Molekulare Phylogenie und freie Software
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Das Problem<br />
Anzahl aller möglichen gewurzelten dichotom gegabelten Bäume<br />
(aus Felsenstein, Inferring <strong>Phylogenie</strong>s, 2004):<br />
6 OTUs = 945<br />
10 OTUs = 34.459.425<br />
15 OTUs = 213.458.046.676.875 Bäume<br />
50 OTUs = 2,75292 x 10 76<br />
Die Rechenzeit von phylogenetischen Analysen wächst faktoriell<br />
(= schneller als exponentiell) mit der Anzahl der OTUs:<br />
mathematisch ein sogenanntes NP-hartes Problem.
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