Temario - UNAM

Genética de poblacionesCurso Optativo, Facultad de CienciasJaime Gasca y Enrique ScheinvarLa evolución es el cambio de las frecuencias alélicas en las poblaciones, de ahí que la genética de poblaciones se encarga deanalizar las bases de la evolución mediante la construcción de modelos matemáticos fundamentados en el análisis de lasadecuaciones y frecuencias alélicas y genotípicas de las poblaciones biológicas.El objetivo principal del curso es que puedas entender y aplicar los principios básicos de la genética de poblaciones y de laevolución molecular, desde sus bases clásicas hasta los desarrollos más recientes revisando tanto la teoría como los patronesempíricos, de forma que al final del curso seas capaz de hacerte preguntas en términos evolutivos y poseas la herramientas básicaspara contestarlas.El curso esta dirigido a estudiantes de la carrera de biología interesados en conocer con cierto detalle la teoría básica de la Genéticade Poblaciones, ya sea con objetivos ecológicos, evolutivos, taxonómicos, médicos, fisiológicos, moleculares, etc. Los alumnosdeben de tener conocimientos básicos de evolución a nivel licenciatura avanzada y facilidad para el pensamiento abstracto.La dinámica del curso será de manera teórico-práctica mediante la explicación en pizarrón de los modelos teóricos y conceptosbásicos de genética de poblaciones, realización de ejercicios que nos ayudarán a comprender sus derivaciones, discusión de variosartículos científicos en los se ejemplifica su uso y se abordan temas de actualidad y realización de prácticas y simulaciones en losque conoceremos algunos de los programas de cómputo que nos ayudarán a realizar pequeños análisis.La evaluación se realizará con los siguiente elementos: examenes, trabajo semestral, ensayos de lecturas, tareas y ejercicios,exposición de cuando menos un artículo (lecturas), discusión, participación y entrega de prácticas. Los alumnos deben de entregartodos los problemas y presentar todos los exámenes para aprobar el curso. El trabajo semestral consistirá en un trabajo de revisióno de análisis de datos relacionados a los temas del programa, breve pero de calidad, original y creativo, y en formato de un artículode revista, y se expondrá de manera breve frente al grupo.La calificación final será la suma de los siguiente componentes:15% Examenes15% Practicas-examen25% Tareas y ejercicios15% Discusión y participación15% Ensayos de lecturas15% Trabajo semestralIntroducción a la genética de poblaciones (6 hrs)a) Objetivos y metas de las genética de poblaciones.b) Breve historia de la genética de poblaciones y de la evolución molecular.c) Repaso de conceptos básicosLa lucha por medir la variación en las poblaciones naturales (6 hrs)a) Qué es y cómo estudiarlab) Variación morfológica y aloezimasc) Variación a nivel molecular y patronesd) Medidas de variación y distancia genéticasLas poblaciones en equilibrio (6 hrs)a) La ley del equilibrio de Hardy-Weinberg para un locus, dos alelosb) Complicaciones a Hardy-Weinberg: Diferencias entre sexos, genes ligados al sexo y más de dos alelos.c) El problema de la estimación empírica de las frecuencias alélicas.La selección natural (8 hrs)a) Seleccion senu Darwinb) El modelo básico de selección.c) Diferentes tipos de selección natural.d) Complicaciones al modelo básico: genes ligados al sexo y alelos múltiples.e) Selección en viabilidad.f) Selección sexual y apareamiento clasificado negativo (negative assortative mating).g) Selección gamética y alelos de incompatibilidad.

h) El problema de estimar la intensidad de la selección en el campo.i) Modelos ecológicos, variación espacial y temporal y selección dependiente de la frecuencia.La endogamia (6 hrs)a) Concepto y efectosb) Modelos básicos: autofertilización total y parcial.d) Estimación del coeficiente de endogamia.f) La endogamia en las poblaciones naturales.g) Endogamia y selección.h) “Kin selection”.i) Reproducción asexual.La deriva génica y el tamaño efectivo de las poblaciones (6 hrs)a) Aproximación generalb) El tamaño efectivo de las poblaciones, definiciones y métodos para su estimación.c) Efecto de fundador y cuellos de botella.d) Deriva génica y selección natural.El flujo génico y la estructura de las poblaciones (8 hrs)a) Aproximación generala) El modelo continente-islas de flujo génico y modelo general.b) El efecto Wahlund.c) Estimaciones directas e indirectas de flujo génicod) Flujo génico y selección.e) Flujo génico y deriva.La mutación (6 hrs)a) Definición y tipos.b) Medidas de mutación.b) Modelos de mutación: basicos, alelo infinitos, sitios infinitos, sitios finitos y step-wisec) Mutación y selección.d) Mutación y deriva.e) El problema de la estimación de las tasas de mutaciónDesequilibrio de ligamiento (6 hrs)a) Toría básica y métodos de estimaciónb) Relación con las fuerzas evolutivas.c) Desequilibrio y selección.d) Hitchiking, recombinación, sexualidad, “Muller ratchet”, y selección de fondo.Introducción a la evolución molecular (4 hrs)a) La teoría neutra de la evolución molecular.b) Estimación del número de substituciones y tasas de substitución.c) Relojes moleculares y pruebas de reloj.Genética de poblaciones molecular (12 hrs)a) Estimación de variación genética a nivel molecular.b) Pruebas de neutralidad-selección (Tajima, Ewens-Watterson, HKA y MK)c) Coalescente básico: Modelo Wright-fisher para una población en equilibriod) Colaescencia y mutación, Coalescencia y flujoe) Inferencia demográficaf) Filogeografíag) Filogenia

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