Modelli di ereditarietà mendeliana complicati - SunHope
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Complicazioni rispetto ai principali<br />
modelli <strong>di</strong><br />
ere<strong>di</strong>tarietà <strong>mendeliana</strong>
Complicazioni rispetto ai principali modelli<br />
<strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tarietà <strong>mendeliana</strong><br />
• Mutazioni de novo<br />
• Espressività variabile<br />
• Penetranza incompleta<br />
• Mosaicismo Germinale<br />
• Insorgenza Tar<strong>di</strong>va<br />
• Eterogeneità genetica
Complicazioni rispetto ai principali modelli<br />
<strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tarietà <strong>mendeliana</strong><br />
Una nuova mutazione autosomica dominante determina uno schema<br />
<strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tà simile a quello <strong>di</strong> un carattere recessivo autosomico o legato<br />
all’X ed invece si tratta <strong>di</strong> un caso spora<strong>di</strong>co (mutazione de novo)<br />
specialmente frequente nelle malattie che portano a morte prima<br />
dell’eta’ riproduttiva (osteogenesi imperfetta 100%, acondroplasia 80%).
Complicazioni rispetto ai principali modelli<br />
<strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tarietà <strong>mendeliana</strong><br />
• Mutazioni de novo<br />
• Espressività variabile<br />
• Penetranza incompleta<br />
• Mosaicismo Germinale<br />
• Insorgenza Tar<strong>di</strong>va<br />
• Eterogeneità genetica
Espressività variabile<br />
Manifestazione più o meno marcata <strong>di</strong> un fenotipo<br />
dovuto ad un allele mutante.<br />
In altre parole, <strong>di</strong>fferenti membri <strong>di</strong> una stessa famiglia<br />
mostrano spettri fenotipici <strong>di</strong>fferenti della stessa malattia.<br />
L’espressività <strong>di</strong> un carattere si riferisce alla natura ed<br />
alla gravità del fenotipo
Sor<strong>di</strong>ta’<br />
Sor<strong>di</strong>ta’+ occhi <strong>di</strong> colore <strong>di</strong>verso<br />
Sor<strong>di</strong>ta’+ occhi <strong>di</strong> colore <strong>di</strong>verso + ciuffo <strong>di</strong><br />
Capelli bianchi sulla fronte<br />
Sor<strong>di</strong>ta’+ occhi <strong>di</strong> colore <strong>di</strong>verso + ciuffo <strong>di</strong><br />
Capelli bianchi sulla fronte + precoce<br />
incanutimento<br />
Ere<strong>di</strong>tà autosomica dominante con espressività variabile: in questa<br />
famiglia con sindrome <strong>di</strong> Waardenburg, l’ombreggiatura del primo<br />
quadrante = sor<strong>di</strong>tà; del secondo quadrante = occhi <strong>di</strong> colore <strong>di</strong>verso;<br />
del terzo quadrante = ciuffo <strong>di</strong> capelli bianchi sulla fronte; del quarto<br />
quadrante = precoce incanutimento.<br />
Altri es Sindrome <strong>di</strong> Marfan, Osteogenesi imperfecta, Distrofia miotonica
Complicazioni rispetto ai principali modelli<br />
<strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tarietà <strong>mendeliana</strong><br />
• Mutazioni de novo<br />
• Espressività variabile<br />
• Penetranza incompleta<br />
• Mosaicismo Germinale<br />
• Insorgenza Tar<strong>di</strong>va<br />
• Eterogeneità genetica
Penetranza<br />
La penetranza è un fenomeno “tutto o nulla” che si<br />
riferisce all’espressione, o alla non espressione, <strong>di</strong> un<br />
dato gene mutante; per un carattere dominante è definita<br />
quantitativamente come la proporzione <strong>di</strong> portatori<br />
obbligati della mutazione (eterozigoti) che esprimono il<br />
fenotipo. Ad esempio se una malattia ha una penetranza<br />
del 90% significa che il portatore (carrier) dell’allele<br />
mutato ha il 90% <strong>di</strong> probabiltà <strong>di</strong> esprimere la malattia a<br />
livelli osservabili.<br />
La penetranza si valuta guardando se la malattia è<br />
presente oppure no
Penetranza incompleta<br />
la penetranza incompleta <strong>di</strong> un carattere si<br />
manifesta in una proporzione <strong>di</strong> figli affetti<br />
minore <strong>di</strong> quella attesa dalle proporzioni<br />
mendeliane (comunemente il 50% e 25% nei<br />
casi <strong>di</strong> caratteri autosomici rispettivamente<br />
dominanti e recessivi)<br />
molte malattie autosomiche dominanti sono a penetranza incompleta:<br />
vengono all’osservazione come fenotipi che saltano una<br />
generazione<br />
– si esprime come una percentuale o una frazione <strong>di</strong> uno<br />
Esempio: la sindrome dell’X Fragile ha una penetranza del 80% (8<br />
su 10 con il genotipo della malattia esprimono il fenotipo)
Il pe<strong>di</strong>gree <strong>di</strong> una famiglia con eritromelalgia autosomica<br />
dominante che mostra un <strong>di</strong>fetto <strong>di</strong> penetranza. Si osservi come<br />
l’in<strong>di</strong>viduo III-1 è clinicamente sano, ma è portatore obbligato<br />
dell’allele mutante. 9 dei 10 eterozigoti obbligati manifestano la<br />
malattia. Quin<strong>di</strong> la penetranza in questo caso e’ del 90%.
