REG CEL Prog 2009v3 - Universidade de Coimbra

REGULAÇÃO CELULAR
(2009/2010)
Mestrado em Biologia Celular Molecular (MBCM)
Coordenadores:
Carlos B. Duarte, Dep. Zoologia, UC (cbduarte@ci.uc.pt)
Ana Luísa Carvalho, Dep. Zoologia, UC (alc@ibili.uc.pt)
Lecturers:
- Ana Luísa Carvalho (ALC), Departamento de Zoologia, Universidade de Coimbra
(alc@ibili.uc.pt)
- Anália Carmo (AC), Centro de Neurociências e Biologia Celular, Universidade de Coimbra
(analiacarmo@gmail.com)
- Carlos B. Duarte (CD), Departamento de Zoologia, Universidade de Coimbra
(cbduarte@ci.uc.pt)
- Elsa Logarinho (EL), IBMC, Universidade do Porto (elsa.logarinho@ibmc.up.pt)
- Manuel Santos (MSS), Universidade de Aveiro (msantos@bio.ua.pt)
- Mário Grãos (MG), Biocant, Cantanhede (mgraos@biocant.pt)
- Michael Schrader (MS), Universidade de Aveiro (mschrader@ua.pt)
-Paulo Pereira (PP), IBILI, Faculdade de Medicina, Universidade de
Coimbra (ppereira@ibili.uc.pt)
- Sukalyan Chatterjee (SC), Centro de Neurociências e Biologia Celular, Universidade de
Coimbra (sukalyan@yahoo.com)
Objectivos:
Esta disciplina visa fornecer conhecimentos aprofundados sobre aspectos actuais da
Regulação Celular ao nível molecular, assim como das estratégias experimentais usadas.
Datas importantes:
- Entrega dos protocolos (MBCM): 28 Setembro
- Exame final (MBCM + MB): 9 de Outubro
Avaliação:
- Protocolos das aulas práticas (em grupo, MBCM): 3 valores
- Apresentação dos resultados dos trabalhos práticos (em grupo, MBCM): 3 valores
- Exame final (MBCM + MB) : 14 valores

Lectures:
1. Molecular blueprints of the cell (Sukalyan Chatterjee)
2. Cell structure and function (Ana Luísa Carvalho)
The cytoskeleton and cell movement
Cell-cell and cell-matrix adhesion
3. Cell signalling (Carlos Duarte)
Signalling molecules and their cell-surface receptors
Intracellular signal transduction
Kinases and phosphatases and their roles in intracellular signalling
4. Regulation of gene expression
Transcription control of gene expression (Ana Luísa Carvalho)
Post-transcriptional gene control (Manuel Santos)
5. Cell cycle (Elsa Logarinho)
6. Cell death and its regulation
Apoptosis (Mário Grãos)
Autophagy (Paulo Pereira)
7. Protein turnover in the cell: the proteasome (Paulo Pereira)
8. Peroxisomes in health and disease (Michael Schrader)
Laboratory work (MBCM):
1. Visualizing cells undergoing mitosis: labeling tubulin and DNA in dividing HeLa cells
2. Role of the cytoskeleton in cell migration: cell migration assay in a glioblastoma cell
line
3. Effects of the anti-inflammatory glucocortocoid dexamethasone in gene expression in
HeLa cells: RT-PCR for IκBα
4. Activation of stress-regulated kinases by overactivation of glutamate receptors in the
HEK-GluR4 cell line: trafficking of active (phosphorylated) to JNK the nucleus
(Western blot experiments after cell fractionation; Immunocytochemistry experiments
with phosphospecific antibodies)
5. Cell death induced by overactivation of the receptors for the neurotransmitter
glutamate: analysis of cell death by fluorescence microscopy

