva, Lenkija;(stend.)„Computational analysis of putative Type I and IIIrestriction-modification systems in bacterialgenomes“; ECCB’08 European Conference onComputational Biology, Cagliary, Italija; (stend.)„A novel protein homology detection method basedon the analytical theory of profile comparisons“;ECCB’08 European Conference on ComputationalBiology; Cagliary, Italija; (stend.)„COMA: a novel protein homology detectionmethod based on the analytical theory of profilecomparisons“; The 8th Meeting on Critical02.24–2612.03-0704.24 – 2704.24–2704.22–2609.22–2612.03-07© Biotechnologijos institutas 51

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Darbuotojo v.pavardėPranešimo pavadinimas, konferencijos vietaAssessment of Techniques for Protein StructurePrediction (CASP8), Quartu S. Elena, Sardinija,Italija; (stend.)Data6.2. Vizitai į užsienio institucijasTrumpalaikių vizitų užsienyje metu Instituto darbuotojai atlieka moksliniuseksperimentus, aptaria tyrimų rezultatus bei planus, pasidalina patirtimi. Tokiais tikslais 2008 m.buvo išvykę:D. Matulis, Prof. Martin Maier laboratorijoje, University of Tubingen, Vokietija; 2008.02.M. Margelevičius, University of Bologna; 9th Bologna Winter School: Grand challenges inComputational Biology;, Bologna, Italy; 02.11-15.S. Klimašauskas; Biotechnologijos parkai, Cambridge and London; JK; 05.18-22. UniversitéPaul Sabatier, CNRS-UMR 5100, Bat IBCG, Toulouse, Prancūzija; 06.17-20.G. Žvirblis Biotechnologijos parkai, Cambridge and London; JK; 05.18-22.M. Juozapaitis, G. Žvirblis, ETH Zürich, Institute of Pharmaceutical Sciences, Zürich;Šveicarija; 04.15-16A. Kanopka dalyvavo ES 6 BP ruošiamo projekto partnerių susitikime, Smolenice Castle,Bratislava, Slovakija; 04.23-25.G. Dienys, European Federation of Biotechnology, Section of Applied Biocatalysis, Hamburg,Vokietija; 08.29-31R. Sukackaitė, Instituto de Tecnologia Química e Biológica;,Oeiras, Portugalija; 10.4-11.A. Kanopka ir G.Vilkaitis dalyvavo FP 6 programos "Euroxy" kursuose Monsummano Terme,Italija; 10.22-25.G. Sasnauskas, M. Zaremba ir A. Owsicka. The University of York, York, Didžioji Britanija;12.10-13.D. Golovenko, S. Gražulis, R. Sukackaitė, G. Tamulaitienė, EMBL, DESY; Hamburg;Vokietija; 12. 01-13.© Biotechnologijos institutas 52

Metinis pranešimas – 20086.3. Bendrainstitutiniai seminaraiBendrainstitutiniai seminarai yra svarbi mokslininkų lavinimo, tobulinimosi irbendravimo forma.Duomenys apie 2008 m. surengtus bendrainstitutinius seminarus pateikti lentelėje 6.2.Lentelė 6.2Eil. Nr. Darbuotojo v,pavardėPranešimo pavadinimas1. N. Laurikietytė Endonukleazės MutH struktūra. MutH giminigosrestrikcijos endonukleazės2. Z. Liutkevičiūtė 5-hidroksimetilcitozinas (5hmC). Paplitimas irbiologinė reikšmė".Data01-3002-283. L. Baranauskienė: Baltymų – DNR sąveikos tyrimai kalorimetriniais 02-29metodais4. S. Jurėnaitė-UrbanavičienėNuo sintetinių genų iki genomų 03-155. M. Gudeliauskaitė Kreipiančiosios RNR: funkcija ir reikšmė 03-286. I. Pečiulienė Pre-iRNR brendimas eukariotuose: splaisingas 04-047. J. Višinskienė PCNA - replikacijos šakutės maestro 05-308. T. Radzvilavičius Baltymų modifikacija prijungiant SUMO bei josreikšmė ląstelinių procesų valdymui9. D. Golovenko Augalų transkripcijos faktorių superšeima B3 irrestrikcijos endonukleazė EcoRII10. L. Baranauskienė Karboanhidrazės ir jų vaidmuo ligųmechanizmuose11. G. Gasiūnas RNR interferencijoje dalyvaujančiosendonukleazės06-0607-1809-0509-1212. I. Pečiulienė Indukuojamos pluripotentinės kamieninės ląstelės 10-0313. Z. Liutkevičiūtė Daugiafunkcinis MRN kompleksas: dvigrandžiųDNR trūkių taisymas ir signalo perdavimas12-1914. J. Višinskienė cDNR klonavimas. Dabartis ir ateitis 12-306.4. Instituto svečių paskaitosKasmet institutą aplanko užsienio ir Lietuvos mokslininkai. Svečių paskaitos teikiagalimybių atnaujinti ir pagilinti žinias, pasikeisti moksline patirtimi.Duomenys apie 2008 m. įvykusius seminarus, kuriuose Lietuvos ir užsienio mokslininkaiskaitė paskaitas ir informacinius pranešimus pateikti lentelėje 6.3.© Biotechnologijos institutas 53

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.1. dr. Eglė Juškevičiūtė, Department ofPathology, Anatomy and Cell Biology,Thomas Jefferson University,Philadelphia2. prof. habil. dr. Leonas Valkūnas,Fizikos Institutas3. dr. Alistair Elfick,University of EdinburghLentelė 6.3.Kas skaitė ir iš kur atvyko? Paskaitos pavadinimas Data4. Doktorantė Agnė Alminaitė,Helsinkio universiteto Haartmaninstitutas5. dr. Béatrice Clouet d'Orval,Le équipe de Métabolisme d’ARN chezles Procaryotes, LMGM-CNRS,Université Paul Sabatier Toulouse,France6. dr. Jaunius Urbonavičius,Universite Libre de Bruxelles,Laboratoire de MicrobiologieTemporal and Functional Profile ofthe Transcriptional RegulatoryNetwork01-04Fotoaktyvių baltymų spektroskopija 02-01Synthethic Biology Using StandardBiological Parts - with anIntroduction to iGEMHantavirusų nukleokapsidėsbaltymo oligomerizacijaThe RNaseJ-type ribonuclease iswidely distributed in prokaryoticgenomes and has an 5' to 3'exoribonucleolytic activity inEuryarchaeaRibosominių RNR modifikacijos irjų susidarymą katalizuojantysfermentai7. dr. Robert Owens Viroids: from molecular biologyto diagnostics8. prof. Miguel X. Fernandes Computational Methods Applied toDrug Design02-2202-2205-2706-2508-0708-146.5. Svečių vizitai2008 m. Institutą aplankiusieji užsienio mokslininkai ir oficialūs asmenys:Dr. B.Clouet-d‘Orval, Université Paul Sabatier, Toulouse, Prancūzija, 2008.05.26-28Nataliya Barinova, Institute of Molecular Genetics, Maskva, Rusija., 2008.04.14-05.12Dr. R.A.Owens, research chemist, Molecular Plant Pathology Laboratory, Plant SciencesInstitute, Beltsville Agricultural Research Center, Beltsville, JAV, 2008.08.2-9Aneta Bialkowska, Technical University of Lodz, Lodz, Lenkija, 2008.09.05Ewa Gromek, Technical University of Lodz, Lodz, Lenkija, 2008.09.05Prof. Maurizio Botta, head of lab, University of Siena, Italy, 2008.10.29-30Dr. Daniele Castagnolo, research chemist, University of Siena, Italy, 10.29-30Prof. Martin Schwemmle, head of lab., Department of Virology, University of Freiburg,10.29-30Dr. Daniel Mayer, senior researcher, Department of Virology, University of Freiburg, 10.29-30© Biotechnologijos institutas 54

