19.06.2013 Views

Curs 2 Proprietatile remarcabile ale enzimelor Enzimele sunt cei ...

Curs 2 Proprietatile remarcabile ale enzimelor Enzimele sunt cei ...

Curs 2 Proprietatile remarcabile ale enzimelor Enzimele sunt cei ...

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

<strong>Curs</strong> 2<br />

<strong>Proprietatile</strong> <strong>remarcabile</strong> <strong>ale</strong> <strong>enzimelor</strong><br />

<strong>Enzimele</strong> <strong>sunt</strong> <strong>cei</strong> mai performanti, precisi, stereospecifici catalizatori din toate grupele<br />

de catalizatori. <strong>Enzimele</strong> (“en”-in, “zima”-drojdie) <strong>sunt</strong> proteine care au capacitatea de a<br />

interactiona cu o substanta chimica numita substrat si proprietatea de a mari viteza de<br />

transformare a acestuia in produsi de reactie, dupa care acestea se refac si pot fi utilizate<br />

intr-un nou ciclu catalitic. S-a estimat faptul ca exista circa 25000 de enzime. Pana in<br />

prezent s-au caracterizat aproximativ 3000 de enzime din care 300 s-au obtinut in stare<br />

cristalina prin tehnici diferite si pot fi achizitionate de la companiile specializate in<br />

vanzarea de produse biochimice.<br />

<strong>Enzimele</strong> au cateva proprietati <strong>remarcabile</strong> in comparatie cu alte tipuri de catalizatori.<br />

Dintre acestea trei proprietati importante <strong>sunt</strong>: marea lor putere catalitica, specificitatea si<br />

gradul in care activitatea lor catalitica poate fi controlata de o serie de compusi naturali.<br />

Puterea catalitica<br />

<strong>Enzimele</strong> pot creste viteza de reactie cu pana la 17 ordine de magnitudine (Ex: orotidin<br />

5’-fosfat decarboxilaza - Radzicka & Wolfenden,Science,1995). In cele mai multe cazuri<br />

o comparatie intre viteza unei reactii catalizate enzimatic si necatalizata este greu de<br />

realizat. Pentru ultima reactie (in absenta catalizatorului, enzimei) vitezele pot fi foarte<br />

mici si ca atare greu de cuantificat. Cand aceasta comparatie este posibila cresterile<br />

vitezei de reactie pot fi mai mari de 4 (creatin kinaza), 8 (alcool dehidrogenaza), 9<br />

(triozfosfat izomeraza), 10 (hexokinaza), 11 (fosforilaza) ordine de magnitudine. In unele<br />

situatii activitatea enzimatica poate fi masurata la temperatura mai mica (datorita<br />

stabilitatii reduse a enzimei) comparativ cu reactia necatalizata.<br />

Un exemplu il constituie ureaza, prima enzima (din fasole Canavalia ensiformis) care a<br />

fost cristalizata in stare pura. Existenta enzimei a fost raportata inca din secolul XIX.<br />

Experimentele initi<strong>ale</strong> au fost efectuate de catre chimistul suedez Jon Jakob Berzelius,<br />

cercetatorul care a introdus termenul de activitate catalitica. In schimb pana in 1926 nu se<br />

stia exact daca ureaza era obtinuta in stare pura. Acest fapt a fost demostrat de catre<br />

James B. Sumner de la Universitatea Cornell. Sumner a reusit sa izoleze enzima si sa o<br />

cristalizeze si din acest motiv a fost recompensat cu premiul Nobel in 1947.<br />

Ureea este o molecula foarte stabila, care in mod normal hidrolizeaza foarte incet<br />

obtinandu-se acidul izocianic si amoniac. Durata reactiei necatalizate este de 3,6 ani la 38<br />

C. Activitatea catalitica a enzimei determina o crestere a vitezei de reactie (in mediu<br />

acid) de aproape 14 ordine de magnitudine. In timp ce reactia necatalizata implica o<br />

eliminare directa a moleculei de amoniac, enzima probabil catalizeaza o reactie<br />

hidrolitica a ionului carbamat (intermediar).


