kazalo vsebine
kazalo vsebine
kazalo vsebine
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Univerza v Ljubljani<br />
Medicinska fakulteta<br />
Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo<br />
Katedra za mikrobiologijo in imunologijo<br />
PRAKTIKUM<br />
IZ MIKROBIOLOGIJE<br />
IN IMUNOLOGIJE<br />
ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
Ljubljana, 2011
Univerza v Ljubljani<br />
Medicinska fakulteta<br />
Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo<br />
Katedra za mikrobiologijo in imunologijo<br />
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
Glavni urednik prof. dr. Vladimir Kotnik, dr. med.<br />
Področni uredniki<br />
Bakteriologija: asist. mag. Veronika Križan Hergouth, dr. med., doc. dr. Tadeja Matos, dr. med., prof. dr. Manica Mueller<br />
Premru, dr. med., prof. dr. Katja Seme, dr. med.<br />
Imunologija: prof. dr. Alojz Ihan, dr. med.<br />
Mikologija: doc. dr. Tadeja Matos, dr. med.<br />
Parazitologija: prof. dr. Jernej Logar, univ. dipl. biol., asist. dr. Barbara Šoba, univ. dipl. mikr., asist. Miha Skvarč, dr. med.<br />
Virologija: doc. dr. Miroslav Petrovec, dr. med.<br />
Avtorji<br />
prof. dr. Vladimir Kotnik, dr. med., doc. dr. Tadeja Matos, dr. med., asist. mag. Veronika Križan Hergouth, dr. med.,<br />
doc. dr. Miroslav Petrovec, dr. med., prof. dr. Manica Mueller Premru, dr. med., prof. dr. Katja Seme, dr. med.,<br />
prof. dr. Eva Ružić Sabljić, dr. med., prof. dr. Jernej Logar, univ. dipl. biol., prof. dr. Alojz Ihan, dr. med.,<br />
doc. dr. Darja Keše, univ. dipl. biol., asist. znan. sod., strok. svet. dr. Saša Simčič, univ. dipl. kem.,<br />
asist. dr. Andreja Nataša Kopitar, univ. dipl. biol., asist. Miha Skvarč, dr. med., asist. dr. Barbara Šoba, univ. dipl. mikr.,<br />
prof. dr. Tatjana Avšič Županc, univ. dipl. biol., asist. strok. svet. dr. Mateja Poljšak Prijatelj, univ. dipl. biol.,<br />
viš. strok. sod. Vesna Golob, univ. dipl. biol., Polona Maver, dr. med., Mateja Jelen, univ. dipl. mikr., asist. Monika Jevšnik,<br />
univ. dipl. mikr., dr. Sanja Stopinšek, univ. dipl. biol., asist. strok. svet. Alenka Andlovic, dr. med., dr. Manca Žolnir Dovč,<br />
univ. dipl. biol., asist. strok. sod. Nataša Švent Kučina, dr. med., asist. Samo Jeverica, dr. med., viš. znan. sod. dr. Branka<br />
Wraber, univ. dipl. biol.<br />
Slike<br />
Veronika Strašek, prof. dr. Eva Ružić Sabljić, dr. med., asist. Mateja Pirš, dr. med., Vladimir Drnovšek<br />
Recenzenti<br />
prof. dr. Marija Gubina, dr. med., prof. dr. Jožica Marin, univ. dipl. biol., prof. dr. Srečko Koren, dr. med.<br />
Lektorica<br />
Katarina Marin Hribar, prof.<br />
Tehnično uredila<br />
Mihaela Oberdank Hrastar<br />
Tehnični sodelavki<br />
Barbara Trtnik, Mrjetka Zupin<br />
Založila<br />
Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo, Katedra za mikrobiologijo in imunologijo<br />
Tisk<br />
Itagraf d. o. o.<br />
Računalniško oblikovanje<br />
Boex DTP d. o. o.<br />
CIP - Kataložni zapis o publikaciji<br />
Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana<br />
579(075.8)(076.5)<br />
616-097(075.8)(076.5)<br />
PRAKTIKUM iz mikrobiologije in imunologije za študente<br />
medicine / [avtorji Vladimir Kotnik ... [et al.] ; glavni urednik<br />
Vladimir Kotnik ; slike Veronika Strašek ... et al.]. - Ljubljana :<br />
Medicinska fakulteta, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo,<br />
Katedra za mikrobiologijo in imunologijo, 2011<br />
ISBN 978-961-91159-4-7<br />
1. Kotnik, Vladimir<br />
258504448<br />
Copyright© Katedra za mikrobiologijo in imunologijo 2011<br />
Vse pravica pridržane. Razmnoževanje ali razširjanje delov ali celote te publikacije s katerim koli sredstvom brez pisnega dovoljenja založnika<br />
je prepovedano.
