Föreläsning 4
Föreläsning 4
Föreläsning 4
You also want an ePaper? Increase the reach of your titles
YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.
Genexpression in<br />
eukaryotes<br />
• Målsättning med föreläsningen<br />
Beskriva konceptionella likheter och skillnader<br />
mellan prokaryot och eukaryot genexpression<br />
Beskriva mikro-RNA och deras roll i posttranskriptionell<br />
reglering av genuttryck i eukaryoter
Some differences between prokaryotic<br />
and eukaryotic gene transcription<br />
• The eukaryotic genome is in general much larger and more<br />
complex<br />
• DNA is organised in chromatin, which in part is involved in<br />
regulation of transcription<br />
• Three different and more complex RNA polymerases<br />
• DNA binding factors much more important<br />
• Very large and complex transcription complex<br />
• Mediator complex<br />
• No operons<br />
• Un-coupled transcription - translation (different compartments)<br />
• mRNA capping<br />
• mRNA polyadenylation<br />
• mRNA splicing<br />
• Transcription termination different
Transcription and translation occur in<br />
different compartments in Eukaryotes
Högre organismer har en utspridd<br />
genorganisation (finns mer plats?)<br />
12,5 miljoner bp<br />
122,7 miljoner bp<br />
3,3 miljarder bp<br />
Havre, 26 miljarder bp<br />
Blått; exones<br />
Grönt; introner
How many genes have different organisms?<br />
• Man<br />
25000 and decreasing<br />
• Gorilla<br />
About the same as<br />
man<br />
• Drosophila<br />
ca 20000<br />
• C. elegans<br />
ca 16000<br />
• Yeast<br />
ca 6000<br />
Arabidopsis<br />
26000<br />
Rice<br />
35000 and increasing<br />
Maize<br />
32500<br />
Oat<br />
40000?<br />
Is there a correlation between number of<br />
genes and how advanced the organism is?<br />
Is rice more advanced than humans?<br />
How good is the gene prediction?
Genbegreppet<br />
Typiska sekvens-motifs i en eukaryot gen
Eukaryota RNA polymeraser<br />
Black curce shows total amount<br />
of protein<br />
Red curve shows RNA<br />
polymerase activity without<br />
alfa-amitrin<br />
Green shading shows alfaamanitin<br />
insensitivity
alfa-amanitin<br />
Cyklisk peptid av 8 aminosyror. Finns i<br />
flugsvamp. Dödligt gift pga dess<br />
aktivitet mot RNA polymeras II.<br />
Om man äter tex vit flugsvamp tas giftet<br />
upp av levern vilket leder till att<br />
levercellerna lyserar
Activity of different eukaryotic<br />
RNA polymerases
Subunit structures<br />
in different RNA<br />
polymerases<br />
E. coli and eukaryotic RNA<br />
polymerases are build up in<br />
similar way<br />
RNA polymerase II differs<br />
from I and II in the alfa<br />
subunits. It also have a unique<br />
C-terminal domain
RPB1-CTD
RNA polymerase II carboxy terminal domain<br />
A model showing the length of yeast CTD compared to the globular<br />
domain of RNA PolII.<br />
CTD from mammalian PolII is about twice as long.<br />
CTD is essential for transcription, can interact with enhancer<br />
sequences, is involved in the organization of transcription foci<br />
within the nucleus, in pre-mRNA processing and in poly-adenylation
Each eukaryotic<br />
RNA<br />
polymerase<br />
recognise its<br />
own set of<br />
promoter<br />
elements<br />
Initiator<br />
element
Eukaryotic transkription<br />
complexes (PolII)<br />
• Four parts<br />
RNA polymerase II<br />
General transcription factors<br />
Specific transcription factors<br />
The mediator complex
PolII core promotorn<br />
Text<br />
BRE; TFIIB Recognition Element<br />
Inr; Initiator element<br />
DPE; Downstream Promoter Element<br />