Un esempio <strong>di</strong> penetranza incompleta spiegata<br />
molecolarmente: il locus <strong>di</strong> retinite pigmentosa RP11<br />
Retinite pigmentosa: la forma piu’ frequente <strong>di</strong> retinopatia<br />
ere<strong>di</strong>taria (1:4000 in<strong>di</strong>vidui);<br />
Clinica: esor<strong>di</strong>o con cecita’ notturna e progressiva degenerazione<br />
della retina periferica, elettroretinogramma (ERG) ridotto o<br />
assente;<br />
Genetica molto complessa: puo’ essere causata da molti <strong>di</strong>versi<br />
geni (circa 50).<br />
La forma RP11 e’ causata da mutazioni nel gene PRPF31 (human<br />
homolog of yeast pre-mRNA splicing factor 31).<br />
Penetranza incompleta descritta per questo locus
Un esempio <strong>di</strong> penetranza incompleta spiegata<br />
molecolarmente: il locus <strong>di</strong> retinite pigmentosa RP11<br />
La penetranza incompleta e’ spiegata dal livello <strong>di</strong> espressione dell’allele<br />
RP11 sano: livelli piu’ elevati hanno un effetto protettivo.
Complicazioni rispetto ai principali modelli<br />
<strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tarietà <strong>mendeliana</strong><br />
• Espressività variabile<br />
• Mutazioni de novo<br />
• Penetranza incompleta<br />
• Mosaicismo Germinale<br />
• Insorgenza Tar<strong>di</strong>va<br />
• Eterogeneità genetica
Eterogeneita’ Genetica<br />
• Eterogeneità genetica: lo stesso fenotipo causato da<br />
mutazioni in geni <strong>di</strong>versi<br />
– mutazioni in geni che co<strong>di</strong>ficano per <strong>di</strong>verse unità o<br />
subunità <strong>di</strong> una proteina, o per proteine che interagiscono<br />
con altre proteine, o che agiscono a sta<strong>di</strong> <strong>di</strong>versi <strong>di</strong> un<br />
processo metabolico<br />
Esempio della Osteogenesis Imperfecta (OI), La tripla<br />
elica del collagene <strong>di</strong> tipo I è formata da 2 catene a1<br />
(co<strong>di</strong>ficate sul cromosoma 17) and 1 catena a2 (co<strong>di</strong>ficata<br />
sul cromosoma 7). Mutazioni nei geni che mo<strong>di</strong>ficano la<br />
produzione o la struttura <strong>di</strong> queste catene danno luogo a<br />
<strong>di</strong>versi tipi clinici <strong>di</strong> OI.
RETINITIS PIGMENTOSA<br />
The most frequent form of inherited retinopathy (1 in<br />
4000 in<strong>di</strong>viduals worldwide)<br />
Characterized by night blindness and progressive<br />
degeneration of the mid-peripheral retina, bone<br />
spicule-like pigmentary deposits and reduced or<br />
absent electroretinogram (ERG).
RETINITIS PIGMENTOSA<br />
Isolated or syndromic<br />
The main syndromic forms are:<br />
Usher syndrome: RP + deafness<br />
Bardet-Biedle syndrome: RP + mental retardation +<br />
renal anomalies + hypogona<strong>di</strong>sm + polydactyly, etc.
RETINITIS PIGMENTOSA<br />
Molecular genetics<br />
Over 130 loci involved in retinal <strong>di</strong>seases have been<br />
mapped.<br />
At least seventy of these loci are involved in the<br />
pathogenesis of RPs (both isolated and syndromic)<br />
Over 45 RP genes have been identified<br />
From RETnet, http://www.sph.uth.tmc.edu/Retnet/home.htm
Summary of genes involved in retinitis pigmentosa
MOLECULAR PATWAYS INVOLVED<br />
IN RP PATHOGENESIS:<br />
PHOTOTRANSDUCTION (1)<br />
PDE<br />
Transducin<br />
Rhodopsin
MOLECULAR PATWAYS INVOLVED<br />
IN RP PATHOGENESIS:<br />
PHOTOTRANSDUCTION (2)
MOLECULAR PATWAYS INVOLVED IN RP<br />
PATHOGENESIS: the retinoid cycle
NRL is a transcription factor regulating Rhodopsin<br />
expression.<br />
Retinal degeneration caused by splicing factors<br />
Mutations in PRP3, PRP31, PRPC8 cause autosomal dominant<br />
retinitis pigmentosa. These three proteins are pre-mRNA<br />
splicing factors and are ubiquitously expressed.