Specificitatea<br />

Majoritatea <strong>enzimelor</strong> au specificitate ridicata atat pentru substrat(e) cat si asupra reactiei<br />

pe care o acesta/acestia o catalizeaza. Exista insa si cazuri in care enzimele au<br />

specificitate scazuta (anumite peptidaze, fosfataze si esteraze)-utilizeaza o gama larga de<br />

substrate care contin legaturile respective (legatura peptidica, gruparea fosfoesterica,<br />

gruparea esterica). Aceste enzime au rol degradativ (digestie, ex chimotripsina) si nu de<br />

biosinteza.<br />

Specificitatea scazuta a chimotripsinei –scindarea legaturilor amidice si esterice<br />

Exista insa si alte exceptii, cand una si aceeasi enzima poate prezenta activitati catalitice<br />

diferite. Un exemplu <strong>sunt</strong> reactiile catalizate de preparatele enzimatice din muschiul<br />

cardiac de porc, bumbac, sau din N. crassa: prima reactie este cea de conversie a oxaloacetatului<br />

la malat, iar cea de-a doua reactie este o reactie de transfer a gruparii amino.<br />

Aceste enzime contin cel putin doi centri activi, specificitatea pentru fiecare substrat fiind<br />

o caracteristica a unui singur situs catalitic.


Exista si enzime care prezinta o specificitate de grup.<br />

Din aceasta categorie fac parte hexokinaza, o enzima<br />

care catalizeaza fosforilarea unei p<strong>ale</strong>te largi de<br />

aldohexoze (zaharuri). Fosforilarea glucozei<br />

determina o incapacitate de transport a moleculei de<br />

monozaharida in/inafara celulei. Oricum, majoritatea<br />

<strong>enzimelor</strong> au specificitate aproape absoluta. Un<br />

exemplu este ureaza care catalizeaza reactia cu ureea<br />

sau cu analogi (la o viteza mult mai redusa). O grupa<br />

de enzime intens studiata in ultimele decenii este cea<br />

a endonucleazelor (enzime de restrictie). Aceste<br />

enzime recunosc o secventa de 4-6 perechi de baze<br />

(secventa palindromica) din cadrul ADNului si<br />

cliveaza legaturile fosfodiesterice din ambele lanturi.<br />

Exista cel putin 400 de endonucleaze care difera prin<br />

specificitatea lor. In acest sens, fiecare endonucleaza<br />

are specificitate absoluta pentru regiunea substratului<br />

care este in contact cu situsul catalitic, desi poate<br />

actiona asupra mai multor secvente de ADN in cazul<br />

in care motivul “substratului” se repeta. De exemplu,<br />

EcoR I (E. Coli Restriction Endonuclease I) poate<br />

scinda intre nucleotidele G si A, iar Stu I scindeaza<br />

intre nucleotidele G si C (taietura enzimatica a ADNului duplex este dreapta)<br />

O trasatura distincta a multor reactii<br />

catalizate de enzime este<br />

stereospecificitatea, capacitatea acestora<br />

de a recunoaste numai un izomer<br />

geometric sau optic. In majoritatea<br />

cazurilor, enzimele recunosc unul dintre<br />

<strong>cei</strong> doi enantiomeri. Din acest motiv in<br />

organism se intalnesc cu precadere Laminoacizi<br />

si D-monozaharuri.<br />

D-aminoacid-oxidazele (sursa: rinichiul de porc), enzime specifice aminoacizilor din<br />

seria D, <strong>sunt</strong> capabile sa converteasca acesti compusi in cetoacizi.


