02.12.2014 Views

kazalo vsebine

kazalo vsebine

kazalo vsebine

SHOW MORE
SHOW LESS

Create successful ePaper yourself

Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.

Univerza v Ljubljani<br />

Medicinska fakulteta<br />

Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo<br />

Katedra za mikrobiologijo in imunologijo<br />

PRAKTIKUM<br />

IZ MIKROBIOLOGIJE<br />

IN IMUNOLOGIJE<br />

ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

Ljubljana, 2011


Univerza v Ljubljani<br />

Medicinska fakulteta<br />

Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo<br />

Katedra za mikrobiologijo in imunologijo<br />

PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

Glavni urednik prof. dr. Vladimir Kotnik, dr. med.<br />

Področni uredniki<br />

Bakteriologija: asist. mag. Veronika Križan Hergouth, dr. med., doc. dr. Tadeja Matos, dr. med., prof. dr. Manica Mueller<br />

Premru, dr. med., prof. dr. Katja Seme, dr. med.<br />

Imunologija: prof. dr. Alojz Ihan, dr. med.<br />

Mikologija: doc. dr. Tadeja Matos, dr. med.<br />

Parazitologija: prof. dr. Jernej Logar, univ. dipl. biol., asist. dr. Barbara Šoba, univ. dipl. mikr., asist. Miha Skvarč, dr. med.<br />

Virologija: doc. dr. Miroslav Petrovec, dr. med.<br />

Avtorji<br />

prof. dr. Vladimir Kotnik, dr. med., doc. dr. Tadeja Matos, dr. med., asist. mag. Veronika Križan Hergouth, dr. med.,<br />

doc. dr. Miroslav Petrovec, dr. med., prof. dr. Manica Mueller Premru, dr. med., prof. dr. Katja Seme, dr. med.,<br />

prof. dr. Eva Ružić Sabljić, dr. med., prof. dr. Jernej Logar, univ. dipl. biol., prof. dr. Alojz Ihan, dr. med.,<br />

doc. dr. Darja Keše, univ. dipl. biol., asist. znan. sod., strok. svet. dr. Saša Simčič, univ. dipl. kem.,<br />

asist. dr. Andreja Nataša Kopitar, univ. dipl. biol., asist. Miha Skvarč, dr. med., asist. dr. Barbara Šoba, univ. dipl. mikr.,<br />

prof. dr. Tatjana Avšič Županc, univ. dipl. biol., asist. strok. svet. dr. Mateja Poljšak Prijatelj, univ. dipl. biol.,<br />

viš. strok. sod. Vesna Golob, univ. dipl. biol., Polona Maver, dr. med., Mateja Jelen, univ. dipl. mikr., asist. Monika Jevšnik,<br />

univ. dipl. mikr., dr. Sanja Stopinšek, univ. dipl. biol., asist. strok. svet. Alenka Andlovic, dr. med., dr. Manca Žolnir Dovč,<br />

univ. dipl. biol., asist. strok. sod. Nataša Švent Kučina, dr. med., asist. Samo Jeverica, dr. med., viš. znan. sod. dr. Branka<br />

Wraber, univ. dipl. biol.<br />

Slike<br />

Veronika Strašek, prof. dr. Eva Ružić Sabljić, dr. med., asist. Mateja Pirš, dr. med., Vladimir Drnovšek<br />

Recenzenti<br />

prof. dr. Marija Gubina, dr. med., prof. dr. Jožica Marin, univ. dipl. biol., prof. dr. Srečko Koren, dr. med.<br />

Lektorica<br />

Katarina Marin Hribar, prof.<br />

Tehnično uredila<br />

Mihaela Oberdank Hrastar<br />

Tehnični sodelavki<br />

Barbara Trtnik, Mrjetka Zupin<br />

Založila<br />

Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo, Katedra za mikrobiologijo in imunologijo<br />