KAZALO VSEBINE<br />
KAZALO VSEBINE<br />
SEZNAM KRATIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13<br />
UVOD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19<br />
POGLAVJE 1<br />
Pravilno in varno delo v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21<br />
Mikrobiološki laboratorij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23<br />
Pravila o varnem delu v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23<br />
Varnostni ukrepi pri delu v laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23<br />
Nezgode v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24<br />
Higiensko umivanje in razkuževanje rok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25<br />
Asepsa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26<br />
Sterilizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26<br />
Nadzor učinkovitosti sterilizacijskih postopkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27<br />
Razkuževanje ali dezinfekcija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28<br />
POGLAVJE 2<br />
Bakteriologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31<br />
1. VAJA: KOKI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33<br />
Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33<br />
Moraxella catarrhalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39<br />
Neisseria gonorrhoeae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43<br />
Neisseria meningitidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47<br />
Staphylococcus aureus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52<br />
Staphylococcus epidermidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58<br />
Streptococcus pyogenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62<br />
Streptococcus pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68<br />
Streptococcus agalactiae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73<br />
2. VAJA: BACILI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77<br />
Bacteroides fragilis in drugi po Gramu negativni anaerobni bacili . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77<br />
Bordetella pertussis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84<br />
Clostridium perfringens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89<br />
Escherichia coli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97<br />
Haemophilus influenzae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103<br />
Klebsiella pnemoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108<br />
Listeria monocytogenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114<br />
Pseudomonas aeruginosa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120<br />
Salmonella Enteritidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125<br />
3. VAJA: DRUGE BAKTERIJE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130<br />
Borrelia burgdorferi sensu lato . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130<br />
Campylobacter spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138<br />
Chlamydia trachomatis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143<br />
Helicobacter pylori . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147<br />
3
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
Legionella spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151<br />
Mycobacterium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157<br />
Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 162<br />
Treponema pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167<br />
Vibrio cholerae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172<br />
POGLAVJE 3<br />
Mikologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177<br />
4. VAJA: GLIVE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179<br />
Aspergillus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180<br />
Candida spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 187<br />
Cryptococcus neoformans . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 195<br />
Dermatofiti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202<br />
POGLAVJE 4<br />
Parazitologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209<br />
5. VAJA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211<br />
Črevesni praživali Giardia intestinalis in Cryptosporidium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211<br />
Pražival Trichomonas vaginalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 216<br />
Pražival Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 219<br />
Krvna, tkivna pražival Plasmodium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 223<br />
Črevesna glista Enterobius vermicularis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 226<br />
Trakulja Taenia solium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229<br />
Trakulja Echinococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 232<br />
Uši Pediculus humanus spp., Phthirus pubis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237<br />
POGLAVJE 5<br />
Virologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 241<br />
Uvod v virološko diagnostiko . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243<br />
Odvzem in transport vzorcev v virološki laboratorij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243<br />
Pregled diagnostičnih tehnik v virologiji . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 244<br />
Encimsko-imunska metoda . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245<br />
Metoda neposredne imunofluorescence (DIF) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245<br />
Dokazovanje virusnih antigenov s hitrimi testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246<br />
Imunohistokemične metode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246<br />
Aglutinacija z lateksom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246<br />
Osamitev virusov v celični kulturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246<br />
Sistemi za osamitev virusa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247<br />
Primarne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247<br />
Diploidne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247<br />
Trajne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247<br />
Postopek osamitve in identifikacije virusnega izolata . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248<br />
Elektronska mikroskopija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248<br />
6.1 VAJA: NEPOSREDNO DOKAZOVANJE VIRUSOV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250<br />
Metoda elektronske mikroskopije: povzročitelji virusnih gastroenteritisov –<br />
rotavirusi, adenovirusi, astrovirusi in kalicivirusi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250<br />
4
KAZALO VSEBINE<br />
Metoda neposredne imunofluorescence (DIF) – dokazovanje virusnih okužb dihal –<br />
respiratorni sincicijski virus – RSV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254<br />
Izvedba hitrega testa za dokaz antigenov RSV neposredno v kužnini . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257<br />
6.2 VAJA: SEROLOŠKO DOKAZOVANJE VIRUSNIH OKUŽB . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258<br />
Metode za dokazovanje specifičnih protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258<br />
Metoda posredne imunofluorescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258<br />
Encimsko-imunska metoda (ELISA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 259<br />
Metoda imunoblot (westernblot) ali imunsko pivnanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 259<br />
Nevtralizacijski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260<br />
Reakcija vezave komplementa (RVK) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260<br />
