HHV-6 - Epublications - Université de Limoges

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1. Caractéristiques du virus 1.1. Virion Comme tous les herpèsvirus, le virion d’HHV-6 est composé de 4 éléments structuraux présentés sur la Figure 1 (Roizman et Pellet, 2001) : le core qui contient l’acide nucléique, la capside, le tégument et l’enveloppe. a. b. Figure 1 : Structure du virion des herpèsvirus a. Photographie en microscopie électronique (http://web.uct.ac.za/depts/mmi/stannard/herpes.html) b. Représentation schématique (http://www.medecinapreventiva.com.ve/ariculos/imagenes) Les virions enveloppés d’HHV-6 mesurent de 160 à 200 nm de diamètre et les nucléocapsides nues 90-110 nm. La capside d’HHV-6 présente une symétrie icosaédrique et contient 162 capsomères. Elle renferme le core qui a un diamètre d’environ 60 nm. Dans le cytoplasme, les capsides sont entourées par un tégument de 20 à 40 nm d’épaisseur. Le tégument correspond donc à l’espace compris entre la capside et l’enveloppe ; il présente une distribution asymétrique et est constitué d’une couche fibreuse de phosphoprotéines et d’enzymes nécessaires à l’initiation de la réplication. L’enveloppe virale d’HHV-6 dérive quant à elle des membranes cellulaires et est un double feuillet lipidique contenant de très nombreuses spicules de glycoprotéines virales relativement courtes (Pellet et Black, 1996). Spicules Enveloppe Acide nucléique Nucléocapside Tégument 24
1.2. Génome Les génomes d’HHV-6A souche U1102, HHV-6B souches Z29 et HST ont entièrement été séquencés (Gompels et al., 1995 ; Dominguez et al., 1999 ; Isegawa et al., 1999) et sont composés d’une molécule d’ADN bicaténaire linéaire respectivement de 159321 pb, 162114 pb et 161573 pb. L’architecture génomique d’HHV-6 (comme celle d’HHV-7) est unique parmi les herpèsvirus humains et ressemble à celle du virus du poisson chat (channel catfish virus). Elle inclut une région unique (U) de 143-144 kb bordée par des répétitions terminales directes (DR) de 8-9 kb (Figure 2). Le rôle des DR reste mal connu, mais elles semblent impliquées dans la circularisation du génome au cours de la réplication. En effet, les DR comportent des séquences pac-1 et pac-2, signaux de clivage-empaquetage de l’ADN. De plus les DR contiennent des réitérations de l’hexanucléotide GGGTTA, séquences similaires aux télomères humains (Gompels et al., 1995). Il est possible que ces réitérations participent à la réplication du virus, à l’intégration du génome viral au sein de la cellule hôte, ainsi qu’au maintien de la latence d’HHV-6 (Gompels et al., 1995 ; Torelli et al., 1995 ; Daibata et al., 1999). En plus des répétitions terminales, trois ensembles majeurs de réitérations existent. Ces répétitions sont localisées à l’extrémité droite du segment U et sont désignées R1, R2 et R3 (Gompels et al, 1995). R1 est composée de réitérations qui codent un domaine SR, R2 est une répétition simple du dinucléotide TG et R3 est une répétition de 110 pb contenant des sites Kpn en tandem. La nomenclature générale pour le génome d’HHV-6 suit celle de Gompels et al. (1995). Les cadres ouverts de lecture (ORF) codant des répétitions directes sont précédés de DR et ceux qui sont dans la région unique sont appelés U1-U100 à partir de l’extrémité gauche de cette séquence (Figure 2), quelques gènes d'HHV-6 et leurs fonctions sont présentés dans le tableau II. Les gènes conservés au sein des herpèsvirus sont organisés en sept blocs dont l’arrangement est spécifique de la sous-famille (Gompels et al., 1995). Un bloc additionnel est spécifique aux β-herpèsvirus. Les gènes appartenant aux blocs de gènes conservés ont plus de 94 % d’identité en acides aminés entre HHV-6A et HHV-6B. Les gènes spécifiques au genre Roseolovirus des β-herpesvirinae (HHV-6 et HHV-7) sont U20-U24, U26, U85 et U100. 25
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