Zahlen und Fakten - Leibniz Institute for Age Research

Jahresbericht 2006 

Zahlen und Fakten 

Leibniz-Institut für Altersforschung – 

Fritz-Lipmann-Institut (FLI) 

Jena

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

� 

Inhalt 

�� 

Struktur und Entwicklung 

4 Vorwort 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

Institutsstruktur 

6 Neue Arbeitsgebiete – neuer Name 

Entwicklung 

10 Zuwachs und Internationalisierung 

Gleichstellung 

11 Wissenschaftlerinnen stark vertreten 

Organigramm 

1 Wer macht was? 

Soziales Leben 

13 Grillfeiern und „noble Gespräche“ 

Drittmittel I 

14 Erfolgreicher Wettbewerb um 

zusätzliche Gelder 

Presse- und Öffentlichkeitsarbeit 

16 Forschung verständlich machen 

Wissenschaftlicher Rahmen 

Forschungsgruppen 

18 Ein Ziel – viele Wege 

Serviceeinrichtungen 

19 Erweitertes Methodenspektrum 

Kolloquien 

Gastredner aus dem In- und Ausland 

Seminare 

4 Wöchentliche Treffen 

Symposien 

8 Schwerpunkte der Forschung 

Klausurtagung 

9 Intensiver wissenschaftlicher Austausch 

Netzwerke I 

30 Kontakte in der Region 

Netzwerke II 

3 Nationale und internationale Kontakte 

Kooperationen 

34 Wissenschaftliche Partner

Wissenschaftliche Leistungen 

Publikationen I 

38 Beiträge in referierten Zeitschriften 

Publikationen II 

43 Beiträge in Zeitschriften und Büchern 

Vorträge 

44 Vorträge weltweit 

Akademische Würden 

49 Dissertationen, Habilitationen, Preise 

Patente 

50 Erfindungen schützen 

Drittmittel II 

51 Zusätzliche Gelder – zusätzliche 

Projekte 

Ausbildung 

57 Schule für Doktoranden 

Universitäre Lehre 

58 Vorlesungen, Praktika, Diplom- und 

Doktorarbeiten 

Weiterbildung 

60 Vielfältige Qualifizierungsangebote 

61 Impressum 

Annex: 

6 Richtlinien für die 

FLI-Graduiertenschule 

(in englischer Sprache) 

Weitere Informationen: 

Die wissenschaftlichen Inhalte der Forschungsarbeiten 

sind ausführlich beschrieben in unserer Broschüre „Rätsel 

Altern – Das Leibniz-Institut für Altersforschung – Fritz- 

Lipmann-Institut in Jena stellt sich vor“. 

Die Broschüre, welche im April 2007 erschienen ist, 

können Sie bei uns kostenfrei anfordern. Sie finden sie au- 

ßerdem zum Herunterladen – zusammen mit weiteren 

allgemein-verständlichen Informationen über das FLI und 

seine Forschungsprojekte – auf den Internetseiten der 

Öffentlichkeitsarbeit unter www.fli-leibniz.de/news/infomaterial.php. 

Für weitere Fragen und Anregungen stehen 

wir Ihnen jederzeit zur Verfügung: 

Kontakt: 

Eberhard Fritz 

Forschungskoordinator 

Tel. 03641-65-6371 

efritz@fli-leibniz.de 

www.fli-leibniz.de 

Sekretariat/Assistenz 

Telefon: 03641-65-6339, -6333 

bergner@fli-leibniz.de, 

wissdir@fli-leibniz.de 

3

4 Vorwort 

Liebe Leserinnen und Leser, 

mit den nun vorliegenden „Zahlen und Fakten“ wollen 

wir unsere Forschungsbroschüre „Rätsel Altern“, mit der 

sich das Fritz-Lipmann-Institut (FLI) bereits der interessier- 

ten Öffentlichkeit vorgestellt hat, ergänzen. Die „Zahlen 

und Fakten“ schreiben die Entwicklung des FLI fort und 

präsentieren Ihnen übersichtlich den Stand der Dinge 

2006. 

Das FLI ist ein eingetragener Verein. Seine Mitglieder 

repräsentieren die Einbettung des Instituts in die Stadt 

Jena und in die Einrichtungen der Friedrich-Schiller-Uni- 

versität Jena. Ein international besetzter wissenschaft- 

licher Beirat begleitet die wissenschaftliche Entwicklung 

des Instituts. Das Kuratorium fungiert als Kontrollorgan. 

Sowohl im Kuratorium als auch im Beirat arbeiten Vertre- 

ter aus Wissenschaft und Industrie außerhalb Thüringens 

mit. 

Im Jahr 2006 konnten wir zwei neue wissenschaftliche 

Gruppen für das Fritz-Lipmann-Institut gewinnen, eine 

unter Leitung von Zhao-Qi Wang, die zweite unter der Lei- 

tung von Manuel Than. Zhao-Qi Wang verstärkt die me- 

thodische Arbeit mit Mausmodellen am FLI und den For- 

schungsschwerpunkt Genomstabilität. Darüber hinaus er- 

gänzt er die Erforschung altersbedingter Erkrankungen 

mit einem weiteren Projekt zum Schwerpunktthema Neu- 

rodegeneration. Manuel Than füllt die seit dem Jahr 2003 

verwaiste „Röntgen-Strukturanalyse“ und erforscht die 

dreidimensionale Struktur von Proteinen, die im Alterspro- 

zess und beim Entstehen alterstypischer Krankheiten eine 

wichtige Rolle spielen. 

Die wissenschaftlichen Leistungen und Projektvor- 

schläge des Fritz-Lipmann-Instituts wurden im Jahr 2006 

unter anderem mit dem „Thüringer Forschungspreis“ 

gewürdigt, mit dem Helen Morrison, die Leiterin der 

Forschungsgruppe Tumorbiologie, ausgezeichnet wurde. 

Innerhalb der Leibniz-Gemeinschaft nahm das Fritz-Lipmann-Institut 

am Wettbewerb um die sogenannten 

„Paktmittel“ teil und konnte erfolgreich zusätzliche 

Gelder einwerben. 

Zahlreiche Veröffentlichungen dokumentieren die Arbeiten 

des Instituts. Einige „Highlights“ des Jahres 2006 

möchte ich besonders hervorheben: 

“DNA sequence and analysis of human chromosome 8” 

Chad Nusbaum, Stefan Taudien, Karin Blechschmidt, 

Gernot Glöckner, et al, Nature 2006, 439(7074), 331-335 

“Mechanisms of Disease: psychomotor retardation and 

high T3 levels caused by mutations in monocarboxylate 

transporter 8” 

Edith C Friesema, Jurgen Jansen, Heike Heuer, Marija 

Trajkovic, Karl Bauer & Theo J Visser, Nat Clin Pract 

Endocrinol Metab. 2006, 2(9), 512-523 

“Tumorigenic transformation by CPI-17 through inhibition 

of a merlin phosphatase” 

Hongchuan Jin, Tobias Sperka, Peter Herrlich & Helen 

Morrison, Nature 2006, 442(7102), 576-579

„Zahlreiche Publikationen dokumen- 

tieren den internationalen Erfolg“ 

“Conditional deletion of Nbs1 in murine cells reveals its 

role in branching repair pathways of DNA double-strand 

breaks” 

Yun-Gui Yang, Amal Saidi, Pierre-Olivier Frappart, Wookee 

Min, Christelle Barrucand, Valerie Dumon-Jones, Jocelyne 

Michelon, Zdenko Herceg & Zhao-Qi Wang, EMBO J. 2006, 

25(23), 5527-5538 

“Analysis of translation initiation using a translation con- 

trol reporter system” 

Volker Wiesenthal, Achim Leutz & Cornelis F Calkhoven, 

Nat Protoc. 2006, 1(3), 1531-1537 

„Solution structure of the partially folded high-risk hu- 

man papilloma virus 45 oncoprotein E7” 

Oliver Ohlenschläger, Thomas Seiboth, Heike Zengerling, 

Lars Briese, Aliaksandr Marchanka, Ramadurai Rama- 

chandran, Marina Baum, Malgozata Korba, Wolfram 

Meyer-Klaucke, Matthias Dürst, Matthias Görlach, 

Oncogene 2006, 25, 5953-5959 

Alle Forschungsgruppenleiter des Fritz-Lipmann-Insti- 

tuts engagieren sich in der Lehre und bieten Vorlesungen, 

Seminare und Praktika in der Friedrich-Schiller-Universität 

an. Ein Meilenstein für die Ausbildung der Doktoranden 

im FLI ist die Etablierung der „Leibniz Graduate School on 

Ageing“ mit einem ausgefeilten Betreuungs- und Regel- 

werk. 

Während des Berichtszeitraums fand ein Wechsel des 

Administrativen Vorstands statt: Doris Schuster ging in 

Ruhestand, Daniele Barthel wurde Ende 2006 zur neuen 

Verwaltungsleiterin ernannt. Sichtbares Zeichen der Fort- 

entwicklung des FLI ist der Beginn des Neubaus, das 

Wachsen des neuen Laborgebäudes in den vergangenen 

Monaten. Die internationale Präsenz des Instituts ist na- 

türlich in erster Linie den Wissenschaftlerinnen und Wis- 

senschaftlern geschuldet. Die zwischenzeitlich weiter ver- 

besserten Laborbedingungen werden die Attraktivität un- 

seres Instituts künftig noch stärker erhöhen. 

Peter Herrlich 

Wissenschaftlicher Direktor 

5

6 Institutsstruktur 

Das Leibniz-Institut für Altersforschung - Fritz-Lip- 

mann-Institut e.V., kurz „FLI“, ist eine Einrichtung der Wis- 

senschaftsgemeinschaft Gottfried Wilhelm Leibniz e.V. 

(WGL). Wegen der überregionalen Bedeutung und auf- 

grund der gesamtstaatlichen wissenschaftspolitischen 

Interessen werden die Leibniz-Institute gemeinsam von 

Bund und Ländern gefördert (gemäß § 91 GG). 

Im Jahr 2003 hat das FLI (vormals „Institut für Mole- 

kulare Biotechnologie“, IMB) ein neues Arbeitsgebiet ent- 

wickelt: die Erforschung der Mechanismen des Alterns 

und altersbedingter Krankheiten – und im Jahre 2005 sei- 

nen neuen Namen der neuen Ausrichtung entsprechend 

gewählt. 

Die Organe des Vereins sind: 

- die Mitgliederversammlung, 

- das Kuratorium, 

- der Vorstand, 

- die Kollegiumsversammlung, 

- der Wissenschaftliche Beirat. 

Prof. Franz Maas, Schüler von Fritz Lipmann, 

bei seiner Rede zur Einweihungsfeier des FLI 

Neue Arbeitsgebiete – neuer Name 

Vereinsmitglieder im Jahr 2006 

Dr. Klaus Bartholmé 

Kanzler, Friedrich-Schiller-Universität Jena 

(bisher: Thüringer Kultusministerium) 

Prof. Dr. Gabriele Beibst 

Rektorin, Fachhochschule Jena 

Dr. Johann Komusiewicz (bis 5. Juli 2006) 

Staatssekretär, Ministerium für Wissenschaft, Forschung 

und Kultur des Landes Brandenburg 


Dr. Jörg Prinzhausen (seit 6. Juli 2006) 

Thüringer Kultusministerium 

Dr. habil. Peter Röhlinger (bis 31. Mai 2006) 

Oberbürgermeister der Stadt Jena 

Dr. Albrecht Schröter (seit 1. Juni 2006) 

Oberbürgermeister der Stadt Jena 

Prof. Dr. Herbert Witte 

Direktor, Institut für Medizinische Statistik, Informatik und 

Dokumentation; Prorektor für Forschung, Friedrich- 

Schiller-Universität Jena 

Dr. Daniele Barthel, 

Administrativer 

Vorstand 

Dr. Klaus Bartholmé 

Kuratoriums- Vorsitzender

Kuratorium im Jahr 2006 

Dr. Klaus Bartholmé, Vorsitzender 

Kanzler, Friedrich-Schiller-Universität Jena 


Prof. Dr. Piet Borst, Vors. Wiss. Beirat 

Professor für Biochemie und Molekularbiologie, 

Het Nederlands Kanker Instituut – Antoni van 

Leeuwenhoek Ziekenhuis, Amsterdam (Niederlande) 

OAR Heinrich Diermann (bis 19. Oktober 2006) 

Bundesministerium für Bildung und Forschung 

MR‘in Dr. Gabriele Hausdorf (seit 20. Oktober 2006) 

Bundesministerium für Bildung und Forschung 

Prof. Dr. Nancy Hynes 

Professorin für Molekularbiologie, Friedrich Miescher 

Institute for Biomedical Research, Basel (Schweiz) 

Prof. Dr. Herbert Jäckle 

Professor für Genetik, Vizepräsident der Max-Planck- 

Gesellschaft, Vorsitzender EMBO-Council 

Prof. Dr. U. Benjamin Kaupp, stellv. Vors. des Wiss. Beirates 

Professor für biophysikalische Chemie; Wissenschaftlicher 

Direktor, Center of Advanced European Studies and 

Research (caesar), (bisher: Instituts-Direktor, Forschungs- 

zentrum Jülich) 

Dr. Jörg Prinzhausen 

Thüringer Kultusministerium 

Prof. Dr. Peter Swetly 

Professor, Medizinische Fakultät der Universität Wien 

Vizerektor für Forschung der veterinärmedizinischen 

Universität Wien (Österreich) 

Prof. Dr. Herbert Waldmann 

Professor für Organische Chemie, Direktor, Max-Planck- 

Institut für Molekulare Physiologie Dortmund 

Prof. Dr. Herbert Witte, 

Direktor, Institut für Medizinische Statistik, Informatik 

und Dokumentation; Prorektor für Forschung, Friedrich- 

Schiller-Universität Jena 

Vorstand im Jahr 2006 

Prof. Dr. Peter Herrlich, Wissenschaftlicher Direktor 

Doris Schuster, Administrativer Vorstand 

(bis 30. April 2006) 

Dr. Daniele Barthel, Administrativer Vorstand 

(seit 02. Dezember 2006) 

Der Vorstand des Vereins besteht aus ein oder in der 

Regel zwei Personen. Das erste Mitglied ist Sprecher des 

Vorstandes und führt die Amtsbezeichnung Direktor. Das 

zweite Mitglied führt die Bezeichnung kaufmännischadministrativer 

Geschäftsführer. Gemäß § 12 der Satzung 

obliegt dem Vorstand die Führung der laufenden Geschäfte 

und die Leitung des Forschungsinstitutes. 

7

8 Institutsstruktur 

Kollegiumsversammlung / 

Forschungsgruppenleiter im Jahr 2006: 

Dr. Cornelis Calkhoven 

Prof. Dr. Stephan Diekmann 

Prof. Dr. Christoph Englert 

Dr. Marcus Fändrich 

Dr. Matthias Görlach 

Prof. Dr. Karl-Otto Greulich 

Prof. Dr. Frank Große 

Prof. Dr. Peter Herrlich 

Dr. Heike Heuer 

Dr. Christoph Kaether 

Dr. Helen Morrison (seit 1. November 2006) 

Dr. Matthias Platzer 

Dr. Aspasia Ploubidou 

Dr. Gabriele Schilling 

Dr. Jürgen Sühnel 

Dr. Manuel Than (seit 1. September 2006) 

Dr. Jan Tuckermann 

Prof. Dr. Zhao-Qi Wang (seit 1. Februar 2006) 

Prof. Dr. Falk Weih 

Dr. Thomas Wilhelm 

Mitglieder des Betriebsrats 

(ab Mai 2006) 

Dr. Oliver Ohlenschläger (Vorsitzender) 

Birgit Besenbeck 

Sabine Landmann 

Dr. Jörg Leppert 

Elke Meier 

Patricia Möckel 

Peter Müller 

Annerose Schneider 

Werner Schütze

Dem Wissenschaftlichen Beirat gehörten 

im Jahr 2006 an: 

Prof. Dr. Peter Becker 

Professor für Molekularbiologie, 

Adolf-Butenandt-Institut der Medizinischen Fakultät, 

Ludwig-Maximilians-Universität München 

Prof. Dr. Piet Borst, Vorsitzender 

Professor für Biochemie und Molekularbiologie 

Het Nederlands Kanker Instituut – Antoni van 


Prof. Dr. Ingrid Grummt 

Professorin für Molekularbiologie, 

Deutsches Krebsforschungszentrum DKFZ Heidelberg 

Prof. Dr. Michael Karin 

Professor für Pharmakologie, University of California, 

San Diego (USA) 

Prof. Dr. U. Benjamin Kaupp, stellv. Vorsitzender 

Professor für biophysikalische Chemie 

Wissenschaftlicher Direktor, Center of Advanced European 

Studies and Research (caesar) 

(bisher: Instituts-Direktor, Forschungszentrum Jülich) 

oben von links nach rechts: 

Prof. Michael Karin, Prof. Maarten van Lohuizen, Prof. Moshe Yaniv 

unten: 

Prof. Peter Becker, Prof. Piet Borst, Prof. Benjamin Kaupp, 

Prof. Ingrid Grummt, Prof. Otto W. Witte 

Prof. Dr. Maarten van Lohuizen 

Professor für Biologie 

Het Nederlands Kanker Instituut - Antoni van 


Prof. Dr. Otto W. Witte 

Professor für Neurologie 

Direktor, Jenaer Universitätsklinik für Neurologie 

Prof. Dr. Moshe Yaniv 

Emeritus-Professor, 

Institut Pasteur, Paris (Frankreich) 

9

10 Entwicklung 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

� 

Alle wissenschaftlichen Gruppen des Fritz-Lipmann- 

Instituts (FLI) haben in den Jahren 2003 bis 2006 Themen 

zur Erforschung des Alterns aufgenommen. Dies ent- 

spricht dem neuen, im Jahr 2003 entwickelten Konzept. In 

der Altersforschung bereits erfahrene Wissenschaftler 

konnten für das FLI gewonnen, die Zahl der Forschergrup- 

pen und der Personalstand erhöht werden. Dies ging mit 

einer merklichen Internationalisierung einher. Die Arbeits- 

sprache im FLI ist Englisch. 

�� 

Zuwachs und Internationalisierung 

Der Mitarbeiterstand am 31. Dezember 2006: 

Vorstand 2 

Professoren und Wissenschaftler 83 

Doktoranden 58 

Diplomanden 17 

Ingenieure und Technische Assistenz 77 

Verwaltung 13 

Arbeiter, Tierpfleger (Infrastruktur) 11 

Auszubildende 3 

Ausländische Mitarbeiter: 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

Anteil ausländischer Mitarbeiter (gesamt) 13,97% 

Anteil ausländischer Wissenschaftler 23,81% 

Anteil ausländischer Doktoranden 29,31% 

Ausländische Nationen am FLI 18 

davon EU -Westeuropa 10

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

Das Fritz-Lipmann-Institut identifiziert sich mit den 

von der Wissenschaftsgemeinschaft Gottfried Wilhelm 

Leibniz (WGL) am 19. Oktober 1998 verabschiedeten Rah- 

menempfehlungen zur Gleichstellung von Frauen und 

Männern. Derzeit (Stand 31. Dezember 2006) sind nahezu 

60 Prozent aller Angestellten des Instituts weiblichen Ge- 

schlechts; 46 Prozent aller Wissenschaftler sind weiblich. 

Die Verwaltungsleitung (Administrativer Vorstand) 

konnte mit Frau Dr. Daniele Barthel kompetent besetzt 

werden. Eine Frauenbeauftragte, Dr. Heike Heuer, wurde 

ernannt und zwischenzeitlich auch durch die Wahl 

bestätigt. 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

Wissenschaftlerinnen stark vertreten 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

� 

�� 

Gleichstellung 

Flexible Arbeitszeitmodelle, eine nahe gelegene bilinguale 

Kindertagesstätte und eine geplante Kindertagesstätte 

auf dem Campus unterstützen die weiblichen und 

männlichen Mitarbeiter des Fritz-Lipmann-Instituts darin, 

Beruf und Familie miteinander zu vereinbaren. 