Metinis pranešimas – 2008Dr. Arnold Martin, senior researcher, Department of Virology, University of Freiburg, 10.29-30Dr. Ulrich Kessler, head of lab, ETH Zürich Institute of Pharmaceutical Sciences, Zürich,Šveicarija, 10.29-30.Dr. Charlene Ranadheera, senior researcher, ETH Zürich Institute of Pharmaceutical Sciences,Zürich, Šveicarija, 10.29-30Dr. Joachim Vogt, senior researcher, ETH Zürich Institute of Pharmaceutical Sciences, Zürich,Šveicarija, 10.29-30Prof. Robert E.Davis, Head of lab., Molecular Plant Pathology Laboratory, Plant SciencesInstitute, Beltsville, JAV, 2008.11.8-27© Biotechnologijos institutas 55

Metinis pranešimas – 20087. LABORATORIJŲ VEIKLA7.1. Baltymų-nukleorūgščių sąveikos tyrimo laboratorijaLentelė 7.1.Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnis1. Virginijus Šikšnys dr.,prof.Pareigosvyriaus. mokslo darb.-laboratorijos vedėjas2. Saulius Gražulis dr. vyresn. mokslo darb.3. Giedrius Sasnauskas dr. vyresn. mokslo darb.4. Elena Manakova dr. mokslo darb.5. Mindaugas Zaremba dr. mokslo darb.6. Giedrė Tamulaitienė dr. mokslo darb.7. Gintautas Tamulaitis dr. jaun. mokslo darb.Pastabos8. Rimantas Šapranauskas dr. mokslo darb. nuo 07.01iki konkurso9. Sonata Jurėnaitė-Urbanavičienėdr. jaun. mokslo darb. iki 09.0110. Arūnas Šilanskas jaun. mokslo darb.11. Rasa Sukackaitė doktorantėbioinžinierė,jaun. mokslo darb.12. Dmitrij Golovenko doktorantas,bioinžinierius,jaun. mokslo darb.13. Neringa Laurikietytė doktorantė,bioinžinierė14. Giedrius Gasiūnas doktorantas,bioinžinieriusnuo 10.01 ikikonkursonuo 10.01 ikikonkurso15. Aurimas Baranauskas doktorantas nuo 10.0116. Sigitas Palikša doktorantas nuo 10.0117. Georgij Kostiuk studentas,laborantas0,5 etato, nuo07.10.01iki 08.12.31© Biotechnologijos institutas 56

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnis18. Virginija Jovaišaitė studentė,laborantė19. Justas Butkus studentas,laborantas20. Ania Tunevič laborantėPareigosPastabos0,5 etato, nuo 10.270,5 etato nuo 07.082008 m. rentgeno spindulių difrakcijos metodu nustatytos BpuJI DNR surišančio domenoir DNR komplekso ir restrikcijos endonukleazės PspGI-DNR komplekso erdvinės struktūros.BpuJI N-galinio domeno erdvinė struktūra atskleidė netikėtus panašumus su gamtinių nikaziųDNR surišančiais domenais. PspGI struktūra parodė, kad šis fermentas, sąveikaudama sus savoatpažinimo seka „išsuka“ centrinę bazių porą atpažinimo sekoje. Biocheminiai tyrimai parodė,kad sekos atpažinimui PspGI ir jo izošizomeras EcoRII-C naudoja dvigubos patikrosmechanizmą. Parodyta, kad restrikcijos endonukleazė BfiI šalia DNR hidrolizės, katalizuoja irnuo DNR matricos priklausomą nukleotido įjungimo reakciją.7.2. DNR modifikacijos tyrimų laboratorija (DMTL)Lentelė 7.2Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnis1. Saulius Klimašauskas habil.dr.,prof.Pareigosvyriaus. mokslo darb.,laboratorijos vedėjas2. Giedrius Vilkaitis dr vyresn. mokslo darb.Pastabos3. Dalia Daujotytė dr. mokslo darb. stažuotė iki 09.09.304. Gražvydas Lukinavičius dr. mokslo darb. stažuotė nuo08.09.01 iki09.08.315. Viktoras Masevičius dr. stažuotojas,mokslo darb.6. Edita Kriukienė dr. mokslo darb.7. Rūta Gerasimaitė jaun. mokslo darb.8. Giedrė Urbanavičiūtė jaun. mokslo darb.9. Zdislav Staševskij jaun. mokslo darb.10. Zita Liutkevičiūtė doktorantė,iki 2008.04.300,5 etato nuo 05.06iki konkurso© Biotechnologijos institutas 57

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnisbioinžinierė11. Miglė Gudeliauskaitė doktorantė,bioinžinierėPareigos12. Eleonora Kulberkytė jaun. mokslo darb.,doktorantė,bioinžinierė13. Simona Jachimovičiūtė bioinžinierė,doktorantė14. Tomas Radzvilavičius doktorantas15. Aleksandra Plotnikova bioinžinierėnuo 06.11nuo 10.01nuo 06.11nuo 10.01Pastabos16. Lina Juknaitė laborantas (studentė) 0,5 etato nuo 08.0417. Igoris Čajevskis laborantas (studentas) 0,5 etato nuo 02.0118. Ala Žilionienė laborantėGenomo DNR metilinimas vaidina svarbų vaidmenį reguliuojant genų raišką, ir yrasusijęs su daugeliu žmogaus kompleksinių ligų. Nors DNR metilinimo sąlygojami biologiniaiefektai susilaukia augančio susidomėjimo, platesnius tyrimus riboja esamų analizės technologijųnetobulumas. Todėl, tęsiant ankstesnių metų darbus, buvo siekiama sukurti efektyvias platausmasto genomo metilinimo lygio tyrimo priemones, kurios galėtų tapti naujo epigenetinių ligųtyrimo ir diagnostikos metodo pagrindu. Sprendžiant šį uždavinį, buvo ištirti ir pasiūlyti naujųkofaktorių, turinčių etino funkcinę grupę, sintezės keliai iš komerciškai prieinamų reagentų.Gauti atitinkami tarpiniai junginiai, leidžiantys vienu sintetiniu žingsniu gauti kofaktorių, nešantįreporterinę biotino grupę. Baltymų inžinerijos metodais buvo sukonstruoti HpaII ir SssI DNRmetiltransferazių mutantai, gebandys vykdyti alkilinimo reakciją nuo AdoMet analogų. Gautimutantai buvo panaudoti, optimizuojant genominės DNR nemetilintos frakcijos žymėjimo beipraturtinimo procedūras.MikroRNR yra trumpos 21-24 nukleotidų ilgio, baltymus nekoduojančios RNRmolekulės, reguliuojančios apie trečdalio žinduolių genų ekspresiją. Specifinės mikroRNR yrabūdingos konkretiems audiniams ir organizmo vystymosi stadijoms. Sutrikus šių mikroRNRraiškai atsiranda organizmo patologijos, gali išsivystyti vėžys.Augaluose aptinkamos mikroRNR ir siRNR yra modifikuojamos metiltransferazės HEN1,kuri perneša metilo grupę nuo kofaktoriaus S-adenozil-L-metionino ant mikroRNR 3‘galiniųribozių 2’-OH grupių. Norint geriau suprasti veikimo mechanizmą ir apibrėžti biologines HEN1funkcijas, yra tęsiami metiltransferazės tyrimai in vitro: nustatyti laukinio tipo ir mutantiniųbaltymų enzimatiniai parametrai, ištirtas kinetinis reakcijos veikimo mechanizmas.Bioinformatiniais metodais HEN1 metiltransferazėje nustatyti trys domenai, galintys sąveikautisu RNR. Sukurti baltymai, neturintys tiriamų domenų, ar su pakeistom aminorūgštimis, spėjamaisvarbiomis sąveikai su RNR. Tikimasi, kad detalus mutantų tyrimas padės suprasti, kodėl HEN1būtini net trys RNR surišantys motyvai ir nuspėti jų funkcijas.© Biotechnologijos institutas 58