Inhibicija hemaglutinacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260<br />
Dokazovanje okužbe s hantavirusi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 261<br />
Dokazovanje okužb z virusom Epstein Barr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 263<br />
Test monospot − izvedba in materiali . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265<br />
Dokazovanje okužbe s HIV-1 s potrditvenim testom westernblot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267<br />
6.3 VAJA: MOLEKULARNA DIAGNOSTIKA VIRUSOV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271<br />
Metode dokazovanja nukleinskih kislin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271<br />
Dokazovanje virusnih nukleinskih kislin brez predhodnega pomnoževanja . . . . . . . . . . . . . . 271<br />
Osamitev nukleinskih kislin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271<br />
Verižna reakcija s polimerazo (PCR) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 272<br />
Posredne hibridizacijske metode − reverzna hibridizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273<br />
Testiranje občutljivosti na protivirusna zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273<br />
Določanje genotipa virusa hepatitisa C (HCV) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 274<br />
Kvantitativno določanje virusnega bremena pri okužbi s HIV-1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278<br />
Genotipsko določanje odpornosti citomegalovirusa (CMV) na zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . 280<br />
POGLAVJE 6<br />
Imunologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283<br />
7. VAJA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285<br />
Imunski sistem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285<br />
Celične vrste in podvrste, ki so pomembne za imunski odziv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285<br />
Fagocitne celice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285<br />
Limfociti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286<br />
Kako imunski sistem odstranjuje tuje molekule iz organizma? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286<br />
Antigeni CD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287<br />
Protitelesa CD, ki jih uporabljamo za opredelitev limfocitov T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287<br />
Celice T pomagalke in aids . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287<br />
Ugotavljanje limfocitnih populacij z imunofluorescenčno tehniko . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288<br />
Analiza imunskih celic s pretočnim citometrom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288<br />
Uporaba pretočne citometrije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 289<br />
Analiza protitelesnega odziva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291<br />
Precipitacijske tehnike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292<br />
Mikroprecipitacija v kapilari (semikvantitativna metoda – MPK) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292<br />
Radialna imunodifuzija (RID – kvantitativna tehnika) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293<br />
Antistreptolizinski test (nevtralizacija hemolize s protitelesi) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294<br />
Aglutinacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 296<br />
5
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
Encimsko-imunski testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 296<br />
Indirektna tehnika z označenimi protitelesi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297<br />
Indirektna tehnika z označenim antigenom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297<br />
Določevanje protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297<br />
Merjenje pokazateljev vnetja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298<br />
Merjenje aktiviranosti komplementnega sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298<br />
Reakcija lize (uničevanja celic) s komplementom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298<br />
Aktivacija komplementnega sistema po alternativni poti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 300<br />
Določevanje koncentracije odlomka C3d/dg z metodo RIEF (raketna imunoelektroforeza) . . . . 301<br />
Diagnostični primer A: na kromosom X vezana agamaglobulinemija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 302<br />
Diagnostični primer B: kronična granulomatozna bolezen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303<br />
Diagnostični primer C: kronična limfocitna levkemija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304<br />
Diagnostični primer D: aids . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 305<br />
Opis metod za tehnično izvedbo nalog A, B, C in D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 306<br />
Analiza diferencialne krvne slike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 306<br />
Določitev titra protiteles proti tetanusnemu in davičnemu toksinu z MPK . . . . . . . . . . . . . . . 307<br />
Določanje C-reaktivnega proteina v serumu z aglutinacijo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 307<br />
Limfocitne vrste in podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 307<br />
Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov v testu fagocitoze<br />
s FITC obarvanih E. coli in v testu oksidacije barvila dihidrorodamin 123 . . . . . . . . . . . . . . . 312<br />
Določanje serumskih protiteles razredov IgM, IgA, IgG s testom ELISA . . . . . . . . . . . . . . . . . 314<br />
Razprava A: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 316<br />
Razprava B: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 316<br />
Razprava C: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 317<br />
Razprava D: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 317<br />
POGLAVJE 7<br />
Laboratorijske tehnike in materiali . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 319<br />
Osnovni aparati in drugi pripomočki za delo v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321<br />
Mikroskop: svetlobni, s temnim poljem, fluorescenčni . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />
Navodila za mikroskopiranje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324<br />
Odvzem in prenos kužnin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 325<br />
Načini odvzema kužnine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 325<br />
Prenos kužnin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326<br />
Laboratorijske tehnike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326<br />
Neposredni razmaz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326<br />
Izdelava razmaza iz hemokulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327<br />
Izdelava razmaza sputuma za barvanje po Gramu in vrednotenje mikroskopskega preparata . . 327<br />
Izdelava neposrednega mikroskopskega preparata iz likvorja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327<br />
Izdelava razmazov in barvanje bakterij iz čiste kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327<br />
Tehnike barvanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328<br />
Tehnika barvanja po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328<br />
Tehnika barvanja z metilenskim modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329<br />
Tehnika barvanja po Ziehl-Neelsenu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329<br />
Tehnika barvanja po Giemsi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 330<br />
Tehnika barvanja debele kaplje krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 331<br />
