BIG 2010 - Station Biologique de Roscoff

BIG 

Biodiversité et Interactions à 

Guaymas 

Proposition de campagne 

à la mer 

Appel d’offres 2008-2009 

Anne GODFROY 

Ifremer DEEP/Laboratoire de Microbiologie des 

Environnements Extrêmes 

(UMR6197) 

Daniel PRIEUR 

Université de Bretagne Occidentale/Laboratoire de 

microbiologie des Environnements Extrêmes 

(UMR 6197)

Avant Propos 

Le dossier de demande de campagne BIG2008 à été présenté dans le cadre de l’appel d’offres 2007-2008. Cette 

demande à été classée en Priorité 1 par la commission OPCB . 

Cette campagne n’ayant pu être préprogrammée en 2008, nous présentons à nouveau cette demande dans le 

cadre de l’appel d’offres 2008-2009. Etant donné l’évaluation précédente nous avons décidé de ne modifier que la 

partie logistique du dossier. 

Dans ce dossier nous avons décidé de proposer deux scénarii possibles : 

-Le premier sur l’Atalante et ce afin de répondre au mieux à l’appel d’offre qui évoque la possibilité que l’Atalante 

soit dans le Pacifique début 2009. 

Dans ce cas la campagne sera divisée en 3 parties ce qui nous permet de ne pas diminuer le nombre total de 

scientifiques embarqués et de réaliser la totalité des travaux prévue dans le dossier initial. 

Les 2 sites d’études, les sites hydrothermaux de la dépression sud du bassin de Guaymas et les zones 

d’émissions de fluides froids de la marge de Sonara étant situés à quelques heures de route du port de Guaymas il 

est ainsi possible d’envisager des rotations au sein de l’équipe scientifique. 

-Le deuxième sur le Pourquoi pas? dans ce cas la campagne sera organisée en 2 parties 

Ce projet présenté par le laboratoire de Microbiologie des Environnement Extrême (UMR6197,UBO, CNRS 

Ifremer) et le Laboratoire Environnement Profonds du département DEEP, Ifremer, est financé dans le cadre du 

projet ANR DEEP OASES pour la période 2007-2010 

3

FICHE SYNTHETIQUE N°1 NOM DE LA CAMPAGNE : BIG 

Biodiversité et Interactions à 

Guaymas 

Date de rédaction du dossier : 

13 janvier 2007 

Année demandée : Chef de projet Chef de mission 

Durée des travaux (hors transits port-zone de 

travail) : 

Nom Prénom : Daniel PRIEUR Anne GODFROY 

25 jours 

Période (si impératif) : janvier à mai ou octobre à 

décembre Organisme : 

Zone : Bassin de Guaymas, Golfe de Californie 

Laboratoire : 

Pays dont les eaux territoriales sont concernées: 

Mexique Adresse : 

Pays dont la zone économique est concernée : 

Mexique 

Université de Bretagne 

Occidentale 

Laboratoire de Microbiologie des 


UMR6197 

Institut Universitaire Européen de 

la Mer (IUEM) 

Technopôle Brest-Iroise 

29280 Plouzané 

Ifremer 

Département Etude des 

Ecosystèmes Profonds 

Laboratoire de Microbiologie 

des Environnements Extrêmes 

UMR6197 

Ifremer 

Centre de Brest 

BP70 

29280 Plouzané 

Tél.: 02 98 49 87 04 02 98 22 45 29 

Fax : 02 98 49 87 05 02 98 22 47 57 

E-mail : daniel.prieur@univ-brest.fr agodfroy@ifremer.fr 

Travaux : 

Bathymétrie 

Plongées Victor 

Micro bathymétrie 

Prélèvements (eau, organismes, substrats) 

Mesures in situ 

Carrotage Usnel 

Mouillages court terme 

Navire : N/O Pourquoi pas? ou N/O Atalante 

Engin(s) sous-marin(s) : VICTOR 6000 

Gros équipements : 

Sondeur multifaisceaux 

Module de prélèvement de base de Victor 

Module route de Victor 

Ascenseur 

Traitement des données et besoins informatiques : Traitement des 

données de bathymétrie à bord 

Nécessité d’une campagne pour récupération d’engins ? 

Non 

Equipes scientifiques et techniques embarquées 

Ifremer DEEP/EP et LM2E UMR 6197 (UBO, CNRS Ifremer) 

Ifremer GM 

Université autonome de Mexico, Mexique 

University of Nimjgen, Pays Bas 

Winogradsky Institute of Microbiology, Russian Academy of 

Sciences,Moscou, Russie 

IRD, Marseille 

Equipes scientifiques et techniques à terre 

Ifremer DEEP EP et LM2E UMR 6197 (UBO, CNRS Ifremer) 

Université autonome de Mexico, Mexique 

Ifremer GM 


Winogradsky Institute of Microbiology, Russian Academy of 



Type de campagne : Recherche scientifique 

Thème de la campagne : Fonctionnement et diversité de deux écosystèmes sédimentaires fondés sur la chimiosynthèse microbienne. 

Cette proposition s’inscrit dans un projet : 

NON 

Cette demande de campagne fait partie des projets de recherches du programme Ifremer GEODE (thème 5 programme 1) : GEObiologie Des 

environnements Extrêmes des grands fonds océaniques et du GDR-ECCHIS 

S’agit-il d’une première demande : : NON Cette demande a été évaluée dans le cadre de l’Appel d’offre 2007-2008 et clasée en 

Priorité 1 (rapport de la comission ci joint ) 

5

BIG (Demandeurs : D. Prieur/A. Godfroy, LMEE, BREST) 

Le projet de campagne BIG 2008 a pour objectif de comparer la biodiversité dans deux types d’environnements - 

sources hydrothermales et suintements froids -, situés dans le même contexte géographique, le bassin de Guaymas 

dans le golfe de Californie. La dorsale océanique qui pénètre le golfe de Californie est ennoyée par les sédiments 

provenant des marges proches. Les circulations de fluides ont donc lieu dans la colonne sédimentaire. A proximité 

de la dorsale, la circulation hydrothermale provoque des sorties de fluides chauds. Les champs hydrothermaux qui 

en résultent ont déjà été largement explorés. Les suintements de fluides froids associés aux décalages transformants 

ont été mis en évidence plus récemment et sont beaucoup moins bien connus. Les deux types de communautés sont 

présentes à des profondeurs comparables et à des distances les unes des autres de quelques dizaines de kilomètres 

seulement. Alors que ces deux types d'écosystèmes présentent des homologies fonctionnelles et évolutives, ils n'ont 

curieusement jamais fait l'objet d'études comparatives menées par les mêmes équipes avec les mêmes méthodes ; en 

effet, la distance qui sépare, en général, les zones d'accrétion des zones de subduction ne permet pas l'étude 

simultanée des deux phénomènes. En permettant de faire la part des facteurs édaphiques par rapport aux 

phénomènes de vicariance, le bassin de Guaymas est donc également une pièce importante dans la comparaison 

biogéographique entre la dorsale du Pacifique oriental (fonds dur de l'EPR) et le système Nord-Est Pacifique 

(champs hydrothermaux sédimentés de la Ride de Gorda). 

La campagne fait intervenir géologues, géochimistes, et biologistes. La partie relation entre les fluides 

(caractéristiques physiques et chimiques) et la biologie est clairement expliquée et se trouve au centre du projet. 

Les rapporteurs font tous ressortir la qualité des hypothèses proposées, la composition et le savoir-faire de l'équipe 

demandeuse. Leurs remarques critiques portent sur: 

(a) l'étude du compartiment sédimentaire. Le dossier fait souvent mention du contexte sédimentaire dans lequel ont 

lieu les circulations de fluides, mais est un peu faible sur l'étude des sédiments eux mêmes. 

(b) la capacité des demandeurs à obtenir du gouvernement mexicain un permis de recherche qui autorise 

l'exportation d'échantillons biologiques et microbiologiques. 

(c) le manque de précisions du dossier de demande pour ce qui concerne certaines stratégies d'échantillonnage 

(mise en oeuvre du microprofileur) et les mesures des paramètres chimiques. 

La Commission émet un avis très favorable pour cette demande sur un site original présenté par une 

équipe compétente ayant fait la preuve de sa capacité à mettre en oeuvre les moyens à la mer et valoriser 

les résultats. Elle recommande d’être vigilant afin d’obtenir du gouvernement mexicain un permis de 

recherche qui autorise l’exportation d’échantillons biologiques et microbiologiques. Après discussion et 

vote, la proposition a été classée prioritaire P1. 

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FICHE SYNTHETIQUE N°2 

NOM DE LA CAMPAGNE : 


Evaluation des frais à la charge de l’équipe demandeuse 

Types de coûts Coûts en Euros Sources de Financement 

Niveau de financement 

assurées et/ou envisagées 

Frais de préparation de la 

campagne (missions 

préparatoires, équipement à 

Chaque équipe participante financera l’achat des équipements et consomables nécessaires à la réalisation de 

ses programmes. 

acquérir, consommables, ….) 

Frais de missions (voyages + 

séjour) des membres de 

l’équipe embarquée 

26 allers/retour Province/Paris/ 

Mexique (2400 €) et frais de 

mission (350€/personne) 

Ifremer programme GEODE 

INSU 

60% 

30% 

soit 71 500 € 


10% 

1 aller/retour Nimjgen(Pays 

Bas)/Mexique 


100% 

4 aller/retour Mexico/port 

d’embarquement (500€/personne) 

Université autonome de Mexico, 

Mexique 

100% 

Frais d’acquisition de 

nouveaux matériels, contrat, 

sous-traitance 

Frais de transport du matériel 

propre à la campagne 

Transports des équipements 

des différentes équipes 

participantes 

Frais d’analyse et de 

dépouillement à terre 

1 aller/retour Moscou/Mexique et 

frais de mission 

Winogradsky Institute of 

Microbiology, Russian Academy of 


100% (éventuellement financé 

dans le cadre d’un programme 

INTAS) 

Chaque équipe participante financera l’achat des équipements nécessaires à la réalisation de ses 

programmes. 

2 containeurs 

+ 2 containeurs laboratoires si 

embarquement sur l’Atalante 

Cout estimé pour le transport d’un 

containeur : 9000 euros 

Ifremer programme GEODE 

INSU 

Autres 

50% 

40% 

10% 

Chaque équipe participante financera l’analyse des échantillons issus de la campagne 

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RESUME - ABSTRACT 



RESUME 

• Texte synthétique résumant l'ensemble des documents 1 à 6, lisible par un non spécialiste 

(ne pas dépasser 15 lignes) 

Le bassin de Guaymas, situé dans le golfe de Californie se caractérise par la présence d’une activité 

hydrothermale dans un contexte de marge, d’où la présence à quelques dizaines de km de distance de sites 

hydrothermaux et de zones d’émission de fluides froids. 

Les dépôts hydrothermaux actifs se distribuent sur le fond du bassin de Guaymas. Ces dépôts sont caractérisés 

par la présence de monts, dominés par des cheminées hydrothermales, mais aussi par la présence d’une 

percolation des sédiments riches en matière organiques par les fluides surchauffés. Des zones d’émission de 

fluides froids ont été mises en évidence le long d’une faille transformante de la marge de Sonara. 

De part la présence simultanée, dans un environnement sédimentaire, de sites hydrothermaux et de zones 

d’émission de fluides froids, le bassin de Guaymas est un lieu unique propice à l’étude comparative, en l’absence 

de barrière biogéographique, de ces écosystèmes basés tous deux sur la chimiosynthèse microbienne. 

Cette étude portera notamment sur la caractérisation des gradients physicochimiques dans ces 2 écosystèmes et 

la comparaison avec le sédiment extérieur pris comme référence. La caractérisation des communautés animales 

et microbiennes le long des gradients physicochimiques (horizontaux et verticaux) permettra d’évaluer les 

similitudes taxinomiques et fonctionnelles au sein des deux habitats. 

ABSTRACT 

Traduction en Anglais du résumé 

The Guaymas basin is located in the Gulf of California. It is characterized by the presence of hydrothermal vent 

activity in a margin area and the presence at a short distance of both hydrothermal and cold seep sites. 

Hydrothermal deposits are scattered at the bottom of the basin. This hydrothermal deposits occurs as 

hydrothermal mounds, with hydrothermal chimneys and also by the presence of rich organic matter sediments 

percolated by the hydrothermal fluid. Cold seep activity was evidenced along a transforming fault of the Sonora 

Margin. 

According to the presence in a sedimentary environment of both hydrothermal vents and cold seep the Guaymas 

basin is a perfect area for a comparative study, in the absence of biogeographic barrier, of these two 

chemosynthetic ecosystems. 

This study will focus on the characterization of the physicochemical gradients in the two ecosystems, using 

external sediment as reference, and the characterization of both microbial and animal communities along the 

physicochemical gradients (horizontal and vertical) in order to evaluate both taxonomical and functional similarities 

within the two habitats. 

11

DOCUMENT N° 1 



PROJET SCIENTIFIQUE 

1-INTRODUCTION 

La découverte des sources hydrothermales océaniques dans le Pacifique oriental, il y a près de 30 ans, puis celle 

des suintements froids dans le Golfe du Mexique et la subduction d’Oregon ont profondément modifié la vision des 

océanographes sur la biologie de l'océan profond. Le plus vaste écosystème de la planète ne se limitait pas à de 

vastes habitats froids et obscurs dominés par les détritivores utilisant la matière organique synthétisée dans la 

zone éclairée. Le long des dorsales océaniques, sur les arcs volcaniques et dans les bassins arrière-arc, dans les 

zones de subduction, et même sur les marges continentales passives, des "oasis de vie" (le terme fut employé en 

1977, lors de la découverte de l'hydrothermalisme océanique dans le secteur des Galapagos) fonctionnant grâce à 

la chimiosynthèse (chimio-litho-autotrophie) bactérienne, étaient présents. Certains auteurs déclaraient même que 

ces écosystèmes inattendus étaient indépendants de l'énergie solaire. Il s'agissait là bien sûr d'une approximation 

(peut-être due à l'enthousiasme initial) car ces chimiosynthèses bactériennes sont basées sur des réactions 

d'oxydo-réduction dans lesquelles l'oxygène moléculaire (produit de la photosynthèse oxygénique) est le plus 

souvent l'accepteur terminal d'électrons. 

Les biologistes marins ont longuement étudié ces écosystèmes d'un type nouveau, dans des zones aux contextes 

géologiques différents (sources hydrothermales océaniques et suintements froids) et souvent géographiquement 

distants, et leurs travaux ont été concentrés sur la distribution et la diversité des communautés animales associées 

à ces phénomènes, leurs physiologies et leurs adaptations, ainsi que les relations symbiotiques qu'ils entretiennent 

avec les bactéries chimiosynthétiques à la base de la chaîne alimentaire. 

Les microbiologistes, se sont surtout focalisé sur les sources hydrothermales, où ils ont principalement décrit de 

nombreuses nouvelles espèces caractérisées par leurs aptitudes à vivre de manière optimale aux températures 

élevées (supérieures à 60°C). 

Alors que ces deux types d'écosystèmes présentent des homologies fonctionnelles et évolutives, ils n'ont pas fait 

à ce jour l'objet d'études comparatives menées par les mêmes équipes avec les mêmes méthodes ; la distance qui 

sépare en général, les zones d’accrétion des zones de subduction ne permet pas l’étude simultanée de ces deux 

phénomènes 1 . 

Le projet BIG se propose de combler au moins partiellement ces lacunes en étudiant le bassin de Guaymas qui se 

caractérise par la présence d’une activité hydrothermale dans un contexte de marge sédimentaire d’où la présence 

à quelques km de distance de sites hydrothermaux et de zones d’émission de fluides froids (marge de Sonora). 

La présence simultanée, dans un environnement sédimentaire, de sites hydrothermaux et de zones d’émission de 

fluides froids, font du bassin de Guaymas un lieu unique pour l’étude comparative de deux écosystèmes basés 

tous deux sur la chimiosynthèse microbienne. 

2-BIOLOGIE DES ECOSYSTEMES A BASE CHIMIOSYNTHETIQUE 

Les taxons rencontrés au niveau des sources hydrothermales et des suintements froids sont souvent endémiques 

(ou tout du moins uniquement prélevés dans ces milieux). Cet endémisme est probablement relié, au moins en 

partie, aux conditions physico-chimiques contraignantes rencontrées (sulfures en forte concentration, faible 

concentration en oxygène, présence de métaux lourds ou d’hydrocarbures etc.). Bien que les sources 

hydrothermales soient en général plus dynamiques (émissions fortes et instables à toutes les échelles de temps), 

ces deux milieux présentent des caractéristiques communes parmi lesquelles des affinités taxinomiques allant 

souvent jusqu’au genre (1) 

Des études de phylogénie moléculaire ont montré la parenté des espèces de ces deux milieux, notamment sur des 

crevettes (2)des bivalves (3) et des vers siboglinidés (4, 5). Ces études montrent une position basale des espèces 

des suintements froids par rapport à celles des sources hydrothermales, ce qui suggère une colonisation du milieu 

hydrothermal par des espèces provenant des sources de fluide froid. (6) suggèrent aussi un passage des mytilidés 

par les milieux enrichis, tels que les bois coulés, avant la colonisation des suintements froids et des sources 

1 Deux programmes américains ayant une problématique voisine mais sur des environnements distincts,.sont en cours, l’un sur la ride et la 

marge du Chili (programme INSPIRE) et l’autre sur la marge néo-zélandaise et les volcans de la ride de Kermadec, 

13

hydrothermales. A l’inverse, (7) proposent que les espèces des zones d’émissions froides seraient plutôt issues 

des milieux hydrothermaux. 

Pour des espèces voisines, la comparaison des caractéristiques des habitats hydrothermaux et des zones de 

suintement reste à effectuer. Les études récentes ont montré des liens entre les caractéristiques générales des 

émissions et la répartition spatio-temporelle de la faune. Dans le milieu hydrothermal, ces liens reflètent la 

dépendance nutritionnelle des espèces pour le fluide chargé en composés réduits et leur tolérance aux conditions 

du milieu (8-10). Dans les sources froides, des relations étroites entre la distribution de la faune et les 

caractéristiques des émissions (débits, modalités d’expulsion de fluides, structures géologiques) ont également été 

mises en évidence (11-15). Les concentrations en méthane et en hydrogène sulfuré ainsi que la nature du substrat 

et sur certains sites la présence d’ hydrocarbures plus lourds influenceraient la microdistribution des espèces 

symbiotiques (16). Cependant, en raison de contraintes technologiques et de temps passé au fond, peu d’études 

ont testé la relation directe des facteurs physico-chimiques à la micro-distribution des espèces. De plus, le rôle des 

facteurs biotiques sur la structure et la dynamique des communautés chimiosynthétiques est encore mal connu 

(17, 18). Les interactions biotiques comme le partage des ressources (19) et la compétition joueraient un rôle 

significatif sur la distribution des espèces et ce, dans les limites imposées par les conditions abiotiques (18). 

Les isotopes stables sont un outil classiquement utilisé pour déterminer les sources de carbone et d’énergie dans 

les écosystèmes profonds basés sur la chimiosynthèse bactérienne (20-22) et pour estimer les contributions 

relatives des différentes sources (23, 24). Dans les sources froides, les hétérotrophes associés aux buissons de 

siboglinidés, y compris les prédateurs, obtiennent la majeure partie de leur nutrition de la production 

chimiosynthétique locale, mais la contribution de la macrofaune dans les sédiments associées aux bivalves 

vésicomyidés peut varier selon les microhabitats et les taxons et la profondeur des sites. Les isotopes du carbone 

et de l’azote, couplés plus récemment à ceux du souffre, sont également utiles pour comprendre les relations 

trophiques dans les écosystèmes hydrothermaux et les sources de fluides froids (25, 26). Toutes ces études 

mettent en évidence l’importance des bactéries libres autotrophes. La présence d’un (ou plusieurs) producteur(s) 

primaire(s) non encore identifié(s), à signature différente de celle des endo- ou épi-symbiontes est un problème 

commun à la plupart des études (27). 

3-MICROBIOLOGIE DES ECOSYSTEMES A BASE CHIMIOSYNTHETIQUE 

La diversité microbienne des écosystèmes hydrothermaux sous-marins profonds a été étudiée en faisant appel à 

la fois aux techniques culturales et plus récemment en utilisant les techniques moléculaires d’études de la 

diversité. Les techniques culturales, avec un accent mis au départ sur les microorganismes thermophiles 

hétérotrophes, puis à d’autres groupes métaboliques (méthanogènes, sulfatoréducteurs etc.), ont conduit à 

l’isolement d’une centaine d’espèces appartenant aux domaines des Archaea et des Bacteria et impliquées dans 

la plupart des cycles biogéochimiques au vu des donneurs et accepteurs d’électrons utilisés. Les analyses 

moléculaires de la diversité microbienne du pôle chaud de l’écosystème hydrothermal ont été réalisées 

-sur des échantillons de cheminées hydrothermales, (28-30), 

-sur des modules de colonisation « VentCap » (31) et « Protocheminées » (32) placés à proximité ou sur les 

édifices hydrothermaux 

-ainsi que sur des animaux vivant à proximité des édifices hydrothermaux (33, 34). 

Ces travaux mettent en évidence une diversité importante. Parmi les phylum identifiés, on trouve des espèces déjà 

connues et décrites mais également beaucoup d’espèces non encore cultivées appartenant à des phylum pour 

lesquels il n’existe aucun représentant cultivé connu et dont la fonction dans l’écosystème ne peut donc être 

identifiée. Des analyses moléculaires de la diversité microbienne des écosystèmes hydrothermaux basées non 

pas sur la diversité des gènes codant pour les ARN ribosomaux 16S mais sur des gènes fonctionnels ont 

également été réalisées. Ces analyses ont porté majoritairement sur les gènes impliqués dans la méthanogènèse 

et l’oxydation anaérobie du méthane (35, 36) et sur la sulfato-réduction (37). 

La microbiologie des zones d’émission de fluides froids est un champ d’investigation émergent. La biologie des 

zones d’émission de fluide froid est reliée aux procédés d’oxydation des sulfures et du méthane par les 

microorganismes 

Le méthane des zones d’émission de fluide froid peut être d’origine biogénique ou thermogénique.. Dans les zones 

de sédiments anoxiques tout le méthane produit par methanogénèse est oxydé dans la zone de transition 

méthane/sulfate et n’atteints jamais l’eau du fond. Dans les zones d’émissions de fluides froids, l’eau interstitielle 

chargée en méthane est transportée vers la surface du sédiment et l’apport massif en méthane conduit a des taux 

élevés d’oxydation anaérobie du méthane (AOM) dans les sédiments de surface. Dans les sédiments qui 

contiennent des hydrates de méthane comme sur Hydrate Ridge il a été montré que l’AOM représente un puit de 

méthane dans les sédiments de surface consommant de 50 à 100% du méthane transporté par advection (38). 

L’AOM est réalisée au moins 2 groupes d’Archae les groupes ANME-1 (39) et ANME-2 (40) et vraisemblablement 

ANME-3. Ces microorganismes vivent en consortium syntrophique avec des bactéries sulfatoréductrices 

appartenant aux groupes Desulfosarcina/Desulfococcus et Desulfobulbus, (41) bien que la nature exacte des 

interactions soit encore peu comprise. La réaction globale implique l’oxydation du méthane et la réduction des 

sulfates et résulte en la formation de bicarbonate et d’hydrogène sulfuré. Des expériences d’hybridation in situ 

14

(FISH) ont révélé que ces consortiums pouvaient avoir des formes différentes comportant un noyau central 

d’Archaea entouré par les bactéries ou que les Archaea et les bactéries pouvaient être distribuées au hasard au 

sein des consortiums. L’activité des consortiums augmente l’alcalinité de l’eau interstitielle ce qui facilite la 

précipitation de carbonate minéral principalement sous forme d’aragonite (42). 

Le taux élevé d’oxydation anaérobie du méthane couplée à la réduction des sulfates génère une importante 

biomasse bactérienne qui pourrait fournir un apport significatif de carbone «dérivé» du méthane pour les 

communautés microbiennes du sédiment. Les microorganismes hétérotrophes pourraient jouer un rôle important 

dans le transfert de ce carbone vers les consommateurs «secondaires» (43). 

Des tapis bactériens sont présents prés de la surface des sédiments des zones d’émission de fluides froids là où il 

existe un apport continu de fluide réduit riche en sulfures et une source d’oxygène. La distribution des ces tapis 

peut être très hétérogène indiquant la présence localisée d’émission de fluide. Ils sont généralement constitués 

d’un assemblage d’espèces microbiennes (bactéries et Archaea) diverses dominé par de grande bactéries 

filamenteuses sulfoxydantes appartenant à des genres proches des genres Beggiatoa, Thiotrix, et Thioploca, (44, 

45). Ces tapis bactériens, malgré le taux élevé de sulfures abritent des assemblages diversifiés de micro, meio et 

macrofaune (43). 

4-CARACTERISTIQUES DU BASSIN DE GUAYMAS 

Le golfe de Californie est situé à la frontière entre les plaques nord américaine et pacifique. Il s’étend sur une 

longueur de 1200 Km et une largeur de 100 à 150 Km. Au centre du golfe la dorsale a une disposition oblique en 

« échelon » avec de courts centres d’accrétion séparés les uns des autres par des longues failles transformantes. 

Le fond du golfe est cloisonné en petits bassins, dont le bassin de Guaymas. 

Le fond du bassin de Guaymas est recouvert d’une couche de sédiment qui peut atteindre 500 m d’épaisseur. Ces 

sédiments sont en partie d’origine continentale (apportés par les fleuves), mais principalement d’origine pélagique. 

En effet la production biologique primaire de surface est importante et génère un flux de matière organique élevée 

vers le fond ( 0,1g/m 2 /jour) avec un taux de sédimentation exceptionnellement élevé de l’ordre de 2,7 m /1000 ans. 

Ce flux organique se traduit par une concentration élevée en carbone organique dans le sédiment (2-4%), ce qui 

est nettement supérieur aux concentrations observées dans d’autres environnements de ce type tel que celui de 

Middle Valley ou de la dépression d’Escabana (0,5%) (46) 

4-1-Les sites hydrothermaux du Bassin de Guaymas 

Les dépôts hydrothermaux actifs sont dispersé sur le fond du 

fond du bassin de Guaymas. Ces dépôts sont caractérisés par 

la présence de monts, dominés par des cheminées 

hydrothermales, mais aussi par la présence d’une percolation 

des sédiments riches en matière organiques par les fluides 

surchauffés. 

Les sites hydrothermaux explorés lors de plusieurs 

campagnes américaines et lors de la campagne française 

GUAYNAUT en 1991 sont situés dans la dépression sud du 

bassin (27°N, 111°5’ W) 

La percolation du fluide au travers du sédiment a des 

températures pouvant atteindre 200°C entraîne un relarguage 

de grandes quantités d’hydrocarbures pétroliers, d’acides 

organiques à courtes chaînes et d’ammonium, grâce à la pyrolyse de la matière organique complexe (47, 48). Les 

rapports isotopiques (δ 13 C) du méthane dans les sédiments du bassin de Guaymas (−43‰ to −51‰) indiquent une 

origine thermo catalytique par pyrolyse de la matière organique enfouie (49, 50). Le contenu en méthane dans les 

fluides de Guaymas est de 12–16 mM soit 2 fois plus élevée que dans la plupart des sites hydrothermaux sur 

substrat basaltique. Par contre l’importante précipitation de sub-surface des sulfures métalliques réduit la teneur 

en métaux du fluide hydrothermal (51) et ainsi leur toxicité pour les microorganismes et les animaux. 

Caractéristiques biologiques et microbiologiques 

La faune qui peuple les édifices hydrothermaux est grossièrement semblable à celle observée sur la dorsale du 

Pacifique Oriental nord; elle est dominée par des populations importantes de Riftia pachytila dont l’appartenance 

spécifique est encore débattue, des vers de la famille des Polynoidae (Branchinotogluma spp.) et des colonies de 

Paralvinella grasslei. Par contre Alvinella pompejana, les grands bivalves Bathymodiolus thermophilus et 

Calyptogena magnifica n’ont pas été observés. Aucun gastéropode 2 n’est signalé au niveau des édifices 

hydrothermaux actifs de Guaymas alors que trois espèces Hyalogirina grasslei, Lepetodrilus guaymasensis et 

2 Un groupe habituellement très représentés sur les édifices hydrothermaux actifs et parmi les vers siboglinides. Pourtant dans un court article, 

Galkin et al. (2004) signalent d’abondantes populations de patelliformes sur un site situé dans le bassin sud par 2050m de profondeur. 

15

Provanna goniata endémique de la zone des Guaymas sont signalés des zones de suintements 3 de fluide 

hydrothermal dans les sédiments (52). Il semble donc qu’il existe une barrière biogéographique au sud de 

l’embouchure de la mer de Cortes. Les relations biogéographiques de la faune des édifices hydrothermaux de 

Guaymas avec celles de l’EPR et de la ride de Gorda, reste à établir en étudiant les parentés d’espèces 

homologues dans des habitats comparables, des deux coté de la plaque Californienne qui a divisé la ride du 

Pacifique oriental, il y a 37 millions d’années. 