TATA; binding site for TBP (TATA box Binding Protein)
General transcription<br />
• TFIID<br />
• TFIIA<br />
• TFIIB<br />
• TFIIF<br />
• TFIIE<br />
• TFIIH<br />
factors<br />
Typiskt exempel på hur ett<br />
stort proteinkomplex byggs<br />
upp med en gradvis<br />
rekrytering av olika faktorer<br />
De olika generella faktorerna är inte bara enskilda proteiner<br />
utan representerar var för sig ofta större proteinkomplex
Very simplified<br />
view of the<br />
initiation complex<br />
N.B. The RNA polymerase dont<br />
bind in until after a number of<br />
other factors already has created a<br />
local promoter complex
TFIID<br />
• A complex of 14 different proteins. Recognise and bind<br />
to the TATA box. Similar activity to sigma factors in<br />
prokaryotes (no sequence homology however)<br />
• TBP (TATA binding protein) in the TFIID complex initially<br />
contacts DNA. The other subunits are denoted TAFs<br />
(TATA Associated Factors). Another two bind to DNA<br />
(Inr and DPE boxes). These control the DNA-TBP<br />
binding<br />
• TBP binding leads to DNA bending. This creates a<br />
platform for the recruitment of additional proteins<br />
• Some of the TAFs associate to histone-modifying<br />
enzymes (direct link between transcription and<br />
chromatin)
TBP - TATA box komplexet<br />
The AT rich sequence<br />
facilitates DNA bending.<br />
TBF also contact DNA<br />
via phenylalanine-side<br />
chains on both sides of<br />
the TATA box
TFIIA<br />
• Two different peptides forming one large and one small unit<br />
of the factor<br />
• Interacts with the TBP in the intial formation and stabilisation<br />
of the pre-initiation complex<br />
• Also acts as coactivator for other transcriptional activators
TFIIB<br />
• A monomeric polypeptide with a N-terminal zink binding<br />
domain. Bind to the initiation complex created by TFIID and<br />
TFIIA. TFIIB binding is essential for later PolII binding<br />
• TFIIB C-terminal contains a helix-turn-helix motif that binds<br />
to the BRE sequence upstream TATA. Also contacts DNA in<br />
the minor groove downstreams TATA via an N-terminal<br />
domain.<br />
• Binds asymmetrically leading to a further assymetical binding<br />
by additional proteins. This contributes to the unidirectioness<br />
of the later transcription
TFIIF<br />
• Heterotetramere of 2 large (RAP74) and 2 small<br />
(RAP30) subunits. Associates to PolII and stabilises the<br />
DNA-TBP-TFIIB complex. Must bind before TFIIE and<br />
TFIIH can be recruited to the pre-initiation complex.<br />
• Both RAP74 and RAP30 contact DNA (on each side of<br />
the TATA box). RAP30 has a “winged helix” motif that<br />
binds SS-DNA. This stabilises the TBP-promoter<br />
interaction
TFIIE and TFIIH<br />
• Like TFIIF, TFIIE is a two-subunit protein complex. TFIIE<br />
binds first and has a role in the recruitment of TFIIH.<br />
• TFIIH is a very complex protein with 9 subunits and a<br />
molecular weigth as high as the RNA polymerase itself! It is<br />
known that 2 of the 9 subunits have ATP-ase aktivity and 1<br />
has kinas activity. The whole TFIIH complex controls the<br />
energy dependent transition from the pre-initiation<br />
complex to an open complex<br />
• Finally, the TFIIH complex (+ a few additional proteins) is<br />
also involved in nucleotide mismatch repair
Initial transcription<br />
complex<br />
Open chromatin<br />
I addition a number of transcription factors are involved in<br />
regulating the expression from the gene
Typical assay for<br />
the determination<br />
of in vivo binding<br />
of a transcription<br />
factor<br />