L-aminoacid-oxidazele (enzime din veninul de sarpe) catalizeaza conversia L-aminoacizilor<br />

la cetoacizi.<br />

Exista insa si alte situatii in care specificitatea este dictata de sursa din care enzima este<br />

izolata. De exemplu, lactat dehidrogenaza din muschi este activa fata de L(+)-lactat, pe<br />

cand cea din Lactobacillus plantarum converteste D(+)-lactatul la piruvat.<br />

Un exemplu este cel al NAD + - si NADP + - dehidrogenazelor. A fost demonstrat, prin<br />

marcarea substratului cu izotopi radioactivi, faptul ca transferul hidrogenului are loc de la<br />

substrat la o fata particulara (notata A sau B) a dehidrogenazelor.<br />

Formele reduse pentru nicotin adenin dinucleotid (NADH)<br />

si nicotin adenin dinucleotid fosfat (NADPH)<br />

Mai mult, majoritatea dehidrogenazelor actioneaza asupra NAD + -ului (alcool-, lactat-,<br />

m<strong>ale</strong>at-, glicerol-3-fosfat-, 3-hidroxibutirat-, glucoz-, gliceraldehid dehidrogenaza si<br />

citocrom b5 -reductaza) sau NADP + -ului (3-oxiacil-reductaza, homoserin si glucoz-6fosfat<br />

dehidrogenaza).<br />

Exista cazuri de prochiralitate (substratul nu are un centru chiral de reactie) in reactiile<br />

catalizate de enzime. Un exemplu este cel a reactiei catalizate de fumarat hidrataza<br />

(localizata in mitocondrii si intervine in ciclul acidului citric), reactie in care fumaratul<br />

este convertit in malat. Reactia poate fi demonstrata prin utilizarea apei tritilate ( 3 H2O).<br />

Aceasta permite marcarea atomului de hidrogen care este atasat la substrat. Un caz<br />

asemanator este cel al aconitazei enzima care catalizeaza interconversia citratului la<br />

izocitrat, compusul intermediar fiind aconitat, in cadrul ciclului acidului citric (ciclul<br />

Krebs).


Fumarat hidraza catalizeaza conversia m<strong>ale</strong>atului in fumarat<br />

Aconitaza catalizeaza conversia citratului in izocitrat<br />

Pentru a intra in ciclul Krebs propionil-CoA trebuie sa fie convertita in succinil-<br />

CoA. O prima etapa a acestui lant de reactii il constituie o sinteza prochirala in care prin<br />

carboxilarea propionil-CoA (optic inactiva) se formeaza metil-malonil-CoA optic activa.<br />

La polul opus se afla racemazele, enzime care actioneaza asupra ambilor<br />

enantiomeri cu formarea de amestecuri racemice. De exemplu, alanil-racemaza poate<br />

actiona asupra ambilor izomeri optici ai alaninei, reactie care conduce intotdeauna la un<br />

racemic.<br />

Un alt aspect al specificitatii <strong>enzimelor</strong> a fost evidentiat in cazul sintezei<br />

proteinelor si replicarii ADNului. Cercetatorii au demostrat ca rata erorilor la replicarea


ADNului in “vivo” este de o greseala la 10 8 -10 10 nucleotide polimerizate si faptul ca<br />

eroarea la transcriptie si translatie (ARNm in secventa proteica) este de aproximativ 1<br />

aminoacid la 1000 de resturi. Aminoacil ARNt sintetaza recunoaste atat aminoacidul<br />

(selectivitate scazuta datorita dimensiunilor mai mici) cat si ARNt-ul (enzima are<br />

selectivitate ridica datorita dimensiunilor mai mari <strong>ale</strong> ARNt-ului). Enzima are si un situs<br />

catalitic care hidrolizeaza aminoacizii din complexul aminoacil-adenilat.<br />

Influenta unor anumiti factori asupra activitatii catalitice<br />

Activitatea catalitica a <strong>enzimelor</strong> poate fi controlata de o serie de factori: pH, tarie<br />

ionica, temperatura, de ioni sau de alte molecule.<br />

Influenta pHului<br />

Activitatea unei enzime depinde de pHul din mediu din doua motive: prezenta in<br />

centrul activ al enzimei de grupe donoare sau acceptoare de protoni si mentinerea<br />

amsamblului structural enzimatic. Grupele acceptoare de protoni pot fi titrate,<br />

dependentele activitatii enzimatice cu pHul au in majoritatea cazurilor o forma de clopot,<br />

cu un maxim la pHul optim. Cel mai adesea expunerea enzimei la valori extreme de pH<br />

poate conduce la schimbari structur<strong>ale</strong> ireversibile (scadere a activitatii enzimatice).<br />