La distribution de la faune endogée des sédiments a fait l’objet de 

prélèvements par les équipes américaines et mexicaines, 

principalement à partir de la surface (carottage USNEL) ; elle 

n’est pas encore bien caractérisée du fait de la complexité de la 

répartition en mosaïque liée à la présence d’émission à travers 

les sédiments et de la couverture par des mattes bactériennes à 

différents stades physiologiques. Les sédiments abritent une 

faune endogée (53) dominée par d’importantes populations 

pratiquement monospécifiques de vers polychètes atteignant des 

densités très élevées. [Ophryotrocha akessoni (3200 ind/m²), 

Amphisamita galapagensis 4 (2250 ind/m²), Sirsoe grasslei (2800 

ind/m²), Exallopus jumarsi (2600ind/m²), deux espèces 

d’Alvinellidae Paralvinella grasslei et P. bactericola (1800 

ind/m²)…] ainsi que deux espèces de bivalves [Vesicomya gigas 5 et Nuculana sp. (6700 ind/m² et 10 kg/m² de 

matière organique humide)]. Ce milieu abrite donc une faune peu diversifiée, mais d’une richesse exceptionnelle 

en termes de densité et de biomasse. Mais si ces données autécologiques ont été publiées, la synécologie de ces 

milieux et les relations entre communautés et habitats sont encore quasiment inconnues. Les seules données 

publiées actuellement (55) font état d’une richesse plus élevée des prélèvements effectués dans les zones 

présentant des suintements d’hydrocarbures (14800 ind/m²), une richesse moyenne pour les zones de mattes 

bactériennes (4300 in/m²) et une densité plus faible dans les sédiments non hydrothermaux (1600 ind/m²). Une 

étude préliminaire des réseaux trophiques (56, 57) fondée sur l’étude des isotopes stables du carbone et de 

l’azote, a été publiée dans la « littérature grise » et montre une intrication importante des réseaux fondés sur le 

carbone d’origine pélagique et le carbone d’origine hydrothermale. 

Pour la méiofaune, des études préliminaires ont été publiées par Dinet (58).Dans les sédiments « témoins », la 

méiofaune est représentée à des densités de l’ordre 250 ind/10 cm², alors que dans les sédiments imprégnés 

d’hydrocarbures ou ceux des mattes bactériennes, la méiofaune est pratiquement absente. Du point de vue 

quantitatif, les copépodes sont dominés par les Cerviniidae [Ivanenko (59) signale cependant 3 espèces de 

Dirivultidae] et les nématodes par les Epsilonematidae et les Draconematidae. L’absence d’autres taxons de la 

méiofaune est aussi un caractère remarquable. 

Du fait des leurs caractéristiques spécifiques les sites hydrothermaux du bassin de Guyamas ont fait l’objet de 

plusieurs études de microbiologie. 

Sur les sédiments percolés par le fluide hydrothermal des bactéries filamenteuses (de type Beggiatoa) forment des 

tapis épais de 2 à 4 m de diamètre. Autour de ces tapis le sédiment laisse diffuser un fluide moiré dont la 

température est comprise entre 5 et 20°C. Le gradient thermique vertical à l’intérieur du sédiment est très 

important et peut atteindre 10°C/cm. 

L’activité microbienne dans les sédiments de Guaymas semble contrôlée par la température. Le gradient de 

température abrupt confine la vie microbienne dans les couches superficielles du sédiment. L’ADN amplifiable par 

PCR, l’analyse des bio marqueurs lipidiques (60, 61), le nombre de cellules procaryotes actives (62) ainsi que les 

taux de réduction des sulfates (63-65) (66) ainsi que l’oxydation anaérobie du méthane (66) décroissent 

rapidement dans les 30 premiers centimètres de sédiment, le long du gradient de température. 

De nouveau genres et espèces ont été isolées à partir d’échantillons prélevés sur les sites hydrothermaux du 

bassin de Guaymas cependant à l’exception des Thermococcales et des Methanocaldococcales qui ont pour 

certaines été isolées à partir d’échantillons de sédiment, la plupart de ces espèces proviennent d’échantillons de 

cheminées hydrothermales actives. 

On peut citer 

-Les Archaea hyperthermophiles hétérotrophes sulfo-reductrices appartenant aux genres Thermococcus et 

Pyrococcus (67, 68) 

-Les Methanoarchae des genre Methanocaldococcus (69-71) and Methanopyrus (72, 73) 

-L’Archae hyperthermophile sufato-réductrice Archaeoglobus profundus (74) 

-La bactérie thermophiles sulfato-réductrice Thermodesulfobacterium hydrogenophilum (75) 

-L’Archae autotrophe hyperthermophile capable de réduire le fer(III) Geoglobus ahangari (76) 

-Et l’Aquificale chimiolithotrophe microaérophile Persephonella guayamensis (77). 

3 Ce terme employé par Warén et Bouchet peut porter à confusion. D’après Petrecca et Grassle, il s’agit d’espèces abondantes dans les 

suintements d’hydrocarbures d’origine thermogénique et donc hydrothermale et non de cold-seeps. 

4 L’attribution spécifique de ces deux espèces mérite d’être revue à la lumière de données moléculaires (54). 

5 En fait, les études moléculaires récentes font état de deux espèces de Vesicomya (V. lepta & V. gigas). 

16

Plusieurs études moléculaires de la diversité des populations bactériennes et archéennes ont été réalisées sur des 

échantillons de sédiment hydrothermaux du bassin de Guaymas .Ces études se sont focalisés sur les couches 

superficielles du sédiment dans lesquelles diverses populations bactériennes et Archéennes utilisent les produits 

issus des réactions chimiques qui se produisent en profondeur dans le sédiment. Par exemple des bactéries 

aérobies sont spécialisées dans l’oxydation complète des composés pétroliers thermogéniques incluant alcanes et 

composes aromatiques (78-80) et des bactéries sulfato-réductrices dégradent également les hydrocarbures (81). 

Des tapis bactériens denses de bactéries sulfoxydantes de type Beggiatoa recouvrent les sédiments 

hydrothermaux actifs (82, 83). Le gradient de température abrupt 2 à 4°C pour l’eau de mer et au-delà de 100°C 

entre 10 et 25 cm de sédiment favorise la présence de microorganismes microaérophiles et de microorganismes 

thermophiles anaérobies. 

Ces études basées sur la diversité des gènes codant pour les ARN ribosomaux 16S (61, 84) et de gènes 

fonctionnels (36, 37, 85) indiquent la présence de microorganismes, appartenant à de multiple lignées 

phylogénétiques, qui restent incultivés à ce jour. Ces nouveaux organismes incluent entre autres des populations 

d’Archaea méthanotrophes qui assimileraient le méthane issu de la décomposition thermogénique de la matière 

organique (61), ainsi que des microorganismes sulfato-réducteurs de l’ordre des Desulfobacteriales et d’autres 

appartenant à une lignée phylogénétique pour laquelle il n’existe pas de représentant cultivé. 

Figure 1 : Localisation des zones d’émission de fluides froids et des sources hydrothermales dans le bassin de Guyamas d’après (86, 88) 

4-2-Les zones d’émission de fluides froids du Bassin de Guaymas 

Contrairement aux sites hydrothermaux qui ont été bien explorés dans le bassin de Guaymas , les zones 

d’émission de fluides froids l’ont peu été. Elles ont été mises en évidence le long d’une faille transformante de la 

marge de Sonora (86). Des populations denses de Vesicomyidae, et de vers tubicoles (Lamellibrachia sp ou 

Escarpia) (87) ont été décrites. La présence de ces zones d’émissions et de la faune associée a été également 

observée lors d’une plongée de l’Alvin en 1994 (Alvin dive 2839 http://www.marine.whoi.edu/divelog.nsf) puis plus 

récemment lors d’une plongée du ROV Tiburon en 2003 lors d’une campagne américaine (MBARI Gulf of 

California expedition, Leg 4 http://www.mbari.org/expeditions/GOC/logbook_main.htm) Les observateurs reportent 

une grande diversité de faune, avec la présence de plusieurs espèces de siboglinidés, de 5 espèces de bivalves 

dont une du genre Solemya, ainsi que d’une faune associée riche comprenant des spongiaires, brachiopodes, des 

polychètes, de nombreux gastéropodes, des holothuries et astérides, des poulpes et des poissons. Des hydrates 

de méthane, ainsi que des bulles de gaz ont également été observés. 

Le gène mitochondrial COI de trois morphotypes de vesicomyidés ont été séquencés et ont placé ces individus 

dans le complexe (Calyptogena kilmeri / Vesicomya gigas), dans un groupe cependant distinct de V. gigas des 

sites hydrothermaux du bassin (groupe kilmeri) (3). Par ailleurs une espèce du complexe C. pacifica / V. lepta a 

également été reportée mais n’a pas été comparée à celle des édifices hydrothermaux assignée à Vesicomya 

lepta 

17

En conclusion, il apparaît que les travaux réalisés par les microbiologistes dans le bassin de Guaymas doivent 

être complétés, particulièrement en ce qui concerne les zones de suintements froids. Dans les zones 

hydrothermales, les mesures d'activité ont été limitées à la sulfato-réduction et à l'oxydation anaérobie du 

méthane, ce qui est insuffisant pour la compréhension des cycles biogéochimiques majeurs. De la même façon, 

les approches culturales et moléculaires de la diversité, si elles ont moins privilégié un métabolisme particulier, 

n'ont pas tenu compte des gradients physico-chimiques. 

Pour l’écologie générale, l’intérêt de l’étude du bassin du bassin de Guaymas repose sur trois de ses 

caractéristiques. 

(1) La percolation des fluides hydrothermaux à travers un sédiment très riche en matière organique produit des 

microhabitats dont les caractéristiques sont extrêmes (concentration en hydrocarbures, gradients physicochimiques, 

couverture bactérienne) et dont les populations, bien que de diversité faible, sont d’une très grande 

richesse. La liaison fine entre l’habitat, la composition et la dynamique trophique des invertébrés benthiques reste 

à déterminer. 

(2) La juxtaposition dans une aire réduite de deux systèmes chimiosynthétiques (sources hydrothermales et 

sources froides des marges), permet d’étudier les similitudes et les différences faunistiques et fonctionnelles en 

l’absence de barrière géographique et de faire l’hypothèse d’échanges actuels entre ces deux systèmes. 

(3) Le bassin de Guaymas est une pièce importante dans la comparaison biogéographique entre la dorsale du 

Pacifique oriental et le système Nord Est Pacifique. Il permet en effet, en comparant les peuplements des 

Guaymas, la faune des champs hydrothermaux sédimentés du Pacifique Nord-Est (Escanaba Trough sur la ride 

de Gorda et Middle Valley), et les peuplements de substrats durs de l’EPR de mieux comprendre le rôle des 

facteurs édaphiques par rapport aux phénomènes de vicariance liés à l’isolement par la plaque Amérique de deux 

stocks faunistiques. 

5-PRESENTATION DU PROJET SCIENTIFIQUE 

Les écosystèmes océaniques profonds basés sur la chimiosynthèse bactérienne sont tout particulièrement sous 

l'influence de gradients physico-chimiques verticaux et horizontaux (température, sources de carbone et d'énergie, 

composés toxiques). L'étude de l'effet de ces gradients sur les communautés de macro et micro-organismes sont 

parfois difficiles en raison de la nature du substrat qui supporte ce gradient. Si l'on prend par exemple le cas de la 

température (paramètre majeur dans le contexte hydrothermal), il est difficile à appréhender dans le cas des 

cheminées hydrothermales constituées de précipités minéraux solides (sulfures métalliques etc.) car le gradient de 

température est confiné dans une zone de quelques cm (300°C au point d’émission du fluide à quelques degrés à 

l’extérieur de la cheminée. Dans le bassin de Guaymas, l’activité hydrothermale se manifeste à la fois au niveau 

de monts hydrothermaux, quand le fluide est émis par un réseau de failles, et au niveau sédimentaire lorsque le 

fluide percole dans le sédiment. Dans ces sédiments percolés par le fluide hydrothermal, le gradient de 

température «s’étends» sur une zone de quelques dizaine de centimètres. D’autre part le sous échantillonnage 

discret le long du gradient physico chimique généré par la percolation du fluide apparaît comme étant nettement 

plus aisé que sur une cheminée hydrothermale. 

Par ailleurs, l'originalité du Bassin de Guaymas est de rassembler, sur une zone géographique réduite et sur un 

même substrat sédimentaire, des sites hydrothermaux et des zones d’émission de fluides froids. Dans ces deux 

environnements, les caractéristiques des réseaux de subsurface se traduisent, à l’interface, par la formation d'une 

mosaïque d’habitats repérables visuellement (mattes de bactéries filamenteuses, assemblages dominés par les 

bivalves ou les vers siboglinidés, thanatocœnoses, etc.). 

Il est donc possible, dans le cas d'environnements sédimentaires dont la connaissance générale est encore très 

incomplète aussi bien dans les milieux hydrothermaux que dans les zones de suintements froids, au cours d'une 

même campagne, sur une zone géographique relativement réduite, de tester les hypothèses suivantes: 

H1- La distribution des communautés microbiennes et animales est liée aux gradients physico 

chimiques verticaux et horizontaux et cette distribution diffère dans les deux écosystèmes. 

H2- Le milieu hydrothermal est plus sélectif que les sources froides et l’endémisme y est supérieur car 

les organismes sont soumis à davantage de contraintes physico-chimiques. 

H3- En l’absence de barrière biogéographique il existe des échanges génétiques entre les deux 

habitats (migration contemporaine d’espèces, sous forme de propagules ou d’adultes). 

La mise en oeuvre d’une approche comparative entre les communautés (microbiennes et animales) 

hydrothermales et celles des émissions de fluides froids, dans un environnement sédimentaire, permettra de 

mettre en évidence les facteurs abiotiques « structurants » communs aux deux milieux ainsi que les différences 

dues, entre autres, à la toxicité, au flux et à la température, propres au milieu hydrothermal. 

Nous proposons dans un premier temps d’effectuer une cartographie des différents habitats en utilisant les 

nouveaux outils de bathymétrie du Pourquoi Pas? ou de l’Atalante ainsi que le module de mesure en route du ROV 

Victor afin de déterminer leur répartition et leur importance en terme de surface. 

18

L’analyse d’images (constitution de mosaïques et reconstruction en 3D des microhabitats) permettra ensuite de 

caractériser la distribution spatiale de ces habitats (mattes de bactéries filamenteuses, assemblages dominés par 

les bivalves ou les vers siboglinidés, thanatocœnoses, etc.) alors que les prélèvements quantitatifs de faune par le 

ROV permettront de déterminer la structure (composition, diversité, biomasse) des différents assemblages de 

faune. 

Ensuite, nous proposons, pour chacun des habitats déterminés, de mesurer les conditions environnementales du 

milieu (pH, température, hydrocarbures, sulfures dissous, oxygène dissous, ammonium, métaux dissous et 

particulaires) en utilisant à la fois des mesures in situ et des prélèvements de fluides. Un micro-profileur permettra 

d’effectuer des profils dans les sédiments (pH, O 2 , H 2 S, température). Des mesures dans l’eau interstitielle 

(hydrocarbures et sulfures dissous) ainsi qu’une caractérisation granulométrique et minéralogique du sédiment 

seront réalisées ex situ à partir des carottes prélevées au sein des différents habitats. Des enregistrements de 

température seront réalisés afin de contraindre la dimension temporelle des émissions. Finalement, les liens entre 

les conditions de l’habitat et la structure et la distribution des assemblages seront mis en évidence à l’aide 

d’analyses statistiques multivariées. 

La stratégie développée pour cette étude écologique multidisciplinaire prendra en compte les spécificités de ces 

milieux : tailles réduites des zones actives, habitats fragmentés et gradients physico-chimiques importants. Pour ce 

faire, nous proposons d'utiliser une instrumentation spécifique qui permettra l'acquisition de données combinant 

imagerie, prélèvements d'eau et analyses physico-chimiques in situ, échantillonnage le long du gradient physicochimique 

vertical dans le sédiment et échantillonnages quantitatifs de faune, de manière reproductible d'un point à 

l'autre et ce, sur les deux écosystèmes. Le milieu sédimentaire abyssal constituera notre zone contrôle pour 

l’ensemble de l’étude. 

Sur les mêmes zones, l’échantillonnage discret le long du gradient physico-chimique, généré verticalement par la 

percolation des fluides dans le sédiment, permettra d’accéder à la distribution des communautés microbiennes. La 

caractérisation des communautés microbiennes présentes dans les deux écosystèmes fera appel aux techniques 

culturales classiques, à des mesures d’activités pour certains groupes métaboliques ainsi qu’aux techniques 

moléculaires d’études de la diversité. 

Les éléments génétiques mobiles (virus et plasmides) des environnements extrêmes ont à ce jour été 

essentiellement étudiés en milieu terrestre, où ils montrent une diversité remarquable (89). En milieu océanique, 

les premiers travaux laissent également présager une grande diversité (90) et l’existence de transferts génétiques 

à plus ou moins longue distance (91) 6 . Ce travail de criblage a également conduit à la découverte et à la 

description par du premier virus (PAV1) infectant l’Euryarchaeota hyperthermophile Pyrococcus abyssi (92) et a 

également révélé l’existence d’une impressionnante diversité virale dans les sources hydrothermales 

océaniques 7 .Au delà de la connaissance de leur diversité, les éléments génétiques mobiles sont des agents 

majeurs des transferts génétiques horizontaux au sein des communautés microbiennes, et leur étude dans le 

cadre de ce projet est particulièrement justifiée. 

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23. L. A. Levin, H. M. Michener, Limnology and Oceanography 47, 1336 (2002). 

6 Les premières analyses portant sur environ 150 souches d’Archaea ont montré que plus de la moitié d’entre elles sont porteuses d’un ou 

plusieurs génomes extrachromosomiques de taille extrêmement variée, de 3 à plus de 36 kb . De façon surprenante, les différents génomes 

plasmidiques, pourtant échantillonnés sur des sites parfois éloignés géographiquement de plusieurs milliers de miles nautiques, présentent la 

particularité de partager en commun de nombreuses régions génomiques, dont les fonctions restent à établir. 

7 avec des morphologies jusqu’alors inconnues, ce qui préfigure l’existence de familles de virus entièrement nouvelles 

19

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74. S. Burggraf, H. W. Jannasch, B. Nicolaus, K. O. Stetter, System. Appl. Microbiol. 13, 24 (1990). 

75. C. Jeanthon et al., International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52, 765 (May 1, 2002, 2002). 

76. K. Kashefi et al., Int J Syst Evol Microbiol 52, 719 (May 1, 2002, 2002). 

77. D. Gotz et al., Int J Syst Evol Microbiol 52, 1349 (July 1, 2002, 2002). 

78. F. E. Goetz, H. W. Jannasch, Geomicrobiology Journal 11, 1 (1993). 

79. D. A. Bazylinski, C. O. Wirsen, H. W. Jannasch, Appl. Environ. Microbiol. 55, 2832 (1989). 

80. M. Marchand, J.-C. Caprais, S. Corre, E. Jacq, D. Hussein, Oceanologica Acta 17, 177 (1994). 

81. P. Rueter et al., Nature 372, 455 (1994). 

82. H. W. Jannasch, D. C. Nelson, C. O. Wirsen, Nature 342, 834 (1989). 

83. D. C. Nelson, C. O. Wirsen, H. W. Jannasch, Appl. Environ. Microbiol. 55, 2909 (1989). 

84. V. P. Edgcomb, D. T. Kysela, A. Teske, A. de Vera Gomez, M. L. Sogin, PNAS 99, 7658 (May 28, 2002, 2002). 

85. A. Teske, A. Dhillon, M. L. Sogin, Biol Bull 204, 186 (April 1, 2003, 2003). 

86. B. R. T. Simoneit, P. F. Lonsdale, J. M. Edmond, W. C. Shanks III, Applied Geochemistry 5, 41 (1990). 

87. M. B. Black et al., Marine Biology 130, 141 (1997/12//, 1997). 

88. X. L. Otero, M. A. Huerta-Diaz, F. Macias, Applied Geochemistry 18, 1149 (2003/8, 2003). 

89. R. Rachel et al., Aechives of Virology 147, 2419 (2001). 

90. C. Geslin, M. Le Romancer, M. Gaillard, G. Erauso, D. Prieur, Research in Microbiology 154, 303 (2003/5, 2003). 

91. E. Lepage et al., Appl. Environ. Microbiol. 70, 1277 (March 1, 2004, 2004). 

92. C. Geslin et al., Journal of Bacteriology 185, 3888 (July 1, 2003, 2003). 

20


PROPOSITION DE CAMPAGNE A LA MER 

IFREMER - IPEV – IRD 



DESCRIPTIF DE LA CAMPAGNE 

1-Méthodologie détaillée et liste précise des travaux et de leur niveau d’intégration pour atteindre les 

résultats escomptés – stratégie 

La stratégie d'étude proposée comprend les étapes suivantes : 

1-1-Exploration multi échelle des sites hydrothermaux de la dépression sud du bassin de Guaymas et de la marge 

de Sonora 

• Acquisition de données bathymétriques multi-faisceaux du navire afin d'obtenir une couverture complète 

du bassin de Guaymas et de la marge de Sonora. Boite 26°50-27°40N ; 111°10-111°40W La couverture 

de la zone peut être effectuée en 40h à 10Nds avec le sondeur 12 kHz. L'acquisition des données pourra 

se faire entre les plongées Victor. 

• Utilisation du Module de Mesures en Route (MMR) du ROV Victor, équipé du sondeur de sédiments, à une 

altitude de 30 à 50 m afin de cartographier les zones, d’acquérir des indicateurs de sortie de fluides, 

d’identifier la présence de structures géologiques ainsi que de caractériser la texture du substrat. La 

couverture d'une zone de 1 km², à une altitude de 30m (fauchée =3.4 * altitude, vitesse 0.3 m/sec) est 

effectuée en 10h. 

• Un second passage du MMR, équipé de la caméra Haute Résolution OTUS (altitude de 8 à 10 m), 

permettra, lors de transect(s) sur les zones actives, de caractériser différents habitats « caractéristiques » 

des divers écosystèmes étudiés : sédiments, mattes bactériennes, assemblages faunistiques. Ces 

informations seront rassemblées dans un SIG et permettront la sélection de la zone d’étude. La couverture 

d'une zone de 1 km², à une altitude de 10m (portée optique de OTUS) est effectuée en 35h, avec 35% de 

la surface étudiée couverte par l'imagerie (fauchée du SMF = 3.4*altitude, fauchée OTUS = altitude). 

• Un transect (discontinu) (10 m de largeur), survolant les différents habitats caractéristiques des trois 

écosystèmes étudiés, constituera notre zone d'étude. Sur ce transect, 21 points de prélèvements seront 

sélectionnés (tirage aléatoire) en fonction de leur représentativité (Legendre et al., 2002) (1) d'un paysage 

sédimentaire (n=3), (2) d'émission de fluide froid (n=3*3 assemblages potentiels) et (3) du milieu 

hydrothermal (n=3*3 assemblages potentiels). 

Cette stratégie d’exploration multi échelles ainsi que le choix des sites d’études seront validés au cours des 

campagnes Vicking, MoMARETO et MEDECO (Hermes Méditerranée). 

1-2-Caractérisation des gradients physicochimiques dans ces 2 écosystèmes et comparaison avec le sédiment 

extérieur pris comme référence. 

Pour chaque point de prélèvement, le protocole suivant sera suivi : 

1- Marquage de la zone et instrumentation par des capteurs de température autonomes, acquisition d'images 

numériques (photos, photo macro, reconstruction 3D). 

2- Mesures de débit. Le débitmètre utilisé combine 2 techniques complémentaires : la mesure visuelle de la 

vitesse des particules dans un cylindre calibré (Sarrazin et al. en prep) et l'utilisation d'un capteur à film chaud 

(Schultz et al., 1996) adapté aux écosystèmes étudiés dans le cadre du projet EXOCET/D 8 . 

3- Prélèvements d'eau et analyses in situ au sein des microhabitats. Un profil vertical sera également effectué en 

présence de faune érigée (base, milieu, sommet).Le préleveur PEPITO sera utilisé pour les prélèvement 

d’eau. Un sous échantillonnage permettra d'accéder aux facteurs suivants : pH, méthane (Sarradin and 

Caprais, 1996), ammonium, métaux dissous et particulaires (Riso et al., 1997) (Sarradin et al., submitted 

2005), matière organique particulaire et dissous. L'analyseur in situ CHEMINI, nouvelle version de l'Alchimist 

(Le Bris et al., 2000), sera utilisé pour mesurer les concentrations en sulfures dissous (Sarradin et al., 1999) et 

en fer II (Sarradin et al., 2005). L'adaptation dans le système CHEMINI de microélectrodes, développées par 

8 EXOCED/D : EXtreme ecosystem studies in the deep OCEan : Technological Developments 

21



UNISENSE et utilisées sur le microprofileur, permettra de mesurer également le pH et l'oxygène dissous. 

Toutes les mesures et tous les prélèvements seront associés à une mesure de température. 

4- Profils sédimentaires. Des profils de température, pH, oxygène et sulfure dans le sédiment (0-30 cm) seront 

effectués à l’aide du microprofileur développé par UNISENSE. Sur les zones les plus chaudes, seule la 

température sera mesurée pour ne pas endommager les capteurs. 

Carottages. L'utilisation des carottiers tube Victor permettra de mesurer les concentrations en méthane, 

ammonium et métaux dans l'eau interstitielle. La caractérisation des composés organiques présent dans les 

sédiments sera également réalisée. 

1-3-Caractérisation des communautés animales et microbiennes le long des gradients physicochimiques 

(horizontaux et verticaux) afin d’ évaluer les similitudes taxinomiques et fonctionnelles au sein des deux habitats. 

1-3-1-Structures des communautés animales 

La microdistribution de la mégafaune sera analysée à partir de la prise d’images en deux dimensions et la 

réalisation de mosaïques, ou de la reconstruction 3D de petits édifices ou agrégats de faune. 

A chacun des points de prélèvements, les différents compartiments de faune seront échantillonnés de manière 

quantitative: 

- la méiofaune (40-250 µm) par carottier tube 

- la macrofaune (250 µm-1 cm) par carottier-lame ou « mussel pot » selon le substrat 

- la mégafaune par carottier lame, « mussel pot » selon le substrat 

Des prélèvements non quantitatifs de faune (pince, aspirateur) pourront être ajoutés pour des études qualitatives 

(isotopes stables, taxonomie…). 

1-3-2-Structure et activité des communautés microbiennes 

Dans chacun des écosystèmes étudiés (sites hydrothermaux et suitements froids) les communautés microbiennes 

présentes sont distribuées le long de gradients physico-chimiques. Ces gradients étant connus (§1.2) il est 

possible de segmenter les échantillons sédimentaires en sous-échantillons représentatifs d’un contexte 

environnemental particulier, en vue d’une étude polyphasique faisant appel aux techniques microscopiques, 

culturales, moléculaires, ainsi qu’aux mesures d’activités enzymatiques. En complément à l’échantillonage par 

carottier, des modules de colonisation contenant différents types de substrats énergétiques et carbonés seront 

utilisés. 

Les analyses microbiologiques des échantillons récoltés tiendront compte des résultats antérieurs sur les 

écosytèmes étudiés et seront, en fonction des objectifs du projet, centrés sur les points suivants. 

-Analyse de la diversité phylogénétique (ARNr 16S) des communautés microbiennes dans les sédiments et à 

l’interface eau-sédiment (tapis microbiens, modules de colonisation) 

-Structure et fonctionnement du compartiment hétérotrophe et interactions avec le compartiment autotrophe le long 

des profils sédimentaires. 

Dans ce but, la matière organique présente sera caractérisée et l’inventaire des taxons microbiens 

impliqués dans sa dégradation et sa minéralisation sera réalisé par une approche moléculaire (ARNr16S, gènes 

de fonction). En complément, une approche culturale en fermenteur (Postec et al., Soumis; Postec et al., 2005) 

(travaux réalisés à terre) permettra d’étudier l’influence des paramètres physico-chimiques (température, pH, 

transition aérobiose/anaérobiose, nature des sources de carbone et d’énergie) sur la dynamique des peuplements 

hétérotrophes et autotrophes cultivés. Les espèces associées à ces changements environnementaux feront l’objet 

d’une caractérisation physiologique et taxonomique détaillée. Leur physiologie en conditions « in situ » sera 

simulée dans des incubateurs haute température/haute pression hydrostatique. 

-Fonctionnement des cycles biogéochimiques majeurs le long des profils sédimentaires 

Cette partie du programme sera centrée sur l’étude de métabolismes microbiens encore peu ou pas étudiés dans 

les écosystèmes hydrothermaux et de suitements froids. 

-Cycle du carbone. Outre l’interaction autotrophes/hétérotrophes mentionné ci-dessus, l’accent sera mis 

sur l’oxydation anaérobie du monoxyde de carbone (Sokolova et al., 2004) par des mesures d’activités, ainsi que 

des approches culturales et moléculaires. 

-Cycle du carbone et du soufre. L’accent sera mis sur l’étude des micro-organismes sulfato-réducteurs 

(dont ma présence a été montrée par approche moléculaire et mesures d’activité) par une approche culturale, en 

privilégiant ceux impliqués dans l’utilisation des substrats organiques de type hydrocarbure (aliphatiques, 

aromatiques et soufrés) comme source de carbone et d’énergie. 

22



-Cycle de l’azote. L’acent sera mis sur la nitrification et la transition entre nitrification aérobie et anaérobie 

le long des gradients thermique et oxique/anoxique. En effet, à ce jour, l’oxydation aérobie de l’ammonium aux 

températures élevées n’a jamais été signalée, tandis que l’oxydation anaérobie de l’ammonium n’a pas été 

détectée dans les écosystèmes hydrothermaux. L’étude combinera des approches géochimiques (isotopes 

stables) (Schouten et al., 2004), moléculaires (ARN r 16S, gènes de fonction, FISH) (Schmid et al., 2005) et 

culturales (bioréacteurs). 