Gesamtanteil weiblicher Mitarbeiter (gesamt) 59,93% 

Anteil Frauen unter den Wissenschaftlern 46,10% 

Anteil Frauen unter den Doktoranden 60,34% 

�� 

�� 

�� 

�� 

11

1 Organigramm 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

�� 

Vorsitzender: Klaus Bartholmé 

�� 


�� 

Daniele Barthel 

�� 

�� 

�� 

E. Fritz 

�� 

H. Lekscha; G.Bergner; E.Stöckl 

�� 

Zhao-Qi Wang 

�� 

J. Sühnel 

�� 

J. Sühnel 

�� 

P. Hemmerich 

�� 

M. Platzer 

�� 

J. Tuckermann 

�� 

F. Weih 

�� 

D. Weih 

�� 

K.-H. Gührs 

�� 

M. Görlach 

�� 

K. Gührs, B. Schlott 

�� 

E. Fritz 

�� 

Ch. Hoischen 

�� 

C. Calkhoven, H. Heuer, C. Kaether 

�� 

M. Than 

�� 

Vorsitzender: Piet Borst 

�� 

�� 

�� 

Maria Voigt 

�� 

Benita Rost 

�� 

Diana Kirchhof 

�� 

Swen Löhle 

�� 

�� 

Stand 31.12.2006

Grillfeiern und „Noble Gespräche“ 

Der Beutenberg Campus bietet viele Möglichkeiten, 

Mitarbeiter anderer Institute kennen zu lernen. Im Rah- 

men eines Festaktes wird beispielsweise alljährlich der 

Beutenberg-Wissenschaftspreis „Lebenswissenschaften 

und Physik“ vergeben, zwei Mal pro Jahr finden die „Nob- 

len Gespräche“ – Vorträge der Wissenschaftler für die Öf- 

fentlichkeit – statt. Mitarbeiter des Fritz-Lipmann-Insti- 

tuts haben zu den neuen „Campus Workshops“ beigetra- 

gen und waren bei öffentlichen Auftritten des „Campus 

Chamber Choir“ vertreten. 

Auf Institutsebene wird das rege soziale Leben unter- 

stützt. Der Betriebsrat des FLI initiierte – insbesondere für 

Wissenschaftler aus dem Ausland – das Vorführen aktu- 

eller Kinofilme in der englischsprachigen Originalversion. 

Auch auf dem sportlichen Sektor treffen sich gemein- 

same Interessen der Mitarbeiter: Mehrere Sportgruppen 

haben sich gebildet, um miteinander Fußball zu spielen, 

Rad zu fahren oder zu laufen. Auf großes Interesse stieß 

auch das sportliche Rahmenangebot rund um die erste 

Klausurtagung der Mitarbeiter in Bad Blankenburg. Sehr 

beliebt sind Ausflüge, Wanderungen und Paddeltouren 

der Forschungsgruppen auf der Saale. 

Soziales Leben 

Der Garten des Fritz-Lipmann-Instituts, das neu ange- 

mietete Bürogebäude („Villa“) und die renovierte „Bran- 

denburger Tor-Küche“ wurden auch im Jahr 2006 gerne 

zum Feiern genutzt, sei es im Sommer zum Grillen, für Ins- 

tituts-, Einstands- oder Weihnachtsfeiern. 

Gemeinsam forschen, 

gemeinsam feiern 

13

14 Drittmittel 

Erfolgreicher Wettbewerb um zusätzliche Gelder 

Als Mitglied der Leibniz-Wissenschaftsgemeinschaft 

wird der Grundhaushalt des Fritz-Lipmann-Instituts über 

eine hälftige Bund-Land–Finanzierung abgedeckt. Zusätz- 

lich haben die Wissenschaftler des FLI erfolgreich Dritt- 

mittel beim Bund, bei der Deutschen Forschungsgemein- 

schaft (DFG), bei der Europäischen Gemeinschaft (EU) 

sowie bei zahlreichen weiteren Institutionen der For- 

schungsförderung, beispielsweise bei Stiftungen, 

eingeworben. 

Der Wettbewerb um zusätzliche Gelder wurde am FLI 

durch interne Maßnahmen gefördert. So hat die Einwer- 

bung von Drittmitteln in den letzten Jahren erfreulicher- 

weise konstant zugenommen. Dies gilt insbesondere auch 

für die besonders kompetitive DFG-finanzierte Projektför- 

derung. 

2005 in € in % 2006 in € in % 2007 in € in % 

DFG 395.355 16,9 832.105 28,1 1.401.625 38,7 

Bund (BMBF + BMU) 1.660.664 71,1 1.786.072 60,4 1.686.129 46,0 

EU 156.277 6,7 71.360 2,4 188.655 5,2 

Stiftungen 18.500 0,8 62.639 2,1 151.200 4,2 

Sonstige öffentliche Zuwendungsgeber 35.603 1,5 114.678 3,9 159.980 4,4 

Industrie und private Zuwendungsgeber 69.000 2,9 92.000 3,1 30.910 0,9 

2.334.399 100 2.958.853 100 3.618.499 100

„Pakt für Forschung und Innovation“ 

Im Jahr 2005 formulierten Bund und Länder als poli- 

tisches Ziel, dass institutionell geförderte Forschungsor- 

ganisationen eine bessere Planungssicherheit erhalten 

sollen. Dies ging einher mit dem Beschluss, die finanziel- 

len Zuwendungen um jährlich drei Prozent zu steigern. 

Diese Mittel werden innerhalb der WGL im Rahmen eines 

Wettbewerbs, des „Pakts für Forschung und Innovation“, 

vergeben. 

Drittmittelfinanzierte Mitarbeiter: 

Mitarbeiter finanziert durch: Drittmittel* Haushalt 

Wissenschaftler 27,5 (39%) 42,5 

Doktoranden 23 (40%) 34** 

Forschungsingenieure/Techniker/Technische Assistenz 16,5 (21%) 60,5 

Wissenschaftliche /studentische Hilfskräfte 2 (25%) 6 

Gesamt 69 

(28 % aller finanzierten Mitarbeiter) 

143 

* inklusive PAKT-Finanzierung 

** inklusive zwei Leibniz-DAAD-Doktoranden 

Professor Christoph Englert und Dr. Matthias Platzer, 

beide Wissenschaftler des Fritz-Lipmann-Instituts, haben 

an diesem Wettbewerb erfolgreich teilgenommen. 

Ihr Projekt „Ein innovatives Modell für die Altersforschung: 

Genomanalyse und Mutagenese des Prachtgrundkärpflings 

Nothobranchius furzeri“ wird vom „Pakt für 

Forschung und Innovation“ mit einer Gesamtsumme von 

620 000 Euro (Laufzeit zwei Jahre: 2006 und 2007) 

gefördert. 

15

16 Presse- und Öffentlichkeitsarbeit 

Forschung verständlich machen 

Das Fritz-Lipmann-Institut (FLI) sieht es als seine Auf- 

gabe an, die Ergebnisse seiner Forschung der interessier- 

ten Öffentlichkeit in verständlicher Weise zugänglich zu 

machen. Um die neuen, von den Wissenschaftlern des FLI 

erarbeiteten Erkenntnisse zu den Mechanismen des Al- 

terns oder altersassoziierter Erkrankungen zu vermitteln, 

werden das Internet sowie Mitteilungen an die Presse ge- 

nutzt. In der eigens für die Öffentlichkeit verfassten 

neuen Institutsbroschüre „Rätsel Altern“ stellen die Wis- 

senschaftler des FLI ihre Arbeiten ausführlich den Bürger- 

innen und Bürgern vor. 

Darüber hinaus beteiligt sich das FLI aktiv an Veran- 

staltungen des Beutenberg-Campus für die Öffentlichkeit. 

So wurde für die „Lange Nacht der Wissenschaften“ im 

Jahr 2005 ein Tag der offenen Tür organisiert, für den „Ort 

der Ideen“ Veranstaltungen geplant, auch an den Vorbe- 

reitungen für die Bewerbung Jenas als „Stadt der Wissen- 

schaft“ war das FLI beteiligt. Mit speziellen Führungen 

und Praktika will das Fritz-Lipmann-Institut Schüler für die 

Alternsforschung interessieren und so gezielt zur Nach- 

wuchsförderung beitragen. 

Die Pressemitteilungen des Jahres 2006 

machten die Medien auf folgende Themen 

und Ergebnisse der Forschung im FLI 

aufmerksam: 

16. Januar 2006 

NGFN-Forscher entdecken neue Varianten im Schnittmuster 

der Gene 

18. Januar 2006 

Erste umfassende Analyse von Chromosom 8 des Menschen 

27. Januar 2006 

Kurzlebige Pfützenbewohner und ergraute Mäuse 

6. Februar 2006 

Wenn die eigene Adresse aus dem Gedächtnis fällt 

27. September 2006 

Merlin: Der Zauberer in der Krebsentstehung 

20. Dezember 2006 

Maus-Genetiker stärkt biomedizinische Altersforschung 

Führungen, Auftritte in der Öffentlichkeit: 

14. Juli 2006 

Thüringentag: Ausstellungszelt Thüringen Innovativ 

14. Juli 2006 

Beutenberg-Campus Jena: „365 Orte im Land der Ideen“, 

Tag der offenen Tür am FLI 

10. August 2006 

Schüler-Praktikum im Rahmen der Sommerschule der 

Friedrich-Schiller-Universität Jena

Prof. Ernst Rietschel 

bei seiner Rede zur 

Einweihungsfeier 

des FLI 

21.-23. September 2006 

Chemie zum Anfassen / Tage der Chemie 

Chemisch-Geowissenschaftliche Fakultät der Friedrich- 

Schiller-Universität Jena, unterstützt von der Gesellschaft 

Deutscher Chemiker, Jena (Goethe-Galerie) 

3. November 2006 

Leibniz-Forum zur Hirn- und Lernforschung, Magdeburg 


„Tag der Wissenschaften“ am Marie-Curie-Gymnasium, 

Wittenberge 

Beiträge in der Presse und sonstigen 

Medien, die über die Arbeiten des FLI 

berichteten (Auswahl): 

17. Januar 2006 

Thüringer Landeszeitung: 

„Das Geheimnis des Alterns“ 

19. Januar 2006 

Ost-Thüringer Zeitung: 

„Aufbau des menschlichen Chromosoms 8 aufgeklärt“ 

20. Januar 2006 

Radio Berlin-Brandenburg: 

Kulturradio am Vormittag 

26. Januar 2006 

MDR TV – MDR um 12: 

Schwerpunktthema Altersforschung 

31. Januar 2006 

Ost-Thüringer Zeitung: 

„Pfützenbewohner und ergraute Mäuse“ 

Jenaer Altersforscher untersuchen an Modell-Organismen 

die Geheimnisse des Alterns 


Neues Deutschland: 

„Fischlein lösen das Altersrätsel“ 

8. Mai 2006 

Thüringer Landeszeitung: 

„Neue Technologie gegen Alzheimer“ 

14. Juni 2006 

Main-Echo: 

„Unsere Lebenserwartung steigt und steigt“ 

14. Juli 2006 

Allgemeiner Anzeiger: 

„Wissenschaft zum Anfassen“ 

10. August 2006 

JenaTV: 

Summer School der FSU – Schüler besuchen das FLI 


EMBO encounters: 

“Striving for a better quality of life” 

23. Oktober 2006 

WDR5 – Wissenschaftsmagazin Leonardo: 

„Weinselig? Mit Rotwein leben Fische länger“ 

Die Aktivitäten der Presse- und 

Öffentlichkeitsarbeit machen die 

Altersforschung transparent. 

17

18 Forschungsgruppen 

Im Jahr 2006 waren 20 unabhängige Forschungsgrup- 

pen am FLI aktiv, darunter 10 Gruppen, die von Nach- 

wuchswissenschaftlern geleitet wurden. Genauere Be- 

schreibungen der wissenschaftlichen Projekte der For- 

schungsgruppen finden Sie in unserer Broschüre „Rätsel 

Altern, Das Leibniz-Institut für Altersforschung- Fritz-Lip- 

mann-Institut in Jena stellt sich vor“. Die Forschungsgrup- 

pen haben überlappende und sich ergänzende Fragestel- 

lungen und methodische Ansätze; sie sind formal den 2 

Programmbereichen „Zelluläre und organismische Senes- 

zenz” sowie „Spezifische altersbedingte Erkrankungen” 

zugeordnet: 

Im Bereich „Zelluläre und organismische Seneszenz“ 

beschäftigen sich die Forschungsgruppen von M. Platzer 

und C. Englert mit den biochemischen und genetischen 

Mechanismen, die die Lebenserwartung beeinflussen. An 

der Stabilität des Genoms, als wesentliche Determinante 

des Alterungsprozesses, arbeiten die Forschungsgruppen 

von S. Diekmann, K.O. Greulich, F. Große, P. Herrlich und 

Z.- Q. Wang. 

Die Leiter der 20 Forschungsgruppen 

Ein Ziel – viele Wege 

Im Bereich „Spezifische altersbedingte Erkrankungen“ 

arbeiten mehrere Forschungsgruppen an Aspekten neuro- 

degenerativer Erkrankungen (Forschungsgruppen von M. 

Fändrich, H. Heuer, C. Kaether, G. Schilling, M. Than) und 

der Krebsentstehung (C. Calkhoven, M. Görlach, H. Morri- 

son, A. Ploubidou). An Mechanismen der Arteriosklerose 

arbeitet die Forschungsgruppe Weih, an Osteoporose die 

Forschungsgruppe Tuckermann. Darüber hinaus forschen 

einige der genannten Gruppen an der Alterung des Im- 

munsystems, an Stammzellen, an den entsprechenden 

Krankheitsgenen und an Stoffwechselerkrankungen. Hier 

ist auch die Gruppe um den Gastwissenschaftler K. Bauer 

angesiedelt. 

Die Gruppen von J. Sühnel und T. Wilhelm forschen mit 

bioinformatischen und systembiologischen Ansätzen an 

übergeordneten Fragestellungen der Strukturbiologie, der 

Genomanalyse und der Zellbiologie, die auch für andere 

Forschungsgruppen relevant sind. 

20 unabhängige Arbeitsgruppen 

erforschen das Phänomen Altern

Erweitertes Methodenspektrum 

Das neue, 2003 etablierte Forschungskonzept des Fritz- 

Lipmann-Instituts erforderte auch ein neues Methoden- 

spektrum. Die bereits bestehenden Methoden und spezia- 

lisierten Einrichtungen sind mittlerweile durch mehrere 

neue Einrichtungen ergänzt worden. Sie können prinzipiell 

von allen Forschungsgruppen des FLI, aber auch von exter- 

nen Partnern genutzt werden. Je nach Aufwand kann die 

Nutzung der Einrichtungen als Service oder im Rahmen ei- 

ner wissenschaftlichen Kooperation erfolgen. Die Organi- 

sation und die Verantwortung für die Einrichtung obliegt 

dem Hauptnutzer beziehungsweise dessen Forschungs- 

gruppe. 

Folgende Serviceeinrichtungen stellt das 

FLI für die wissenschaftlichen Arbeiten 

bereit: 

Bioinformatik 

Die Biocomputing-Gruppe betreut eine Reihe von Ser- 

ver-Installationen für Anwendungsprogramme wie AM- 

BER, ClustalW, GAUSSIAN, Insight II [Accelrys], MolMol, 

MolScript, PAML, Prepi, SYBYL [Tripos], UCSF Chimera. 

(Forschungsgruppe Jürgen Sühnel) 

DNA-Sequenzierung 

Das FLI ist mit verschiedenen ABI-Sequenzern (3730, 

3700, 377), einem Pyrosequenzer PSQ96 und Robotern zur 

DNA-Präparation und Pipettierung von Flüssigkeiten ausgestattet. 

Darüber hinaus ist ein Netzwerk mit SUN-Workstations 

und ein Linux Cluster zur automatischen Sequenz- 

Assemblierung, -Analyse, und -Annotation verfügbar. Diese 

Ausstattung ermöglicht das Bearbeiten und Auswerten 

mehrerer Tausend DNA-Proben pro Tag sowie die Durch- 

Serviceeinrichtungen 

führung von „de novo“- und Re-Sequenzierprojekten in 

großem Maßstab (pro- und eukaryotische Genome, Metagenome, 

EST-Projekte, Mutations- und SNP-Detektion). 

Die rasante Entwicklung neuer Technologien erlaubt es, in 

Zukunft Geräte zu etablieren, die massiv-paralleles Sequenzieren 

(MPS) ermöglichen und somit die Sequenziergeschwindigkeit 

enorm beschleunigen. (Forschungsgruppe 

Matthias Platzer) 

Durchflusszytometrie/FACS 

FACS steht für „fluorescence activated cell sorting“. 

Für Routine-Analysen steht ein Becton Dickinson FACSCalibur 

Durchflusszytometer mit 488 und 633 nm Lasern zur 

Verfügung. Nach der Einweisung am Gerät können die 

Mitarbeiter selbstständig neben zwei physikalischen Parametern 

(Vorwärts- und Seitwärts-Streulicht) mindestens 

vier Oberflächenmarker messen sowie Zellzyklusanalysen 

durchführen. Weiterhin können mit dem präparativen 

FACSAria (ebenfalls 488 und 633 nm Laser) zusammen mit 

einem erfahrenen „Operator“ Subpopulationen von Zellen 

mit sehr hoher Geschwindigkeit und Reinheit sortiert werden. 

(Forschungsgruppe Falk Weih) 

Elektronenmikroskopie 

Strukturen biologisch relevanter Moleküle und deren 

Lokalisierung in Zellen und Geweben können elektronenmikroskopisch 

erkannt werden. Hierfür sind am FLI zwei 

Transmissions-Elektronenmikroskope etabliert. Sie stehen 

internen Benutzern und – nach entsprechender Vereinbarung 

– auch externen Nutzern zur Verfügung. 

(Forschungsgruppe Jan Tuckermann) 

19

0 Wissenschaftliche Serviceeinrichtungen 

Erweitertes Methodenspektrum 

Histologie 

Für histologische, immunhistochemische und immun- 

fluoreszierende Untersuchungen tierischer und mensch- 

licher Gewebe wurde ein modernes Histologielabor einge- 

richtet. Es können Paraffin- und Gefrierschnitte angefer- 

tigt, gefärbt und untersucht werden. Neben der Betreu- 

ung der benötigten Geräte (beispielsweise Gewebe- 

infiltrationsautomat, Paraffinausgießstation, Rotations- 

mikrotom, Kryostat, Färbe- und Glaseindeckautomat, 

Mikroskop mit Multidiskussionsbrücke) wird auch histo- 

technologisches „Know-how“ zur Verfügung gestellt. 

(Forschungsgruppe Falk Weih) 

Konfokale Mikroskopie 

Für konfokal-mikroskopische Analysen steht am FLI ein 

LSM510/Confocor2-Kombigerät von Zeiss zur Verfügung. 

Verschiedene Laserlinien ermöglichen das Detektieren 

und Trennen der gängigen Fluorophore in fixierten und 

lebenden Proben zur Bestimmung der Ko-Lokalisation, Interaktion 

und Dynamik von Biomolekülen durch Techniken 

wie FRET, FRAP und FCS. (Forschungsgruppen Stephan 

Diekmann und Karl-Otto Greulich) 

Massenspektrometrie 

Die Massenspektrometrie ist Teil des Proteinlabors im 

FLI. Gegenwärtig ist es mit einem Bruker Biflex II MALDI- 

ToF-Gerät und einem ThermoFinnigan LCQclassic ion-trap- 

ESI-Gerät ausgestattet. In erster Linie erfolgen die Messungen 

im Rahmen der Forschungsarbeiten des FLI. Darüber 

hinaus steht das Gerät auch interessierten externen Gruppen 

zur Verfügung, sofern deren Forschungsgegenstand mit 

der Grundrichtung des FLI – der molekularen Altersforschung 

– übereinstimmt. (Forschungsgruppe Frank Große) 

MUG: Microscope User Group 

MUG steht für „Microscope User Group“ und ist ein 

offenes Netzwerk von Mikroskop-Nutzern am FLI. Die Mikroskop-Palette 

reicht von einfachen Fluoreszenzmikroskopen 

bis hin zu hochwertigen Video- und konfokalen 

Mikroskopen. Die Philosophie des Netzwerkes ist es, die 

korrekte Einweisung und Nutzung der Mikroskope zu 

gewährleisten und technische sowie wissenschaftliche 

Hilfen zu leisten. (Koordination: Cornelis Calkhoven, Heike 

Heuer, Christoph Kaether) 

NMR 

Mit der Kernspinresonanz (nuclear magnetic resonance, 

NMR) lässt sich die dreidimensionale Struktur von 

Molekülen bestimmen. Das Kernresonanz-Gebäude des 

FLI ist ausgerüstet mit drei Kernresonanz (NMR)-Spektrometern. 

Die Bruker Avance III 750 MHz und 600 MHz narrow-bore 

Spektrometer werden für die Strukturbestimmung 

von Biomakromolekülen in Lösung eingesetzt. Seit 

2005 ist das 600 MHz-Spektrometer mit einem hochsensitiven 

Cryoprobenkopf ausgerüstet. Am 500 MHz widebore 

System werden Strukturuntersuchungen an Biomolekülen 

mittels Festkörper-NMR-Spektroskopie vorgenommen. 