Majoritatea <strong>enzimelor</strong> au un pH optim in mediu neutru. <strong>Enzimele</strong> care prefera conditii<br />

extreme, ca pepsina si fosfataza alcalina, trebuie testate in domeniul de pH adecvat.<br />

Deoarece activitatea enzimatica este influentata de schimbarile de pH, valoarea acestui<br />

parametru trebuie mentinuta constanta in decursul determinarii. Pe de alta parte,<br />

componentele din amestecul de testat sau solutia enzimei pot schimba pHul. In unele<br />

situatii reactia enzimatica poate determina un salt/o scadere a pHului si din acest motiv<br />

valoarea finala a acestuia la sfarsitul reactiei trebuie masurata.<br />

Taria ionica si solutiile tampon<br />

Taria ionica potrivita pentru masurarea activitatii enzimatice este dictata de<br />

molaritatea solutiei tampon utilizate. Cel mai frecvente se foloseste o concentratie de<br />

0,1 M, valoare care reprezinta o tarie ionica mica comparativ cu aceea intalnita in celula.<br />

O tarie ionica ridicata (1 M) poate conduce la inactivarea enzimei, cu unele exceptii<br />

(organismele termofile si halofile). Natura ionilor din solutia tampon poate fi un factor<br />

determinant pentru inactivarea sau destabilizarea <strong>enzimelor</strong>. Solutiile tampon avand in<br />

componenta substante de natura organica pot fi mai stabile, dar in majoritatea cazurilor<br />

trebuie cautat tamponul potrivit pentru fiecare enzima. De exemplu, in cazul folosirii<br />

fosfatului de potasiu trebuie sa se stie faptul ca tamponul are capacitate de legare pentru<br />

cationi. Tris, un alt compus folosit la prepararea solutiilor tampon, poate uneori dezactiva<br />

enzimele. Alaturi de compatibilitatea tampon-enzima trebuie sa se considere si<br />

capacitatea de tamponare optima (intre 1-2 unitati de pH).<br />

Temperatura<br />

Ca si in cazul pHului nu se poate postula o temperatura ideala pentru toate<br />

enzimele. De obi<strong>cei</strong>, pentru o enzima se va masura activitatea la diferite valori <strong>ale</strong><br />

temperaturii, mentinand pHul constant (si in domeniul optim). De fapt, in acest caz<br />

intervin doua procese. Odata cu cresterea temperaturii, viteza miscarii moleculelor<br />

(vitezei de reactie) creste cu un factor de 2-3 la fiecare 10 grade. In schimb, odata cu<br />

cresterea temperaturii apare tendinta proteinelor de a se denatura si implicit a se<br />

dezactiva. Procesul de denaturare a <strong>enzimelor</strong> depinde de doi factori: temperatura si timp.<br />

La temperaturi inalte are loc o inactivare rapida, insa si la temperaturi moderate poate<br />

avea loc o inactivare mai lenta. De exemplu, alcool dehidrogenaza poate fi inactivata si la


o temperatura de 37 ºC. Din acest motiv activitatea poate fi influentata de timpul scurs<br />

pana la masurarea activitatii. In majoritatea cazurilor se va incerca scurtarea timpului de<br />

procesare a unui extract enzimatic in scopul pastrarii activitatii. In general se utilizeaza 3<br />

temperaturi (25, 30 si 37 ºC)<br />

Cofactorii<br />

Cofactorii metalici<br />

Studiile cristalografice au dovedit faptul ca enzimele <strong>sunt</strong> proteine cu lanturi de<br />

100-2500 de aminoacizi. Enzime ca chimiotripsina sau triozfosfat izomeraza (enzima<br />

care catalizeaza interconversia compusilor difosforilati cu 3 atomi de carbon) <strong>sunt</strong> active<br />

fara a avea nevoie de alti compusi/ioni. In general, pentru o activitate corespunzatoare,<br />

enzimele au nevoie de o componenta neproteica (cofactor). Un grup de cofactori <strong>sunt</strong><br />

ionii metalici. In cele mai multe cazuri ionii metalici stabilizeaza conformatia enzimei in<br />

forma catalitic activa. Un exemplu il constituie fosforilaza, enzima care catalizeaza prima<br />

etapa de clivare a glicogenului din muschii scheletici. Aceasta enzima permite degradarea<br />

rezervelor de carbohidrati. Contractia muschilor scheletici este o consecinta a expulzarii<br />