PROGRAMA SEMANAL
Semana 1
14Setembro 15 Setembro 16 Setembro 17 Setembro 18 Setembro
Manhã Manhã Manhã Manhã Manhã
9:00-9:30 1
Structure and
objectives of the
course
11:00 1
Discussion of
the protocols
10:00-11:15 1
Molecular
blueprints of the
cell (SC)
9:00-10:15 3
Cell structure
and function:
Cell-cell and
cell-matrix
adhesion (ALC)
10:45-12:00 3
Cell structure
and function:
Cell-cell and
cell-matrix
adhesion (ALC)
9:00-10:15 4
Cell structure
and function:
Cell-cell and
cell-matrix
adhesion (ALC)
10:45-12:00 4
Intracellular
signaling:
Basic principles
(CD)
Tarde Tarde Tarde Tarde Tarde
13:30-14:15 2
Objectives of
the laboratory
work (ALC &
CD)
14:30-15:45 2
Cell structure
and function:
The
cytoskeleton and
cell movement
(ALC)
15:00-16:15 1
Cell structure
and function:
The
cytoskeleton and
cell movement
(ALC)
16:30-18:15 1
Cell structure
and function:
Cell-cell and
cell-matrix
adhesion (ALC)
1. Anfiteatro de Histologia, Faculdade de Medicina, Polo 1, 2º piso
2. Anfiteatro Gomes Teixeira, Departamento de Matemática
3. Anfiteatro de Anatomia Patológica, Faculdade de Medicina, Polo 1, 1º piso
4. Anfiteatro de Higiene ou Anfiteatro de Patologia Geral, Faculdade de Medicina, Polo
1, 2º/3º piso

Semana 2
21 Setembro 22 Setembro 23 Setembro 24 Setembro 25 Setembro
Manhã Manhã Manhã Manhã Manhã
8:30-13:30
Laboratory
work
(ALC & CD)
8:30-13:30
Laboratory
work
(ALC & CD)
8:30-13:30
Laboratory
work
(ALC & CD)
8:30-13:30
Laboratory
work
(ALC & CD)
11:00
Presentation of
the results
Tarde Tarde Tarde Tarde Tarde
15:00-16:15
Intracellular
signaling:
neurotrophins
(CD)
16:45-18:00
Intracellular
signaling:
Strucutre and
function of the
Trk
neurotrophin
receptors
(CD)
15:00-16:15
Intracellular
signaling:
Strucutre and
function of the
Trk
neurotrophin
receptors
(CD)
16:45-18:00
Intracellular
signaling:
Strucutre and
function of the
Trk
neurotrophin
receptors
(CD)
15:00-16:15
Intracellular
signaling:
Strucutre and
function of the
Trk
neurotrophin
receptors
(CD)
16:45-18:00
Regulation of
gene expression
Transcription
control of gene
expression
(ALC)
NOTA: Aulas no anfiteatro do Centro de Neurociências e Biologia Celular, Faculdade de
Medicina, Polo 1, 2º piso

Semana 3
28 Setembro 29 Setembro 30 Setembro 1 Outubro 2 Outubro
Manhã Manhã Manhã Manhã Manhã
8:30-13:30
Laboratory
work
(ALC & CD)
8:30-13:30
Laboratory
work
(ALC & CD)
8:30-13:30
Laboratory
work
(ALC & CD)
8:30-13:30
Laboratory
work
(ALC & CD)
11:00
Presentation of
the results
Tarde Tarde Tarde Tarde Tarde
15:00-16:15
Mitosis (EL)
16:45-18:00
Mitosis (EL)
15:00-16:15
Regulation of
gene expression
Posttranscriptional
gene control
(MSS)
16:45-18:00
Regulation of
gene expression
Posttranscriptional
gene control
(MSS)
15:00-16:15
Cell death and
its regulation:
Apoptosis (MG)
16:45-18:00
Cell death and
its regulation:
Apoptosis (MG)
15:00-16:15
Cell death and
its regulation:
autophagy (PP)
16:45-18:00
Protein
turnover in the
cell: the
ubiquitinproteasome
pathway (PP)
14:30-15:45
Protein
turnover in the
cell: the
ubiquitinproteasome
pathway (PP)
NOTA: Aulas no anfiteatro do Centro de Neurociências e Biologia Celular, Faculdade de
Medicina, Polo 1, 2º piso

Semana 4
5 Outubro 6 Outubro 7 Outubro 8 Outubro 9 Outubro
(Feriado)
Manhã Manhã Manhã Manhã Manhã
Tarde Tarde Tarde Tarde Tarde
15:00-16:15
Biology of
peroxisomes
(MS)
14:30-17:00
Exame
16:45-18:00
Peroxisomes in
health and
disease (MS)
NOTA: Aulas no anfiteatro do Centro de Neurociências e Biologia Celular, Faculdade de
Medicina, Polo 1, 2º piso