Die Auswertung von NMR-Spektren und die Strukturberechnung 

der Proben (Proteine, Peptide und RNA) 

erfolgen an UNIX-Rechnern. (Forschungsgruppe Matthias 

Görlach) 

Proteinkristallographie 

Um die dreidimensionale Struktur von Proteinen und 

von Protein-Protein- beziehungsweise von Protein-Ligand- 

Komplexen auf molekularer und atomarer Ebene zu bestimmen, 

ist am FLI ein modernes Proteinkristallographie-

Labor eingerichtet worden. In erster Linie werden arbeits- 

gruppeninterne strukturbiologische Fragestellungen ver- 

folgt. Es bieten sich aber auch wissenschaftliche 

Kollaborationen zu strukturbiologischen Fragestellungen 

mit anderen Forschungsgruppen des Hauses und externen 

Wissenschaftlern an. Neben dem biochemischen Labor 

zum Vorbereiten der Proben stehen ein präzise tempe- 

rierter Kristallisationsraum mit Robotern zur Kristallisati- 

onsvorbereitung sowie zum Pipettieren von Nanoliter- 

Kristallansätzen, Stereomikroskope, zwei Röntgendiffrak- 

tometer inklusive Image Plate Detektor und Cryo-System 

sowie zur Auswertung und Strukturberechnung dezidierte 

Unix-Computer einschließlich zwei 3D-Graphikarbeitsplät- 

zen zur Verfügung. (Forschungsgruppe Manuel Than) 

Proteinlabor 

Das Proteinlabor stellt verschiedene Methoden zur 

Verfügung, mit denen Arbeiten der Proteinanalyse durch- 

geführt werden können, etwa die 2-D Proteinelektropho- 

rese, die N-terminale Proteinsequenzierung und die Pro- 

tein/Peptid-Massenspektrometrie (MALDI-TOF, ESI-MS). 

Dazu wurden chromatographische und elektrophoretische 

Techniken im analytischen und präparativen Maßstab 

etabliert und mit entsprechenden Geräten unterlegt. Das 

Proteinlabor bietet Unterstützung beim Planen von Stra- 

tegien zum Reinigen und Charakterisieren von Proteinen 

an. Nach Absprache kann dies auch die praktische Unter- 

stützung und die Übernahme einzelner Trennungsschritte 

oder Analysen umfassen. Das wissenschaftliche Interesse 

konzentriert sich auf das Netzwerk des Tumorsuppressor- 

proteins p53, dessen mögliche Interaktionen mit anderen 

Proteinpartnern mit den Techniken des Proteinlabors be- 

stimmt werden. (Forschungsgruppe Frank Große) 

15 Serviceinrichtungen unterstützen 

die Arbeit der Forscher. 

Radioaktivitätslabor 

Radioisotope sind nahezu unerlässlich, um Moleküle zu 

markieren und zu charakterisieren. Das zentrale Radioakti- 

vitäts-Labor des FLI ist mit einem Flüssig-Scintillationszäh- 

ler und Monitoren ausgestattet, die es erlauben, gängige, 

zugelassene Radioisotope zu messen. (Forschungsgruppe 

Frank Große) 

Strahlenquelle 

Seit dem Jahr 2005 befindet sich im Fritz-Lipmann-Ins- 

titut eine Anlage zur niedrigdosierten Applikation ionisie- 

render Strahlen. Biologische Proben können damit mit ei- 

ner Dosis von etwa 1 Gy/min experimentell bestrahlt wer- 

den. Die Bestrahlung erzeugt Schäden in der Erbsubstanz 

DNA wie sie beispielsweise durch Umwelteinflüsse, oder 

auch spontan, in den Zellen auftreten können. Somit lässt 

sich beispielsweise die Stressantwort der Zellen im Hin- 

blick auf krankhafte Veränderungen und zelluläre Alte- 

rung bestimmen. (Forschungsgruppe Peter Herrlich) 

Tierhaus 

Um die Mechanismen des Alterns und alters-assoziier- 

ter Erkrankungen zu erforschen, sind Tiermodelle – zu- 

meist Mäuse – unerlässlich. Mit ihnen können molekulare 

Grundlagen und Mechanismen der Erkrankungen sowie 

deren klinische Ausprägung und mögliche Therapiean- 

sätze erforscht werden. Die Mäuse werden derzeit in ein- 

zelbelüfteten Käfigeinheiten (IVC racks) gehalten, wo- 

durch spezifisch-pathogen-freie (SPF) Tiere vor Infekti- 

onen aus der Umwelt geschützt sind. (Forschungsgruppe 

Zhao-Qi Wang) 

1

Kolloquien 

Prof. Dr. 

Holger Reichardt 

Regelmäßig lädt das Fritz-Lipmann-Institut führende 

Wissenschaftler aus aller Welt zu Gastvorträgen nach 

Jena ein. Ergänzt werden die Vorträge durch intensive Ge- 

spräche und Diskussionen mit den Wissenschaftlern und 

Doktoranden des Instituts. 

Prof. Dr. Andrew Cato 

Die Gastvorträge des Jahres 2006: 

Ferenc Müller, Institut für Toxikologie und Genetik, Karlsruhe, 12. Januar 2006 

Initiation of zygotic gene expression in the vertebrate 

embryo: a model for differential regulation of Pol. II 

transcription by members of the TBP family 

Bernd Baumann, Universität Ulm, Physiologische Chemie, 26. Januar 2006 

The Role of the IKK/NF-κB System in Brain and Pancreas 

Martin Blum, Universität Hohenheim, Institut für Zoologie, 2. Februar 2006 

Origin of vertebrate left-right asymmetry 

Michael Ristow, FSU Jena, Institut für Ernährungswissenschaften, 


Mitochondrial Metabolism and Common Mammalian 

Disorders 

Harald König, Institut für Toxikologie und Genetik, Karlsruhe, 16. Februar 2006 

Divided we stand - Metazoan splicing systems in 

development and disease 

Fried Zwartkruis, Department of Physiological Chemistry, University Medical 

Center Utrecht, 23. Februar 2006 

Interplay between the small GTPase Rheb and the eIF2 

complex in the regulation of cell growth 

Jochen Balbach, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, 9. März 2006 

Structural biology of protein folding 

Dr. Stefan Kins 

Gastredner aus dem In- und Ausland 

Prof. Dr. 

Manfred Schartl 

Dr. Erez Raz 

K. Lenhard Rudolph, Medizinische Hochschule Hannover, 16. März 2006 

Telomere dysfunction, stem cell senescence and adaptive 

responses during ageing 

Manuel Than, MPI für Biochemie Martinsried, 23. März 2006 

Crystal Structures in Biomedical Research: Molecular 

Players in Protein Activation and in Alzheimer‘s Disease 

Alexander Bürkle, Universität Konstanz, 30. März 2006 

Maintenance of genomic stability by poly (ADP-ribose) 

polymerase-1: possible impact on the ageing process 

Ralf Seidel, Biotechnologisches Zentrum, TU Dresden, 17. April 2006 

Single-molecule magnetic tweezers measurements of DNA 

translocation by the motor protein EcoR124I 

Alfred Blume, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, 

Fachbereich Chemie, 4. Mai 2006 

Lipid-protein interactions at the air-water interface studied 

by infrared reflection-absorption spectroscopy (IRRAS) 

Gunter Reuter, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, 

Institut für Genetik, 11. Mai 2006 

Differential chromatin organisation in germ line and 

somatic cells of Drosophila 

Manfred Schartl, Physiologische Chemie I, Biozentrum der 

Dr. Bernd Baumann 

Universität Würzburg, 18. Mai 2006 

Sex determination in Medaka: A new function for an old 

transcription factor 

Stefan Kins, Zentrum für Molekulare Biologie, Heidelberg, 1. Juni 2006 

Neuronal functions and trafficking of the APP Family in 

Alzheimer‘s Disease 

Hans Schöler, MPI für molekulare Biomedizin, Münster, 8. Juni 2006 

From embryos to pluripotent stem cells - from pluripotent 

stem cells to embryos

Prof. Dr. 

Karl-Lenhard Rudolph 

Dr. Ralf Seidel 

Mathias Heikenwälder, Universitätsspital Zürich, Institut für 

Neuropathologie, 15. Juni 2006 

Cytokines, chemokines and prions: un ménage à trois 

Andrew Cato, Forschungszentrum Karlsruhe, ITG, 22. Juni 2006 

Amplified polyglutamine stretch in the human androgen 

receptor and late onset motor neuropathy 

Anna A. Friedl, Strahlenbiologisches Institut, LMU München, 27. Juni 2006 

Radiation-induced chromatin alterations and recruitment 

of DNA damage response proteins - experiments at the 

Munich ion microbeam SNAKE 

Dagmar Wilhelm, Institute for Molecular Bioscience, University of 

Queensland, Australia, 29. Juni 2006 

Elucidation of regulatory pathways during early gonad 

development 

Erez Raz, MPI für biophysikalische Chemie, Göttingen, 6. Juli 2006 

Development and migration of primordial germ cells in 

zebrafish 

Holger Reichardt, Institut für Virologie und Immunbiologie, 

Universität Würzburg, 13. Juli 2006 

Modulation of autoimmune and atopic diseases by 

glucocorticoids and CD28-specific antibodies 

Robert Kaptein, Bijvoet Center for Biomolecular Research, Utrecht 

University, Netherlands, 15. September 2006 

How Gene Regulatory Proteins Interact with DNA: 

The Lac Repressor System 

Prof. Dr. Martin Blum 

Hiroshi Maruta, Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf, 

28.September 2006 

Signal therapy of cancers and NF (neurofibromatosis): Hunting 

down the targets along the PAK pathways 

Prof. Dr. 

Alexander Buerkle 

Dr. Fried Zwartkruis. 

Larry S. Sherman, Division of Neuroscience, Oregon Health and 

Science University, Oregon, USA, 11. Oktober 2006 

Hyaluronan accumulates in neurodegenerative lesions and 

regulates neural progenitor expansion and maturation 

Martin Digweed, Institut für Humangenetik, Charité - Universitätsmedizin 

Berlin, 2. November 2006 

The NBS1 Gene: a dosage-dependent suppressor of genomic 

instability 

Rainer Rudolph, Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, 

Institut für Biotechnologie, 16. November 2006 

Artificial, non-antibody binding proteins for 

pharmaceutical and industrial application 

Michael Naumann, Institut für Experimentelle Innere Medizin, 

Universität Magdeburg, 30. November 2006 

NF-κB control in pathogen-infected epithelial cells 

Jekaterina Erenpreisa, Latvian Biomedicine Research and Study Centre, 

Riga, Latvia, 13. Dezember 2006 

Cancer, aging, and stress: in the holistic context 

Prof. Dr. Hans Schoeler 

Thomas Hehlgans, Universität Regensburg, Institut für Immunologie, 


Biological functions of the lymphotoxin receptor-ligand 

system 

3

4 Seminare 

Wöchentliche Treffen 

Die Forscher des Fritz-Lipmann-Instituts berichten jede 

Woche über die Fortschritte ihrer Arbeiten, erläutern die 

Konzepte ihrer Projekte und stellen sich der Diskussion 

mit ihren Kollegen. 

Die internen Institutsseminare 

des Jahres 2006: 

Stefan Taudien, 10. Januar 2006 

Surfactant Protein genes - another example for interindividual 

copy number polymorphisms? 

Anja Rockstroh, 10. Januar 2006 

The topoisomerase I stress response 

Karol Szafranski, 17. Januar 2006 

NAGNAG splice acceptors and SNPs. Insights into subtle 

alternative splicing 

Kerstin Brand, 17. Januar 2006 

Inhibition of Huntington (Htt) cleavage fragments by 

protease inhibitors 

Irene Weibrecht, 24. Januar 2006 

Oxidation sensitivity of the SH2-domain protein-tyrosine 

phosphatases 

Kamal Kumar Balavenkatraman, 24. Januar 2006 

Signaling of DEP-1 protein-tyrosine phosphatase in colon 

epithelial cells 

Sigrun Horn, 31. Januar 2006 

Influence of thyroid hormones to the development of the 

murine cerebellum 

Kent Soe, 31. Januar 2006 

Topoisomerase I - the involvement in cellular stress responses, 

its regulation and future use in clinical diagnostics 

Eberhard Schmitt, 7. Februar 2006 

Weißt Du in English woviel Genlein stehen? 

Ramadurai Ramachandran, 7. Februar 2006 

Biomolecular NMR in the solid state 

Sandra Orthaus, 14. Februar 2006 

Interaction of human kinetochore proteins 

Shamci Monajembashi, 14. Februar 2006 

Cell mechanics (and aging?): What optical tweezers can 

do? 

Markus Winter, 21. Februar 2006 

Isoforms of the focal adhesion LIM-domain protein Trip6 

are produced by secondary translation start sites 

Amna Musharraf, 21. Februar 2006 

Eya1 and BOR: Understanding Relationship(s) 

Sandra Schreiber, 28. Februar 2006 

Regulation of C/EBP isoform expression by intracellular 

nutrient and energy signalling 

Leo Wollweber, 28. Februar 2006 

Karyotype analysis of chromosome segregation after 

formation of mouse-mouse hybridomas with chromosome 

painting probes 

Michela Carella, 7. März 2006 

Structural characterization of methionine sulfoxide 

reductases

Christine Müller, 7. März 2006 

Sub-cellular localization and function of C/EBPalpha and 

Thyroid Receptor alpha isoforms 

Roman Siddiqui, 14. März 2006 

Genomic variability of host factors in the AIDS macaque 

model 

Anandhakumar Jayamani, 14. März 2006 

Is kinesin bypassing road blocks? 

Anett Illing, 21. März 2006 

STAT5 function in the osteoblast 

Bernhard Schlott, 21. März 2006 

MS techniques in protein interaction studies 

Katrin Jünemann, 28. März 2006 

Generation of a HD and DRPLA transgenic mouse model 

lacking the proteolytic site 

Gernot Glöckner, 28. März 2006 

Borrelia – Lost in paradise 

Maria Yosifova Radeva, 4. April 2006 

First steps towards multiprotein analysis of colon cancer 

progression 

Anke Schürer, 4. April 2006 

mfh1 and mfh2 from S. pombe are functional homologues 

of bakers yeast MPH1gene and Fanconi Anaemia complementation 

group M gene 

Stefanie Weidtkamp-Peters, 11. April 2006 

In vivo dynamics of foundation kinetochore proteins: 

evidence for both, self-assembly and self-organization 

mechanisms in human centromere formation 

Ulrike Gaussmann, 11. April 2006 

Quick and Easy Trend Analysis of Microarray Data - QUE- 

TAM 

Peter Hemmerich, 18. April 2006 

Spastin, the protein mutated in autosomal dominant 

hereditary spastic paraplegia, is regulated by nucleo- 

cytoplasmic compartmentalization 

Klaus Huse, 18. April 2006 

High-mobility group box 1 (HMGB1) protein is another 

ligand of LRP1 

Karl-Heinz Gührs, 25. April 2006 

The CDKN1A gene encoding p21(Cip1) - characterization and 

putative p53 interaction sites 

Debra Weih, 25. April 2006 

Demonstration /confirmation of flow cytometric 

analysis(FACS)data by histological staining of tissue 

sections 

Ulrike Merkel, 2. Mai 2006 

Ezrin in cellular growth control 

Helen Morrison, 2. Mai 2006 

Tumorigenic transformation by CPI-17 through inhibition of 

a merlin phosphatase 

Tobias Sperka, 9. Mai 2006 

Growth control via the tumour-suppressor protein merlin 

Paulius Grigaravicius, 9. Mai 2006 

Recruitment of DNA repair enzymes to laser microbeam 

damaged DNA in fixed and living cells 

Kerstin Riedel, 16. Mai 2006 

Tailoring broadband inversion pulses for MAS Solid state 

NMR 

5

6 Seminare 

Wöchentliche Treffen 

Zhao-Qi Wang, 16. Mai 2006 

Biological response to DNA breaks 

Marius Felder, 23. Mai 2006 

GenColors: Annotation and Comparative Genomics for 

Prokaryotes Made Easy 

Norma Baum, 23. Mai 2006 

p53-protein interactions depending on subcellular 

localization and PTM 

Daniela Hellwig, 30. Mai 2006 

Expression of human kinetochore proteins and antibody 

development in E. coli 

Yvonne Ihle, 30. Mai 2006 

A signal structure for nuclear export of unspliced 

HBV mRNA 

Olga Shevchuk, 6. Juni 2006 

Characterization of Legionella-containing phagosom 

Ralph Sierig, 6. Juni 2006 

3 ways to explore Wt1 function in gonadogenesis 

Christian Hoischen, 13.Juni 2006 

Analysis of kinetochore proteins 

Marija Trajkovic, 13. Juni 2006 

Abnormal thyroid hormone metabolism in mice lacking the 

tryroid hormone transporter 8 

Sven Peters, 27. Juni 2006 

Fluorescence experiments: Why lifetimes? 

Frank Bollig, 27. Juni 2006 

In search of the hidden enhancer 

Marc Riemann, 4. Juli 2006 

Examining the role of NF-kappaB pathways downstream 

of the Lymphotoxin-beta-receptor in secondary lymphoid 

organ development 

Thomas Seiboth, 4. Juli 2006 

The E7 Oncoprotein - Interaction With Cellular Proteins 

Slavomir Kacmar, 11. Juli 2006 

Alterations in Axonal Transport in Alzheimer‘s Disease: 

First steps 

Birgit Perner, 11. Juli 2006 

Wt1 inactivation induces severe defects during early kidney 

development in zebrafish 

Christine Kamperdick, 18. Juli 2006 

NMR-based Screening of 11beta-Hydroxysteroid 

Dehydrogenase 1 

Marco Groth, 18. Juli 2006 

Adapting Multiplex Liagation-dependent Probe Amplification 

(MLPA) for the determination of individual defensin 

gene copy numbers 

Stefan Taudien, 5. September 2006 

Comparative genome analysis as a tool for better understanding 

the variability in CYP3A regulation and expression 

Nikolina Kalchishkova, 5. September 2006 

Molecular structure and function of human chromokinesin 

Kid 

Rolf Hühne, 12. September 2006 

Getting the Most Out of 3D Structural Information on 

Biological Macromolecules 

Claudia Reichardt, 12. September 2006 

Adressing gonad development in zebrafish

Jan Lukas, 19. September 2006 

Identification of thyroid hormone transporters in the CNS 

Stefanie Schindler, 19. September 2006 

Violating the splicing rules: TG dinucleotides function as 

alternative splice acceptors 

Antje Trümpler, 26. September 2006 

PTP1B oxidation leads to enhanced association to and 

cleavage by calpain 

Dirk Schmidt-Arras, 26. September 2006 

ER entrapment of FLT3-ITD – chaperones and signals 

Michaela Pes, 10. Oktober 2006 

Cytoskeletal disruption induced by Human Papilloma Virus 

Iwona Powolny, 10. Oktober 2006 

Regulation of γβT cell development and function by NF- κB 

Woo Kee Min, 17. Oktober 2006 

Functional analysis of poly(ADP-ribosy)lation 

Tobias Ulbricht, 17. Oktober 2006 

The role of PML nuclear bodies in the regulation of MHC 

class II gene expression 

Jürgen Thomas Klattig, 24. Oktober 2006 

Of mice and men: Wt1 and sexual development 

Kristin Dreffke, 24. Oktober 2006 

Molecular biomarker for clinical and cellular radiosensitivity 

Feng Guo, 14. November 2006 

Constitutive alternative NF-kB signaling promotes marginal 

zone B cell development but disrupts the marginal sinus 

and induces HEV-like structures in the spleen 

Ingmar Scholl, 14. November 2006 

Tumorigenic transformation by CPI-17 through inhibition of 

a merlin phosphatase 

Stephanie Spange, 21. November 2006 

Regulation of the deacetylase SIRT1 – implications for 

ageing 

Shahidul Makki An, 21. November 2006 

Downregulation of Wt1 expression by histone deacetylase 

inhibitors 

Oliver Ohlenschläger, 28. November 2006 

Structural features of a redox enzyme 

Christian Weber, 28. November 2006 

Structure determination of the centromeric chromatin fiber 

by AFM and Cryo-EM 

Kerstin Hünniger, 5. Dezember 2006 

Notch signaling in neurons 

Jong Kwang Kim, 12. Dezember 2006 

Characterization, Complexity, and Clustering of Biological 

Networks 

Kathrin Landgraf, 12. Dezember 2006 

Sipl1 – a new interaction partner of Eya1 

Frank-Thomas Koch, 12. Dezember 2006 

Exploring disease- and age-related information from a 3D 

perspective 

Konrad Böhm, 19. Dezember 2006 

Molecular mechanisms of the kinesin-dependent neuronal 

transport 

Carsten Sachse, 19. Dezember 2006 

Cryo-EM on Amyloid Fibrils from Alzheimer‘s Abeta(1-40) 

Peptide 

7

8 Symposien 

Schwerpunkte der Forschung 

Folgende Tagungen und Symposien wurden im Jahr 

2006 von den Wissenschaftlern des Fritz-Lipmann-Insti- 

tuts organisiert oder mitorgansiert. 