RETINITIS PIGMENTOSA<br />
All types of inheritance have been described in RP<br />
(autosomal dominant, autosomal recessive, Xlinked<br />
and mitochondrial)
AUTOSOMAL DOMINANT RETINITIS<br />
PIGMENTOSA (AD-RP)
GENES MOST COMMONLY INVOLVED IN<br />
Other genes responsible for AD-RPs:<br />
AD-RP<br />
Rhodopsin (40% of AD-RP)<br />
Peripherin (5% of AD-RP)<br />
RP10 (5-10% of AD-RP)<br />
RP11 (21% of AD-RP)<br />
RP1 (5-10% of AD-RP)<br />
HPRP3, NRL, PRPC8, FSCN2, CRX, ROM1
AUTOSOMAL RECESSIVE RETINITIS<br />
PIGMENTOSA (AR-RP)<br />
. .<br />
.<br />
.<br />
. .<br />
.<br />
.<br />
.<br />
.<br />
.
GENES INVOLVED IN AR-RP<br />
MERTK<br />
PDE6B<br />
PDE6A<br />
CNGA1<br />
CNGB1<br />
LRAT<br />
ABCA4<br />
CRB1<br />
TULP1<br />
RGR<br />
PNR<br />
RLBP1<br />
SAG (arrestin)<br />
USH2A
X-LINKED RETINITIS<br />
PIGMENTOSA (XL-RP)<br />
. . . .<br />
.
GENES INVOLVED IN XL-RP<br />
RPGR (RP3)<br />
RP2
GENES INVOLVED IN USHER<br />
Autosomal recessive<br />
SYNDROME<br />
Usher I= USH1B (Myosin7a), USH1C (Harmonin),<br />
USH1F (protocadherin 15), USH1D (cadherinlike<br />
gene 23)<br />
Usher II= USH2A (Usherin)<br />
Usher III= clarin-1
GENES INVOLVED IN BARDET-<br />
BIEDLE SYNDROME<br />
Autosomal recessive<br />
BBS1<br />
BBS2<br />
BBS3<br />
BBS4<br />
BBS5<br />
BBS6<br />
BBS7<br />
BBS8<br />
BBS9<br />
BBS10<br />
BBS11<br />
BBS12
RETINITIS PIGMENTOSA<br />
All types of inheritance have been described in RP<br />
(autosomal dominant, autosomal recessive, Xlinked<br />
and mitochondrial)<br />
BUT<br />
About fifty percent of RP cases are spora<strong>di</strong>c (new mutations,<br />
recessive inheritance, <strong>di</strong>genic inheritance)
- new mutations<br />
- recessive inheritance<br />
WHY?<br />
- more complex patterns of inheritance
.<br />
.<br />
.<br />
.<br />
.<br />
.<br />
.
DIGENIC INHERITANCE HAS<br />
BEEN OBSERVED IN BARDET-<br />
BIEDLE SYNDROME
Complicazioni rispetto ai principali modelli<br />
<strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tarietà <strong>mendeliana</strong><br />
• Espressività variabile<br />
• Mutazioni de novo<br />
• Penetranza incompleta<br />
• Mosaicismo Germinale<br />
• Insorgenza Tar<strong>di</strong>va<br />
• Eterogeneità genetica
Mosaicismo<br />
Mosaicismo: con<strong>di</strong>zione in cui in un’in<strong>di</strong>viduo sono presenti due o<br />
piu’ linee cellulari geneticamente <strong>di</strong>verse derivate da un singolo<br />
zigote, ma <strong>di</strong>verse per una mutazione o per una non <strong>di</strong>sgiunzione.<br />
Queste mutazioni possono avere luogo in epoca prenatale o<br />
postnatale.
Presentazione schematica <strong>di</strong> <strong>di</strong>visioni mitotiche della cellula. Una mutazione che<br />
avviene durante la proliferazione della cellula, in<strong>di</strong>fferentemente nelle cellule<br />
somatiche o durante la gametogenesi, porta ad una porzione <strong>di</strong> cellule che portano la<br />
mutazione, risultando in mosaicismo somatico oppure della linea germinale.
