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Manual rápido de uso de Tools for Population Genetics (TFPGA)

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5.- Hardy Weinberg<br />

Este análisis realiza pruebas para <strong>de</strong>terminar si la población se encuentra o no en equilibrio <strong>de</strong> H.W.<br />

1.- Pica Analyze --> 2.- Hardy-Weinberg --> 3.- Options.<br />

4.- Determina si quieres <strong>de</strong>terminar se el Entire data set se encuentra en H.W., si las <strong>Population</strong>s se encuentran en H.W. y/<br />

o si las Subpopulatins se encuentran en H.W. 5.- Determina el tipo <strong>de</strong> prueba que quieres hacer: prueba <strong>de</strong> Xi cuadrada<br />

(te la recomiendo, ya que es la que vimos en clase), G-test o Extact Test (que realiza remuestreos <strong>de</strong> tu muestra para<br />

indicar un error estandard y en cuyo caso, se activaría la parte 5a para solicitarte in<strong>for</strong>mación sobre el remuestreo).<br />

6.- Determina si <strong>de</strong>seas que agrupe los genotipos iguales y realice la prueba con los “tipos” (Pooled Genotypes no te lo<br />

recomiendo) o que utilice todos los genotipos que indicaste (All Genotypes, si te lo recomiendo).<br />

7.- Pica Analyze --> Hardy-Weinberg--> Start analysis. El programa te va a mostrar la Xi calculada, y los grados <strong>de</strong><br />

significancia, ve a una tabla estadística y <strong>de</strong>termina si se encuentra o no en H.W.<br />

En algunos casos, cuando el archivo <strong>de</strong> resultados es muy gran<strong>de</strong>, el programa no pue<strong>de</strong> mostrarlo en pantalla, por lo que te<br />

va a pedir que lo guar<strong>de</strong>s en un archivo, en ese caso, guárdalo como txt (ponle el nombre que quieras con la terminación .txt<br />

- punto txt-) y luego abrelo con el block <strong>de</strong> notas.

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