FIBROSI CISTICA - Nuclear Laser Medicine srl

FIBROSI CISTICA
Bibliografia
Cremonesi L, Ferrari M, Bellomi E, Magnani C, Seia M, Ronchetto P, Rady M, Russo MP, Romeo G, Devoto M. “Four new mutations
of the CFTR gene (541 delC,R347H,R352Q,E585X) detected by DGGE analysys in Italian CF patients, associated with different clinical
phenotypes” Hum. Mutat. 1992; 1 (4): 314-9
Bonizzato A, Bisceglia L, Marigo C, Nicolis E, Bombieri C, Castellani C, Borgo G, Zelante L, Mastella G, Cabrini G, et al. “Analysis of
the complete coding region of the CFTR, gene in a cohort of CF patients from north-eastern Italy: identification of 90% of the mutations”
Hum Genet 1995 Apri; 95 (4): 397-402
Bombieri C, Benetazzo M, Saccomani A, Belpinati F, Gile LS, Luisetti M, Pignatti PF “Complete mutational screening of the CFT gene
in 120 patients with pulmonary disease” Hum Genet. 1998 Dec; 103 (6) 718-22
D’Apice MR, Gambardella S, Bengala M, Russo S, Nardone AM, Lucidi V, Sangiuolo F, Novelli G “Molecular analysis using DHPLC of
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Modelli di analisi per la Fibrosi Cistica Società Italiana di Genetica Medica Commissione di studio sulle modalità di analisi genetica per
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Mutations in Sardinia: implications for population screening, Valeria Faà, Pietro Pellegrini Bettoli, Maria Demurtas, Maurizio Zanda,
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Four new mutations of the CFTR gene (541delC, R347H, R352Q, E585X) detected by DGGE analysis in Italian CF patients, associated
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Geographic Distribution and Regional Origin of 272 Cystic Fibrosis Mutations in European Populations. HUMAN MUTATION
10:135–154 (1997) X. Estivill et al.
Analisi genetica mediante ibridazione inversa su
striscia delle più importanti mutazioni italiane
Identificazione
dei portatori
Diagnosi
prenatale
Infertilità
maschile
Fecondazione
assistita
Screening
neonatale
Tipizzazione
di pazienti affetti
NUCLEAR LASER MEDICINE S.r.l.
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FIBROSI CISTICA
FIBROSI CISTICA
INTRODUZIONE
La fibrosi cistica (FC) è una malattia congenita, cronica, evolutiva, trasmessa con meccanismo
autosomico recessivo più frequente nella popolazione caucasica: ne è affetto un neonato ogni 2500-
2700 nati vivi.
La fibrosi cistica è secondaria ad un’anomalia della proteina chiamata CFTR (Cystic Fibrosis
Transmembrane Conductance Regulator) localizzata nella membrana apicale delle cellule degli
epiteli; la sua funzione è quella di regolare gli scambi idroelettrolitici.
Il gene che codifica questa proteina è stato localizzato nel 1989 sul braccio lungo del cromosoma 7
e, all’alterazione della proteina, consegue un’anomalia del trasporto di sali che determina
principalmente una produzione di secrezioni per così dire “disidratate”. Il sudore è molto ricco in sodio
e cloro, il muco è denso e vischioso e tende ad ostruire i dotti nei quali viene a trovarsi.
La malattia coinvolge numerosi organi ed apparati: l’apparato respiratorio, dalle prime vie aeree al
tessuto polmonare, il pancreas nella produzione di enzimi digestivi, il fegato, l’intestino e l’apparato
riproduttivo, soprattutto nei maschi.
La patologia può manifestarsi precocemente, in età neonatale o nelle prime settimane o mesi di vita,
con gravità diversa, in alcuni casi in correlazione a particolari mutazioni geniche.
Più raramente la malattia può evidenziarsi nell’età adolescenziale od adulta con quadri clinici meno
gravi.
Inoltre, una caratteristica ricorrente tra i maschi con Fibrosi Cistica, è l’infertilità associata alla
patologia ostruttiva dei vasi deferenti (CBAVD). Questo difetto costituisce cause di sterilità maschile
che nel 60% dei casi è riconducibile a mutazioni di CFTR.