Metinis pranešimas – 20087.3. Prokariotų genų inžinerijos laboratorija (PGIL)Prokariotų genų inžinerijos laboratorija panaikinta 2008-05-01 (instituo tarybos sprendimas,2008-04-09).Lentelė 7.3.Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnisPareigos1. Kornelijus Stankevičius dr. vyresnysis mokslo darb.,l. e. laboratorijos vedėjopareigas2. Sonata Jurėnaitė-Urbanavičienėiki 06.30Pastabosdr. jaun. mokslo darb. perkelta į BNSTLnuo 08.05.013. Eglė Kriukienė dr. jaun. mokslo darb. perkelta į DMTLnuo 09.01.014. Rimantas Šapranauskas dr. jaun. mokslo darb. perkeltas į BNSTLnuo 08.05.015. Jolanta Giedrienė jaun. mokslo darb. iki 04.306. Eglutė Rudokienė bioinžinierius perkelta į EGILnuo 08.05.017. Kristina Jatkovskaja laborantė iki 05.10© Biotechnologijos institutas 59

Metinis pranešimas – 20087.4. Eukariotų genų inžinerijos laboratorija (EGIL)Lentelė 7.4Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnis1. Kęstutis Sasnauskas habil.dr., prof.Pareigosvyriaus. mokslo darb.2. Gintautas Žvirblis dr. vyresn. mokslo darb.,laboratorijos vedėjasPastabos3. Alma Gedvilaitė dr. vyriaus. mokslo darb. nuo 07.01 ikikonkurso4. Aušra Ražanskienė dr. vyresn. mokslo darb.5. Edita Mištinienė dr. vyresn. mokslo darb. 0,25 etatonepagr. darb.,vaiko priež. atost.iki 10.03.046. Rimantas Slibinskas dr. vyresn. mokslo darb.7. Rokas Abraitis dr. mokslo darb.8. Asta Abraitienė dr. mokslo darb. atost. vaikopriežiūrai iki09.07.239. Vaiva Kazanavičiūtė dr. stažuotoja,mokslo darb.10. DanguolėKavaliauskaitėiki 2008.04.30,nuo 05.06 ikikonkursodr. stažuotoja iki 2008.04.3011. Aistė Bulavaitė dr. jaun. mokslo darb.12. Rasa Petraitytė dr. jaun. mokslo darb.13. Linas Antoniukas dr. jaun. mokslo darb.,mokslo darb.14. Rimantas Šiekštelė jaun. mokslo darb.15. Raimundas Ražanskas jaun. mokslo darb.16. Eglė Rudokienė bioinžinierė17. Mindaugas Juozapaitis doktorantas,jaun. mokslo darb.nuo 2008.10.08 ikikonkursonuo 10.01 ikikonkurso© Biotechnologijos institutas 60

Metinis pranešimas – 200818. Eglė Aleksaitė doktorantė,bioinžinierė19. Evaldas Čiplys doktorantas,bioinžinierius20. Rita Vorobjovienė doktorantė,bioinžinierius0,5 etatonuo 09.17nuo 10.0121. Agnė Petuškaitė laborantė (studentė) 0,5 etato iki 06.3022. Ieva Strodomskytė laborantė (studentė) 0,5 etato iki 06.30ir nuo11.0423. Lina Kungytė laborantė (studentė) 0,5 etato24. Tomas Šinkūnas laborantas (studentas) 0,75 etato25. Dalia Gritėnaitė laborantė (studentė) 0,5 etato26. Jonas Dabrišius laborantas (studentas) 0,5 etato27. Agnė Valinčiūtė laborantė (studentė) 0,5 etato28. Milda Žilinskaitė laborantė (studentė) 0,5 etato29. Raminta Jonikaitė laborantė (studentė) 0,5 etato nuo 05.14iki 09.2130. Dovilė Vaičaitytė laborantė (studentė) 0,5 etato31. Erna Biveinytė laborantė (studentė) 0,5 etato 01.0232. Rugilė Stanyte laborantė (studentė) 0,5 etato 01.0233. Deimantė Šimatė laborantė (studentė) 0,5 etato nuo 03.2034. Gabrielis Kundrotas laborantas (studentas) 0,5 etato nuo 05.0635. Gelena Kondratovič laborantė36. Elena Čeberakienė laborantė 0,75 etato2008 m. buvo vystoma tęstinė tema „Chimerinių ir natyvių virusinių baltymų sintezėmielėse ir jų panaudojimas“, apimanti visus su virusais susijusius laboratorijos projektus.Konstruojant į virusus panašias daleles žiurkėno poliomos viruso VP1 baltymo dvejosepozicijose buvo įterpta hOCT3 (angl. human Organic cation transporter 3) ekstraląstelinė kilpa irtrys trumpesni jos fragmentai. Sukonstruoti baltymai buvo susintetinti mielėse ir išgryninus buvonustatyta, kad jie formuoja virusus primenančias daleles, kurios buvo perduotos Imunologijos irląstelės biologijos laboratorijai ir naudojamos pelių imunizacijai ir monokloninių antikūnųgamybai.Pradėjus EK 7-sios programos projektą, tiriantį gripo viruso RNR polimerazės veikimą irpotencialius šio fermento inhibitorius, buvo sėkmingai ekspresuoti mielėse gripo virusopolimerazės subvienetai PA ir PB1. Išgryninus PA subvienetą parodyta, kad jis tinka inhibicijos© Biotechnologijos institutas 61

Metinis pranešimas – 2008eksperimentams ir susirišimo su PB1 testams. Tai leidžia projekto partneriams paruoštiinhibitorių paieškos sistemą, tinkančią masinei inhibitorių efektyvumo atrankai.Tęsiant EK 6-sios programos projektą buvo sukurti viruso VSV glikoproteino producentaibei chimerinės virusus primenančios dalelės, eksponuojančios VSV glikoproteino B-ląsteliųepitopus, LCMV viruso glikoproteino T-ląstelių epitopą bei HCV glikoproteinųneutralizuojančius epitopus. Bendradarbiaujant su Friedrich Loffter-Institute kolegomis, sukurtosir dalinai charakterizuotos virusus primenančios dalelės, eksponuojančios modelinį LCMV CTLepitopą. Analizuojami in vivo ir in vitro eksperimentai su šiomis chimerinėmis VLP paveiktomispelių dendritinėmis ląstelėmis, tiriamas imunizacijos jomis poveikis vėžinių auglių augimuipelėse.Tiriant sodo augalų ligų sukėlėjų viroidų ir fitoplazmų paplitimą kartu su kolegomis išBotanikos instituto ir LSDI buvo nustatyti vaismedžiai infekuoti viroidais ir fitoplazmomis.Analizuojamas anksčiau rastas iki šiol Lietuvoje nepasitaikęs fitoplazmos porūšis.Bendradarbiaujant su LSDI ir LŽŪU konstruojami šalčiui atsparūs rapsai ir sodo augalai.Analizuojami rapso Brassica napus CBF/DREB šalčio atsako kelio genai, panaudojant naujusvektorius, pasižyminčius padidinta antocianų produkcija ir stabilumu vaisinių augalų bei ląsteliųkultūrose.© Biotechnologijos institutas 62

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.7.5. Biotermodinamikos ir vaistų tyrimo laboratorija (BVTL)Vardas, pavardėMokslinislaipsnisPareigos1. Daumantas Matulis dr. vyriaus. mokslo darb.,laboratorijos vedėjas2. Gervydas Dienys habil.dr.,prof.vyresn. mokslo darb.3. Birutė Surinėnaitė dr. vyresn. mokslo darb.4. Inga Čikotienė dr. stažuotoja,vyresn. mokslo darb.5. Asta Zubrienė dr. mokslo darb.6. Virginija Dudutienė dr. mokslo darb.7. MindaugasZaveckasdr.mokslo darb.0,5 etatoPastabosiki 2008.04.30,nuo 05.06Lentelė 7.58. Vilma Petrikaitė dr. mokslo darb. nuo 07.01 iki kokurso9. PiotrasCimmpermandr.stažuotojas,mokslo darb.iki 2008.04.30,nuo 05.06 ikikonkurso10. Inga Matijošytė dr. jaun. mokslo darb. nuo 08.05.0111. MeilutėMeizereitytėdr.jaun. mokslo darb.12. Henrikas Šebėka dr. jaun. mokslo darb.13. VilmaMichailovienėjaun. mokslo darb.14. Jelena Jachno jaun. mokslo darb.15. Jolanta Torresan jaun. mokslo darb. nuo 07.01 ikikonkurso16. Lina Baranauskienė doktorantė,bioinžinierė17. Darius Lingė informacinių sistemųinžinierius18. Tatjana Romaškevič bioinžinierė iki 03.3119. EigidijusKazlauskasdoktorantas,bioinžinierius© Biotechnologijos institutas 63

