Luglio 2007 - Associazione Nazionale Allevatori del Cavallo Trottatore

ossa nelle articolazioni Cavallo da sella Trottatore 42 campione di
DNA, i frammenti generati dal taglio saranno grandi e, formeranno
bande che migreranno poco durante l’elettroforesi. Se i siti di
restrizione sono più frequenti nel campione, il DNA sarà tagliato in
frammenti più piccoli che migreranno più rapidamente nel gel.
PCR - La maggior parte delle tecniche che usano marcatori molecolari
sono basate sulla reazione a catena della polimerasi (PCR, Polymerase
Chain Reaction), una tecnica che ha rivoluzionato l’intero
campo della genetica. La PCR è una tecnica semplice e automatizzata
per produrre molte copie di uno specifi co frammento di DNA. A
tal scopo, si sintetizzano dei piccoli oligonucleotidi (lunghezza da
20 a 30 basi), complementari alle due estremità di un determinato
frammento da amplifi care che vengono utilizzati come primers (inneschi)
per la sintesi di DNA. I primers sono, quindi, miscelati al
campione di DNA da analizzare, alla DNA-polimerasi (che catalizza
la sintesi del DNA) e ad un eccesso dei quattro nucleotidi (A,T,C e
G). Tale miscela viene quindi sottoposta a ripetuti cicli di:
1) denaturazione del campione di DNA in fi lamenti singoli che fungono
da stampo nella reazione di sintesi;
2) legame (annealing) dei primers ai suddetti fi lamenti;
3) sintesi di nuove copie del DNA tra i due primers.
Microsatelliti - Gli RFLP sono stati sostituiti negli anni 90 da altri
marcatori, i microsatelliti che possono essere facilmente analizzati
utilizzando la tecnica della catena a reazione della polimerasi
(PCR). Lo sviluppo dei microsatelliti ha consentito un notevole progresso
nei metodi di analizzare il genoma. Questi marcatori sono
caratterizzati da un numero variabile di ripetizioni di sequenze di
1-5 nucleotidi e sono altamente informativi grazie al loro elevato
numero di alleli (polimorfi smo). In genere i microsatelliti si trovano
in regioni anonime del DNA, cioè regioni che non hanno una funzione
nota. Altre caratteristiche di questi marcatori sono:
- codominanza (eterozigote riconoscibile);
- visualizzazione risultati mediante l’elettroforesi (gel di acrilamide).
I microsatelliti vengono utilizzati nelle seguenti applicazioni:
- stima del fl usso genetico tra popolazioni;
- variabilità genetica tra ed entro popolazioni;
- effetti dell’ibridazione;
- analisi del pedigree;
- mappatura del menoma.
La mappatura del genoma viene utilizzata per identifi care i loci
responsabili della variabilità genetica quantitativa (QTL) e i geni
maggiori cioè a largo effetto. Il concetto generale di identifi cazione
dei geni responsabili di una malattia genetica si basa sulla presenza
di disequilibrio di associazione tra gli alleli di geni marcatori e
quelli del gene di interesse. Il grado di disequilibrio tra il marcatore
e il gene dipende in modo non lineare dalla loro distanza e,
in parte, dal tipo di popolazione che si analizza. Sono, in genere,
utilizzate due strategie per l’identifi cazione questi geni: 1) scansione
del genome 2) gene canditato. Con la scansione del genoma
si analizza tutto il genoma dell’animale, tipizzando un certo numero
di marcatori informativi. L’effi cacia di questo metodo dipende dal
numero di marcatori che sono tipizzati, dal numero di alleli di questi
marcatori, dallo schema sperimentale e dal numero di animali analizzati.
L’approccio del gene candidato si basa sull’ipotesi che alcuni
geni, in base alla loro funzione fi siologica e biochimica, possano
infl uenzare direttamente un carattere di interesse.