Tehnika barvanja spor po Schaeffer-Fultonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 331<br />
Bakteriološka gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332<br />
Vrste gojišč . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332<br />
6
KAZALO VSEBINE<br />
Osnovna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332<br />
Obogatena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333<br />
Tioglikolatni bujon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333<br />
Krvni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />
Čokoladni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />
Agar po Schaedlerju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />
Bogatitvena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />
Diferencialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />
Agar po Drigalskem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />
CLED (Cystine, Lactose, Electrolyte Deficient agar) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />
Selektivna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />
Agar XLD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />
CNA Columbia agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />
MacC (MacConkey agar) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />
Specialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />
Agar BG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />
Karmali agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />
Agar CYA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />
Kromogena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />
MRSA kromogeno gojišče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />
Zasejavanje kužnin na gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />
Postopek zasejavanja iztrebka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />
Postopek zasejavanja sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />
Hemokultura . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />
Postopek zasejavanja urina s kvantitativno metodo in določitev koncentracije<br />
mikroorganizmov v urinu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />
Osamitev bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />
Prepoznava (identifikacija) bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />
Izdelava čiste kulture iz mešane kulture bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />
Postopki za identifikacijo bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />
Prepoznava bakterij po fizioloških in biokemičnih lastnostih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />
Biokemična identifikacija po Gramu pozitivnih in negativnih kokov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />
Dokaz katalaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342<br />
Dokaz oksidaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342<br />
Navzočnost vezane koagulaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />
Navzočnost proste koagulaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />
Deoksiribonukleaza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />
Navzočnost hemolize beta ali alfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />
Bacitracinski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />
Optohinski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />
Satelitni fenomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />
Test PYR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />
Test razgradnje arabinoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />
Fermentacija sladkorjev glukoze in maltoze (Hissovi sladkorji) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />
Test CAMP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 346<br />
Biokemična identifikacija po Gramu negativnih bacilov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 346<br />
Biokemična vrsta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />
Test za dokaz razgradnje glukoze, laktoze ali obeh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />
Test za dokaz nastanka indola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />
7
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
Test za dokaz razgradnje glukoze − metil rdeče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />
Test za dokaz razgradnje glukoze do acetoina − Voges-Proskauer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />
Test za dokaz zmožnosti razgradnje citrata – citrat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />
Test za dokaz navzočnosti ureaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />
Dokaz gibljivosti bakterij − gojišče po Winkleju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350<br />
Komercialni testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350<br />
Odčitavanje API 20 E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350<br />
Vrednotenje API NH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 351<br />
Ugotavljanje antigenske zgradbe bakterijskega seva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352<br />
Serološke metode za dokazovanje bakterijskih okužb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352<br />
Določanje občutljivosti bakterij za antibiotike − antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352<br />
Difuzijski antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 353<br />
Izdelava difuzijskega antibiograma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354<br />
Minimalna inhibitorna koncentracija, določena z metodo difuzijskega<br />
gradienta – E-test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354<br />
Odčitavanje E-testov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355<br />
Dilucijski antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355<br />
Določanje MIK in MBK z dilucijsko metodo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355<br />
Določitev laktamaz beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 356<br />
Spremni list za mikrobiološke preiskave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 357<br />
Izbor preparatov medicinsko pomembnih mikrobov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 359<br />
Izbor preparatov medicinsko pomembnih parazitov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 360<br />
Slika 1. Postopek pri prelitju mikrobne kulture, kužnine ali krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24<br />
Slika 2. Postaja za izpiranje oči . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24<br />
Slika 3. Postopek izpiranja oči . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24<br />
Slika 4. Pravilno umivanje in razkuževanje rok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25<br />
Slika 5. N. gonorrhoeae v brisu uretre, barvano z metilenskim modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43<br />
Slika 6. A: N. gonorrhoeae na krvnem agarju. B: N. gonorrhoeae – fermentacija sladkorjev . . . . . . . . . 44<br />
Slika 7. Potek testa za določitev povzročitelja angine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65<br />
Slika 8. Odčitavanje rezultatov testa STREP A. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65<br />
Slika 9. A: Mikroskopska slika B. fragilis; B: Kultura B. fragilis z diskom metronidazola . . . . . . . . . . . 78<br />
Slika 10. Mikroskopska slika mešane okužbe − vzorec iz abscesa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78<br />
Slika 11. Bolniku med operacijo aseptično odvzamejo gnoj iz abscesa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80<br />
Slika 12. Tipična mikroskopska slika C. perfringens. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89<br />
Slika 13. Rast na KA; toplo-hladna hemoliza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89<br />