Die Tagungen des Jahres 2006: 

20. April 2006 

Mini-Symposium „Gedächtnis- und Altersforschung“, 

Fritz-Lipmann-Institut, 

mit leitenden Wissenschaftlern des Leibniz-Instituts für 

Neurobiologie, Magdeburg 

Organisation: Eberhard Fritz 

21. April 2006 

8. VBMF Kolloquium “Kinetic microscopy: in vivo analysis 

of subcellular structures”, 


Organisation: Peter Hemmerich 

11. Mai 2006 

„Multifunctional Signaling Proteins“, Workshop des SFB604, 

Hörsaal der ThULB Jena, 

Organisation: Thomas Kamradt (FSU), Falk Weih (FLI) 

19. Mai 2006 

Minisymposium “Nothobranchius as a model for age 

research“, 


mit Wissenschaftlern der Universität Würzburg, 

des Sanger Center (Hinxton, UK) und der 

Academy of Sciences of the Czech Republic 

Organisation: Christoph Englert, Matthias Platzer 

VERBUND BIOMEDIZINISCHE FORSCHUNG JENA 

18. bis 20. Juni 2006 

Kongresswochenende des FLI „Genomische Instabilität 

und Neurodegeneration“. 

Bad Blankenburg, 

Organisation: Jan Tuckermann, Eberhard Fritz, 

Heidrun Lekscha 

12. bis 15. September 2006 

8. VBMF Methoden-Kolloquium 

„Kinetic Microscopy: in vivo Analysis of 

subcellular structures"“ 

Termin: Freitag, 21. April 2006, 14:00 Uhr 

Ort: Hörsaal des Leibniz Instituts für Naturstoff-Forschung und 

Infektionsbiologie, Beutenbergstr. 11a, 07743 Jena 

Organisator: PD Dr. Peter Hemmerich 

Programm: 

14:00 Begrüßung 

[e-mail: phemmer@fli-leibniz.de ] 

14:10 „Ultraschnell und flexibel - Neue konfokale Dimensionen" 

Almut Kiesslich, Carl Zeiss MicroImaging GmbH 

14:30 „Use of temporally and spatially resolved laser micromanipulation 

to study DNA repair in vivo“ 

Karl-Otto Greulich, Fritz Lipmann Institut 

14:50 „Axonal transport: imaging in living hippocampal neurons" 

Christoph Kaether, Fritz Lipmann Institut 

15:10 Pause 

15:20 „Molecular networks of kinetochore proteins in living cells as 

measured by FRET and FLIM “ 

Sandra Orthaus, Fritz Lipmann Institut 

15:40 „Assessing in vivo kinetics of centromere assembly using FRAP 

and FCS“ 

Stefanie Weidtkamp-Peters, Fritz Lipmann Institut 

16:00 „Real-time visualization of Ras activation in live cells" 

Ignacio Rubio, Institut für Molekulare Zellbiologie, FSU 

16:20 „Ratiometrische Nanosensoren für intrazelluläre Natrium- 

Messungen" 

Sascha Dietrich, Institut für Physiologie II, FSU 

16:40 Ende 

Jahreskongress des „DNA-Reparatur-Netzwerks“, 

Universitätsklinikum Eppendorf, Hamburg, 

Organisation: Alexander Bürkle, Jochen Dahm-Daphi, 

Ekkehard Dikomey, Frank Große (FLI), Marlis Frankenberg- 

Schwager, Andrea Hartwig, George Iliakis, Bernd Kaina, 

Jürgen Thomale, Lisa Wiesmüller

Dr. Axel Behrens (links) und Prof. Ian Hickson 

als Gastredner des Retreat 2006 

Intensiver wissenschaftlicher Austausch 

Die erste Klausurtagung (retreat) des Fritz-Lipmann- 

Instituts fand vom 18. bis 20. Juni 2006 in der Landes- 

sportschule von Bad Blankenburg statt. An der Tagung 

nahmen 124 Wissenschaftler teil, 17 Projektleiter präsen- 

tierten in ihren Vorträgen die Höhepunkte und Perspekti- 

ven ihrer Forschungsprojekte zu den Schwerpunktthemen 

„Genomische Instabilität“ und „Neurodegeneration“. 

Als Ehrengäste waren zu beiden Themengebieten in- 

ternational renommierte Wissenschaftler geladen, die als 

Hauptredner key note lectures über die Schwerpunktthe- 

men gaben: 

Ian Hickson, 

The Weatherall Institute of Molecular Medicine, Oxford, 

UK, und 

Axel Behrens, 

London Research Institute, Cancer Research, UK. 

Sunday, June, 18 

Retreat Bad Blankenburg 

18.06. – 20.06.2006 

13:00 Departure: Bus transfer from FLI to Bad Blankenburg 

14:30 Check-in; Poster set-up 

15:30 Peter Herrlich 

Introductory remarks 

Genomic Instability Talks (Chair: Peter Herrlich) 

15:45 – 16:15 Woo Kee Min 

Poly(ADP-ribosyl)ation and genomic stability 

16:15 – 16:45 Amal Saidi 

How MRN controls DNA double strand break repair 

16:45 – 17:15 Karl Otto Greulich 

DNA Repair - a look on diverse cell types and different damaging agents 

17:15 – 17:45 Coffee Break 

17:45 – 18:15 Suisheng Zhang 

NDH II, Werner helicase and progeria diseases 

18:15 – 18:45 Eberhard Fritz 

Biomarker for clinical and cellular radiosensitivity; and the mystery of Topo3 

18:45 – 19:15 Anke Schürer 

FancM & its homologues - From yeast to man: future goals and perspectives 

19:15 – 19:30 Coffee Break 

19:30 – 20:30 Keynote lecture: 

Ian Hickson (The Weatherall Institute of Molecular Medicine, Oxford, UK) 

Role of the Bloom's syndrome helicase in maintenance of genome stability 

21:00 Dinner 

22:00 Get-together at the Bar 

Monday, June, 19 

Genomic Instability Talks II (Chair: Karl Otto Greulich) 

08:00 – 08:30 Frank Große 

Identification of p53 interaction partners by proteomic means 

08:30 – 09:00 Stephan Diekmann 

The human kinetochore 

Die Preisträger der 

Posterpreise 

Organizers: 

Jan Tuckermann 


Heidrun Lekscha 

Klausurtagung 

Zusätzlich zu den Vorträgen präsentierten 46 Dokto- 

randen des Fritz-Lipmann-Instituts in Postersitzungen ihre 

Forschungsprojekte. Drei Posterpreise, gestiftet von der 

Biometra GmbH, konnten vergeben werden und zwar an 

die FLI-Doktoranden: 

Thomas Seiboth 

aus der Forschungsgruppe von Matthias Görlach (1. Preis) 

“The human Papillomavirus E7 protein – a small protein 

with large impact on cervical carcinogenesis” 

Jens Hollunder 

aus der Forschungsgruppe von Thomas Wilhelm (2. Preis) 

„Pattern recognition in unordered data“ 

Sigrun Horn 

aus der Forschungsgruppe von Heike Heuer (3. Preis) 

„Thyroid hormone actions during the development of cerebellar 

Purkinje cells and Bergmann Glia“ 

Ein Sonderpreis für das beste Poster der zehn Diplo- 

manden, die ihre Arbeiten während der Klausurtagung 

präsentierten, ging an: 

Claudia Reichardt 

aus der Forschungsgruppe von Christoph Englert 

“Expression analysis of the Wilms’development of 

zebrafish” 

9

30 Netzwerke I 

Kontakte in der Region 

Das Fritz-Lipmann-Institut ist mit vielen lokalen und 

regionalen Partnern eng verbunden: 

Beutenberg Campus 

Das FLI gehört zum „Beutenberg Campus“ in Jena. Auf 

dem Campus finden sich acht Forschungsinstitute und 

zwei Gründerzentren, die gemeinsam wissenschaftliche 

Veranstaltungen organisieren und Öffentlichkeitsarbeit 

betreiben. Mit mehreren Forschungsinstituten des Beu- 

tenberg Campus arbeitet das Fritz-Lipmann-Institut auch 

auf wissenschaftlicher Ebene zusammen. 

Friedrich-Schiller-Universität (FSU) 

Mit der FSU, vor allem mit der biologisch-pharmazeu- 

tischen und der medizinischen Fakultät, bestehen enge 

wissenschaftliche Kontakte. Sieben Forschungsgruppen- 

leiter des Fritz-Lipmann-Instituts sind gleichzeitig Profes- 

soren der Friedrich-Schiller-Universität. 

Dr. Bartholmé (Kuratoriumsvorsitzender) , 

Prof. Diekmann, Prof. Große und Prof. Hoenig 

(IPHT/Beutenberg Campus) im Gespräch 

Verbund biomedizinische Forschung 

(VBMF) 

Das FLI gehört zu den Gründungsmitgliedern des im 

Jahre 2004 gegründeten VBMF. Der Verbund besteht aus 

dem Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infekti- 

onsbiologie (Hans-Knöll-Institut, HKI), dem Fritz-Lipmann- 

Institut (FLI), der medizinischen und der biologisch-phar- 

mazeutischen Fakultät der Friedrich-Schiller-Universität 

sowie der „BioRegio“ e.V. Der Verbund hat zum Ziel, die 

Methodenentwicklung und Nachwuchsarbeit abzustim- 

men, gemeinsame Verbundprojekte zu entwickeln und 

den Forschungstransfer zu Firmen zu organisieren. Das 

Kompetenznetz „BioInstrumente Jena“, dem das FLI eben- 

falls angehört, fördert den Forschungstransfer zwischen 

den Instituten und Unternehmen. 

VERBUND BIOMEDIZINISCHE FORSCHUNG JENA

Sonderforschungsbereich SFB 604 – 

Multifunktionale Signalproteine 

Der SFB 604 ist der einzige Sonderforschungsbereich 

für Lebenswissenschaften in Thüringen. Das Fritz-Lip- 

mann-Institut ist mit sieben von insgesamt 17 Projekten 

im SFB 604 vertreten: 

- Regulation of DNA polymerase alpha, Cdc45, and 

TopBP1 at the initiation step of DNA replication (Forschungsgruppe 

Frank Große) 

- Alternative splicing as a modulator of signal transduction 

(Forschungsgruppe Matthias Platzer) 

- Quality control of γ-secretase complex assembly in the 

endoplasmic reticulum (Forschungsgruppe Christoph 

Kaether) 

- Crystal structure determination of proteins related to 

Alzheimer’s disease (Forschungsgruppe Manuel Than) 

- Eya1 as a switch between signal transduction and transcription 

(Forschungsgruppe Christoph Englert) 

- Activation of distinct NF-κB pathways through the 

lymphotoxin β receptor (LTβR) (Forschungsgruppe Falk 

Weih) 

- Regulation of the tumour suppressor protein merlin 

(Forschungsgruppe Helen Morrison) 

Am Sonderforschungsbereich sind außerdem die folgenden 

Institutionen beteiligt: 

- Friedrich-Schiller-Universität Jena, 

- Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie 

– Hans-Knöll-Institut (HKI), 

- Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, 

- Max-Planck-Forschungsstelle für Enzymologie der Proteinfaltung, 

Halle. 

Jena Center for Bioinformatics (JCB) 

Das Bundesministerium für Bildung und Forschung 

(BMBF) finanziert das Jenaer Zentrum für Bioinformatik. 

Es hat zum Ziel, die interdisziplinäre Forschung und Ausbildung 

in Jena und Umgebung im Bereich der Bioinformatik 

zu stärken. Das JCB wird im Fritz-Lipmann-Institut 

koordiniert (Jürgen Sühnel). Folgende Gruppen, Institutionen 

und Firmen gehören ihm an: 

- Forschungsgruppe Jürgen Sühnel (FLI) 

- Forschungsgruppe Matthias Platzer (FLI) 

- Forschungsgruppe Matthias Görlach (FLI) 

- Forschungsgruppe Thomas Wilhelm (FLI) 

- Forschungsgruppe Dieter Willbold, ehemals IMB/FLI, 

jetzt Jülich 

- Forschungsgruppe Rolf Hilgenfeld, ehemals IMB/FLI, 

jetzt Lübeck 

- Forschungsgruppe Martin Zacharias, ehemals IMB/FLI, 

jetzt Bremen 

- Friedrich-Schiller-Universität Jena 

- Leibniz-Institut für Naturstoff-Forschung und 

Infektionsbiologie – Hans-Knöll-Institut (HKI) 

- Fachhochschule Jena 

- Albert-Ludwigs-Universität Freiburg 

- Max-Planck-Institut für Chemische Ökologie, Jena 

- BioControl Jena GmbH 

- Clondiag Chip Technologies GmbH 

- Jenapharm GmbH & Co. KG 

31

3 Netzwerke II 

Nationale und internationale Kontakte 

Mit zahlreichen Netzwerken ist das Fritz-Lipmann-Ins- 

titut überregional verbunden 

Biomedizinische Allianz (BIMA) der Leibniz- 

Gemeinschaft (WGL) 

Die Institute der Biomedizinische Allianz widmen sich 

der Aufgabe, Erkrankungen von Menschen und Primaten 

zu erforschen. Das Ziel ist, Moleküle zu identifizieren, die 

am Entstehen von Krankheiten beteiligt sind, und ihre 

biologischen Funktion zu bestimmen. Daraus sollen neue 

Ansätze für die Therapie erwachsen. 

Die Mitglieder der Biomedizinischen Allianz sind: 

- Deutsches Primatenzentrum, Göttingen 

- Heinrich-Pette-Institut für Experimentelle Virologie 

und Immunologie, Hamburg 

- Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin, Hamburg 

- Forschungsinstitut für Molekulare Pharmakologie, Berlin 

- Forschungszentrum Borstel, Borstel 

- Leibniz-Institut für Neurobiologie, Magdeburg 

- Deutsches Institut für Ernährungsforschung, Bergholz- 

Rehbrücke 

- Deutsches Diabetes-Forschungsinstitut, Düsseldorf 

- Leibniz-Institut für Altersforschung, Jena 

Deutsches Genomsequenzierungsanalyse- 

Konsortium – GGSAC (German Genome 

Sequencing Analysis Consortium) 

Das Genomsequenzierungsanalyse-Konsortium ist verteilt 

auf die Standorte Max-Planck-Institut für Molekulare 

Genetik (MPIMG) in Berlin, Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung 

in Braunschweig und das Leibniz-Institut 

für Altersforschung in Jena (Forschungsgruppe Matthias 

Platzer). Das Konsortium erstellt im Rahmen einer internationalen 

Kooperation zirka 40 Mb finaler Sequenz vom 

X-Chromosom des Schimpansen. 

Nationales Genomforschungsnetzwerk 

(NGFN2) 

Die FLI-Forschungsgruppen von Matthias Platzer (Genomanalyse) 

und Jürgen Sühnel (Biocomputing) sind an mehreren 

„Systematisch-Methodischen Plattformen“ (SMP) des 

Nationalen Genomforschungsnetzwerks beteiligt. 

SMP „DNA“: 

Teilprojekte 2.2, 16 (Forschungsgruppe Matthias Platzer) 

- Sequenzierung und finishing großer Regionen des 

Schimpansen X-Chromosoms und medizinisch relevanter 

Bereiche des Schimpansen-Genoms 

- Resequenzierung und Mutation 

Weitere Mitglieder: 

- GSF-Forschungszentrum für Umwelt und Gesundheit 

Neuherberg bei München 

- Christian-Albrechts-Universität zu Kiel 

- Max-Planck-Institut für Molekulare Genetik, Berlin 

- Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin, Berlin-Buch 

- Universität zu Köln 

- Deutsches Krebsforschungszentrum, Heidelberg 

- Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung, 

Braunschweig 

SMP „Epigenetik“: 

Teilprojekte 1 bis 4 (Forschungsgruppe Matthias Platzer): 

- Hochdurchsatzanalyse zur Identifikation krankheitsrelevanter 

Methylierungsstellen mittels einer etablierten 

Microarray-pipeline 

- „CpG- islands“ Microarrays für einen genomweiten 

Nachweis epigenetischer Veränderungen in menschlicher 

DNA 

- Analyse von DNA-Methylierungsmustern durch 

“on-chip“ Primerverlängerung

- Etablierung eines genetischen Chips für Routinean- 

wendungen 

- Etablierung eines epigenetischen Profils des mensch- 

lichen Chromosoms 21 



- Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität, Bonn 

- Epigenomics AG, Berlin 

- febit biotech GmbH, Heidelberg 

- International University Bremen GmbH 

- Universität des Saarlandes 


SMP „Bioinformatik“: 

Teilprojekt TP 1 bis 5 (Forschungsgruppe Jürgen Sühnel): 

- 3D-Struktur-Information für die Genomforschung 



- GSF-Forschungszentrum für Umwelt und Gesundheit, 

Neuherberg bei München 

- BIOMAX Informatics AG, Martinsried 

- Max-Planck-Institut für Informatik, Saarbrücken 

- Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie, 

Heidelberg 


- Ludwig-Maximilians-Universität München 

- Georg-August-Universität Göttingen 

Expressed Sequence Tag (EST) Analysis of 

Toxic Algae 

Dieses Forschungsprojekt hat die genetische Analyse 

toxischer Algen zum Ziel und soll im sechsten Rahmenprogramm 

der Europäischen Gemeinschaft realisiert 

werden.Die Projekte der Genomanalyse toxischer Algen 

(Forschungsgruppe Matthias Platzer) sind: 

Workpackages WP 1 bis 4: 

- ESTs from Alexandrium minutum & Prymnesium 

parvum 

- ESTs from Pseudo-nitzschia 

- ESTs from Fibrocapsa japonica 

- ESTs from Planktothrix rubescens 


- Alfred-Wegener-Institut, Bremerhaven 

- Stazione Zoologica Anton Dohrn, Neapel 

- Ecole Normale Superieure, Paris 

- School of Biological Sciences, University of Bristol 

- Max-Planck-Institut für Chemische Ökologie, Jena 

Active Biomimetic Systems 

Das Projekt zur Erforschung aktiver biomimetischer 

Systeme erfolgt ebenfalls innerhalb des sechsten Rahmenprogramms 

der EU. Die Projekte der Forschungsgruppe 

von Karl-Otto Greulich (Molecular Motors Group, 

K. Böhm) sind: 

- Cooperativity of kinesin molecules 

- Kinesin movement and track fidelity 

- Polarity-defined two and three-dimensional microtubule 

systems 


- Universität Leipzig 

- Polytecnico di Milano, Mailand 

- Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie, 

Heidelberg 

- Institut Curie, Paris 

- BASF AG, Ludwigshafen 

- Stichting Fom, Niederlande 

- CNRS, Frankreich 

33

34 Kooperationen 

Wissenschaftliche Partner 

Unabhängig von größeren Netzwerken sind projekt- 

bezogene wissenschaftliche Kooperationen mit natio- 

nalen und internationalen Partnern das Fundament jeder 

effektiven Forschung. 

