12.07.2015 Views

Klastrowanie, klasyfikacja

Klastrowanie, klasyfikacja

Klastrowanie, klasyfikacja

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

W jaki sposób ocenić jakość klastrowania?• Wizualnie – obejrzeć czy profile ekspresji genów w klastrach są podobne.Trudne do weryfikacji, gdy jest wiele genów i próbek• Powiązanie biologiczne – sprawdzenie czy geny w jednym klastrze mająpodobną funkcjonalność• K-means – sprawdzenie czy dla kilkukrotnego uruchomienia z tą samą liczbąklastrów otrzymujemy takie same klastry (jeśli nie, być może liczbaklastrów jest niepoprawnie dobrana)• Metody bootstrapowe – tworzonych jest wiele zestawów wejściowych ikażdy z nich jest klastrowany, następnie klastry są porównywane;• najpewniejsze są klastry, które powtarzają się we wszystkich badanychzbiorach;• klastry, które pojawiają się rzadko nie są odporne na błędy eksperymentalne inie można z nich wyciągać pewnych wniosków

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!