Mosaicismo<br />
Mosaicismo germinale: nella linea germinale possono essere<br />
presenti due o piu’ linee cellulari derivate da un singolo zigote<br />
che <strong>di</strong>fferiscono per la presenza <strong>di</strong> una mutazione somatica o una<br />
non-<strong>di</strong>sgiunzione. Chiamato anche mosaicismo gona<strong>di</strong>co<br />
Durante le prime fase dello sviluppo embrionale <strong>di</strong> un genitore e’<br />
possibile ipotizzare che sia avvenuta una mutazione in una cellula<br />
o in un precursore della linea germinale che poi e’ persistito in<br />
tutti i <strong>di</strong>scendenti del clone <strong>di</strong> quella cellula e successivamente<br />
hanno formato una porzione <strong>di</strong> gameti.<br />
30 <strong>di</strong>visioni mitotiche nelle cellule della linea germinale prima della meiosi<br />
nelle femmine e molte centinaia nei maschi<br />
Implicazioni per il counseling genetico
Esempio <strong>di</strong> mosaicismo germinale<br />
Famiglia con osteogenesi imperfetta (autosomica dominante). Alleli<br />
normali: 153 e 63 bp. Allele affetto: 72 bp. Il padre non ha la mutazione<br />
nelle cellule del sangue ma ha due figli affetti che hanno l’allele mutato.<br />
L’analisi dello sperma del padre (FSp) rivela la presenza della<br />
mutazione.
Complicazioni rispetto ai principali modelli<br />
<strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tarietà <strong>mendeliana</strong><br />
• Espressività variabile<br />
• Mutazioni de novo<br />
• Penetranza incompleta<br />
• Mosaicismo Germinale<br />
• Insorgenza Tar<strong>di</strong>va<br />
• Eterogeneità genetica
MALATTIE AD INSORGENZA TARDIVA<br />
• Un caso particolarmente importante <strong>di</strong> penetranza ridotta è rappresentato dalle<br />
“malattie ad insorgenza tar<strong>di</strong>va”.<br />
• Le malattie genetiche non necessariamente devono essere “congenite”.<br />
• Quelle congenite sono quelle che si presentano alla nascita.<br />
• In alcune malattie, sebbene l’alterazione genetica sia presente fin dalla<br />
nascita, il quadro clinico può manifestarsi nell’età adulta.<br />
• Il ritardo nell’insorgenza può essere dovuto a:<br />
• lento accumulo <strong>di</strong> sostanze nocive<br />
• morte rallentata <strong>di</strong> certi tessuti<br />
• incapacità <strong>di</strong> riparare certe forme <strong>di</strong> danno ambientale<br />
• geni oncosoppressori<br />
• cause sconosciute
Come apparira’ un’albero <strong>di</strong><br />
malattia ad insorgenza tar<strong>di</strong>va?
Casi in cui in una malattia trasmessa con<br />
modalita’ dominante un affetto ha<br />
entrambi i genitori sani<br />
• Mutazione de novo<br />
• Penetranza incompleta<br />
• Mosaicismo germinale<br />
• Errata attribuzione <strong>di</strong><br />
paternita’ (5-10%)
Alcune classi particolari <strong>di</strong> malattie<br />
genetiche<br />
• Malattie Mitocondriali<br />
• Imprinting (sindrome <strong>di</strong> Prader-Willi e<br />
sindrome <strong>di</strong> Angelman)<br />
• Malattie da triplette (X-fragile, SCA).<br />
Concetto <strong>di</strong> premutazione ed anticipazione
DNA<br />
co<strong>di</strong>ficante<br />
Organizzazione del Genoma Umano<br />
Genoma nucleare<br />
3.000 Mb<br />
65.000-80.000 geni<br />
Geni e sequenze<br />
correlati ai geni<br />
Sequenze uniche o<br />
moderatamente ripetute<br />
~ 10% ~ 90%<br />
~ 30% ~ 70%<br />
DNA non<br />
co<strong>di</strong>ficante<br />
Pseudogeni Frammenti<br />
genici<br />
DNA extragenico<br />
Genoma umano<br />
Introni,<br />
sequenze non<br />
tradotte, ecc.<br />
Due geni<br />
Per rRNA<br />
Genoma mitocondriale<br />
16,6 kb<br />
37 geni<br />
Sequenze uniche o con<br />
un basso numero <strong>di</strong> copie<br />
22 geni<br />
Per tRNA<br />
~ 80% ~ 20%<br />
Ripetizioni in<br />
tandem o ripetizioni<br />
raggruppate<br />
13 geni che<br />
co<strong>di</strong>ficano polipepti<strong>di</strong><br />
Da me<strong>di</strong>amente ad<br />