Metinis pranešimas – 2008Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnisPareigos20. Rūta Kulbokaitė bioinžinierė 0,5 etatoPastabos21. Edita Čapkauskaitė laborantas 0,5 etato, nuo 09.3022. Zigmas Toleikis laborantas (studentas) 0,5 etato, iki 06.3023. Dovilė Šapokaitė laborantė (studentė) 0,5 etato24. Edita Kleinaitė laborantė (studentė) 0,5 etato25. JustasVaitekūnas laborantas (studentas) 0,5 etato26. VytautasIešmantavičius27. JūratėKamarauskaitė28. Agnė Liniauskaitė/Bendikienėlaborantas (studentas) 0,5 etato iki 08.29laborantė (studentė) 0,5 etato iki 06.30laborantė (studentė)0,5 etato29. Lina Malinauskaitė laborantė (studentė) 0,5 etato30. Aliona Voroncova laborantė (studentė) 0,5 etato31. Audrius Ruškulis laborantas (studentas) 0,5 etato 02.1532. Gabrielė Stakaitytė laborantė (studentė) 0,5 etato nuo 06.16iki 08.2933. Leokadija Davidian laborantėVykdomi tyrimai aktyvių medžiagų su antivėžinėmis savybėmis paieškos srityje.Pasirinkti molekuliniai taikiniai – žmogaus karboanhidrazės bei šaperonas Hsp90 – ir ieškomosjuos slopinančios mažamolekulinės medžiagos. Medžiagos gali būti išskirtos iš natūralių šaltiniųarba chemiškai susintetintos. Aptiktų aktyvių medžiagų jungimasis su baltymais taikiniais, kuriepagaminti molekulinio klonavimo būdu laboratorijoje, matuojamas biofizikiniais ITC ir TSmetodais, nustatomos kokristalinės molekulinio komplekso struktūros, tiriamas aktyvių medžiagųpoveikis vėžinėms žmogaus ląstelėms. Pagrindiniai rezultatai paskelbti mokslinėse publikacijose.Bendradarbiaujant su mokslininkais iš Vokietijos pradėti HSA ir dendrimerų sąveikos tyrimai.Pradėtas D. Matulio ir bendraautorių sukurtos sąveikos energijos skaičiavimo funkcijosintegravimas į DOCK6.2 programą.Buvo eksperimentiškai tirta ligandų įtaka baltymų slėginiam stabilumui. Buvotobulinamas slėginio postūmio modelis, aprašantis baltymas-ligandas sistemos slėginį stabilumą.Taikant šį modelį baltymo lydymosi slėgio priklausomybės nuo pridėto ligando koncentracijosaprašymui ir naudojant termodinaminius parametrus, nustatytus ITC bei TS būdu, galimanustatyti tūrio ir suspaudžiamumo pokyčius dėl ligando jungimosi. Tai yra naujas, netiesioginis,metodas leidžiantis nustatyti minėtus termodinaminius parametrus. Rengiama mokslinėpublikacija.© Biotechnologijos institutas 64

Metinis pranešimas – 2008Vykdant Pramoninės biotechnologijos plėtros Lietuvoje programos projektus buvotiriama fermentų imobilizacija. Tyrinėtos imobilizuotų amilolitinių, proteolitinių, lipolitiniųfermentų savybės; biokatalitinis krakmolo skaidymas į maltozinius sirupus, triacilgliceroliųbiokatalitinės hidrolizės bei peresterinimo reakcijos. Vykdyti anaerobinės fermentacijos tyrimai.Eil.Nr.Vardas, pavardė7.6. Imunologijos ir ląstelės biologijos laboratorija (ILBL)Lentelė 7.6.MokslinislaipsnisPareigos1. Aurelija Žvirblienė dr. vyriaus. mokslo darb.,laboratorijos vedėja2. Jurga Matulienė dr. vyresn. mokslo darb.3. Petras Stakėnas dr. vyresn. mokslo darb.4. Arvydas Kanopka dr. mokslo darb.Pastabosnuo 07.01 ikikonkurso5. Milda Plečkaitytė dr. mokslo darb. iki konkurso6. Daiva Bakonytė jaun. mokslo darb.7. Indrė Šėžaitė jaun. mokslo darb.8. Indrė Kučinskaitė doktorantė,bioinžinierė9. Inga Pečiulienė doktorantė,bioinžinierė10. Rita Lasickienė bioinžinierė11. Eglė Jakubauskienė laborantė12. Ieva Kairytė laborantė (studentė) 0,5 etato iki 12.3113. Rūta Kudarauskaitė laborantė (studentė) 0,5 etato iki 06.3014. Liodzia Diglienė laborantė 0,5 etato nepagr. darb.2008 metais ILBL vykdyti projektai:Monokloninių ir rekombinantinių antikūnų kūrimas. Vadovė A. ŽvirblienėBuvo sukurti nauji monokloniniai antikūnai prieš žmogaus organinių katijonų transporterį(hOCT3). Šie darbai buvo atliekami, bendradarbiaujant su Wurzburgo universiteto (Vokietija)mokslininkų grupe, kuri pirmą kartą identifikavo hOCT šeimos transmembraninius baltymus irpradėjo išsamius jų funkcijų bei lokalizacijos audiniuose tyrimus. Organinių katijonųtransporteriai (hOCT1, hOCT2, hOCT3), randami daugiausia inkstų, blužnies, žarnyno ląstelėse,yra atsakingi už įvairių organinių katijonų (cholino, dopamino, serotonino ir kt.) pernešimą įląstelę ir iš jos. Šie polispecifiniai baltymai vykdo organinių junginių, tarp jų – ir įvairių vaistų -transportą iš kraujo į inkstų epitelio ląsteles. Šių baltymų struktūra ypatinga tuo, kad jie turi net12 transmembraninių domenų. Ekstraląstelinė kilpa, atsakinga už hOCT sąveiką su ligandais, yralokalizuota baltymo N-galinėje dalyje, tarp 1 ir 2 transmembraninio domeno. Šių baltymų tyrimai© Biotechnologijos institutas 65