Slika 14. Tipična mikroskopska slika C. tetani . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90<br />
Slika 15. Tipična mikroskopska slika C. botulinum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90<br />
Slika 16. Plinska gangrena . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92<br />
Slika 17. Hitri test za dokaz enterotoksina pri C. difficile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95<br />
Slika 18. Izvedba urikulta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101<br />
Slika 19. Odčitavanje pozitivnega rezultata urikulta s shemo za oceno števila bakterijskih kolonij . . . . 101<br />
Slika 20. API 20E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109<br />
Slika 21. Test API Listeria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115<br />
Slika 22. API 20NE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121<br />
Slika 23. Restrikcijski vzorci referenčnih borelijskih vrst . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133<br />
Slika 24. Trak z nanesenimi borelijskimi antigeni: pozitivna kontrola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135<br />
Slika 25. B. burgdorferi sensu lato v mikroskopu s temnim poljem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135<br />
Slika 26. Elektroforeza pridelka PCR v agaroznem gelu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136<br />
8
KAZALO VSEBINE<br />
Slika 27. Celična kultura z značilnimi klamidijskimi vključki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144<br />
Slika 28. Priprava vzorca za določitev antigenov bakterije H. pylori v iztrebku . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149<br />
Slika 29. Prikaz pozitivnega, negativnega in neveljavnega rezultata v testu za dokaz<br />
antigena H. pylori . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150<br />
Slika 30. Posredna imunofluorescena: Legionella pneumophila – pozitiven rezultat . . . . . . . . . . . . . . 152<br />
Slika 31. Fotografija značilnih kolonij M. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163<br />
Slika 32. Diagnostično pomembne strukture posameznih glivnih rodov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179<br />
Slika 33. Teden dni stare kolonije A. fumigatus, A. flavus, A. niger na SABA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180<br />
Slika 34. A: Aspergillus spp. – konidiofore, vezikule, fialide, konidiji. B: A. fumigatus,<br />
obarvan z modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180<br />
Slika 35. A: C. albicans, pseudomicelij z značilnimi terminalnimi klamidosporami na<br />
koruznem agarju. B: C. albicans na kromogenem gojišču, obarvana zeleno . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 187<br />
Slika 36. C. albicans, kužnina, barvanje po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188<br />
Slika 37. A: M. canis, makrokonidiji, obarvani z modrilom; B: T. mentagrophytes,<br />
spiralne hife, obarvane z modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202<br />
Slika 38. M. canis, teden dni stara kolonija na dermatofitnem gojišču . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203<br />
Slika 39. Shema obravnave vzorca blata, poslanega na ugotavljanje okužbe s črevesnimi paraziti . . . 212<br />
Slika 40. Inokulacija kužnine v gojišču »InPouch« . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 217<br />
Slika 41. Shema obravnave vzorca seruma, poslanega za ugotovitev okužbe s parazitom<br />
Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 220<br />
Slika 42. Razporeditev vzorcev za izvedbo indirektnega hemaglutinacijskega testa za<br />
kvantitativno določanje protiteles proti Echinococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 234<br />
Slika 43. Test westernblot za dokazovanje protiteles proti ehinokoknim antigenom . . . . . . . . . . . . . . 235<br />
Slika 44. Primer pozitivnega in negativnega rezultata pri metodi neposredne imunfluorescence . . . 257<br />
Slika 45. Izvedba hitrega testa za dokaz antigenov RSV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257<br />
Slika 46. Dinamika nastajanja specifičnih protiteles pri okužbi z EBV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265<br />
Slika 47. Pozitivni in negativni rezultati testa monospot za dokaz okužbe z EBV . . . . . . . . . . . . . . . . 265<br />
Slika 48. Princip reverzne hibridizacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273<br />
Slika 49. Shematski prikaz genotipizacije HCV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 276<br />
Slika 50. Določanje odpornosti CMV za protivirusna zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 282<br />
Slika 51. Neposredna in posredna imunofluorescenčna tehnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288<br />
Slika 52. Prikaz rezultatov pretočne citometrije v obliki točkovnih diagramov . . . . . . . . . . . . . . . . . . 290<br />
Slika 53. Shematični prikaz mikroprecipitacije v kapilari . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293<br />
Slika 54. Shema nanašanja antigenov v testu RID za določanje koncentracije sestavine C3c<br />
komplementnega sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293<br />
Slika 55. Točkast graf za analizo rezultatov C3c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294<br />
Slika 56. Izvedba antistreptolizinskega testa (AST) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 295<br />
Slika 57. Aglutinacija s kardiolipinom označenih lateksnih delcev v testu RPR<br />
za določanje protiteles pri okužbi z bakterijo Treponema pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 296<br />
Slika 58. Encimsko-imunski preskus – direktna tehnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297<br />
Slika 59. ELISA – določevanje protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298<br />
Slika 60. Izvedba testa za ugotavljanje sestavin, ki so potrebne za aktivacijo komplementnega sistema . . . 299<br />
Slika 61. Shema za izvedbo testa za ugotavljanje dejavnosti komplementnega sistema<br />
po alternativni poti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 300<br />
Slika 62. Slika gela s precipitati C3d/dg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301<br />
Slika 63. Preiskovanec A: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 309<br />
Slika 64. Preiskovanec B: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 309<br />
Slika 65. Preiskovanec C: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 310<br />
Slika 66. Preiskovanec D: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 311<br />
9
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
Slika 67. Preiskovanec A: fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov<br />
v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 312<br />
Slika 68. Preiskovanec B: fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov<br />
v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 313<br />
Slika 69. Preiskovanec C: Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov<br />
v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 313<br />
Slika 70. Preiskovanec D: Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov<br />
v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314<br />
Slika 71. Shema pipetiranja na mikrotitrsko ploščo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 315<br />
Slika 72. Avtoklav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321<br />
Slika 73. Varnostna komora . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321<br />
Slika 74. Laboratorijski hladilnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321<br />
Slika 75. Bakteriološki inkubator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />
Slika 76. Suhi sterilizator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />
Slika 77. Laboratorijska centrifuga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />
Slika 78. Bunsenov gorilnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />
Slika 79. Bakteriološke zanke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />
Slika 80. Posoda za varno odlaganje kužnih odpadkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />
Slika 81. Deli svetlobnega mikroskopa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 323<br />
Slika 82. Kaj zmanjšuje učinkovitost razločevanja opazovanih predmetov v svetlobnem mikroskopu? . . 324<br />
Slika 83. Mikroskopiranje z imerzijo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324<br />
Slika 84. Bris žrela . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 325<br />
Slika 85. Odvzem brisa uretre pri moškem in brisa cerviksa pri ženski . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 325<br />
Slika 86. Odvzem srednjega curka urina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326<br />
Slika 87. Priprava mikroskopskega razmaza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327<br />
Slika 88. Barvanje po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328<br />
Slika 89. Oblika in razporeditev bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329<br />
Slika 90. Razporeditev bičkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329<br />
Slika 91. Priprava razmaza krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 330<br />
Slika 92. Barvanje spor po Schaeffer-Fultonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 331<br />
Slika 93. Navadni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333<br />
Slika 94. Tioglikolatni bujon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333<br />
Slika 95. Krvni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />
Slika 96. Čokoladni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />
Slika 97. Agar po Schaedlerju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />
Slika 98. Različna diferencialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />
Slika 99. Agar BG (Bordet Gengou) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />
Slika 100. Kromogeno gojišče za gojenje MRSA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />
Slika 101. Zasejavanje kužnine na gojišče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />
Slika 102. Redčenje vzorca na gojišču . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />
Slika 103. Priprava ustrezne razredčine urina za kvantitativno urinokulturo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />
Slika 104. Zasejavanje in štetje kolonij pri kvantitativni urinokulturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />
Slika 105. Priprava čiste kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />
Slika 106. Značilne oblike bakterijskih kolonij od zgoraj in v prerezu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />
Slika 107. Po Gramu pozitivne in po Gramu negativne bakterije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />
Slika 108. Značilna rast v bujonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />
Slika 109. Anaerobni lonec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />
Slika 110. Dokaz katalaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342<br />
Slika 111. Dokaz oksidaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />
10
KAZALO VSEBINE<br />
Slika 112. Dokaz koagulaze na predmetniku . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />
Slika 113. Dokaz koagulaze v epruveti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />
Slika 114. Hemoliza beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />
Slika 115. Hemoliza alfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />
Slika 116. Satelitni fenomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />
Slika 117. Test PYR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />
Slika 118. Hissovi sladkorji za dokaz bakterijske vrste Neisseria/Moraxella . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />
Slika 119. CAMP fenomen, ki je značilen za skupino B beta hemolitičnih streptokokov<br />
(S. agalactiae) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 346<br />
Slika 120. Fermentativna (enterobakterije) in oksidativna (nefermentativni po Gramu<br />
negativni bacili) razgradnja glukoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 347<br />
Slika 121. Značilne reakcije na dvojnem sladkorju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />
Slika 122. Gojišče za dokazovanje razgradnje triptofana do indola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />
Slika 123. Metil rdeče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />
Slika 124. Reakcija Voges-Proskauer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />
Slika 125. Gojišče za dokaz citrata kot edinega vira ogljika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />
Slika 126. Dokaz navzočnosti ureaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />
Slika 127. Gojišče za ugotavljanje gibljivosti bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350<br />
Slika 128. API 20E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 351<br />
Slika 129. Izdelava difuzijskega antibiograma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354<br />
Slika 130. Izdelava difuzijskega antibiograma z avtomatskim polagalcem diskov . . . . . . . . . . . . . . . . 354<br />
Slika 131. Določanje MIK z E-testom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355<br />
Slika 132. Določanje minimalne inhibitorne in minimalne baktericidne koncentracije antibiotika . . . 355<br />
Slika 133. Inaktivacija penicilina z laktamazo beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 356<br />
Slika 134. Obrazec spremnega lista . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 357<br />
Razpredelnica 1. Pregled sterilizacijskih postopkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27<br />
Razpredelnica 2. Priporočeni temperatura, čas delovanja in tlak pri sterilizaciji s toploto . . . . . . . . . . 27<br />
Razpredelnica 3. Nekatera razkužila in njihovo delovanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29<br />
Razpredelnica 4. Barvilne in biokemične značilnosti Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34<br />
Razpredelnica 5. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37<br />
Razpredelnica 6. Ugotavljanje občutljivosti za vankomicin in teikoplanin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37<br />
Razpredelnica 7. Barvilne in biokemične značilnosti M. catarrhalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39<br />
Razpredelnica 8. Diagnostična razpredelnica za ugotavljanje biokemičnih značilnosti M. catarrhalis . . 41<br />
Razpredelnica 9. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. aureus . . . . . . . 55<br />
Razpredelnica 10. Ugotavljanje občutljivosti za vankomicin in teikoplanin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56<br />
Razpredelnica 11. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. pyogenes . . . . 67<br />
Razpredelnica 12. Razpredelnica za oceno ustreznosti odvzetega sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70<br />
Razpredelnica 13. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije<br />
S. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71<br />
Razpredelnica 14. Ugotavljanje občutljivosti za penicilin in cepotaksin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72<br />
Razpredelnica 15. Razpredelnica za določitev MIK pri neznani anaerobni bakteriji . . . . . . . . . . . . . . . 82<br />
Razpredelnica 16. Kultivacijske in biokemične značilnosti klostridijev . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91<br />