If protein X has a<br />
DNA binding<br />
activity the<br />
reporter gene will<br />
be expressed
Linker scanning
Definition of<br />
transcription<br />
factor binding<br />
sites in vivo
Transcription factors<br />
• Regulate cell differentiation and growth by<br />
binding to specific sites on DNA to regulate<br />
the expression of its specific target gene<br />
• Transcription factors are classified according to<br />
their DNA binding motifs
Homeobox<br />
gene<br />
Encodes a homeodomain (HD)<br />
Was first discovered in mutated<br />
Drosophila (double wing pairs, leg<br />
instead of antenna, etc). Homeobox<br />
genes are present in all eukaryotes
The eyeless mutation<br />
Normal fly Eyless<br />
Homeoboxgener reglerar ofta hela utvecklinglinjer dvs HD faktorerna reglerar<br />
uttrycket av andra nedströms transkriptions-faktorer. En mutation i en sådan<br />
”Mastergen” kan således slå ut en hel utvecklingsväg
Homeotic mutations in Drosophila<br />
T3 segmentet<br />
muterat. T2<br />
gener tar över<br />
Om en utvecklingslinje slås ut fyller ofta andra<br />
transkriptionsfaktorer ”tomrummet” och initierar<br />
”sina egna” utvecklingslinjer<br />
Ben<br />
istället för<br />
antenn
Exempel på regulatoriska nätverk<br />
up-regulated genes down-regulated genes<br />
Bioinformatisk<br />
modellering
Homeo-<br />
domän<br />
HD kan binda till<br />
DNA<br />
Helix-turn-helix<br />
motif
Zink finger domain<br />
Two His residues in an<br />
alfa helix structure and<br />
two Cys residues in the<br />
beta sheet domain of<br />
coordinate the binding<br />
of a Zn atom that is<br />
essential for DNA<br />
binding
Leucine<br />
zipper<br />
• 2 monomeric alfa<br />
helices are dimerised<br />
and form a “coil-coil”<br />
structure that keeps<br />
the monomers<br />
together in a way that<br />
fork like structure is<br />
formed that can bind<br />
to the major groove<br />
on bot sides of the<br />
DNA<br />
The first TF of this<br />
class that was<br />
idenitfied contained a<br />
leucine(hydrofobic)<br />
every 7th aa in the DNA<br />
binding region, hence<br />
leucin zipper. The<br />
leucine can be<br />
exchanged for other<br />
hydrophobic aa (basic<br />
leucine zipper)
TFs har både DNA bindande<br />
och aktiveringsdomäner<br />
DNA binding domain conserved. Activation domain more<br />
specialised.<br />
Often several activator domains, separated by flexible protein linkers
Olika TFs kan interagera med varandra<br />
via sina aktiveringsdomäner
Det finns ett<br />
flertal olika<br />
transkriptions<br />
-faktorfamiljer<br />
De klassificeras<br />
med avseende på<br />
DNA bindade<br />
region och övrig<br />
sekvenshomologi<br />
Dessa proteiner<br />
är väldigt<br />
konserverade<br />
genom<br />
evolutionen
POU protein.<br />
Jämförelse<br />
människa -<br />
Macaca mulatta<br />
100% homologi<br />
till en apa!
..och mot<br />
Sus scrofa<br />
98% homologi
Det finns många gener dedikerade<br />
till transkriptionsreglering
DNA binding proteins<br />
Transcription factors<br />
Activators<br />
Repressors<br />
Proteins can interact in several ways with both DNA and other<br />
proteins to form big complexes
Det finns också ett mediator<br />
komplex<br />
Son till Arthur Kornberg. Bror till Thomas Kornberg
• 20 proteins<br />
identified by yeast<br />
two hybrid<br />
• Forms a bridge<br />
between chromatin<br />
and other<br />
activators and the<br />
PolII complex<br />
• At least one<br />
subunit has HAT<br />
(histoneacetylas)<br />
activity
Modell of a total<br />
transcription complex<br />
Transcription<br />
factors
Overview of gene regulation in a eukaryot