Metinis pranešimas – 2008svarbūs, kadangi hOCT dalyvauja įvairių vaistinių medžiagų pernešime į ląsteles ir yra atsakingiuž šių organinių katijonų pašalinimą iš kraujo. Todėl hOCT aktyvacija arba blokavimas gali būtinauja strategija, nukreipiant vaistų patekimą į taikinius bei reguliuojant jautrumą ar atsparumątam tikriems vaistams.Anksčiau mums pavyko sėkmingai sukurti monokloninius antikūnus prieš hOCT1 irhOCT2 (Bierman et al., 2006). Naujas hOCT šeimos narys hOCT3 buvo identifikuotas priešporą metų, todėl iškilo būtinybė sukurti monokloninius antikūnus ir imunocheminius metodus šiobaltymo nustatymui. Tuo pačiu buvo iškeltas ir kitas uždavinys – sukurti rekombinantiniusantigenus, skirtus imunizacijos eksperimentams. Dėl hOCT struktūros ypatybių –12transmembraninių domenų – jų biosintezė heterologinėse sistemose buvo nelengvas uždavinys.Kuriant monokloninius antikūnus prieš hOCT3, buvo pasirinkta strategija imunizacijoms naudotirekombinantinius chimerinius baltymus, turinčius įterptus hOCT3 ekstraląstelinio domenofragmentus. Eukariotų genų inžinerijos laboratorijoje buvo sukurti antigenai VP1/hOCT3-P2 irVP1/hOCT3-P1, turintys įterptus 21 ir 22 a.r. ilgio hOCT3 fragmentus į žiurkėno poliomosviruso kapsidės baltymą VP1. Šie antigenai efektyviai formavo į virusus panašias daleles irsukėlė stiprų imuninį atsaką prieš hOCT3.Naudojant chimerinį antigeną VP1/hOCT3-P2 (su 21 a.r. ilgio hOCT3 intarpu), buvogautos 3 hibridomų linijos, gaminančios IgG2a, IgG3 ir IgM izotipų monokloninius antikūnusprieš hOCT3. Jų specifiškumas patvirtintas imunoblotingo metodu. Antikūnai perduoti įWurzburgo universitetą tolesniems tyrimams.Buvo atlikti anksčiau sukurtų monokloninių antikūnų prieš žmogaus paragripo 3 tipoviruso (hPIV3) nukleokapsidės (N) baltymą specifiškumo tyrimai. Anksčiau buvo nustatyta, kadmonokloniniai antikūnai prieš hPIV3 N baltymą atpažįsta C-galinę hPIV3 N baltymo seką – tarp397 ir 486 a.r. Siekiant tiksliau lokalizuoti epitopus, buvo sukonstruoti trumpi persidengiantysrekombinantiniai hPIV3 N baltymo fragmentai, prijungti prie gliutation-S-transferazės (GST):397-436 a.r. (fragmentas #4), 417-456 a.r. (fragmentas #5) ir 447-486 a.r. (fragmentas #6). Šiefragmentai buvo ekspresuoti E.coli. Atlikus bakterijų lizatų analizę imunoblotingo metodu, buvonustatyta, kad antikūnai reaguoja tik su fragmentu #5, bet nereaguoja nei su fragmentu #4, nei sufragmentu #6. Tai rodo, kad jie atpažįsta nepersidengiančią 10 a.r. ilgio hPIV3 N baltymo sekątarp 436 ir 447 a.r. Rezultatas buvo patvirtintas, naudojant atitinkamą sintetinį peptidą(GEPQSSIIQY). Gautieji rezultatai suteikė naujų duomenų apie hPIV3 N baltymoimunodominuojantį rajoną, kurio lokalizacija panaši į kitų paramiksovirusų N baltymų epitopųlokalizaciją. Ankstesni mūsų tyrimai parodė, kad tymų viruso N baltymo B ląstelių linijiniaiepitopai lokalizuoti tymų viruso N baltymo sekoje tarp 440 ir 448 a.r. (Zvirbliene et al., ArchVirol., 2007). Ši seka beveik sutampa su identifikuotu hPIV3 N baltymo imunodominuojančiurajonu.Pateikta publikacija žurnalui Viral Immunology: A Zvirbliene, I Sezaite, M Pleckaityte, IKucinskaite-Kodze, M Juozapaitis, K Sasnauskas , Localization and fine mapping of an antigenicsite on the nucleocapsid protein of human parainfluenza virus type 3.Naujai atrasti deguonies sensoriai, kaip priešvėžiniai vaistų taikiniai: Deguoniesįtaka pre-iRNR splaisingui. Vadovas A.Kanopka.Vieni aktyviausių piktybinių navikų vystimosi sukėlėjų arba skatintojų yra ląstelės stresąsukeliantys veiksniai, tokie kaip deguonies trūkumas (hipoksija) bei įvairių toksinių medžiagųpoveikis. Sparčiai didėjant augliui, jo viduje paprastai susidaro hipoksinės sąlygos dėlnepakankamos auglio vaskuliarizacijos. Hipoksijos metu ląstelėse suaktyvėja hipoksijosindukuojamų faktorių (HIF) – HIF-1α, HIF-2α ir HIF-3α sintezė. Šie transkripcijos reguliatoriaisąlygoja eilės genų, padidinančių ląstelės bei viso organizmo atsparumą deguonies trūkumui,transkripciją. Didžioji dalis duomenų apie HIF įtaką bei jų funkcijas yra gauti tyrinėjant faktorių© Biotechnologijos institutas 66

Metinis pranešimas – 2008HIF-1α. Parodyta, kad šis faktorius yra svarbus piktybinių navikų vystimuisi, jis randamasdaugelyje žmogaus vėžinių auglių. Šio faktoriaus raiška paprastai lemia blogą prognozę irterapinį atsaką daugelio vėžinių auglių atvejais. Manoma, jog panašios savybės būdingos irfaktoriui HIF-2α, tuo tarpu duomenų apie HIF-3α vaidmenį ląstelėje bei jo funkciją yra nedaug.HIF-1α raiška ir aktyvumas padidėja hipoksinėmis sąlygomis, o reoksigenacijos metu šiebaltymai greitai degraduojami.Neseniai atrastas baltymas, kurio funkcija ląstelėje yra priešinga HIF-3 funkcijai. Šisbaltymas buvo pavadintas IPAS (inhibitorinis PAS domeną turintis baltymas). Parodyta, kadIPAS iRNR susidaro nuo HIF-3α pre-mRNR alternatyvaus pre-iRNR splaisingo pasekmėje.Nustatyta, kad šis faktorius nesąveikauja su HIF-β subvienetu tačiau sąveikauja su HIF-1αbaltymu ir tuo pačiu slopina vėžinių auglių vystimąsi, išlaikant avaskuliarinį jų fenotipą.HIF-3α/IPAS splaisingo reguliacijos tyrinėjimai, lyginant pre-iRNA splaisingo profiliusgautus in vitro pre-iRNR splaisingo reakcijoje HeLa ląstelių augintų normoksinėmis arhiposkinėmis sąlygomis branduolių ekstraktuose parodė kad šioje pre-iRNR spalisingoreguliacijoje dalyvauja esminis splaisingo faktorius U2AF 65 kurio ekspresija kinta priklausomainuo deguonies kiekio bei SR baltymai. Mažėjant deguonies kiekiui ląstelėje mažėja U2AF 65kiekis, o SR baltymai, dėl modifikacijų juose pradeda stipriau sąveikauti su pre-iRNR.Laboratorijoje gauti rezultatai parodė kad tiek U2AF 65 tiek SR baltymai vaidina svarbią rolębaltymo slopinančio HIF-1α funciją susidaryme.Tuberkuliozės molekulinės epidemiologijos tyrimai. Vadovas P. Stakėnas.Tuberkuliozė išlieka svarbia sveikatos apsaugos problema Lietuvoje. 2007 m.užregistruoti 2223 susirgimų atvejai, o sergamumo vaistams atsparia tuberkuliozeepidemiologiniai rodikliai yra vieni iš blogiausių pasaulyje. Šio tęstinio projekto tikslas yraintegruoti tuberkuliozės molekulinės epidemiologijos tyrimus į Atsparios tuberkuliozės kontrolėsstrategiją, kas leistų įvertinti tuberkuliozės sukėlėjo populiacijos pokyčius bei kovos sutuberkulioze efektyvumą. Tyrimai atliekami glaudžiai bendradarbiaujant su Respublikinetuberkuliozės ir infekcinių ligų universitetine ligonine. M. tuberculosis genotipavimo tyrimaiatliekami tarptautiname lygmenyje standartizuotais metodais, kas leidžia gautus rezultatusintegruoti į atitinkamas duomenų bazes. 2008 metais atlikus 270 iš skirtingų tuberkuliozesergančių žmonių išskirtų M. tuberculosis padermių genotipavimo IS6110 RFIP irspoligotipavimo analizės metodais tyrimus buvo išsamiai charakterizuota respublikojecirkuliuojanti M. tuberculosis populiacija ir apibūdinta jos filogenetinė struktūra. Tyrimai parodė,kad M. tuberculosis populiacijoje yra susiformavusios genetiškai giminingų padermių grupės,kurių nariai sukelią daugumą visų susirgimų tuberkulioze. Palyginamoji su ankstesnių tyrimųrezultatais analizė patvirtino, kad neturinčios dauginio atsparumo vaistams tuberkuliozės situacijastabilizavosi, tačiau turinčios dauginį atsparumą vaistams tuberkuliozės pernašos grandinių kolkas nepavyko nutraukti. Atliekant tuberkuliozės sukėlėjų identifikavimo tyrimus gydymo eigojeparodyta, kad savavališkai pertraukę gydymą asmenys platina sunkias tuberkuliozės formas.Atliekant M. tuberculosis mutacijų, nulemiančių atsparumą gydymui naudojamiems vaistamstyrimus, 92 atsparių streptomicinui ir 146 atsparių izoniazidui padermių grupėse identifikavusmutacijas ir rezultatus apjungus su ankstesnių tyrimų rezultatais nustatyta, kad M. tuberculosispotencialas įgyti specifines mutacijas, nulemiančias atsparumą šiems vaistams, priklauso nuopadermės genotipo. Atliekant M. tuberculosis mutacijų, nulemiančių atsparumą gydymuinaudojamiems rezerviniams vaistams, tyrimus gauti rezultatai rodo, kad kuriant naujos kartosatsparumo ofloksacinui diagnostinius metodus jais turėtų būti nustatomos gyrA ir gyrB genųmutacijos, o atsparumo rezerviniams aminoglikozidams pagrindinės genetinės determinantės kolkas dar nėra žinomos. Pradėta mutacijų, susijusių su atsparumu para-amino salicilo rūgštiesderivatais, paieška. Tęsiant vienos iš labiausiai virulentiškos M. tuberculosis Beijing genetinės© Biotechnologijos institutas 67

