Transcrição do DNA - Instituto de Biologia da UFRJ
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Transcrição <strong>do</strong> <strong>DNA</strong>Mestran<strong>do</strong>: Ighor TeixeiraOrienta<strong>do</strong>r: Régis correa
O controle genético sobre ometabolismo• Os organismos <strong>de</strong>pen<strong>de</strong>m <strong>da</strong>s reações químicaspara crescer e se reproduzir.• Conjunto <strong>de</strong> reações químicas <strong>do</strong> organismo e<strong>de</strong>nomina<strong>do</strong> metabolismo.• As reações químicas <strong>do</strong> nosso corpo sãocatalisa<strong>da</strong>s por enzimas, que são proteínas.• Além disso a “construção” <strong>de</strong> um organismo<strong>de</strong>pen<strong>de</strong> <strong>da</strong>s proteínas.• As proteínas são produzi<strong>da</strong>s a partir <strong>de</strong>informação conti<strong>da</strong> no código genético.
Transcrição• Realiza<strong>da</strong> por um complexo enzimático cuja enzima chave é aRNA polimerase.• A síntese <strong>de</strong> RNA ocorre no senti<strong>do</strong> 5’=>3’.• O RNA sintetiza<strong>do</strong> será complementar à fita <strong>de</strong> <strong>DNA</strong> mol<strong>de</strong>.
Diferenças entre eucariontes eprocariontes• A transcrição em eucariontes é bem maiscomplexa que em procariontes.• Nos eucariontes a transcrição ocorre nonúcleo, enquanto a tradução ocorre nocitoplasma.• Nos procariontes tal separação celular nãoexiste, sen<strong>do</strong> os <strong>do</strong>is processos muito bemacopla<strong>do</strong>s no espaço.
Diferenças entre <strong>DNA</strong> E RNA
Os diferentes tipos <strong>de</strong> moléculas<strong>de</strong> RNA
Expressão gênica• O fenótipo <strong>de</strong> um organismo é umacombinação <strong>do</strong>s efeitos <strong>de</strong> to<strong>do</strong>s os seusgenes.• Os genes são regiões <strong>do</strong> <strong>DNA</strong> que contéminformação para produzir as proteinas.• A informação <strong>do</strong> <strong>DNA</strong> não é passa<strong>da</strong>diretamente para proteinas.• RNA intermediário (mRNA).
Descoberta <strong>do</strong> mRNA• Experimento <strong>de</strong> Spiegelman• Experimento <strong>de</strong> pulso-caça (Elliot Volkin eLawrence Astrachan)
Transcrição em procariontes• RNA polimerase <strong>de</strong>procariotos é umaholoenzima, ou seja,uma enzimacomposta por váriassubuni<strong>da</strong><strong>de</strong>sproteicas.• Cerne tetramérico(α2ββ’)• Subuni<strong>da</strong><strong>de</strong> σ
Estrutura geral <strong>de</strong> um gene• Promotor: seqüências específicas <strong>do</strong> <strong>DNA</strong> reconheci<strong>da</strong>s pelaRNA polimerase com o sítio <strong>de</strong> início <strong>da</strong> transcrição.Direcionam a transcrição <strong>de</strong> segmentos adjacentes <strong>do</strong> <strong>DNA</strong>(gene)• Região Transcrita <strong>da</strong> fita mol<strong>de</strong> <strong>da</strong> qual mRNA é sintetiza<strong>da</strong>• Finaliza<strong>do</strong>r: seqüências que sinalizam o produto <strong>da</strong> RNApolimerase a partir <strong>do</strong> gene.
Promotor• Sítio on<strong>de</strong> a RNA polimerase se liga e inicia a transcrição.• Genes são regula<strong>do</strong>s similarmente conten<strong>do</strong> seqüências comuns <strong>de</strong> <strong>DNA</strong>(seqüência <strong>de</strong> consenso) <strong>de</strong>ntro <strong>de</strong> seus promotores.
Iniciação transcricional
Bolha <strong>de</strong> transcrição• RNA polimerase se liga aopromotor.• RNA polimerase separa as fitas<strong>de</strong> <strong>DNA</strong> forman<strong>do</strong> a bolha <strong>de</strong>transcrição.• O RNA começa a sersintetiza<strong>do</strong> a partir <strong>da</strong> fitamol<strong>de</strong> <strong>de</strong> <strong>DNA</strong>.• Conforme a RNA polimerasean<strong>da</strong> e transcreve o <strong>DNA</strong> elafecha as fitas atrás (5’P)e abreas fitas à frente (3’OH).
