Données génétiques de la schizophrénie - Psychologie - M. Fouchey

facteurs de risque génétiques en nombre insuffisant ou encore
l’existence de facteurs protecteurs pourraient atténuer le risque
de développer la maladie.
Cependant le pourcentage de familles au sein desquelles
plusieurs individus sont atteints demeure faible, environ 10 %
des cas. D’autres hypothèses ont été avancées pour expliquer la
forte prévalence de cas sporadiques. Lorsque le père est âgé de
plus de 50 ans au moment de la conception, le risque de
schizophrénie est augmenté d’environ 3 fois chez l’enfant
comparativement au risque observé chez celui conçu par un
père plus jeune. L’hypothèse de mutations survenant de novo
dans les cellules germinales a été avancée pour expliquer ce
phénomène [5] . Le phénomène d’anticipation pourrait également
contribuer à expliquer la fréquence des cas sporadiques, il
sera détaillé plus loin dans le chapitre consacré à l’anticipation.
■ Identification des gènes
impliqués
De nombreux travaux ont bien sûr tenté de localiser et
d’identifier les gènes que l’on suppose impliqués dans l’étiologie
de la schizophrénie. Les analyses de liaison génétique ainsi que
les études d’association sont les deux principaux types d’études
utilisés.
Analyses de liaison génétique
Elles sont réalisées à partir de familles de patients. Le principe
est de tester si les allèles d’un marqueur de l’ADN, dont la
localisation chromosomique est connue, coségrègent avec le
locus (emplacement d’un segment d’ADN sur le chromosome)
supposé de la maladie. Deux gènes situés sur le même chromosome
auront en effet tendance à être transmis ensemble,
probabilité d’autant plus forte que ces gènes sont proches et que
la possibilité de crossing-over (échange réciproque de matériel
génétique entre chromosomes homologues au moment de la
méiose) est faible. La méthode classique utilisée pour tester la
vraisemblance d’une liaison entre un marqueur et un gène
pathologique est celle des Lod scores. Les résultats sont exprimés
en logarithme du rapport de deux probabilités : celle de
l’hypothèse d’une liaison divisée par la probabilité d’observer
l’hypothèse nulle d’absence de liaison. Un Lod score supérieur
à 3 (score souvent retenu) signifie qu’une liaison est 1 000 fois
plus probable qu’une absence de liaison.
De nombreuses études ont rapporté des liaisons positives
mais les valeurs de Lod scores ont toujours été modestes. Dans
la plupart des cas, les études positives peinent à être répliquées.
D’autres méthodes d’études de liaison, à partir de fratries de
sujets schizophrènes, ont été utilisées mais un nombre considérable
de fratries doit être étudié pour espérer obtenir un résultat
fiable et reproductible, ce qui contraint les équipes à la constitution
de larges cohortes internationales et accroît le risque
d’hétérogénéité.
En fait, les études de liaison (ou de linkage) sont peu adaptées
à l’étude des maladies complexes telles que la schizophrénie
pour plusieurs raisons :
absence de certitude quant au statut clinique des apparentés
(malades ou sains) ;
hétérogénéité génétique très probable de la schizophrénie ;
pénétrance incomplète : en interagissant avec l’environnement,
le génotype peut conduire à l’expression d’un phénotype
clinique correspondant à la schizophrénie ou encore à
certains symptômes de la maladie ou à un trouble de la
personnalité appartenant au spectre clinique de la maladie
(phénotype clinique incomplet) ou bien finalement ne pas
avoir de traduction clinique observable ;
les phénocopies correspondent à des patients schizophrènes
qui ne présenteraient pas les gènes d’intérêt pour la schizophrénie
;
il s’agit d’une méthode dite paramétrique nécessitant de
connaître le mode de transmission de la maladie, ce qui est
donc peu adapté à la recherche en génétique dans la schi-
Psychiatrie
zophrénie. L’utilisation d’un modèle génétique peu adapté
peut conduire à des erreurs dans les études de liaison multipoint
;
il y a très peu de grandes familles comportant de nombreux
sujets schizophrènes (pour revue [6] ).