Tisk<br />

Itagraf d. o. o.<br />

Računalniško oblikovanje<br />

Boex DTP d. o. o.<br />

CIP - Kataložni zapis o publikaciji<br />

Narodna in univerzitetna knjižnica, Ljubljana<br />

579(075.8)(076.5)<br />

616-097(075.8)(076.5)<br />

PRAKTIKUM iz mikrobiologije in imunologije za študente<br />

medicine / [avtorji Vladimir Kotnik ... [et al.] ; glavni urednik<br />

Vladimir Kotnik ; slike Veronika Strašek ... et al.]. - Ljubljana :<br />

Medicinska fakulteta, Inštitut za mikrobiologijo in imunologijo,<br />

Katedra za mikrobiologijo in imunologijo, 2011<br />

ISBN 978-961-91159-4-7<br />

1. Kotnik, Vladimir<br />

258504448<br />

Copyright© Katedra za mikrobiologijo in imunologijo 2011<br />

Vse pravica pridržane. Razmnoževanje ali razširjanje delov ali celote te publikacije s katerim koli sredstvom brez pisnega dovoljenja založnika<br />

je prepovedano.


KAZALO VSEBINE<br />

KAZALO VSEBINE<br />

SEZNAM KRATIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13<br />

UVOD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19<br />

POGLAVJE 1<br />

Pravilno in varno delo v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21<br />

Mikrobiološki laboratorij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23<br />

Pravila o varnem delu v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23<br />

Varnostni ukrepi pri delu v laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23<br />

Nezgode v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24<br />

Higiensko umivanje in razkuževanje rok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25<br />

Asepsa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26<br />

Sterilizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26<br />

Nadzor učinkovitosti sterilizacijskih postopkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27<br />

Razkuževanje ali dezinfekcija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28<br />

POGLAVJE 2<br />

Bakteriologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31<br />

1. VAJA: KOKI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33<br />

Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 33<br />

Moraxella catarrhalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39<br />

Neisseria gonorrhoeae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43<br />

Neisseria meningitidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47<br />

Staphylococcus aureus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52<br />

Staphylococcus epidermidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58<br />

Streptococcus pyogenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62<br />

Streptococcus pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68<br />

Streptococcus agalactiae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73<br />

2. VAJA: BACILI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77<br />

Bacteroides fragilis in drugi po Gramu negativni anaerobni bacili . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77<br />

Bordetella pertussis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84<br />

Clostridium perfringens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89<br />

Escherichia coli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 97<br />

Haemophilus influenzae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 103<br />

Klebsiella pnemoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108<br />

Listeria monocytogenes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114<br />

Pseudomonas aeruginosa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120<br />

Salmonella Enteritidis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125<br />

3. VAJA: DRUGE BAKTERIJE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130<br />

Borrelia burgdorferi sensu lato . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130<br />

Campylobacter spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138<br />

Chlamydia trachomatis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143<br />

Helicobacter pylori . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147<br />

3


PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

Legionella spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151<br />

Mycobacterium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157<br />

Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 162<br />

Treponema pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 167<br />

Vibrio cholerae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172<br />

POGLAVJE 3<br />

Mikologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177<br />

4. VAJA: GLIVE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179<br />

Aspergillus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180<br />

Candida spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 187<br />

Cryptococcus neoformans . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 195<br />

Dermatofiti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202<br />

POGLAVJE 4<br />

Parazitologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 209<br />

5. VAJA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211<br />

Črevesni praživali Giardia intestinalis in Cryptosporidium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 211<br />

Pražival Trichomonas vaginalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 216<br />

Pražival Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 219<br />

Krvna, tkivna pražival Plasmodium spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 223<br />

Črevesna glista Enterobius vermicularis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 226<br />

Trakulja Taenia solium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229<br />

Trakulja Echinococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 232<br />

Uši Pediculus humanus spp., Phthirus pubis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237<br />

POGLAVJE 5<br />

Virologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 241<br />

Uvod v virološko diagnostiko . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243<br />

Odvzem in transport vzorcev v virološki laboratorij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243<br />

Pregled diagnostičnih tehnik v virologiji . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 244<br />

Encimsko-imunska metoda . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245<br />

Metoda neposredne imunofluorescence (DIF) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245<br />

Dokazovanje virusnih antigenov s hitrimi testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246<br />

Imunohistokemične metode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246<br />

Aglutinacija z lateksom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246<br />

Osamitev virusov v celični kulturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246<br />

