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Manual rápido de uso de Tools for Population Genetics (TFPGA)

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2.- Descriptive Statistics<br />

Este análisis estima las frecuencias alélicas, frecuencias genotípicas, heterocigosis y el polimorfismo <strong>de</strong><br />

tus datos.<br />

1.- Pica Analyze 2.- pica Descriptive Statistics 3.- Pica Options para indicar cómo calcular la heterocigosis y el<br />

polimorfismo.<br />

4.- Indica a qué niveles quieres el análisis Entire data set <strong>Population</strong>s y Subpopulations si quieres que te indique el<br />

nivel <strong>de</strong> diversidad (Heterocigosis y polimorfismo) para cada uno <strong>de</strong> estos niveles. Entire data set te da la H y P para todos<br />

los datos sin consi<strong>de</strong>rar estrucrura. <strong>Population</strong>s te va a dar la H y P para cada población y Subpopulations te va a dar la<br />

H y P para cada subpoblación.<br />

5.- Indica las opaciones que <strong>de</strong>sees: Calculate Allele and Heterozygote Frequencies para que te muestre las frecuencias<br />

alélicas y genotípicas. Calculate Per Locus Heterozygosities para que te indique las heterocigosis por cada locus (a<strong>de</strong>más<br />

<strong>de</strong> las indicadas en el punto 4). Calculate Average Heterozygosities over Loci para que te indique la Heterocigosis<br />

promedio . Calculate Percent Polymorphic Loci para que te indique el polimorfismo.<br />

6.- Pica OK<br />

7.- Para iniciar el análisis pica Analyze --> Descriptive Statistics --> Start analysis. La pantalla va a mostrar los<br />

resultados (Nota: no le hagas caso a -unbiased- ni a -direct count-). En algunos casos, cuando el archivo <strong>de</strong> resultados es<br />

muy gran<strong>de</strong>, el programa no pue<strong>de</strong> mostrarlo en pantalla, por lo que te va a pedir que lo guar<strong>de</strong>s en un archivo, en ese caso,<br />

guárdalo como txt (ponle el nombre que quieras con la terminación .txt - punto txt-) y luego abrelo con el block <strong>de</strong> notas.<br />

8.- Interpreta los datos <strong>de</strong> diversidad genética.

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