Bien que les analyses de liaison réalisées à partir de sib-pairs
permettent de s’affranchir de certaines difficultés méthodologiques
rencontrées dans les études classiques de liaison, telles que
l’estimation de la pénétrance de la maladie, cette méthode des
sib-pairs présente également ses propres limites, elle est en effet
plus puissante dans des conditions d’hétérogénéité génétique
modérée de la maladie étudiée.
Ces études de liaison peuvent être menées sur le génome
entier en recherchant des régions candidates ou bien directement
à partir de gènes candidats préalablement identifiés. Un
gène est considéré comme candidat lorsque sa fonction suggère
qu’il joue un rôle dans l’étiopathogénie de la maladie. Ces gènes
d’intérêt sont alors examinés afin de rechercher des variations
d’ADN ayant, dans la mesure du possible, un impact fonctionnel
lors de la transcription du gène.
Études d’association
Données génétiques de la schizophrénie 37-285-A-16
On recherche une association entre la maladie et un polymorphisme
(variation dans le gène) localisé sur un gène en
comparant les fréquences alléliques de ces polymorphismes
entre une population de patients et une population de témoins.
Cet échantillon de témoins doit être le plus précisément
possible apparié à la population de malades, l’origine ethnique
étant particulièrement importante, afin d’éviter le principal biais
de ce type d’étude lié à une stratification de la population. La
stratification correspond à une différence de fréquence allélique
pour un polymorphisme donné entre la population d’où
provient le patient et celle d’où provient le témoin. Afin de
s’affranchir de cette difficulté, des familles sont parfois utilisées
pour réaliser ces études d’association. Le test utilisé est celui du
déséquilibre de transmission (Transmission Disequilibrium Test)
qui étudie s’il existe une transmission préférentielle d’un allèle,
des parents à un enfant schizophrène, pour un marqueur
donné. Ce test peut être utilisé même lorsque des stratifications
de population existent. Cependant les études d’association,
surtout celles réalisées à l’aide de nombreux single nucleotide
polymorphisms (SNP) localisés à différents endroits dans le
génome, se heurtent à de nombreux biais méthodologiques
(tests statistiques multiples et risque de faux positifs...). De plus,
l’hétérogénéité des populations analysées, les différentes
méthodes statistiques utilisées ou encore les différents polymorphismes
ou haplotypes testés pour le même gène rendent les
études difficiles à comparer entre elles. Enfin, la plupart des
études négatives ne sont pas publiées. Parfois l’association peut
être positive avec certaines caractéristiques cliniques de la
maladie mais pas avec le phénotype schizophrénie ; ce type de
résultat pose toujours la question des faux positifs de par le
nombre de tests statistiques utilisés pour la même population.
Ioannidis et al. [7] et Delisi et Faraone [8] ont publié récemment
une liste de recommandations pour les études d’association
dans le cas des maladies complexes comportant une
hétérogénéité allélique telles que la schizophrénie (pour revue
voir également [9] ). La prudence est d’autant plus importante
que l’on teste des polymorphismes rares qui sont parfois plus
fréquemment observés dans certaines ethnies, indépendamment
de la pathologie étudiée [10] . La World Federation of Societies for
Biological Psychiatry (WFSBP) établit également des recommandations
dans ce domaine (www.wfsbp.org).
Résultats des études réalisées sur le génome
entier
Deux méta-analyses récentes des études de liaison réalisées
sur le génome entier ont confirmé, en utilisant des méthodes
statistiques différentes, que les régions 1q, 6p, 8p, 13q et 22q ou
encore, à un degré moindre, les régions 2p12-q22, 5q, 3p, 11q,
2q, 20p, 14q comportaient un ou plusieurs gènes de susceptibilité
à la schizophrénie [11, 12] . Ceci signifie qu’une bonne dizaine
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