BAHAN GENETIK SITOPLASMA
bahan genetik sitoplasmik
bahan genetik sitoplasmik
- No tags were found...
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
<strong>BAHAN</strong> <strong>GENETIK</strong> <strong>SITOPLASMA</strong><br />
Bahan genetik<br />
Kromosom<br />
Ekstrakromosom<br />
Prokaryot:<br />
Plasmid<br />
Bahan genetik<br />
ekstrakromosom<br />
Eukaryot:<br />
Mitokondria<br />
Kloroplast<br />
Bahan genetik<br />
sitoplasma
Sel<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Asal-usul Eukaryot<br />
•Endosimbiosis antara prokaryot anaerobi (mitokondria/ kloroplast) dan<br />
prokaryot aerobi
Proses evolusi organel<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Makanan dan pemanenan<br />
energi<br />
Katabolisme:<br />
3 tahap dari makanan ke<br />
limbah<br />
1.Pemecahan molekul besar<br />
menjadi subunit yang lebih<br />
kecil saluran pencernaan<br />
2. Pemecahan subunit kecil<br />
menjadi asetil Co-A (+ATP,<br />
NADH) glikolisis di dalam<br />
sel (sitoplasma)<br />
3.Oksidasi asetil Co-A menjadi<br />
H 2 O dan CO 2 (+ATP) <br />
siklus asam sitrat dan<br />
transport elektron di dalam<br />
mitokondria
Glikolisis<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Sitosol<br />
Mitokondria
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Pemrosesan molekul di dalam mitokondria<br />
Sitosol
Fosforilasi oksidatif<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Mitokondria<br />
Kesamaan dengan prokaryot<br />
1. Bentuk dan ukuran<br />
2. DNA: sirkuler (walaupun tidak semuanya)<br />
3. Sintesis protein:<br />
-Ribosom 70s<br />
-Inhibitor (antibiotik)<br />
4. Reproduksi: pembelahan biner<br />
5. Respirasi<br />
Pelomyxa palustris: di dalam sitoplasma terdapat bakteri<br />
aerobi untuk melakukan metabolisme oksidatif<br />
Leluhur mitokondria sama dengan bakteri
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Proses biosintesis protein di dalam sel<br />
Sitosol
Biosintesis protein mitokondria dan kloroplast<br />
α-amanitin<br />
DNA<br />
RNA<br />
RNA<br />
Cycloheximide<br />
Inti sel<br />
Protein prekursor<br />
DNA<br />
Kloroplast/Mitokondria<br />
RNA<br />
Protein<br />
Etidium/Acridine<br />
Kloramfenikol, Eritromisin,<br />
Tetrasiklin<br />
Situs aksi inhibitor<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Biosintesis polipeptida di mitokondria<br />
Sitosol
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Kompleks polipeptida yang penting<br />
Membran dalam<br />
1. NADH-CoQ reductase<br />
CoQ = Coenzim Q = ubiquinon<br />
2. Succinate-CoQ reductase<br />
3. Cytochrome c reductase<br />
4. Cytochrome oxidase<br />
5. Fo ATP synthetase (5 (khamir) s/d 9 subunit (sapi))<br />
Matriks<br />
F1 ATP synthetase<br />
-5 polipeptida (α3, β3, γ, δ, ε)<br />
-Situs penempelan nukleotida (pada β, atau antara α dan β)<br />
-Situs penempelan MgATP, Mg2+, Pi<br />
1, 3, 4, 5 terlibat dalam translokasi proton
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Gen yang ada di mitokondria<br />
Penyandi Tanaman Khamir<br />
RNA stabil<br />
rRNA 26s, 18s, 5s (semua) 21s, 15s (semua)<br />
tRNA 30 (semua) 30 (semua)<br />
Protein<br />
NADH dehidrogenase<br />
ATP sintetase<br />
(10 subunit)<br />
Cytochrome c oxidase<br />
(9 subunit)<br />
Ubiquinol cytochrome<br />
c reductase<br />
(Cytochrome b/c1)<br />
(9 subunit)<br />
Protein ribosomal<br />
Kloroplast<br />
subunit 1 (nadh1)<br />
subunit 2 s/d 7 (?)<br />
subunit a (atpA)<br />
subunit 6 (atp6)<br />
subunit 9 (atp9)<br />
subunit I (coxI)<br />
subunit II (coxII)<br />
subunit III (coxIII)<br />
cytochrome b (cob)<br />
1 protein subunit kecil<br />
jagung: 16 rRNA,<br />
tRNA, LSU rubisco<br />
?<br />
subunit 6 (atp6) subunit 8<br />
(atp8)<br />
subunit 9 (atp9)<br />
subunit I (coxI)<br />
subunit II (coxII)<br />
subunit III (coxIII)<br />
Apocytochrome b<br />
33 protein subunit kecil<br />
38 protein subunit besar<br />
-