Chromatin and gene<br />
regulation<br />
Spontaneous<br />
remodeling
Activators can<br />
recuite chromatine<br />
remodeling<br />
complexes<br />
Remodelling faclitated by<br />
histone modification
An activator create local<br />
changes in chromatin<br />
structure. This often lead to<br />
the recruitment of a histone<br />
acetylase, which acetylates<br />
histone tails leading to an<br />
opening of the chromatin
Histone tails can be modified<br />
reversibly or non-reversibly<br />
Acetylation opens<br />
Methylation closes
A large number of<br />
different modification<br />
combinations are<br />
possible<br />
Acetylations, methylations,<br />
phosphorylations and ubiqinations<br />
all alter gene expression by making<br />
the chromatin accessible or nonaccessible<br />
for activators or<br />
repressors (DNA binding proteins)<br />
The histone code
Eukaryotiskt<br />
mRNA är<br />
”cappat”<br />
Omedelbart efter det den<br />
nysyntetiserade mRNA<br />
kedjan blir tillgänglig<br />
sätts ett 7-metylguanylat<br />
på 5’-ändan i en<br />
ovanlig 5’-5’ bindning<br />
mha av ett dimerisk<br />
capping enzym som är<br />
associerat till PolII-CTD.<br />
Denna Cap skyddar mRNA<br />
mot degradering samt<br />
behövs för utransport till<br />
cytoplasman
Terminering och tailing<br />
Alla mRNA förutom histon<br />
mRNA har en polyA tail<br />
Cleavage and polyadenylation<br />
specificity factor<br />
Cleavage stimulatory factor<br />
AUUAAA. Mycket<br />
konserverad<br />
G/U längre 3´
CPSF: Cleavage and polyadenylation<br />
specificity factor<br />
CStF: Cleavage stimulatory factor<br />
Ett flertal proteiner binder till<br />
polyA signal sekvensen<br />
En loop bildas mot nedströms<br />
G/U rika sekvenser<br />
Clevage<br />
factor I och II
Efter PAP inbindningen sker mRNA<br />
klyvningen. Delar av komplexet<br />
faller därefter sönder och en<br />
polyadenylering startar<br />
Till att börja med går denna<br />
reaktion långsamt
Efter det att ca 200-250 A har byggts in signalerar PABPII till PAP att<br />
upphöra med polymeriseringen (mekanism okänd)
mRNA syntes och processning<br />
mRNA existerar aldrig som fritt RNA. Från det ögonblick det kommer<br />
ut från RNA polymeraset kläs det med ett antal olika proteiner
Start RNA syntes poly(A) site<br />
exon<br />
Intron<br />
poly(A)<br />
Cap<br />
cap<br />
3’ klyvning<br />
poly(A) svans<br />
Text<br />
(A)n<br />
Intron excision,<br />
exon ligering<br />
(A)n<br />
3’-end<br />
(A)n
hnRNPs<br />
• Heterogenous ribonucleprotein particles som<br />
innehåller hnRNA (heterogenous nuclear RNA).<br />
hnRNA är en kollektiv term på pre-mRNA och andra<br />
typer av nukleära RNA av varierande storlek<br />
• Identifierades genom UV-crosslinking och rening via<br />
oligo-dT cellulosa kolumner<br />
• Varierar i storlek från 34 till 120kD<br />
• Innnehåller ett eller flera RNA bindningsmotif (ex<br />
RRM domän, RGG repeats, KH, etc) och proteininteraktionssites.
Infärgning av hnRNPs associerade till en<br />
nysyntentiserad mRNA<br />
Rhodamin kopplad antikropp mot<br />
hnRNP proteiner
•<br />
•<br />
•<br />
Funktioner hos hnRNP<br />
partiklar<br />
Reglerar formation av RNA sekundärstrukturer<br />
Olika hnRNPs associerar med olika delar av den<br />
nysyntetiserade mRNA molekylen. Vissa (A1, C<br />
och D) binder preferentiellt till de pyrimidinrika<br />
(UC) sekvenserna på introners 3’-ända<br />
Kan förekomma både i nucleus och cytoplasman
En okomplicerad gen<br />
Från det minsta växtgenomet. Förhållandevis enkel genorganisation<br />
72811 AAAGGCCATAGTTCTCCAATGTTTTCAATATGTAACCAATGTAATAAACCTGGTAACTGTAAAAATTAAATTGGTCCAATTGATCATTAAACAAAGACATCTTTCCAAAAAGTGTTTGATTTAA<br />
