подсекция «цикл наук о живом

Ломоносов-2008 «Химия» Цикл наук о живом
Изучение влияния комплексов метилтрансфераз с рибосомной рнк на структуру
рибосом
Сергеева О. В., Сергиев П. В.
МГУ им. М.В .Ломоносова, химический факультет, г.Москва, Россия
olga.sergeeva.v@gmail.com
Основной функцией рибосомы является перевод информации, закодированной в
матричной РНК, в самостоятельную единицу метаболизма – белок. Функциональную и
структурную основу рибосомы составляют молекулы РНК. Особенностью этой РНК
является наличие модификаций, в основном метилирования и псевдоуридинилирования,
реакции образования которых происходят на ранних этапах сборки рибосомы.
Наибольший интерес представляют модификации, находящиеся в функциональноважных
областях: каталитических центрах, лиганд-связывающих областях, поверхности
контакта двух субъединиц. Так, например, метилтрансфераза RsmD метилирует G966,
расположенный в 31 спирали 16S рРНК, там он образует часть полости, в которой
происходит связывание тРНК в Р-сайте. А метилтрансфераза RlmF метилирует A1618,
который участвует в образовании пептидного канала.
Целью данной работы является изучение влияния комплексов метилтрансфераз
RsmD и RlmF с рРНК на структуру рибосом.
Для этого были выделены метилтрансферазы и рибосомы из клеток E. Coli,
содержащии делеции генов сответствующих метилтрансфераз: RsmD и RlmF.
Существование комплексов было доказано методом гель-фильтрации. Для изучения
влияния комплексов на структуру рибосомы использовался метод химической
модификации с дальнейшим анализом с помощью реакции с обратной транскриптазой и
ПААГ.
В результате данной работы было доказано существование комплексов
метилтрансфераз RsmD и RlmF с соответствующими рРНК. А также обнаружены
некоторые основания, защищенные комплексами от модификации химическими
реагентами, то есть изучено влияние комплексов на структуру рибосомы.
[1] D. Moazed, S. Stern and H.F. Noller. Rapid chemical probing of conformation in 16 S
ribosomal RNA and 30 S ribosomal subunits using primer extension. J Mol Biol, 1986, V. 187,
N. 3, p. 99-416.
[2] C. Weitzmann, S. J.Tumminia, M. Boublik and J Ofengand. A paradigm for local
conformational control of function in the ribosome: binding of ribosomal protein S19 to
Escherichia coli 16S rRNA in the presence of 57 is required for methylation of m 2 G966 and
blocks methylation of m 5 C967 by their respective methyltransferases. Nucleic Acids Research,
1991, Vol. 19, N. 25, p. 7089- 7095.
298