-Recherche d’éléments génétiques mobiles 

Les éléments génétiques mobiles (plasmides et virus) se propagent naturellement au sein des communautés 

microbiennes, transferrant aux cellules infectés de nouvelles propriétés et influençant par conséquence 

l’adaptabilité de leurs hôtes à leur mileu et en définitive la structure et le fonctionnement des écosystèmes. Ils 

représentent des indicateurs forts pour déceler des échanges entre organismes vivant actuellement dans un 

écosystème unique ou des écosystèmes distants. Ces éléments génétiques mobiles seront recherchés (extraction 

d’ADN extrachromosomique, microscopie électronique en transmission) soit à partir d’échantillons bruts d’eau et 

de sédiments, soit à partir des cultures de micro-organismes (Geslin et al., 2003). Les génomes seront ensuite 

séquencés et comparés. 

Références Bibliographiques 

Geslin, C., Le Romancer, M., Gaillard, M., Erauso, G. and Prieur, D. (2003). Research in Microbiology 154, 303-307. 

Le Bris, N., Sarradin, P., Birot, D. and Alayse-Danet, A. (2000). Marine Chemistry 72, 1-15. 

Legendre, P., Dale, M. R. T., Fortin, M. J., Gurevitch, J., Hohn, M. and Myers, D. (2002). Ecography 25, 601-615. 

Postec, A., Lesongeur, F., Pignet, P., Ollivier, B., Quérellou, J. and Godfroy, A. (Soumis). Extremophiles. 

Postec, A., Urios, L., Lesongeur, F., Ollivier, B., Quérellou, J. and Godfroy, A. (2005). Current Microbiology 50, 138-144. 

Riso, R. D., Le Corre, P. and Chaumery, C. J. (1997). Analytica Chimica Acta 351, 83-89. 

Sarradin, P.-M. and Caprais, J. C. (1996). Analytical Communications 33, 371-373. 

Sarradin, P.-M., Lannuzel, D., Riso, R., Crassous, P., N., L. B., Caprais, J. C., Fouquet, Y., Robert, M. and Fabri, M.-C. (submitted 2005). Deep 

Sea Research. 

Sarradin, P.-M., Le Bris, N., Le Gall, C. and Rodier, P. (2005). Talanta 66, 1131-1138. 

Sarradin, P. M., Le Bris, N., Birot, D. and Caprais, J. C. (1999). Analytical Communications 36, 157-160. 

Schmid, M. C., Maas, B., Dapena, A., van de Pas-Schoonen, K., van de Vossenberg, J., Kartal, B., van Niftrik, L., Schmidt, I., Cirpus, I., 

Kuenen, J. G., Wagner, M., Sinninghe Damste, J. S., Kuypers, M., Revsbech, N. P., Mendez, R., Jetten, M. S. M. and Strous, M. 

(2005). Appl. Environ. Microbiol. 71, 1677-1684. 

Schouten, S., Strous, M., Kuypers, M. M. M., Rijpstra, W. I. C., Baas, M., Schubert, C. J., Jetten, M. S. M. and Sinninghe Damste, J. S. (2004). 

Appl. Environ. Microbiol. %R 70, 3785-3788. 

Schultz, A., Dickson, P. and Elderfield, H. (1996). Geophysical Research Letters 23, 3471-3474. 

Sokolova, T. G., Jeanthon, C., Kostrikina, N. A., Chernyh, N. A., lebedinski, A. V., Stackebrandt, E. and Bonch-Osmolovkaya, E. A. (2004). 

Extremophiles 8, 317-323. 

2-Déroulement général de la mission, durée totale, temps sur zone, période souhaitée. 

Durée totale de la mission : 28 ou 29 jours (en fonction du port d’embarquement et de debarquement et du navire) 

Temps sur zone : 24 jours 

Période souhaitée : hors périodes de cyclone avril-octobre 

3-Calendrier journalier prévisionnel des travaux 

La campagne sera organisée de la façon suivante 

Suivant le navire océanographique disponible la campagne sera organisé en 2 ou 3 legs.Deux tableaux présentent 

les 2 scenarii possibles à la fin de ce document. 

1ére partie (leg 1) 

Deux plongées d’ acquisition des données de microbathymétrie (Victor en mode survey) (MMR/OTUS) : une sur la 

zone d’émission de fluides froids (Sonora Margin) et l’autre sur la zone hydrothermale (Southern Trough) 

Décomposées de la façon suivante : 

MMR à 30m : 20h 

Exploration visuelle : 12h 

MMR/OTUS à 10 m : 20h 

2 plongées d’exploration/ prélèvement (1 sur chaques zones) 

2ème partie (Leg 2 ou Leg 2 et 3) 

14 plongées de type chantier (prélèvements/expérimentation in situ) sur les zones choisies grâce aux relevés de 

microbathymétriques MMR/OTUS 

6 plongées sur les sites hydrothermaux 

6 plongées sur les zones d’émission de fluide froids 

23

2 plongés hors zones actives 



L’acquisition des données bathymétrique pourra être réalisée pendant les transits : 

-à l’arrivée sur zone en début de campagne 

-pendant le transit entre les 2 zones d’études 

-après les plongées MMR/OTUS pendant le changement de module sur Victor 

-entre les plongée de type chantier/prélèvement sur les deux zones d’étude 

En noir scénario Pourquoipas ? en mauve Scénario Atalante 

jour 

1 Mise à disposition 

2 Transit (36h) Bathymétrie multifaisceaux à l’arrivée dans le bassin de Guyamas 

3 Transit Bathymétrie multifaisceaux 

Sur Marge de Sonora (dépression sud du bassin) Plongée Victor 1 MMR/OTUS 

4 Plongée Victor 1 MMR/OTUS 



Transit (4h) Bathymétrie multifaisceaux 

Sur Zone hydrothermale Plongée Victor 2 MMR/OTUS 




Bathymétrie multifaisceaux (24h) – changement de module VICTOR 

Plongée Victor 3 sur zone hydrothermale 

10 Plongée Victor 3 sur zone hydrothermale 

Transit 

Plongée Victor 4 sur marge de Sonora 

11 Plongée Victor 4 sur marge de Sonora 

Transit vers Guaymas /escale 

12 Escale/ Rotation équipe scientifique 

Transit vers Southern Trough/Marge de Sonora 

Plongée Victor 5 Expérimentation in situ/prélèvements 

13-18 Plongées Victor 6-11 Expérimentation in situ/prélèvements sur Southern Trough/Marge de Sonora 

19 Plongée Victor 11 transit vers Marge de Sonora / Plongée Victor 12 

19 Plongée Victor 11 transit vers Guaymas/escale 

20 Escale/ Rotation équipe scientifique 

Transit vers Southern Trough 

Plongée Victor 12 Expérimentation in situ/prélèvements sur Southern trough 

20-26 Plongée Victor 12-18 Expérimentation in situ/prélèvements sur Marge de Sonora 

21-27 

27 Transit 

28 

28 Fin de mise à disposition 

29 

24



25



26



4-Carte de situation générale, cartes de détails, coordonnées géographiques des zones d’études 

Localisation géographique des zones d’études : Bassin de Guaymas : Golfe de Californie, Pacifique Est 

Site hydrothermaux : dépression sud du basin de Guaymas : 27°00N ; 111° 24 W 

Zone d’émission de fluides froids : Marge de Sonora : 27°34 N ; 111°28W 

Distances inter-zones 

Marge de Sonora- Zone hydrothermale (Southern Trough) : 35 miles 

Microbathymétrie MMR/OTUS 

Bathymétrie de 

surface 

27



28






MOYENS A METTRE EN OEUVRE 

1- Navire support, submersible et positionnement 

Navire support : Pourquoi pas ? ou Atalante 

Les campagnes précédentes mettant en œuvre Victor sur les sources hydrothermales (EXOMAR 2005, 

MoMARETO 2006) et sur les zones d’émission de fluides froids (BIOZAIRE, VICKING) on démontré sa capacité 

aux opérations de type chantier. Ces opérations sont largement basées sur l’expérimentation à bord et in situ et 

sur l’acquisition d’un volume d’échantillons et de données importants. Le traitement immédiat à bord des 

échantillons , notamment pour les études de microbiologie (mise en route de cultures, extraction d’ADN et 

conservation à partir des échantillons) nécessite la présence d’un nombre suffisant de scientifiques pour effectuer 

simultanément les plongées Victor (et les quarts associés) et les expérimentations à bord. Le Pourquoi pas ? 

répondra à ce besoin en offrant un nombre de place important pour les scientifiques et surtout une importante 

surface de laboratoires adaptés. 

D’autre part les nouveaux outils d’acquisition de données bathymétrique disponibles sur le Pourquoi pas ? 

permettront de réaliser une cartographie précise du bassin de Guaymas à partir de la surface. 

La réalisation de cette campagne sur l’Atalante necessitera l’embarquement de 2 containeurs laboratoires et 

l’embarquement du containeur logement. D’autre part afin de pouvoir embarquer tous les scientifiques dont la 

présence est necéssaire à la réalisation de ce projet il sera nécessaire de découper la campagne en 3 legs (au lieu 

de 2) afin de pouvoir assurer une rotation de l’équipe scientifique. 

Submersible : VICTOR 6000 

Le schéma de travail proposé repose sur la capacité de VICTOR à travailler aussi bien en mode survey 

(Microbathymétrie et survey vidéo) avec le module route qu’en mode chantier avec le prélèvement de base. 

L’utilisation de Victor en mode survey (MMR) a été validée lors des campagne Momareto et Vicking, en 2006 et 

sera utilisé sur la campagne MEDECO (Hermes, Méditerranée) en 2007. 

D’autre part sur une campagne pluridisciplinaire de type chantier l’utilisation de Victor facilite les échanges entre 

scientifiques, optimise l’observation, le choix des site de prélèvement et les prélèvements eux même et ce en 

temps réel durant la plongée. 

Positionnement : 

GPS et base ultra courte Posidonia du submersible 

2-Equipements de base 

Matériel géré par GENAVIR 

Sondeur multifaisceaux 

VICTOR 6000 et son matériel de mise en œuvre 

Module de prélèvement de base 

Pince à godet 

1 panier mobile motorisé 

3 sondes thermiques Pt 100 

1 préleveur de faune par aspiration 

3 boites isothermes 

1 dispositif de prélèvement d’eau par pompage (PEP) 

4 seringues Titane 

1 distributeur de marqueur (petit poucet) 

caméras vidéo et photo 

1 système de mesure dimensionnelle par 4 lasers (installé sur la caméra principale) 

Carrotiers tubes 

29



Module route équipé du sondeur multifaisceau , du sondeur de sédiment et de la caméra OTUS 

Navette NASA (ascenceur) 

Matériel propre à l’équipe scientifique : 

Instrumentation à intégrer sur VICTOR ou mis en œuvre par VICTOR 

Module vidéo stéréo 

Analyseur chimique in situ CHEMINI 

Préleveur d’eau PEPITO 

Capteur de méthane 

Capteur de débit 

modules de colonisation AISCIS 

Ces équipements ont été développé dans le cadre 

dévelop du STREP EXOCED/D : EXtreme ecosystem 

studies in the deep OCEan : Technological 

Developments et ont été testés avec succés pendant la 

campagne MoMARETO en 2006 

micro profiler UNISENSE (en cours d'acquisition) 

carottiers à lame 

3-Laboratoires et outils de dépouillement informatique nécessaires à bord 

Tous les laboratoire y compris les laboratoires thermostatés. 

Equipements de froid : réfrigérateurs, congélateurs -20°C et –80°C 

Matériel de microbiologie de bord en bon état de fonctionnement : hotte à flux laminaire, autoclave 

PC scientifique 

Postes de travail ADELIE 

4-Personnel spécialisé 

Equipe Victor : 

10 personnes 

5-Produits chimiques et produits radioactifs 

Une liste indicative des principaux produits chimiques est présentée ci-dessous: 

Nom Code UN Formule Quantité Ionisant (O / N) 

PRODUITS 

14C 

O 

RADIOACTIFS 

GAZ COMPRIMES 

Air synthétique 1002 N 2 + O 2 9 + 4 m 3 N 

Azote 1066 N 2 3 x 9 m 3 N 

Hélium 1046 He 9 + 4 m 3 N 

Hydrogène 1049 H 2 9 + 4 m 3 N 

N 2 /CO 2 (80/20) N 2 + CO 2 9 m 3 N 

H 2 /CO 2 (80/20) H 2 + CO 2 9 m 3 N 

N 2 /H 2 /CO 2 (90/5/5) N 2 + H 2 + CO 2 9 m 3 N 

PRODUITS CHIMIQUES 

Acide chlorhydrique 1789 HCl 4 L N 

Acide sulfurique 1830 H 2 SO 4 0.5 L N 

Chloroforme 1888 CHCl 3 3,5 L N 

Ethanol absolu C 2 H 5 OH 51 L N 

Formol 2209 CH 2 O 50L N 

Methanol 1230 CH 4 O 1 L N 

Soude NaOH 10N 500 ml N 

Sulfure de sodium Na 2 S (2.5%) 200 ml N 

Chlorure de Potassium KCl 1,5 kg N 

Chlorure de Sodium NaCl 2,5 kg N 

Eau de mer reconstituee NaCl et minéraux traces 500 g N 

Paraformaldéhyde 30 g N 

Soude (en pastilles) 1824 NaOH 2 kg N 

Sulfure de sodium 1849 Na 2 S 0,25 kg N 

Tampon PBS NaCl, KH 2 PO 4 , Na 2 HPO 4 300 g N 

30






ANALYSE ET TRAITEMENT DES ECHANTILLONS ET DES DONNEES 

Analyses et traitements des échantillons et des données effectués à bord 

Echantillons/ données Traitement Analyse 

Métadonnées 

Logiciel Alamer 

Navigation submersible Arc View-module Adelie / Sumatra 

Microbathymétrie/imagerie OTUS 

MNT pour SIG 

Imagerie Optique 

Arc View-module Exocet/D 

Données in situ CHEMINI (analyseur chimique, 

H 2 S , Fe II , T°C) 

Profileur UNISENSE (H 2 S, O 2 , 

pH) 

Capteur méthane 

Capteur débit 

Température 

Prélèvements discrets Acidification, congélation Mesure pH 

Echantillons biologiques 

Tri 

Dissection 

Fixation (Alcool, Formol,) 

Congélation -80°C, Azote liquide 

Echantillons de sédiment : 

biologie 

Tamisage 

Fixation (Alcool, Formol,) 

Echantillons de sédiment : 

microbiologie 

Modules de colonisations AISCIS 

Sous échantillonnage 

Fixation (Formol/PBS, 

glutaraldehyde) 

Congélation (-80°C ou Azote 

liquide) 

Conditionnement en anaérobiose 

Cultures d’enrichissement, 

Cultures en fermenteur 

Extraction ADN, ARN 

Microscopie optique : dénombrements 

(contraste de phase : epifluoresecence et 

hybridation in situ ) 

Echantillons de sédiments : 

chimie 

Conditionnement 

Extraction de l’eau interstitielle 

pour analyse en chromatographie 

en phase gazeuse (GC) 

Analyses chimique de base (pH, H 2 S,) 

Analyse CH4,NH4, métaux 

Analyse des composés organiques (pyrolisis- 

CG-EM et GC haute résolution) 

Précipités solides Découpe analyse des majeurs (éventuellement) 

Analyses et traitements des échantillons et des données effectués à terre 

Echantillons Traitement/stockage Analyse 

Metadonnées 

Base de données Biocean 

Microbathymétrie 

MNT pour SIG 

Imagerie Optique DVD Plaquage sur MNT 

Mise à l’échelle 

Prélèvements discrets (eau / Acidification 

Polarographie, GC, Microscopie électronique 

particules) 

Congélation 

à balayage (MEB) 

Données courants 

Traitement 

Imagerie optique et acoustique 

Traitement 

31

Echantillons biologiques 

Fixation 

Congélation 



Echantillons microbiologiques Fixation (Formol/PBS , 

glutaraldehyde) 

Congélation -80°C ou Azote 

liquide 

Conditionnement en anaérobiose 

Echantillons de fluides 

Précipités solides 

Archivage des données 

composition 

densité 

biomasse 

diversité/taxinomie 

analyses isotopiques 

Hybridation in situ 

Analyse moléculaire amplification d’ADN et 

d’ADNc, clônage séquençage des ADNr16S 

et de gènes fonctionnels 

Cultures (pression atmosphérique et pression 

in situ), 

Cultures en bioréacteurs 

Isolement de souches. Mesures d’activité 

Recherche de virus et plasmides, Microscopie 

électronique (balayage et transmission). 

Analyses génomique. 

Analyses chimique de base (pH, H 2 S,) 

Analyse CH 4 ,NH 4 , métaux 

Analyse des composés organiques (pyrolisis- 

CG-EM et GC haute résolution) 

Analyses échantillons : microcopie optique, 

microscopie électronique, diffraction X, 

microsonde électronique, fluorescence X 

Les opérations effectuées pendant la campagne seront rassemblées via le logiciel embarqué ALAMER. 

Les metadonnées et les données (associées à leur détenteur) seront ensuite archivées et référencés dans la base 

de données BIOCEAN. Les metadonnées seront consultables sur internet (http://www.ifremer.fr/isi/biocean ) 

Les rapports de plongées et données acquises par le submersible seront accessibles après la mission sous forme 

de CD-ROM. 

Les données vidéoscopiques brutes seront à la disposition des participants de la campagne après engagement de 

confidentialité vis-à-vis des médias. 

Stockage des échantillons 

Le stockages des échantillons sera à la charge des équipes scientifiques impliquées dans le projet en fonction des 

différentes expérimentations prévues. 

Prévision et calendrier de publication des résultats 

A la suite de la campagne, un rapports scientifiques préliminaires relatant les faits marquants sera rédigé et 

communiqués aux participant et aux équipes associés au projet. 

Un article relatant les résultats préliminaires pourra être soumis à une revue sans comité de lecture de type 

InterRidge News. 

L’organisation d‘une réunion post campagne pourra être envisagée dans les 12 à 18 mois après la campagne. 

Les publications et la communication des résultats s'échelonneront entre 6 mois et 4 ans après la fin de la 

campagne, en fonction de l'avancement des travaux de chaque laboratoire impliqué. 

32






EQUIPE SCIENTIFIQUE ET TECHNIQUE 

1-Equipe demandeuse 

Ifremer DEEP/EP et LM2E UMR 6197 (UBO, CNRS Ifremer) 

Chef de projet : Daniel Prieur 

Chef(s) de mission : Anne Godfroy 

1-2-Equipe embarquée 

Nom Prénom 

Arnaud Haond 

Sophie 

Caprais Jean 

Claude 

Chercheur 

Recrutement 2007 

Desbruyères Daniel 

Doctorant 


Doctorant 


Doctorant 

recrutement 2008 

Escobar-Briones 

Elva 

Fabri Marie Claire 

Fouquet Yves /X 

doctorant 

Geslin Claire ou Le 

Romancer Marc 

Institut 

Laboratoi 

re 

Ifremer 

DEEP 

Ifremer 

DEEP 

UMR6197 

UBO 

Ifremer 

DEEP 

UMR6197 

UBO 

UMR61 

97 Ifremer 

UMR6197 

Ifremer 

UAM, 

Mexico 

Ifremer 

DEEP 

Ifremer 

GM 

UMR6197 

UBO 

Spécialité Thématique Responsabilité 

et rôle à bord et à terre 

(données, analyses …) 

Biologiste/ 

Ecologiste 

1-3-2 Biologie des écosystèmes 

hydrothermaux et des Cold 

Seep Génétique des 

populations 

Chimie 1-2 Chimie 

environnement/communaut 

és chimiosynthétiques 

Microbiologie/ 

Ecologie 

microbienne 

Ecologie/ 

taxinomie 


Ecologie 

microbienne 


Ecologie 

microbienne 


Ecologie 

microbienne 

1-3-1 Ecologie microbienne des 


Microbiologie de 

subsurface 



Seep 

1-3-1 Microbiologie des cold seep 

Cycle du méthane 

1-3-1 Microbiologie des 

écosystèmes 

hydrothermaux et des cold 

seep / Tapis microbiens 


écosystèmes 

hydrothermaux 

/Microorganismes du cycle 

du carbone 

Biologie 1-3-2 Biologie des ecosystèmes 

hydrothermaux/ reseau 

trophique 

SIG/ 

biostatistiques 



Seep 

Conditionnement des 

échantillons biologique/ 

Analyses moléculaire/ 

génétique ds population 

analyses et prélèvements 

(Profileur UNISENSE, 

Pepito) 

Interactions bactéries 

minéraux 

1ère 

partie 

Leg1 

2ème 

partie 

Leg 2 

seeps 

2ème 

partie 

Leg 3 

Vents 

X X X 

X X X 

X X X 

Taxinomie X X X 

Cultures/ analyses 

moléculaires 


moléculaires 

Cultures des 

communautés 

microbiennes en 

bioréacteur/analyses 

moléculaire de la 

diversité 

Conditionnements des 

échantillons( sédiments , 

carbonates, cheminées 

hydrothermales), tri, 

recherche de symbiontes 

Microscopie, Analyses 

élémentaire et 

isotopique( 

Formatage des données 

(GIS ArcView, Adelie, 

Alamer, Casino+) pour 

leur intégration dans la 

base de données 

Biocean Contrôle de la 

qualité des données pour 

leur intégration dans la 

base Biocean 

Traitement statistique 

des données d’écologie 

Géologie 1-1 Géologie / Minéralogie Conditionnement des 

échantillons/ Anlyse 

minéralogique FluoX 


Virologie 

1-3-1 Eléments génétiques 

mobiles 

Cultures/ recherches 

d’éléments génétiques 

mobiles/analyse 

moléculaires/génomique 

(X) X (X) 

(X) X X 

(X) X X 

X X X 

X X X 

X (X) (X) 

(X) (X) X 

33

Godfroy Anne 

DEEP 

UMR6197 

Ifremer 


Ecologie 

microbienne 

Hirschler Agnès IRD, 

Marseille 

Microbiologie 

/chimie 

ITA 

UMR6197 Microbiologie/ 

UBO/CNR Ecologie 

S microbienne 

Jetten Mike University 

of 

Nimjgen, 

Pays Bas 

L’Haridon Stéphane UMR6197 Microbiologie/ 

Ecologie 

microbienne 

LeGall Christian 

Lesongeur 

Françoise 

Mortera Gutiérrez 

Carlos 

Navarro-Gonzàlez 

Rafaél 

Normand Alain 

Ollivier Bernard 

Olu-Leroy Karine 

Ondréas Hélène 

Ph-Dstudent 

Prieur Daniel 

Sarradin Pierre 

Marie 

Sarrazin Jozée 

Ifremer 

DEEP 

UMR 

6197 

ifremer 

UAM- 

Mexico 

UAM- 

Mexico 

Ifremer 

GM 

IRD, 

Marseille 

Ifremer 

DEEP 

Ifremer 

GM 

UAM, 

mexico 

UMR6197 

UBO 

Ifremer 

DEEP 

Ifremer 

DEEP 



1-3-1 Chef de mission 

Microbiologie des 

écosystèmes 

hydrothermaux/ 

Microorganismes du cycle 

du carbone/ 

Tapis Microbiens 

1-3-1 Dégradation des 

hydrocarbures 



Cultures des 

communautés 

microbiennes en 

bioréacteur / 

X X X 

Cultures/isolement (X) X 

cultures sous pression 

hydrostatique. Isolement 

par pinces optiques. 

Microbiologie 1-3-1 Cycle de l’azote/Anammox Analyse moléculaire la 

diversité/mesures 

d’activité 

1-3-1 Microbiologie des cold 

seep/ 

Methanogénèse/Methanotr 

ophie 

Chimie 1-2 Chimie environnement/ 

Communautés 

chimiosynthétiques 


Ecologie 

microbienne 


écosystèmes 

hydrothermaux 

/Microorganismes du cycle 

du carbone/tapis bactriens 

Cultures/ analyse 

moléculaires 


(débit, CHEMINI et 

PEPITO) 

Cultures 

Analyses moléculaire de 

la diversité 

Géophysique 1-1 Géophysique/Bathymétrie Traitement et analyse 

des données 

bathymétriques 

Chimie 

organique 

1-2 Chimie organique des 

sédiments 

Analyse des composés 

organiques des 

sédiments, des 

carbonates, et des tapis 

bactériens 

(X) (X) X 

X 

X 

(X) X (X) 

X X X 

X X X 

X (X) (X) 

(X) X X 

Cartographie 1-1 Traitement des données 


Traitement des données 


X 

Microbiologie 1-3-1 Sulfato-réduction/cycle du Cultures/isolement (X) X 

soufre 

Ecologie 1-3-2 Biologie/ecologie des Cold Dissections/Analyses X X (X) 

Seep 

isotopiques 

Réseau trophique 

Géologie 1-1 Géologie/Cartographie/SIG Traitement des données X 


Biologie 1-3-2 Biologie des ecosystèmes 

(X) X X 

hydrothermaux/ reseau 

trophique 


Ecologie 

microbienne 

1-3-1 Chef de projet 

Microbiologie des 

environnements extrêmes 

Chimie 1-2 Chimie environnement/ 

Communautés 

chimiosynthétiques 

Ecologie 1-3-2 Biologie/ecologie des 

écosystèmes 

chimiosynthètiques 

Sokolova Tatyana Moscou Microbiologie 1-3-1 Oxydation du CO 

Mesure d’activité 

Technicien 

Technicien 

Toffin Laurent 

Ifremer 

DEEP 

Ifremer 

DEEP 

UMR6197 

Ifremer 

Instrumentation 1-1 

1-2 

Biologie 1-2 

1-3-2 

Microbiologie/Ec 

ologie 

microbienne 

Instrumentation sur 

VICTOR 

Biologie des écosystèmes 


Seep 

1-3-1 Microbiologie des cold 

seep/ Methanogénèse/ 

Methanotrophie 

Conditionnements des 

échantillons( sédiments , 

carbonates, cheminées 

hydrothermales), tri, 

recherche de symbiontes 

Microscopie, Analyses 

élémentaire et isotopique 

Culture et caractérisation 

des baro-lithotrophes, 

microscopie électronique 

à balayage. 


(débit, CHEMINI et 

PEPITO) Profileur 

UNISENSE 

Ecologie, etude de 

lafaune 

chimiosynthétique : 

distribution spatiale en 

fonction des facteurs du 

milieu 

Cultures/isolement/analy 

se moléculaire de la 

diversité 

Mise en France de 

l’instrumentation 

scientifique 

Préparation/Traitement 

des plongées 

Tri/conditionnements des 

échantillons biologiques 


moléculaires 

X X X 

X X X 

X X X 

(X) 

X 

X X X 

X X (X) 

X X (X) 

34

X Observateur ou 

étudiant Méxicain 

X Com 

UNAM 

mexique 

Ifremer 

D/COM 



Communication Mise en place d’un site web X 

Total Atalante 22 23 23 

Total Pourquoipas? 30 30 

X 

1-2-Equipe à terre 

Nom Prénom 

Institut 

Spécialité 

Responsabilité et rôle 

Laboratoire 

Pierre Legendre Université du 

Québec 

Bio statistiques Traitement statistiques des données 

faune / environnement 

Ricardà Riso UBO Chimie Analyses et traitement des 

échantillons (métaux) 

Stéphane Hourdez CNRS Roscoff Taxinomie 

Moléculaire 

Marie-Anne Cambon- 

Bonavita ou 

Sébastien Duperron 

Ifremer LM2E 

UPMC 


Symbioses 

Pignet Patricia IfremerDEEP/LM2E Chimie Caractérisation chimique sédiment / 

eau interstitielle 

Pedro Morales 

Insitut de Geologie 

UNAM 

Analyse isotopiques 

MEB 

Rosa María Prol Insitut de 

géophysique, UNAM 

Minéralogie Minéralogie des carbonates et des 

édifices hydrotheramux 

1-3-Campagnes auxquelles les membres de l’équipe demandeuse ont participé au cours des 10 dernières 

années 

Nom des campagnes Année Noms des membres de l’équipe 

demandeuse ayant participé (chef de 

mission en caractère gras) 

HOT 96 Nadir Nautile EPR 1996 Desbruyères,Caprais, Desbruyères, 

Thomas G. Thompson, REVEL ‘96, 1996 Sarrazin 

ROPOS, Pacifique NE. 

MARVEL Atalante/Nautile MAR 1997 Caprais, Lesongeur, Fabri, Desbruyères, 

Sarradin 

C.S.S. John P. Tully, BIOROPOS 97, 1997 Sarrazin 

Pacifique NE. 

R/V Atlantis and DSRV Alvin and Jason, 1997 Sarrazin 

Pacifique NE. 

PICO Nadir/Nautile MAR 1998 Olu, Desbruyères, Sarradin, Fouquet, 

SALDANHA Nadir/Nautile/MAR 1998 Olu 

R/V Atlantis and DSRV Jason, Golfe de 1998 Sarrazin 

Californie. 

Thomas J. Thompson, REVEL ‘98, ROPOS, 1998 Sarrazin 

Pacifique NE. 

R/V Atlantis and DSRV Alvin Dive Program, 1998 Sarrazin 

Pacifique NE. 


Pacifique SE. 