Razpredelnica 17. Razpredelnica za vpis podatkov za interpretacijo urinokulture . . . . . . . . . . . . . . . . . 99<br />
Razpredelnica 18. Antibiotiki, ki so primerni za zdravljenje okužb, povzročenih z enterobakterijami . . 100<br />
Razpredelnica 19. Ocena kvalitete sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105<br />
Razpredelnica 20. Antibiotiki, primerni za zdravljenje okužb s H. influenzae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106<br />
Razpredelnica 21. Antibiotiki, primerni za zdravljenje okužb s K. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112<br />
Razpredelnica 22. Ugotavljanje navzočnosti laktamaze beta razširjenega spektra (ESBL) . . . . . . . . . 112<br />
11
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
Razpredelnica 23. Biokemični testi značilni za razlikovanje listerij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115<br />
Razpredelnica 24. Kultivacija likvorja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117<br />
Razpredelnica 25. Razpredelnica za identifikacijo listerij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117<br />
Razpredelnica 26. Razpredelnica za ugotavljanje kvalitete sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122<br />
Razpredelnica 27. Razpredelnica z antibiotiki, ki so primerni za zdravljenje okužb<br />
z nefermentativnimi bakterijami . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123<br />
Razpredelnica 28. Kauffmann-Whiteova razpredelnica antigenske zgradbe<br />
bakterij iz taksonomske vrste Salmonella enterica subsp. enterica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128<br />
Razpredelnica 29. Biokemična identifikacija kampilobaktrov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139<br />
Razpredelnica 30. Razpredelnica za vnos rezultatov testiranja Campylobacter spp. na<br />
odpornost za antibiotike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 141<br />
Razpredelnica 31. Koncentracije in količine reagentov, potrebnih za izvedbo testa<br />
PCR za dokaz Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 165<br />
Razpredelnica 32. Značilnosti netreponemskih in treponemskih testov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168<br />
Razpredelnica 33. Razpredelnica za ugotavljanje občutljivosti za antimikotik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 184<br />
Razpredelnica 34. Značilnosti različnih vrst kvasovk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 189<br />
Razpredelnica 35. Fiziološke značilnosti kvasovk, API 20C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 191<br />
Razpredelnica 36. Razpredelnica za ugotavljanje MIK za antimikotike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192<br />
Razpredelnica 37. Fiziološke značilnosti kvasovk, API 20C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 199<br />
Razpredelnica 38. Razpredelnica za ugotavljanje MIK za antimikotike flukonazol,<br />
vorikonazol, amfotericin in caspofungin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 200<br />
Razpredelnica 39. Razdelitev dermatofitov glede na naravno nahajališče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202<br />
Razpredelnica 40. Najpogostejši povzročitelji gastroenteritisov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250<br />
Razpredelnica 41. Danes znani tipi hantavirusov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 261<br />
Razpredelnica 42. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 1) . . . 266<br />
Razpredelnica 43. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 2) . . . 266<br />
Razpredelnica 44. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 3) . . . 267<br />
Razpredelnica 45. Virusne beljakovine, nanesene na nitrocelulozno membrano testa<br />
westernblot, za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268<br />
Razpredelnica 46. Interpretacija testa westernblot za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269<br />
Razpredelnica 47. Poročilo rezultatov potrditvenega testa westernblot za dokaz okužbe<br />
s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 270<br />
Razpredelnica 48. Poročilo rezultatov genotipizacije HCV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 277<br />
Razpredelnica 49. Najpomembnejše molekule (antigeni), ki jih odkrivamo za<br />
opredeljevanje limfocitnih populacij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288<br />
Razpredelnica 50. Normalne vrednosti limfocitnih populacij pri zdravih odraslih ljudeh . . . . . . . . . 290<br />
Razpredelnica 51. Spremembe aktivnosti in koncentracije posameznih sestavin<br />
komplementnega sistema pri nekaterih boleznih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301<br />
Razpredelnica 52. Predvidene normalne vrednosti za test ugotavljanja fagocitne<br />
in oksidativne zmožnosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 312<br />
Razpredelnica 53. Povečava, potrebna za opazovanje različnih mikrobov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324<br />
Razpredelnica 54. Shema za identifikacijo po Gramu pozitivnih in po Gramu negativnih kokov . . . . . 342<br />
Razpredelnica 55. Shema za identifikacijo po Gramu negativnih bacilov – enterobakterij . . . . . . . . . 346<br />
Razpredelnica 56. Različne enterobakterije razgrajujejo različne substrate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 347<br />
Razpredelnica 57. Interpretacija rezultatov testa API NH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352<br />
Razpredelnica 58. Antibiotiki, ki jih lahko testiramo pri po gramu pozitivnih<br />
in negativnih bakterijah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 353<br />
Razpredelnica 59. Nekatere bakterije in bolezni, ki jih le-te povzročajo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 358<br />
12
SEZNAM KRATIC<br />
Seznam kratic<br />
AHFITC (anti human FITC) – s FITC obarvana protitelesa proti človeškim imunoglobulinom<br />
aids (acquired immune deficiency syndrome) – sindrom pridobljene imunske pomanjkljivosti<br />
AP (Alternative Pathway) – alternativna pot aktivacije komplementnega sistema<br />
API (Analytical Profile Index Systems) – komercialni testi za dokazovanje bakterijskih povzročiteljev bolezni<br />
API 20E – diagnostični sistem za identifikacijo po Gramu negativnih enterobakterij<br />
API NH – diagnostični sistem za identifikacijo po Gramu negativnih enterobakterij<br />
ARS – akutni retrovirusni sindrom<br />
AST – antistreptolizinski test<br />
ATCC (American Type Culture Collection) – zbirka trajnih celičnih linij<br />
BAL – bronhoalveolarna lavaža<br />
BCYE (Buffered Charcoal Yeast Extract) – obogateno in selektivno gojišče za legionele<br />
bDNA (branched-chain) – razvejana DNA<br />
BG (Bordet Gengou) – agar za gojenje bakterije Bordetella pertussis<br />
BSA (Bovine Serum Albumin) – goveji serumski albumin<br />
CagA – citotoksični protein – encim, značilen za bakterijo Helicobacter pylori<br />
CAMP (Christie Atkins Munch-Peterson) – test za identifikacijo beta hemolitičnih steptokokov skupine B<br />
CAPD (Continous Ambulatory Peritoneal Dialysis) – peritonealna dializa<br />
CCD (Charge Coupled Device) – fotoelektrična kamera<br />
CD (Cluster of Differentiation) – monoklonska protitelesa proti antigenom na limfocitih, tudi antigeni<br />
na limfocitih<br />
CDC (Center for Disease Control) – center za nalezljive bolezni – najbolj znani iz Atlante v ZDA<br />
CDV – cidofovir<br />
NK – naravne celice ubijalke<br />
CFW – fluorescenčno barvilo (kalkofluor belo, angl. CalcouFluor White, CFW)<br />
CLED (Cystine, Lactose, Electrolyte Deficient agar) – agar za izvedbo kvantitativne urinokulture<br />
CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) – zbirka mednarodnih mikrobioloških standardov<br />
CMV – citomegalovirus<br />
