Evolucao Molecular.pdf - Instituto de Biologia da UFRJ
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Parâmetros do alinhamento par a<br />
par<br />
• KTUP – Tamanho <strong>da</strong> palavra procura<strong>da</strong><br />
• Window – Tamanho <strong>da</strong> janela (para fora <strong>da</strong> diagonal<br />
procura<strong>da</strong>)<br />
• SCORE – Score mínimo para ser levado em consi<strong>de</strong>ração<br />
• TOPDIAG – Número <strong>de</strong> gran<strong>de</strong>s diagonais<br />
• PAIRGAP – Penali<strong>da</strong><strong>de</strong> <strong>de</strong> intervalo<br />
(mu<strong>de</strong> as opções apenas para tornar alinhamento mais rápido)
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