Die wichtigsten Partner der 

Forschungsgruppen des Fritz-Lipmann- 

Instituts im Jahr 2006 waren: 

Forschungsgruppe Cornelis Calkhoven 

A. Leutz - MDC Berlin 

P. Borger, M. Roth - University Hospital Basel, Schweiz 

F.J.T. Zwartkruis, P.J. Coffer- University of Utrecht, 

Niederlande 

O. MacDougald - University of Michigan, Medical School, USA 

M.M. von Lindern - Erasmus University Rotterdam, 

Niederlande 

Forschungsgruppe Stephan Diekmann 

U. Claussen, T. Liehr, K. Benndorf, C. Biskup, T. Deufel, 

P. Dittrich, Ch. Melle - FSU Jena, 

C. Cremer - Universität Heidelberg 

A. von Mikecz - Universität Düsseldorf 

C. Cardoso - MDC Berlin 

K. Rippe - DKFZ und Bioquant, Heidelberg 

T. Hofmann, J. Langowski, M. Bussiek, M. Waldeck - 

DKFZ Heidelberg 

S. G. Addinall, F. Hayes, A. Derome - University of 

Manchester, UK 

V. Doye - Jaque Monod, Paris, Frankreich 

Forschungsgruppe Christoph Englert 

G. Scherer - Institut für Humangenetik, Universität Freiburg 

M. Schartl - Biozentrum, Universität Würzburg 

F. Hildebrandt - University of Michigan, Ann Arbor, USA 

E. Winterhager - Universität Essen 

C. Stocking – Habers - HPI Hamburg 

R. Witzgall - University of Regensburg 

F. Hänel - Hans-Knöll-Institut Jena 

A. Habenicht - FSU Jena 

G. Walz - Universität Freiburg 

T. Obara - Case Western Reserve University, Cleveland, USA 

K.L. Rudolph - Medizinische Hochschule Hannover 

A. Brunet - Stanford University, USA 

Forschungsgruppe Marcus Fändrich 

U. Horn, P. Hortschansky - Hans-Knöll-Institut Jena 

A. Fahr, M. Westermann - FSU Jena 

C. Röcken - Charité Berlin 

K. Reymann - IfN Magdeburg 

R. Winter - Universität Dortmund 

N. Grigorieff - Brandeis University, USA 

C. Wang - Troy, USA 

D. Thal - Universität Ulm 

Forschungsgruppe Matthias Görlach 

M. Dürst, S. Heinemann, R. Zell, J. Weston - FSU Jena 

B. Schneider - MPI for Chemical Ecology, Jena 

M. Göbel, H. Schwalbe - JWG-Universität, Frankfurt 

W. Meyer – Klaucke - EMBL/DESY, Hamburg 

T. Heise, - HPI - Hamburg/ Medical University of South Carolina, 

Charleston, USA 

M. Swanson - Univ. of Florida, Gainsville, FL, USA 

H. – P. Nasheuer - University of Ireland, Galway, Ireland 

S. Albrizio - Universita degli Studi di Napoli „Federico II“, Italien 

A. Hansel - Jena Bioscience 

Forschungsgruppe Karl-Otto Greulich 

T. Gibson - EMBL Heidelberg 

E. Gebhart - Universität Erlangen 

H. Prinz - Institut für Pharmazeutische Chemie, Universität 

Münster 

E. Dinjus, S. Behrens - FZ Karlsruhe, Institut für Technische 

Chemie

E. Günther - Zentaris AG Frankfurt 

R. Lipovsky - MPI Kolloid- und Grenzflächenforschung Potsdam 

M.W. Berns - University of California, Irvine, USA 

R. Arunthyunyan - University of Erewan, Armenien 

P.K. Gupta, S. Mohanti - Center for Advanced Technology, 

Indore, Indien 

Z. Földes – Papp - Universität Graz, Österreich 

P. Draber, V. Viklicky - Tschechische Akademie der Wissenschaften, 

Prag, Tschechische Republik 

U. Plappert – Helbig - Novartis, Basel, Schweiz 

C. Hertweck - Hans-Knöll-Institut Jena 

B. Pool – Zobel - FSU Jena 

D. Knoll - Schott Jena 

P. Schellenberg - IPHT Jena 

A. Rapp - University of Oxford, UK 

G. Pilarczyk - Universität Giessen 

Forschungsgruppe Frank Große 

H. Will - Heinrich-Pette-Institut für Experimentelle Virologie und 

Immunologie, Hamburg 

J. Sänger - Tumorklinik Bad Berka 

G. Fischer - Max-Planck-Forschungsstelle Enzymologie der 

Proteinfaltung, Halle 

V. Bohr - National Institute on Aging, NIH, Baltimore, USA 

M. Bakhanashvili - Infectious Diseases Unit, 

Sheba Medical Center, Israel 

S. Heinemann - FSU Jena 

Forschungsgruppe Heuer 

T. J. Visser - Erasmus Medical Center, Rotterdam, Niederlande 

G. Raivich - University College, London, UK 

K. Bauer - MPI, Hannover 

M.K.H. Schäfer - Philipps-Universität, Marburg 

V. Darras - Katholike Universiteit, Leuven, Niederlande 

S. Heinemann - FSU Jena 

Forschungsgruppe Christoph Kaether 

S. Kins, B. Schwappach - ZMBH Heidelberg 

M. Jucker - Universität Tübingen 

E. Mandelkow - Max-Planck-Arbeitssgruppen für strukturelle 

Molekularbiologie Hamburg 

T. Schmitt – John - Aarhus University, Dänemark 

C. Hübner - FSU Jena 

R. Rudolf - ITG Karlsruhe 

Forschungsgruppe Helen Morrison 

A. Wittinghofer - MPI Dortmund 

M. Giovannini - INSERM U434 Paris, Frankreich 

J. Wehland, K. Rottner, T. Stradal - GBF Braunschweig 

F. Böhmer, I. Rubio, R. Wetzker - FSU Jena 

R. Hennigan - University of Cincinnati, USA 

O. Hanemann - Peninsula College of Medicine and Dentistry, UK 

C. Breithaupt - Universität Halle 

Forschungsgruppe Matthias Platzer 

A. Burnet - Stanford University, USA 

E. Shmukler - Evrogen JSC, Moskau, Russland 

A. Cattaneo - Lay Line Genomics S.p.A., Rom, Italien 

A. Brakhage, R. Guthke - Hans-Knöll-Institut (HKI) Jena 

J. Hebebrand - Universität Duisburg-Essen 

M. Wabitsch - Universität Ulm 

N. Hübner - MDC Berlin 

E. Cuppen - Netherlands Institute for Developmental Biology, 

Utrecht, Niederlande 

P. Flicek - European Bioinformatics Institute, Hinxton, UK 

M. Lathrop, I. Gut - Centre National de Genotypage, 

Evry, Frankreich 

H. Lehrach - MPIMG, Berlin 

H. Blöcker - HZI, Braunschweig 

I. Ebersberger - Center for Integrative Bioinformatics Wien, 

Österreich 

M. Krawczak, S. Schreiber - CAU Kiel 

P. Nürnberg - CGC Köln 

U. Sauermann - DPZ Göttingen 

35

36 Kooperationen 

Wissenschaftliche Partner 

R. Kinne, S. Schuster - FSU Jena 

B. Wilske - Max-von-Pettenkofer-Institut, München 

J. Hacker - Universität Würzburg 

M. Steinert - Universität Braunschweig 

C. Buchrieser - Institut Pasteur, Paris, Frankreich 

O. Holst - LCMB Borstel 

R. Backofen - ALU Freiburg 

A. Noegel - Universität Köln 

R. Guigo - Institut Municipal d‘Investigacio Medica, Barcelona, 

Spanien 

A. Kuspa - Baylor College of Medicine, Houston, USA 

P. Schaap - School of Life Sciences Biocentre, Dundee, UK 

G. Birkenmeier - Universität Leipzig 

K. Valentin, A. Cembella - Alfred-Wegener-Institut, 

Bremerhaven 

P. Hayes - School of Biological Sciences, University of Bristol, 

Bristol, UK 

C. Bowler - Ecole Normale Superieure, Department of Biology 

CNRS, Paris, Frankreich 

W. Kooistra - Stazione Zoologica Anton Dohrn, Villa Comunale, 

Naples, Italien 

M. Melkonian - Universität Köln 

L. Wojnowski - Universität Mainz 

W. Marwan - MPIDKTS, Magdeburg 

G. Werner – Felmayer - Universität Innsbruck, Österreich 

G. Kerns - SIAB Leipzig 

Forschungsgruppe Aspasia Ploubidou 

E. Karsenti - EMBL, Heidelberg 

B. Lange - MPI-MG, Berlin 

M. Way - Cancer Research UK, London, UK 

N. Scaplehorn - CNRS-ESPCI, Paris, France 

Forschungsgruppe Gabriele Schilling 

D. Borchelt - SantaFe Health Alzheimer’s Disease Research 

Center, USA 

M. Poirier - Baltimore Huntington’s Disease Center, USA 

J. Cooper - National Institute for Biological Standards and 

Control London, UK 

Forschungsgruppe Jürgen Sühnel 

C. Skerka, P. Zipfel - Hans-Knöll-Institut (HKI) Jena 

M. Lechmann - MediGene AG, Martinsried/Planegg 

M. Hausmann - Kirchhoff Institute for Physics, Ruprecht-Karls- 

Universität Heidelberg 

P. Dittrich - FSU Jena, Computer Science Institute 

B. Altenberg - EMBL Heidelberg) 

Forschungsgruppe Manuel Than 

I. Lindberg - Louisiana State University, New Orleans, USA 

T. Komiyama, R.S. Fuller - University of Michigan, Ann Arbor, 

USA 

R. Day - Université de Sherbrooke, Québec, Kanada 

A. Maisa, W. Garten, T. Steinmetzer - Universität Mainz 

R. Wetzker - FSU Jena 

Forschungsgruppe Jan Tuckermann 

G. Schütz, P. Angel - DKFZ Heidelberg 

R. Bräuer, T. Heinzel, A. Habenicht, T. Kamradt - FSU 

Jena 

R. Moriggl - Ludwig Boltzmann Institut für Krebsforschung, 

Wien, Österreich 

L. Hennighausen - National Institutes of Health, USA 

H. Reichardt - Universität Göttingen 

P. Perez - Instituto de Biomedicina de Valencia, Spanien 

K. Michelsen - Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, USA 

A. Clark - Kennedy Institute of Rheumatology Division, 

London, UK 

A. Cato - ITG, Forschungszentrum Karlsruhe 

F. Baier - University of Western Ontario, London, Canada 

M. Seibel - Sydney, Australien 

J.–P. David - Deutsches Rheumaforschungszentrum Berlin 

C.–X. Zhang - Faculty of Medicine, University Lyon, Frankreich

Forschungsgruppe Zhao-Qi Wang 

V.N. Anisimov - Petrov Research Institute of Oncology, 

St.Petersburg, Russland 

J. Barski - Max-Planck-Institute of Neurobiology, Martinsried 

A. Barzilai, G.S. Wise - Tel Aviv University, Israel 

A. Behrens - Mammalian Genetics Laboratory, 

Cancer Research UK 

M. Benahmed - INSERM U407, Faculté de Médecine Lyon-Sud, 

Oullins, Frankreich 

P. Concannon - Benaroya Research Institute, Seattle, USA 

S. Cuzzocrea - Department of Clinical and Experimental 

Medicine and Pharmacology, Torre Biologica, Policlinico 

Universitario, Messina, Italien 

M. Digweed - Institut fur Humangenetik, Charite - Universitätsmedizin 

Berlin 

G. Graziani - Department of Neuroscience, University of Rome 

„Tor Vergata“, Rome, Italien 

Z. Herceg - International Agency for Research on Cancer (IARC), 

Lyon, Frankreich 

M. Jacobson - College of Pharmacy, University of Arizona, 

Tucson, USA 

M. Jasin - Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, 

New York, USA 

S. Jackson - The Gurdon Institute, University of Cambridge, UK 

M. Miwa - Comprehensive Human Science, University of 

Tsukuba, Japan 

K.L. Rudolph - Medical School Hannover 

K. Sabapathy - Molecular Carcinogenesis, National Cancer 

Centre, Singapore 

Y. Shiloh - Sackler School of Medicine, Tel Aviv University, Israel 

G. Smith - KuDOS Pharmaceuticals Ltd, Cambridge, UK 

Y. Shen - Institute of Basic Medical Sciences, CAMS, Beijing, China 

B. Wang - Dept. of Microbiology and Immunology, China 

Agricultural University, Beijing, China 

C.–X. Zhang - Faculty of Medicine, University Lyon, Frankreich 

G. Romeo - Unità di Genetica Medica, Policlinico Universitario S. 

Orsola-Malpighi, University of Bologna, Bologna, Italien 

Forschungsgruppe Falk Weih 

D. Radke - Hans-Knöll-Institut Jena 

J. Fluhr, J. Norgauer - Hautklinik, FSU Jena 

A. Habenicht, R. Gräbner - FSU Jena 

S. Isenmann - Klinik für Neurologie, FSU Jena/Neurologie, Universität 

Witten/Herdecke 

M. Schwaninger - Pharmakologisches Institut, Universität 

Heidelberg 

J. Simon - Department of Dermatology, Venerology and Allergy, 

University Leipzig 

R. Schmid - Innere Medizin, Klinikum rechts der Isar, München 

K. Pfeffer - Institut für Medizinische Mikrobiologie, 

Universität Düsseldorf 

H. Körner - Comparative Genomics Centre, 

James Cook University, Townsville, Australien 

P. Balogh - Department of Immunology and Biotechnology, 

University of Pécs, Ungarn 

M. Busslinger - Institute of Molecular Pathology (IMP), Wien, 

Österreich 

J. Blackburn - Department of Cranofacial Development, Kings 

College London, UK 

E.– J. Freyschmidt - Department of Pediatrics, Harvard Medical 

School, Boston, (MA) USA 

Y.– X. Fu - Committee on Immunology and Department of 

Pathology, University of Chicago, USA 

Forschungsgruppe Thomas Wilhelm 

T. Ideker - University of California San Diego, USA 

R. Kinne, S. Schuster - FSU Jena 

H.– J. Thiesen - Universität Rostock 

37

38 Publikationen I 

8 

Beiträge in referierten Zeitschriften 

10 

1. Abraham, S.M., Lawrence, T., Kleiman, A., Warden, P., 

Medghalchi, M., Tuckermann, J., Saklatvala, J. and Clark, 

A.R. (2006). Antiinflammatory effects of dexamethasone are partly 

dependent on induction of dual specificity phosphatase 1. Journal Of 

Experimental Medicine 203, 1883-1889. 

2. Altenberg, B., Gemuend, C. and Greulich, K.O. (2006). 

Ubiquitous cancer genes: Multipurpose molecules for protein micro-arrays. 

Proteomics 6, 67-71. 

3. Barrionuevo, F., Bagheri-Fam, S., Klattig, J., Kist, R., Taketo, 

M.M., Englert, C. and Scherer, G. (2006). Homozygous 

inactivation of Sox9 causes complete XY sex reversal in mice. Biol. 

Repr. 74, 195-201. 

4. Behrens, S., Habicht, W., Wagner, K. and Unger, E. 

(2006). Assembly of nanoparticle ring structures based on protein 

templates. Advanced Materials 18, 284-+. 

5. Behrens, S., Habicht, W., Wu, J. and Unger, E. (2006). 

Tubulin assemblies as biomolecular templates for nanostructure synthesis: 

from nanoparticle arrays to nanowires. Surface And Interface 

Analysis 38, 1014-1018. 

6. Beyer, A., Workman, C., Hollunder, J., Radke, D., Moller, 

U., Wilhelm, T. and Ideker, T. (2006). Integrated assessment 

and prediction of transcription factor binding. Plos Computational Biology 

2, 615-626. 

7. Birkenmeier, G., Nicklisch, S., Pockelt, C., Mossie, A., 

Steger, V., Glaser, C., Hauschildt, S., Usbeck, E., Huse, K., 

Sack, U. et al. (2006). Polymyxin B-conjugated alpha 2-macroglobulin 

as an adjunctive therapy to sepsis: Modes of action and impact 

on lethality. J Pharmacol Exp Ther 318, 762-771. 

8. Bollig, F., Mehringer, R., Perner, B., Hartung, C., Schafer, 

M., Schartl, M., Volff, J.N., Winkler, C. and Englert, C. 

(2006). Identification and comparative expression analysis of a second 

wt1 gene in zebrafish. Developmental Dynamics 235, 554-561. 

9. Bolterauer, H., Tuszynski, J.A. and Unger, E. (2006). A 

directed binding mechanism of processive motion for the kinesin motor 

protein families. Acta Physica Polonica B 37, 1425-1443. 

10. Clugston, R.D., Klattig, J., Englert, C., Clagett-Dame, 

M., Martinovic, J., Benachi, A. and Greer, J.J. (2006). Teratogen-induced, 

dietary and genetic models of congenital diaphragmatic 

hernia share a common mechanism of pathogenesis. American 

Journal Of Pathology 169, 1541-1549. 

21 22 

11. Cozzi, A., Cipriani, G., Fossati, S., Faraco, G., Formentini, 

L., Min, W., Cortes, U., Wang, Z.Q., Moroni, F. and 

Chiarugi, A. (2006). Poly(ADP-ribose) accumulation and enhancement 

of postischemic brain damage in 110-kDa poly(ADP-ribose) glycohydrolase 

null mice. Journal Of Cerebral Blood Flow And Metabolism 

26, 684-695. 

12. Cuzzocrea, S., Genovese, T., Mazzon, E., Crisafulli, C., 

Min, W., Di Paola, R., Muia, C., Li, J.H., Esposito, E., Bramanti, 

P. et al. (2006). Poly(ADP-ribose) glycohydrolase activity 

mediates post-traumatic inflammatory reaction after experimental 

spinal cord trauma. Journal Of Pharmacology And Experimental Therapeutics 

319, 127-138. 

13. ElSharawy, A., Manaster, C., Teuberl, M., Rosenstiel, P., 

Kwiatkowski, R., Huse, K., Platzer, M., Becker, A., Nurnberg, 

P., Schreiber, S. et al. (2006). SNPSplicer: Systematic analysis 

of SNP-dependent splicing in genotyped cDNAs. Human Mutation 

27, 1129-1134. 

14. Fändrich, M., Zandomeneghi, G., Krebs, M.R.H., Kittler, 

M., Buder, K., Rossner, A., Heinemann, S.H., Dobson, 

C.M. and Diekmann, S. (2006). Apomyoglobin reveals a random-nucleation 

mechanism in amyloid protofibril formation. Acta 

Histochemica 108, 215-219. 

15. Freyschmidt, E.J., Mathias, C., Laouar, A., Narasimhaswamy, 

M., Weih, F. and Chatila, T. (2006). Eczema-prone 

RelB(-/-) and FoxP3(-) mice display defective immune responses and 

impaired viral clearance following vaccinia infection. Journal Of Immunology 

176, S85-S86. 

16. Friesema, E.C., Jansen, J., Heuer, H., Trajkovic, M., 

Bauer, K. and Visser, T.J. (2006). Mechanisms of disease: psychomotor 

retardation and high T3 levels caused by mutations in monocarboxylate 

transporter 8. Nat Clin Pract Endocrinol Metab 2, 

512-523. 

17. Fromme, T., von Praun, C., Liebig, M., Reichwald, K., 

Platzer, M. and Klingenspor, M. (2006). A single base exchange 

leads to tissue specific ablation of UCP3 expression. Biochimica 

Et Biophysica Acta-Bioenergetics, 366-367. 

18. Gellermann, G.P., Appel, T.R., Davies, P. and Diekmann, 

S. (2006). Paired helical filaments contain small amounts of 

cholesterol, phosphatidylcholine and sphingolipids. Biological Chemistry 

387, 1267-1274.

19. Gellermann, G.P., Ullrich, K., Tannert, A., Unger, C., Habicht, 

G., Sauter, S.R.N., Hortschansky, P., Horn, U., Mollmann, 

U., Decker, M. et al. (2006). Alzheimer-like plaque formation 

by human macrophages is reduced by fibrillation inhibitors 

and lovastatin. Journal Of Molecular Biology 360, 251-257. 

20. Glaser, C., Birkenmeier, G., Schulz, S. and Huse, K. 

(2006). In Welsh, E. M. (ed.), New Research on Alzheimer‘s Disease. 

Nova Science Publishers, New York, pp. 99-123. 

21. Glöckner, G., Schulte-Spechtel, U., Schilhabel, M., 

Felder, M., Sühnel, J., Wilske, B. and Platzer, M. (2006). 

Comparative genome analysis: Selection pressure on the Borrelia vls 

cassettes is essential for infectivity. BMC Genomics 7, 211. 

22. Goldsbury, C., Mocanu, M.M., Thies, E., Kaether, C., 

Haass, C., Keller, P., Biernat, J., Mandelkow, E. and Mandelkow, 

E.M. (2006). Inhibition of APP trafficking by tau protein 

does not increase the generation of amyloid-beta peptides. Traffic 7, 

873-888. 

23. Groth, M., Huse, K., Reichwald, K., Taudien, S., Hampe, 

J., Rosenstiel, P., Birkenmeier, G., Schreiber, S. and Platzer, 

M. (2006). Method for preparing single-stranded DNA templates for 

Pyrosequencing using vector ligation and universal biotinylated primers. 

Anal Biochem, 356, 194-201. 

24. Habicht, W., Behrens, S., Unger, E. and Dinjus, E. 

(2006). Cylindrical and ring-shaped tubulin assemblies as metallization 

templates explored by FESEM/EDX and SFM. Surface And Interface 

Analysis 38, 194-197. 

25. Herbst, C., Riedel, K., Leppert, J., Ohlenschläger, O., 

Görlach, M. and Ramachandran, R. (2006). Solid state NMR 

at high magic angle spinning frequencies: Dipolar chemical shift correlation 

with adiabatic inversion pulse based RF pulse schemes. Journal 

Of Biomolecular Nmr 35, 241-248. 

26. Hiller, M., Huse, K., Szafranski, K., Jahn, N., Hampe, J., 

Schreiber, S., Backofen, R. and Platzer, M. (2006). Singlenucleotide 

polymorphisms in NAGNAG acceptors are highly predictive 

for variations of alternative splicing. American Journal Of Human Genetics 

78, 291-302. 