Metinis pranešimas – 2008linijos padermių subpopuliacijos Lietuvoje išsamų apibūdinimą, reprezentacinėje Beijingpadermių kolekcijoje, turinčioje visų duomenų bazėje esančių skirtingų IS6110-RFIP profiliųatstovus, buvo atlikti mobilaus IS6110 elemento įsiterpimo į chromosomos NTF rajoną tyrimai.Nustatyta, kad 99% padermių, pagal šį požymį, priklauso naujajai Beijing genotipo evoliucijosšakai ir nei viena padermė nepriklauso W-Beijing genotipo, sukėlusio atsparios tuberkuliozėsprotrūkius JAV, pogrupiui. Atlikus mutacijų numanomuose mutatoriniuose genuose paieškosBeijing genetinei linijai priklausančių M. tuberculosis padermių ir labiausiai paplitusių kitųgenetinių linijų padermių reprezentacinėse grupėse tyrimus nustatyta, kad 98% Beijing genetinėslinijos padermių turėjo tik joms būdingas mutT2, mutT4, ogt mutacijas visuose trijuose genuose,o Haarlem 1 ir Haarlem 3 sublinijų padermės turėjo specifines ogt ir ung genų mutacijas.7.7. Bioinfomatikos laboratorija (BL)Lentelė 7.7.Eil.Nr.Vardas, pavardėMokslinislaipsnisPareigos1. Česlovas Venclovas dr. vyriaus. mokslo darb.2. Albertas Timinskas dr. vyresn. mokslo darb.3. MindaugasMargelevičiusdr.vyresn. mokslo darb.4. Alvydas Špokas jaun. mokslo darb. iki 12.315. Jolita Višinskienė doktorantė6. Rytis Dičiūnas inžinierius informatikas7. Darius Kazlauskas laborantas (studentas) iki 12.31Pastabos8. Mindaugas Laganeckas laborantas (studentas) iki 08.12.31Per ataskaitinius metus Bioinformatikos laboratorijos darbuotojai intensyviai kūrėbioinformatikos metodus bei juos taikė įvairioms konkrečioms biologinėms problemoms spręsti.Metodų kūrimo srityje šiais metais buvo užbaigtas sekų profiliais paremtas metodas tolimiems (irtodėl visiškai neakivaizdiems) evoliucinio giminingumo ryšiams tarp baltymų šeimų nustatyti.Naujasis metodas nuodugniai ištestuotas ir palygintas su kitais geriausiais tokio tipo metodais.Palyginimo rezultatai parodė, kad naujai sukurtas metodas yra šiuo metu jautriausias, profilisprofilislyginimu pagrįstas, giminingų baltymų paieškos metodas.Šiais metais taip pat buvo dalyvauta viso pasaulio mastu aštuntą kartą vykdomame baltymųstruktūrų modeliavimo eksperimente-konkurse CASP8 (sutr. nuo angl. Critical Assessment ofProtein Structure Prediction). Jame dalyvavo daugiau nei 100 mokslininkų grupių iš JAV,Europos, Japonijos ir kitų šalių. Bioinformatikos laboratorijos grupės (IBT_LT) rezultatusnepriklausomi ekspertai pripažino geriausiais vienoje iš pagrindinių, lyginamojo baltymųmodeliavimo, kategorijoje.© Biotechnologijos institutas 68

Metinis pranešimas – 20088. FINANSAI8.1 PajamosInstituto pajamos, gautos 2008 m. parodytos lentelėje 8.1. ir schemoje 8.1. Bendra pajamųsuma buvo 10564 tūkst. Lt (be ES struktūrinių fondo lėšų). Lyginant su 2007 m. (gauta 10564tūkst. Lt), pajamų buvo gauta 135.8 % daugiau.Nr. Š a l t i n i a i Iš viso2 0 0 8 m.Iš to skaičiausBendroslėšosMokslininkųlėšos2007 m.iš viso2008/2007%Lentelė 8.1.Sąmata2008m.iš viso1. Biudžeto subsidija 5284,2 5284,2 4240,9 124,6 5282,02. Švietimo ir mokslo163,8 163,8 362,8 45,1 167,6ministerijos lėšos2a Lietuvos mokslo taryba 76,0 7,6 68,4 39,8 171,9 36,02b Tarptautinė mokslo irtechnologijų plėtrosprogramos91,4 91,4 70,1 130,4 16,03. Mokslinės sutartys,finansuojamos LVMSF4. Mokslinės sutartys suorganizacijomisSutartys su UAB“Fermentas”Sutartys su kt. organizacijomis4.1.4.2.5.5.1.5.2.5.3.Užsienio grantai ir kt.GrantaiSutartysKitos lėšos3208,0 231,4 2976,6 2375,0 135,1 2850,0769,9130,0639,91574,81414,3143,217,376,713,063,7162,5141,421,1693,2117,0576,21412,31272,9122,117,3710,8265,0445,82247,91877,6312,757,6108,349,1143,570,175,345,830,0660,0150,0510,01200,01200,06. Paramos fondas 70,1 70,1 26,2 267,6 50,07.7.1.7.2.Ūkinės sutartysSutartis su UAB “Fermentas”Sutartys su kitomisorganizacijomis475,2457,317,9475,2457,317,9395,5370,624,9120,1123,471,9395,0370,025,08. Kitos ūkinės veiklos pajamos 156,6 156,6 95,0 164,8 110,0Iš viso: 11870,0 6394,2 5475,8 10564,0 112,4 10714,6Praeitų metų likutis 1396,0 114,4 1281,6 533,1 261,9 1396,0Iš viso: 13266,0 6508,6 6757,4 11097,1 119,5 12110,6ES struktūriniai fondai 1639,0 1639,0 1926,5 85,1 1300,0Tiesioginė biudžeto subsidija sudarė 44.5 % Lt visų gautų pajamų. Biudžeto subsidija 2008metais, lyginant su 2007 m., padidėjo 1043,3 tūkst. Lt (24.6 %). Lentelėje 8.2 parodytasbiudžeto subsidijos kitimas per pastaruosius 5 metus.© Biotechnologijos institutas 69