FRANCESCA COSTA
(Libero professionista)
EDO D’AGARO
Dipartimento di Scienze Animali
Facoltà di Medicina Veterinaria di Udine
Via S. Mauro 2, 33010 Pagnacco (UD ) tel: 0432-650110;
fax: 0432-660614 e-mail: dagaro@dspa.uniud.it
GLOSSARIO DI GENETICA
ABERRAZIONE Una anormalità, associata generalmente al numero e a malformazioni
nei cromosomi. ACIDO NUCLEICO Molecole composte da purine, pirimidine,
carboidrati e acido fosforico, concentrate nel nucleo della cellula. ALLELE Un allele
è la variante di un gene. Alleli differenti allo stesso locus (in cromosomi omologhi)
contribuiscono in maniera differente al espressione di un carattere. Un individuo
porta due alleli per ogni gene (tranne che per gli alleli sul cromosoma X nei maschi),
ciascuno ereditato da ognuno dei suoi genitori. ALLELI CODOMINANTI Nessuno dei
due domina sull’altro (neanche parzialmente). Rappresenta l’eccezione alla legge
della dominanza di Mendel. ALLELI DOMINANTI Alleli che determinano il fenotipo pur
essendo presentì in singola copia (cioè, in un individuo eterozigote). ALLELI MULTIPLI
Una serie di alleli (maggiore di due) che occupa un locus su un cromosoma in una
popolazione. AMBIENTE Tutti i fattori esterni con i quali il genotipo dell’animale
interagisce per determinare il suo fenotipo.ANEUPLOIDIA Variazione nel numero dei
cromosomi che non interessa l’intera serie dei cromosomi, ma solo parte di essa.
ANTENATO Un individuo dal quale un animale è discendente. APLOIDE Riferito a una
cellula con un solo set di cromosomi. ASSOCIAZIONE – LINKAGE Situazione nella quale
due geni sono situati sullo stesso cromosoma ad una distanza che non consente
l’indipendenza. Il tasso di associazione misura la frequenza alla quale i due geni
restano uniti durante la gametogenesi. AUTOSOMI Tutti i cromosomi ad eccezione dei
cromosomi sessuali (eterocromosomi) e che sono tra loro simili in entrambi i sessi.
CARATTERE Una caratteristica o qualità distinguibile. Caratteri Legati al Sesso Caratteri
che sono infl uenzati da geni situati sui cromosomi sessuali. CARATTERI QUALITATIVI
Caratteri determinati da pochi geni con distinzione netta tra i fenotipi. Sinonimo di
caratteri Mendeliani. CARATTERI QUANTITATIVI Caratteri determinati da molti geni
(poligeni) con mancanza di distinzione netta tra i fenotipi. CODOMINANZA Un tipo
di azione genica nella quale due o più alleli esibiscono approssimativamente eguale
espressione. Assenza di dominanza completa tra alleli.CROMOSOMA Uno dei diversi
fi lamenti relativamente lunghi che si trovano nel nucleo della cellula; i cromosomi
sono fatti di proteine e DNA e portano i geni. CROMOSOMI OMOLOGHI I cromosomi
si presentano in coppie pressoché identiche, uno trasmesso dal padre ed uno dalla
madre. CROMOSOMI SESSUALI Una coppia di cromosomi presente negli animali e che
determina il sesso dell’individuo. LOCUS Un locus è una regione sul cromosoma dove
un dato gene è situato. Negli animali diploidi, un locus consiste di due siti occupati da
un gene ereditato da ogni genitore. MARCATORE ASSOCIATO Un marcatore associato è
un marcatore genetico che è associato ‘linked’ ad un QTL o gene maggiore.MARCATORE
GENETICO Un marcatore genetico è una sequenza del DNA che è diversa tra animali e
può essere esaminato facilmente in laboratorio. MUTAZIONE Un cambiamento nella
sequenza della coppia di basi nella molecola del DNA e risultante nella formazione di
un allele.NUCLEOTIDE L’unità base del DNA consta da una base organica, uno zucchero
pentoso, ed un fosfato. NUCLEO La porzione della cellula che porta i cromosomi e
quindi il materiale ereditario. OMOZIGOTE Un omozigote è un individuo che ha due
alleli identici al locus interessato. PEDIGREE La lista degli antenati di un individuo.
La defi nizione è spesso estesa ad includere gli animali che sono parenti collaterali
dell’individuo. POLIGENI Due o più (generalmente molti, e con effetto cumulativo)
coppie di alleli che infl uenzano un singolo carattere. PORTATORE Riferito ad un
individuo che esprime un carattere dominante, ma che porta anche il gene recessivo.
PROBABILITÀ Espressione matematica in relazione alle frequenze con le quali eventi
specifi ci possono o non possono presentarsi. PROGENIE I fi gli di un individuo. QTL
(Locus per un Carattere Quantitativo) - Quantitative Trait Locus Un locus è una regione
nel genoma che può comprendere diversi geni, uno o più dei quali infl uenzano il
carattere. RECESSIVO Riferito ad un gene la cui espressione può essere modifi cata o
soppressa dall’allele dominante.
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