altamente ripetute<br />
Ripetizioni<br />
intersperse
Le proteine mitocondriali sono prodotte da<br />
geni mitocondriali e geni nucleari<br />
Le proteine mitocondriali
CARATTERISTICHE dell’ mtDNA<br />
• POLIPLASMIA<br />
• ETEROPLASMIA<br />
• EFFETTO SOGLIA<br />
• SEGREGAZIONE MITOTICA<br />
• EREDITÀ MATERNA
POLIPLASMIA In ogni cellula sono presenti molti mitocondri ed ogni<br />
mitocondrio contiene multiple copia del suo genoma (eccetto piastrine e<br />
ovulo non fertilizzato) → migliaia <strong>di</strong> copie mtDNA / cell.<br />
Durante la <strong>di</strong>visione cellulare i mitocondri vengono <strong>di</strong>stribuiti casualmente<br />
alle cellule figlie<br />
ETEROPLASMIA In tessuti normali tutte le copie <strong>di</strong> mtDNA sono<br />
identiche.<br />
Nel caso <strong>di</strong> una mutazione del mtDNA questa può colpire tutte le copie →<br />
omoplasmia oppure essere presente solo in una percentuale <strong>di</strong> genomi →<br />
eteroplasmia.<br />
Generalmente i polimorfismi neutrali sono omoplasmici mentre la maggior<br />
parte delle mutazioni-malattia sono eteroplasmiche
EFFETTO SOGLIA L’espressione clinica delle mutazioni del mtDNA è<br />
determinata dalla relativa proporzione wild type/mutato in un determinato<br />
tessuto; è necessario un numero minimo <strong>di</strong> copie per danneggiare il metabolismo<br />
energetico <strong>di</strong> un determinato organo o tessuto (valore relativo e non assoluto)<br />
(SNC, cuore, muscolo, rene e ghiandole esocrine) (bilancio energetico).<br />
SEGREGAZIONE MITOTICA Durante la <strong>di</strong>visione cellulare la<br />
proporzione <strong>di</strong> genomi mutati può variare per deriva nelle cellule figlie, con<br />
conseguente cambiamento fenotipico.<br />
EREDITÀ MATERNA Virtualmente tutti i mitocondri dello zigote<br />
derivano dall’oocita e perciò la modalità <strong>di</strong> trasmissione delle mutazioni mt<br />
<strong>di</strong>fferisce dalla trasmissione <strong>mendeliana</strong> classica:<br />
madre portatrice → trasmissione a tutta la progenie, ma solo le figlie<br />
femmine possono trasmettere la mutazione ai loro figli (ere<strong>di</strong>ta’<br />
matrilineare).<br />
Eteroplasmia + effetto dose → eccezioni fenotipiche all’ere<strong>di</strong>tà matrilineare.
- 16.569 bp<br />
GENOMA MITOCONDRIALE<br />
- 37 geni (13 co<strong>di</strong>ficano per proteine che rappresentano<br />
subunità <strong>di</strong> enzimi coinvolti nella catena respiratoria;<br />
22 per RNA transfer; 2 per RNA ribosomiale)<br />
- Co<strong>di</strong>ce genetico leggermente <strong>di</strong>verso da quello nucleare<br />
(AGA e AGG sono STOP)<br />
- Le mutazioni possono essere eteroplasmiche e omoplasmiche
- Frequenza 6-7/100.000 nati<br />
MALATTIE MITOCONDRIALI<br />
- Malattie da mutazioni <strong>di</strong> geni del genoma mitocondriale<br />
Mutazioni puntiformi, delezioni o duplicazioni<br />
- Malattie da mutazioni <strong>di</strong> geni del genoma nucleare che<br />
co<strong>di</strong>ficano per proteine che vengono trasportate nel<br />
mitocondrio (proteine strutturali, proteine deputate all’importazione<br />
o alla comunicazione tra i due genomi)<br />
- Poiche’ la funzione mitocondriale e’ necessaria a quasi tutte le<br />
cellule e poiche’ l’espressione fenotipica <strong>di</strong> una mutazione<br />
nell’mtDNA <strong>di</strong>pende dalla proporzione relativa <strong>di</strong> mtDNA normale e<br />
mutante nelle cellule che formano i tessuti, la ridotta penetranza<br />
l’espressivita’ variabile e la pleiotropia sono caratteristiche tipiche <strong>di</strong><br />
un’albero genealogico <strong>di</strong> un <strong>di</strong>sor<strong>di</strong>ne mitocondriale
Malattie mitocondriali<br />
L’ere<strong>di</strong>ta’ e’ matrilineare e nessun maschio affetto trasmette la malattia alla sua progenie<br />
mentre la femmina affetta trasmette la malattia a tutti i figli senza <strong>di</strong>stinzione <strong>di</strong> sesso.