VICTOR 1° Thalassa/Victor , MAR 1999 Sarradin 

HOPE Atalante/Nautile, EPR 1999 Fabri, Caprais, Desbruyères, Sarradin 

AMISTAD Atalante/Victor, EPR 1999 Geslin, L’Haridon, Ollivier 

ESCOROV Thalassa/Victor Atlantique 2000 Sarradin 

ZAIANGOBIOL2 Thalassa 2000 Olu, 

ZAIANGO-ROV Atalante/Victor 2000 Olu,Ondréas 


Pacifique NE 

BIOZAIRE 1 Atalante/Victor 2001 Fabri,Olu 

IRIS (Atalante/Victor) 2001 Prieur, Fouquet, L’Haridon 

ATOS Atalante/Victor MAR 2001 Sarradin,Godfroy, Caprais, Desbruyères, 

CARACOLE Atalante/Victor Atlantique Nord 2001 

Olu, Caprais 

BIOZAIRE 2 Atalante/Victor 2001 Fabri, 

R/V Martha Black. ROPOS, Atlantique N 2001 Sarrazin 

35



PHARE Atalante/Victor EPR 2002 Prieur, Fabri,Sarradin,Caprais, Desbruyères, 

L’Haridon, Prieur 

ESCONAUT Atalante/Nautile Méditerranée 2002 Fabri 

ESCOROV Thalassa/Victor Méditerranée 2003 Sarradin 

NAUTINIL Atalante/Nautile Méditerranée 2003 Caprais, Fouquet, Ondréas, 

BIOZAIRE 3 Atalante 2003 Fabri,Olu, Caprais 

NODINAUT Atalante/Nautile Pacifique Sud 2004 Fabri, Caprais 

TUIM 07 Melville/ Jason2 Bassin Nord 2005 Desbruyères, 

Fidjien 

EXOMAR Atalante/Victor MAR 2005 Godfroy, Fabri, Geslin,Sarradin, Fouquet 

ENVAR Europe, Méditérranée 2005 Caprais, 

Vicking Pourquoipas ?/Victor Mer de 2006 Fabri, Olu, Toffin, Caprais 

Norvège 

MoMARETO Pourquoipas ?/Victor 

2006 Desbruyères, Sarradin, Sarrazin, Lesongeur, 

MAR/ATJ 

Godfroy, Ondréas, LeGall, 

BIONIL Meteor/Quest 2006 Olu, 

36



2-Références scientifiques des équipes demandeuses 

Ifremer DEEP/LEP et LM2E UMR6197 (Ifremer/CNRS/UBO) 

Années 2000-2005 

Alain, K., Marteinsson, V. T., Miroshnichenko, M. L., Bonch- 

Osmolovskaya, E. A., Prieur, D. & Birrien, J. L. (2002). 

Marinitoga piezophila sp. nov., a rod-shaped, thermo-piezophilic 

bacterium isolated under high hydrostatic pressure from a deepsea 

hydrothermal vent. International Journal of Systematic and 

Evolutionary Microbiology 52, 1331-1339. 

Alain, K., Olagnon, M., Desbruyeres, D., Page, A., Barbier, G., 

Juniper, S. K., Querellou, J. & Cambon-Bonavita, M. A. (2002). 

Phylogenetic characterization of the bacterial assemblage 

associated with mucous secretions of the hydrothermal vent 

polychaete Paralvinella palmiformis. FEMS Microbiology Ecology 

42, 463-476. 

Alain, K., Pignet, P., Zbinden, M., Quillevere, M., Duchiron, F., 

Donval, J. P., Lesongeur, F., Raguenes, G., Crassous, P., 

Querellou, J. & Cambon-Bonavita, M. A. (2002). Caminicella 

sporogenes gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic spore-forming 

bacterium isolated from an East-Pacific Rise hydrothermal vent. 

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 

52, 1621-1628. 

Alain, K., Querellou, J., Lesongeur, F., Pignet, P., Crassous, P., 

Raguenes, G., Cueff, V. & Cambon-Bonavita, M. A. (2002). 

Caminibacter hydrogeniphilus gen. nov., sp. nov., a novel 

thermophilic, hydrogen-oxidizing bacterium isolated from an East 

Pacific Rise hydrothermal vent. International Journal of Systematic 

and Evolutionary Microbiology 52, 1317-1323. 

Alain, K., Rolland, S., Crassous, P., Lesongeur, F., Zbinden, 

M., Gall, C., Godfroy, A., Page, A., Juniper, S. K., Cambon- 

Bonavita, M. A., Duchiron, F. & Querellou, J. (2003). 

Desulfurobacterium crinifex sp. nov., a novel thermophilic, pinkishstreamer 

forming, chemolithoautotrophic bacterium isolated from a 

Juan de Fuca Ridge hydrothermal vent and amendment of the 

genus Desulfurobacterium. Extremophiles 7, 361-370. 

Alain, K., Zbinden, M., Le Bris, N., Lesongeur, F., Querellou, J., 

Gaill, F. & Cambon-Bonavita, M. A. (2004). Early steps in 

microbial colonization processes at deep-sea hydrothermal vents. 

Environmental Microbiology 6, 227-241. 

Andersen, A., Hourdez, S., Marie, B., Jollivet, D., Lallier, F. H. & 

Sibuet, M. (2004). Escarpia southwardae, sp. nov., a new species 

of vestimentiferan tubeworm (Annelida, Siboglinidae) from West- 

African cold seeps. Canadian Journal of Zoology 82, 980-999. 

Biscoito, M., A. J. Almeida, and M. Segonzac. (2006). 

Preliminary biological characterization of the Saldanha 

hydrothermal field at the Mid-Atlantic Ridge (36°34'N, 32°26'W, 

2200 m). Cahiers de Biologie Marine 47:421-427. 

Biscoito, M., Segonzac, M., Almeida, A. J., Desbruyères, D., 

Geistdoerfer, P., Turnipseed, M. & Dover, C. L. V. (2002). 

Fishes from the hydrothermal vents and cold seeps - An update. 

Cahiers de Biologie Marine 43, 359-362. 

Bonch-Osmolovskaya, E. A., Miroshnichenko, M. L., 

Lebedinsky, A. V., Chernyh, N. A., Nazina, T. N., Ivoilov, V. S., 

Belyaev, S. S., Boulygina, E. S., Lysov, Y. P., Perov, A. N., 

Mirzabekov, A. D., Hippe, H., Stackebrandt, E., L'Haridon, S. & 

Jeanthon, C. (2003). Radioisotopic, Culture-Based, and 

Oligonucleotide Microchip Analyses of Thermophilic Microbial 

Communities in a Continental High-Temperature Petroleum 

Reservoir. Applied and Environmental Microbiology 69, 6143-6151. 

Cambon-Bonavita, M. A., Lesongeur, F., Pignet, P., Wery, N., 

Lambert, C., Godfroy, A., Querellou, J. & Barbier, G. (2003). 

Thermococcus atlanticus sp. nov., a hyperthermophilic Archaeon 

isolated from a deep-sea hydrothermal vent in the Mid-Atlantic 

Ridge. Extremophiles 7, 101-109. 

Cambon-Bonavita, M. A., Raguenes, G., Jean, J., Vincent, P. & 

Guezennec, J. (2002). A novel polymer produced by a bacterium 

isolated from a deep-sea hydrothermal vent polychaete annelid. 

Journal of Applied Microbiology 93, 310-315.. 

Cardigos, F., Colaço, A., Dando, P. R., Avila, S. P., Sarradin, P. 

M., Tempera, F., Conceiçao, P., Pascoal, A. & Serrao Santos, 

R. (2005). Shallow water hydrothermal vent field and communities 

of the D. Joao de Castro Seamount (Azores). Chemical Geology 

224, 153-168. 

Chausson, F., Sanglier, S., Leize, E., Hagège, A., Bridges, C. 

R., Sarradin, P.-M., Shillito, B., Lallier, F. & Zal, F. (2004). 

Respiratory adaptations of a deep-sea hydrothermal vent crab. 

Micron 35, 27-29. 

Chevaldonné, P., Jollivet, D., Desbruyères, D., Lutz, R. A. & 

Vrijenhoek, R. C. (2002). Sister-species of eastern Pacific 

hydrothermal vent worms (Ampharetidae, Alvinellidae, 

Vestimentifera) provide new mitochondrial COI clock calibration. 


Cohen, G. N., Barbe, V., Flament, D., Galperin, M., Heilig, R., 

Lecompte, O., Poch, O., Prieur, D., Querellou, J., Ripp, R., 

Thierry, J. C., Van, D. O. J., Weissenbach, J., Zivanovic, Y. & 

Forterre, P. (2003). An integrated analysis of the genome of the 

hyperthermophilic archaeon Pyrococcus abyssi. Molecular 

Microbiology 47, 1495-1512. 

Colaço, A., P. Bustamante, Y. Fouquet, P. M. Sarradin, and R. 

Serrao Santos. (2006). Bioaccumulation of Hg, Cu and Zn in the 

Azores triple junction hydrothermal vent fields food web. 

Chemosphere 

Colaço, A., Dehairs, F. & Desbruyères, D. (2002). Nutritional 

relations of deep-sea hydrothermal fields at the Mid-Atlantic Ridge: 

a stable isotope approach. Deep-Sea Research I 49, 395-412. 

Colaço, A., Dehairs, F., Desbruyères, D., Bris, N. L. & Sarradin, 

P.-M. (2002). d13C signature of hydrothermal mussels is related 

with the end-member fluid concentrations of H2S and CH4 at the 

Mid-Atlantic Ridge hydrothermal vent fields. Cahiers de Biologie 

Marine 43, 259-262. 

Corre, E., Reysenbach, A.-L. & Prieur, D. (2001). e- 

Proteobacterial diversity from a deep-sea hydrothermal vent on the 

Mid-Atlantic Ridge. FEMS Microbiology Letters 205, 329-335. 

De Mol, B., Kozachenko, M., Wheeler, A., Alvares, H., Henriet, 

J.-P. & Olu-Le Roy, K. (in press). Thérèse Mound: a case study 

of coral bank development in the Belgica Mound Province, 

Porcupine Seabight. International Journal of Earth Sciences. 

Desbruyères, D., Almeida, A., Biscoito, M., Comtet, T., 

Khripounoff, A., Le Bris, N., Sarradin, P. M. & Segonzac, M. 

(2000). A review of the distribution of hydrothermal vent 

communities along the Northern Atlantic Ridge: Dispersal vs. 

environmental controls. Hydrobiologia 440, 201-216. 

Desbruyères, D., Biscoito, M., Caprais, J. C., Colaço, A., 

Comtet, T., Crassous, P., Fouquet, Y., Khripounoff, A., Le Bris, 

N., Olu, K., Riso, R., Sarradin, P. M., Segonzac, M. & 

Vangriesheim, A. (2001). Variations in deep-sea hydrothermal 

vent communities on the Mid-Atlantic Ridge near the Azores 

plateau. Deep-Sea Research I 48, 1325-1346. 

Desbruyères, D., J. Hashimoto, and M. C. Fabri. (2006). 

Composition and biogeography of hydrothermal vent communities 

in Western Pacific back-arc basins. Geophysical Monograph 

166:215-234. 

Desbruyères, D. & Hourdez, S. (2000). A new species of scaleworm 

(Polychaeta: Polynoidae), Lepidonotopodium atalantae sp. 

nov., from the East Pacific Rise at 13°N and 9°50'N. Cahiers de 

Biologie Marine 41, 47-54. 

Desbruyères, D. & Hourdez, S. (2000). A new species of scaleworm 

(Polychaeta: Polynoidae), Lepidonotopodium jouinae sp. 

nov., from the Azores Triple Junction on the Mid-Atlantic Ridge. 


Desbruyères, D., M. Segonzac, and M. Bright. (2006). Handbook 

of deep-sea hydrothermal vent fauna, vol. 18. Landesmuseen, 

Linz. 

Duperron, S., Nadalig, T., Caprais, J. C., Sibuet, M., Fiala- 

Médioni, A., Amann, R. & Dubilier, N. (2005). Dual symbiosis in a 

Bathymodiolus sp. mussel from a methane seep on the Gabon 

Continental Margin (Southeast Atlantic): 16sRNA phylogeny and 

distribution of the symbionts in gills. Applied and Environmental 


Fabri, M. C., J. Galéron, M. Larour, and G. Maudire. (2006). 

Combining the Biocean database for deep-sea benthic data with 

the online Ocean Biogeographic Information System. Marine 

Ecology Progress Series 316:215-224. 

Fardeau, M. L., Salinas, M. B., L'Haridon, S., Jeanthon, C., 

Verhe, F., Cayol, J. L., Patel, B. K. C., Garcia, J. L. & Ollivier, B. 

(2004). Isolation from oil reservoirs of novel thermophilic 

anaerobes phylogenetically related to Thermoanaerobacter 

subterraneus: reassignment of T. subterraneus, 

Thermoanaerobacter yonseiensis, Thermoanaerobacter 

tengcongensis and Carboxydibrachium pacificum to 

Caldanaerobacter subterraneus gen. nov., sp. nov., comb. nov. as 

37

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40






ASPECTS INTERNATIONAUX ET ENGAGEMENTS CONTRACTUELS 

La totalité de la campagne se déroulera dans le Golfe de Californie donc dans les eaux territoriales mexicaines 

Cette campagne sera réalisée en collaboration avec des scientifiques mexicains de l’Université Autonome de 

Mexico. 

En fonction des recommandations présentées par le Bureau des Ressources génétiques concernant «Le Droit 

international, la conservation, l’utilisation et les échanges des ressources génétiques » (brochure éditée par le 

BRG, 16 rue Claude Bernard, 75231 Paris cedex 05) : 

Nous prendrons des contacts, avec les correspondants français et mexicains (et ce par l’intermédaire de nos 

collaborateurs scientifiques mexicains) en charge des questions relatives à la gestion des ressources génétiques 

dans le cadre des accords internationaux sur la gestion de la Diversité Biologique 

http://www.biodiv.org/world/map. afin d’établir un«Accord de transfert de matériel biologique» (Material transfert 

Aggreement, MTA). 

L’exploitation des échantillons sera réalisée en collaboration étroite entre les équipes françaises et mexicaines, en 

fonction de leurs domaines de compétences. 

Les autres participants étrangers devront également signer un «Accord de transfert de matériel biologique» (les 

engageant à n’utiliser les échantillons issus de la campagne BIG qu’à des fins de recherche scientifique. 

Scientifiques mexicains 

A bord : 

Elva G. Escobar Briones 

Investigador Titular B, 

Universidad Nacional Autónoma de México 

Instituto de Ciencias del Mar y Limnología 

Unidad Académica Sistemas Oceanográficos y Costeros 

A.P. 70-305 Ciudad Universitaria 

México D.F.04510, MEXICO 

escobri@mar.icmyl.unam.mx 

Rafael Navarro-González 

Research Professor 

Instituto de Ciencias Nucleares 


Circuito Exterior, Ciudad Universitaria 

Apartado Postal 70-543 

México D.F. 04510, MEXICO 

Carlos A. Mortera Gutiérrez 

Instituto de Geofísica 



A terre : 

Rosa María Prol Ledesma 

Investigador Titular “C”, T.C. 

Instituto de Geofísica, 



41

Pedro A. Morales Puente 

Instituto de Geofísica, 



mopuente@servidor.unam.mx 



Scientifiques étrangers invités : 

Prof M.S.M. Jetten 

Director Institute for Water and Wetland Research (IWWR) 

Department of Microbiology 

Huygens Building Room 02.406 

Faculty of Science 

Radboud University Nijmegen 

Toernooiveld 1 

6525 ED Nijmegen 

The Netherlands 

T +31 24 36 52941 

F + 31 24 36 52830 

m.jetten@science.ru.nl 

Tatyana G. Sokolova, 

Winogradsky Institute of Microbiology, 

Russian Academy of Sciences, 

Moscow, Russia 

tatso@mail.ru 

42



43



44






CURRICULUM VITAE 

DU CHEF DE PROJET ET DU CHEF DE MISSION 

Chef de projet 

PRIEUR, Daniel, Michel 

Né le 7 décembre 1947 à Brest, France 

Marié, 2 enfants (33 et 32 ans) 

Professeur des Universités 1 ère classe,Université de Bretagne Occidentale 

Institut Universitaire Euopéen de la Mer 

UMR CNRS/IFREMER/UBO 6197, Technopôle Brest-Iroise, 29270 Plouzané, France 

Téléphone : 02 98 49 87 04 Télécopie : 02 98 49 87 05 e-mail : daniel.prieur@univ-brest.fr 

Diplômes universitaires 

Maîtrise de Biologie animale (Caen, 1970) 

DEA Océanographie Biologique (Paris, 1971) 

Doctorat 3 ème cycle (Brest, 1974) 

Doctorat es Sciences Naturelles (Brest, 1981) 

Emplois 

1970-1976 Chercheur contractuel à l’Université de Brest 

1976-1983 Attaché de recherche CNRS (Brest) 

1983-1990 Chargé de recherche 1 ère classe CNRS (Brest-Roscoff) 

1990-1996 Directeur de recherche 2 ème classe CNRS (Brest) 

1997-1997 Professeur des universités 2 ème classe (Brest) 

2005 Professeur des universités 1 ère classe (Brest) 

Responsabilités principales 

Equipe de Bactériologie marine depuis 1984 

Département « Adaptation et Diversité en milieu marin » de l’UPR 4601 (90-94) 

Directeur du GDR Bactocéan (92-99) 

Responsable UBO du DEA de microbiologie fondamentale et appliquée depuis 1996 

Vice-Président du Conseil Scientifique de l’UBO (1998-2002) 

Directeur adjoint UMR 6197 (2004-) 

Campagnes à la mer 

Nombreuses campagnes sur les navires côtiers Gwalarn, Pluteus II, Côtes d’aquitaine, St Anne du Portzic, Thalia. 

8 campagnes hauturières sur Le Suroit, Le Nadir, le Jean Charcot, l’Atalante. 

Chef de mission de la campagne Microsmoke, 6 plongées à bord de Cyana, Alvin et Nautile. 

Comités scientifiques 

1982-1989 Comité « Mer » du Ministère de l’Environnement 

1986-1991 Programme National pour l’étude de l’hydrothermalismes océanique (PNEHO) 

1987-1991 Comité Franco-Japonais Starmer 

1988-1992 Comité scientifique du GDR Ecoprophyce 

1997-1999 ODP Programme Planning Group on Deep Biosphere 

1997-1999 ODP France 

1995-1998 Programme Bridge (Royaume Uni) 

1998-2002 Life Science working group (Agence Spatiale Euopéenne) 

2001-2002 European Space Expert Group (Agence Spatiale Européenne) 

1994-2001 Commission OPCB (Ifremer) 

1999-2002 Comité scientifique du GDR Exobiologie 

2002- Comité scientifique du GDR Exobiologie 

1994-1998.1 Comiité ATIPE Microbiologie du CNRS 

1998-2001 Comité scientifque Dorsales (INSU, Ifremer) 

2001- Comité des Programmes scientifiques (CPS du CNES) 

1999- Comité scientifique pour l’étude des échantillons martiens (CNES) 

2001- Comité scientifique du programme Geomex (CNRS) 

2001-2002 Comité de pilotage du Génopôle Ouest. 

2003- Commission OPCB ( Ifremer) 

Expertises : 

Articles scientifiques 

Vie et Milieu, Oceanologica Acta, Publications de l’ORSTOM, Microbial Ecology, Marine Geology, Marine Ecology Progress Series, Symbiosis, 

Archives of Microbiology, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, Journal of Marine Biotechnology. 

Comité d’edition de la revue Biodiversity and Conservation de 1992 à 2000 

Comité d’éditions d’Extremophiles, Journal of Marine Biotechnology, depuis 1998. 

Diffusion des connaissances 

33 Séminaires sur invitation en France et à l’étranger 

187 Communications et affiches dans les congrès nationaux et internationaux : 

Dont 45 sur invitation 

125 Publications dans des revues à comité de lecture 

49 Autres publications 

Formation de chercheurs 

26 DEA 27 Doctorats dont 7 en co-direction 75 Jurys de thèses et HDR 

45

Chef de mission 



GODFROY Anne Françoise 

Née le 23 décembre 19961 à Montpellier (Hérault) 

Française, 2 enfants (9 et 7 ans) 

Adresse professionnelle : Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes UMR6197 

Département Etude des Environnements Profonds 

IFREMER, Centre de Brest, BP70, 29280 Plouzané 

Téléphone professionnel : 33 (0)2 98 22 45 29 

Télécopie professionnelle : 33 (0)2 98 22 47 57 

Messagerie électronique professionnelle : agodfroy@ifremer.fr 

DIPLOMES : 

1982 Diplôme d’études générales, Université des Sciences et Techniques du 

Languedoc, Montpellier 

1983 Licence de Biochimie ,Université des Sciences et Techniques du 


1984 trise de Biochimie, Université des Sciences et Techniques du 


1985 Diplôme d’étude approfondies, Spécialité Bioénergétique et Biologie Microbienne et Végétale. Université 

Scientifique et Médicale de Grenoble. 

1989 Docteur de l’Université des Sciences et Techniques du Languedoc, 

Montpellier II, Spécialité , Biologie des Organismes et des Population. 

2006 Habilitation à Diriger les Recherches : Université de Bretagne Occidentale 

ACTIVITE PROFESSIONNELLE : 

Depuis avril 1989 Cadre de Recherches (C2), Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes UMR6197 

Département Etude des Environnements Profonds, IFREMER, centre de Brest . 

FONCTIONS SUPPLEMENTAIRES : 

Membre élu du CHSCT du centre de Brest de l’IFREMER de 1998 à 2002 

Chargé de cours au Master 2 de Microbiologie des Milieux Aquatiques et Extrêmes de l’Université de Bretagne 

Occidentale (Brest) depuis 2003 

Membre du comité scientifique du GDR Ecchis 

A partir de 2008 Directrice adjointe de l’UMR 6197 

FORMATION A LA RECHERCHE : 

Stagiaires de niveau bac+2 : 8 



Thèses : 2 

VALORISATION SCIENTIFIQUE DES RESULTATS 

24 articles publiés dans des revues à comité de lecture et 3 soumis. 

3 articles dans des revues sans comité de lecture 

2 chapitres d’ouvrage 

9 communications orales lors de congrès, séminaires et cours internationaux 

26 communications affichées lors de congrès internationaux 

CAMPAGNES A LA MER 

1989 : STARMER, Nadir et Nautile (1 plongée), Sud Ouest Pacifique, Bassin Nord Fidjien 

1991 : HERO, Nadir et Nautile (1 plongée), Ride Est Pacifique, 9 et 13°N 

1993 : MAR, Jean Charcot/ Atlantis II et Alvin, Ride médio-Atlantique, TAG et Snake Pit 

1995 : MICROSMOKE, Nadir et Nautile (1 plongée) , Ride médio-Atlantique Snake Pit et Logatchev 

2001 : ATOS, Atalante et Victor, Ride médio-Atlantique, Rainbow et Lucky Strike 

2005 : EXOMAR, Chef de mission ; Atalante et Victor, Ride médio-Atlantique 

2006 : MoMARETO Pourquoi pas ? et Victor, Ride médio-Atlantique 

46






ACCORD DES PERSONNELS EMBARQUANT 

(Chaque embarquant devra indiquer les autres propositions de campagnes pour lesquelles il a donné son accord) 

Marseille le 10 janvier 2007 

Je soussigné Bernard Ollivier, Directeur de Recherche à l'IRD et Directeur 

adjoint de l'UMR 180 (Microbiologie et Biotechnologie des Environnements 

Chauds) confirme mon intérêt à participer à la Campagne BIG. A cette 

occasion, je compte développer des recherches sur les bactéries 

sulfato-réductrices indigènes au Bassin de Guaymas et capables, en 

particulier, d'oxyder les hydrocarbures à haute température. 

Dr Bernard Ollivier 

Directeur de recherche 

IRD (Institut de Recherche pour le Développement) 

Directeur adjoint UMR 180 

Microbiologie et Biotechnologie des Environnements Chauds 

Universités de Provence et de la Méditerranée 

163, Avenue de Luminy, ESIL-GBMA, Case 925 

13288 Marseille, cedex 09, France 

tel: (33) O4 91 82 85 8 

Je soussignée, Agnès Hirschler-Réa, Maître de Conférences effectuant ma recherche à l’IRD, UMR 180, 

Microbiologie et Biotechnologie des Environnements Chauds, confirme mon intérêt à participer à la Campagne 

BIG En effet, mes recherches portant sur le métabolisme des hydrocarbures par les bactéries anaérobies 

strictes, je souhaite entreprendre l’étude de la dégradation des hydrocarbures à haute température par les 

communautés bactériennes présentes dans les sédiments du Bassin de Guaymas. 

A. Hirschler-Réa 

Laboratoire de Microbiologie - LMI 

Universités de Provence et de la Méditerranée-ESIL, Case 925 

163, Avenue de Luminy 

F-13288, Marseille Cedex 09, France 

Anne, 

Je confirme mon intérêt pour la campagne BIG. Pour la période 2008-2009, 

je participe à un Leg d'une campagne sur le METEOR (GUINECO), programmée 

en juillet 2008, et soumets un dossier de demande (WACS) pour une 

campagne dans le Golfe de Guinée. 

Karine Olu - Le Roy 

DRO/Département Environnement Profond 

IFREMER Centre de Brest 

BP 70- 29280 PLOUZANE 

FRANCE 

Jean Claude CAPRAIS du LEP (laboratoire Environnement Profond) Ifremer 

Centre de Brest confirme mon intérêt pour la campagne BIG, concernant la 

periode concernée j'ai également un engagement de campagne dans le Golfe 

de Guinée (campagne WACS) 

Je confirme mon intérêt pour une participation à la campagne BIG 

Claire GESLIN 

Maître de conférences en Microbiologie 

Laboratoire de Microbiologie des Environnements extrêmes 

UMR 6197 (CNRS, UBO, IFREMER) 

Université de Bretagne Occidentale 

Anne, 

Je te confirme mon interet a participer a la campagne Big 2009 et a 

l'exploitation geologique des donnees sur le contexte des sorties de 

47



fluides froids et chauds, 

grace notamment aux cartographies fines realisees par le Module Route 

de Victor. 

Je suis egalement engagée sur le projet Wacs (Golfe de Guinee - chef de 

mission K. Olu) pour l'annee 2009 (?). 

Amicalement 

Helene ONDREAS 

Laboratoire Geochimie et Metallogenie 

Geosciences Marines - IFREMER 

Je confirme par la présente mon intérêt à participer à la campagne BIG d'étude du Bassin des Guaymas. 

Je suis également engagé sur la campagne WACS 

Daniel Desbruyeres 

Responsable du Departement 

Etude des Ecosystemes Profonds (DEEP) 

Centre de Brest de l IFREMER 

BP 70, 29280 Plouzane Cedex France 

Bonjour, 

Suite a une discussion avec Helene Ondreas,je vous confirme mon interet 

a embarquer sur la campagne BIG pour le traitement des donnees 

multifaisceaux Navire et ROV. 

Bonne journee. 

Alain Normand. 

(Bureau Cartographie Ifremer/GM) 

This mail is to confirm that we want to participate in the Guyamas cruise 

Best regards 

Mike jetten 

prof dr ir M.S.M. Jetten 

Director Institute for Water and Wetland Research (IWWR) 

Department of Microbiology 

Huygens Building Room 02.406 

Faculty of Science 

Radboud University Nijmegen 

Toernooiveld 1 

6525 ED Nijmegen 

The Netherlands 

Dear Anne, 

Thank you very much for the letter. I am very much interested in participating to the BIG (Biodiversity and 

interactions at Guaymas) cruise. Studying anaerobic CO-oxidizing microorganisms in deep-sea hot environments 

using cultural, molecular biological and isotopic methods will let us to understand the role of this organisms in 

microbial populations inhabbiting deep-sea hot vents. 

Sincerely yours, 

Tatyana Sokolova. 

onjour Anne, 

Comme deja indiqué l'année dernière je te confirme l'intérêt du 

laboratoire pour cette campagne. Notre intérêt porte sur les données 

microbathymétriques (morphologie des sites, lien avec le volcanisme et 

la tectonique) et sur les échantillons de précipités hydrothermaux et de 

48

sédiments associés. 



Pour l'instant nous prévoyons l'embarquement de H. Ondreas et moi Même, 

en fonction de mon plan de charge et de la période a laquelle sera 

programmée la campagne je pourrais éventuellement me faire remplacer par 

un étudiant. Dans tous les cas les échantillons de solides récoltés 

seront analysés dans le laboratoire. Pour une plus grande efficacité sur 

les echantillons et effectuer les anlyses à bord, une troisième place 

pour J. Etoubleau est souhaitée. Nous discutons egalemnt sur la 

possibilité d'embarquer un cartographe piour le leg de maicrobathymétrie. 

Yves Fouquet 

Salut Anne, 

Je confirme pour le groupe "marges continentales" du LMEE le souhait de 

participation à la campagne BIG dans le bassin de Guaymas de Stéphane 

L'Haridon, un doctorant et moi même. 

Laurent TOFFIN 

Nous sommes impliqués dans les projets de campagnes sur le chantier 

ouest africain: ERIG3D (Janvier 2008?), GUINECO (Juin-Juillet 2008), et 

WACS (2009). 

-- 

Laurent TOFFIN 

Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes (UMR6197) 

IFREMER Centre de Brest 

Anne , 

Je te confirme mon interêt à participer à la campagne BIG 

Françoise Lesongeur 

Ifremer/ DEEP/LM2E 

Je confirme mon interêt à participer à la campagne BIG 

Stéphane L’Haridon 

UBO/ UMR6197 

Bonjour Anne, 

Je suis très intéressée à participer à la campagne BIG qui correspond tout à fait à mes objectifs de recherche, particulièrement 

en ce qui concerne la comparaison d'assemblages de faune inféodés à des écosystèmes chimiosynthétiques de nature 

différente (fluides chauds vs fluides froids).Je suis également engagée sur les campagnes WACS (Golfe de Guinée) et 

ESONET/Momar sur la dorsale médio-Atlantique, aussi demandées en janvier 2007. 

Jozée SARRAZINChercheure e n écologie benthique 

Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la MER 

Département Etude des Ecosystèmes Profonds 

Laboratoire Environnement Profond 

Christian Le Gall, laboratoire DEEP/LEP, 

Je confirme mon interet à participer à la campagne BIG. 

pour le moment je ne sais pas si je suis concerné par d'autres campagnes 

durant cette période. 

Bonjour Anne 

Je te confirme ma participation à la campagne BIG en 2009. 

