Klastrowanie, klasyfikacja
Klastrowanie, klasyfikacja
Klastrowanie, klasyfikacja
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
W jaki sposób ocenić jakość klastrowania?• Wizualnie – obejrzeć czy profile ekspresji genów w klastrach są podobne.Trudne do weryfikacji, gdy jest wiele genów i próbek• Powiązanie biologiczne – sprawdzenie czy geny w jednym klastrze mająpodobną funkcjonalność• K-means – sprawdzenie czy dla kilkukrotnego uruchomienia z tą samą liczbąklastrów otrzymujemy takie same klastry (jeśli nie, być może liczbaklastrów jest niepoprawnie dobrana)• Metody bootstrapowe – tworzonych jest wiele zestawów wejściowych ikażdy z nich jest klastrowany, następnie klastry są porównywane;• najpewniejsze są klastry, które powtarzają się we wszystkich badanychzbiorach;• klastry, które pojawiają się rzadko nie są odporne na błędy eksperymentalne inie można z nich wyciągać pewnych wniosków