Ca 2+ din reticulul sarcoplasmatic fapt care duce la activarea fosforilazei (poate fi dictata<br />

si de hormoni-adrenalina) si implicit la producerea ATPului.<br />

Fenomenul de inhibitie feedback este comun pentru diferite cai de biosinteza. De<br />

exemplu, c<strong>ale</strong>a metabolica de sinteza a nucleotidelor pirimidinice conduce la UTP si<br />

CTP. Acesti produsi inhiba primele enzime (carbamoil-fosfat sintazei si aspartat carbamoil<br />

transferazei) din cadrul sintezei metabolice determinand controlul biosintezei<br />

metabolitilor.<br />

Carboxipeptidazele, enzime care catalizeaza scindarea legaturii peptidice la<br />

capatul C-terminal al substratului, necesita zinc pentru activitatea catalitica. Indepartarea<br />

zincului (prin complexare cu EDTA) poate avea drept consecinta inactivarea enzimei.<br />

Activitatea poate fi redobandita la adaugarea ionilor de zinc. Aldolaza si anhidraza<br />

carbonica necesita de asemenea ioni de zinc pentru o activitate catalitica corespunzatoare.<br />

Kinazele, enzime care transfera o grupare -fosforil de la ATP la o molecula acceptor,<br />

necesita ionii de magneziu care se leaga, in acest caz, de substrat (ATP) si nu de enzima.


Nucleaza stafilococala, enzima care hidrolizeaza ADNul si ARNul, leaga Ca 2+ un<br />

ion esential pentru reactia enzimatica. Si ureaza contine ioni de nichel, fapt care a fost<br />

dovedit la 50 de ani de la cristalizarea enzimei.<br />

Necesitatea prezentei acestor cofactori explica de ce<br />

organismele au nevoie de cantitati mici din aceste<br />

molecule (ioni) in dieta lor. Natura metalo-<strong>enzimelor</strong><br />

poate explica uneori efectele toxice <strong>ale</strong> met<strong>ale</strong>lor grele<br />

asupra unor plante/organisme. De exemplu, Cd 2+ si<br />

Hg 2+ poate inlocui Zn 2+ din situsul catalitic al aceleiasi<br />

enzime (din ARN polimeraza) determinand pierderea<br />

activitatii acesteia.<br />

Exista si alte exemple in care ionii metalici <strong>sunt</strong><br />

indispensabili <strong>enzimelor</strong> (Tabelul 2)<br />

Tabel 2. Exemple de ioni metalici necesari unor enzime<br />

Metalul Enzima<br />

Na -D-glucohidrolaza din intestin<br />

K Piruvat kinaza<br />

Mg Hexokinaza, Piruvat-kinaza, Adenozintrifosfataza<br />

Fe Catalza, Peroxidaza, Nitrogenaza<br />

Zn Alcooldehidrogenaza, Carboxipeptidaza<br />

Mo Xantinoxidaza, Nitrogenaza<br />

Cu Citocrom c oxidaza, Amin-oxidaza<br />

Ni Ureaza<br />

Cofactorii organici<br />

A doua clasa de cofactori este reprezentata de cofactorii organici (marea partea<br />

