Sinteza lucrării - Lorentz JÄNTSCHI

ID1051/2007 - Sinteza lucrării - perioada 2007-2010
A6: Planificarea activitătilor experimentale; derularea experimentelor demostrative (de
testare a metodelor de analiză)
R6: Planificarea activităţilor experimentale a urmat schema: Selectare activitate
biologică de interes (chimie medicală); Selectare clasă de compuşi cu potenţă
biologică (biochimie); Design structură la nivel topologic (chimie matematică);
Design structură la nivel geometric (chimie cuantică); Generare familie de
descriptori moleculari (chimie combinatorială); Analiză structură-activitate (virtual
screening); Modelare matematică şi validare statistică (statistică aplicată); Selecţie,
mutaţie şi încrucişare modele (informatică aplicată); Validare potenţă biologică
(chimie medicală). Experimente demonstrative au fost derulate pentru punctul de
topire (MP) al aminoacizilor (fiind incluşi în analiză 31 de aminoacizi, dintre care 23
au format setul de învăţare) când s-a reuşit îmbunătăţirea capacităţii estimative de la
o determinare de 63% (folosind un model structură-activitate cu o variabilă
independentă) 99% (folosind un model structură-activitate cu patru variabile
independente).
A7: Proiectarea şi crearea bazelor de date pentru managementul cercetării şi a
rezultatelor cercetării
R7: Baza de date realizată (denumită MDFV) are următoarea structură (repetitivă pentru
fiecare set de compuşi supus investigaţiilor şi exemplificată pentru setul de 31 de
aminoacizi): Tabela 31aa_data (3 câmpuri, 31 înregistrări): Id (cheie primară), Mol
(abreviere aminoacid), Hin (câmp binar conţinând designul geometric al structurii
obţinut din optimizarea geometrică a conformaţiei moleculare); Tabela 31aa_prop
(31 câmpuri, 1 înregistrare): Property (abreviere proprietate), Aib..Val (câmpuri
numerice conţinând valoarea proprietăţii măsurate pentru fiecare compus); Tabela
31aa_mdfv (1+31 câmpuri, 2387280 înregistrări): valorile descriptorilor moleculari
indexate după un câmp cheie primară; Tabela 31aa__MP (4+31 câmpuri, 7617
înregistrări - pentru MP) - conţinând modelele structură-activitate cu o variabilă
independentă pentru proprietatea MP obţinute în urma selecţiei pe baza concordanţei
folosind algoritmul Goodman-Kruskal; Tabela 31aa_qsar (6 câmpuri, număr variabil
de înregistrări - 30 pentru MP) - conţinând modelele structură-activitate mai mult de
o variabilă independentă pentru setul 31aa obţinute în urma încrucişării folosind un
algoritm genetic clasic.
A8: Completarea bazelor de date cu cunoştinţele provenite din documentare şi
Actualizare documentare (O1/2007) şi respectiv Managementul cunoştinţelor
(O2/2007)
R8: Actualizarea documentării cu privire la stadiul cunoaşterii a dus la includerea în
evidenţe a unui număr de 321 de baze de date relevante pentru caracterizarea
structurii şi proprietăţilor chimice ale compuşilor de interes medical, clasificate la
R1-3. Baza de date a fost completată cu cunoştinţe provenite din Managementul
cunoştinţelor prin includerea în baza de programe a unui algoritm genetic clasic
pentru încrucişarea variabilelor independente aşa cum în lucrarea [Lorentz
JÄNTSCHI, Sorana D. BOLBOACĂ, Mircea V. DIUDEA, Chromatographic
Retention Times of Polychlorinated Biphenyls: from Structural Information to
Property Characterization, International Journal of Molecular Sciences, 8(11), 1125-
1157, 2007] a fost prima dată comunicată metoda.
A9: Participări la manifestări ştiinţifice (diseminare - conferinţe, congrese, workshopuri)
şi dobândirea de competenţe complementare (stagii de documentare/cercetare în
străinătate)
R9-1: Fourth International Conference of Applied Mathematics and Computing;
Organizator: Technical University of Plovdiv (TUP), Plovdiv, BG; Tip: conferinţă
internaţională; Perioadă: 11-19 August 2008; Participanţi: Lorentz JÄNTSCHI,
Carmen E. STOENOIU;