72935 CGGTAACAAATAAACTAAAGATCCCTTTATTCATAAACAAAAGAATATATATATCATTCACTTTCTCATTGTCTTGTTCAT ATG GTA AAA AAA AAA AAG GAA AAG GAG AAA<br />
1 M V K K K K E K E K<br />
73046 AGC AAA GAA ATA GAG GAG ATG GAT AGA GAG ATC CAA AAC GGT GCG TAT AGT GGG AGA GTG ATG ACT GAG GAG CAG ATG GAG ATT CTC CGT AAG<br />
11 S K E I E E M D R E I Q N G A Y S G R V M T E E Q M E I L R K<br />
73139 CAG ATC GCC GTT TAC GCC GTT ATT TGT GAC CAA CTC GTC CTC CTC CAC AAC TCC CTC TCT TCT TAC CAT CCA CTC TCA TCA G GTACACTT<br />
42 Q I A V Y A V I C D Q L V L L H N S L S S Y H P L S S<br />
73229 CTCTCTGTTTTTGTTCCTGATTAACAACAATCACTTTTCTATGTATTTGATTTTTTTACAAGAGACCATTTGATGAGCTTCTTTGTATACGGTAGAAGAAGTGTGTAAGACGAAAGTGTTTAAA<br />
73353 CGCAGCGTTTTTTGCGATGCAAACGTTGTTTCCATTAATACACTTGACCCATTGAGACTTTAGTGTAAAAATGTGAAAATTGTGTTTGCGTTTGGTATACAACTAACGAAATCCAAGGCTTTTT<br />
73477 TTTTCCCAGTGTTCGATGCATAACTTTGAATCAAATTTCATAATGTTTTAGACATTCGAAGACAGTTTACCTACCGCTTAGATATCGATTTATCATTGCTAAAGATATTTGTTAATATAGTTTA<br />
73601 TGATTTGCTTAGATCGAACAATTCAATATATTATTAATGTTTATTTTCTCTAGACGTAAGCTGATTTGAGGGTTATCATGTCGTGGCCGATTTTTAAGAAGCTTGAGTTATTAGTGCTTTGTGG<br />
73725 TTTTGATAATACATATTTTGTACATGGAAGAAACTTAAGGGTCACGTCACTTATTTTTTTATAATGATTGAGTGTAAAAAAGGA GTG AGG CCA ATG GTT GGC GGA TAC TTT GAT<br />
1 V R P M V G G Y F D<br />
73839 CCG ATG GGG GCA TCG TCA AGT TCT CAT AGG ATA TCG ACT AGG CAT CGG TGG ACT CCG ACT TCA ACA CAG CTT CAG ATA CTT GAG AGC ATT TAC<br />
11 P M G A S S S S H R I S T R H R W T P T S T Q L Q I L E S I Y<br />
73932 GAC GAA GGA AGT GGA ACA CCG AAT CGA CGG AGG ATT AGA GAG ATC GCG ACG GAG CTG TCT GAA CAT GGA CAG ATC ACG GAG ACA AAT GTC TAC<br />
42 D E G S G T P N R R R I R E I A T E L S E H G Q I T E T N V Y<br />
74025 AAT TGG TTT CAA AAC CGG CGA GCT CGG TCC AAA CGA AAG CAG CCT CAA ACG ACG ACA GCT AAT GGT CAG GCT GAC GAT GTG GCG GTG ACA ACG<br />
73 N W F Q N R R A R S K R K Q P Q T T T A N G Q A D D V A V T T<br />
74118 GAG GAA AGG AGG AGT TGT GGA GAT TCA GGG GGA TTA GAG TCT TAT GAG CAT ATA CTC TTC CCA AGT CCT GAC TTA G GTAAAAAGATCATTTGAGTTTT<br />
104 E E R R S C G D S G G L E S Y E H I L F P S P D L<br />
74216 TAAACATTTGGTTAGGTTTATTTTTTATTTTTGGTTTGAGTTTGCATTTTTTTTTGTGGTTTCAGGG ATT GAG CAT TTG TTG AGT ATA GGG AAA TTT ATG GAG ACT TAA<br />
1 I E H L L S I G K F M E T •<br />
74325 AATTCGTATAGACTTCGATGAAGAAGATCTCTAATCTATTCTGTTTTCTTTTACTCTGTTTTCATAAAATAGAATTGTGTGTGTTTGTGTGTGACATTAACAACAAGTCTTCAATTTTATTATA<br />
74449 ATTTTGTGTTCCTCAACTTGATATATATGCCCACATCTTTTTCAGCATCAGAAAGAAAAGTGATGCCATCTTAAACTCGGTTGATATTTTGACCGGTAAATCTCAATTCA<br />
Introns and regulatory sequences in red<br />
Exons in blue
Konsensussekvens runt 5’ och<br />
3’ splice sites<br />
Ett fåtal baser är nästan 100% konserverade medan ytterligare<br />
några är klart överrepresenterade.<br />
Själva intronsekvensen, som kan vara över 50 kb, har ingen<br />
funktion i splicingen med undantag av de 30-40 baser<br />
omedelbart vid splice-siten
Flera små nukleära RNA (snRNA) ingår i mRNA<br />
splicingen (U1, U2, U4, U5 och U6)<br />
Basparning mellan U1 och U2<br />
och pre-mRNA<br />
Även övriga snRNA basparar med pre-mRNAt under olika faser av<br />
splicing processen
Via mRNA splicing bildas de slutliga<br />
matura, funktionella mRNAt.<br />
För korta transkript startat splicingreaktionerna<br />
först efter det att klyvning<br />
och polyadenylering av hnRNA har skett.<br />
För långa transkript med flera introner<br />
börjar processningen medan<br />
transkriptionen fortfarande pågår<br />
Splicing sker mha snRNPs (U1, U2, U4,<br />
U5 och U6.<br />
Introner avlägsnas från mRNAt via två<br />
trans-esterfierings reaktioner