27. Hiller, M., Huse, K., Szafranski, K., Rosenstiel, P., 

Schreiber, S., Backofen, R. and Platzer, M. (2006). Phylogenetically 

widespread alternative splicing at unusual GYNGYN donors. 

Genome Biology, 7, R65. 

26 

32 

28. Hiller, M., Szafranski, K., Backofen, R. and Platzer, M. 

(2006). Alternative Splicing at NAGNAG Acceptors: Simply Noise or 

Noise and More? PLoS Genet 2, e207. 

29. Hinney, A., Bettecken, T., Tarnow, P., Brumm, H., 

Reichwald, K., Lichtner, P., Scherag, A., Nguyen, T.T., 

Schlumberger, P., Rief, W. et al. (2006). Prevalence, spectrum, 

and functional characterization of melanocortin-4 receptor gene mutations 

in a representative population-based sample and obese adults 

from Germany. Journal Of Clinical Endocrinology And Metabolism 91, 

1761-1769. 

30. Hölscher, D., Reichert, M., Görls, H., Ohlenschläger, O., 

Bringmann, G. and Schneider, B. (2006). Monolaterol, the 

first configurationally assigned phenylphenalenone derivative with a 

stereogenic center at C-9, from Monochoria elata. Journal of Natural 

Products 69, 1614-1617. 

31. Jeltsch, A., Walter, J., Reinhardt, R. and Platzer, M. 

(2006). German human methylome project started. Cancer Research 

66, 6778-6778. 

32. Jin, H.C., Sperka, T., Herrlich, P. and Morrison, H. 

(2006). Tumorigenic transformation by CPI-17 through inhibition of a 

merlin phosphatase. Nature 442, 576-579. 

33. Kaether, C., Schmitt, S., Willem, M., Haass, C. (2006). 

Amyloid Precursor Protein and Notch Intracellular Domains are generated 

after Transport of their Precursors to the Cell Surface. Traffic 7, 

408-15. 

34. Kersting, G., Tzvetkov, M.V., Huse, K., Kulle, B., Hafner, 

V., Brockmoller, J. and Wojnowski, L. (2006). Topoisomerase 

II beta expression level correlates with doxorubicin-induced apoptosis 

in peripheral blood cells. Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol. 374, 

21-30. 

35. Keil, C. Maskos, K., Than, M. E., Tan, F. Huber, R., Deddish, 

P. A., Skidgel, R. A., Erdös, E. G. and Bode, W. (2007). 

Crystal structure of the human carboxypeptidase N (kininase I) catalytic 

domain. J. Mol. Biol. 366, 504-16. 

39


78 

Beiträge in 

referierten Zeitschriften 

36. Kittler, M., Yu, X., Vyvenko, O.F., Birkholz, M., Seifert, 

W., Reiche, M., Wilhelm, T., Arguirov, T., Wolff, A., Fritzsche, 

W. et al. (2006). Self-organized pattern fonnation of biomolecules 

at silicon surfaces: Intended application of a dislocation network. 

Materials Science & Engineering C-Biomimetic And Supramolecular 

Systems, 26, 902-910. 

37. Klingenspor, M., Helwig, M., Fromme, T., Brand, M.D., 

Kloas, W., Taudien, S., Platzer, M. and Jastroch, M. (2006) 

Uncoupling protein 1 is expressed in the brain of ectothermic vertebrates. 

Biochimica Et Biophysica Acta-Bioenergetics, 375-376. 

38. Korosoglou, G., Behrens, S., Bekeredjian, R., Hardt, S., 

Hagenmueller, M., Dinjus, E., Böhm, K.J., Unger, E., Katus, 

H.A. and Kuecherer, H. (2006). The potential of a new stable ultrasound 

contrast agent for site-specific targeting. An in vitro experiment. 

Ultrasound In Medicine And Biology, 32, 1473-1478. 

39. Lo, J. C., Basak, S., James, E. S., Quiambo, R., Kinsella, 

M. C., Alegre, M.-L., Weih, F., Franzoso, G., Hoffmann, A., 

and Fu, Y.-X. (2006). Coordination between NF-kB family members 

p50 and p52 is essential for mediating LTβR signals in the development 

and organization of secondary lymphoid tissues. Blood 107, 

1048-1055. 

40. Loizou, J.I., Murr, R., Finkbeiner, M.G., Sawan, C., 

Wang, Z.Q. and Herceg, Z. (2006). Epigenetic information in 

chromatin - The code of entry for DNA repair. Cell Cycle, 5, 696-701. 

41. Mock, T., Krell, A., Glöckner, G., Kolukisaoglu, U. and 

Valentin, K. (2006). Analysis of expressed sequence tags (ests) 

from the polar diatom fragilariopsis cylindrus. Journal Of Phycology 

42, 78-85. 

42. Morley, N., Rapp, A., Dittmar, H., Salter, L., Gould, D., 

Greulich, K.O. and Curnow, A. (2006). UVA-induced apoptosis 

studied by the new apo/necro-Comet-assay which distinguishes viable, 

apoptotic and necrotic cells. Mutagenesis 21, 105-114. 

43. Murr, R., Loizou, J.I., Yang, Y.G., Cuenin, C., Li, H., 

Wang, Z.Q. and Herceg, Z. (2006). Histone acetylation by 

Trrap-Tip60 modulates loading of repair proteins and repair of DNA 

double-strand breaks. Nature Cell Biology 8, 91-99. 

44. Musharraf, A., Markschies, N., Imhof, D. and Englert, 

C. (2006). Structural requirements of substrates for the PTP domain 

of Eya proteins. Journal Of Peptide Science 12, 174. 

39 

45. Musumeci, D., Valente, M., Capasso, D., Palumbo, R., 

Görlach, M., Schmidtke, M., Zell, R., Roviello, G.N., Sapio, 

R., Pedone, C. et al. (2006). A short PNA targeting coxsackievirus 

B3 5 ‚-nontranslated region prevents virus-induced cytolysis. Journal Of 

Peptide Science 12, 161-170. 

46. Nusbaum, C., Taudien, S., Blechschmidt, K., Glöckner, 

G., Lehmann, R. et al. (2006). DNA sequence and analysis of human 

chromosome 8. Nature 436, 331-335. 

47. Ohlenschläger, O., Seiboth, T., Zengerling, H., Briese, 

L., Marchanka, A., Ramachandran, R., Baum, M., Korbas, 

M., Meyer-Klaucke, W., Dürst, M. et al. (2006). Solution 

structure of the partially folded high-risk human papilloma virus 45 

oncoprotein E7. Oncogene 25, 5953-5959. 

48. Orian-Rousseau V., Morrison H., Matzke A., Kastilan 

T., Pace G., Herrlich P., Ponta H. (2007). Hepatocyte growth 

factor-induced Ras activation requires ERM proteins linked to both 

CD44v6 and F-actin. Mol Biol Cell. 18, 76-83. Epub 2006 

49. Orthaus, S., Ohndorf, S. and Diekmann, S. (2006). RNAi 

knockdown of human kinetochore protein CENP-H. Biochemical And 

Biophysical Research Communications 348, 36-46. 

50. Peim A., Hortschansky P., Christopeit T., Schroeckh V., 

Richter W. and Fändrich M. (2006). Mutagenic exploration of 

the cross-seeding and fibrillation propensity of Alzheimer‘s beta-amyloid 

peptide variants. Protein Sci. 15, 1801-1805. 

51. Peifer, C., Stoiber, T., Unger, E., Totzke, F., Schachtele, 

C., Marme, D., Brenk, R., Klebe, G., Schollmeyer, D. and 

Dannhardt, G. (2006). Design, synthesis, and biological evaluation 

of 3,4-diarylmaleimides as angiogenesis inhibitors. Journal Of Medicinal 

Chemistry 49, 1271-1281. 

52. Platzer, M., Hiller, M., Huse, K., Szafranski, K., Hampe, 

J., Backofen, R. and Schreiber, S. (2006). Die Variabilität der 

Plastizität - Proteinvielfalt durch subtiles alternatives Spleißen an NAG- 

NAG-Motiven. GenomXPress 1, 4-6.

41 

53. Platzer, M., Hiller, M., Szafranski, K., Jahn, N., Hampe, 

J., Schreiber, S., Backofen, R. and Huse, K. (2006). Sequencing 

errors or SNPs at splice-acceptor guanines in dbSNP? Nature Biotechnology 

24, 1068-1070. 

54. Riedel, K., Herbst, C., Hafner, S., Leppert, J., Ohlenschläger, 

O., Swanson, M.S., Görlach, M. and Ramachandran, 

R. (2006). Constraints on the structure of (CUG)(97) RNA from 

magic-angle-spinning solid-state NMR spectroscopy. Angewandte Chemie-International 

Edition 45, 5620-5623. 

55. Riedel, K., Herbst, C., Leppert, J., Ohlenschläger, O., 

Görlach, M. and Ramachandran, R. (2006). Heteronuclear decoupling 

in rotating solids: Improving the efficacy of CNnv symmetrybased 

tanh/tan adiabatic RF pulse schemes. Chemical Physics Letters 

429, 590-594. 


Görlach, M. and Ramachandran, R. (2006). Tailoring broadband 

inversion pulses for MAS solid state NMR. Journal Of Biomolecular 

Nmr 35, 275-283. 


Görlach, M. and Ramachandran, R. (2006). Broadband homonuclear 

double-quantum NMR/filtering via zero-quantum dipolar 

recoupling in rotating solids. Chemical Physics Letters 424, 178-183. 

58. Röcken C., Fändrich M., Stix B., Tannert A., Hortschansky 

P., Kähne T., Menard R., Ancsin J. and Bühling F. 

(2006) Cathepsin protease activity is linked to extracerebral amyloidosis. 

J. Pathology 210, 478-487. 

59. Röcken C., Becker K., Fändrich M., Schroeckh V., Stix 

B., Rath T., Kähne T., Roessner A. and Albert F.W. (2006). 

ALys amyloidosis caused by compound heterozygosity in exon 2 

(Thr70Asn) and exon 4 (Trp112Arg) of the lysozyme gene. Human Mutation 

27, 119-120. 

60. Rohr K.B., Selwood, T., Marquardt, U., Huber, R., 

Schechter, N.M., Bode, W. and Than, M.E. (2006). X ray 

Structures of Free and Leupeptin-Complexed Human αI-Tryptase Mutants: 

Indication for an α → β-Tryptase Transition. J. Mol. Biol. 357, 

195-209. 

53 

62 

61. Rosenstiel, P., Huse, K., Till, A., Hampe, J., Hellmig, S., 

Sina, C., Billmann, S., von Kampen, O., Waetzig, G.H., 

Platzer, M. et al. (2006). A short isoform of NOD2/CARD15, 

NOD2-S, is an endogenous inhibitor of NOD2/receptor-interacting protein 

kinase 2-induced signaling pathways. Proceedings Of The National 

Academy Of Sciences Of The United States Of America 103, 3280-3285. 

62. Sachse, C., Xu, C., Wieligmann, K., Diekmann, S., Grigorieff, 

N. and Fändrich, M. (2006). Quaternary structure of a 

mature amyloid fibril from Alzheimer‘s a beta(1-40) peptide. Journal 

Of Molecular Biology 362, 347-354. 

63. Schickel, J., Beetz, C., Frommel, C., Heide, G., Sasse, A., 

Hemmerich, P. and Deufel, T. (2006). Unexpected pathogenic 

mechanism of a novel mutation in the coding sequence of SPG4 (spastin). 

Neurology 66, 421-423. 

64. Siddiqui, R.A., Hoischen, C., Holst, O., Heinze, I., 

Schlott, B., Gumpert, J., Diekmann, S., Grosse, F. and Platzer, 

M. (2006). The analysis of cell division and cell wall synthesis 

genes reveals mutationally inactivated ftsQ and mraY in a protoplasttype 

L-form of Escherichia coli. Fems Microbiology Letters 258, 305-311. 

65. Simon, A., Glöckner, G., Felder, M., Melkonian, M. and 

Becker, B. (2006). EST analysis of the scaly green flagellate Mesostigma 

viride (Streptophyta): Implications for the evolution of green 

plants (Viridiplantae). BMC Plant Biol 6, 2. 

66. Siol, O., Boutliliss, M., Chung, T., Glöckner, G., Dingermann, 

T. and Winckler, T. (2006). Role of RNA polymerase III 

transcription factors in the selection of integration sites by the Dictyostelium 

non-long terminal repeat retrotransposon TRE5-A. Molecular 

And Cellular Biology 26, 8242-8251. 

67. Soe, K., Hartung, S. and Grosse, F. (2006). Human topoisomerase 

I forms double cleavage complexes on natural DNA. Biochemical 

And Biophysical Research Communications 349, 178-185. 

68. Steinert, M. and Glöckner, G. (2006). In Dobrindt, U. and 

Hacker, J. (eds.), Pathogenomics. Wiley-VCH, pp. 445-456. 

69. Steinmetzer, T., Schweinitz, A., Stürzenbecher, A., 

Dönnecke, D., Uhland, K., Schuster, O., Steinmetzer, P., 

Friedrich, R., Than, M. E., Bode, W. and Stürzebecher, J. 

(2006). Secondary amides of sulfonylated 3 amidinophenylalanine – 

New Potent and selective inhibitors of matriptase. J. Med. Chem. 49, 

4116-4126. 

41


73 

Beiträge in referierten Zeitschriften 

70. Szafranski, K., Jahn, N. and Platzer, M. (2006). tuple_ 

plot: Fast pairwise nucleotide sequence comparison with noise suppression. 

Bioinformatics 22, 1917-1918. 

71. Tanaka, Y., Igarashi, S., Nakamura, M., Gafni, J., Torcassi, 

C., Schilling, G., Crippen, D., Wood, J.D., Sawa, A., 

Jenkins, N.A. et al. (2006). Progressive phenotype and nuclear 

accumulation of an amino-terminal cleavage fragment in a transgenic 

mouse model with inducible expression of full-length mutant huntingtin. 

Neurobiology Of Disease 21, 381-391. 

72. Taudien, S., Ebersberger, I., Glöckner, G. and Platzer, 

M. (2006). Should the draft chimpanzee sequence be finished? 

Trends Genet 22, 122-125. 

73. Tong, W.M., Lee, M.K., Galendo, D., Wang, Z.Q. and 

Sabapathy, K. (2006). Aflatoxin-B exposure does not lead to p53 

mutations but results in enhanced liver cancer of Hupki (human p53 

knock-in) mice. International Journal Of Cancer, 119, 745-749. 

74. Veith, A.M., Klattig, J., Dettai, A., Schmidt, C., Englert, 

C. and Volff, J.N. (2006). Male-biased expression of X-chromosomal 

DM domain-less Dmrt8 genes in the mouse. Genomics 88, 185-195. 

75. Weidtkamp-Peters, S., Rahn, H.P., Cardoso, M.C. and 

Hemmerich, P. (2006). Replication of centromeric heterochromatin 

in mouse fibroblasts takes place in early, middle, and late S phase. 

Histochemistry And Cell Biology 125, 91-102. 

76. Wicher, D., Agricola, H.J., Sohler, S., Gundel, M., Heinemann, 

S.H., Wollweber, L., Stengl, M. and Derst, C. 

(2006). Differential receptor activation by cockroach adipokinetic 

hormones produces differential effects on ion currents, neuronal activity, 

and locomotion. J Neurophysiol 95, 2314-2325. 

77. Wiesenthal, V., Leutz, A. and Calkhoven, C.F. (2006). A 

translation control reporter system (TCRS) for the analysis of translationally 

controlled processes in the vertebrate cell. Nucleic Acids Research 

34, 23. 

78. Wiesenthal, V., Leutz, A. and Calkhoven, C.F. (2006). 

Analysis of translation initiation using a translation control reporter 

system. Nature Prot 1, 1531-1537. 

81 

79. Winning, J., Claus, R.A., Huse, K. and Bauer, M. 

(2006). Molecular biology on the ICU. From understanding to treating 

sepsis. Minerva Anestesiol 72, 255-267. 

80. Yamasaki, A., Eimer, S., Okochi, M., Smialowska, A., 

Kaether, C., Baumeister, R., Haass, C., Steiner, H. (2006). 

The GxGD motif of presenilin contributes to catalytic function and 

substrate identification of g-secretase. J. Neurosci. 26, 3821-8. 

81. Yang, Y.G., Frappart, P.O., Frappart, L., Wang, Z.Q. and 

Tong, W.M. (2006). A novel function of DNA repair molecule Nbs1 

in terminal differentiation of the lens fibre cells and cataractogenesis. 

Dna Repair 5, 885-893. 

82. Yang, Y.G., Saidi, A., Frappart, P.O., Min, W., Barrucand, 

C., Dumon-Jones, V., Michelon, J., Herceg, Z. and 

Wang, Z.Q. (2006). Conditional deletion of Nbs1 in murine cells reveals 

its role in branching repair pathways of DNA double-strand 

breaks. Embo Journal 25, 5527-5538. 

83. Zheng, W., Rosenstiel, P., Huse, K., Sina, C., Valentonyte, 

R., Mah, N., Zeitlmann, L., Grosse, J., Ruf, N., Nurnberg, 

P. et al. (2006). Evaluation of AGR2 and AGR3 as candidate 

genes for inflammatory bowel disease. Genes Immun 7, 11-18. 

84. Zuse, A., Schmidt, P., Baasner, S., Böhm, K.J., Müller, 

K., Gerlach, M., Günther, E.G., Unger, E., Prinz, H. (2006). 

9-Benzylidene-naphtho[2,3-b]thiophen-4-ones as novel antimicrotubule 

agents - Synthesis, antiproliferative activity and inhibition of tubulin 

polymerization. J. Med. Chem. 49, 7816-7825

Publikationen II 

Beiträge in nichtreferierten Zeitschriften und Büchern 

1. Balogh, P., Balázs, M., Schumacher, A., Weih, F. and Arnold, 

H.H. - Ontogeny and postnatal development of the 

splenic vascular beds: regional cues, phenotypic responses. 

In: Embryonic Stem Cell Research, E. V. Grier, ed., Nova Sci- 

ence Publishers, Inc., Hauppauge NY, 2006, 143-169. 

2. Böhm, K.J. - Kinesin-driven transport in cell-free envi- 

ronment. International Symposium: The Plant Cytoskele- 

ton: Genomic and Bioinformatic Tools for Biotechnology 

and Agriculture. Yalta (Ukraine) 19.-23.09.2006, 9-11. 

3. Greulich, K.O. - The single DNA molecule as analytical 

target and as building block. In: LabPlus International 2006 

April/May 12 -14. 

4. Kaether, C, Haass, C, Steiner, H. (2006). - Assembly, 

trafficking and function of gamma-secretase. Neurode- 

gener Dis. 2006;3:275-83. (Review) 

5. Nolte, O., Müller, M., Häfner, B., Knemeyer, J.P., Stöhr, 

K., Wolfrum, J., Hakenbeck, R., Denapaite, D., Schwarz – 

Finsterle, J., Stein, S., Schmitt, E., Crèmer, C., Herten, D.P., 

Hausmann, M., Sauer, M.- Novel Singly Labelled Probes for 

Life Science Applications (SMART PROBES). In: Biophoto- 

nics: Visions for Better Health Care. (J. Popp, M. Strehle, 

Eds.), Wiley-VCH, 2006, 167-230. 

6. Platzer, M. - The human genome and its upcoming dy- 

namics. In: GenomeDynamics (J.-N. Volff, Ed.), S. Karger AG, 

Basel, 2006, 1-16. 

7. Romualdi, A., Felder, M., Rose, D., Gausmann, U., Schilhabel, 

M, Glöckner, G., Platzer, M., Sühnel, J. - Annotation 

and Comparative Genomics of Prokaryotes Made Easy. In: 

Comparative Genomics (N. Bergman, Ed.), Methods in Mo- 

lecular Biology, Humana Press, Totowa/NJ, GenColors. 

8. Steiner, H., Than, M. E., Bode, W. and Haass, C. (2006).- 

Pore-forming scissors? A first structural glimpse of gam- 

masecretase. Trends Biochem Sci. 31, 491-493. (Kommentar 

/Review) 

43

44 Vorträge 

Vorträge weltweit 

Die Wissenschaftler des Fritz-Lipmann-Instituts 

berichteten im Jahr 2006 im In- und Ausland über ihre 

Arbeit. 