Je participe également au dossier de demande de campagne WACS proposé 

par Karine OLU en 2009. 

Je suis également impliqué dans la demande de campagne (ESONET MOMAR) 

menée par M. Cannat et Jérôme Blandin en 2008 (19 jours) et 2009 (19 jours). 

-- 

Pierre-Marie SARRADIN 

Ifremer Brest, DEEP/Laboratoire Environnement Profond 

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Enquête sur la valorisation des campagnes MARVEL et PICO (1997-98) 

6- Almeida, A.J. et M.J. Biscoito, 2001. An attempt to quantify the fish fauna observed during submersible dives to the 

hydrothermal vent fields in the Mid-Atlantic Ridge. Poster au 2 nd International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent 

Biology, Brest 8-12 octobre 2001. p. 141. 

7- Bachali S., A. Hassanin, P. Jollès, A. Fiala-Médioni, J. Deutsch, 2000. Une nouvelle classe de lysozymes ? Journées 

"Dorsales 2000", 20-22 Septembre, Roscoff. 

1- Bartsch, I. 1997. Copidognathus nautilei (Acari: Halacaridae), a new mite from a hydrothermal vent field in the Mid-Atlantic 

Ridge. Cahiers de Biologie Marine 38: 29-33. 

7- Biscoito, M., A. J. Almeida, D. Desbruyères & A. Colaço, 2002. Ambientes hidrotermais profundos. O caso do Ponto Triplo 

dos Açores. Plenary talk at the “7º Encontro Nacional de Ecologia”, Ponta Delgada, Açores, 14-16 November, 2002. 

5/7- Biscoito, M., Desbruyères, D. ,Barriga, F., 1998. Recent discoveries in the Azorean deep-sea hydrothermal vent area with 

special emphasis on the fish fauna. In: IIIème Simposium Fauna and Flora of the Atlantic Islands. Ponta Delgada, p. 66-69 

1- Biscoito, M., and L. Saldanha. 2000. Occurrence of Chaceon affinis (Decapoda: Geryonidae) in the vicinity of a hydrothermal 

vent site on the Mid-Atlantic Ridge. Journal of Crustacean Biology 20:128-131. 

6- Biscoito, M., Geistdoerfer, P., Segonzac, M. et A.J. Almeida, 2001. Fishes from the hydrothermal vents and cold seeps - An 

update. Poster au 2 nd International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest 8-12 octobre 2001. p. 144. 

1- Biscoito, M. and others 2002. Fishes from the hydrothermal vents and cold seeps - An update. Cahiers de Biologie Marine 43: 

359-362. 

5/7- Blythe, S., Brindley, J., Cann, J., Dando, P., Desbruyères, D., Dixon, D., Fowler, M., Gebruk, A., Halley, J., Jenkyns, H., 

Jollivet, D., Kutzenov, A., Murton, B., Richards, K., Rudnichi, M., Sloan, H., Southward, A., Southward, E., Tunnicliffe, V., Tyler, 

P., VanDover, C. L., Walker, C. ,Wilson, J., 1994. Diversity of Vent Ecosystem. In: J. Cann, C. L. Van Dover, C. Walker, P. 

Dando and B. Murton (ed.) Bridge Workshop n°4. BRIDGE, Plymouth, UK, p. 1-39. 

1- Calder, D. R., and W. Vervoort. 1998. Some hydroids (Cnidaria: Hydrozoa) from the Mid-Atlantic ridge, in the North Atlantic 

Ocean. Zoologische Verhandelingen 319: 3-67. 

1- Cambon-Bonavita, M.-A., Lesongeur F., Pignet, P., Wery, N., Lambert, C., Godfroy, A., Querellou, J. & G. Barbier, 2002. 

Themococcus atlanticus sp. nov., a hyperthermophilic Archeon isolated from a deep-sea hydrothermal vent in the Mid-Atlantic 

Ridge. Extremophiles 7:101-109. 

14- Camus, L., 1996. Effets de l’hypercapnie sur l’équilibre acide-base de l’hémolymphe de crevettes: comparaison entre une 

espèce littorale et une espèce hydrothermale. In: Océanologie Biologique. Université P-et-M-Curie (Paris 6), CNRS, Roscoff 

7- Caprais, J. C., Sarradin, P. M., Comtet, T. ,Aminot, A., 1997. Description de l'environnement chimique des communautés de 

moules des sites hydrothermaux Lucky Strike et Menez Gwen, MAR. In: Colloque National Dorsales. Paris. 

5/7- Caprais, J.-C., Sarradin, P.-M., Comtet, T. ,Aminot, A., 1997. Description of the environment of hydrothermal mussel beds 

at Lucky Strike and Menez Gwen vent fields, MAR. In: F. Gaill, F. Lallier and D. Desbruyères (ed.) Biologie des Sources 

Hydrothermales Profondes, Journées d'échange du programme Dorsales. Cahiers de Biologie Marine, Roscoff, France, p. 115. 

6- Casse N, Pradier E., Demattei M-V, Bigot Y and M. Laulier. Mariner transposons are a genetic parasites occurring in the 

genomes of hydrothermal invertebrates. Présentation orale au 2 nd International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent 

Biology, Brest 8-12 octobre 2001. p. 51. 

2- Casse N., Pradier E., Bigot Y., Loiseau C. and M. Laulier. 2000. Mariner, a mobile DNA transposon in the genomes of several 

hydrothermal invertebrates. InterRidge News 9 (1): 15-1. 

1- Casse, N., E. Pradier, M.-V. Demattei, Y. Bigot, and M. Laulier, 2002. Mariner transposons are widespread genetic parasites 

in the genome of hydrothermal invertebrates. Cahiers de Biologie Marine 43: 325-328. 

1- Charmantier-Daures, M. ,Segonzac, M., 1998. Organ of Bellonci and sinus gland in three decapods from Atlantic 

hydrothermal vents: Rimicaris exoculata, Chorocaris chacei, and Segonzacia mesatlantica. Journal of Crustacean Biology, 18, 

213-223. 

6- Charmasson, S., Agarande, M., Neiva-Marques A.-M., Sarradin P.-M. & D. Desbruyères 2002. Natural radioactivity (U-Th) in 

biota from hydrothermal vents : First results (Poster). 

15- Chausson, F., 2001. Adaptation au milieu hydrothermal profond: étude comparative de l'écophysiologie respiratoire des 

Crustacés Décapodes des Dorsales Pacifique et Atlantique. Thèse de doctorat Université Pierre et Marie Curie (Paris 6), 184pp. 

Laboratoires d’accueil : DRO-EP/IFREMER-Brest, Station Biologique de Roscoff. 

6- Chausson, F., Bridges, C. R., Sarradin, P.-M. ,Lallier, F. H., 2000. Micro-environments and functional properties of 

haemocyanin: correlation or divergence? The case of two hydrothermal vent crabs. In: XII th International Conference on 

Invertebrate Dioxygen Binding Proteins. Roscoff, France. 

6- Chausson, F., Camus, L., Lallier, F. H., Sarradin, P. M., Truchot, J. P. ,Bridges, C. R., 2000. Haemocyanin function in deepsea 

hydrothermal decapod crustaceans. In: Society for Experimental Biology. Exeter, UK. 

7- Chausson, F., Colaço, A., Sarradin, P. M., Desbruyères, D., Dehairs, F. ,Lallier, F. H., 2000. Quelques aspects sur la biologie 

de Segonzacia mesatlantica, crabe hydrothermal de la dorsale médio-atlantique. In: Journées DORSALES 2000. Roscoff, 

France. 

6- Chausson, F., Colaço, A., Sarradin, P. M., Desbruyères, D., Dehairs, F. ,Lallier, F. H., 2000. Some aspects of the biology of 

Segonzacia mesatlantica, an hydrothermal vent crab from the Mid-Atlantic Ridge. In: 9th Deep-Sea Biology Symposium. 

Galway, Ireland. 

6- Chausson, F., Sarradin, P. M. ,Lallier, F. H., 2000. Effects of hypercapnia on haemolymph acid-base status in a deep-sea 

hydrothermal vent shrimp, Rimicaris exoculata. In: Society of Experimental Biology. Exeter, UK. 

7- Chevaldonné, P., Jollivet, D., Feldman, R. A., Desbruyères, D., Lutz, R. A. ,Vrijenhoek, R. C., 1997. Phylogenetic 

relationships between deep-sea hydrothermal-vent and cold-seep polychaetes of the genus Branchipolynoe (Polychaeta: 

Polynoidae) inferred from sequences of mitochondrial genes (16S rRNA and COI). In: F. Gaill, F. Lallier and D. Desbruyères 

(ed.) Biologie des Sources Hydrothermales Profondes, Journées d'échanges du Programme Dorsales. Cahiers de Biologie 

Marine, Roscoff, p. 111-148. 

50



6- Chevaldonné, P., Jollivet, D., Feldman, R. A., Desbruyères, D., Lutz, R. A. ,Vrijenhoek, R. C., 1997. Molecular phylogeny of 

deep-sea hydrothermal-vent and cold-seep polychaetes of the genus Branchipolynoe (Polychaeta: Polynoidae): results from 

mitochondrial genes (16S rRNA and COI). In: 1st International Symposium on Deep-Sea Hydrothernmal Vent Biology. Funchal, 

Madeira, PT. 

1- Chevaldonné, P., Jollivet, D., Feldman, R. A., Desbruyères, D., Lutz, R. A. ,Vrijenhoek, R. C., 1998. Commensal scale-worms 

of the genus Branchipolynoe (Polychaeta: Polynoidae) at deep-sea hydrothermal vents and cold seeps. Cahiers de Biologie 

Marine, 39, 347-350. 

6- Colaço, A., Dehairs, F., Desbruyères, D., Marques, A. ,Alayse, A.-M., 1997. Isotopic composition of some organisms from the 

Lucky Strike and Menez Gwen hydrothermal vent areas (Azores Triple Junction, Mid-Atlantic Ridge). POSTER. In: C. Wilson 

(ed.) 1st International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology. InterRidge, Funchal, Madeira, Portugal, p. 28 

1- Colaço A., Desbruyères D., Comtet, T. & Allayse, A.-M. 1998. Ecology of the Menez Gwen hydrothermal field (Mid-Atlantic 

Ridge/Azores Triple Junction). Cahiers de Biologie Marine de Roscoff 3-4 (39): 237-240. 

6- Colaço, A., Desbruyères, D., Comtet, T., Dehairs, F. ,A.-M., A., 1997. Ecology of the Menez Gwen hydrothermal vent field 

(Mid-Atlantic Ridge / Azores Triple Junction). In: C. Wilson (ed.) 1st International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent 

Biology. InterRidge, Funchal Madeira Portugal, p. 16. 

6- Colaço A. & Guezennec J. 1998. Fatty acids as trophic biomarkers in the food web of Lucky Strike and Menez Gwen 

hydrothermal field. AMORES final meeting. Lisbon June 1998. 

6- Colaço A., Dehairs F., Fiala-Médioni A., Dando P., Marques A. & Sarradin P.-M. 1998. Hydrothermal vent community food 

web and stable isotopes. AMORES final meeting. Lisbon-June 1998. 

7- Colaço A. 2001. Fontes hidrotermais de profundidade: o que são e qual o papel da Investigação Portuguesa. Encontros com 

a Ciência. Universidade Lusófona. Portugal. 

5- Colaço A., Dehairs F., Desbruyères D., Khripounoff A., Marques A. & Sarradin P.-M. 1999. Trophic Ecology of ATJ 

hydrothermal sites. Geophysical Research Abstracts 1 (2): 420 

6- Colaço, A., Dehairs, F. Desbruyères, D., Guezennec, J., Le Bris, N., & P.-M. Sarradin, 2000. Nutritional relations of deep-sea 

hydrothermal fields at the Mid-Atlantic Ridge. 9 th Deep-Sea Biology Symposium, June 2000, Galway, Ireland. p.19. 

6- Colaço, A., Dehairs, F., Desbruyères, D., Khripounoff, A., Marques, A. ,Sarradin, P.-M., 1999. Trophic ecology of ATJ 

hydrothermal sites. In: 34th European Marine Biology Symposium. Departamento de Biologia, Universidade dos Açores 

Sociedade "Afonso Chaves", Ponta Delgada Sao Miguel Açores Portugal. 

1- Colaço, A. Dehairs, F., Desbruyères, D. 2002. "Nutritional relations of deep-sea hydrothermal fields at the Mid-Atlantic Ridge: 

a stable isotope approach" Deep-Sea Research I 49 (2002) 395-412. 

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2001. p. 192. 

2- Marques, A., and A. J. Almeida. 2000. Fishes from the Lucky Strike hydrothermal vent field and the surrounding deep-sea 

environment: Crista 3 Cruise results. InterRidge News 9:16-17. 

1- Marques, A., and F. Porteiro. 2000. Hydrothermal vent mussel Bathymodiolus sp. (Mollusca: Mytilidae): Diet item of 

Hydrolagus affinis (Pisces: Chimaeridae). Copeia 3:806-807 

6- Martins, I. Costa, F., Porteiro F., Cravo A. et R. Serrao-Santos, 2001. Poster au 2 nd International Symposium on Deep-Sea 

Hydrothermal Vent Biology, Brest 8-12 octobre 2001. p. 193. 

54



2- Martins, I., V. Costa, F. Porteiro, and R. S. Santos. 2000. Mercury levels in mussels and shrimp from the Mid-Atlantic Ridge 

(MAR) hydrothermal vent fields. InterRidge News 9:17-20. 

14- Martins, I. 2000. Bioacumulação de mercúrio em organismos das fontes hidrotermais da Crista Média do Atlântico” 

Licenciatura em Biologia Marinha e Pescas, IMAR-Dop/ Universidade do Algarve 

1- Martins I, Costa V, Porteiro F, Cravo A, Santos RS, 2001. Mercury concentrations in invertebrates from Mid-Atlantic Ridge 

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7- Martins, I. Costa, F., Porteiro F., Cravo A. et R. Serrao-Santos, 2000. “Total Mercury Levels In Organisms At 

Hydrothermal Vents Of The Mid-Atlantic Ridge” (Poster) Congresso Ibérico de Contaminação Ambiental, em Faro. Portugal. 

6- Martins, I. Costa, F., Porteiro F., Cravo A. et R. Serrao-Santos 2000- “Bioaccumulation of mercury in organisms at 

hydrothermal vents” (presentation oral) Congresso de Toxicologia Aquática, na cidade de Cádiz 

6- Martins, I. Costa, F., Porteiro F., Cravo A. et R. Serrao-Santos 2002- Mercury levels in organisms from MAR hydrothermal 

vents (poster). II MOMAR Workshop. Towards planning of seafloor Observatory programs for the MAR region. Horta. 14-17 

Juin, 

6- Martins, I. Costa, F., Porteiro F., Cravo A. et R. Serrao-Santos 2003- Mercury levels in organisms from MAR hydrothermal 

vents (poster). Workshop "Biogeography and Biodiversity of Chemosynthetic Ecosystems: Planning for the Future", SOC, UK, 

16-18 June. 

1- Mattison, R. G., Abbiati, M., Dando, P. R., Fitzsimons, M. F., Pratt, S. M., Southward, A. J. & Southward, E. C., 1998. 

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14- Mercier, E., 1998. Identification de marqueurs microsatellites chez une annélide hydrothermale profonde à développement 

direct : Branchipolynoe seepensis (Polychaeta, Polynoydae) Université Paris XI, p. 28. 

1- Nègre-Sadargues G., R. Castillo and M. Segonzac (2000) Carotenoid pigments and trophic behaviour of deep-sea shrimps 

(Crustacea, Decapoda, Alvinocarididae) from a hydrothermal area of the Mid-Atlantic Ridge. Comparative Biochemistry and 

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3- Olu, K., 1998. Biological mapping of the recently discovered Rainbow hydrothermal field (MAR, 36°14N). In: AMORES Final 

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1- Pond, D. W., Bell, M. V., Dixon, D. R., Fallick, A. E., Segonzac, M. ,Sargent, J. R., 1998. Stable-carbon-isotope composition 

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1- Pond, D. W., Gebruk, A., Southward, E. C., Southward, A. J., Fallick, A. E., Bell, M. V. ,Sargent, J. R., 2000. Unusual fatty 

acid composition of storage lipids in the bresilioid shrimp Rimicaris exoculata couples the photic zone with MAR hydrothermal 

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1- Pond, D. W., Sargent, J. R., Fallick, A. E., Allen, C., Bell, M. V. ,Dixon, D. R., 2000. δ 13 C values of lipids from phototrophic 

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1- Pond, D. W., Segonzac, M., Bell, M. V., Dixon, D. R., Fallick, A. E. ,Sargent, J. R., 1997. Lipid and lipid carbon stable isotope 

composition of the hydrothermal vent shrimp Mirocaris fortunata: evidence for nutritional dependence on photosynthetically fixed 

carbon. Marine Ecology Progress Series, 257, 221-231. 

1- Pond, D., Dixon, D. ,Sargent, J., 1997. Wax-ester reserves facilitate dispersal of hydrothermal vent shrimps. Marine Ecology 

Progress Series, 146, 289-290. 

7- Pruski A. et D. Dixon, 2001. Age-related differences in DNA repair capability in vent and non-vent mussels. Poster au 2 nd 

International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest 8-12 octobre 2001. p. 215. 

7- Ramirez-Llorda, E. et P.A. Tyler, 2001. Conservative gametogenesis and enhanced fecundity of Caridean shrimp from the 

Mid-Atlantic Ridge. Poster au 2 nd International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest 8-12 octobre 2001. p. 

217. 

15- Ramirez-Llorda, E., 2000. Reproductive patterns of deep-sea invertebrates related to energy availability. PHD Thesis, 

University of Southampton, U.K. 202pp. Laboratoire d’accueil : SOC, Southampton, UK. 

6- Ramirez-Llodra, E., P.A. Tyler & M. Baker. 1998. Reproductive patterns and population structure of hydrothermal vent 

invertebrates from the Mid-Atlantic Ridge, Lisboa, Portugal, 16-18 November 1998; AMORES final meeting. Oral presentation. 

6- Ramirez-Llodra E. & P.A. Tyler. ‘Reproductive patterns of caridean shrimp from the Mid-Atlantic Ridge hydrothermal vents’, 

Ponta Delgada, Azores, 13-17 September, 1999. 34 th European Marine Biology Symposium. Poster. 

1- Ramirez-Llodra E., P.A. Tyler et J.T.P. Copley 2000 Reproductive patterns of three caridean shrimp, Rimicaris exoculata, 

Chorocaris chacei and Mirocaris fortunata (Caridea: Decapoda) from hydrothermal vents along the Mid-Atlantic Ridge. Journal 

of the Marine Biological Association of the UK 80: 473-484. 

7- Richardson, C.A., S.V. Proud, P. R. Dando and R. Stöhr Laboratory observations on the survival and activity of hydrothermal 

vent mussels. Challenger Society Meeting on Extreme Marine Environments, Plymouth 30 March - 3 April 1998. 

7- Richardson, C.A., S.V. Proud, P.R. Dando & R Stöhr Laboratory observations of the survival and activity of hydrothermal vent 

mussels Poster abstract presented at the BRIDGE Science Meeting, Bristol January 6-7 1998 

6- Riso, M., Cosson, R., Rousse, N., Fiala-Médioni, A., Caprais, J. C. ,Sarradin, P. M., 1998. Relationship between vent 

organisms and their environment. 1. Bioaccumulation and concentration factors. In: AMORES FINAL MEETING. Lisbon (poster). 

15- Rousse N., 1999. La bioaccumulation des métaux et les procédés de détoxication chez le Mollusque bivalve symbiotique 

dépendant de la chimiosynthèse, Bathymodiolus sp. Thèse Université Pierre et Marie Curie. Laboratoire ARAGO, 66650 

Banyuls sur Mer. 

6- Rousse, N., Boulègue, J., Pin, S., Cosson, R. P. ,Fiala-Medioni, A., 1999. The role of metallothioneins in the mytilid 

Bathymodiolus sp. from the Atlantic Ridge. 950040 / 3 (2/2) In: AMORES FINAL MEETING. Lisbon (poster). 

6- Rousse, N., Cosson, R. P., Fiala-Médioni, A. ,Sarradin, P. M., 1998. Relationship between vent organisms and their 

environment. 2. Bioaccumulation and distribution of metals among organs and subcellular fractions. In: AMORES FINAL MEETING. 

Lisbonne (poster),. 

1- Rousse, N., Fiala-Médioni, A. ,Sarradin, P. M., Biscoito, M. ,Saldanha, L., 2000. Occurrence of Chaceon affinis (Decapoda: 

Geryonidae) in the vecinity of a hydrothermal vent site on the Mid-Atlantic Ridge. Journal of Crustacean Biology, 20, 128-131. 

55



1- Rousse N., J. Boulègue, R. Cosson, A. Fiala-Médioni,1998. Bioaccumulation des métaux chez le Mytilidae hydrothermal 

Bathymodiolus sp., de la ride médio-Atlantique. Oceanologica Acta, 21(4): 597-607. 

2- Saldanha, L., and M. Biscoito. 1997. Fishes from the Lucky Strike and Menez Gwen hydrothermal vent sites (Mid-Atlantic 

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6- Sarradin, P. M., Caprais, J. C., Comtet, T. ,Aminot, A., 1997. Description of the environment of hydrothermal mussels beds at 

Lucky Strike and Menez Gwen vent fields, MAR. In: First International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology,. 

Madeira, Portugal. 

7- Sarradin, P. M., Caprais, J. C., Rodier, P. ,Kerdoncuff, J., 1997. Study of the chemical environment of hydrothermal 

organisms: water sampling and dissolved gases analysis gy HSS/GC/HWD-FID-FPD. In: workshop "Marine Analytical Chemistry 

for Monitoring and Oceanographic Research". Brest. 

1- Sarradin P.M., Caprais J.C., Riso R., Comtet T., Aminot A. 1998. Brief account of the chemical environment at hydrothermal 

vent mussel beds on the MAR. Cah. Biol. Mar. 39: 253-254. 

1- Sarradin P.M., Caprais J.C., Riso R., Kérouel R., Aminot A. 1999. Chemical environment of the hydrothermal mussel 

communities in the Lucky Strike and Menez Gwen vent fields, Mid Atlantic Ridge. Cah. Biol. Mar. 40: 93-104. 

1- Shank, T. M., R. A. Lutz, and R. C. Vrijenhoek. 1998. Molecular systematics of shrimp (Decapoda: Bresiliidae) from deep-sea 

hydrothermal vents, I: Enigmatic "small orange" shrimp from the Mid-Atlantic Ridge are juvenile Rimicaris exoculata. Molecular 

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1- SIGVADOTTIR, E., and D. Desbruyères. 2003. Two new species of Spionidae (Annelida: Polychaeta) from Mid-Atlantic Ridge 

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1- Tudge, C. C., Jamieson, B. G. M., Segonzac, M. ,Guinot, D., 1998. Spermatozoal ultrastructure in three species of 

hydrothermal vent crab, in the genera Bythograea, Austinograea and Segonzacia (Decapoda, Brachyura, Bythograeidae). 

Invertebrate Reproduction and Development, 34, 13-23. 

1- Tyler, P.A. and D.R. Dixon 2000 Temperature/pressure tolerance of the first larval stage of Mirocaris fortunata from Lucky 

Strike hydrothermal vent field. Journal of the Marine Biological Association of the UK 80: 739-740. 

1- Tyler, P.A. et C.M. Young 1999 Reproduction and dispersal and hydrothermal vents and cold seeps. Journal of the Marine 

Biological Association of the UK 79, 193-208 

6- Vagne A., Desbruyères, D., Sarradin P.-M. Le Bris, N., and F. Lecornu, 2001. Mosaicking tool for hydrothermal vent 

community study. "Second Symposium on Hydrothermal Vent Biology", Brest 8-12 octobre 2001. p. 232. 

6- Vangriesheim, A. ,Khripounoff, A., 1998. Particule flux near the Lucky Strike hydrothermal site (Mid Atlantic Ridge). In: 

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1- Villanueva R., Segonzac M., Guerra A. 1997. Locomotion modes of deep-sea cirrate octopods (Cephalopoda) based on 

observations from video recordings on the Mid-Atlantic Ridge. Mar. Biol. 129: 113-122. 

6- Von Cosel, R., Comtet, T. ,Krylova, E. M., 1999. Bathymodiolus (Bivalvia: Mytilidae) from hydrothermal vents on the Azores 

Triple junction and the Logatchev hydrothermal field, Mid-Atlantic Ridge. The Veliger, 42, 218-248.1998. Relationship between 

vent organisms and their environment. 3. Metal detoxification mechanisms, metallothioneins functions question. In: AMORES 

FINAL MEETING. LISBONNE (poster). 

1- Von Cosel, R., Comtet, T. ,Krylova, E. M., 1999. Bathymodiolus (Bivalvia: Mytilidae) from hydrothermal vents on the Azores 

Triple Junction and the Logatchev hydrothermal field, Mid Atlantic Ridge. The Veliger, 42, 218-248. 

1- Waren, A. et Bouchet, P. 2001. Gastropoda and Monoplacophora from hydrothermal vent and seeps; New taxa and records. 

The Veliger 44:116-231. 

6- Wery N., Cambon M.-A., Lesongeur F., Monsan P. & Barbier G. (1998). New species of Thermococcus isolated from deepsea 

hydrothermal vents of the Mid-Atlantic ridge ; screening of thermophilic strains with biodegradation activities on carbonate 

substrates. Thermophiles'98, Brest (France), 6-11 septembre 1998 (Communication affichée) 

7- Wery N., Cambon-Bonavita M.-A., Lesongeur F. et Barbier G. (2000). Caractérisation moléculaire de souches thermophiles 

anaérobies hétérotrophes, issues de sources hydrothermales de la ride médio-Atlantique. Colloque “ Microbiologie anaérobie ” 

de la Société Française de Microbiologie, Lyon (France), 5-6 avril 2000 (Communication orale). 

6- Wery N., Derennes V., Lesongeur F., Pignet P., Godfroy A., Cambon-Bonavita M.-A. & Barbier G. (2000). Molecular 

classification of anaerobic thermophiles isolated from deep-sea hydrothermal vents on the Mid-Atlantic Ridge and description of 

a new bacterial genus. Extremophiles 2000, The third international congress on extremophiles, Hamburg-Harburg (Allemagne), 

3-7 septembre 2000 (Communication orale). 

6- Wery N., Moricet J.-M., Lesongeur F., Pignet P., Cambon-Bonavita M.-A., Kato C. & Barbier G. (2000). Description of a new 

anaerobic thermophile isolated from a deep-sea hydrothermal vent and affiliated to the genus Clostridium; Effect of hydrostatic 

pressure on growth. Extremophiles 2000, The third international congress on extremophiles, Hamburg-Harburg (Allemagne), 3-7 

septembre 2000 (Communication affichée). 

1- Wery N., Lesongeur F., Pignet P., Derennes V., Cambon-Bonavita M.-A., Godfroy A. & Barbier G. (2001). Marinitoga camini 

gen. nov., sp. nov., a rod-shaped bacterium belonging to the order Thermotogales isolated from a deep-sea hydrothermal vent, 

International Journal of Systematics and Evolutionary Microbiology. 51: 495- 504. 

1- Wery, N., Cambon-Bonavita, M.-A., Lesongeur, F. & G. Barbier, 2002. Diversity of anaerobic heterotrophic thermophiles 

isolated from deep-sea hydrothermal vents of the Mid-Atlantic Ridge. FEMS Microbiol. Ecol. 41: 105-114. 

1- Wery N., Moricet J.-M., Cueff V., Jean J., Pignet P., Lesongeur F., Cambon-Bonavita M.-A. & Barbier G. 

(2001).Caloranaerobacter azorensis gen. nov., sp. nov., an anaerobic thermophilic bacterium, isolated from a deep-sea 

hydrothermal vent. International Journal of Systematics and Evolutionary Microbiology 51 : 1789-1796. 

6- Wéry, N., Cambon, M.A., Lesongeur, F., Monsan, P., & G. Barbier (1998). New species of Thermococcus isolated from 

deep-sea hydrothermal vents on the Mid-Atlantic Ridge ; screening of thermophilic strains with biodegradation activities on 

carbonate substrates. Thermophiles '98, Brest France (Poster). 

15- Wery N. (2000) Caractérisation de micro-organismes thermophiles de la ride médio Atlantique. Description de deux 

nouveaux genres bactériens. Thèse de l'Université de Toulouse III – Paul Sabatier en "Biologie-Santé-Biotechnologie" soutenue 

le 23 novembre 2000 à l'IFREMER, Centre de Brest, Plouzané (France). Laboratoire d’accueil: IFREMER, DRV-VP-LCMM. 

1- Young, P. S. 1998. Cirripeds (Crustacea) from the Mid-Atlantic Ridge collected by the submersible Nautile. Cahiers de 

Biologie Marine 39: 109-119. 

56



1- Young, P.S.. 2001. Deep-sea Cirripedia Thoracica (Crustacea) from the northeastern Atlantic collected by French 

expeditions. Zoosystema 23: 705-756. 

57



58



DEEP-SEA HYDROTHERMAL VENTS:A NATURAL POLLUTION LABORATORY, (EVK3 CT1999-00003) 

ATOS cruise 

Nom de la campagne : ATOS 

Programme : VENTOX (EVK3-CT1999-00003) 

Navire : NO Atalante 

Engins lourds : Victor 

Dates de la campagne : Juin, juillet 2001 

Zone : Atlantique , Açores 

Chef de projet : D. Desbruyères 

Organisme : Ifremer 

Chef de mission 1 : P.M. Sarradin 


Chef de mission 2 : Organisme : 

Fiche remplie par : P.M. Sarradin Date de rédaction de la fiche : janvier 2004 

Adresse : Ifremer DRO EP, BP 70 F-29280 PLOUZANE 

Email : Pierre.Marie.Sarradin@ifremer.fr Tel : 02 98 22 46 72 Fax : 

Résultats majeurs obtenus : 

Etude des adaptations et processus spécialisés développés par les organismes hydrothermaux et leurs communautés microbiennes associées en 

réponse à un environnement « toxique ». 

