28.09.2015 Views

BAHAN GENETIK SITOPLASMA

bahan genetik sitoplasmik

bahan genetik sitoplasmik

SHOW MORE
SHOW LESS
  • No tags were found...

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

<strong>BAHAN</strong> <strong>GENETIK</strong> <strong>SITOPLASMA</strong><br />

Bahan genetik<br />

Kromosom<br />

Ekstrakromosom<br />

Prokaryot:<br />

Plasmid<br />

Bahan genetik<br />

ekstrakromosom<br />

Eukaryot:<br />

Mitokondria<br />

Kloroplast<br />

Bahan genetik<br />

sitoplasma


Sel<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Asal-usul Eukaryot<br />

•Endosimbiosis antara prokaryot anaerobi (mitokondria/ kloroplast) dan<br />

prokaryot aerobi


Proses evolusi organel<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Makanan dan pemanenan<br />

energi<br />

Katabolisme:<br />

3 tahap dari makanan ke<br />

limbah<br />

1.Pemecahan molekul besar<br />

menjadi subunit yang lebih<br />

kecil saluran pencernaan<br />

2. Pemecahan subunit kecil<br />

menjadi asetil Co-A (+ATP,<br />

NADH) glikolisis di dalam<br />

sel (sitoplasma)<br />

3.Oksidasi asetil Co-A menjadi<br />

H 2 O dan CO 2 (+ATP) <br />

siklus asam sitrat dan<br />

transport elektron di dalam<br />

mitokondria


Glikolisis<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Sitosol<br />

Mitokondria


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Pemrosesan molekul di dalam mitokondria<br />

Sitosol


Fosforilasi oksidatif<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Mitokondria<br />

Kesamaan dengan prokaryot<br />

1. Bentuk dan ukuran<br />

2. DNA: sirkuler (walaupun tidak semuanya)<br />

3. Sintesis protein:<br />

-Ribosom 70s<br />

-Inhibitor (antibiotik)<br />

4. Reproduksi: pembelahan biner<br />

5. Respirasi<br />

Pelomyxa palustris: di dalam sitoplasma terdapat bakteri<br />

aerobi untuk melakukan metabolisme oksidatif<br />

Leluhur mitokondria sama dengan bakteri


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Proses biosintesis protein di dalam sel<br />

Sitosol


Biosintesis protein mitokondria dan kloroplast<br />

α-amanitin<br />

DNA<br />

RNA<br />

RNA<br />

Cycloheximide<br />

Inti sel<br />

Protein prekursor<br />

DNA<br />

Kloroplast/Mitokondria<br />

RNA<br />

Protein<br />

Etidium/Acridine<br />

Kloramfenikol, Eritromisin,<br />

Tetrasiklin<br />

Situs aksi inhibitor<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Biosintesis polipeptida di mitokondria<br />

Sitosol


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Kompleks polipeptida yang penting<br />

Membran dalam<br />

1. NADH-CoQ reductase<br />

CoQ = Coenzim Q = ubiquinon<br />

2. Succinate-CoQ reductase<br />

3. Cytochrome c reductase<br />

4. Cytochrome oxidase<br />

5. Fo ATP synthetase (5 (khamir) s/d 9 subunit (sapi))<br />

Matriks<br />

F1 ATP synthetase<br />

-5 polipeptida (α3, β3, γ, δ, ε)<br />

-Situs penempelan nukleotida (pada β, atau antara α dan β)<br />

-Situs penempelan MgATP, Mg2+, Pi<br />

1, 3, 4, 5 terlibat dalam translokasi proton


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Gen yang ada di mitokondria<br />