<strong>sunt</strong> derivati ai vitaminelor B) ce interactioneaza slab cu apoenzimele. Intre cele doua<br />

componente se formeaza legaturi slabe de tipul puntilor de hidrogen, interactiuni<br />

hidrofobe.<br />

Cofactorii legati strans (prin legaturi cov<strong>ale</strong>nte) poarta denumirea de grupari<br />

prostetice. O enzima care contine un cofactor sau o grupare prostetica poarta numele de<br />

holoenzima, iar una in care cofactorul este indepartat apoenzima. Daca din holoenzima<br />

este indepartat cofactorul dispare activitatea catalitica. Moleculele mici sau speciile care<br />

se leaga reversibil la o enzima se numesc liganzi (acest termen general poate include<br />

substratul, compusi analogi cu structura asemanatoare substratului, inhibitorul sau<br />

ionul/ionii metalici).<br />

Asadar, cofactorii se pot lega necov<strong>ale</strong>nt sau cov<strong>ale</strong>nt de apoenzime. De exemplu FADul<br />

este o grupare prostetica pentru lipoamid-dehidrogenaza si coenzima pentru D-aminoacid-oxidaza.<br />

Din punct de vedere structural enzimele se impart in 4 clase: coenzime de natura<br />

alifatica, coenzime de natura aromatica si coenzime cu structura nucleozidica sau<br />

nucleotidica.


Princip<strong>ale</strong>le coenzime de natura alifatica <strong>sunt</strong> glutationul, acidul lipoic si acidul ascorbic.<br />

O enzima dependenta de glutation este glutation-homocistin-transdehidrogenaza si<br />

permite formarea puntilor disulfidice prin conversia cisteinei in cistina. Glutationul redus<br />

(G-SH) poate fi oxidat reversibil sub actiunea glutation-reductazei.<br />

Decarboxilarea oxidativa a acidului piruvic din tesuturile anim<strong>ale</strong> este realizata cu<br />

ajutorul unui complex enzimatic. Una dintre enzime este dihidrolipo-transacetilaza care<br />

contine amida acidului lipoic drept cofactor.<br />

Conversia DOP-aminei in noradrenalina este catalizata de DOP-amin-hidroxilaza care<br />

necesita acid ascorbic, O2 si ioni de cupru. Tirozina poate fi metabolizata la acid<br />

homogentizinic care se elimina pe c<strong>ale</strong> renala. Ultima etapa a acestei secvente metabolice<br />

este catalizata de o enzima specifica care este dependenta de ascorbat.<br />

Astfel majoritatea carboxilazelor, enzime implicate in incorporarea CO2, necesita biotina,<br />

care este atasata printr-o legatura de tip amidic de enzima (intre gruparea –COOH a<br />

biotinei si o grupare -amino din catena laterala a unei lizine din secventa polipeptidica).<br />

Propionil-CoA-carboxilaza este o enzima care este dependenta de biotina ce catalizeaza<br />

transformarea propionil-CoA in metil-malonil-CoA. Tiamin difosfatul joaca rol de<br />

coenzima pentru transcetolaza, enzima care intervine in metabolismul glucidic (catalizeza<br />

transferul unui fragment de doi atomi de carbon din molecula fructozo-6-fosfatului pe<br />

scheletul hidrocarbonat al glicerinaldehid-3-fosfatului). Decarboxilarea aminoacizilor,<br />

reactie din care rezulta aminele, se realizeaza cu ajutorul unor enzime specifice care <strong>sunt</strong><br />

dependente de piridoxal fosfat. Histidin-decarboxilaza este o enzima care converteste<br />

histidina la histamina, substanta cu proprietati vasopresoare si care regleaza secretia de<br />

HCl din stomac prin stoparea secretiei de gastrina. Ornitin- decarboxilaza catalizeaza<br />

reactia de decarboxilare a ornitinei cu formare de putres<strong>cei</strong>na (precusorul poliamidelor<br />

spermidina si spermina esenti<strong>ale</strong> pentru reglarea celulara si pentru interactiunile dintre<br />

acizii nucleici). Aminotransferazele, enzime care intervin in c<strong>ale</strong>a metabolica de<br />

degradare a aminoacizilor, contin piridoxal-fosfatul in calitate de coenzima. Serindezaminaza<br />

si serin-hidroximetil-transferaza , enzime care converstesc serina la piruvat,<br />

respectiv glicocol, au piridoxalfosfatul in calitate de cofactor (este legat de enzima sub<br />

forma unei baze Schiff).<br />

Pteroenzimele folosesc drept cofactor acidul tetrahidrofolic pentru transferarea gruparilor<br />

formil, hidroximetil.<br />

Nucleozid-fosfatii indeplinesc rol de cofactori in reactiile de transfosforilare, enzimele ce<br />

catalizeaza aceste procese fiind denumite kinaze. Nucleozidfosfatii contin in molecula<br />

atat baze purinice cat si pirimidinice.<br />

Piridoxal-fosfat biotina


Acid lipoic<br />

Tiamin difosfat<br />

Unii cofactori <strong>sunt</strong> atasati tranzitoriu la diverse enzime si astfel joaca rol de cosubstrat.<br />