Nombre 

1 Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées SCI 21 

2 Publications dans d’autres revues scientifiques 9 

3 Publications sous forme de rapports techniques 7 

4 Articles dans des revues / journaux grand public 16 

5 Publications de résumés de colloques 

6 Communications dans des colloques internationaux 

33 

dont communications orales 

dont posters 

7 Communications dans des colloques nationaux 

12 


dont posters 

8 Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités …) 

9 Applications (essais thérapeutiques ou cliniques, AMM …) 

10 Brevets 

11 Publications d’atlas (cartes, photos) 

12 Documents vidéo-films 1 

13 Publications électroniques sur le réseau Internet 

14 DEA ayant utilisé les données de la campagne 2 

15 Thèse ayant utilisé les données de la campagne 

16 Validation des données terminée : .... 

17 Transmission au SISMER Oui : .... 

18 Transmission à d’autres banques de données Biocean Oui : .... 

19 Transmission à d’autres équipes Oui : .... 

20 Considérez-vous l’exploitation en cours : .... X 

Rubrique 1: Refereed papers published 

Biscoito, Manuel, Michel Segonzac, Armando J. Almeida, Daniel Desbruyères, Patrick Geistdoerfer, Mary Turnipseed & Cindy Van Dover. 

2002. Fishes from the hydrothermal vents and cold seeps – An update. Cahiers de Biologie Marine (2002) 43: 359-362. 

Casse, N., E. Pradier, M.-V. Demattei, Y. Bigot, and M. Laulier, 2002. Mariner transposons are widespread genetic parasites in the genome 

of hydrothermal invertebrates. Cahiers de Biologie Marine 43: 325-328. 

Compère P., Martinez A.S., Charmentier-Daures M., Toullec J.-Y., Goffinet G. et Gaill F. 2002 Does sulfide detoxication occur in the gills 

of the hydrothermal vent shrimp, Rimicaris exoculata? C. R. Biologies, 325, 591-596 

Chausson, F., Sanglier, S., Leize, E., Hagège, A., Bridges, C. R., Sarradin, P.-M., Shillito, B., Lallier, F. H. and Zal, F. (2003). Respiratory 

adaptations to the deep-sea hydrothermal vent environment: the case of Segonzacia mesatlantica, a crab from the Mid-Atlantic ridge. 

Micron in press. 

Colaço, A., F. Dehairs and D. Desbruyères. (2002). Nutritional relations of deep-sea hydrothermal fields at the Mid-Atlantic Ridge: a stable 

isotope approach. Deep-Sea Research I, 49, 395-412. 

Colaço, A., F. Dehairs, D. Desbruyères, N. Le Bris and P.M. Sarradin. (2002). d13C signature of hydrothermal mussels is related with the 

end-member fluid concentrations of H2S and CH4 at the Mid-Atlantic Ridge hydrothermal vent fields. Cahiers de Biologie Marine, 

43(3-4), 259-262. 

Desbruyères D., A. Almeida, M. Biscoito, T. Comtet, A. Khripounoff, N. Le Bris, P. M. Sarradin and M. Segonzac (2002) A review of the 

distribution of hydrothermal vent communities along the Northern Atlantic Ridge: Dispersal vs. environmental controls. Hydrobiologia, 

440, 201-216. 

Denis, F. , Vachoux c., Gauvry L., Leignel V., Hardivillier Y., Salin C., Cosson R.P. et M. Laulier, 2002. Characterization and expression of 

a Bathymodiolus sp. metallothionein gene. Cahiers de Biologie Marine 43.: 329-332. 

Dixon, D.R., Dixon, L.R.J., Pascoe, P.L. & Wilson, J.T. (2001). Chromosomal and nuclear characteristics of deep-sea hydrothermal-vent 

organisms: correlates of increased growth rate. Marine Biology 139, 251- 255. 

Dixon, D.R., Dixon, L.R.J., Shillito, B. and Gwynn, J.P. 2002. Background and induced levels of DNA damage in Pacific deep-sea vent 

polychaetes: the case for avoidance. Cah. Biol. Mar. 43, 333-336. 

59



Dixon, D.R., Pruski, A.M., Dixon, L.R.J. ad Jha, A.N. 2002. Marineinvertebrate eco-genotoxicology: a methodological overview. 

Mutagenesis, 17, 495-507. 

Geret F., Riso R., Sarradin P.M., Caprais J.C. and Cosson R.P., 2002. Metal bioaccumulation and storage forms in the shrimp, Rimicaris 

exoculata, from the Rainbow hydrothermal field (Mid-Atlantic Ridge), preliminary approach to the fluid-organism relationship. Cahiers 

de Biologie Marine. 43, pp 43-52. 

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Le Bris N., P. M. Sarradin, D. Birot and A. M. Alayse-Danet (2000) A new chemical analyzer for in situ measurement of nitrate and total 

sulfide over hydrothermal vent biological communities. Marine Chemistry, 72, 1-15. 

Le Bris N., P. M. Sarradin and S. Pennec (2001) A new deep-sea probe for in situ pH measurement in the environment of hydrothermal vent 

biological communities. Deep-Sea Research I, 48, 1941-1951 

Lopez-Garcia, Phillipe H., Gaill F., Moreira D., 2003, Autochtonous eukayotic diversity in hydrothermal sediment and experimental 

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Postec A, Breton CL, Fardeau ML, Lesongeur F, Pignet P, Querellou J, Ollivier B, Godfroy A (2005) Marinitoga hydrogenitolerans sp. nov., 

a novel member of the order Thermotogales isolated from a black smoker chimney on the Mid-Atlantic Ridge. International Journal of 

Systematic and Evolutionary Microbiology 55:1217-1221 

Postec A, Lesongeur F, Pignet P, Ollivier B, Quérellou J, Godfroy A (Soumis) Continuous enrichment cultures: enlarge our knowledge of 

microbial diversity at deep-sea vent chimneys, and a glance into microbial interactions. Extremophiles 

Postec A, Urios L, Lesongeur F, Ollivier B, Querellou J, Godfroy A (2005) Continuous Enrichment Culture and Molecular Monitoring to 

Investigate the Microbial Diversity of Thermophiles Inhabiting Deep-Sea Hydrothermal Ecosystems. Current Microbiology 50:138-144 

Pruski, A.M. and D.R. Dixon (2002). Effects of cadmium on nuclear integrity and DNA repair efficiency in the gill cells of Mytilus edulis 

L. Aquatic Toxicology, 52, 127-137. 

Sanglier, S., Leize, E. Van Dorsselaer, A. and Zal, F. 2003. Comparative ESI-MS study of ~2.2MDa native hemocyanins from deep-sea and 

shore crabs: from protein oligomeric state to biotope. Journal of the American Society of Mass Spectrometry, 14: 419-429. 

Shillito, B., Jollivet, D., Sarradin, P.-M., Rodier, P., Lallier F.H., Desbruyères, D. & Gaill, F. 2001. Temperature Resistance of Hesiolyra 

bergi, A Polychaetous Annelid Living on Deep-Sea Vent Smoker Walls. Marine Ecology Progress Series, 216, 141-149. 

Wilson, J.T., D.R. Dixon & L.R.J. Dixon (2002). Numerical chromosomal aberrations in the early life-history stages of the marine 

tubeworm, Pomatoceros lamarckii (Polychaeta: Serpulidae). Aquatic Toxicology, 59, 163-175. 

Zbinden M., Martinez I., Guyot F., Cambon-Bonavita M.A. and Gaill F. (2001). Zinc-iron sulphide mineralization in tubes of hydrothermal 

vent worms. Eur. J. Mineral., 13 : 653-658. 

Rubrique 2 : Non- refereed papers 

Biscoito, M., Segonzac, M. & Almeida, A. J. . New zoarcid fish species from deep-sea hydrothermal vents of Atlantic and Pacific Oceans. 

InterRidge News, 10 (1): 2001, 15-17. 

Biscoito, M. J., Almeida, A. J. & Santos, R. S. 2002 – The Ichthyology of the MAR Hydrothermal vents and the MOMAR Initiative. P. 26 in 

R. S. Santos, J. Escartin, A. Colaço & A. Adamczewska (Eds). Towards planning of sea-floor observatory programs for the MAR region. 

(Proceedings of the II MOMAR Workshop). Arquipélago, Suplem. 3: XII+64pp. 

Dixon, D.R., J.T. Wilson, L.R.J. Dixon. Toxic vents and DNA damage. InterRidge News Vol. 9(1), 2000, 13-14. 

Dixon, D.R., Dando, P.R., Santos, R.S. and Gwynn, J.P. (2001). Retrievable cages open up new era in deep-sea vent research. InterRidge 

News, 10, 21-23. 

Dixon, D.R., P.M. Sarrdin, L.R.J. Dixon, A. Khripounoff, A. Colaço and R. Serrao Santos (2002). Towards unravelling the enigma of vent 

mussel reproduction on the Mid-Atlantic Ridge, or when ATOS met Cages!. InterRidge News, 11, 14-17. 

Sarradin, P. M., Desbruyères, D., Dixon, D., Almeida, A. J., Briand, P., Caprais, J. C., Colaço, A., Company, R., Cosson, R., Cueff, V., 

Dando, P., Etoubleau, J., Fabri, M. C., Fiala Medioni, A., Gaill, F., Godfroy, A., Gwynn, J., Hourdez, S., Jollivet, D., Khripounoff, A., 

Lallier, F., Laulier, M., Le Bris, N., Martins, I., Mestre, N., Pruski, A., Rodier, P., Serrão Santos, R., Shillito, B., Zal, F., & Zbinden, M. 

- ATOS cruise, R/V L'Atalante, ROV Victor, June 22nd - July 21st 2001. InterRidge News, 10 (2): 2001, 18-20. 

Sarradin, P.M. (2001) Campagne ATOS. Lettre aux Médias, 65, 6. 

Sarradin, P.M. et les participants à la campagne (2001) Campagne ATOS (N.O. L'Atalante et Victor 6000, 22 juin-21 juillet). La lettre 

Dorsales, n°8/12, 14-16. 

Sarradin, P.M., K. Olu-Le Roy, H. Ondréas, M. Sibuet, M. Klages, Y. Fouquet, B. Savoye, J.F. Drogou and J.L. Michel. (2002). Evaluation 

of the first year of scientific use of the french ROV Victor 6000. Underwater Technology 2002, Tokyo, Japan (extended abstract 

RUBRIQUE 3 : Technical reports 

RUBRIQUE 4 : Press and Media 

LabHorta : Diário de Notícias. Friday, 25 August 2000, p. 20 (report in a national newspaper) (Copy sent to Brussel August 2000). 

Açoriano Oriental. 13565, 25 August 2000, p. 3 (report in a regional newspaper) (Copy sent to Brussels August 2000). 

Plymouth Evening Herald – June 20, 2001.Secrets of the deep explored. (Copy included with this report) 

BBC Radio 4 June 14 2001 – The Leading Edge. Interview with David Dixon on VENTOX. 

Saber Açores, No. 21, August 2001 p10-11. Oasis de vida no mar junto aos Açores. (Copy included with this report) 

Saber Açores, No. 21, August 2001 p12-15. Estranhas formas de vida. (Copy included with this report) 

Visao, No. 442, 30 Agosto a 5 Setembro 2001 p. 86-91. Estranhas formas de vida. (Copy included with this report) 

RTP Açores. Telejornal 22/7/2001 Entitled “Atalante na Horta” 

RTP-Açores Telejornal 27/6/2001 Entitled “Missão VENTOX” 

Açoriano Oriental, nº 13953 20 of June 2001. Universidade defende criação de um laboratório subaquático. page: 1 (news on a regional 

newspaper) 

Açoriano Oriental, nº 13953 20 of June 2001. Projecto VENTOX cria bases para laboratório subaquático. Page 5 (news on a regional 

newspaper) 

Infociências (Folha informativa da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa), {Almeida, A} 96, pp.15-16 (copy included with 2 nd 

Annual Report). 

National Geographic Portugal, February 2003. Campos Hidrotermain. Golpe de Sorte. (Text Gonçalo Pereira), 6 pages (Report on 

VENTOX project) (copy included with Final Report). 

Sciences Ouest, 2001, n°181, 8.. Campagne Océanographique ATOS : les secrets de la vie à 2000m de profondeur. 

60



Le Télégramme, 15 juin 2001, n°17412. Milieux extrêmes : l'Ifremer en campagne.. 

Ouest France, 15 juin 2001. La vie dans les milieux extrêmes de l'Atlantique Nord : Ifremer cherche en eau profonde.. 

RUBRIQUE 5 : Conference proceedings 

RUBRIQUE 6 : Conferences Internationales 

B-Deos meeting in Cardiff (25-27 July 2001) LABHORTA- a land base laboratory for vent studies Colaço, A.; Serrão Santos, R.; and the 

VENTOX partners – Poster. 

Biscoito, M., Segonzac, M., Almeida, A.J., Desbruyères, D., Geistdoerfer, P, Turnipseed, M. and Van Dover, C. Fishes from the 

hydrothermal vents and cold seeps – an update. 2 nd International Symposium on Deep sea Hydrothermal vent Biology (Brest, 8- 

12/10/2001). 

Biscoito, M., A. J. Almeida, D. Desbruyères & A. Colaço, 2002. Ambientes hidrotermais profundos. O caso do Ponto Triplo dos Açores. 

Plenary talk at the “7º Encontro Nacional de Ecologia”, Ponta Delgada, Açores, 14-16 November, 2002. 

Casse N., Pradier E., Demattéi M-V., Bigot Y. and M. Laulier. Mariner transposons are genetic parasite occuring in the genome of 

hydrotermal invertebrates. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal vent biology, Brest 8-12 October 2001. 

Charmasson, S., M. Agarande, A. M. Neiva Marques, P. M. Sarradin and D. Desbruyères (2003). Natural radioactivity (U-Th) in biota from 

hydrothermal vents: first results. 5th Applied isotope Geochemistry conference, Heron Island, Australia. Poster. 

Chausson F., Menard L., Lallier F.H. (2003) Acid-base responses to hypercapnia in hydrothermal vent crustaceans. 10th Deep-Sea biology 

symposium, Coos Bay, Oregon, Aug 25-30 2003. Poster. 

F. Chausson, A. Colaço, F. Dehairs, D. Desbruyères, F. Lallier, P.M. Sarradin, (2000). Some biological aspects of Segonzacia mesatlantica, 

an hydrothermal vent crab from the Mid Atlantic Ridge. Colloque Galway & Journées Dorsales, Roscoff. 

Colaço, A.; Santos, R.; VENTOX party. -LABHORTA- a land base laboratory for vent studies- II MOMAR workshop- Towards planning of 

seafloor observatory programs for the MAR region. Horta, 15 -17 June 2002 – Poster. 

Company, R., Serafim, A. & Bebianno, M.J., 2002. Antioxidant defence mechanisms in hydrothermal vent mussels Bathymodiolus azoricus 

from Mid-Atlantic Ridge. MOMAR Workshop. Azores. Portugal. 15-17 June 2002-Poster. 

Company, R., Serafim, A. & Bebianno, M.J., 2002. Antioxidant Defence Mechanisms in Mussels Bathymodiolus azoricus from Mid- 

Atlantic Ridge Hydrothermal Vent Sites. International Symposium on the Environment & Analytical Chemistry-ISEAC 32. 17-21 June 

2002. Plymouth, UK-Poster.Company, R., Serafim, A. & Bebianno, M.J., 2002. Antioxidant enzymes in hydrothermal vent mussels 

Bathymodiolus azoricus from Menez-Gwen and Lucky Strike. XI Seminário Ibérico de Química Marinha. Faro. Portugal. 2-4 April 

2002-Poster. 

Company, R., Serafim, A., Bebianno, M.J., Cosson, R. & A. Fiala-Médioni . Effect of cadmium, copper and mercury on antioxidant 

enzyme activities and lipid peroxidation in the gills of the hydrothermal vent mussel Bathymodiolus azoricus” Abstract accepted to 

PRIMO 12, Florida, June 2003 

Cosson R.P., Chausson F., Bustamante P., Laulier M. and Fiala-Médioni A., 2001. First experimental induction of metallothioneins in 

Bathymodiolus azoricus and B. thermophilus at the atmospheric pressure. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal 

vent biology, Brest 8-12 October 2001. 

Dando, P. R. Growth and maintenance of vent mussels, Bathymodiolus azoricus, in aquaria. 2 nd International Symposium on Deep-Sea 

Hydrothermal Vent Biology, Brest, October 2001. (oral presentation) 

Desbruyères, D. (2002). Hydrothermal vents as functional parts of the deep-sea. Gift of the Earth Ceremony, Horta Faial (Portugal), 20 juin 

2002. 

Desbruyères, D. (2002). Biology and ecological zonation of Lucky Strike and Menez Gwen hydrothermal vent fields. Campos 

Hidrothermais dos Açores. Management Workshop, Horta Faial (Portugal), 18-19 juin 2002 

Desbruyères, D. (2002). MOMAR : The ecosystem dynamics and how to study it. Momar 2 workshop, Horta Faial (Portugal), 15-17 juin 

2002. 

De Cian, M.C., Andersen, A.C.& Lallier, F>H. Carbonic anydydrase loaclization in the gills of two hydrothermal vent crustaceans, 

Bythograea thermydron and Rimicaris exoculata. 10th Deep-Sea biology symposium, Coos Bay, Oregon, Aug 25-30 2003. Poster. 

Denis F., Vachoux C., Gauvry L., Leignel V., Salin C., Cosson R.P. and Laulier M., 2002. Metallothionein in Bathymodiolus sp.: 

complementary DNA characterization and quantification of expression. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal 

vent biology, Brest 8-12 October 2001. 

Dixon, D.R. 2001. In vitro Komet method using haemocytes. Industrial Genotoxicology Group Meeting at Institute of Medicine, London, 

17 December 2001. 

Dixon, D.R. and L.R. Dixon. Summer spawning in the MAR vent shrimp Rimicaris exoculata: fact or fallacy? Island Ecosystems 

Symposium – A Conservation and Molecular Approach, Madeira, Portugal, 5-9 March 2001. 

Dixon, D.R., Dando, P.R., Santos, R.S, Gwynn, J.P. and the VENTOX Consortium. Retrievable cages open up a new era in deep-sea vent 

research. 2. Reproductive studies. MOMAR Workshop held in Horta, Açores, Portugal, 15-17 June 2002. 

Dixon, D.R., Dixon, L.R.J., Shillito, B. and Gwynn, J.P. Background and induced levels of DNA damage in Pacific deep-sea bent 

polychaetes: the case for avoidance. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal vent biology, Brest 8-12 October 

2001. 

Felícia, H., Serafim, A., Company, R. & Bebianno, M.J., 2002. Metallothionein levels in fishes from Lucky Strike hydrothermal vent site. 

MOMAR Workshop. Azores. Portugal. 15-17 June 2002-Poster. 

Godfroy A., Postec A., Ollivier B., et Quérellou J. Etude de la biodiversité microbienne obtenue par enrichissement en fermenteur de microorganismes 

thermophiles issus d'échantillons hydrothermaux de la Dorsale Médio-Atlantique. Premier Colloque d'Ecologie Microbienne 

Carry le Rouet, France. 2003 

Godfroy A., Postec A., Lesongeur F., Ollivier B. and Quérellou J.Use of continuous culture to access the cultivable thermophilic microbial 

diversity from deep-sea hydrothermal vent. Deep Sea Vent and Seep Biology Symposium 2005 , La Jolla, Californie, USA 

Godfroy A., Cambon-Bonavita M.A., Geslin C., Leromancer M.,Prieur D. and Quérellou J. Microbial diversity in marine extreme 

environements. ASLO 2005 Aquatic sciences Meeting Salt Lake City,Utah, USA 

Godfroy A., Postec, A., Lesongeur, F. Ollivier B. and Quérellou J. Use of continuous culture to access the cultivable thermophilic microbial 

diversity from deep-sea hydrothermal vent. Extremophile 2004, Cambridge Maryland USA 

Hourdez, S., Jollivet, D., Lallier, F. H., Schaeffer, S. W., Toulmond, A. and Fisher, C. R. (2003). Evolution of hemoglobins in deep-sea 

hydrothermal vent polynoids. In 13th International Conference on Invertebrate Dioxygen Binding Proteins. Mainz, DE. 

61



Jollivet, D., D., Le Guen, T., Comtet & F., Viard. (2001) Bathymetric cline of allozyme frequencies despite high levels of gene flow 

between azorean mytilid populations. poster, Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology. 8-12 October, 

Brest 2001, France. 

Lallier F.H., Chausson F., Sarradin P.M. Adaptation to hypercapnia in hydrothermal vent crustaceans. Second International Symposium on 

Deep-Sea Hydrothermal vent biology, Brest 8-12 October 2001 

Postec A., Urios L., Ollivier B., Quérellou J. and Godfroy A. Microbial diversity obtained by enrichment culture in bioreactor of 

thermophilic microorganisms from hydrothermal samples of the Medio?Atlantic Ridge. Symposium d'Ecologie Microbienne « ISME 

2004 », Cancun, Mexique. 


thermophilic microorganisms from hydrothermal samples of the Medio?Atlantic Ridge. Colloque « Micro-organismes et environnement 

», Rennes, France. 2003 


thermophilic microorganisms from hydrothermal samples from the Mid-Atlantic Ridge Thermophiles 2003 Exeter, Grande 

Bretagne.2003 

Postec A.; Laurent Urios ; Bernard Ollivier ; Joël Querellou and Anne Godfroy .Microbial diversity obtained by enrichment culture in 

bioreactor of thermophilic microorganisms from hydrothermal samples of the Medio-Atlantic Ridge. Poster, Thermophiles 2003, Exeter , 

UK September 2003 

Sanglier S., Van Dorsselaer A., Zal F., Leize E. (2002Poster. Comparative ESMS study of native hemocyanins from deep-sea and shore 

crabs with molecular weights up to 2 341 kDa. ) 50th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, Orlando, USA, 2-6 

Juin. 

Sanglier S., Van Dorsselaer A., Zal F., Leize E. (2002) Poster. Comparative ESMS study of native hemocyanins from deep-sea and shore 

crabs with molecular weights up to 2 341 kDa. EuroConference on Fundamental Studies and Applications, Wilbad Kreuth, Allemagne, 

21-26 Juillet. 

Sarradin P. M. (2001) New approach to the study of biogeochemical interactions in hydrothermal vents. Second International Symposium on 

Deep-Sea Hydrothermal Vents Biology, Quartz, Brest, 8-12 octobre, pp. 19. 

Sarradin, P.M., K. Olu-Le Roy, H. Ondréas, M. Sibuet, M. Klages, Y. Fouquet, B. Savoye, J.F. Drogou and J.L. Michel. (2002). Evaluation 

of the first year of scientific use of the french ROV Victor 6000. Underwater Technology 2002, Tokyo, Japan (extended abstract) 

Zal, F., Sanglier, S., Leize, E. and Van Dorsselaer, A. (2003). Comparative ESI-MS Study of ~2.2 MDa Native Haemocyanins from Deepsea 

and Shore Crabs : from Oligomerization to the Biotope of the Crabs. In 13th International Conference on Invertebrate Dioxygen 

Binding Proteins. Mainz, DE. 

RUBRIQUE 7 : Conférences Nationales 

Almeida, A. J., M. Biscoito & P. Briand - First attempt to assess the distribution and abundance of fish at the hydrothermal vent fields and 

surrounding areas of the Azores Triple Junction (Mid-Atlantic Ridge, 36ºN-37ºN). Oral presentation to RIF2003 – “Deuxièmes 

rencontres de l’ichthyologie en France”, Paris 25-28 March 2003. 

Desbruyères, D. (2001) Dynamique des écosystèmes et observation à long terme. La vision d'un écologiste. Atelier "Observation à long 

terme sur les dorsales océaniques", Roscoff, 29-31 octobre. 

Desbruyères, D. (2002). Ecologie des milieux abyssaux extrêmes : l'indispensable approche non invasive. Journée Imagerie Optique Sous- 

Marine, POP, Maison des Technologies, Toulon, 28 novembre 2002. 

Godfroy A., Anne Postec, Bernard Ollivier et Joël Querellou. Etude de la diversité microbienne obtenue par enrichissement en fermenteur de 

micro-organismes thermophiles issus d’échantillons hydrothermaux de la Dorsale Médio-Atlantique. Communication orale Colloque 

d’Ecologie Microbienne , Carry le Rouet , France Avril 2003. 

Guerreiro, V., L. Narciso, A. J. Almeida & M. Biscoito – Lipid profile of deep-sea fishes from the Lucky Strike and Menez Gwen 

Hydrothermal vent sites (Mid-Atlantic Ridge). Poster presentation to RIF2003 – “Deuxièmes rencontres de l’ichthyologie en France”, 

Paris 25-28 March 2003. 

Hardivillier Y., Leignel V., Denis F. and Laulier M.. Cloning of metallothionein gene and characterization of cDNA sequence in 

hydrothermal mussel, Bathymodiolus sp. XIX ème forum des jeunes oceanographes. Nantes – 4/04/2002.Poster. 

Le Bris, N., P.-M. Sarradin and R. Vuillemin In situ chemical analysis to characterise the environment of deep-sea hydrothermal vent 

fauna.. Sensor and Biosensors, Toulouse, France 2001. 

Le Bris, N., P.M. Sarradin, R. Vuillemin, D. Birot, S. Pennec and B. Leilde. Analyseurs et capteurs pour l'étude des écosystèmes 

chimiosynthétiques profonds. Atelier Experimentation et Instrumentation, INSU-Ifremer-Meteo-France, 28-30 janv. 2003, Brest, France. 

Teixeira, S. C., F. Dehairs, A. J. Almeida & M. Biscoito – Evaluation of heavy metals spatio-temporal variations in otoliths and vertebrae of 

fishes from the Azorean hydrothermal vent areas: Lucky Strike and Menez Gwen (Mid-Atlantic Ridge). Oral presentation to RIF2003 – 

“Deuxièmes rencontres de l’ichthyologie en France”, Paris 25-28 March 2003. 

Sarradin, P.M. (2002). Observatoire fond de mer pour l'étude des interactions organismes - habitats : le chantier Açores. Séminaire DRO, 

Ifremer Centre de Brest, 30-31 octobre 2002. 

Sarradin, P.M. (2002). WP4 : ATOS Cruise. VENTOX Meeting, Ifremer Centre de Brest, 18-19 novembre 2002. 

Zal, Franck, Bruce Shillito, Pierre-Marie Sarradin, Nadine Le Bris, Jean-Claude Caprais & François H. Lallier (2000) Évolution du système 

IPOCAMP : Contrôle des paramètres chimiques de l'enceinte (O2, CO2, CH4, H2S, NO2 et NO3) pour une expérimentation in situ 

simulée. Journées DORSALES 2000, 20-22 Sep, Roscoff (France) – Poster. 

RUBRIQUE 8 : reports 

Desbruyères, D., Khripounoff, A., Le Bris, N. , Sarradin P.M. (2002). Rapport annuel VENTOX. Plouzané, Ifremer. 

Sarradin P. M. (2000) Demande de campagne ATOS. (demande de campagne). 

Sarradin P. M. (2000) Demande d'autorisation de travaux de recherche scientifique dans la zone économique exclusive sous juridiction du 

Portugal (rapport). 

Sarradin P. M. (2001) Demande de soutien de campagne à la mer (soutien de campagne ATOS, VENTOX). 

Sarradin, P.M. et participants campagne ATOS (2001) Campagne ATOS (texte pour le Comité d'Administration). 

Sarradin, P. M. (2002). Rapport de campagne ATOS. Plouzané, Ifremer: 294 p. (rapport de campagne) 

Sarradin, P-M., Fabri, M-C. & Briand, P. 2002. Rapport de campagne ATOS. (N/O Atalante – Victor 6000, 22 juin – 21 juillet, 2001 

5°PCRD VENTOX (EVK3-CT1999-00003). Brest: IFREMER, DRO/EP Avril 2002 – DRO/EP-02/31, 304pp. 

62



Rubrique 12 : documents vidéo, films 

Biscoito, M. & A. J. Almeida, 2003 - Fishes of the Hydrothermal Vents of the Azores Triple Junction (Mid-Atlantic Ridge). . 2 nd edition. 

CD-ROM. 

Rubrique 14 : DEA 

Duperron, S. Diversité des bactéries associéees à différentes substrats au niveau de sources hydrothermales sous marines. DEA Biodiversité, 

Université Pierre et Marie Curie 

Menard, L., 2002. Les crustacés hydrothermaux : des adaptations originales à l’hypercapnie ? DEA report, DEA Biologie Intégrée des 

Invertébrés, Université Pierre et Marie Curie, 20 pp. 

Chapitre d'ouvrage 

Godfroy A, Postec A, Raven N (sous presse) Growth of hyperthermophilic microorganisms for physiological and nutritional studies. In: A. 

