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Literaturdatenbanken im Bereich Life-Science

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

<strong>Literaturdatenbanken</strong> <strong>im</strong> <strong>Bereich</strong> <strong>Life</strong>‐<strong>Science</strong><br />

3. Juli 2009<br />

10:45-15:00 Uhr<br />

03.07.2009<br />

BTH Fachreferat Biologie : Dr. Susanne Ruffert ruffert@bth.rwth‐aachen.de Fon: 80‐94452 1


Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Was erwartet Sie?<br />

Analyse des Informationsbedarfs –<br />

Was brauche ich?<br />

Informationsquellen in der BTH –<br />

Wo finde ich…?<br />

Suchstrategie entwickeln –<br />

Wie suche ich?<br />

Rechercheergebnis bewerten –<br />

Wie opt<strong>im</strong>iere ich die Recherche?<br />

Präsentation<br />

Praxis<br />

03.07.2009<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

I. Analyse des Informationsbedarfs<br />

Was brauche ich?<br />

Einführungen in ein • Lehrbücher, Dissertationen, Handbücher<br />

Thema/Methode<br />

• Reviews<br />

Aktuelle<br />

Forschungsergebnisse<br />

• Zeitschriftenartikel ift tik (P („Paper“),<br />

Konferenzberichte<br />

• Patente<br />

Infos zu<br />

• Web of <strong>Science</strong>, JCR<br />

Kooperationspartnern,<br />

Zi Zeitschriften hif etc.<br />

• Internetquellen<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Aktualität wissenschaftlicher Literatur<br />

Art der Publikation<br />

Zeitraum<br />

Lehrbuch<br />

5‐10 Jahre<br />

Monographien,<br />

Proceedings<br />

3‐5 Jahre<br />

Reviews<br />

1‐2 Jahre<br />

Artikel<br />

referierter<br />

Journale<br />

6‐12 Monate<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

II. Informationsquellen in der Hochschulbibliothek<br />

Wo finde ich…?<br />

Lehrbücher, Handbücher,<br />

• Bibliothekskataloge (Bestandsnachweis)<br />

Zit Zeitschriften hift • nur für selbstständig erschiene Literatur<br />

(Keine Seitenzahlangabe!)<br />

Paper, Reviews, Patente,<br />

Fakten<br />

• <strong>Literaturdatenbanken</strong> (Publikationsnachweis)<br />

• unselbstständig erschienene Literatur,<br />

Spezialdatenbanken für Patente, Normen, Daten<br />

Infos zu<br />

Kooperationspartnern,<br />

Diskussionsgruppen etc.<br />

• Zitationsdatenbanken, Internetquellen:<br />

DBIS: Portale, Virtuelle Fachbibliotheken....<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Einige Begriffe....<br />

<strong>Literaturdatenbanken</strong> = Bibliographische Datenbank...<br />

• verzeichnet hauptsächlich wissenschaftliche Zeitschriftenartikel, aber auch, in geringerem<br />

Umfang, Reports, Patente, Bücher/Buchartikel<br />

• bihlttLit beinhaltet Literaturnachweise, t i die nicht ihtan einen Standort t gebunden sind, keine ki Volltexte<br />

t<br />

• ist i.d.R. fachspezifisch, es gibt aber auch fachübergreifende Datenbanken<br />

Datenbankproduzenten...<br />

• sammeln und ordnen die Informationen und bauen die Datenbank nach einer best<strong>im</strong>mten<br />

Struktur auf; z.B. BIOSIS (mittlerweile Thompson)<br />

Datenbankanbieter (Hosts)...<br />

• Bieten die Datenbanken unter einer best<strong>im</strong>mten Suchoberfläche für den Kunden an; z.B. zB BIOSIS<br />

bei Ovid, bei ISI Web of Knowledge, STN etc.<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Was muss ich über die <strong>Literaturdatenbanken</strong> wissen?<br />

• Wie ist die Datenbank zugänglich?<br />

• Welchen Umfang hat der Inhalt der Datenbank?<br />

‐ Thematisches Spektrum, Berichtzeitraum, Dokumenttyp, ausgewertete Zeitschriften...<br />