Alongamento
Término <strong>de</strong> transcrição• Processo pelo qual o complexo RNA polimerase sedisassocia <strong>da</strong> extremi<strong>da</strong><strong>de</strong> 3’ <strong>do</strong> gene.• Seqüências específicas sinalizam a terminação <strong>da</strong>síntese <strong>de</strong> RNA.• E. coli - duas classes <strong>de</strong> sinais <strong>de</strong> terminação:<strong>de</strong>pen<strong>de</strong>nte <strong>de</strong> ρ (rho) e outro é in<strong>de</strong>pen<strong>de</strong>nte <strong>de</strong> ρ.
In<strong>de</strong>pen<strong>de</strong>nte <strong>de</strong> Rho• duas características distintas: região cujo transcrito <strong>de</strong> RNApossui seqüências autocomplementares, permitin<strong>do</strong>formação <strong>de</strong> estruturas grampos.• Outra seria um colar curto <strong>de</strong> a<strong>de</strong>nilato na fita mol<strong>de</strong>, que étranscrito em uridilatos na extremi<strong>da</strong><strong>de</strong> 3´ <strong>do</strong> RNA.
Pausa e disassociação• O grampo possui a função <strong>de</strong> travar o an<strong>da</strong>mento <strong>da</strong>transcrição.• 3’ terminal ten<strong>de</strong> a ser rica em AU p/ romper facilmentedurante a pausa. Leva a disassociação <strong>do</strong> complexo RNApolimerase.
Depen<strong>de</strong>nte <strong>de</strong> Rho• Rho é uma helicase <strong>de</strong>pen<strong>de</strong>nte <strong>de</strong> ATP.• Se move ao longo <strong>do</strong> RNA transcrito.• Quan<strong>do</strong> a RNA Polimerase diminui ou pára nasequencia <strong>de</strong> terminação (grampo), Rho se une aRNA Pol e separa o RNA nascente <strong>da</strong> bolha <strong>de</strong>transcrição.
Transcrição em eucariotos• Diferente <strong>de</strong> procariotosque possuem apenas umaRNA polimerase, eucariotospossuem 3 RNApolimerases.• Ca<strong>da</strong> RNA polimerase éresponsável por transcreverum <strong>de</strong>termina<strong>do</strong> grupo <strong>de</strong>genes.• As RNA polimerases <strong>de</strong>eucariotos são bem maiscomplexas que <strong>de</strong>procariotos.
RNA Polimerases eucarióticas
Promotor• O promotor <strong>de</strong> eucariotos contém uma região consensochama<strong>da</strong> <strong>de</strong> TATA Box (TATAAAA).• As RNA polimerases eucarióticas se ligam a esta região <strong>do</strong>promotor para iniciar a transcrição.• O TATA Box está situa<strong>do</strong> a -30 <strong>do</strong> gene.
Fatores <strong>de</strong> transcrição• Polimerase I, II, e III nãose ligamespecificamente aospromotores.• Eles po<strong>de</strong>m interagircom seus promotoresvia fatores <strong>de</strong>transcrição .• Fatores <strong>de</strong> Transcriçãoreconhecem e iniciamtranscrição emseqüências <strong>de</strong>promotores específicas.
Alongamento e término• O alongamento <strong>da</strong> ca<strong>de</strong>ia <strong>de</strong> RNA ocorre emum processo similar a procariotos.• O término <strong>de</strong> transcrição ain<strong>da</strong> não está bem<strong>de</strong>fini<strong>do</strong>, mas há participação <strong>de</strong> umaen<strong>do</strong>nuclease.• O RNA é cliva<strong>do</strong>, mas a transcrição continuamesmo <strong>de</strong>pois <strong>da</strong> clivagem <strong>do</strong> RNA por mais1000 a 2000 nucleotí<strong>de</strong>os até que a síntesepára em uma seqüência <strong>de</strong> término.