Christina Bauerschmidt 

Institut für Medizinische Strahlenbiologie, Universitäts- 

klinikum Essen, 1. Februar 2006 

Konrad Böhm 

Nato Symposium “The Plant Cytoskeleton: Genomic and 

Bioinformatic Tools for Biotechnology and Agriculture”, 

Jalta, 19. bis 23. September 2006 

Strep Meeting, Potsdam, 12. Juni 2006 

Cornelis Calkhoven 

Utrecht Graduate School of Developmental Biology, 

University of Utrecht; Niederlande, 29. Juni 2006 

Signal Transduction Society Meeting (STS), Weimar, 

2. bis 4. November 2006 

Michela Carella 

EMBO workshop Redox signalling in human disease and 

ageing, Catholic University Rom, Italien, 20. bis 23. April 

2006 

24 hpf 

5 dpf 

7 dpf 

Control-MO Wt1b-M 

Wt1a-MO 

Stephan Diekmann 

GBM-Lecture, TU München, 24. Januar 2006 

Institut Monod, Paris, Frankreich, 15. Dezember 2006 

Cold Spring Harbor Meeting “Dynamic organisation of 

nuclear function”, Cold Spring Harbor, USA, 


Christoph Englert 

SFB 604 workshop on “Signal transduction and cancer“, 

Weimar, 25. Februar 2006 

Colloquium on “Transgenic animal models for Medicine”, 

Jena, 16. Juni 2006 

Institut für Toxikologie and Genetik, Forschungszentrum 

Karlsruhe, 17. Oktober 2006 

Institut für Humangenetik und Anthropologie, 

Universität Freiburg, 22. November 2006 

SFB 604 workshop on “Gene regulatory networks“ 

in Dornburg/Jena, 7. Dezember 2006 

Marcus Fändrich 

Biozentrum Basel, Schweiz, 12. November 2006 

Konferenz Faltertage, Halle/Saale, 22. September 2006 

Universität Dortmund, 8. Juni 2006 

Friedrich-Schiller-Universität Jena, 20. April 2006

Universität Konstanz, 23. Mai 2006 

Universität Göttingen, 9. Februar 2006 

Universität Halle, 20. Februar 2006 

Ulrike Gausmann 

SFB 604 Workshop on “Gene regulatory networks”, 

Dornburg/Jena, 7. Dezember 2006 

Oberseminar Bioinformatik, Friedrich-Schiller-Universität 

Jena, 28. Februar 2006 

Gernot Glöckner 

ESTTAL meeting, Neapel, Italien, 25. Februar 2006 

SFB 680, Köln, 17. März 2006 

Matthias Görlach 

International conference on magnetic resonance in 

biological systems (ICMRBS), Göttingen, 

20. bis 25. August 2006 

Jahrestagung der GDCh Fachgruppe Magnetische 

Resonanzspektroskopie, Tübingen, 


TU München (Garching), 2. November 2006 

Universität Lübeck, 23. November 2006 

Karl-Otto Greulich 

Indore, Indien, 7. bis 20. Februar 2006 

PHOTONICS, Hyderabad, Indien, 13. bis 16. Dezember 2006 

Paulius Grigaravicius 

9. Jahrestagung der Gesellschaft für Biologische Strahlen- 

forschung (GBS), Braunschweig, 10. bis 12. Mai 2006 

Frank Große 

Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, 

Basel, Schweiz, 2. Mai 2006 

Feng Guo 

1st Joint Meeting of European National Societies of 

Immunology / 16th European Congress of Immunology, 

Paris, Frankreich, 9. September 2006 

Andrew Heidel 

International Dictyostelium Conference, Santa Fe (NM), 

USA, 17. bis 22. September 2006 

Peter Hemmerich 

EMBO workshop “Functional Organization of the Cell 

Nucleus“, Prag, Tschechische Republik, 5. bis 8. Mai 2006 

45

46 Vorträge 

Muttermal Fehlgebildetes 

Muttermal 



Radiales 

Wachstum 

Summer School, Spetses, Griechenland, 


Vertikales 

Wachstum 

Maligner 

Tumor & 

Metastasenbildung 

8. DGZ-Nachwuchswissenschaftler-Tagung in Heidelberg, 

21. bis 23. Juli 2006 

Oridis Biomed Forschungs- und Entwicklungs GmbH, 

Wien, Österreich, 21. April 2006 

Kongress “Gene regulation in health and disease”, Institut 

Pasteur, Paris, Frankreich, 6. Bis 8. März 2006 

Heike Heuer 

Neuro-Seminar, Institut für Anatomie, Friedrich-Schiller- 

Universität Jena, 7. Juni 2006 

Neurokolloquium, Institut für Physiologie und Pathophy- 

siologie, Phillipps-Universität Marburg, 13. Juli 2006 

Seminarreihe „Neurobiochemie und Zellbiologie“, 

Interfakultäres Institut für Biochemie, Tübingen, 

25. Juli 2006 

88th Annual Endo Meeting, Boston, USA, 26. Juni 2006 

77th Annual Meeting of the American Thyroid Association, 

Phoenix, USA, 12. Oktober 2006 

Christian Hoischen 

Annual Conference of the Association for General and 

Applied Microbiology, Jena, 

19. bis 22. März 2006 

Institut für Biochemie, Universität Köln, 3. Mai 2006 

Christoph Kaether 

Institutsseminar ZMBH Heidelberg, 3. Februar 2006 

Zweiter Tag der Gesundheitsforschung, Klinikum Jena, 


Institutsseminar ITG Karlsruhe, 28. März 2006 

6th Eibsee-Meeting of the DFG priority program “Cellular 

Mechanisms of Alzheimer´s disease”, 6. April 2006 

Minisymposium Gedächtnis- und Altersforschung, 

Fritz-Lipmann-Institut Jena, 20. April 2006 

Methodenkolloquium des VBMF on Kinetic Microscopy, 

Fritz-Lipmann-Institut Jena, 21. April 2006 

Institutsseminar Universität Mainz, 5. Juli 2006 

10th International Conference on Alzheimer´s disease, 

Madrid, Spanien, 16. Juli 2006 

Institutsseminar, Max-Planck-Institut für Experimentielle 

Medizin Göttingen, 4. Juli 2006 

Institutsseminar Biochemie Kiel, 21. November 2006

Shamci Monajembashi 

Forschungsschwerpunkt Biophotonik Symposium: 

Bilder vom Leben, München, 27. bis 29. April 2006 

Oliver Ohlenschläger 

1st European Chemistry Congress of the European Chemi- 

cal Societies (HCS, RSC, GDCh, SFC), University Budapest, 

Ungarn, 27. bis 31. August 2006 

Matthias Platzer 

Biochemisches Kolloquium, Universität Leipzig, 

1. März 2006 

NGFN Meeting, Heidelberg, 25. bis 26. November 2006 

Anja Rockstroh 

Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf, 

DNA Repair Meeting 2006, 14. September 2006 

Eberhard Schmitt 

Max-Planck-Institut für Mathematik in den Naturwissen- 

schaften, Leipzig, 1. Februar 2006 

Seminars Sunas Biologija, Riga, 7. September 2006 

Roman Siddiqui 

Bundesforschungsinstitut für Tiergesundheit – Friedrich- 

Loeffler-Institut Jena, 12. Dezember 2006 

Kent Søe 

GSF – Forschungszentrum für Umwelt und Gesundheit, 

Weiterbildung „Fachtoxikologe / Fachtoxikologin DGPT“, 

Institut für Toxikologie, Neuherberg bei München, 


Jürgen Sühnel 

Oberseminar Bioinformatik, Friedrich-Schiller-Universität 

Jena, 25. April 2006 

First Tunisian-German Workshop on Bioinformatics, Borj 

Cedria, Tunesien, 8. September 2006 

Karol Szafranski 

BCB-Workshop on medical aspects of alternative splicing, 

Berlin, 14. Dezember 2006 

Stefan Taudien 

Universität Mainz, Institut für Pharmakologie, 


Manuel Than 

Seminar, Universität Göttingen, 24. Oktober 2006 

Ringberg Symposium - Regulated Intramembrane 

Proteolysis, 28. November 2006 

1st Campus Workshop – Beutenberg, Jena, 


47

48 Vorträge 


Jan Tuckermann 

Signal Transduction Meeting, Weimar, 

2. bis 4. November 2006 

Schering/Berlin, 20. bis 21. September 2006 

Endocrinology Meeting, Boston, USA, 23. bis 26. Juni 2006 

Keystone Conference, Banff, Kanada, 18. bis 22. März 2006 

Deutsches Krebsforschungszentrum, Heidelberg, 

4. August 2006 

RWTH, Aachen, 13. Februar 2006 

SFB 604 Signal transduction and Cancer, Weimar, 

24. bis 25. Februar 2006 

Ludwig Boltzmann Institute for Cancer Research Wien, 

Österreich, 15. Mai 2006 

Eberhard Unger 

Joint Meeting of the Czech, German and Hungarian 

Pharmaceutical Societies, Marburg, 4 bis 7.Oktober 2006 

Zhao-Qi Wang 

VBMF Methoden-Kolloquium „Transgenic Animals“, Jena, 

16. Juni 2006 

2006 International Workshop on Ataxia Telangiectasia 

(A-T) and ATM. Banff, Kanada, 8. bis 12. September 2006 

p100 

α α 

P P 

RelB 

p52 RelB 

p52 RelB 

p100 

C-term. 

Ub Ub 

P P 

LTα 1 β 2 

LTβR 

Alternative NF-κB 

Activation 

Pathway 

NIK 

IKKα activation 

p100 

phosphorylation 

p100 

ubiquitination 

and processing 

Lymphoid organ development 

Adaptive immunity 

Cytoplasm 

UbUb Ub 

P P 

Ub 

Bα 

Iκ 

Nucleus 

ECDO (the European Cell Death Organization) 14th Euro- 

conference on Apoptosis, Sardinien, Italien, 29. September 

bis 4. Oktober 2006 

International Symposium on the Mechanisms of 

Haematopoiesis, Beijing, China, 12. bis 13.Oktober 2006 

Institute for Pathology, Bonn Medical School, Bonn, 

10. Mai 2006 

Cancer Research UK – London Research Institute London, 

UK, 12. Mai 2006 

Institut für Toxikologie, Johannes Gutenberg-Universität 

Mainz, 10. November 2006 

Medizinische Fakultät, Friedrich-Schiller-Universität Jena, 


Falk Weih 

Nikolaus-Fiebiger-Zentrum für Molekulare Medizin/SFB 

2008, Erlangen, 30. Mai 2006 

Universitätsklinikum Schleswig-Holstein, Institut für 

Immunologie Kiel, 6. Juli 2006 

Universitätsklinik Leipzig, Klinik für Dermatologie, 

Venerologie und Allergologie, 17. Juli 2006 

Konferenz: Development and Function of Secondary and 

Tertiary Lymphoid Tissues, Institut Pasteur, Paris, 

Frankreich, 5. September 2006 

MEKK3 

γ 

α β 

P P 

Classical 

IκBα 

p50 RelA 

p50 RelA 

p50 RelA 

IKKβ activ 

IκB 

phospho 

IκBα 

ubiquitin 

and prote 

degrada 

Cell survival, inflammation 

Innate immunity

Dissertationen, Habilitationen, Preise 

Vier Mitarbeiter des Fritz-Lipmann-Instituts erlangten 

im Jahr 2006 die Doktorwürde, drei Mitarbeitern wurde 

die Lehrerlaubnis erteilt, vier erhielten renommierte Preise 

für ihre hervorragenden wissenschaftlichen Arbeiten. 

Dissertationen 

Jürgen Thomas Klattig (Forschungsgruppe Christoph Englert) 

“On the role of Wt1, Dmrt8 and Sox9 during murine gonad 

development and sex determination“, Januar 2006 

Christina Bauerschmidt (Forschungsgruppe Frank Große) 

„Der humane Replikationsfaktor Cdc45 – Lokalisation und 

Interaktionspartner“, Januar 2006 

Svetlana Nikolajewa (Forschungsgruppe Thomas Wilhelm) 

„Identification and Analysis of Patterns in DNA sequences, 

the Genetic code and Transcriptional Regulation“, März 

2006 

Sandra Orthaus (Forschungsgruppe Stephan Diekmann) 

„Das humane Kinetochor – Aufbau, Funktion und deren 

Regulation“, Dezember 2006 

Habilitationen 

Matthias Platzer 

„Das Humangenom und seine sich abzeichnende Dyna- 

mik“, Friedrich-Schiller-Universität Jena 

Gernot Glöckner 

Akademische Würden 

„Analyse des Genoms von Dictyostelium discoideum“, 

Friedrich-Schiller-Universität Jena 

Manuel Than 

“Structure, Function and Inhibition of the Prohormone/ 

Proprotein Convertase Family of Endoproteinases”, 

Ludwig-Maximilians-Universität München 

Auszeichnungen 

Karin Schütze, Carsten Hoyer 

(ehemalige Mitarbeiter der Forschungsgruppe von Karl-Otto Greulich): 

Nominierung für den Zukunftspreis des Bundespräsi- 

denten 

Alexander Rapp (Forschungsgruppe Karl-Otto Greulich): 

GUM Nachwuchswissenschaftler-Preis 2006 

Heike Heuer: 

The Endocrine Society Travel Award, Endo 2006 

Helen Morrison: 

Thüringer Forschungspreis 2006 

Kultusminister Dr. Jens 

Goebel überreicht den 

Thüringer 

Forschungspreis 

49

50 Patente 

Erfindungen schützen 

Die Forschungsarbeiten des Fritz-Lipmann-Instituts 

können – neben ihrer Veröffentlichung in wissenschaft- 

lichen Fachzeitschriften – schutzrechtlich gesichert und 

potenziell einer Verwertung zugeführt werden. Um Pa- 

tent- und Verwertungsstrategien effizient zu verfolgen, 

wird das FLI seit 2006 von der Patentverwertungsagentur 

Ascenion GmbH betreut. Dies geschieht im Rahmen eines 

vom Bundesministerium für Bildung und Forschung finan- 

zierten Projektes. 

Im Jahr 2006 gab es zwei interne Erfindungsmeldungen und zwei neue Patentanmeldungen 

Titel des angemeldeten Patents Erfinder 

Statistisch signifikante Substrukturen in Molekülen Thomas Wilhelm, Maik Friedel 

Anthracen-Derivate und deren Verwendung zur Eberhard Unger, Konrad Böhm; 

Behandlung gutartiger und bösartiger Kooperation mit Zentaris GmbH 

Tumorerkrankungen 

Existenzgründungen Lizenzen 

Patente 

Aktuelle Technologieangebote, die aus der For- 

schungsarbeit des FLI entstanden sind, finden Sie auch 

auf den Internetseiten der Ascenion GmbH unter 

www.ascenion.de.

231.445 

54.382 

Das erfolgreiche Einwerben von Drittmitteln wird von 

der wissenschaftlichen Gemeinschaft als Leistungspara- 

meter gewertet. Die nachfolgende Tabelle zählt die For- 


Zuwendungsgeber Thema Projektleiter Beginn Gesamt- Einnahmen 

Ende zuwendung 2006 in E 

in E 

Institut allgemein 

BMBF Verwertungsoffensive Leibniz E. Fritz 01.01.06 231.445 83.425 

31.12.08 

Gesamtzuwendung 2006 83.425 

Forschungsgruppe Matthias Görlach 

DFG Interaktion des humanen M. Görlach 01.01.05 67.305 28.500 

Poly(rC)-bindenden Protein 2 mit 31.12.06 

Enterovirus-RNA 

DFG Determination of RNA Structure by M. Görlach 01.03.06 83.000 28.000 

Magic Angle Spinning Solid State 29.02.08 

NMR Spectroscopy 

BMBF Jenaer Centrum für Bioinformatik: M. Görlach 01.08.05 185.000 140.731 

TP NMR-Aufklärung von Targetproteinen 31.07.07 

Summe bewilligt: 197.231 

Forschungsgruppe Jürgen Sühnel 

14.073 

28.500 

9.32083.425 

Zusätzliche Gelder – zusätzliche Projekte 

schungsgruppen und ihre Projekte, die Zuwendungsgeber 

und die zusätzlich von den FLI-Wissenschaftlern einge- 

worbenen Gelder auf. 

175.000 

67.305 

BMBF JCB: Centrum Bioinformatik: J. Sühnel 01.09.01 300.000 121.126 

TP Centrumsmanagement 31.12.07 

BMBF JCB: Centrum Bioinformatik: J. Sühnel 01.09.01 175.000 9.120 

TP Ausbildung 31.12.07 

BMBF NGFN 2:SMP Bioinformatik: J. Sühnel 01.11.04 247.937 122.494 

3D-Struktur-Information für die 31.10.07 

Genomforschung 

BMBF JCB-2: Centrum Bioinformatik: J. Sühnel 01.08.05 150.000 54.182 

51 

247.937

5 


135.400 

13.565 

.850 22.157 

39.500 2.225 

703.000 




in E 

Forschungsgruppe Jürgen Sühnel (Fortsetzung) 

TP Identifikation von Virulenzgenen 31.07.07 

pathogener Mikroorganismen durch 

differentielle Genomanalyse verschiedener 

Stämme 


Forschungsgruppe Marcus Fändrich 

BMBF BioFuture: Struktur und Zusammensetzung M. Fändrich 01.08.03 1.200.000 229.672 

von krankheitsassoziierten Amyloidfibrillen 31.07.08 


Forschungsgruppe Frank Große 

DFG Untersuchungen zur Rolle der nukleären F. Große 01.07.06 70.000 10.000 

DNA-Helikase in der DNA-Reparatur 30.06.08 

DFG Regulation on DNA polymerase alpha, F. Große 01.07.05 135.400 38.850 

Cdc45 and TopBP1 at the initiation step of 31.12.08 

DNA replikation 


Forschungsgruppe Stephan Diekmann 

DFG Optische Analyse der Struktur und Dynamik P. Hemmerich 01.03.05 73.000 30.000 

supramolekularer biologischer Komplexe 28.02.07 


Forschungsgruppe Thomas Wilhelm 

21 2 

15.000 

245.700 

BMBF JCB: Centrum Bioinformatik: T. Wilhelm 01.09.01 703.000 106.018 

Nachwuchsgruppe „Simulation 31.12.07 

regulatorischer Netzwerke“ 

Summe bewilligt: 106.018

0.700 

181.252 



in E 

Forschungsgruppe Karl-Otto Greulich 

EU Active Biomimetic Systems K. Böhm 01.05.05 231.000 21.360 

30.04.08 

DAAD Identifizierung und Charakterisierung K. Böhm 01.01.05 5.250 2.255 

mitotischer Spindelkomponenten 31.12.06 

Industrie Synthese, Testung und Charakterisierung K. Böhm 01.01.04 268.000 92.000 

von tubulin-aktiven Verbindungen, 31.12.06 

Kinesin-Effektoren und weiteren 

antiproliferativen Zytoskelett-Effektoren 


Forschungsgruppe Matthias Platzer 

21.360 

131.062 

43.218 13.188 

1.202.508 98.250 

DFG From comparative to functional genomics G. Glöckner 01.03.06 720.000 109.000 

of social amoeba 31.12.08 

DFG SNP-dependent splicing as an evolutionary K. Huse 01.10.06 170.000 20.000 

mechanism to increase proteome variability 30.09.08 

DFG SFB 604: TP Alternative Splicing as a M. Platzer 01.07.05 210.700 60.200 

Modulator of Signal Transduction 31.12.08 

DFG Genomevolution bei den Viridiplantae: M. Platzer/ 01.01.05 30.000 15.000 

EST-Analyse von Grünalgen G. Glöckner 31.12.06 

DFG Die Funktion der Entkopplerproteine bei M. Platzer 01.04.05 20.000 6.000 

Wirbeltieren: Vergleichende genomische 31.05.07 

und physiologische Untersuchungen 

BMBF Genomische Variabilität von Wirtsfaktoren M. Platzer 01.10.04 768.900 270.000 

im AIDS-Makaken-Modell 30.09.07 

BMBF NGFN 2: SMP Epigenetik: M. Platzer 01.05.05 98.250 42.188 

DNA-Methylierungsprofil des menschlichen 30.04.08 

Chromosoms 21 

BMBF NGFN 2: SMP DNA: Sequenzierung und M. Platzer 01.07.05 1.202.508 258.230 

finishing des Schimpansen X-Chromosoms 30.06.08 

53

54 


243.218 

50.417 




in E 

Forschungsgruppe Matthias Platzer (Fortsetzung) 