Nicotin adenin dinucleotidul (NAD + ) si nicotin adenin dinucleotid fosfatul (NADP + ) <strong>sunt</strong><br />

exemple de cosubstrate. De exemplu, NAD + este un agent de oxidare in reactia catalizata<br />

de alcool dehidrogenaza (ADH):<br />

Nomenclatura <strong>enzimelor</strong><br />

Clasificare generala<br />

In general denumirea unei enzime se face prin adaugarea sufixului –aza la numele<br />

substratului asupra caruia actioneaza (ureaza) sau are legatura cu reactia catalizata (lactat<br />

dehidrogenaza catalizeaza dehidrogenarea lactatului cu obtinerea piruvatului).<br />

Denumirea <strong>enzimelor</strong> se face pe trei paliere.<br />

Primul palier cuprinde o denumire uzuala, mai putin stiintifica, se bazeaza pe denumirile<br />

trivi<strong>ale</strong> <strong>ale</strong> <strong>enzimelor</strong> (enzima “galbena”, catalaza, papaina, tripsina, rodanaza-o enzima<br />

mitocondriala care converteste ionul cianura in ionul tiocianat) si are in vedere evolutia in<br />

timp a cunostintelor legate de enzimele respective. Oricum, multe enzime (ex. catalaza<br />

care mediaza descompunerea apei oxigenate) au nume care nu <strong>sunt</strong> in concordanta cu<br />

functia pe care acestea o manifesta in decursul reactiei enzimatice.<br />

Al doilea palier se bazeaza pe tipul reactiei catalizate de enzime. Astfel, exista 6 tipuri<br />

majore de reactii enzimatice:<br />

1. reactii de oxido-reducere catalizate de oxidoreductaze;<br />

2. reactii de transfer a unor grupe (grupari fosfat, resturi de peptide), catalizata de<br />

transferaze;<br />

3. reactii hidrolitice (hidroliza esterilor, hidroliza legaturilor C-X, aditia apei la<br />

legatura dubla) catalizata de hidrolaze;<br />

4. reactii de eliminare in care legatura dubla este formata, catalizata de liaze;<br />

5. reactii de izomerizare, catalizate de izomeraze;


6. reactiile de formare a unor legaturi chimice (C-C), pe baza energiei consumate de<br />

o sursa de energie (uzual ATP), catalizata de ligaze (sintetaze).<br />

Numele complet al unei enzime nu descrie numai tipul reactiei catalizate, insa<br />

descrie substratul asupra caruia enzima actioneaza si alte informatii.<br />

1. Oxidoreductazele<br />

Oxidoreductazele <strong>sunt</strong> enzime implicate in procese de oxidare biologica si<br />

catalizeaza reactii bimoleculare:<br />

A ox + B red<br />

A red + B ox<br />

Denumirea <strong>enzimelor</strong> din aceasta clasa se realizeaza prin includerea denumirii<br />

donorului si acceptorului de hidrogen urmate de termenul oxidoreductaza<br />

(donor:acceptor-oxidoreductaza). In situatia in care acceptorul de hidrogen este oxigenul<br />

se apeleaza la termenul de oxidaza. Astfel, denumirea sistematica a alcooldehidrogenazei,<br />

enzima care catalizeaza reactia de oxidare reversibila a etanolului, este alcool:NAD + -<br />

oxidoreductaza (alcoolul = acceptor, NAD + = donor). Alcool dehidrogenaza joaca un rol<br />

important in procesele de fermentatie alcoolica. In biochimia clinica aceasta enzima se<br />