Penyandi Tanaman Khamir<br />

RNA stabil<br />

rRNA 26s, 18s, 5s (semua) 21s, 15s (semua)<br />

tRNA 30 (semua) 30 (semua)<br />

Protein<br />

NADH dehidrogenase<br />

ATP sintetase<br />

(10 subunit)<br />

Cytochrome c oxidase<br />

(9 subunit)<br />

Ubiquinol cytochrome<br />

c reductase<br />

(Cytochrome b/c1)<br />

(9 subunit)<br />

Protein ribosomal<br />

Kloroplast<br />

subunit 1 (nadh1)<br />

subunit 2 s/d 7 (?)<br />

subunit a (atpA)<br />

subunit 6 (atp6)<br />

subunit 9 (atp9)<br />

subunit I (coxI)<br />

subunit II (coxII)<br />

subunit III (coxIII)<br />

cytochrome b (cob)<br />

1 protein subunit kecil<br />

jagung: 16 rRNA,<br />

tRNA, LSU rubisco<br />

?<br />

subunit 6 (atp6) subunit 8<br />

(atp8)<br />

subunit 9 (atp9)<br />

subunit I (coxI)<br />

subunit II (coxII)<br />

subunit III (coxIII)<br />

Apocytochrome b<br />

33 protein subunit kecil<br />

38 protein subunit besar<br />

-


Protein di mitokondria yang disandi gen yang ada di inti<br />

Lokasi di mitokondria<br />

Matriks<br />

Membran dalam<br />

Ruang antar membran<br />

Membran luar<br />

Polipeptida<br />

F1 ATPase: sub unit α (kecuali tanaman), β, γ<br />

Carbamyl phosphate synthetase<br />

Mn2+-superoxyde dismutase<br />

RNA polymerase<br />

Protein ribosom<br />

Citrat synthetase & enzim-enzim siklus asam sitrat<br />

Ornithine transcarbamylase<br />

Cytochrome c1<br />

Sub unit V cytochrome b/c1<br />

Transporter ADP-ATP<br />

Cytochrome c oxydase: su IV, V, VI, VII<br />

Proteolipid kompleks Fo-ATPase<br />

Cytochrome c<br />

Cytochrome c peroxydase<br />

Cytochrome b2<br />

Porin<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Pewarisan sifat yang disandi oleh gen mitokondria<br />

- Tidak mengikuti hukum Mendel (non<br />

mendelian inheritance)<br />

- Melalui sitoplasma<br />

- Uniparental (umumnya)<br />

- Melalui induk betina (maternal<br />

inheritance) misalnya: tanaman CMS<br />

- Khusus khamir (yeast): biparental,<br />

misalnya: perkawinan khamir normal<br />

x “petite”


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Siklus hidup khamir (Saccharomyces cerevisiae)<br />

n<br />

n<br />

Mitosis<br />

n<br />

Sel vegetatif a<br />

2n<br />

Sel vegetatif<br />

diploid<br />

Sporulasi<br />

(kekurangan N)<br />

n<br />

Mitosis<br />

Sel vegetatif α<br />

2n<br />

Spora<br />

Spora a<br />

n<br />

Meiosis n Spora α<br />

n<br />

n<br />

n<br />

n<br />

Askus


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Pewarisan bahan sitoplasma pada khamir<br />

A (haploid)<br />

B (haploid)<br />

Mt normal<br />

Zigot diploid<br />

Mt petite<br />

Meiosis


Mitokondria didistribusikan<br />

secara acak kepada sel<br />

anak<br />

Mitosis<br />

Mitosis<br />

Mitosis<br />

Normal Normal Normal Petite<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Mutan petite<br />

• B. Ephrussi (1940)<br />

• Pertumbuhan lambat, koloni kecil (petite)<br />

• Tidak mampu melakukan fosforilasi oksidatif<br />

• Energi diperoleh dari fermentasi glukosa menjadi etanol<br />

• Mutasi terjadi pada DNA inti (pet) menghasilkan petite<br />

nuklir (inti) atau pada DNA mitokondria (rho - atau ρ - )<br />

• Pewarisan pet mengikuti hukum mendel, pewarisan ρ -<br />

tidak mengikuti hukum mendel


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Pewarisan sifat petite<br />

pet<br />

+<br />

ρ - ρ+<br />

ρ- ρ +<br />

+ ρ +<br />

pet<br />

ρ - ρ +<br />

ρ -<br />

pet<br />

pet<br />

+ + ρ + ρ + ρ + ρ + ρ - ρ - ρ - ρ -<br />

Petite nuklir Petite netral Petite supresif<br />

Segregasi Mendelian<br />

2 mutan : 2 liar<br />

Segregasi non-mendelian<br />

4 liar : 0 mutan<br />

Segregasi non-mendelian<br />

0 liar : 4 mutan<br />

Hipotesis:<br />

1. Petite netral kehilangan sebagian besar mtDNA, sedangkan petite<br />

supresif mengalami perubahan (atau kehilangan) sedikit mtDNA.<br />

2. Replikasi mtDNA petite supresif lebih cepat daripada tipe liar sehingga<br />

pembelahan mitokondria petite supresif juga lebih cepat.


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Mitokondria manusia<br />

Utas L :8tRNA<br />

Utas H :<br />

•rRNA (12s, 16s)<br />

•14 tRNA<br />

•11mRNA (SU I, II, III Cyt c oxidase ;SU 6 F1-ATPase;7SU<br />

NADH-CoQ reduktase dan Cyt b)<br />

•2 situs inisiasi transkripsi<br />

•Transkrip I: sbl tRNA Phe - stl rRNA 16s<br />

•Transkrip II: rRNA 12s - seluruh mtDNA<br />

•Transkrip I 10x> transkrip II rRNA sangat banyak


Importasi protein ke mitokondria (organel)<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Peptida signal<br />

Linier<br />

Transportasi protein ke ruang antar membran<br />

Pemotongan protein<br />

di ruang antar membran<br />

Heliks α


Importasi protein ke dalam kloroplast<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Suharsono. 2005. BTK505. IPB<br />

Kloroplast<br />

Klorofil


Suharsono. 2005. BTK505. IPB


Perbandingan mitokondria dan kloroplas dalam sintesis ATP<br />

Suharsono. 2005. BTK505. IPB

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!