RF, A. O (eds) Methods in Microbiology, Extremophiles. Academic Press., Oxford, England 

63



64



Fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques antérieures ” 

Nom de la campagne : IRIS 

Navire : L’ATALANTE 

Dates de la campagne : 6/07 au 10/08 2001 

Chef de projet : Yves Fouquet 

Chef de mission 1 : Yves Fouquet 

Chef de mission 2 : 

Programme : DORSALE 

Engins lourds : Victor 

Zone : Rainbow/Menez Gwen 

Organisme : IFREMER 

Organisme : IFREMER 

Fiche remplie par : Y. Fouquet Date de rédaction de la fiche : Janvier 2004 

Adresse : Ifremer Centre de Brest BP 70, 29280, Plouzané 

Email : fouquet@ifremer.fr Tel : 02 98 22 52 54 Fax : 02 98 22 45 70 

Résultats majeurs obtenus : Mise en évidence de la grande diversité des composés organiques abiotiques générés lors des réactions 

haute température entre l’eau de mer et les roches du manteau. Mise en évidence de la richesse en cuivre, zinc, cobalt, argent, et or 

des sites hydrothermaux mantelliques (Rainbow est le site le plus riche en éléments valorisables actuellement connu dans les 

océans). Découverte de la zone hydrothermale Menez Hom en domaine mantellique. Premières études géophysiques (magnétisme) 

pour évaluer la géométrie et les dimensions des systèmes hydrothermaux mantelliques. Premières approches de terrain sur les 

interactions fluides-minéraux-bactéries par des études intégrées sur échantillons. 

Nombre 


2 Publications dans d’autres revues scientifiques 

3 Publications sous forme de rapports techniques 

4 Articles dans des revues / journaux grand public 

5 Publications de résumés de colloques 31 



dont posters 



dont posters 

8 Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités …) 4 


10 Brevets 


12 Documents vidéo-films 


14 DEA ayant utilisé les données de la campagne 2 

15 Thèse ayant utilisé les données de la campagne 4 

16 Validation des données en cours : .... terminée : .... 

17 Transmission au SISMER Non : .... Oui : .... 

18 Transmission à d’autres banques de données Non : .... Oui : .... 

19 Transmission à d’autres équipes Non : .... Oui : .... 

20 Considérez-vous l’exploitation en cours : oui terminée : 

non 

Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées 

Géosciences 

Bougault, H., 2002, Dorsales médio-océaniques et hydrothermalisme: Les Techniques de l'Industrie Minérale, v. 15, p. 39-49. 

Charlou, J. L., Donval, J. P., Fouquet, Y., Jean-Baptiste, P., and Holm, N., 2002, Geochemistry of high H2 and CH4 vent fluids issuing 

from ultramafic rocks at the Rainbow hydrothermal field (36°14'N, MAR): Chemical Geology, v. 191, p. 345-359. 

Costa, I., Barriga, F. J. A. S., and Fouquet, Y., sous presse, Alteration processes associated with active hydrothermal sites: the Lucky Strike 

and Menez Gwen examples (37°20'N and 37°50'N, Mid Atlantic Ridge): Publication Société Géologique du Portugal. 

Douville, E., Charlou, J. L., Oelkers, E. H., Bienvenu, P., Jove, C. C. F., Donval, J. P., Fouquet, Y., Prieur, D., and Appriou, P., 2002, The 

Rainbow Vent fluids (36 degrees 14'N, MAR); the influence of ultramafic rocks and phase separation on trace metal content in Mid- 

Atlantic Ridge hydrothermal fluids: Chemical Geology, v. 184, p. 37-48. 

Fouquet, Y., 2002, Sulfures polymétalliques hydrothermaux océaniques: Les Techniques de l'Industrie Minérale, v. 15. 

65



Fouquet, Y., Charlou, J. L., Donval, J. P., Radford-Knoery, J., Ondréas, H., Cambon, P., Bougault, H., Etoubleau, J., Barriga, F., Costa, I., 

Lourenço, N., and Tivey, M., submitted, Hydrothermal processes on shallow volcanic segments: MAR near the Azores triple junction: 

J Mineralium deposita 

Philippot, P., Foriel, J., Susini, J., Khodja, H., Grassineau, N., and Fouquet, Y., 2003, High-resolution imaging of transition metal and 

sulfur-redox distribution in individual microfossils: Journal De Physique Iv, v. 104, p. 381-384. 

Rouxel, O., Dobbek, N., Ludden, J., and Fouquet, Y., 2003, Iron isotope fractionation during oceanic crust alteration: Chemical Geology, v. 

202, p. 155-182. 

Rouxel, O., Fouquet, Y., and Ludden, J. N., 2002, Copper isotopes systematic of seafloor hydrothermal systems along the Mid Atlantic 

Ridge: Lucky Strike, Rainbow and Logatchev fields: Geochemistry, Geophysics, Geosystems (G 3 ), v. submitted. 

Rouxel, O., Ludden, J., Carignan, J., Marin, L., and Fouquet, Y., 2002, Natural variations of Se isotopic composition determined by hydride 

generation multiple collector inductively coupled plasma mass spectrometry: Geochimica et Cosmochimica Acta, v. 66, p. 3191-3199. 

Rouxel, O., Ludden, J., and Fouquet, Y., 2003, Antimony isotope variations in natural systems and implications for their use as geochemical 

tracers: Chemical Geology, v. 200, p. 25-40. 

Microbiologie 

Reysenbach, A-L., D. Götz, A. Banta, C. Jeanthon & Y. Fouquet. 2002. Expanding the distribution of the Aquificales to the deep-sea vents 

on Mid-Atlantic Ridge and Central Indian Ridge. Proceedings of the Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal 

Vent Biology. Cah. Biol. Mar. 43 : 425-428. 

Miroshnichenko, M. L., S. L'Haridon, O. Nercessian, A. N. Antipov, N. A. Kostrikina, B. J. Tindall, P. Schumann, S. Spring, E. 

Stackebrandt, E. A. Bonch-Osmolovskaya & C. Jeanthon. 2003. Vulcanithermus mediatlanticus gen. nov., sp. nov., a novel member 

of the family Thermaceae from a deep-sea hot vent. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 53 : 1143-1148. 

Miroshnichenko, M. L., A. I. Slobodkin, S. Gavrilov, S. L'Haridon, O. Nercessian, N. A. Kostrikina, S.Spring, E. Stackebrandt, E. A. 

Bonch-Osmolovskaya & C. Jeanthon. 2003. Deferribacter abyssi sp. nov., an anaerobic thermophile from deep-sea hydrothermal 

vents of the Mid-Atlantic Ridge. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 53 : 1637-1641. 

Miroshnichenko, M. L., S. L'Haridon, P. Schumann, S. Spring, E. A. Bonch-Osmolovskaya, C. Jeanthon & E. Stackebrandt. 2004. 

Caminibacter profundus sp. nov., a novel thermophile in the Nautiliales ord. nov. within the class "Epsilonproteobacteria". Int. J. Syst. 

Evol. Microbiol. (published online 20 June 2003. DOI 10.1099/ijs.0.02753-0). 

Nercessian, O., M. Prokofeva, A. Lebedinskii, S. L'Haridon, C. Cary, D. Prieur & C. Jeanthon. 2004. Design of 16S rRNA-targeted 

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(sous presse). 

Nercessian, O., N. Bienvenu, D. Moreira, D. Prieur & C. Jeanthon. Diversity of functional genes of methanogens, methanotrophs, and 

sulfate-reducers in deep-sea hydrothermal environments. Appl. Environ. Microbiol. (soumis). 

Nercessian, O., Y. Fouquet, C. Pierre, D. Prieur & C. Jeanthon. Diversity of Bacteria and Archaea associaterd with carbonate-rich 

metalliferous sediments at the Rainbow vent field on the Mid-Atlantic Ridge. Appl. Environ. Microbiol. (soumis). 

Communications dans des colloques internationaux 

Géosciences 

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Profond", Paris, 7 mars 2002, 2002. 

Charlou, J. L., Donval, J. P., Fouquet, Y., Jean-Baptiste, P., and Holm, N., 2002, Hydrogen and organics produced by serpentinization on 

the Mid-Atalntic Ridge: Thermal regime of ocean ridges and dynamics of hydrothermal circulation, Pavia (Italy), 9-13 September 

2002, 2002, p. 35-36. 

Charlou, J. L., Donval, J. P., Jean-Baptiste, P., and Holm, N., 2001, IRIS cruise results on the MAR : hydrogen and organics from 

serpentinization: AGU 2001 Fall Meeting, San Francisco, 2001. 

Charlou, J. L., Donval, J. P., Jean-Baptiste, P., Holm, N., and Fouquet, Y., 2001, Serpentinization of ultramafics along the Mid-Atlantic 

Ridge: abiotic process generating hydrogen, light hydrocarbons and other various organic species in black smokers 

Charlou J.L., Donval J.P., Mastalerz V., Jean-Baptiste P., 2003. Hydrogen, methane and organics in ultramafic fluids from slow spreading 

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Charlou J.L., Donval J.P., Mastalerz V., Jean Baptiste P., Foucher J.P., Ondreas H., Cochonat P., Levaché D., 2003. Fluid circulation on 

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66



Fouquet Y., Charlou J.L., 2003. Minéralisations hydrothermales associées au manteau sur les dorsales lentes : état des connaissances et 

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XI Meeting 8th, Strasbourg (France), 2001. 

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behavior during seafloor weathering: Geochemical Earth Reference Model (GERM) Workshop, San Diego, U.S.A., 2001. 

Rouxel, O., Ludden, J., and Fouquet, Y., 2001, Selenium and antimony isotope variations in natural systems determined by MC-ICP-MS: 

experimental and field studies: Applied Isotope Geochemistry IV, Pacific Grove, California, 2001. 

Rouxel, O., Ludden, J., and Fouquet, Y., 2001, Selenium isotopes as biosignatures in seafloor hydrothermal systems: AGU Fall Meeting, 

2001. 

Rouxel, O., Ludden, J., J., C., and Fouquet, Y., 2001, Natural variations of Selenium, Copper and Antimony isotopes determined by MC- 

ICP-MS: application to seafloor hydrothermal systems: Geochemical Earth Reference Model (GERM) Workshop, San Diego (U.S.A.), 

2001. 

Rouxel, O., Ludden, J., Kelley, K., and Plank, T., 2001, Metal and Metalloïd input to the Mariana-Izu subduction factory (leg 185 ODP): 

ODP Leg 185 Postcruise Meeting, Torino (Italy), 2001. 

Microbiologie 

Nercessian, O., Reysenbach, A.–L., Cary, S. C. & Jeanthon, C. 2002. Diversity of archaeal communities associated with hydrothermal vent 

samples from the East-Pacific Rise 9°N, 13°N and Mid-Atlantic Ridge 36°N. 8th Symposium on Aquatic Microbial Ecology. 

Taormina, Italy. 

Nercessian, O., A-L. Reysenbach, S. C Cary, Y. Fouquet & C. Jeanthon. 2003. Novel archaeal lineages in microbial assemblages associated 

with Atlantic and Pacific hydrothermal vents. 1st FEMS Congress of European Microbiologists. Juillet 2003, Ljubljana, Slovénie. 

Chernyh, N. A., A. V. Lebedinskii, A. N. Perov, O. Nercessian, C. Jeanthon, E. A. Bonch-Osmolowskaya & A. D. Mirzabekov. 2002. 

Design of biological microchip to express analysis of biodiversity in thermal habitats. The 4th International Congress on 

Extremophiles, Septembre 2002, Naples, Italie. 

Nercessian, O. G, M. I. Prokof'eva, A. V. Lebedinskii, & C. Jeanthon. 2002. Design and evaluation of 16S rRNA-targeted probes to assess 

the structural composition of archaeal communities thriving in hot biotopes. 8th Symposium on Aquatic Microbial Ecology, Traormina 

(Italie). 

Miroshnichenko, M. L., S. L'Haridon, O. Nercessian, S. Spring, E. Stackebrandt, P. Schumann, E. A. Bonch-Osmolovskaya & C. 

Jeanthon. 2002. Phylogenetic and metabolic diversity at deep-sea hydrothermal vents. The 4th International Congress on 

Extremophiles, Septembre 2002, Naples, Italie. 

Miroshnichenko, M. L., S. L'Haridon, O. Nercessian, S. Spring, P. Schumann, E. Stackebrandt, E. A. Bonch-Osmolovskaya, & C. 

Jeanthon. Novel thermophilic bacteria from deep-sea hydrothermal vents. 1st FEMS Congress of European Microbiologists. Juillet 

2003, Ljubljana, Slovénie. 

Nercessian, O., A-L. Reysenbach, S. C. Cary & C. Jeanthon. 2003. Diversity of archaeal communities associated with hydrothermal vent 

samples from the East-Pacific Rise 9°N, 13°N and Mid-Atlantic Ridge 36°N. 1st FEMS Congress of European Microbiologists. Juillet 

2003, Ljubljana, Slovénie. 

Nercessian, O., A-L. Reysenbach, S. C. Cary & C. Jeanthon. 2003. Diversity of archaeal communities associated with hydrothermal vent 

samples from the East-Pacific Rise 9°N, 13°N and Mid-Atlantic Ridge 36°N. Colloque d'Ecologie Microbienne. Carry-Le-Rouet. 

Rapports 

Bélec, J., 2002, Utilisation de la fluorescence X pour établir un protocole de séparation des platinoïdes et de l'or sur résine échangeuse 

d'ions, en prévision de leur détermination dans les encroûtements cobaltifères par ICP-MS: Lannion, I.U.T., p. 35. 

Dumont, 2002, Recherche de composés hydrocarbonés dans des fluides hydrothermaux enrichis en hydrogène en contexte de 

serpentinisation. Utilisation d'un couplage chromatographie/spectrométrie de masse: Brest, Université de Bretagne Occidentale, p. 25. 

Knoery, J., 2002, L'Analyseur In Situ (AIS) : guide d'utilisation et développement: Brest, Ifremer, p. 50. 

Quéouron, N., 2002, Etalonnage des gaz permanents et hydrocarbures légers dans des solutions salines : eau de mer, fluides hydrothermaux, 

saumures: Lannion, I.U.T., p. 27. 

67



DEA ayant utilisé les données de la campagne 

Mattenet Anne-Claire. 2003. Etude de la diversité des plasmides chez les Archaea appartenant à l'ordre des Thermococcales. DEA de 

Microbiologie Fondamentale et appliquée. Université de Bretagne Occidentale. Soutenu le 30 juin 2003. Laboratoire d’accueil : 

UMR6539, Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin, IUEM, Plouzané. 

Mastalerz V., 2003. Signature de fluides hydrothermaux enrichis en hydrogène en contexte de serpentinisation. Utilisation d'un couplage 

chromatographie en phase gazeuse/spectrométrie de masse. Mémoire de DEA Chimie de l'Environnement marin de l'UBO Ifremer. 

Brest. DRO/GM/03-22, 24 p. 

Thèses ayant utilisé les données de la campagne 

Geslin Claire. 2002. Recherche te caractérisation de particules virales chez les Thermococcales (Archaea hyperthermophiles). Description 

du premier virus de Pyrococcus abyssi: PAV1. Université de Bretagne Occidentale. Soutenue le 19 décembre 2002. Laboratoire 

d’accueil : UMR6539, Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin, IUEM, Plouzané. 

Nercessian Olivier. 2003. Etude de la diversité spécifique et fonctionnelle des communautés microbiennes associées à des sources 

hydrothermales marines profondes par des approches moléculaires. Université de Bretagne Occidentale. Soutenue le 20 juin 2003. 

Laboratoire d’accueil : UMR6539, Laboratoire des Sciences de l’Environnement Marin, IUEM, Plouzané. 

Rouxel, O., 2002, Géochimie isotopique des métaux (Fe, Cu, Sb) et des métalloïdes (S, Se) dans la croûte océanique: Unpub. Doctorat 

thesis, Institut National Polytechnique de Lorraine (CRPG), 400 p. 

Charlou, J. L., 2003, Circulation des fluides dans l'océan profond - dorsales et marges - Mise en évidence par les traceurs physiques et 

géochimiques - Processus physicochimiques associés: Unpub. Habilitation à Diriger des Recherches, spécialité Géosciences Marines 

thesis, Université de Bretagne Occidentale. 

68



Fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques antérieures ” 

CARACOLE 

Nom de la campagne : CARACOLE Programme : 

Navire : ATALANTE Engins lourds :Victor 6000 

Dates de la campagne :30/07/2001-15/08/2001 

Zone :Ouest Irlande 

Chef de projet :A. Grehan/M .Sibuet/JP Henriet 

Organisme :Univ. Galway, Univ. Gent, Ifremer 

Chef de mission 1 : K. Olu-Le Roy 

Organisme :Ifremer 

Chef de mission 2 : Organisme : 

Fiche remplie par :K. Olu-Le Roy Date de rédaction de la fiche :10/01/2006 

Adresse :Ifremer Brest 

Email :kolu@ifremer.fr Tel :0298224657 Fax :0298224757 

Résultats majeurs obtenus : 

• Mise en évidence d’un lien intrinsèque entre les processus géo-biologiques et les paramètres physiques qui gouvernent la 

formation des monts. 

• Observation de différences entre la topographie des monts reliées aux courants ou à des processus hydrologiques. La 

genèse et le développement de monts actifs grâce à une forte croissance des coraux se trouvent dans des zones à 

hydrodynamisme intense, tandis que les monts inactifs se trouvent dans des zones à forte sédimentation. 

• L’édification d’une charpente récifale par les coraux est essentielle pour la croissance des monts. 

• La faune associée aux coraux diffère beaucoup, de façon inattendue, entre les monts des différentes régions. 

• Les fonds indurés très étendus sur le Mont Propeller, les Monts du Banc du Porcupine et les Monts Pelagia, et les “ dropstones 

”, pierres déposées par des glaces dérivantes durant les glaciations du Néogène, constituent les supports solides 

nécessaires à la fixation des coraux actuels et anciens. 

• Aucune démonstration directe de suintement d’hydrocarbures sur les sites étudiées n’a été obtenue. 

Nombre 


2 Publications dans d’autres revues scientifiques 3 



5 Publications de résumés de colloques 32 



dont posters 



dont posters 

8 Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités …) 


10 Brevets 


12 Documents vidéo-films 


14 DEA ayant utilisé les données de la campagne Min 2 

15 Thèse ayant utilisé les données de la campagne Min 3 

16 Validation des données en cours : .... terminée : X.... 

17 Transmission au SISMER Non : ....X Oui : .... 

18 Transmission à d’autres banques de données Non : .... Oui : Biocean 

19 Transmission à d’autres équipes Non : .... Oui : .... 

20 Considérez-vous l’exploitation en cours : ....X terminée : .... 

36 

32 

5 

17 

69



1 Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées SCI 

De Mol B, Kozachenko M, Wheeler A, Alvares H, Henriet J-P, Olu-Le Roy K (2006) Thérèse Mound: a case study of coral bank 

development in the Belgica Mound Province, Porcupine Seabight. International Journal of Earth Sciences. Online first 

Grehan AJ, Unnithan V, Olu Le Roy K, Opderbecke J (2005) Fishing Impacts on Irish Deepwater Coral Reefs: Making a Case 

for Coral Conservation. American Fisheries Society Symposium 41:819–832 

Huvenne VAI, Beyer A, de Haas H, Dekindt K, Henriet J-P, Kozachenko M, Olu-Le Roy K, Wheeler AJ, participant TPaCc 

(2005) The seabed appearance of different coral bank provinces in the Porcupine Seabight, NE Atlantic: results from 

sidescan sonar and ROV seabed mapping. In: Freiwald A, Roberts JM (eds) Cold-water corals and ecosystems, p 535-569 

Huvenne, V.A.I., Bailey, W.R., Shannon, P.M., Naeth, J., Di Primio, R., Henriet, J.P., Horsfield, B., de Haas, H., Wheeler, A., 

Olu-Le Roy, K. (in press). The Magellan mound province. In: Henriet, J.P. & Dullo, C. (Eds.). North Atlantic carbonate 

mounds: clues towards their genesis, development and significance. Springer-Verlag, Heidelberg. 

Wheeler, A.J., Beyer, A., Freiwald, A., de Haas, H., Huvenne, V.A.I., Kozachenko, M., & Olu-Le Roy, K. (in press). The 

environmental context of carbonate mounds on the NW European Margin. In: Henriet, J.P. & Dullo, C. (Eds.). North Atlantic 

carbonate mounds: clues towards their genesis, development and significance. Springer-Verlag, Heidelberg. 

Borchielinni, C., Ailvon, E. & Vacelet, J. In press. The systematic position of Alectona (Porifera, Demospongiae): a tetractinellid 

sponge. Boll. Mus. Ist. biol. Univ. Genova, . 

Long, R. and Grehan, A. (2002). Marine Habitat Protection in Sea Areas under the Jurisdiction of a Coastal Member State of 

the European Union: The Case of Deep-Water Coral Conservation in Ireland. The International Journal of Marine and 

Coastal Law, 17: 241-269. 

Olu-Le Roy, K. (2004) Les coraux profonds: une biodiversité à évaluer et à préserver. VERTIGO, revue électronique en 

environnement, 5 (3) la biodiversité des océans, ses différents visages, sa valeur et sa conservation. 

Könnecker, G. and Freiwald, A. (2005) Plectroninia celtica n. sp. (Calcarea, Minchinellidae), a new specxies of “pharetronid” 

sponge from bathyal demths in the northern Porcupine Seabight, NE Atlantic 

Dorschel, B., D. Hebbeln, A. Rqggeberg, W.-C. Dullo, A. Freiwald (2005) Growth and erosion of a cold-water coral covered 

carbonate mound in the Northeast Atlantic during the Late Pleistocene and Holocene. Earth and Planetary Science Letters 233 

(2005) 33– 44 

2 Publications dans d’autres revues scientifiques 

Olu-Le Roy, K. (2001) Campagne CARACOLE. Lettre aux Médias, 65, 7. 

Grehan, A.J., R. Long, M. Mellett (2002). Deep-Water Coral Conservation - a primer for the development of an Irish Integrated 

Ocean Management Strategy. In: Achievement and Challenge: Rio + 10 in Ireland (J. Feehan and F. Convery, eds.), 

Environmental Institute, UCD. 386-393pp. 

Contribution à : Freiwald, A., JH Fossa, A. Grehan, T. Koslow and J.M. Roberts (2004), Cold-water coral reefs- Out of 

sight- no longer out of mind.UNEP Report, 84p. ww.corals.unep.org. 

3 Publications sous forme de rapports techniques 

Olu-Le Roy, K., J. Galéron & the Caracole Cruise Scientific Team. 2002. CARACOLE cruise report. Vol. 1&2. 

Opderbecke, J. & Pitout C. Campagne CARACOLE, cartographie acoustique et optique avec VICTOR. Rapport interne 

Ifremer.2002. 

Fifis, A., Galéron, J., 2003. Caracole, résultats de tri 

Contribution à : EU 5FP 'Atlantic Coral Ecosystem Study '(EVK3 CT1999 00008) Final Report (2003) 

Report on Two Deep-Water Coral Conservation Stakeholder Workshops held in Galway in 2000 and 2002. (Grehan, A.J, B. 

Deegan, M.O'Cinneide and R. Long, editors). Marine Environment and Health Series, No. 11, 2003, published by the 

Marine Institute, Parkmore, Galway. 

Sample-data set of co-located video and high-frequency data-set from the R2 site on CD-ROM provided for engineers within 

AMASON, an EU funded project (EVK3-2001-00067) developing advanced video and sonar applications. NUIG is a 

co-partner of IFREMER Toulon in the project. 

Contribution à ICES (2005) Report of the Working Group on Deep-water Ecology (WGDEC). Copenhagen, ICES (International 

Council for the Exploration of the Sea). 76 pages. 

4 Articles dans des revues / journaux grand public 

Pêche en mer, août 2003. Des coraux des profondeurs marines 

Libération, février 2002. Au nord, les coraux labourés par les chalutiers. 

Libération, juin 2004. Le corail froid étudié en profondeurs 

Sea State, Newsletter of the Marine Institute, Galway, Ireland. CARACOLE cruise/corals. Spring 2002. 

70



Sherkin comment (Irish newspaper). Ireland’s cold water coral reefs.New horizons in irish Marine Science. By Geoffrey 

O’Sullivan.2002. 

Le Marin, septembre 2003. La recherche s’intéresse aux coraux profonds. Marion Francoual. 

Pour la Science. Juillet 2003. Les coraux des profondeurs. André Freiwald. 

„Korallengärten in kalten Tiefen“.- Spektrum der Wissenschaft, February 2003 

„Out of sight, out of mind?“- The Parliament Magazine, 24 March 2003 

Wochenend Magazin.- Erlanger Nachrichten, 12 April 2003 

„Europas kalte Koralengärten“:- VDI-Nachrichten, 13 June 2003 

Interview for national broadsheet (The Irish Times) Science Today:section: 'French assist coral reef marine research project' 

July 2001 

Interview for national broadsheet (The Irish Times) Front Page: 'Victor' shows underwater world of coral gardens. August 2001 

Forfas Science News On-Line; High Tech Exploration Reveals the True Extent of the Irish Deep-Water Coral Province. August 

2001 

The Irish Skipper (On-line journal of the Irish fishing industry). 'Beauty beneath the waves'. September 2002 

Interview for national broadsheet (The Irish Times): 'Young soak up the world of the sea'. November 2001 

Interview for national broadsheet (The Irish Times): Pollution of coastal waters growing fast'. November 2001 

Interview for electronic newsletter MPA News (International News and Analysis on Marine Protected Areas): ' Conserving 

Habitats that are poorly understood: deepwater corals and efforts to protect them'. November 2001 

Interview for Galway Broadsheet (Galway City Tribune). Irish deep-water coral on public display in Galway's Atlantaquarium 

January 2002 

Interview for Nature Science Update ' Fishing scars Atlantic Reefs'. February 2002 

Interview for national broadsheet (The Irish Times) Science Today Section: 'Trawlers damage coral reef'. March 2002 

5 Publications de résumés de colloques 

Lorance P., Olu K., 2004. Demersal fish distribution and abundance in deep-sea coral and surrounding sedimentary seabed. 

ICES CM 2004/AA:03 (oral communication) 

Kozachenko, M., Wheeler, A., Beyer, A., Blamart, D., Masson, D., Olu-Le Roy, K. (2003). Ireland's Deep-Water Coral Carbonate 

Mounds: Multidisciplinary Research Results. Geophysical Research Abstracts, EGS-AGI-EUG Joint Assembly, Nice, 061-11 

April 2003. Vol. 5, p.10095 

Kozachenko, M., Wheeler, A.J., Beyer, A., Blamart, D., Masson, D., Olu-Le Roy, K. (2003). Ireland's Deep-Water Coral 

Carbonate Mounds: Multidisciplinary Research Results. 13 th Irish Environmental Research Colloquium, National University of 

Ireland, Galway, 8-10 January 2003. 

Kozachenko, M., Wheeler, A.J., Beyer, A., Blamart, D., Masson, D., Olu-Le Roy, K. (2003). Sedimentary Processes and 

Carbonate Mound Morphology: the Belgica Mounds, Porcupine Seabight. 2 nd International Symposium on Deep-sea Corals, 

Erlangen, Germany, 8-14 th September, 2003. Erlanger Geologische Abhandlungen, Sonderband 4, p.53 

Wheeler, A.J., de Haas, H., Huvenne, V., Kozachenko, M., Olu-Le Roy, K. & Masson, D.G. (2003). Coral mound morphology 

and growth: evidence for environmental controls. . 2 nd International Symposium on Deep-sea Corals, Erlangen, Germany, 

8-14 th September, 2003. Erlanger Geologische Abhandlungen, Sonderband 4, p.88. 

Wheeler, A.J., Kozachenko, M., Beyer, A., Blamart, D., Masson, D., Olu-Le Roy, K. (2003). Sedimentary processes and 

carbonate mound morphology: the Belgica Mounds, Porcupine Seabight. Ocean Margin Research Conference, Paris 

15 th -17 th September 2003. p.163 

Kozachenko, M., Wheeler, A., Beyer, A., Blamart, D., Masson, D., Olu-Le Roy, K. (2002) A Four Dimensional Prospective of the 

Sedimentary Processes and their Interactions with Ireland’s Deep-water Coral Carbonate Mound Ecosystems: Belgica 

Carbonate Mound province, Eastern Porcupine Seabight, NE Atlantic, 27th General Assembly of the European 

Geophysical Society, Nice, 21-26 April 2002. 

Wheeler, A.J., Beyer, A., Kozachenko, M., Masson, D.G.& Olu-Le Roy, K. (2002) Deep Marine Coral Reefs in Irish and British 

Waters: New Insights into a Fascinating Environment. 12 th Irish Environmental Research Colloquium, University College 

Cork, 25-27January 2002 

Wheeler, A.J., Kozachenko, M. & Olu-Le Roy, K (2002). Integrated high resolution side-scan sonar and video mapping of Irish 

deep-water coral-colonised carbonate mounds. Extended Abstract: Geophysical Association of Ireland seminar "Marine 

Geophysical Investigations in Ireland Today", Dublin 22nd May 2002 

Wheeler, A.J., Kozachenko, M. & Olu-Le Roy, K. (2002) The Role of Benthic Currents and Sediment Transport on Deep-water 

Coral Mound Morphology and Growth: Examples from the Belgica and Moira Mounds, Eastern Porcupine Seabight, NE 

Atlantic. Abstract, 27th General Assembly of the European Geophysical Society, Nice, 21-26 April 2002. 

Huvenne, V.A.I., Bailey, W.R., Shannon, P.M., Naeth, J., di Primio, R., Horsfield, B. (2002). The Magellan mystery in the 

Porcupine Basin : a thousand mounds over a frozen slope failure. Geomound/Ecomound – Industry workshop, Dublin, 

November 6, 2002 : The message of carbonate mounds and cold-water coral banks in hydrocarbon provinces. Book of 

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Lorance P. & C. Scalabrin (2003) : Abundance estimation of deep-water species in the Northeast Atlantic. Assessment and 

Management of Deepwater Fisheries, Pre-conference meeting to Deep Sea 2003, University of Otago. 27-29 November 

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Sarradin, P.-M., Olu-Le Roy, K. Ondréas, H., Sibuet, M., Klages, M., Fouquet, Y., Savoye, B., Drogou, J.-F., Michel, J.-L. (2002) 

Evaluation of the first year of scientific use of the french ROV VICTOR 6000. Underwater Technology 2002. Tokyo, 

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Beuck, L., Schulbert, C. & Freiwald, A. (2003): Sweet home Lophelia: A multicolour journey into the microcosm of bioeroders 

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2003, Erlangen, Germany. 