•<br />
•<br />
•<br />
Multipla RNA<br />
Kan uppstå på flera olika sätt<br />
Exon skipping. Användandet av olika splice sites kan<br />
leda till alternativ mRNA processing och då ge mRNA<br />
med identiska 5´och 3´ändar men med olika antal<br />
interna exoner.<br />
Användande av alternativa PolyA site. Ger mRNA med<br />
samma 5’ exoner men olika 3´exoner<br />
Användandet av alternativa promotorer ger mRNA<br />
med olika 5´exoner men med samma 3´exoner
Kombination av olika<br />
exoner
Complexa<br />
transkriptionsenheter<br />
Dessa producerar primära<br />
transkript som kan<br />
processar på alternativa<br />
sätt<br />
b) Innehåller alternativa<br />
splice sites<br />
c) Innehåller extra polyA<br />
site<br />
d) Innehåller alternativa<br />
promoter element och Cap<br />
site
Exon-shuffling<br />
Uppstår som en konsekvens av en överkorsning mellan<br />
två olika gener. Är möjligt eftersom interna<br />
intronsekvenser inte påverkar splicingen
Next -<br />
next<br />
generation<br />
sequencing
Deep sequencing techniques<br />
•<br />
Massive parallell sequencing<br />
pyro-sequencing (MPPS) (454)<br />
• PacBio<br />
up to 800 bp/read<br />
900 000 - 1 300 000 reads<br />
signature sequencing (MPSS)(Illumina)<br />
up to 150 bp/read<br />
ca 180 million reads per plate<br />
up to 20000 bp/read<br />
Parallell sequencing allows millions of parallell reactions<br />
Digital reads possible (eliminate errors)<br />
Does not need cloning of the cDNA
Vad visar alla dessa nya<br />
genomiska data?<br />
• Genomet mycket mer komplext än vad vi tidigare trott<br />
Transkriptionsaktivitet över hela genomet. Ett stort antal<br />
snRNA tycks finnas<br />
Antisense transkripts vanliga<br />
MikroRNA vanliga<br />
• Epigentics ett viktigt inslag<br />
• Förmodligen återstår flera fundamentalt nya principer att<br />
upptäcka
Små RNA<br />
• Small nuclear RNAs (snRNAs). 20-26 nukleotider långa<br />
icke kodande RNA som kan reglera transkription och<br />
translation via flera olika mekanismer<br />
• Kan också interagera med kromatinet<br />
• Micro RNA genereras via endonukleolytisk klyvning av<br />
hairpin prekursor transkript via speciella nukleaser<br />
(DICER, RNAseIII, RNAseH).<br />
• MiRNA kan baspara med igenkännings site i 3’-UTRs och<br />
förhindra translation<br />
• I kombination med RISC (RNA-induced silencing<br />
complex), kan miRNA bilda siRNA (short interfering) som<br />
kan binda till speciella targets på närbesläktade RNA<br />
som då degraderas
Science, sep 2005, Special Issue
Genbegreppet blir allt svårare att definiera<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
•<br />
Regulerande sekvenser kan fysiskt befinna sig lång från<br />
TATA sekvensen<br />
Kan finnas på 5´och 3’ sidan om transkriptionsenheten<br />
Både sense och anti-sense transkript syntetiseras<br />
Skall det DNA som kodar för ett antisense transkript<br />
definieras som en gen?<br />
Olika splice-varianter<br />
Små icke-kodande RNA<br />
Är dessa gener?<br />
Dessutom kompliceras det hela av att det också finns<br />
reglering på kromatinnivå<br />
Histone code. Epigenetics
When still have a bit to go for a complete<br />
understanding of transcriptional regulation
Generering av<br />
miRNA och<br />
siRNA<br />
Dicer ribonukleaset<br />
klyver både DSRNA och<br />
hairpin mRNA<br />
prekursorer till kortare<br />
dsRNA 21-23 nt bitar<br />
(siRNA).<br />
En sträng associeras till<br />
ett RNA-inducerat<br />
interference<br />
complex(RISC).<br />
Från detta selektera en<br />
aktiv RNA sträng som<br />
kan binda till diverse<br />
mRNA molekyler
Change language