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32 Modifiche al codice Cap. 4massimocorrenteminimoFigura 4.4: Metodo di ricerca binaria del raggio di smussamento delle particelle dimateria barionica
Sez. 4.5 Metodi di scrittura dei file 33• oppure quando la differenza tra i due raggi è sufficientemente piccola da risultareinutile un maggior approfondimento (nel nostro codice tale dimensione è1/100.000 del raggio).Si è visto nelle simulazioni svolte che il numero di iterazioni per trovare un raggiocontenente 40±2 particelle sono necessari sempre meno di 10 iterazioni.In secondo luogo è necessario esportare tali particelle ed effettuare i calcoli inremoto. Ciò viene fatto come spiegato precedentemente nella Sez. 4.2 a pag. 27.Una sola differenza è stata necessaria per quanto riguarda il calcolo della pressione inquanto la particella in esame non deve essere considerata come negli altri calcoli ma,mentre per gli altri tale eliminazione avviene in modo implicito a causa del fatto chela posizione coincide, deve essere fatta in modo esplicito implementando un modo perriconoscere quando si sta considerando la particella in esame ed eliminarla.4.5 Metodi di scrittura dei fileInnanzitutto vi è il problema della dimensione di tali file in quanto il parallelismopermette di gestire una quantità maggiore di informazioni che quindi possono superarela capacità di un singolo file. Per tale motivo viene data la possibilità all’utente didecidere in quante parti un file debba essere diviso (NumberOfFiles, si veda 4.7 a pag.39 per maggiori dettagli). Questo permette anche una parallelizzazione nella scritturain quanto su file diversi è possibile una scrittura simultanea per quanto riguarda ilprogramma, ovviamente demandando il problema al sistema operativo.Esistono poi due tipi di file scritti dal programma:• file di restart che contiene tutti i dati relativi alla simulazione in corso e permetteil riavvio in caso di problemi• snapshot che contiene un sottoinsieme dei dati della simulazione necessari perle elaborazioni a posteriori e in grado anch’esso di permettere il riavvio di unasimulazione.Dato che, come si è già detto nella Sez. 3.3.2 a pag. 24, si è dovuto procedere in mododiverso nella gestione dei due tipi dati i diversi vincoli che su essi erano presenti diseguito si analizzano le metodologie impiegate nella scrittura e rilettura di tali file.4.5.1 File di restartPer questi file è stato deciso di far scrivere ad ogni processore la sezione di suacompetenza. Ciò principalmente per due motivi:1. la quantità di dati scritta è notevole in quanto tutte le informazioni contenute inmemoria sulle particelle vanno scritte,
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