Protein di mitokondria yang disandi gen yang ada di inti<br />
Lokasi di mitokondria<br />
Matriks<br />
Membran dalam<br />
Ruang antar membran<br />
Membran luar<br />
Polipeptida<br />
F1 ATPase: sub unit α (kecuali tanaman), β, γ<br />
Carbamyl phosphate synthetase<br />
Mn2+-superoxyde dismutase<br />
RNA polymerase<br />
Protein ribosom<br />
Citrat synthetase & enzim-enzim siklus asam sitrat<br />
Ornithine transcarbamylase<br />
Cytochrome c1<br />
Sub unit V cytochrome b/c1<br />
Transporter ADP-ATP<br />
Cytochrome c oxydase: su IV, V, VI, VII<br />
Proteolipid kompleks Fo-ATPase<br />
Cytochrome c<br />
Cytochrome c peroxydase<br />
Cytochrome b2<br />
Porin<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Pewarisan sifat yang disandi oleh gen mitokondria<br />
- Tidak mengikuti hukum Mendel (non<br />
mendelian inheritance)<br />
- Melalui sitoplasma<br />
- Uniparental (umumnya)<br />
- Melalui induk betina (maternal<br />
inheritance) misalnya: tanaman CMS<br />
- Khusus khamir (yeast): biparental,<br />
misalnya: perkawinan khamir normal<br />
x “petite”
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Siklus hidup khamir (Saccharomyces cerevisiae)<br />
n<br />
n<br />
Mitosis<br />
n<br />
Sel vegetatif a<br />
2n<br />
Sel vegetatif<br />
diploid<br />
Sporulasi<br />
(kekurangan N)<br />
n<br />
Mitosis<br />
Sel vegetatif α<br />
2n<br />
Spora<br />
Spora a<br />
n<br />
Meiosis n Spora α<br />
n<br />
n<br />
n<br />
n<br />
Askus
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Pewarisan bahan sitoplasma pada khamir<br />
A (haploid)<br />
B (haploid)<br />
Mt normal<br />
Zigot diploid<br />
Mt petite<br />
Meiosis
Mitokondria didistribusikan<br />
secara acak kepada sel<br />
anak<br />
Mitosis<br />
Mitosis<br />
Mitosis<br />
Normal Normal Normal Petite<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Mutan petite<br />
• B. Ephrussi (1940)<br />
• Pertumbuhan lambat, koloni kecil (petite)<br />
• Tidak mampu melakukan fosforilasi oksidatif<br />
• Energi diperoleh dari fermentasi glukosa menjadi etanol<br />
• Mutasi terjadi pada DNA inti (pet) menghasilkan petite<br />
nuklir (inti) atau pada DNA mitokondria (rho - atau ρ - )<br />
• Pewarisan pet mengikuti hukum mendel, pewarisan ρ -<br />
tidak mengikuti hukum mendel
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Pewarisan sifat petite<br />
pet<br />
+<br />
ρ - ρ+<br />
ρ- ρ +<br />
+ ρ +<br />
pet<br />
ρ - ρ +<br />
ρ -<br />
pet<br />
pet<br />
+ + ρ + ρ + ρ + ρ + ρ - ρ - ρ - ρ -<br />
Petite nuklir Petite netral Petite supresif<br />
Segregasi Mendelian<br />
2 mutan : 2 liar<br />
Segregasi non-mendelian<br />
4 liar : 0 mutan<br />
Segregasi non-mendelian<br />
0 liar : 4 mutan<br />
Hipotesis:<br />
1. Petite netral kehilangan sebagian besar mtDNA, sedangkan petite<br />
supresif mengalami perubahan (atau kehilangan) sedikit mtDNA.<br />
2. Replikasi mtDNA petite supresif lebih cepat daripada tipe liar sehingga<br />
pembelahan mitokondria petite supresif juga lebih cepat.
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Mitokondria manusia<br />
Utas L :8tRNA<br />
Utas H :<br />
•rRNA (12s, 16s)<br />
•14 tRNA<br />
•11mRNA (SU I, II, III Cyt c oxidase ;SU 6 F1-ATPase;7SU<br />
NADH-CoQ reduktase dan Cyt b)<br />
•2 situs inisiasi transkripsi<br />
•Transkrip I: sbl tRNA Phe - stl rRNA 16s<br />
•Transkrip II: rRNA 12s - seluruh mtDNA<br />
•Transkrip I 10x> transkrip II rRNA sangat banyak
Importasi protein ke mitokondria (organel)<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Peptida signal<br />
Linier<br />
Transportasi protein ke ruang antar membran<br />
Pemotongan protein<br />
di ruang antar membran<br />
Heliks α
Importasi protein ke dalam kloroplast<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />
Kloroplast<br />
Klorofil
Suharsono. 2005. BTK505. IPB
Perbandingan mitokondria dan kloroplas dalam sintesis ATP<br />
Suharsono. 2005. BTK505. IPB