• Wie ist die Datenbank aufgebaut?<br />

‐ Suchfelder, Index, Thesaurus, normiertes Vokabular, Klassifikation...<br />

• Welche speziellen Suchmöglichkeiten bietet sie?<br />

‐ Operatoren, Trunkierungen<br />

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Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

<strong>Life</strong> <strong>Science</strong> <strong>Literaturdatenbanken</strong> <strong>im</strong> Angebot der BTH<br />

• BIOSIS Previews 1926‐ / Web of Knowledge…<br />

o größte Datenbank <strong>im</strong> <strong>Bereich</strong> der Biowissenschaften: 18 MIO<br />

• MEDLINE 1950‐/ Web of Knowledge….<br />

o 12 MIO, 4.800 biomedizinische Zeitschriften<br />

allgemein<br />

• SCI Finder Scholar (Chemical Abstracts)<br />

o >25 MIO Dokumente; ou ete;Quellen: e Zeitschriften etsc te und Patentinformation<br />

t o<br />

o Substanzen (1907‐) und chemische Reaktionen (37 MIO Einträge)<br />

• CEABA Chemische Technik u. Biotechnologie (1966‐) /FIZ Technik<br />

o 700.670 Dokumente, jährlicher Zuwachs: 15.000<br />

• CAB Abstracts 1910 –1989 /OvidSP<br />

o Veterinär‐, Agrar‐, Forst‐, Ernährungswiss., Umweltwiss., Lebensmittelkunde<br />

speziell<br />

• Zoological Record Archive 1864 – 2007/Ovid SP<br />

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Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

<strong>Literaturdatenbanken</strong> <strong>im</strong> Vergleich<br />

In<br />

welcher<br />

2818 Titles Web of<br />

2624 Titles<br />

Datenbank<br />

suchen?<br />

<strong>Science</strong><br />

8.800 Titles<br />

MEDLINE<br />

4.962 Titles<br />

BIOSIS<br />

Previews<br />

5.200 Titles<br />

2043 Titles<br />

BIOSIS Previews hat ca. 1.900 Titel,<br />

die weder in Web of <strong>Science</strong><br />

noch in Medline enthalten sind!!!!!<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Metasuche = gleichzeitige Suche in mehreren Datenbanken<br />

• Metasuche in Web of Knowledge<br />

o BIOSIS Previews 1926‐<br />

o Medline 1950 –<br />

o <strong>Science</strong> Citation Index 1945‐<br />

• Metasuche in OvidSP<br />

o BIOSIS Previews 1969 – 2008<br />

o MEDLINE 1950 –<br />

o Biological Abstracts Archive 1926 to 1968<br />

o Zoological Record 1864 to 2007<br />

…..<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Im Fokus<br />

• BIOSIS / Web of Knowledge (WoK)<br />

• Medline / Web of Knowledge (WoK)<br />

• CEABA / FIZ Technik<br />

Präsetation<br />

Praxis<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

III. Suchstrategien entwickeln: Suchbegriffe finden<br />

• Analysieren Sie, welche Aspekte Ihr Thema beinhaltet<br />

• Suchen Sie nach Synonymen, Ober‐, Unter‐ und verwandten Begriffen<br />

Beispielthema: Rolle von Hormonen bei der Häutung in Arthropoden<br />

Hormones involved in the process of moulting in arthropods<br />

Aspekt 1 Aspekt 2 Aspekt 3<br />

Häutung<br />

Moulting<br />

Ecdysis<br />

Ekdysis<br />

Hormone(s)<br />

Arthopod(s)<br />

Arthropod(en)<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Suchbegriffe finden<br />