Metinis pranešimas – 2008MetaiPradinispaskirstymasBiudžeto subsidija, tūkst. LtKitimaimetų bėgyjeFaktinisfinansavimasLentelė 8.2Kitimas (per metus)Tūkst.. Lt %2003 2052 +2,1 2054,1 - 25,9 -1,32004 2664 +156,7 2820,7 +766,6 +37,32005 3043 +3,0 3046,0 +225,3 +8,02006 3715 +43,8 3758,8 +712,8 +23,42007 4233 +7,9 4240,9 +482,1 +12,82008 5282 +2,2 5284,2 +1043,3 +24,62008 m. Švietimo ir mokslo ministerija papildomai skyrė 163.8 tūkst. Lt iš jų: 144,3 tūkst.Lt skirta mokslinės aparatūros įsigijimui, vykdant LR švietimo ir mokslo ministro 2008 m.balandžio 8 d. įsakymą Nr. ISAK-970; 10,0 tūkst.Lt skirta tarptautinės mokslinės konferencijos„7 ScanBalt Forum and Biomaterials Days 2008“ organizavimo dalinėms išlaidoms padengti;5,4 tūkst.Lt – atstovo dalyvavimo ES Žinių bioekonomikos tinklo renginiuose išlaidoms; 4,1tūkst.Lt – Dvišalio bendradarbiavimo mokslinių tyrimų ir eksperimentinės plėtros srityseLietuvos-Prancūzijos veiklos programos „Žiliberas“ vykdymui.Pajamos iš ūkinės veiklos turi tendenciją augti ( 2008 m. – 475,1 tūkst. Lt, 2007 m. –395,5 tūkst. Lt, 2006 m. - 313,9 tūkst. Lt, 2005 m. – 243,9 tūkst. Lt, 2004 m. – 226,1 tūkst. Lt).Kitos Instituto pajamos padidėjo 64,8 % (2008 m. – 156,6 tūkst. Lt, 2007 m. – 95,0 tūkst. Lt,2006 m.- 48,7 tūkst. Lt, 2005 m. – 31,5 tūkst. Lt). Kitos pajamos padidėjo ryšium su atliekamaissekvenavimo darbais įvairioms institucijoms.8.2. Išlaidos2008 m. išlaidos parodytos lentelėje 8.3.Lentelė 8.3.Klasif.Nr.P a v a d i n i m a sIš viso2 0 0 8 m.Iš to skaičiausIšbendrųpajamųIš mokslininkų2007 m.iš viso2008/2007%Sąmata2008 m.iš viso1. Darbo užmokestis 3757,4 3757,4 2983,2 125,9 3584,41.1. Mokslo darbuotojams 2422,4 2422,4 1828,6 132,5 2300,01.2. Aptarnaujančioms tarnyboms 948,2 948,2 821,7 115,4 889,5© Biotechnologijos institutas 70

Metinis pranešimas – 2008Klasif.Nr.P a v a d i n i m a sIš viso2 0 0 8 m.Iš to skaičiausIšbendrųpajamųIš mokslininkų2007 m.iš viso2008/2007%Sąmata2008 m.iš viso1.3. Administracijai 386,8 386,8 332,9 116,2 394,92. Kiti mokėjimai darbuotojams 1393,1 218,7 1174,4 1264,9 110,1 1400,03. Socialinis draudimas 1488,4 1221,8 266,6 1168,7 127,4 1389,04. Stipendija doktorantams 223,7 223,7 139,4 160,5 212,55. Komandiruotės 331,4 12,1 319,3 193,3 171,4 260,06. Elektros energija 102,7 102,7 91,0 112,9 109,27. Šildymas 69,9 69,9 60,7 115,2 88,08. Vanduo ir kanalizacija 14,5 14,5 15,4 94,2 18,09. Ryšių paslaugos 41,8 28,4 13,4 40,9 102,0 51,010. Pagrindinės priemonės mokslodarbams11. Reagentai, medžiagos mokslodarbams12. Pagrind. priemonės ūkinėmsfunkcijoms1338,0 92,4 1245,6 1226,6 109,1 1550,0941,0 39,8 901,2 1001,1 94,0 1189,092,6 92,6 91,5 101,2 130,013. Medžiagos ūkio darbams 33,6 27,9 5,7 23,1 145,4 32,014. Inventorius (baldai ir kt.) 30,5 7,7 22,8 90,2 33,8 90,015. Kanceliarinės, ūkinės prekės 36,4 25,2 11,2 20,0 182,0 35,016. Pastatų, teritorijos remontas irpriežiūra257,3 255,7 1,6 188,6 136,4 240,017. Darbo sąlygos ir darbų sauga 13,5 13,5 15,4 87,7 16,018. Spauda ir informacija 25,3 5,9 19,4 38,5 65,7 76,019.92,8Autotransporto išlaikymas92,871,3 130,1 92,566,6 66,648,8 136,5 60,019.1. Kuras ir tepalai8,2 8,25,9 139,0 11,019.2. Atsarginės dalys8,9 8,97,2 123,6 10,019.3. Autoserviso paslaugos5,7 5,75,5 103,6 6,519.4. Angaro komun. patarn.3,4 3,43,9 87,2 5,019.5. Automobilių draudimas20. Mokėjimai už paslaugas 582,2 150,0 432,2 362,0 160,8 540,021. Draudimas 11,8 11,8 9,9 119,2 11,022. Mokesčiai 3,1 1,0 2,1 12,4 25,0 14,0© Biotechnologijos institutas 71

Metinis pranešimas – 2008Klasif.Nr.P a v a d i n i m a sIš viso2 0 0 8 m.Iš to skaičiausIšbendrųpajamųIš mokslininkų2007 m.iš viso2008/2007%Sąmata2008 m.iš viso23. Išlaidos reprezentacijai 12,7 3,5 9,2 2,9 437,9 12,024. Išlaidos kontragentams 917,5 917,5 583,0 157,4 872,025. Kitos išlaidos 7,1 1,2 5,9 7,1 100,0 8,026 Netinkamų ESF išlaidųkompensavimas91,4Iš viso: 11818,3 6470,2 5348,1 9701,1 121,8 12110,6Pajamų/išlaidų balansas: 1447,7 38,4 1409,3 +1396,0 - -ES struktūrinių fondų išlaidos 1802,9 1802,9 1457,4 1300,0Kaip ir kiekvienais metais, pagrindinę išlaidų dalį (31,8 %) sudarė darbo užmokestis(2007 m. buvo 30,8 %). Išlaidos darbo užmokesčiui 2008 m. padidėjo 25,9 % lyginant suankstesniais metais. Kiti mokėjimai darbuotojams padidėjo 128,2 tūkst. Lt (10,1 %). Jie padidėjotodėl, kad buvo gauta daugiau lėšų iš Lietuvos valstybinio mokslo ir studijų fondo. Papildomimokėjimai mokslo darbuotojams, jų pačių iniciatyvos ir intensyvaus darbo rezultatas, sudarėnemažą dalį jų darbo užmokesčio – 33,5 % nuo ( 2422,4+1220,9) tūkst. Lt, 2007 m. buvo 33,4%, 2006 m. – 30,0 %, 2005 m. – 41,6 %, 2004 m. – 38,1 %).2008 m. tiesioginės išlaidos mokslo reikalams (komandiruotėms, reagentams,laboratorinėms medžiagoms, prietaisams, kontragentams) – 3383,6 tūkst. Lt padidėjo 433,1tūkst. Lt (14,7 %) lyginant su 2007 m. (2007 m. buvo 2950,5 tūkst.Lt, 2006 m. buvo 2402,7tūkst. Lt, 2005 m. – 1879,1 tūkst. Lt, 2004 m. – 2207,6 tūkst. Lt).Institutas įsigijo ilgalaikio turto mokslo darbams už 1338,0 tūkst. Lt (2007 m. už 1226,6tūkst.Lt, 2006 m. – 863,7 tūkst. Lt, 2005 m. – 602,8 tūkst. Lt, 2004 – 1182,9 tūkst. Lt).Išlaidos energetiniams ištekliams ir ryšiams (228,8 tūkst. Lt) padidėjo lyginant su 2007 m.30,5 tūkst. Lt (2007 m. – 198,3 tūkst. Lt, 2006 m. – 176,9 tūkst. Lt, 2005 m. – 188,3 tūkst. Lt,2004 m. – 175,4 tūkst. Lt.). Išlaidos autotransporto išlaikymui (92,8 tūkst. Lt) padidėjo lyginantsu 2007 m. 30,2 % (2007 m. – 71,3 tūkst. Lt , 2006 m. – 65,2 tūkst. Lt , 2005 m. – 68,8 tūkst. Lt,2004 – 76,8 tūkst. Lt.).Bendra išlaidų suma 2008 m. (11818,2 tūkst. Lt ) buvo 2117,1 tūkst. Lt (21,8%) didesnėuž 2007 m. sumą (9701,1 tūkst. Lt). Visumoje, metai finansiniu požiūriu buvo pakankamaisėkmingi, visi pagrindiniai Instituto poreikiai buvo patenkinami.© Biotechnologijos institutas 72

