Manual rápido de uso de Tools for Population Genetics (TFPGA)

4.- Genetic distance
Calcula la distancia genética entre las poblaciones y/o subpoblaciones. Este análisis nos va a mostrar una tabla
de distancias genéticas entre todos los pares de poblaciones y/o subpoblaciones de nuestra muestra. Una distancia de 0
indica que las poblaciones comparten el 100% de sus alelos, es decir que son idénticas y una distancia grande (generalmente
de 1) indica que no comparten ninguno de sus alelos, es decir, que son completamente diferentes. Nota: este parámetro se
entiende e interpret mejor luego de hacer el UPGMA (árbol de distancias o representación gráfica entre las distancias)
1.- Pica Analyze 2.- Genetic Distance 3.- Options.
4.- Selecciona entre quienes quieres calcular las distancias: entre las poblaciones y/o entre las subpoblaciones
5.- Selecciona el modelo con el que se va a medir la distancia genética (te recomiendo usar Nei, 1972,1978 que va de 0 a 1).
6.- Selecciona el tipo de tabla que quieres que te muestre: en columnas (expanded format) o en tabla de contingencia
(matrix format). 7.- pica OK.
8.- Pica Analyze --> Genetic Distance --> Start analysis para iniciar el análisis. El programa te va a mostrar dos valores la
distancia genética (dist.) y la identidad genética (ident.) que indica lo contrario a la distancia (I=1-dist), es decir, que
cuando las poblaciones son idénticas la distancia es 0 y la identidad es 1. Por el momento no le hagas caso a unbiased dist.
ni a unbiased ident.
En algunos casos, cuando el archivo de resultados es muy grande, el programa no puede mostrarlo en pantalla, por lo que te
va a pedir que lo guardes en un archivo, en ese caso, guárdalo como txt (ponle el nombre que quieras con la terminación .txt
- punto txt-) y luego abrelo con el block de notas.