Regulação Celular 09/10
Mestrado em Biologia Celular e Molecular
Componente laboratorial:
Semana de 21-25 Setembro:
Grupos I-IV (lab 1):
1. Visualizing cells undergoing mitosis: labelling tubulin and DNA in dividing HeLa
cells
2. Role of the cytoskeleton in cell migration: cell migration assay in a glioblastoma cell
line
3. Effects of the anti-inflammatory glucocortocoid dexamethasone in gene expression in
HeLa cells: RT-PCR for IκBα
Grupos V-VII (lab 2):
4. Activation of stress-regulated kinases by overactivation of glutamate receptors in the
HEK-GluR4 cell line: trafficking of active (phosphorylated) to JNK the nucleus
(Western blot experiments after cell fractionation; Immunocytochemistry experiments
with phosphospecific antibodies)
6. Cell death induced by overactivation of the receptors for the neurotransmitter
glutamate: analysis of cell death by fluorescence microscopy
Semana de 28 Setembro-2 Outubro:
Grupos V-VIII (lab 1):
1. Visualizing cells undergoing mitosis: labelling tubulin and DNA in dividing HeLa
cells
2. Role of the cytoskeleton in cell migration: cell migration assay in a glioblastoma cell
line
3. Effects of the anti-inflammatory glucocortocoid dexamethasone in gene expression in
HeLa cells: RT-PCR for IκBα and for MKP-1
Grupos I-IV (lab 2):
4. Activation of stress-regulated kinases by overactivation of glutamate receptors in the
HEK-GluR4 cell line: trafficking of active (phosphorylated) to JNK the nucleus
(Western blot experiments after cell fractionation; Immunocytochemistry experiments
with phosphospecific antibodies)
5. Apoptotic cell death induced by trophic factor deprivation: analysis of cell death by
fluorescence microscopy

GRUPOS DE TRABALHO:
Grupo I:
Ana Catarina Vidinhas Oliveira (Biologia, UC)
Ana Francisca Silva de Lima (Ciências Biomédicas, Aveiro)
Ana Rita Fernandes Lourenço (Biologia Molecular e Genética, FC/UL)
Bruno Vasconcelos (Bioquímica, UC)
Grupo II:
Ana Isabel Reis dos Santos (Biologia, UP)
Ana Sofia Maximiano Leitão Ribeiro Lourenço (Biologia, UC)
Remy Cardoso (Bioquímica, UC)
Sandra Iris Sanches Godinho (Biologia, ISA Lisboa)
Grupo III:
Carla Marina Pereira Gomes (Ciências Biomédicas, UA)
Diana Isabel Queirós Guedes Rodrigues (Biologia, UC)
Lucília Pereira da Silva (Bioquímica, UC)
Marcelo José Marques Correia (Biologia, UP)
Grupo IV:
Dominique Moreira Fernandes (Bioquímica, UP)
Duarte Mendes Oliveira (Biologia, UC)
Luisa Filipa Morais dos Santos (Biologia, UA)
Pieter van der Linden
Grupo V:
Nuno Dinis Lopes Oliveira Alves (Bioquímica, UTAD)
Pedro Rio (Bioquímica, UC)
Raquel Fernanda da Silva Alves (Biologia, UC)
Tânia Marisa Melim Perestrelo (Biol Cel Molec, UNL)
Grupo VI:
Catarina Oliveira Praça de Almeida (Ciências Biomédicas, UA)
Luís Pedro de Araújo Leitão (Bioquímica, UP)
Sofia Pereira Constantino Romano (Biologia Aplicada, UM)
Vanessa Mendes Machado (Biologia, UC)
Grupo VII:
Igor André Morgado Vieira (Biologia Aplicada, UM)
Maria da Conceição Moutinho Pedroso Pereira (Bioquímica, UP)
Telma Sofia Correia Bernardo (Biologia, UC)
Vanessa Filipa Coelho Santos (Biotecnologia, Esc Sup Agrária Coimbra)
Grupo VIII:
Carolina Isabel Mendes de Matos Guibentif (Biol Cel Mol, UNL)
Daniel Ferreira dos Santos (Biol Marinha Biotec, IPL)
Inês Gomes de Oliveira e Castro (Biologia Aplicada, UM)
Isabel Ferreira (Biologia, UC)