Metinis pranešimas – 20088.3. Sąmatos įvykdymas2008 m. instituto tarybos patvirtintos sąmatos įvykdymą parodo lentelė 8.4.RodikliaiLėšų likutismetų pradžiaiPatvirtinta,tūkst. LtĮvykdytaTūkst. Lt %1396,0Pajamos 10714,6 11870,0 110,8Išlaidos 12110,6 11818,3 97,6Lėšų likutismetų pabaigai1447,7 -Lentelė 8.4.Gauta 1155,4 tūkst. Lt ( 10,8 %) daugiau pajamų negu buvo numatyta sąmatoje. Metųpabaigoje likęs nepanaudotų lėšų likutis, paaiškinamas tuo, kad dalis mokslininkų dėl įvairiųpriežasčių nespėjo išleisti lėšų, gautų grantų ir sutarčių vykdymui. Planuotos išlaidos perkeltos įsekančius – 2009 metus.8.4. Laboratorijų iniciatyvinės lėšosNepakankamo valstybinio finansavimo sąlygomis labai didelę reikšmę turi laboratorijųiniciatyvinės lėšos, t.y. lėšos, gaunamos vykdant mokslines sutartis, programas, gaunant grantusir pan. Aktyvios laboratorijos šiais keliais gauna 30 – 100 tūkst. Lt/ vienam faktiškai dirbančiammokslo darbuotojui (lentelė 8.5). Šių lėšų praktiškai pakanka reagentams bei smulkiailaboratorinei technikai ir dar lieka pelnytiems priedams prie darbo užmokesčio. Iniciatyvinėslėšos praktiškai yra pagrindinis šaltinis būtinų moksliniams tyrimams priemonių įsigijimui.Lentelė 8.5LaboratorijaLėšų šaltiniai ir kiekiai, tūkst.. LtLVMSFsutartysSutartyssuLietvospartn.UžsieniograntaiUžsieniokontraktaiIš viso,tūkst.Lt.Lėšos vienamdarbuo-Dar-tojuibuotojųsk.* 2008 2007EGIL 1398,0 86,0 393,0 23,8 1900,8 18,25 104,2 76,6BL 124,5 0 234,6 0 343,7 4 85,9 60,6BNSTL 413,5 30,0 593,0 0 1036,5 16 64,6 38,5BVTL 531 0 399,9 0 930,9 16,5 54,7 44,3IL 109,1 52,6 65,8 51,6 279,1 8 34,8 65,3DMTL 313 0 116,6 0 429,6 14 30,7 38,8Iš viso 08 2889,1 168,6 1802,9 75,4 4920,6 76,75 - -© Biotechnologijos institutas 73

Metinis pranešimas – 2008LaboratorijaLėšų šaltiniai ir kiekiai, tūkst.. LtLVMSFsutartysSutartyssuLietvospartn.UžsieniograntaiUžsieniokontraktaiIš viso,tūkst.Lt.Lėšos vienamdarbuo-Dar-tojuibuotojųsk.* 2008 2007Iš viso 07 2188,3 306,8 898,4 304,2 3697,7 72,75 - -* Faktiškai dirbančių mokslo darbuotojų skaičius, žr. lentelę 2.3.© Biotechnologijos institutas 74

Metinis pranešimas – 20089. ŪKINĖ VEIKLA9.1. Aptarnaujančios tarnybosInstitutą 2007 m aptarnavusios tarnybos įvardytos Instituto struktūros lentelėje 1.1.Žemiau pateiktoje lentelėje 9.1 pateikiama smulkesnė jų struktūra.Lentelė 9.1EilNr.TarnybospavadinimasVadovasDarbuotojųskaičiusDarbuotojai1. Buhalterija O. Šiurkutė 3 Vyr. buhalterio pavaduotojas (1),buhalteris (2)2. Biblioteka R. Misiūnienė 2 Vedėjas (1),bibliotekininkas (1)3. Technikos tarnyba J. Potecki 15 Technikos tarnybos vadovas (1),inžinierius – energetikas (1), elektrikas(1),elektrikas – telefonistas (1),santechnikas-suvirintojas (1),santechnikas (1),tekintojas (1),šaltkalvis (1),stiklapūtys (1),vandens paruošimo operatorius (0, 5),statybininkas – remontininkas (3),stalius (1), elektrikas – inžinierius (1),inžinierius metrologas (0,5)4. Transporto ūkis V. Kosevičius 6 Inžinierius – automechanikas – ūkiovadovas (1), autošaltkalvis (1),vairuotojas (4)5. Ūkio tarnyba - 6 Budėtojas – kontrolierius (2),valytoja (2),skalbėja – kiemo prižiūrėtoja (1)sandėlininkas6. Kitos tarnybos - 3,5 Informacinių sistemų inžinierius – (1),darbosaugos inžinierius (1),ekspeditorius (0,5),medicinos punkto vedėjas (1).2008 instituto aptarnavimo sferoje dirbo 35,5 darbuotojų.© Biotechnologijos institutas 75

Metinis pranešimas – 20089.2. Ūkinės sutartys2008 m. sudarytos ūkinės sutartys su UAB „Fermentas“, UAB BIOK, UAB „Militė“.Institutas ir UAB „Fermentas“ turi dalinai bendrą ūkinę infrastruktūrą, kurioseksploatacinę priežiūrą, aptarnavimą, remontą atlieka instituto aptarnaujančios tarnybos. Taibendri elektros, vandens, kanalizacijos, šildymo tinklai. Be to, instituto aptarnaujančios tarnybosteikia kai kurias paslaugas, pvz. veža darbuotojus į darbą ir iš darbo, teikia bibliotekos paslaugas,aprūpina stiklapūčio dirbtuvių gaminiais ir kt. Taip pat UAB „Fermentas“ nuomojamosgamybinės patalpos. Pagal sudarytas sutartis, iš UAB „Fermentas“ institutas 2008 metais gavo457.3 tūkst.Lt pajamų.Sutartys su kitomis įmonėmis sudarytos dėl transporto, elektros energijos, vandens irkitų paslaugų teikimo. Iš šių organizacijų gauta 17.8 tūkst. Lt. pajamų.9.3. Pagrindiniai ūkiniai darbaiAptarnaujančių techninių tarnybų svarbiausia užduotis yra instituto patalpų ir inžineriniųtinklų – elektros, vandentiekio, kanalizacijos, šildymo, vėdinimo, suspausto oro, kompiuterių irtelefonų tinklų ir kt. normalaus funkcionavimo užtikrinimas, priežiūra ir remontas. Be to,instituto techninės tarnybos veža darbuotojus į/iš darbo, prižiūri instituto teritoriją, pagalgalimybes teikia įvairias paslaugas mokslinėms laboratorijoms.2008 m. buvo tęsiami Instituto infrastruktūros gerinimo darbai:1. NLK 306 lab. remontas.2. SLK laiptinės remontas.3. SLK 250, 261, 262, 263, 257 lab. remontas ir įrengimas.4. Salės langų pakeitimas.5. Priešgaisrinės signalizacijos ir papildomo apšvietimo įrengimas transporto ukio patalpose.s6. Patalpos rūkymui lauke įrengimas.7. Vėdinimo sistemos montavimas IVa NLK (UAB „Fermentas“)8. Vėdinimo sistemos montavimas 250 lab.9. Kiemo apšvietimo sistemos remontas.10. Transformatorinės pastotės profilaktikos darbai.11. Hepa filtrų įrengimas 113 lab. (UAB „Fermentas“)12. UAB „Fermentas“ lab. 104 apšvietimo sistemos pakeitimas.13. Patalpos Nr. 113 remontas (UAB „Fermentas“).14. Cheminių medžiagų išvežimas.15. Kondicionavimo sistemų įrengimas 313, 306 lab.16. Sandelių perkraustymo darbai (UAB „Fermentas“).17. Kavos aparatų pajungimas.© Biotechnologijos institutas 76