• Suchbegriffe des Suchenden müssen den suchbaren Begriffen in der Datenbank<br />

entsprechen!<br />

‣ beide Seiten müssen die gleiche Sprache sprechen!<br />

• wenn möglich, Indexlisten/Thesauri/Klassifikationen benutzen!<br />

• Ab Arbeit mit Platzhaltern:<br />

lt<br />

Trunkierungen beliebige Zeichenanzahl<br />

Joker<br />

genau ein Zeichen<br />

Wildcards festgelegte g Zeichenanzahl<br />

Beachte: datenbankspezifische Syntax<br />

• Verknüpfungen der Suchbegriffe (Operatoren)<br />

Boole‘sche Operatoren<br />

Abstandsoperatoren<br />

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Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Suchbegriffe: Stichwort‐ vs. Schlagwortsuche<br />

Stichworte<br />

t Schlagworte<br />

‐ kommen <strong>im</strong> Text/Datenbankfeldern vor<br />

(Titel, Abstract, Volltext, Deskriptoren...)<br />

Vorsicht:<br />

• Beschreiben nicht <strong>im</strong>mer<br />

den eigentlichen Inhalt des Dokuments!<br />

• Können in best<strong>im</strong>mten Formen vorliegen<br />

‐ werden intellektuell vergeben<br />

• Unkontrollierte (freie) Schlagwörter<br />

‐ auch Deskriptoren genannt<br />

• Kontrollierte (gebundene) Schlagwörter<br />

‐ Regelwerk mit normierten Wortlisten<br />

In Bibliographien können beide Varianten<br />

gleichzeitig vorkommen!<br />

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Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Thesaurus<br />

• ist eine Sonderform eines kontrollierten Vokabulars:<br />

Hierarchischer Aufbau!<br />

• soll eindeutige Benennungen für einen Begriff schaffen<br />

• verweist von Synonymen, Übersetzungen oder Abkürzungen<br />

auf den kontrollierten Begriff<br />

Kürzel und Bezeichnungen nach DIN 1463‐1 bzw. ISO 2788 sind:<br />

BF ‐ Benutzt für<br />

UF ‐ Used for<br />

BS ‐ Benutze Synonym<br />

USE/SYN Use synonym<br />

OB –Oberbegriff<br />

BT ‐ Broader term<br />

UB –Unterbegriff<br />

NT ‐ Narrower term<br />

VB ‐ Verwandter Begriff<br />

RT ‐ Related term<br />

SB – Spitzenbegriff TT ‐ Top term<br />

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Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

In BIOIS: Major Concepts<br />

• 168 Themen/Begriffe<br />

• 77 Oberbegriffe (= top level major concepts)<br />

• 91 Unterbegriffe (= narrow concepts)<br />

Ausschnitt:<br />

Education<br />

Environmental <strong>Science</strong>s<br />

Cl<strong>im</strong>atology<br />

Ecology<br />

Estuarine Ecology<br />

Freshwater Ecology<br />

Groundwater Ecology<br />

Marine Ecology<br />

Subterranean Ecology<br />

Terrestrial Ecology<br />

Geology<br />

Equipment, Apparatus, Devices and Instruments<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Klassifikation<br />

• ist ein Ordnungssystem, das fachlich gegliedert und hierarchisch organisiert ist.<br />

• hat Notationen, die unabhängig von Bezeichnungen sind (Kontinuität).<br />

• kann bedarfsgerecht erweitert werden (Aktualität).<br />

Beispiel:<br />

FIZ‐Technik : CEABA<br />

Datenbank Klassifikation<br />

3A Unternehmen, Management, Recht, Märkte, Politik<br />

3B naturwissenschaftlich-technische Grundlagen, Methoden und Modelle<br />

3D Datenverarbeitung<br />

3E Energietechnik und -wirtschaft<br />

3F Elektronik, Mikroelektronik<br />

3G Nachrichten- und Kommunikationstechnik<br />

3I Mess-, Prüf-, Steuerungs- und Regelungstechnik<br />

3K Werkstoffe, Werkstoffeigenschaften<br />

3L Fertigungstechnik<br />

3M Maschinenbau<br />

3N Verkehr, Transport, Fahrzeuge<br />

3P Verfahrenstechnik, Bioverfahrenstechnik, Aufbereitungstechnik, Reaktion<br />

3Q Mikrotechnik, Nanotechnik<br />

3R biomedizinische Technik<br />

3S Holz und Papier<br />

3T Textil, Bekleidung, Textilmaschinen<br />

3U Umweltschadstoffe, -belastung, -technik<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