Dullo, W.-C. & Freiwald, A. (2003): The modern deep water coral reefs off NW-Europe: the largest reef province in 

the world.- EGS - AGU - EUG Joint Assembly, Nice, France, April 2003. 

Freiwald, A. (2003): Ocean margin deep-water research.- Key-note Vortrag auf der OMARC research Conference, 15-17 

September, 2003, Paris. 

Freiwald, A. (2003): Europe's deep-water coral margins - myths and facts.- Key-note Vortrag auf der OMARC research 

Conference, 15-17 September, 2003, Paris. 

Grehan, A.J., Lundalv, T., Bett, B.J., Freiwald, A., Gage, J.D., Roberts, J.M. & Rogers, A. (2003): The Atlantic Coral Ecosystem 

Study: Bridging the science-policy divide.- Poster auf dem 2nd International Symposium on Deep Sea Corals, September 

2003, Erlangen, Germany. 

Unnithan, V., A. Grehan, T. van Weering and K. Olu-LeRoy (2003). Biological and Geological characterisation of the R1 and R2 

coral mounds, Rockall Trough, west of Ireland. European Geophysical Society 27th Annual Meeting, Nice, France, 21-26 

April, 2003 

Grehan, A.J., J. Opderbecke, V. Unnithan and D. Lane (2002). Improved mapping of deep-water coral ecosystems. Poster 

presented at the Marine Geological Habitat Mapping (GEOHAB) Workshop, Moss Landing Marine Laboratories, California, 

US (May 1st to 3rd, 2002). 

Grehan, A.J., V. Unnithan and K. Olu-Le Roy (2002). Mapping Irish deep-water corals: a necessary first step towards their 

conservation. Poster presented at the Marine Geological Habitat Mapping (GEOHAB) Workshop, Moss Landing Marine 

Laboratories, California, US (May 1st to 3rd, 2002) 

Grehan, A. J., Unnithan, V., Olu, K. and Opderbecke, J. 2002. Fishing impacts on Irish deep-water coral reefs: making the case 

for coral conservation. Poster presented at the Symposium on the Effects of Fishing Activities on Benthic Habitats: Linking 

Geology, Biology, Socioeconomics and Management, Tampa, USA, November, 2002. 

Grehan, A.J., Kiriakoulakis, K., Mahaffey, C., Wolff, G. (2003). Food web relationships in deep-water corals from the 

Porcupine Sea Bight and Rockall Trough, west coast of Ireland. Poster presented at the 2nd International Deep-Water Coral 

Symposium, Erlangen, Germany and at the Ocean Margin Research Conference, Paris, France. 

Jurkiw, A., Hebbeln, D. & Freiwald, A. (2003): Sedimentary facies distribution over Propeller Mound, a deep-water coral 

carbonate mound at the Irish continental margin.- Vortrag auf dem 2nd International Symposium on Deep Sea Corals, 

September 2003, Erlangen, Germany. 

Kiriakoulakis, K., White, M., Freiwald, A. & Wolff, G.A. (2003): Biogeochemistry of deep-water coral systems at the NW 

European continental margin.- Vortrag auf dem 2nd International Symposium on Deep Sea Corals, September 2003, 

Erlangen, Germany. 

Le Guilloux E, Olu-Le Roy K, Lorance P, Lecornu F, Sinquin J-M, Opderbecke J, Allais AG, Grehan A (2005) Development of 

new methods for mound-scale habitat mapping and invertebrate and fish community structure analysis, coupling 

microbathymetry, mosaïcking and GIS: exemple of the Theresa mound off Ireland 3rd International Symposium on Deep- 

Sea Corals (3rd ISDSC), Miami, Florida, USA 

Olu-Le Roy K, Fifis A, Freiwald A, Galéron J, Grehan A, Le Guilloux E, Henriet J-P, Lorance P, Sibuet M, Vacelet J, Zibrowius H, 

team tCcs (2005c) Megafauna and fish community patterns at several carbonate mounds dominated by Lophelia pertusa 

along the Porcupine and Rockall Bank, west off Ireland 3rd International Symposium on Deep-Sea Corals (3rd ISDSC), 

Miami, Florida, USA 

Beck, T. and Freiwald, A. (2005): Key Species of Cold-Water Coral-Associated Fauna.- 3rd International Symposium on Deep- 

Sea Corals, November 2005, Miami, USA. 

Beck, T. and Foubert, A. (2005): Distribution of Benthic Species Associations in the Belgica Mound Province, Porcupine 

Seabight – Ecological Aspects and Relation to Facies and Benthic Habitat Features.- 3rd International Symposium on Deep- 

Sea Corals, November 2005, Miami, USA. 

Freiwald, A. (2005): A Portrait of deep-water coral ecosystems in the World Oceans.- Vortrag, One-day Conference on Europe’s 

Hidden Coral Worlds, Februar 2005, Edinburgh. 



dont posters 

Voir liste des résumés de colloques 

+ 

Grehan, A.J. 2002. Deep-water coral conservation in the offshore waters to the west off Ireland. Oral communication presented 

at the JNCC Workshop on offshore Marine Protected Areas in the OSPAR area, Stansted, United Kingdom, October, 

2002. 

Grehan, A.J. 2002. Deep-water coral research in Ireland, France and Germany. Oral communication presented at International 

Collaborative Meeting on Deep-water Corals in Tampa, United States, November, 2002. 

Grehan, A.J. 2002. Deep-water coral conservation. Royal Dublin Society (RDS) Science and Media Seminar, Dublin, Ireland, 

November, 2002 

Grehan, A.J. 2003. Deep-water coral conservation issues. Oral presentation at the Final ACES Workshop, Erlangen, February, 

2003 

Grehan, A.J. 2003. European deep-water coral research. Invited presentation delivered as NOAA Seminar , NOAA Head Office, 

Washington and at a House Ocean Caucus briefing on deep-water corals to the US Congress on Capital Hill, Washington, 

US, March, 2003. 

72





dont posters 

Huvenne, V. (2001). Geomound/Ecomound meeting, Gent (10/12/01, 10.15u), Huvenne V. 'Results from l'Atalante Caracole 

survey' 

Huvenne, V. (2002). Departemental seminar, University College Dublin (04/02/02, 13.00u), Huvenne V. 'The Magellan mound 

province SW of Ireland : a portrait' 

Huvenne, V. (2002) Presentation during the general assembly of the ‘GGG’ (association of the Geologists of the University of 

Gent), Gent (29/03/02, 19.30u), Huvenne, V. 'Een portret van de Magellan Mound-provincie, ten zuidwesten van Ierland' 

Huvenne, V. (2002) Presentation during the first preparatory meeting for the Victor/Polarstern cruise in 2003, Bremerhaven 

(23/04/02, 14.00u), Huvenne, V. 'Suggestions for the return of Victor 6000 to the Porcupine Seabight' 

Olu-Le Roy, K. Campagne CARACOLE, Etude multidisciplinaire des monts carbonatés et massifs de coraux profonds sur les 

marges Nord est Atlantique (bancs de Porcupine et Rockall). Journée bilan de la première année d’utilisation de Victor, 

Ifremer octobre 2001. 

Dullo, W.-C. & Freiwald, A. (2002): The modern deep water coral reefs off NW-Europe: The largest reef province in the world.- 

Vortrag auf der GEO 2002, Würzburg. 

Freiwald, A. (2003): Die Tiefwasser-Korallenriff-Provinz - Ergebnisse aus dem ACES-Projekt (Atlantic Coral Ecosystem Study).- 

Öffentlicher Abendvortrag auf der 124. Tagung des Oberrheinischen Geologischen Vereins e.V., April 2003, Erlangen. 

Freiwald, A. (2002): Postglaziale Evolution von Tiefwasser-Riffen vor dem Hintergrund der Storegga-Rutschung.- 

Kolloquiumsvortrag am 23. Januar im Institut für Ostseeforschung Warnemünde. 

Freiwald, A. (2002): Korallenmounds im Nordatlantik - Bio-geologische Forschung am Kontinentalrand.- 

Kolloquiumsvortrag am 10. Januar im Paläontologischen Institut Bonn . 

Freiwald, A. (2002): Korallenriffe am Kontinentalhang?- Vortrag am 5. Januar in der Wendelstein Klinik, Gammertingen. 

Freiwald, A. (2001): Tiefwasser-Riffe/Mounds des Nordatlantiks im Brennpunkt multidisziplinärer Forschungsprogramme.- 

Kolloquiumsvortrag am 24. Oktober im Geologisch-Paläontologischen Institut Frankfurt. 

Freiwald, A. (2001): "Deep, dark and dirty" - Korallenmounds am Kontinentalhang.- Kolloquiumsvortrag am 20. November in 

Fribourg, Schweiz. 

Grehan, A.J. Irish deep-water corals. Talk given to the Zoological Society and the Department of Zoology, Trinity College, 

Dublin, November, 2002. 

Grehan, A.J. 2002. Deep-water coral conservation. Royal Dublin Society (RDS) Science and Media Seminar, Dublin, Ireland, 

November, 2002 

Grehan, A.J. , V. Unnithan and J. Opderbecke 2002. Improved mapping of deep-water corals. Poster presented at the Marine 

Institute 10 th Year Anniversary Symposium, Dublin, Ireland, November, 2002. 

Lorance P., 2005. Biodiversité et pêche profonde. 3ème Symposium des Entretiens de Port-Cros Biodiversité des mers 

profondes, Porquerolles 5-7 octobre 2005 (communication orale) 

Lorance P. (2003). Pêcheries et écosystèmes profonds. Symposium pêche et Biodiversité (2ème Symposium des 

Entretiens de Port-Cros), Porquerolles, 21-23 Septembre 2003. 

15 Thèse ayant utilisé les données de la campagne 

Thèses 

Huvenne, V. (2003). Spatial geophysical analysis of the Magellan carbonate build-ups and the interaction with sedimentary 

processes : key to a genetic interpretation? PhD thesis, Faculty of Sciences, Department of Geology and Soil Science. 

University of Gent, Gent, 285pp. 

Guinan, J. PhD en cours sous la direction d’Anthony Grehan (univ.Galway). Dept. of Earth and Ocean Sciences, NUI, Galway. 

Doctoral thesis - Geohabitat mapping studies in the offshore west of Ireland. Expected to submit by end of 2005. 

Le Guilloux E., Ecosystèmes de coraux profonds : structure spatiale et diversité des communautés d’invertébrés et poissons. 

Thèse co-financée Ifremer/région bretagne. Nov 2005-Oct 2008. 

Stage de Master 2eme année . Erwan Le Guilloux. Encadrement K. Olu & P. Lorance (Ifremer) Structure des peuplements de 

mégafaune (invertébrés et poissons) associée aux coraux profonds. 

Stage de Maîtrise 

K. Dekindt, 2001. Contribution à l’étude de la distribution spatiale des coraux, caractérisation des différents faciès et de la faune 

associée sur le site du Mont Thérèse. Encadrement K. Olu, Ifremer. 

Divers communication grand public 

Conferences Ifremer à Rennes le 08/10/2003 et Brest le 17/12/2003 (P. Lorance) 

Exposition pour la Science en fête, Brest novembre 2003 (K.Olu, P. Lorance) 

Exposition lors des journées portes ouvertes de l’Ifremer, octobre 2004. 

73



74



Fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques ” 

(à transmettre par courrier électronique au secrétariat de la Commission Nationale Flotte et Engins 

anne.marie.alayse@ifremer.fr) 

Nom de la campagne : EXOMAR 

Programme : 

Navire : Atalante Engins lourds : VICTOR 6000 

Dates de la campagne :25 juillet-28 août 2005 Zone : Dorsale médio-Atlantique 

Chef de projet : Georges BARBIER 

Chef de mission : Anne GODFROY 

Organisme : Université de Bretagne Occidentale 


Fiche remplie par : Anne GODFROY Date de rédaction de la fiche : lundi 6 novembre 2006 

Adresse : Ifremer, Cnetre de Brest BP70 29280 Plouzané 

Email : agodfroy@ifremer.fr Tel : 02 98 22 45 29 Fax : 02 98 22 47 57 

Résultats majeurs obtenus 

1 à 2 pages destinées à informer un large public sur les résultats obtenus par chaque campagne 

EXOMAR (EXtremophiles Of the Mid-Atlantic Ridge) est campagne dont la maitrise d’œuvre aété assuré par le 

laboratoire Microbiologie des Environnements Extrêmes (UMR 6197 CNRS/ UBO/ IFREMER). Cette campagne avait pour 

objet l’étude de la biodiversité des écosystèmes de sites hydrothermaux très différenciés de la ride médio-Atlantique : TAG 

(26°N), Lost City (30°N) ainsi que les sites Rainbow et Lucky Strike du point triple des Açores. TAG est un site très 

profond de l'Atlantique (3650 m) qui a fait l'objet de très nombreux travaux de géosciences publiés alors que les 

communautés tant animales que microbiennes restent à décrire. Lost City est un site très récemment découvert [Nature 

(2001) 412:145] qui offre un contexte géochimique particulièrement original (fluides hydrothermaux basiques de faibles 

températures) a priori propice à la recherche de nouveaux taxons microbiens. Les sites Rainbow et Lucky Strike présentent 

également des caractéristiques différentes (profondeurs intermédiaires et signatures géochimiques spécifiques). Cette 

campagne à forte participation de microbiologistes a mis en œuvre simultanément les approches culturales et moléculaires 

d’étude des écosystèmes microbiens extrêmophiles associées aux édifices hydrothermaux actifs et aux invertébrés ,dans le 

but d'en décrire la diversité. L’organisation des travaux et l’interprétation des résultats de microbiologie reposeront sur une 

intégration poussée avec les analyses minéralogiques et géochimiques. Parallèlement, la répartition des populations 

animales seront analysée en fonction de l’acquisition de données analytiques caractéristiques de leurs environnements 

respectifs. Les travaux de microbiologie seront effectués par les scientifiques français et japonais dans le cadre d'une 

collaboration entre le JAMSTEC et l'IFREMER. Dans ce contexte, deux domaines de l'extrêmophilie des microorganismes 

feront l'objet de travaux concertés : la thermophilie et la barophilie. 

Résultats attendus et en cours d’exploitation : 

Caractérisation minéralogique et géochimiques de sites de la ride médio-Atlantique présentant des différences géologiques 

majeures 

Description de l'organisation des écosystèmes hydrothermaux, en particulier pour ce qui concerne leur composante 

microbienne en relation avec le contexte tectonique, géologique, minéralogique, géochimique et biologique 

Indications sur la possible existence d'une microflore de subsurface 

Indications sur les flux de particules émis pour le site Lucky Strike et la dispersion de la microflore hydrothermale associée à 

ces particules 

Description de nouveaux taxons procaryotes piezophiles et/ou thermophiles et étude certaines de leurs caractéristiques 

spécifiques 

Description des associations symbiotiques entre invertébrés et micro-organismes 

Analyse des relations existant entre la distribution des communautés animales sur la ride médio-Atlantique et leur 

environnement physico-chimique. 

Le cœur de la campagne concernait l’échantillonnage de bactéries, animaux, fluides et précipités hydrothermaux afin mieux 

comprendre la diversité microbiologique et les interactions fluides minéraux bactéries dans les environnements extrêmes des 

grands fonds océaniques. De nombreux conditionnements et mises en cultures ont été réalisés à bord pour identifier bactéries 

et moisissures. Les échantillons prélevés pour les études de microbiologie permettront d’étudier différents compartiments 

microbiens de l’écosystème hydrothermal : 

- les populations microbiennes adaptées aux températures élevées des cheminées actives 

- les populations microbiennes de subsurface 

75

- 



- les populations microbiennes associées aux crevettes Rimicaris exoculata 

Nombre 


2 Publications dans d’autres revues scientifiques - 



5 Publications de résumés de colloques Voir rubrique 6 et 

7 


15 


dont posters 


1 


dont posters 

8 Nouvelles espèces (animales, végétales, microorganismes) découvertes et décrites - 

9 Rapports de contrats (Union européenne, FAO, Convention, Collectivités …) - 

10 Applications (essais thérapeutiques ou cliniques, AMM …) - 

11 Brevets - 

12 Publications d’atlas (cartes, photos) - 

13 Documents vidéo-films - 

14 Publications électroniques sur le réseau Internet 2 

15 DEA ou MASTER ayant utilisé les données de la campagne 7 

16 Thèses ayant utilisé les données de la campagne 6 

17 Validation des données en cours : .... 

18 Transmission au SISMER .... Oui : .... 

19 Transmission à d’autres banques de données Non : .... 

20 Transmission à d’autres équipes Non : .... 

21 Considérez-vous l’exploitation en cours : .... .... 

Fournir en annexe pour chacune des rubriques : 

Rubriques 1 à 8 incluses : Une liste des publications et colloques avec les noms d’auteurs suivant la 

présentation en vigueur pour les revues scientifiques. A présenter selon la classification du tableau ci-dessus. 

Rubriques 9 à 14 : Liste des références des rapports, des applications, des brevets, atlas ou documents vidéo 

Rubriques 15 et 16 : Pour chaque étudiant Nom et Prénom, Laboratoire d’accueil. Sujet du DEA ou MASTER ou 

de la thèse, Date de soutenance 

Rubriques 17 à 20 incluses : Le type des données validées et/ou transmises, 

Les banques de données (SISMER, JGOFS, CDIAC …) les équipes auxquelles elles ont été transmises. 

Rubrique 21 : Si l’exploitation est toujours en cours, pouvez-vous donner un échéancier ? 

1- Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées SCI 

76



Kádár E., and Azevedo, C. 2006. Unidentified extracellular prokaryotes within the byssal threads of the deep-sea 

vent mussel Bathymodiolus azoricus. Parasitology 133, 509–513. 

2- Publications dans d’autres revues scientifiques 

3- Publications sous forme de rapports techniques 

Godfroy, A. Briand, P et Fabri M-C. (2005) Compte rendu de campagne. EXOMAR 

4- Articles dans des revues ou journaux grand public / Conférences grand public 

Godfroy, A. Cycle de conférences grand public, Ifremer centre de Brest,12 avril 2006: Sites hydrothermaux de la 

dorsale médio-Atlantique : la campagne EXOMAR 2005 

Godfroy, A. Conférence à l’espace de Sciences , Rennes 21 novembre 2006 :La diversité microbienne dans les 

sites hydrothermaux 

Godfroy, A.La Croix : Victor à l'assaut des grands fonds marins. 12 juillet 2005 

Godfroy, A.Mon quotidien : Le robot Victor part explorer les grands fonds sous-marins. 27 juillet 2005 

Godfroy, A. Le Télégramme de Brest : Sources hydrothermales : l’Atalante aux Açores, 26 juillet 2005 

Godfroy, A. Le Marin : Une nouvelle campagne sur la dorsale médio-Atlantique , 28 juillet 2005 

Godfroy, A. Le Marin : Les Nouvelles de l'Ifremer 27 janvier 2005 (n°364) - Campagne Exomar : comprendre le 

rôle des microorganismes dans l'écosystème 

Godfroy, A.France-Info: Interview par Bruno Rougier «La campagne EXOMAR», en direct de Horta, Açores, 

2 août 2005 

5- Publications de résumés de colloques 

Cf. ; § 6 et 7 

6- Communications dans des colloques internationaux 

a. dont communications orales 

Charlou, J-L., Donval J-P. , Y Fouquet, Y., Jean-Baptiste, P., Dehairs, F. N Holm and Godfroy, A. (2005) 

Organics in hydrothermal fluids from ultramafics on the Mid-Atlantic Ridge (MAR) . AGU Fall meeting San 

Francisco USA 

Charlou, J.L., Donval, J.P., Konn, C.; Jean-Baptiste, P., Holm, N., Dehairs, F. and Bouillon, S. (2006) 

Mineral, gases and organic signature of hydrothermal fluids issued from ultramafics on the Mid-Atlantic Ridge 

European Geosciences Union (EGU) Vienne, Autriche 

Konn,C. Organics in hydrothermal fluids from ultramafic-hosted vents of the Mid-Atlantic Ridge- The first step to 

the origin of life. (2006) 16th V. M. Goldschmidt Conference. 

Kato, C., Takai, K., Hirayama, H., Nakagawa, S., Querellou, J. and Godfroy, A. (2005, Nov) The French-Japanese 

cooperation cruises of the Mid Atlantic Ridge, EXOMAR 2005. 6th Meeting of Japanese Society for Extremophiles, 

J. Jap. Soc. Extremophiles, 4 (2), 105-106, Tokyo, Japan. 

Kato, C., Takai, K., Hirayama, H., Nakagawa, S., Querellou, J. and Godfroy, A. (2006, Jan) Investigation cruises of 

the EXOMAR 2005 The French-Japanese cooperation cruises of the Mid Atlantic Ridge-. Pressure, Hydration 

and Dynamics toward a new dynamic view of protein-, JSPS Core-to-Core Program, International Seminar 

2006, Abstract p. 35, Okinawa, Japan. 

Kato, C., Sato, T., Kawano, H., Abe, F., Ohmae, E., Nakasone, K. (2006, Sep.) Diversity of deep-sea piezophiles, 

and their pressure adapted enzymes. 6th International Conference on Extremophiles, Abstract p. 35, Brest, 

France. 

b. dont posters 

Barbier, G., Le Calvez, T., Burgaud, G., Arzur, D. and Vandenkoornhuyse, P.(2006) New fungal taxonomic groups 

isolated from deep-sea vent ecosystems. International Conference on Extremophiles, Brest, France. 

77



Byrne N., Birrien JL., Strous M., Schmid M., Lesongeur F., Prieur D., Godfroy A. (2006) Looking for ANAMMOX 

bacteria in deep-sea hydrothermal vents. International Conference on Extremophiles, Brest, France. 

Durand,L., V Cueff Gauchard, M Zbinden, E Roussel, N Le Bris, C. Schmidt, C Tessier, B Shillito, and MA Cambon 

Bonavita (2006) Micro-organisms Associated with the Deep Sea Hydrothermal Vent Shrimp Rimicaris exoculata : a 

Possible Symbiosis? 6 th International Conference on Extremophiles, Brest (France). 

Durand,L., V Cueff Gauchard, M Zbinden, N Le Bris, E Roussel, C. Schmidt, B Shillito and MA Cambon Bonavita 

(2006) Micro-Organisms and Minerals Associated to the Rimicaris Exoculata Vent Shrimp. International Symbiosis 

Symposium, Vienne (Autriche). 

Costa, V. and Kadar, E. (2006) Site specific metal signatures in the shells of the deep sea hydrothermal mussel B. 

azoricus - 11th International Deep-Sea Symposium, Southampton, UK. 

Konn, C., Charlou, J. L., Donval, J. P., Holm, N. G., Dumont, M., Dehairs, F. and Bouillon, S. (2006) 

Fluids from ultramafic-hosted vents of the Mid Atlantic Ridge : biogenic or abiogenic organic compounds spotted. 

European Geosciences Union (EGU) Vienne, Autriche 

Martins I., Colaço A, Serrão Santos R., Cosson, R., Sarradin, P-M. (2006) Physiological condition of mussel 

Bathymodiolus azoricus from Eiffel Tower hydrothermal vent field: filament bacteria approach” - 11th International 

Deep-Sea Symposium, Southampton, UK. 

Randrianalivelo, H., Lesongeur, F. and Godfroy, A.(2006) Diversity of microbial mats at deep-sea hydrothermal 

vents (Lucky Strike, MAR). International Conference on Extremophiles, Brest, France. 

Shillito, B., Hamel , G, Ravaux , J., Gaill, F.(2005) Isobaric Collection of Deep-Sea Fauna: the PERISCOP Project, 

3 rd International Symposium on Hydrothermal Vent and Seep Biology, San Diego, USA 

7- Communications dans des colloques nationaux 

a. dont communications orales 

Shillito, B. (invité), Hamel, G., Ravaux, J., Cottin, D., Gaill, F. (2006)La récolte sous pression d'organismes de 

grande profondeur: le projet PERISCOP. 5eme forum national des Hautes Pressions (CNRS) Monthieux, France 

8- Nouvelles espèces (animales, végétales, microorganismes) découvertes et décrites 

9- Rapports de contrats (Union européenne, FAO, Convention, Collectivités …) 

10- Applications (essais thérapeutiques ou cliniques, AMM …) 

11- Brevets 

12- Publications d’atlas (cartes, photos) 

13- Documents vidéo-films 

14- Publications électroniques sur le réseau Internet 

Godfroy, A. Briand, P et Fabri M-C. (2005) Compte rendu de campagne. EXOMAR 

Version électronique sur http://www.sb-roscoff.fr/Ecchis/ 

Base Biocean, 

http://www.ifremer.fr/isi/biocean/acces_fr/cruisefr.htql?numcruise=117 

15- DEA ou MASTER ayant utilisé les données de la campagne 

Lyes Aziz 2005-2006 Master 2 « Microbiologie Fondamentale et Appliquée, Université de Bretagne Occidentale : 

« Etude de la diversité des virus associés à des bactéries thermophiles issues de sources hydrothermales 

océaniques profondes » 

Responsable : Claire Geslin, UBO, Brest 

Gaëtan Burgaud 2005-2006 Master 2 « Microbiologie Fondamentale et Appliquée, Université de Bretagne 

Occidentale : - Etude de la biodiversité fongique marine de sites hydrothermaux de l'Océan Atlantique 

Responsable Georges Barbier, UBO, Brest 

Lucile Durand, 2005-2006 Master 2 « Microbiologie Fondamentale et Appliquée, Université de Bretagne 

Occidentale : « Diversité microbienne de Rimicaris exoculata, une crevette hydrothermale : Une possible 

symbiose. » 

78



Responsable : Marie-Anne Cambon-Bonavita, Ifremer, Brest 

Aurélie Fisher, 2006, élève ingénieur deuxième année Institut National Agronomique de Paris Grignon, stage 6 

mois, 

Etude de la diversité microbienne associée à la crevette hydrothermale Rimicaris exoculata, approche 

bioinformatique. 


Heninstoa Randrianalivelo 2005-2006 Master 2 « Microbiologie Fondamentale et Appliquée, Université de 

Bretagne Occidentale .- Etude moléculaire de la diversité des microorgansimes des tapis bactériens de la source 

hydrothermale de Lucky Strike. 

Responsable Anne Godfroy, Ifremer, Brest 

Agathe Talarmin 2006 Master 1 Master 1 Sciences de la Mer et du Littoral , mention Sciences Biologiques 

Marines , Université de Bretagne Occidentale, Brest 

Comparaison de microhabitats au sein d’une moulière du site hydrothermal Lucky Strike 

Responsable Jozée Sarrazin, Ifremer, Brest 

Claire Tessier 2006 Master 1 Sciences de la Mer et du Littoral , mention Sciences Biologiques Marines , 

Université de Bretagne Occidentale, Brest 

Etude des microorganismes présents dans la cavité branchiale et dans l'environnement de la crevette 

hydrothermale Rimicaris exoculata. 


16- Thèses ayant utilisé les données de la campagne 

Gaëtan Burgaud. Doctorat 2006-2009, Ecole doctorale des Sciences de la mer 

Etude de la biodiversité fongique marine issue de sites hydrothermaux profonds. 

Directeur de thèse/ Responsable Scientifique Georges BARBIER, UBO, Brest 

Nathalie Byrne Doctorat 2005-2008, Ecole Doctorale des Sciences de la Mer,Université de Bretagne Occidentale, 

Brest: Diversité métabolique des communautés microbiennes des édifices hydrothermaux actifs. 

Directeur de thèse/ Responsable Scientifique : Anne GODFROY Ifremer, Brest 

Lucile Durand 2006-2009 , Ecole Doctorale des Sciences de la Mer,Université de Bretagne Occidentale, Brest: 

Diversité des peuplements microbiens épibiontes de la crevette hydrothermale Rimicaris exoculata : une possible 

association mutualiste ? 

Directeur de thèse : Daniel Prieur, UBO, Brest Responsable Scientifique : Marie-Anne Cambon Bonavita, Ifremer, 

Brest 

Inês Martins. Doctorat 2005-2009, Technologie and Science Fundation, Portugal 

Ecotoxicology response of mussel Bathymodiolus azoricus within the fauna of Lucky Strike hydrothermal vent: 

microenvironment biotic and abiotic influence. 

Directeur de thèse/ Responsable Scientifique Ricardo Serrão Santos (DOP-UAçores), Ana Colaço (DOP- 

UAçores), Richard Cosson (University of Nantes), Pierre-Marie Sarradin (DRO-IFREMER). 

Erwan Roussel Doctorat 2004-2007, Ecole Doctorale des Sciences de la Mer,Université de Bretagne Occidentale, 

Brest 

Diveristé microbiennes des sédiments marins profonds: Approches culturales et moléculaires. 

Directeur de Thèse : Daniel PrieurUBO, Brest ; Responsable scientifique : Marie-Anne Cambon Bonavita. 

Caroline Schmidt 2005-2008 Iron biogeochemical processes associated with symbiotic shrimps in deep-sea 

hydrothermal environments 

Directeur de thèse/ : Nadine LeBris, Ifremer Brest, Françoise Gaill, UMPC, Paris 

17- Validation des données 

18- Transmission au SISMER 

19- Transmission à d’autres banques de donnée 

20- Transmission à d’autres équipes 

21- Considérez-vous l’exploitation en cours 

79

BIG 2010 - Station Biologique de Roscoff

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