Processamento <strong>do</strong> RNA• Em eucariotos a transcrição e tradução ocorreem compartimentos separa<strong>do</strong>s.• Isso permite que o RNA possa ser “matura<strong>do</strong>”antes que seja traduzi<strong>do</strong>.• O RNA sofre 3 tipos <strong>de</strong> modificações nonúcleo antes <strong>de</strong> ser en<strong>de</strong>reça<strong>do</strong> para ocitoplasma on<strong>de</strong> será traduzi<strong>do</strong>.• O RNA antes <strong>de</strong> ser modifica<strong>do</strong> é chama<strong>do</strong> <strong>de</strong>“transcrito primário” ou “hnRNA”.
Capeamento <strong>do</strong> RNA mensageiro• A primeira modificação que ocorre no hnRNAé a adição <strong>de</strong> um CAP na porção 5’P <strong>do</strong> RNAmensageiro.• O CAP é um 7-metilguanosina, que é uni<strong>da</strong> aoresíduo terminal 5´<strong>do</strong> RNA por meio <strong>de</strong> umaligação 5´,5´-trifosfato.• A função <strong>do</strong> CAP é proteger o RNA <strong>de</strong><strong>de</strong>gra<strong>da</strong>ção por exonucleases, aumentan<strong>do</strong> otempo <strong>de</strong> vi<strong>da</strong> <strong>do</strong> RNA.
Polia<strong>de</strong>nilação• A segun<strong>da</strong> modificação é a adição <strong>de</strong> umacau<strong>da</strong> Poli(A) na extremi<strong>da</strong><strong>de</strong> 3’ <strong>do</strong> hnRNA.• A cau<strong>da</strong> Poli(A) é a adição <strong>de</strong> cerca <strong>de</strong> 200nucleotí<strong>de</strong>os <strong>de</strong> a<strong>de</strong>nina no final <strong>do</strong> RNAmensageiro (extremi<strong>da</strong><strong>de</strong> 3’).• A função <strong>da</strong> cau<strong>da</strong> Poli(A) também éaumentar o tempo <strong>de</strong> vi<strong>da</strong> <strong>do</strong> mRNA, porqueas exonucleases terão que <strong>de</strong>gra<strong>da</strong>r 200nucleotí<strong>de</strong>os antes <strong>de</strong> começar a <strong>de</strong>gra<strong>da</strong>r omRNA.
éxons e Íntrons• Os genes <strong>de</strong> eucariotos possuem regiõescodificantes e não codificantes.• Essas regiões não codificantes estarãoconti<strong>da</strong>s no RNA quan<strong>do</strong> ele for transcrito eprecisam ser removi<strong>da</strong>s.• As regiões codificantes <strong>do</strong> RNA mensageirosão chama<strong>da</strong>s <strong>de</strong> éxons, as não codificantessão chama<strong>da</strong>s <strong>de</strong> íntrons.
Recomposição <strong>do</strong> RNA (Splicing)• Mecanismo pelo qual os introns são retira<strong>do</strong>s<strong>do</strong> RNA mensageiro.• São 3 diferentes mecanismos: Recomposição<strong>do</strong> precursor <strong>de</strong> tRNA, recomposiçãoautocatalítica e recomposição <strong>do</strong> Pre-mRNA.
Mecanismos <strong>de</strong> remoção <strong>de</strong> íntrons• Recomposição <strong>do</strong> precursor <strong>de</strong> tRNA: os introns <strong>do</strong>sprecursores <strong>de</strong> tRNA são removi<strong>do</strong>s precisamentepor uma en<strong>do</strong>nuclease que cliva os introns, umaligase <strong>de</strong>pois religa os éxons <strong>de</strong> tRNA.• recomposição autocatalítica: Em alguns rRNA osintrons se autoremovem, sem a ação catalítica <strong>de</strong>nenhuma enzima.• recomposição <strong>do</strong> Pre-mRNA: Os introns <strong>do</strong> hnRNAsão removi<strong>do</strong>s por particulas complexas envolven<strong>do</strong>proteinas e snRNA que são chama<strong>da</strong>s <strong>de</strong>spliceossomos.
• O processamento <strong>de</strong> RNA aumentaconsi<strong>de</strong>ravelmente o tempo <strong>de</strong> vi<strong>da</strong> <strong>do</strong> mRNA(10 horas em células <strong>de</strong> mamíferos e 2-5minutos em procariotos).• mRNA está pronto para sair <strong>do</strong> núcleo e sertraduzi<strong>do</strong> no citoplasma.