50.417 

245.700 

51739.500 6.000 

BMBF JCB-2: Centrum Bioinformatik: M. Platzer 01.08.05 131.062 62.909 

TP Populationsgenetische Variabilität in 31.07.07 

alternativen NAGNAG-Spleißakzeptoren 

BMBF Kompetenznetz Genomforschung an M. Platzer 01.07.04 40.824 8.324 

pathogenen Bakterien (Pathogenomik): 30.06.06 

Genomforschung bei Legionella pneumophilae 

BMBF NGFN 2: KG Umweltbedingte Erkrankungen: M. Platzer 01.07.04 243.218 105.882 

Charakterisierung genomischer DNA und 30.06.07 

Transkriptionsanalyse 

BMBF NGFN 2: SMP DNA: Towards a SNP based M. Platzer 01.11.04 110.000 50.417 

Haplotype Map for the Rat Genome 31.10.07 

BMBF NGFN 2: Neuronetz: Resequenzierung M. Platzer 01.11.05 6.000 3.000 

des Melanocortin-4-Rezeptors 31.10.06 

BMBF NGFN 2: Sequenzierung SFTP: Genetische M. Platzer 01.11.05 7.516 7.517 

Varianten in den humanen Genen 31.10.06 

SFTPD, SFTPA1 und SFTPA2 

EU STAR: A SNP and Haplo Type Map for the Rat M. Platzer 01.01.05 50.000 50.000 

31.12.06 

W.-Sander-Stiftung Funktionelle Genomik von Defensin-Genen M. Platzer 01.09.05 160.100 43.843 

bei Prostata-Karzinom - neue genetische 31.08.07 

Marker für die individualisierte Prognose 

und Therapie 

BMBF NGFN 2: MHC-Typisierungsverfahren und M. Platzer 01.08.06 79.000 39.500 

die Quantifizierung von SIV im Rhesusaffen 30.09.07 

Summe bewilligt: 1.152.010 

118 

2

.750 

43.218 



in E 

Forschungsgruppe Peter Herrlich 

BMU Vergleichende Analyse molekularer E. Fritz 01.02.05 329.493 79.734 

Parameter, die zelluläre und klinische 30.04.08 

Strahlenüberempfindlichkeit verursachen, 

BMU Ringstudie für klinische E. Fritz 01.10.05 87.633 31.104 

Strahlenempfindlichkeit , 31.03.08 

TP: Biomarker 

DFG In vivo functions of CD 44 P. Herrlich 01.09.06 212.000 74.000 

31.08.08 


Forschungsgruppe Falk Weih 

DFG The role of p100 and relB in B lymphopoiesis 01.05.06 86.500 43.000 

30.04.08 

DFG SFB 604:Activation of distinct NF-kB Pathways 01.07.05 263.800 75.700 

31.12.08 


Forschungsgruppe Christoph Englert 

DFG Identifikation und Charakterisierung von C. Englert 01.01.06 73.400 74.350 

Zielgenen des Tumorsuppressors WT1 31.12.06 

während der Gonadenentwicklung 

DFG SFB 604: Eya 1 as a switch between C. Englert 01.07.05 255.000 73.200 

signal transduction and transcription 31.12.08 


Forschungsgruppe Heike Heuer 

19.560 

126.442 

1.152.010 

8.324 

263.800 

American Thyroid Generation and analysis of mice H. Heuer 01.07.05 40.200 19.560 

Association deficient in the thyroid hormone 30.06.06 

transporter MCT8 


55 

329.493

56 


204.700 




in E 

Forschungsgruppe Cornelis Calkhoven 

DFG Translational control of C/EBP expression C. Calkhoven 01.10.06 126.000 17.000 

through metabolic signalling pathways 30.09.08 

and its role in cancer 


Forschungsgruppe Christoph Kaether 

DFG SFB 604: Quality control of C. Kaether 01.03.06 204.700 59.000 

gamma-secretase complex assembly 31.12.08 

in the endoplasmatic reticulum 


Forschungsgruppe Zhao-Qi Wang 

Association The molecular and genetic dissection of Z.Q. Wang 01.02.06 194.200 53.362 

for Interational DNA damage response pathways in 30.09.08 

Cancer Research cellular and mouse models 


Forschungsgruppe Helen Morrison 

18.795 

6.320 

194.200 245.700 

31.104 

8.995 59.000 

DFG SFB 604: Regulation of the tumor H. Morrison 01.07.05 245.700 70.200 

suppressor protein merlin 31.12.08 

Deutsche Krebshilfe Die Rolle von Membran gebundenem H. Morrison 15.06.06 201.600 18.795 

Actin in der Aktivierung von Ras und 14.06.09 

der Lokalisierung dessen Einflussortes auf 

das Tumor hemmende Protein Nf2 

Summe bewilligt: 88.995

Schule für Doktoranden 

Ende des Jahres 2006 konnte die „Leibniz Graduate 

School on Ageing and Age-related Disease“, kurz LGSA, im 

Fritz-Lipmann-Institut etabliert werden. Dies wurde durch 

das erfolgreiche Einwerben öffentlicher Mittel möglich. 

Die LGSA hat im Fritz-Lipmann-Institut zehn Doktoran- 

denstellen, zwei davon sind über Kooperationsverträge an 

die Friedrich-Schiller-Universität angegliedert. Die Gradu- 

iertenschule sichert über ein formalisiertes Auswahlver- 

fahren, ein eigenes Betreuerkomitee, ein Curriculum mit 

mehreren Weiterbildungsangeboten sowie jährlichen 

Zwischenevaluationen die Qualität der Bewerber, ihre 

Ausbildung und deren wissenschaftliche Fortschritte. 

Um sicher zu stellen, dass die Doktoranden stets hoch- 

wertige Forschungsthemen erhalten, werden die Projekte 

in einem Wettbewerb und nach der Begutachtung durch 

ein Auswahlgremium, dem auch externe Wissenschaftler 

angehören, vergeben. 

Die seit 2006 über die LGSA angestellten 

Doktoranden sind: 

Eileen Baum (Friedrich-Schiller-Universität, Professor Witte) 

Anna Bremer (Forschungsgruppe Cornelis Calkhoven) 

Katja Geissler (Forschungsgruppe Helen Morrison) 

Michael Graf (Forschungsgruppe Christoph Englert) 

Ralph Gruber (Forschungsgruppe Zhao-Qi Wang) 

Jessica Meinhardt (Forschungsgruppe Marcus Fändrich) 

Andre Mischo (Forschungsgruppe Matthias Görlach) 

Katja Seider (Forschungsgruppe Heike Heuer) 

Stephanie Stepanow (Forschungsgruppe Matthias Platzer) 

Verena Wolf (Friedrich-Schiller-Universität, Professor Heinzel) 

Ausbildung 

Das für die LGSA entwickelte Curriculum sowie seine 

speziellen Organisations- und Betreuungsstrukturen wur- 

den mittlerweile für alle Doktoranden, die im Fritz-Lip- 

mann-Institut forschen, übernommen, sodass alle Dokto- 

randen des Instituts in einer „FLI-Graduiertenschule“ zu- 

sammengefasst sind. Ende 2006 arbeiteten insgesamt 58 

Doktoranden im Fritz-Lipmann-Institut. 

Die Richtlinien und Prozeduren der Graduiertenschule 

finden Sie (in englischer Sprache) im Annex dieses Be- 

richts. Für weitere Informationen besuchen Sie bitte die 

Internetseiten der Graduiertenschule unter www.fli-leib- 

niz.de/phd. 

Zwischenzeitlich wurde beschlossen, die FLI-Graduier- 

tenschule in eine übergeordnete „Graduate School of Mo- 

lecular Biomedicine“ des Forschungsstandortes Jena ein- 

zubinden. Alle Doktoranden der thematisch beteiligten 

universitären und außeruniversitären Institute haben Ge- 

legenheit, daran teilzunehmen. 

57

58 

Universitäre Lehre 

Vorlesungen, Praktika, Diplom- und Doktorarbeiten 

Die Wissenschaftler des Fritz-Lipmann-Instituts 

beteiligen sich intensiv an der universitären Lehre. Da- 

durch sollen die Altersforschung der Universität Jena un- 

terstützt und Nachwuchswissenschaftler für die Altersfor- 

schung gewonnen werden. Mehrere Forschungsgruppen- 

leiter des FLI sind aufgrund gemeinsamer Berufungen als 

Professoren an der Lehre in der biologisch-pharmazeu- 

tischen sowie der medizinischen Fakultät der Friedrich- 

Schiller-Universität beteiligt. Zusätzlich zu den Lehrveranstaltungen, 

die von den Forschungsgruppenleitern 

angeboten werden, finden im FLI regelmäßig Studentenpraktika 

statt. Jährlich werden 15 bis 20 Diplomarbeiten 

vergeben, unter anderem auch an Studenten der Fachhochschule 

Jena. 

Böhm, K., Monajembashi, S., Grigaravicius, P.: 

Praktikum “Biophysikalische Chemie – Spektroskopische 

Methoden“ 

Diekmann, S.: 

Vorlesung “Molecular Biology I“ 

Ringvorlesung FSU Jena “Struktur und Funktion des menschlichen 

Kinetochors” 

Diekmann, S., Hemmerich, P., Hoischen C.: 

Vorlesung, Seminar “Molecular Biotechnology“ 

Praktikum “Molecular Biotechnology“ 

Englert, C.: 

Vorlesung “Molekulargenetik“ 

Vorlesung “Entwicklungsgenetik“ 

Seminar “Neuere Aspekte der Krebsforschung“ 

Seminar “Genetik des Alterns“ 

Vorlesung „Zur Rolle des Wilms Tumorproteins Wt1 in der 

Organogenese“, in der Reihe „Genetische Forschung in Jena“ 

Fändrich, M.: 

Vorlesung “Biophysik“ (Organisation: W. Pohle) 

Vorlesung “Biophysik“ (Organisation: W. Pohle) 

Fändrich, M., Görlach, M.: 

Vorlesung “Proteinchemie“ 

Glöckner, G.: 

“Plastidengenome“ 

Vorlesung “Molekularbiologie I“ 

„Genomanalyse von Modellorganismen“ 

Görlach, M.: 

Vorlesung „Molecular structural biology“ 

Görlach, M., Ramachandran, R., Ohlenschläger O.: 

Praktikum „NMR-Spektroskopie biologischer Makromoleküle“ 

Praktikum „Biophysikalische Chemie u. Spektroskopie I“ 

Greulich, K.-O.: 

Vorlesung „Einzelmolekültechniken“, in der Reihe “Molekulare 

Biotechnologie“ 

Greulich, K.-O., Glaser, R.: 

Vorlesung “Biophysikalische Chemie und Spektroskopie“ 

Greulich, K.-O., Glaser, R., Schellenberg, P.: 

Vorlesung “Biophysikalische Chemie und Spektroskopie II“

Große, F.: 

Vorlesung “Biochemie II“ 

Vorlesung “Biochemie IV” 

Seminar “Biochemie II“ 

Laborkurs “Biochemie II“ 

Verschiedene Laborkurse für Fortgeschrittene in analytischer 

Biochemie, präparativer Biochemie, Molekularbiologie, 

Zellbiologie 

Hemmerich, P., Hoischen, C.: 

Seminar “Structure and function of the human cell nucleus“ 

Herrlich, P.: 

Vorlesungsreihe LGSA 

Forschungspraktikum “Molekularbiologie“ 

“Genetisches Kolloquium“ 

Heuer, H.: 

Vorlesung „Regulation der Genexpression durch 

Schilddrüsenhormone“, in der Reihe „Genetische Forschung in 

Jena“ 

Seminar „Molekulare Endokrinologie“ 

Seminar „Molekulare Neurobiologie“ 

Seminar im Wahlpflichtfach „Molekulare Medizin“ 

Praktikum im Wahlpflichtfach „Molekulare Medizin“ 

Kaether, C.: 

Seminar „Molekulare Neurobiologie“ 

Vorlesung „Molekularbiologie der Alzheimer Krankheit“, in der 

Reihe „Genetische Forschung in Jena“ 

Ohlenschläger, O.: 

Vorlesung „Basic principles of NMR spectroscopy“ 

Platzer, M.: 

Vorlesung „Subtiles alternatives Spleißen - weit verbreitet beim 

Menschen & anderen Organismen.“, in der Reihe „Genetische 

Forschung in Jena“ 

“Evolution der menschlichen Sprache“ 

„Das Humangenom & seine sich abzeichnende Dynamik“ 

Platzer, M., Glöckner, G.: 

„Moderne Geräte zur DNA-Sequenzierung“ 

“Biochemische Analytik - Teil DNA“ 

Sühnel, J.: 

Vorlesung „3D- Strukturen biologischer Makromoleküle“ 

Vorlesung „Biomoleküle: Datenbanken, Visualisierungen und 

Rechnungen“ 

Tuckermann, J.: 

Seminar „Neuere Aspekte der Krebsforschung“ 

Seminar „Molekulare Endokrinologie“ 

Vorlesung „Glucocorticoids in Health and Disease“, in der Reihe 

„Genetische Forschung in Jena“ 

Praktikum im Wahlpflichtfach „Molekulare Medizin“ 

Praktikum im Wahlpflichtfach „Mikrobiologie“ 

Weih, F.: 

Vorlesung „Immunbiologie I“ 

Vorlesung „Immunbiologie II“ 

Seminar „Aktuelle Aspekte der Immunologie“ 

Seminar „Immunseneszenz“ 

Laborpraktika 

59

60 Weiterbildung 

Vielfältige Qualifizierungsangebote 

Als Forschungsinstitut bildet das FLI in erster Linie 

Wissenschaftler aus, durch Vergabe und Betreuung von 

Praktika, Diplomarbeiten und Doktorarbeiten. Weiterfüh- 

rende Qualifizierungen promovierter Wissenschaftler, bis 

hin zur Habilitation, werden ermöglicht und unterstützt. 

Darüber hinaus werden unter der fachkundigen 

Betreuung von Heike Dittmar, Uta Petz, Maria Voigt und 

Diana Kirchhof im Fritz-Lipmann-Institut Biologielabo- 

ranten (Lehrzeit 3,5 Jahre) und Bürokaufleute (3 Jahre) 

ausgebildet. 

Im Jahr 2006 beschäftigte das FLI sechs 

Auszubildende: 

Roland Klimitsch, Biologielaborant 

Nicole Hartenstein, Biologielaborantin 

Katja Brückner, Bürokauffrau 

Christin Hahn, Biologielaborantin 

Ronald Schmidt, Biologielaborant 

Nancy Peisker, Bürokauffrau 

Angesichts der zunehmenden Internationalisierung der 

Forschung ist die Möglichkeit der sprachlichen Weiterbil- 

dung für die Mitarbeiter von großem Interesse. Der Be- 

triebsrat organisiert Deutsch- und Englischkurse, an denen 

die Mitarbeiter des Fritz-Lipmann-Instituts teilnehmen 

können, um ihre Sprachkompetenz zu steigern. Diese 

Sprachkurse werden von externen Fachkräfte abgehalten; 

weitere interne Sprachkurse finden im Rahmen kleinerer 

Gruppen statt.

Impressum Bildnachweis 

Herausgeber: 

Leibniz-Institut für Altersforschung - Fritz-Lipmann-Institut e.V. (FLI) 

Beutenbergstraße 11 

07745 Jena 

www.fli-leibniz.de 

Verantwortlich: 


Forschungskoordinator 

Redaktion: 

Claudia Eberhard-Metzger 

www.eberhard-metzger.de 

Korrektorat: 

Mitarbeiter des FLI, 

Insbesondere Oliver Ohlenschläger, Heidrun Lekscha, 

Sylvia Hein, Gundula Bergner 

Gestaltung: 

Herbert Thum 

Viskon Kommunikation & Design 

www.viskon.de 

Druck: 

Nino Druck GmbH; Neustadt/Weinstraße 

Die wissenschaftlichen Abbildungen wurden – soweit nicht anders 

vermerkt - von den Mitarbeitern des Fritz-Lipmann-Instituts zur 

Verfügung gestellt. 

Bilder von Personen, des Instituts und des Campus stammen von 

Gerhard Müller (FLI), Rolf Hühne (FLI), Peter Scheere (FSU) und 

Eckhardt Hoenig (IPHT / Beutenberg Campus). 

Die Graphiken und das Titelbild wurden von Herbert Thum erstellt. 

Der Herausgeber hat sich um die Einholung der nötigen Bildrechte mit 

allen Mitteln bemüht; wo das nicht möglich war, bitten wir eventuelle 

Rechtsinhaber, sich mit den Verantwortlichen in Verbindung zu setzen. 

Seite 4: Birgitta Kowsky 

Seite 17: Birgitta Kowsky 

Seite 36 links: M. J. Grimson & R. L. Blanton 

61

6 Annex 

The FLI Graduate School Procedures 

current version, October 2007 

Selection of PhD Students 

1. All PhD student candidates are interviewed and selected 

by the PhD recruitment committee, irrespective of the 

source of financial support (FLI budget or grant). Prefer- 

ably, the candidate starts the interview with a brief pre- 

sentation (10 min). 

2. The recruitment committee consists of six elected 

group leaders (3 senior, 3 junior group leaders). Prospec- 

tive thesis supervisors are not present. 

3. Interviews for the selection of PhD candidates are sche- 

duled twice per year, in May and in October. At least three 

members of the interviewing committee have to be pre- 

sent at these meetings. As an exception, additional inter- 

view dates may be scheduled. 

4. In general, PhD students are allotted to a project/re- 

search based on their declared project preferences, provi- 

ded acceptance by the group leader. 

PhD contracts 

PhD students receive initially a one-year contract which 

reminds the thesis committee to meet within the first 

year. The contract can be extended to three years with the 

possibility of an additional one-year extension, provided 

that a written positive statement from the PhD commit- 

tee supports the extensions. 

Supervisory committee for PhD students 

The PhD student and his/her supervisor select a PhD com- 

mittee within the first 8 weeks after start of the contract. 

The PhD committee consists of the supervisor plus two 

group leaders or senior postdocs outside the group of the 

supervisor. Preferably, at least one committee member 

comes from another institute. 

The committee monitors the quality and progress of the 

PhD project; the committee‘s task is to advise and help 

the PhD student, to ascertain success and sort out even- 

tually occurring disagreements. The committee can be 

contacted whenever appropriate. The first meeting 

should take place within three months after beginning of 

the project, followed by - at least - annual meetings. For 

these subsequent meetings, the PhD student fills in an 

evaluation form and prepares a brief report (approxima- 

tely 2 pages) on the progress of his/her work and future 

plans. The meetings have to be announced to the LGSA 

coordinator. A signed copy of the evaluation form and the 

written report must be forwarded. It is the responsibility 

of the PhD student to call in PhD committee meetings. 

PhD students‘ organisation 

The PhD students at the FLI elect a speaker and a co-spea- 

ker as their representatives. The PhD students also elect a 

Dean of PhD students from the pool of FLI group leaders. 

The Dean serves as a contact person for organization, per- 

sonal problems and any matter that the supervisory com- 

mittee cannot solve.

Objectives to be achieved 

The goal of a successful PhD study is to publish at least 

one first-author paper in an international peer-reviewed 

journal. At the end of the study a written thesis, an exam 

and a successful thesis defence qualify for a Ph.D. (Dr. rer. 

nat.) degree at the Friedrich Schiller University in Jena. 

Students have the choice to receive their doctoral degree 

also from another university. 

The Graduate School Courses 

Participation in a number of activities and courses is obli- 

gatory. The current program is listed below. The detailed 

program is available on the home page and will be upda- 

ted regularly. 

1. Lecture series, to be held by all group leaders (also open 

for all interested and to be announced at the FSU). The to- 

pic of the lecture will be related to the FLI research focus, 

covering for instance cellular senescence, animal models 

of ageing, age-relate diseases. Lectures will be monthly, 

on Monday 9.00 in the Abbe Centre. Explore the website 

for any changes. 

2. Thursday seminar series of external speakers. The talks 

will be scheduled at 1pm followed by a one-hour meeting 

with the PhD students, ‚beer and bretzels‘ will be provi- 

ded. Prior to the talk and after the meeting with the PhD 

students, the program is up to the scientist who invited 

the guest. 

3. Fritz Lipmann lectures are a series of presentations by 

internationally renowned speakers, held a few times a 

year. The lectures are held at the Abbe Centre followed by 

a ‚Happy Hour‘. 

Students are encouraged to invite and take care of speakers 

for the lecture series under #2 or #3. The student represen- 

tatives will be equipped with a budget for this purpose. 

4. The FLI work-in-progress seminar (currently on Tues- 

days, 11.30) is obligatory for students, postdocs and senior 

scientists alike. 

5. Journal club. Students have to attend one of the already 

existing or to be established journal clubs. Information will 

be available on the FLI website. As a rule, each student has 

to analyse and present two scientific articles a year. 

6. FLI retreat. Participation in the annual institute‘s retreat 

with a poster presentation is also obligatory. 

7. Meetings. Students should attend at least one internati- 

onal recognized meeting per year to get in contact with 

the community of scientists. 

8. A Soft-skill training program will be organized in colla- 

boration with neighbouring graduate schools. Current of- 

fers will be advertised on the home page. 

9. Language courses. The FLI will provide the opportunity 

to learn German and English language. For courses please 

check our home page. 

63

64 Dachzeile links

Zahlen und Fakten - Leibniz Institute for Age Research

Erfolgreiche ePaper selbst erstellen

Template löschen?

Als Template speichern?