EXAMPLES OF MITOCHONDRIAL DISORDERS
Neuropatia Ottica Ere<strong>di</strong>taria <strong>di</strong> Leber<br />
(LHON)<br />
Per<strong>di</strong>ta acuta o subacuta della visione senza dolore, acc.<br />
Da scotoma centrale, per atrofia ottica nel giovane adulto<br />
- teleangectasia peripapillare nel p. presintomatico.<br />
NUCLEOTIDE GENE FREQUENZA<br />
11.778 ND 4 50-70%<br />
3.460 ND 1 15%<br />
14.484 ND 6 10%<br />
Sono geni del complesso 1 della catena respiratoria<br />
= NADH - coenzima Q ossido reduttasi
Alcune classi particolari <strong>di</strong> malattie<br />
genetiche<br />
• Malattie Mitocondriali<br />
• Imprinting (sindrome <strong>di</strong> Prader-Willi e<br />
sindrome <strong>di</strong> Angelman)<br />
• Malattie da triplette (X-fragile, SCA).<br />
Concetto <strong>di</strong> premutazione ed anticipazione
IMPRINTING GENOMICO:<br />
La battaglia dei sessi comincia nello zigote
DEFINIZIONE<br />
Per la maggioranza dei geni <strong>di</strong> mammifero<br />
l’espressione <strong>di</strong> un allele non <strong>di</strong>pende dal fatto<br />
che l’allele sia stato ere<strong>di</strong>tato dalla madre o dal<br />
padre. Tuttavia alcuni geni sono particolari<br />
poiché l’espressione <strong>di</strong> un allele <strong>di</strong>pende dalla<br />
sua origine parentale: per alcuni geni viene<br />
espresso l’allele materno per altri quello<br />
paterno. A questo fenomeno si dà il nome <strong>di</strong><br />
IMPRINTING GENOMICO.<br />
Si definisce “imprinted” la copia del gene che<br />
non viene espressa.
The expression of an imprinted gene<br />
Paternal allele<br />
Maternal allele<br />
depends on its parental origin<br />
GENE 1 GENE 2 GENE 3<br />
ON ON OFF<br />
non Imprinted<br />
Imprinted<br />
Paternally<br />
expressed<br />
Imprinted<br />
Maternally<br />
expressed<br />
GENE 1 GENE 2 GENE 3<br />
ON OFF ON
La scoperta dell’ Imprinting Genomico<br />
• Solter e Surani<br />
(1980):trapianti <strong>di</strong> nuclei.<br />
Embrioni <strong>di</strong> topo<br />
manipolati in modo da<br />
contenere due genomi<br />
Pronucleus<br />
transplantation<br />
materni o due genomi<br />
paterni non si<br />
sviluppavano
Altre osservazioni<br />
• Gravidanze umane con assetto triploide<br />
hanno caratteristiche <strong>di</strong>verse a seconda che il<br />
genoma in più sia materno o paterno.<br />
• Caratteri autosomici dominanti che si<br />
manifestano solo quando ere<strong>di</strong>tati da un<br />
genitore.<br />
• La delezione <strong>di</strong> certe regioni cromosomiche<br />
dà un certo fenotipo a seconda che si trovi sul<br />
cromosoma paterno o materno.
QUANTI SONO I GENI IMPRINTED<br />
• Ad oggi sono stati identificati 31 geni<br />
imprinted nell’uomo e 45 nel topo.<br />
• Nell’uomo quasi tutti i cromosomi presentano<br />
geni imprinted. I cromosomi maggiormente<br />
coinvolti sono il cromosoma 2, 6, 7, 11, 14,<br />
15, 16, 20.<br />
• Sono geni coinvolti nel controllo della crescita<br />
fetale.
CARATTERISTICHE DEI GENI IMPRINTED<br />
• Tendenza a formare cluster (80%);<br />
• Metilazione <strong>di</strong>fferenziale dei due alleli;<br />
• Possono co<strong>di</strong>ficare sia per proteine<br />
che RNA non tradotti.
Metilazione del DNA<br />
Ad<strong>di</strong>zione covalente <strong>di</strong> gruppi metilici<br />
alle basi del DNA. Negli eucarioti<br />
consiste principalmente nella<br />
metilazione delle citosine ed e’<br />
associata a ridotti livelli <strong>di</strong> trascrizione<br />
dei geni. Ad esempio nelle femmine <strong>di</strong><br />
mammiferi il cromosoma X inattivo e’<br />
estesamente metilato.
METILAZIONE DIFFERENZIALE<br />
(presenza <strong>di</strong> <strong>di</strong>fferentially methylated regions: MDRs)<br />
HA UNA RUOLO FONDAMENTALE NEL MANTENERE<br />
L’IMPRINTING<br />
• La metilazione può essere<br />
introdotta nella linea germinale<br />
e mantenuta durante lo<br />
sviluppo in tutte le cellule.<br />
• Può esserci una mo<strong>di</strong>ficazione<br />
della metilazione durante lo<br />
sviluppo in alcuni tessuti.<br />
• Alcune MDRs sono metilate<br />
nella copia inattiva del gene<br />
altre in quella attiva.
