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花 生 气 生 果 针 败 育 候 选 蛋 白<br />
PAD2 的 生 物 信 息 学 初 步 分 析<br />
第 11 组<br />
朱 伟 谭 龙 涛<br />
郭 军 管 庆 丰
花 生 气 生 果 针 败 育 候 选 蛋 白 PAD2 的 生 物 信 息 学 初 步 分 析<br />
1<br />
2<br />
3<br />
4<br />
研 究 背 景<br />
前 期 工 作<br />
进 展 分 析<br />
生 物 信 息 学 分 析<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
1. 研 究 背 景<br />
花<br />
生<br />
的<br />
生<br />
长<br />
特<br />
性<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
研 究 背 景<br />
气<br />
生<br />
果<br />
针<br />
的<br />
不<br />
结<br />
实<br />
性<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
研 究 意 义<br />
气 生 果 针<br />
气 生 果 针<br />
Why<br />
Can<br />
不 结 实<br />
结 实 增 产<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
2. 前 期 工 作<br />
形<br />
态<br />
学<br />
观<br />
察<br />
A<br />
B<br />
C<br />
图 3-1 气 生 果 针 与 地 下 荚 果 的 生 长 发 育 形 态 学 观 察<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
细 胞 显 微 结 构 差 异 分 析<br />
0 1 2 3 4 5 6<br />
L<br />
D<br />
图 3-2 标 记 后 不 同 发 育 天 数 的 气 生 果 针 和 地 下 果 针 的<br />
细 胞 显 微 结 构 差 异 分 析<br />
L 代 表 气 生 果 针 ,D 表 示 地 下 荚 果 ,0-6 表 示 标 记 后 不 同 发 育 天 数 。<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
基 因 表 达 谱 差 异 分 析<br />
图 3-3 不 同 发 育 天 数 的 地 下 荚 果 比 气 生 果 针 上<br />
调 或 下 调 3 倍 以 上 的 差 异 基 因 聚 类 分 析<br />
L 代 表 气 生 果 针 ,D 表 示 地 下 荚 果 ,1-8 表 示 标 记 后 不 同 发 育 天 数 。<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
蛋 白 质 表 达 谱 差 异 分 析<br />
<br />
=<br />
Transcriptome Proteome<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
蛋 白 质 表 达 谱 差 异 分 析<br />
L<br />
D<br />
图 3-5 花 生 气 生 果 针 和 地 下 荚 果 不 同 发 育 天 数 的<br />
蛋 白 质 2-DE 图 谱<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
表 3-1. MALDI-TOF-TOF 对 差 异 表 达 蛋 白 的 鉴 定
3.PubMed:PAD2 研 究 进 展<br />
• The ubiquitin-proteasome system (UPS) is an important intermediate<br />
signaling step involving in plant developmental process, including<br />
embryogenesis, photomorphogenesis, hormone signaling and senescence<br />
(Moon et al., 2004).<br />
• Some studies suggested that phytochrome was localized in tissue-specific of<br />
the developing embryo and integument tissues, which may play an important<br />
role in the underground phase during pod development, but not be involved<br />
in the elongation phase of the gynophore after fertilization (Thompson et al.,<br />
1992; Moctezuma, 2003).<br />
• Vierstra (2003) revealed that UPS was crucial in removing multiple light<br />
regulators (such as phyA, HY5, COP) during photomorphogenesis, indicating<br />
that UPS might regulate aerial and subterranean pod growing under the light<br />
and dark conditions.<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
PAD2 研 究 进 展<br />
• It is well known that the failure of peg penetration into the soil leads to<br />
seed abortion in peanut (Chen et al., 2012).<br />
• Recently, many studies revealed that the 26S proteasome might contribute<br />
to plant cell division cycle progression by actively associating with<br />
intracellular structures including mitotic spindles, the preprophase band,<br />
and the phragmoplast (Farras et al., 2001; Yanagawa et al., 2002), and<br />
also by affecting the half-life of many modulators, such as cyclins, CDKactivating<br />
and -inhibiting kinases, and several CDK inhibitors (Dewitte<br />
and Murray, 2003; Smalle and Vierstra, 2004).<br />
• Moreover, several senescence mutants provided UPS with a direct<br />
connection to senescence signaling, such as ORE9 (Woo et al, 2001), and<br />
the UPS also appeared to involve in plant PCD (Kim et al, 2003).<br />
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4. 生 物 信 息 学 初 步 分 析<br />
蛋<br />
白<br />
质<br />
组<br />
学<br />
流<br />
程<br />
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First Step:Mascot 搜 索 结 果<br />
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点 击 此 处 进 入 蛋 白 质 全 序 列
Second Step: 结 果 blast 连 接<br />
点 击 此 处 进 入 blast 页 面<br />
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Third Step: 进 入 NCNI 数 据 库<br />
blast<br />
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Fourth Step:blast 分 析 核 酸 同 源 序 列<br />
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Fifth Step:blast 分 析 氨 基 酸 同 源 序 列<br />
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Sixth Step:Uniprot 信 息 交 叉 链 接<br />
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Senventh Step: 系 统 进 化 树 分 析<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
Senventh Step: 系 统 进 化 树 分 析<br />
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Eightth Step:ORF 分 析<br />
>AHTC1001379 [95 - 856] Proteasome subunit alpha<br />
IAPPPMARYDRAITVFSPDGHLFQVEYALEAVRKGNAAVGVRGTDNVVLGVEKKSTAK<br />
LQDSRTVRKIVNLDDHIALACAGLKADARVLINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIA<br />
GLQQKYTQSGGVRPFGLSTLIVGFDPYTGTPSLYQTDPSGTFSAWKANATGRNSNSI<br />
REFLEKNYKEVSGQETIKLAIRALLEVVESGGKNIEVAVMTKEQGLRQLEEAEIDAIVAEI<br />
EAEKAAAEAAKKAPPKET<br />
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Nineth Step: 氨 基 酸 组 成 分 析<br />
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Tenth Step: 重 复 序 列 点 阵 分 析<br />
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Eleventh Step: 跨 膜 区 预 测<br />
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Twelveth Step:α 螺 旋 预 测<br />
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Thirteenth Step: 三 维 结 构 模 型 预 测<br />
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Fourteenth Step: 信 号 肽 预 测<br />
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Fifteenth Step: 亚 细 胞 定 位<br />
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致 谢<br />
• 感 谢 罗 老 师 的 辛 勤 指 导 !<br />
• 敬 请 大 家 提 出 宝 贵 意 见 !<br />
2013/1/22 商 业 信 息 服 务 平 台
Thank you!
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