In BIOIS: Concept Codes<br />

• 5stellige Notation für breit gefächerte Themenbereiche<br />

• Nach der numerischen Notation folgt eine Definition (= concept heading)<br />

• Verschiedene Concept Codes sind in Überschriften zusammen gefasst<br />

(=Broad Concept Headings)<br />

Ausschnitt:<br />

Broad Concept Heading Concept Code Concept Heading<br />

General biology 00502 philosophy<br />

00504 taxonomy, nomenclature and terminology<br />

00506 explorations, expeditions, etc.<br />

00508 institutions, administration and legislation<br />

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Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Suchbegriffe: Trunkierungen / Wildcards (Joker)<br />

• Carbo? = carbon, carbox, carboy etc.<br />

• car?on = carbon, carton etc.<br />

• ???oxide = monoxide, peroxide etc.<br />

• carbo* = carbon,carboxylic, etc.<br />

• carbo*ate = carbonate, carbohydrate, carbocysteinate<br />

• *oxide = monoxide, titanoxide, id lithium‐mangan‐mischoxide<br />

i h id<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Suchbegriffe verknüpfen: Bool‘sche Operatoren<br />

Operator AND bildet eine Schnittmenge<br />

ecdysis<br />

hormone<br />

Operator OR bildet eine Vereinigungsmenge<br />

ecdysis<br />

moulting<br />

Operator NOT schließt aus<br />

moulting<br />

mammals<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Operatoren: Vergleich mit der Alltagssprache<br />

Beispiel nach „Hapke, Thomas: Recherchestrategien in elektronischen Datenbanken.<br />

http://www.tu-harburg.de/b/hapke/infolit/rechstrg.htm.“<br />

Suppe UND Salat<br />

<strong>im</strong> normalen Restaurant:<br />

1 Teller Suppe<br />

und<br />

1 Teller Salat<br />

<strong>im</strong> Boole‘schen Restaurant:<br />

1 Teller Salatsuppe<br />

Suppe ODER Salat<br />

<strong>im</strong> normalen Restaurant:<br />

1 Teller Suppe<br />

oder<br />

1 Teller Salat<br />

<strong>im</strong> Boole‘schen Restaurant:<br />

1 Tll Teller Suppe und<br />

1 Teller Salat und<br />

1 Teller Salatsuppe<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Suchbegriffe verknüpfen: Nachbarschaftsoperatoren<br />

• Nachbarschafts‐Operatoren: L<strong>im</strong>itieren Suche <strong>im</strong> Vergleich<br />

zum AND Operator<br />

‣ SAME ‐ Suchbegriffe tauchen <strong>im</strong><br />

‐ gleichen Satz /‐ gleichen Datenbankfeld auf<br />

‣ WITH ‐ Suchbegriffe tauchen <strong>im</strong> gleichen Satz auf<br />

‣ AJD ‐ (adjacent ) Suchbegriffe stehen direkt nebeneinander<br />

‐ auch: Phrase Searching, angezeigt g durch Anführungszeichen<br />

‣ AJDn ‐ Suchbegriffe sind durch n Wörter getrennt<br />

03.07.2009<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Suchhilfen bei BIOSIS (Web of <strong>Science</strong>) und CEABA (FIZ Technik)<br />

BIOSIS* <strong>im</strong><br />

WoS<br />

CEABA<br />

OPERATOREN<br />

‐ AND/OR/NOT<br />

‐ SAME<br />

OPERATOREN<br />

‐ AND/OR/NOT<br />

‐ADJ/ADJn/WITH/SAME<br />

TRUNKIERUNGEN<br />

* = unbegrenzt<br />

? = einzelne Buchstaben<br />

$ = kein/ein Buchstabe<br />

TRUNKIERUNGEN<br />

*/$ = unbegrenzt<br />

? = einzelne Buchstaben (3)<br />

*n/$n = def. Anzahl Buchstaben<br />

* Gilt auch für Medline <strong>im</strong> WoK<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Order of Precedence in BIOSIS<br />