Genomic Imprinting and Human Disease<br />
Syndromes involving imprinted<br />
genes<br />
Beckwith–Wiedemann syndrome<br />
Prader–Willi syndrome<br />
Angelman syndrome<br />
Silver–Russell syndrome<br />
Transient neonatal <strong>di</strong>abetes mellitus<br />
PHP1b, Albright here<strong>di</strong>tary<br />
osteodystrophy<br />
Familial nonchromaffin paraganglioma<br />
Maternal and paternal UPD14 syndromes<br />
Syndromes that probably involve<br />
imprinted genes<br />
Turner syndrome phenotypes<br />
Familial pre-eclampsia<br />
Maternal UPD2 syndrome<br />
Maternal UPD16 syndrome<br />
Complex genetic <strong>di</strong>seases with<br />
parent-of-origin effects<br />
Asthma, atopy<br />
Autism<br />
Hirschsprung <strong>di</strong>sease<br />
Cornelia de Lange syndrome<br />
Psoriasis<br />
Handedness<br />
Type I <strong>di</strong>abetes<br />
Type II <strong>di</strong>abetes<br />
Alcoholism<br />
Alzheimer <strong>di</strong>sease<br />
Bipolar affective <strong>di</strong>sorder<br />
Schizophrenia
IMPRINTING E MALATTIE<br />
GENETICHE<br />
• Delezione del gene;<br />
• Mutazioni del centro dell’imprinting;<br />
• Disomia uniparentale (UDP).<br />
• SINDROME DI<br />
BECKWITH-WIEDEMANN<br />
• SINDROME DI SILVER RUSSEL<br />
• SINDROME DI PRADER-WILLI<br />
• SINDROME DI ANGELMAN.<br />
11p15.5<br />
15q11-13
Disomia Uniparentale presenza <strong>di</strong> due copie dello stesso<br />
cromosoma ere<strong>di</strong>tate dallo stesso genitore, mentre nessuna copia viene<br />
dall’altro genitore<br />
Materna<br />
Paterna<br />
M<br />
M<br />
P<br />
P
Sindrome <strong>di</strong> Prader - Willi<br />
• Ipotonia, debole succhiatura<br />
• Testicoli ritenuti (M)/Labbra<br />
ipoplastiche (F)<br />
• Iperfagia (2 - 3 anni)⇒ OBESITA’<br />
• Facies: stretto <strong>di</strong>ametro bitemporale<br />
occhi a mandorla, strabismo<br />
• Bassa statura, piccole mani e pie<strong>di</strong><br />
• Capelli chiari e ipopigmentazione<br />
• RITARDO MENTALE me<strong>di</strong>o
Sindrome <strong>di</strong> Angelman<br />
• Inappropriati accessi <strong>di</strong> riso<br />
• Andatura atassica (a marionetta)<br />
• EPILESSIA<br />
• Facies: bocca larga, lingua protrusa, labbro sup. sottile, man<strong>di</strong>bola prominente<br />
• Ipopigmentazione<br />
• RITARDO MENTALE grave con assenza <strong>di</strong> parola
Prader-Willi (PWS) Angelman (AS)<br />
• Ipotonia, debole, succhiatura<br />
• Testicoli ritenuti (M)/Labbra<br />
ipoplastiche (F)<br />
• Iperfagia (2 - 3 anni)⇒ OBESITA’<br />
• Facies: stretto <strong>di</strong>ametro bitemporale<br />
occhi a mandorla, strabismo<br />
• Bassa statura, piccole mani e pie<strong>di</strong><br />
• Capelli chiari e ipopigmentazione<br />
• RITARDO MENTALE me<strong>di</strong>o<br />
• Inappropriati accessi <strong>di</strong> riso<br />
• Andatura atassica (a marionetta)<br />
• EPILESSIA<br />
• Facies: bocca larga, lingua protrusa<br />
labbro sup. sottile, man<strong>di</strong>bola<br />
prominente<br />
• ASSENZA DELLA PAROLA<br />
• Ipopigmentazione<br />
• RITARDO MENTALE grave<br />
LA MAGGIOR PARTE DEI CASI SONO SPORADICI<br />
In entrambe le sindromi si trovano anomalie della<br />
stessa regione del cromosoma 15 (delezione 15q11-q13)
L’analisi molecolare ha <strong>di</strong>mostrato che<br />
è deleto lo stesso intervallo<br />
La <strong>di</strong>fferenza del fenotipo è dovuta alla<br />
<strong>di</strong>fferente origine parentale della delezione<br />
Delezione dell’allele paterno ⇒ PWS<br />
Delezione dell’allele materno ⇒ AS<br />
Ci sono due o più geni "imprinted " in<br />
maniera opposta nella regione deleta
Il gene PWS è espresso<br />
Esclusivamente nell’omologo<br />
paterno<br />
Il gene AS è espresso<br />
esclusivamente nell’omologo<br />
materno<br />
La delezione dell’<br />
allele espresso<br />
determina nullisomia<br />
IMPRINTING<br />