utilizeaza la estimarea concentratiei de alcool etilic in sange sau urina. Denumirea<br />

sistematica a catalazei este H2O2: H2O2-oxidoreductaza.<br />

Denumirea sistematica a lactat dehidrogenazei, L-lactat: NAD + -oxidoreductaza,<br />

arata ca L-lactatul actioneaza drept donor de electroni iar NAD + este acceptorul de<br />

electroni. Reactia este intalnita in fermetatiile lactice precum si in procesele anaerobe de<br />

degradare a glucidelor in cadrul procesului de glicoliza. Determinarea activitatii acestei<br />

enzime din sange este folosita la diagnosticarea infarctului miocardic, a hepatitei vir<strong>ale</strong>, a<br />

anemiei pernicioase.<br />

In metabolismul glucidic actioneaza si gliceraldehidfosfat-dehidrogenaza (Dgliceraldehid-3-fosfat:NAD<br />

+ -oxidoreductaza fosforilanta) care concomitet cu procesul<br />

redox fosforileaza si substratul:<br />

Aceasta subclasa cuprinde si superoxid-dismutaza (superoxid:superoxid –<br />

oxidoreductaza, metaloproteina-eritrocupreina, hemocupreina sau citocupreina) ce<br />

catalizeaza reactia de dismutatie a radicalilor superoxidici:<br />

Eliminarea CO2 de la acidul izocitric, din cadrul ciclului Krebs, se realizeaza prin<br />

intermediul izocitrat:dehidrogenazei (izocitrat:NAD + O<br />

-oxidoreductaza decarboxilanta)<br />

produsul de reactie fiind acidul –ceto-glutaric.<br />

2- + O2- + 2H + O2 + H2O2


O alta enzima din ciclul Krebs este succinat dehidrogenaza (succinat:acceptoroxidoreductaza),<br />

o flavoproteina care contine fier si sulf. Reactia catalizata de aceasta<br />

enzima consta in dehidrogenarea acidului succinic cu formarea de acid fumaric.<br />

Malat-dehidrogenaza (L-malat:NAD + -oxidoreductaza) intervine in ultima etapa a<br />

ciclului Krebs prin oxidarea acidului L-malic la acid oxalil-acetic.<br />

In fosforilarea oxidativa (oxidarea hidrogenului in apa) are loc reducerea<br />

co<strong>enzimelor</strong> (FAD sau NAD + ). Regenerarea acestor cofactori (la forma oxidata) se poate<br />

realiza prin actiunea transdehidrogenazei (NADPH:NAD + -oxidoreductaza). Enzima s-a<br />

izolat din mitocondriile din inima bovinelor sau bacterii. Sursa de energie a acestei reactii<br />

o constituie potentialul de membrana (din fluxul membranar de protoni) si din acest<br />

motiv aceasta enzima este o pompa protonica. Transdehidrogenaza mitocondriala este<br />

inglobata in structura membranei interne (prin intermediul a 14 segmente membranare) a<br />

mitocondriei sub forma unui dimer. De asemenea enzima poseda un motiv <br />

caracteristic domeniului care leaga nucleotide. Cele doua dinucleotide substrat (NADPH<br />

si NAD + respectiv NADH si NADP + ) se leaga la doua situsuri adiacente, diferite, fapt<br />

care face posibil transferul protonului de la un substrat la celalalt.<br />

UDP-glucozo-dehidrogenazei (UDP-glucoza:NAD + -6-oxidoreductaza), enzima din<br />

hepatocite, tesuturi si microorganisme, participa la formarea acidului UDP-glucuronic<br />

(un precursor al zaharurilor acide) din alcoolul corespunzator. Enzima din hepatocite


contine 6 monomeri. Oxidarea UDP-glucozei la UDP-glucuronat este acompaniata cu<br />

reducerea a doi moli de NAD + .<br />

Enzima formeaza intr-o prima etapa lagaturi cov<strong>ale</strong>nte (o baza Schiff) cu o grupare<br />

-amino a unui rest de lizina din centrul activ. In a doua etapa gruparea –SH apartinand<br />

unui rest de cisteina formeaza un tioester.

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!