CNA (Columbia agar) – selektivno gojišče, ki omogoča rast po Gramu pozitivnih bakterij<br />
CPU – citopatogeni učinek<br />
CRP – C-reaktivni protein<br />
CT – računalniška tomografija<br />
CTXФ – lizogeni bakteriofag<br />
CVK – centralni venski kateter<br />
CYA (Charcoal Yeast Agar) – agar, ki omogoča rast legionelam<br />
ČA – čokoladni agar<br />
13
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
DIF – direktni (neposredni) imunofluorescenčni test<br />
DKS – diferencialna krvna slika<br />
DNK – deoksiribonukleinska kislina<br />
dNTP – deoksiribonukleotid<br />
DOB – virus Dobrava<br />
DRIG – agar po Drigalskem<br />
EAEC – enteroagregativna E. coli<br />
EBV – virus Epstein Barr<br />
ECACC (European Collection (Agency) of Cell Cultures) – zbirka trajnih celičnih linij –<br />
podobno kot v ZDA ATCC<br />
EDTA (Ethylene Diamine Tetraacetic Acid) – antikoagulans – helator kalcijevih in magnezijevih ionov<br />
EGTA (Ethylene Glycol Tetraacetic Acid) – helator kalcijevih in magnezijevih ionov, vendar z mnogo<br />
večjo afiniteto do kalcijevih ionov kot EDTA<br />
EHEC – enterohemoragična E. coli<br />
EIA ali ELISA (Enzyme Immuno Assay ali Enzyme Linked Immunosorbent Assay) –<br />
encimsko imunski test<br />
EIEC – enteroinvazivna E. coli<br />
EIT – encimsko-imunski test<br />
EM – elektronska mikroskopija<br />
env – gen, ki kodira ovojnično virusno beljakovino<br />
EPEC – enteropatogena E. coli<br />
ESBL (Extended Spectrum Beta Lactamases) – enterobakterije z razširjenim spektrom laktamaz beta<br />
ETEC – enterotoksigena E. coli<br />
FALS (Forward Angle Light Scatter) – detektor v pretočnem citometru, ki meri svetlobo v smeri izvora<br />
FITC – FluoresceinIzoTioCianat<br />
FOS – foskarnet<br />
FSC (Forward SCatter) – ime za os v histogramu FSC-SSC na kateri so prikazani dogodki, ki jih<br />
zazna detektor FALS<br />
FTA – ABS (Fluorescent Treponemal Antibody – ABSorption) – imunofluorescenčni test za<br />
dokazovanje protiteles proti bakteriji Treponema pallidum<br />
gag – strukturna virusna beljakovina<br />
GAS-PAK – sistem za gojenje anaerobnih bakterij<br />
GCV – ganciklovir<br />
HAART (Highly Active Antiretroviral Therapy) – način medikamentoznega zdravljenja okužbe s HIV<br />
HBV – virus hepatitisa B<br />
HCV – virus hepatitisa C<br />
HIV – virus pridobljene imunske pomanjkljivosti<br />
HLA (Human Leukocyte Antigens) – antigeni poglavitnega sistema tkivne skladnosti pri človeku<br />
14
SEZNAM KRATIC<br />
HLAR (High-Level Aminoglycoside Resistance) – povečana odpornost proti aminoglikozidom<br />
HMRS – hemoragična mrzlica z renalnim sindromom<br />
HPS – hantavirusni pljučni sindrom<br />
HPV – humani papiloma virus<br />
I – (Indeterminate) – nedoločljivo<br />
IFT – imunofluorescenčni test<br />
IgA – imunoglobulin razreda A<br />
IgG – imunoglobulin razreda G<br />
IgM – imunoglobulin razreda M<br />
IHA – indirektni (posredni) hemaglutinacijski test<br />
IIF – indirektni (posredni) imunofluorescenčni test<br />
KA – krvni agar<br />
KIA (Kligler Iron Agar) – agar za gojenje enteričnih, po Gramu negativnih bakterij<br />
KLL – kronična limfocitna levkemija<br />
KNS – za koagulazo negativni stafilokoki<br />
KOPB – kronična obstruktivna pljučna bolezen<br />
KRA – koruzni agar<br />
LCR (Ligase Chain Reaction) – metoda pomnoževanja z verižno rekacijo z ligazo<br />
LGV – LimfoGranuloma Venerum – spolno prenosljiva bolezen<br />
LIA (Line Immuno Assay) – molekularni test za dokaz protiteles proti rekombinantnim antigenom<br />
npr. T. pallidum<br />
LOS – LipoOligoSaharid<br />
M (Membrane protein) – membranski protein, pomemben za razlikovanje streptokokov<br />
MAC (Membrane Attack Complex) – tudi terminalni kompleks ali C5b-9 – končna faza ubijanja celic<br />
s komplementom<br />
MacC (MacConkey agar) – selektivno in diferencialno gojišče, ki omogoča rast po Gramu<br />
negativnim bakterijam, zavira pa rast po Gramu pozitivnih bakterij<br />
MBK – minimalna baktericidna koncentracija<br />
MGB (Minor Groove Binder) – hibridizacijska sonda za označevanje na novo nastale DNK<br />
v reakciji PCR<br />
MH – gojišče Mueller – Hinton<br />
MIK – minimalna inhibitorna koncentracija<br />
MKP – modificirno Kelly – Pettenkoferjevo gojišče za gojenje borelij<br />
MOMP (Major Outer Membrane Protein) – poglavitna beljakovina zunanje ovojnice pri C. trachomatis<br />
MPK – mikroprecipitacije v kapilari<br />
MR – metil rdeče<br />
MRSA (Methicillin-Resistant S. aureus) – proti meticilinu odporen S. aureus<br />
NAD – nikotinamid adenin dinukleotid<br />
15
PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />
NASBA (Nucleic Acid Sequence Based Amplification) – metoda, primerna za odkrivanje okužbe<br />
s HIV – alternativa PCR<br />
NCAM (Neural Cell Adhesion Molecule) izoforma adhezijske molekule živčnih celic na naravnih<br />
celicah ubijalkah<br />
NS – (Non Susceptible) – ni občutljiv<br />
ORSAB – MRSA kromogeno gojišče<br />
PAF – protein akutne faze vnetja<br />
PBS – fosfatni pufer<br />
PCR – verižna reakcija s polimerazo<br />
PE (PhycoErythrin) – rdeče fluorescirajoče barvilo<br />
PFGE (Pulsed-Field Gel Electrophoresis) – metoda elektroforeze v utripajočem električnem polju<br />
pol – gen, ki kodira virusni encim<br />
PTLD – posttransplantacijska limfoproliferativna bolezen<br />
PUU – virus Puumala<br />
PYR (L-pirolidonil-beta-naftilamid) – test za dokaz enterokokov<br />
RALS (Right Angle Light Scatter) – detektor v pretočnem citometru, ki meri lomljeno svetlobo<br />
RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) – polimorfizem restrikcijskega odseka<br />
RIA (Radio Immuno Assay) – radioimunski preskus<br />
RID – radialna imunodifuzija<br />
RIEF – raketna imunoelektroforeza<br />
RNK – ribonukleinska kislina<br />
ROS (Reactive Oxidative Species) – reaktivne kisikove zvrsti, pomembne za oksidativni način<br />
ubijanja mikrobov v fagocitih<br />
RPR (Rapid Plasma Reagin) – test za odkrivanje antikardiolipinskih protiteles pri sifilisu<br />
RSV– respiratorni sincicijski virus<br />
RT-PCR – pomnoževanje nukleinskih kislin z verižno reakcijo s polimerazo v realnem času<br />
RVK – reakcija vezave komplementa<br />
S – (Susceptible) –občutljiv<br />
S-DD – (Susceptible – Dose Dependent) – občutljiv, odvisen od doze<br />
SCID (Severe Combined Immune Deficiency) – težka kombinirana imunska pomanjkljivost<br />
SDA (Strand Displacement Assay) – metoda pomnoževanja z verižno rekacijo<br />
SEO – virus Seoul<br />
SLE – sistemski lupus eritematosus<br />
SN – virus Sin Nombre<br />
SSC (Side SCatter) – ime za os v histogramu FSC-SSC, na kateri so prikazani dogodki, ki jih zazna<br />
detektor RALS<br />
STREP A – hitri test za dokaz antigena S. pyogenes<br />
TCBS – gojišče (Tiosulfat, Citrat, žolčne soli (Bile), Saharoza)<br />
16
SEZNAM KRATIC<br />
TCR – T-celični receptorji<br />
TEM – transmisijska elektronska mikroskopija<br />
tio – tioglikolatni bujon<br />
TMA – metoda pomnoževanja nukleinskih kislin – pomnoževanje s transkripcijo<br />
TMB – tetrametil benzidin<br />
TPHA – test pasivne hemaglutinacije za določitev protiteles proti bakteriji Treponema pallidum<br />
UZ – ultrazvok<br />
VacA – vakuolizirajoči toksin – encim, značilen za bakterijo Helicobacter pylori – povzroča nastanek<br />
vakuol v epitelijskih celicah želodca<br />
VDRL (Veneral Disease Research Laboratories) – kardiolipinski test za dokaz sifilisa, ekvivalenten<br />
testu RPR (Rapid Plasma Reagin)<br />
VP (Voges-Proskauer) – test za dokaz razgradnje glukoze do acetoina<br />
VRE (Vancomycin-Resistant Enterococcus) – enterokok, odporen za vankomicin<br />
VTM – virusni transportni medij<br />
WB – test westernblot<br />
XLD (Xylose, Lysin, Deoxycholate agar) – gojišče, ki omogoča rast salmonel, zavira rast po Gramu<br />
pozitivnih bakterij<br />
17