La copia paterna e la copia materna <strong>di</strong> un gene sono<br />
espressi DIFFERENTEMENTE<br />
Il pattern <strong>di</strong> ere<strong>di</strong>tà è deviato rispetto<br />
alle regole mendeliane
70 %<br />
Delezione 15 q<br />
85%<br />
visibile al cariotipo<br />
PWS 20 %<br />
UPD = uniparental<br />
<strong>di</strong>somy (<strong>di</strong>somia<br />
uniparentale)<br />
< 1 % AS<br />
restanti<br />
casi<br />
Mutazioni puntiformi<br />
nei geni<br />
restanti<br />
casi<br />
UPD = ere<strong>di</strong>tà <strong>di</strong> entrambi i cromosomi omologhi da un singolo<br />
genitore<br />
UPD Materna ⇒ PWS ( = delezione omologo paterno)<br />
UPD Paterna ⇒ AS ( = delezione omologo paterno)<br />
Il meccanismo alla base sarebbe una non <strong>di</strong>sgiunzione nella meiosi<br />
materna
The PWS/AS Imprinting Cluster
Beckwith-Wiedemann syndrome (BWS,<br />
overgrowth<br />
• neonatal hypoglycemia<br />
• visceromegaly<br />
• ear pits/creases<br />
1/13700)<br />
macroglossia<br />
abdominal wall<br />
defects<br />
• naevus flammeus<br />
• hemihypertrophy<br />
• increased susceptibility<br />
to childhood tumours
Silver-Russell syndrome (SRS)<br />
congenital<br />
dwarfism<br />
body<br />
asymmetry<br />
triangular<br />
face
Human 11p15.5<br />
CARS<br />
11p15.5 Imprinting Cluster<br />
NAP1L4<br />
TSSC3<br />
TSSC5<br />
CDKN1C<br />
KCNQ1OT1/<br />
LIT1<br />
KCNQ1<br />
LTRPC5<br />
TSSC4<br />
CD81<br />
TSSC6<br />
ASCL2<br />
Domain 1<br />
Th TH<br />
Ins2<br />
INS<br />
Igf2<br />
IGF2<br />
H19<br />
H19<br />
RPL23<br />
cen tel<br />
Cars<br />
Nap1l4<br />
Tssc3<br />
Tssc5<br />
Cdkn1c<br />
IC2<br />
Kcnq1ot1/<br />
Lit1<br />
Kcnq1<br />
Ltrpc5<br />
Tssc4<br />
Cd81<br />
Tssc6<br />
Ascl2<br />
IC1<br />
IC1<br />
100kb<br />
John et al.,<br />
1998
Pathogenesis of BWS<br />
CDKN1C<br />
KCNQ1OT1/<br />
LIT1<br />
cen tel<br />
IC2<br />
Domain 2<br />
IGF2<br />
Excess of paternally expressed genes<br />
Defect of maternally expressed genes<br />
H19<br />
IC1<br />
Domain 1
Pathogenesis of SRS<br />
CDKN1C<br />
KCNQ1OT1/<br />
LIT1<br />
cen tel<br />
IC2<br />
IGF2<br />
Excess of maternally expressed genes<br />
Defect of paternally expressed genes<br />
H19<br />
IC1<br />
Domain 1
La genetica della sindrome BWS<br />
• Mutazioni loss of function del gene CDKN1C (40%<br />
familiari e nel 5% spora<strong>di</strong>ci)<br />
• uniparental <strong>di</strong>somy paterna (UPD) <strong>di</strong> 11p15.5 (1%)<br />
• maternal translocation con punto <strong>di</strong> rottura in<br />
11p15.5 (molto raro)<br />
• Mutazioni nel centro dell’Imprinting<br />
• Aumento <strong>di</strong> metilazione del DNA materno (ICD1)<br />
• Per<strong>di</strong>ta della metilazione del DNA materno ICD2
LA GUERRA TRA I SESSI<br />
Osservazione: i geni imprinted influenzano la crescita<br />
fetale (molti geni imprinted sono espressi nella<br />
placenta) e ciò avviene potenzialmente in modo<br />
antagonistico:<br />
• i geni espressi dal cromosoma paterno aumentano<br />
la crescita;<br />
• i geni espressi dal cromosoma materno la<br />
sopprimono<br />
TEORIA DEL CONFLITTO PARENTALE
MODELLO DEL CONFLITTO<br />
PARENTALE<br />
• I geni espressi dal cromosoma paterno sono<br />
selezionati in modo da estrarre maggiori risorse dalla<br />
madre per incrementare il benessere della propria<br />
prole.<br />
• I geni espressi dal cromosoma materno tendono a<br />
conservare le risorse per <strong>di</strong>viderle tra un maggior<br />
numero <strong>di</strong> figli (magari con un <strong>di</strong>verso padre) in modo<br />
da aumentare le proprie capacità riproduttive.<br />
SPECIAZIONE
FILOGENESI<br />
• L’imprinting genomico è stato trovato<br />
nei<br />
MAMMIFERI EUTERI;<br />
MARSUPIALI;<br />
PIANTE CON FIORI.<br />
• Non è stato trovato nei Monotremi<br />
(mammiferi non euteri) né in altri<br />
vertebrati ed invertebrati.