• Reihenfolge, in der Operatoren bearbeitet werden:<br />

‣ SAME<br />

‣ NOT<br />

‣ AND<br />

‣ OR<br />

Beispiel:<br />

copper OR lead AND algae<br />

Wird so umgesetzt: copper OR (lead AND algae)<br />

Eingabe also so!!<br />

(copper OR lead) AND algae<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

IV. Rechercheergebnis bewerten<br />

Wie opt<strong>im</strong>iere e ich die deRecherche?<br />

e c e<br />

Bei der Recherche gibt es <strong>im</strong>mer eine Gratwanderung zwischen zu wenigen und zu vielen<br />

Treffern:<br />

Relevanz =<br />

Zahl der gefundenen relevanten Dokumente<br />

Zahl der gefundenen Dokumente<br />

Vollständigkeit =<br />

Zahl der gefundenen relevanten Dokumente<br />

Zahl der relevanten Dokumente in der Datenbank<br />

03.07.2009<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Relevanz und Vollständigkeit<br />

relevant aber<br />

nicht<br />

gefunden<br />

relevant und<br />

gefunden<br />

nicht relevant<br />

und gefunden<br />

• Alle Treffer sind relevant: Hinweis auf Unvollständigkeit<br />

• Je vollständiger die Suche, desto mehr irrelevante Treffer gibt es<br />

03.07.2009<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Recherche modifizieren<br />

Zu wenig Treffer<br />

• Relevante Treffer sichten<br />

‐ Suche mit weiteren Synonymen/Schlagwörtern („OR“)<br />

• Thema weiter fassen<br />

‐ Wortliste ergänzen / mittels Trunkierungen erweitern<br />

• Suchinstrumente<br />

‐Schlagwortindex nutzen/ auf zusätzliche Suchbegriffe prüfen<br />

• Fehlerquellen suchen<br />

‐Tippfehler<br />

‐ falsche Platzhalter<br />

‐ Falsche Suchlogik<br />

‐ Voreinstellungen nicht beachtet?<br />

03.07.2009<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Recherche modifizieren<br />

Zu viele Treffer<br />

• Relevante Treffer sichten<br />

‐ Suche nach genaueren Synonymen/Schlagwörtern<br />

• Thema enger fassen<br />

‐ Nebenaspekte weg lassen<br />

‐ Trunkierungen einschränken<br />

• Irrelevante Treffer sichten<br />

‐ Arbeiten mit dem Nicht‐Operator<br />

• Speziellere Datenbanken benutzen<br />

03.07.2009<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Tipps zur Literaturrecherche: Zusammenfassung<br />

• Analysieren Sie, welche lh Aspekte Ihr Thema bihltt beinhaltet<br />

• Suchen Sie nach Synonymen, Ober‐, Unter‐ und verwandten Begriffen<br />

(Sprache! Trunkierungen!)<br />

• Nutzen Sie die Indexsuche! Insbesondere bei Autorensuche (Schreibweisen)!<br />

• Verknüpfen Sie die Suchbegriffe aus Ihrer Wortliste mit Hilfe von Operatoren<br />

AND OR NOT<br />

• Werten Sie relevante Treffer <strong>im</strong> Hinblick auf weitere Suchbegriffe aus<br />

• Speichern Sie Ihre Such‐History ab!<br />

• Richten Sie sich ein Alerting mit Ihrem Suchprofil ein.<br />

03.07.2009<br />

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Informationskompetenz für Biowissenschaftler<br />

Literaturrecherche in den Biowissenschaften<br />

Ansprechpartner<br />

• Allgemeine Fragen:<br />

Auskunft auskunft@bth.rwth‐aachen.de aachen.de 80‐ 94459<br />

• PIZ, Fachreferat Biologie<br />

Dr. Susanne Ruffert ruffert@bth.rwth‐aachen.de 80‐ 94452<br />

Präsentation<br />

Praxis<br />

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