Piemonte
81,40%
Lombardia
75,47%
79,31%*
Sardegna
86,43%
87,68%*
Trentino
Alto Adige
95,10%
Veneto
85,80%
87,30%*
Emilia Romagna
79,63%
83,28%*
Toscana
78,00%
Friuli
Venezia
Giulia
82,90%
86,00%*
Umbria
90,80%
97,94%*
Lazio
83,10%
84,50%*
Estrazione da sangue intero e da spot su carta
Puglia
84,80%
91,50%*
Campania
88,00%
90,10%* Basilicata
78,70%
88,30%*
Unica Mix di amplificazione per striscia
25 test totali per striscia
Reattivi in formato pronto uso
Test automatizzabile
Analisi in 5 ore fino a 60 mutazioni
* Detection rate con terza striscia
Dato prelevato dal sito del gruppo
italiano di fibrosi cistica per le regioni
per le quali esiste un dato bibliografico
http://spazioweb.inwind.it/laboratoriCF
RISULTATI
Strip 1 CF 22 Mutazioni
Linea di riferimento rossa
Controllo Rivelazione
M.F508del (c.1521_1523del)
M.I507del (c.1519_1521del)
M.F508C c.1523T>G)
M.I502T (c.1505T>C)
M.1706del17 (c.1574_1590del)
M.1677delTA (c.1545_1546delTA)
M.G542X (c.1624G>T)
M.1717-1G>A (c.1585-1G>A)
M.R553X (c.1657C>T)
M.Q552X (c.1654C>T)
M.G551D (c.1652G>A)
M.S549RA>C (c.1645A>C)
M.2183AA>G (c.2051_2052delAAinsG)
M.N1303K (c.3909C>G)
M.4016insT (c.3889dupT)
M.3849+10kb C>T (c.3718-2477C>T)
M.G85E (c.254G>A)
M.711+5G>A (c.579+5G>A)
M.711+1G>T (c.579+1G>T)
M.2789+5G>A (c.2657+5G>A)
M.W1282X (c.3846G>A)
M.G1244E (c.3731G>A)
W.F508del=I507del=F508C (1M=2M=3M)
W.I502T (c.1505T>C)
W.1706del17 (c.1574_1590del)
W.1677delTA (c.1545_1546delTA)
W.G542X (c.1624G>T)
W.1717-1G>A (c.1585-1G>A)
W.R553X=Q552X=G551D (9M=10M=11M)
W.S549RA>C) (c.1645A>C)
W.2183AA>G (c.2051_2052delAAinsG)
W.N1303K (c.3909C>G)
W.4016insT (3889dupT)
W.3849+10kbC>T (c.3718-2477C>T)
W.G85E (c.254G>A)
W.711+5G>A=711+1G>T (18M=19M)
W.2789+5G>A (c.2657+5G>A)
W.W1282X (c.3846G>A)
W.G1244E (c.3731G>A)
Cod. AC023/25 Fibrosi Cistica
Linea di riferimento azzurra
1M=2M=3M=
(c.1521_1523del)=(c.1519_1521del)=(c.1523T>G)
9M=10M=11M=
(c.1657C>T)=(c.1654C>T)=(c.1652G>A)
18M=19M=
(c.579+5G>A)=(c.579+1G>T)
Strip 2 CF 16 Mutazioni+Tn
Linea di riferimento rossa
Controllo Rivelazione
M.621+1G>T (c.489+1G>T)
M.R117H (c.350G>A)
M.852del22 (c.720_741del)
M.T338I (c.1013C>T)
M.R347P (c.1040G>C)
M.1259insA (c.1130dupA)
M.R1066H (c.3197G>A)
M.L1065P (c.3194T>C)
M.L1077P (c.3230T>C)
M.D1152H (c.3454G>C)
M.4382delA (c.4251delA)
M.R1162X (c.3484C>T)
M.R1158X (c.3472C>T)
M.S912X (c.2735C>A)
M.I148T (c.443T>C)
M.3199del6 (c.3067_3072del)
W.621+1G>T (c.489+1G>T)
W.R117H (c.350G>A)
W.852del22 (c.720_741del)
W.T338I (c.1013C>T)
W.R347P (c.1040G>C)
W.1259insA (c.1130dupA)
W.R1066H=L1065P (7M=8M)
W.L1077P (c.3230T>C)
W.D1152H (c.3454G>C)
W.4382delA (c.4251delA)
W.R1162X (c.3484C>T)
W.R1158X (c.3472C>T)
W.S912X (c.2735C>A)
W.I148T (c.443T>C)
W.3199del6 (c.3067_3072del)
5T (c.1210-12T[5])
7T (c.1210-12T[7])
9T (c.1210-12T[9])
Linea di riferimento azzurra
7M=8M=
(c.3197G>A)=(c.3194T>C)
Cod. AC089 CF PLUS
Strip 22 Mutazioni
Linea di riferimento azzurra
Controllo Rivelazione
M.D110H (c.328G>C)
M.H139R (c.416A>G)
M.G178R (c.532G>A)
M.991del5 (c.859_863del)
M.R334W (c.1000C>T)
M.R347H (c.1040G>A)
M.R352Q (c.1055G>A)
M.1717-8G>A (c.1585-8G>A)
M.D579G (c.1736A>G)
M.1874insT (c.1739_1740insT)
M.E585X (c.1753G>T)
M.1898+1G>A (c.1766+1G>A)
M.1898+3A>G (c.1766+3A>G)
M.1898+5G>T (c.1766+5G>T)
M.2184insA (c.2052_2053insA)
M.2522insC (c.2390_2391insC)
M.3120+1G>A (c.2988+1G>A)
M.R1066C (c.3196C>T)
M.3272-26A>G (c.3140-26A>G)
M.3659delC (c.3528delC)
M.4015delA (c.3883delA)
M.G1349D (c.4046G>A)
W.D110H (c.328G>C)
W.H139R (c.416A>G)
W.G178R (c.532G>A)
W.991del5 (c.859_863del)
W.R334W (c.1000C>T)
W.R347H (c.1040G>A)
W.R352Q (c.1055G>A)
W.1717-8G>A (c.1585-8G>A)
W.D579G=1874insT (9M=10M)
W.E585X (c.1753G>T)
W.1898+1G>A=1898+3A>G=1898+5G>T
(12M=13M=14M)
W.2184insA (c.2052_2053insA)
W.2522insC (c.2390_2391insC)
W.3120+1G>A (c.2988+1G>A)
W.R1066C (c.3196C>T)
W.3272-26A>G (c.3140-26A>G)
W.3659delC (c.3528delC)
W.4015delA(c.3883delA)
W.G1349D(c.4046G>A)
Linea di riferimento blu
9M=10M=
c.1736A>G=c.1739_1740insT
12M=13M=14M
1766+1G>A=1766+3A>G=1766+5G>T
Sicilia
79,46%
80,04%*