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$extracción de nitrógeno $n$, crecimiento y determinación de l...$

Figura 24: Puentes de hidrógeno de la DM de 4 ns en Desmond…………………….43Figura 25: Complejo proteína/micela con 1,2 ns de DM en NAMD…………………..44Figura 26: RMSD de la proteína y micela después de 1,2 ns de DM en NAMD……45Figura 27: Puentes de hidrógeno de la DM de 1,2 ns en NAMD……………………..45Figura 28: Energías de interacción entre la proteína Sav1866 y la micela dedetergente C 12 E 8 en 1,2 ns de DM …………………………………….……46Figura 29: RMSD de la proteína y micela a 4 ns de DM en NAMD…………………..47Figura 30: Energías de interacción entre la proteína Sav1866 y la micela dedetergente C 12 E 8 a 4 ns de DM……………………………………………....47Figura 31: Puentes de hidrógeno de la DM de 4 ns en NAMD…………………….….48Figura 32: Estado intermedio de la DM con aumento de temperatura ensolución a 560 °K……………………………………………………………....49Figura 33: Estado intermedio de la DM con aumento de temperatura ensolución a 570 °K……………………………………………………………....49Figura 34: RMSD proteína con aumento de temperatura en solución……………….50Figura 35: Energía interacción entre la proteína Sav1866 y la micela dedetergente C 12 E 8 en solución con aumento de temperatura………………50Figura 36: Puentes de hidrógeno en la proteína Sav1866 con aumentode temperatura en solución……………...……………………………..……..51Figura 37: Puentes de hidrógeno entre la proteína Sav1866 y la micelade detergente C 12 E 8 con aumento de temperatura en solución….…..…..51Figura 38: Gráfico de selección de los residuos básicos para la fase gaseosa….….53Figura 39: Proteína Sav1866 con residuos cargados seleccionados…………...…....55Figura 40: Estados de la DM del complejo Sav1866/C 12 E 8 con aumentode temperatura en la fase gaseosa……………………………………….….57Figura 41: RMSD de la proteína Sav1866 en la fase gaseosa…………………….….57Figura 42: Energía de interacción entre la proteína Sav1866 y la micela de……………detergente C 12 E 8 en la fase gaseosa…………………………………….…58Figura 43: Puentes de hidrógeno en la proteína Sav1866 en la fase gaseosa….….58Figura 44: Puentes de hidrógeno entre la proteína Sav1866 y la micelade detergente C 12 E 8 en la fase gaseosa…………….……………………...59
ÍNDICE DE TABLASTabla 1: Propiedades estructurales del complejo proteína/micela en unasimulación de DM……………………………………………………………….26Tabla 2: Métodos de optimización geométrica para el detergente en estudio........ 31Tabla 3: Residuos básicos seleccionados de la cadena B…………………………...53Tabla 4: Residuos básicos seleccionados de la cadena C…………………………...54Tabla 5: Porcentaje de estructuras secundarias de alfa hélices de la proteínaen diferentes estados moleculares………………………..…………………...60
Page 2 and 3: 6.1 Objetivos Generales............

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