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SQUILIBRIO DA LINKAGE
La mutazione compare per la prima volta in un soggetto A3, B3/A4, B4 sul cromosoma che
porta gli alleli A3 e B3. Per effetto delle vicinanza del locus C rispetto al locus B, la mutazione
tenderà ad essere trasmessa ai discendenti insieme all’allele B3 (pochi eventi di ricombinazione tra
B e C). Invece, potranno verificarsi più crossing-over tra C e A, quindi nelle generazioni il gene
mutato si dissocia dall’allele A3 che era presente nel cromosoma originario.
Se il gene mutato è vantaggioso, si osserverà un aumento della frequenza dell’aplotipo
B3/C rispetto agli altri aplotipo possibili. Se la mutazione è svantaggiosa si osserverà il contrario.
POLIMORFISMI DI SINGOLI NUCLEOTIDI (SNP)
• Posizioni del genoma in corrispondenza delle quali alcuni soggetti hanno un nucleotide (ad es. G) ed altri uno diverso (ad es. C).
• Presenti in gran numero nel genoma (circa 1,4 x 10 6 ).
• Solo alcuni generano RFLP perché la sequenza nella quale si trovano non è riconosciuta da enzimi di restrizione.
• Possono essere evidenziati con metodi diversi dall’elettroforesi su gel.
Rivelazione di SNP mediante ibridazione in soluzione
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Sonda specifica per un SNP, complementarietà
non totale con la sequenza normale.
Fluorocromo inibito, nessuna fluorescenza visibile.
Rivelazione di SNP su filtro mediante oligonucleotidi allele-specifici (ASO)
Perfetta complementarietà dovuta ad un SNP:
quando c’è ibridazione la sonda si apre.
Fluorocromo attivo, forte fluorescenza visibile e
misurabile per via strumentale.
SNP-1 SNP-2
La sonda specifica per SNP-2 non ibridizza con SNP-1 La sonda specifica per SNP-2 ibridizza con SNP-2
Ovviamente, la sonda specifica per SNP-1 darà un risultato complementare.
GENETICA DI POPOLAZIONI – LEGGE DI HARDY-WEINBERG
Condizioni di validità Premesse
1. Popolazione di dimensioni infinite
2. Panmissia, cioè incroci casuali
3. Assenza di mutazioni (o equilibrio)
4. Assenza di migrazione tra popolazioni
5. Assenza di selezione (tutti i genotipi hanno lo stesso successo riproduttivo)
1. Locus singolo con due alleli: A e a
2. Frequenza dell’allele A = p
3. Frequenza dell’allele a = q
4. p + q = 1
5. 1 – q = p
In una popolazione panmittica, le frequenze degli alleli e dei genotipi restano costanti di generazione in generazione e sono
facilmente deducibili. E’ più facile che la popolazione sia panmittica per un carattere non visibile come il gruppo sanguigno.