Sistemi za osamitev virusa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247<br />

Primarne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247<br />

Diploidne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247<br />

Trajne celične kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247<br />

Postopek osamitve in identifikacije virusnega izolata . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248<br />

Elektronska mikroskopija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248<br />

6.1 VAJA: NEPOSREDNO DOKAZOVANJE VIRUSOV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250<br />

Metoda elektronske mikroskopije: povzročitelji virusnih gastroenteritisov –<br />

rotavirusi, adenovirusi, astrovirusi in kalicivirusi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250<br />

4


KAZALO VSEBINE<br />

Metoda neposredne imunofluorescence (DIF) – dokazovanje virusnih okužb dihal –<br />

respiratorni sincicijski virus – RSV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 254<br />

Izvedba hitrega testa za dokaz antigenov RSV neposredno v kužnini . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257<br />

6.2 VAJA: SEROLOŠKO DOKAZOVANJE VIRUSNIH OKUŽB . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258<br />

Metode za dokazovanje specifičnih protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258<br />

Metoda posredne imunofluorescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258<br />

Encimsko-imunska metoda (ELISA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 259<br />

Metoda imunoblot (westernblot) ali imunsko pivnanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 259<br />

Nevtralizacijski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260<br />

Reakcija vezave komplementa (RVK) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260<br />

Inhibicija hemaglutinacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 260<br />

Dokazovanje okužbe s hantavirusi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 261<br />

Dokazovanje okužb z virusom Epstein Barr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 263<br />

Test monospot − izvedba in materiali . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265<br />

Dokazovanje okužbe s HIV-1 s potrditvenim testom westernblot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267<br />

6.3 VAJA: MOLEKULARNA DIAGNOSTIKA VIRUSOV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271<br />

Metode dokazovanja nukleinskih kislin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271<br />

Dokazovanje virusnih nukleinskih kislin brez predhodnega pomnoževanja . . . . . . . . . . . . . . 271<br />

Osamitev nukleinskih kislin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271<br />

Verižna reakcija s polimerazo (PCR) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 272<br />

Posredne hibridizacijske metode − reverzna hibridizacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273<br />

Testiranje občutljivosti na protivirusna zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273<br />

Določanje genotipa virusa hepatitisa C (HCV) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 274<br />

Kvantitativno določanje virusnega bremena pri okužbi s HIV-1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 278<br />

Genotipsko določanje odpornosti citomegalovirusa (CMV) na zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . 280<br />

POGLAVJE 6<br />

Imunologija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 283<br />

7. VAJA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285<br />

Imunski sistem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285<br />

Celične vrste in podvrste, ki so pomembne za imunski odziv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285<br />

Fagocitne celice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 285<br />

Limfociti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286<br />

Kako imunski sistem odstranjuje tuje molekule iz organizma? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 286<br />

Antigeni CD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287<br />

Protitelesa CD, ki jih uporabljamo za opredelitev limfocitov T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287<br />

Celice T pomagalke in aids . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 287<br />

Ugotavljanje limfocitnih populacij z imunofluorescenčno tehniko . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288<br />

Analiza imunskih celic s pretočnim citometrom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288<br />

Uporaba pretočne citometrije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 289<br />

Analiza protitelesnega odziva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 291<br />

Precipitacijske tehnike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292<br />

Mikroprecipitacija v kapilari (semikvantitativna metoda – MPK) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 292<br />

Radialna imunodifuzija (RID – kvantitativna tehnika) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293<br />

Antistreptolizinski test (nevtralizacija hemolize s protitelesi) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294<br />

Aglutinacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 296<br />

5


PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

Encimsko-imunski testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 296<br />

Indirektna tehnika z označenimi protitelesi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297<br />

Indirektna tehnika z označenim antigenom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297<br />

Določevanje protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297<br />

Merjenje pokazateljev vnetja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298<br />

Merjenje aktiviranosti komplementnega sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298<br />

Reakcija lize (uničevanja celic) s komplementom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298<br />

Aktivacija komplementnega sistema po alternativni poti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 300<br />

Določevanje koncentracije odlomka C3d/dg z metodo RIEF (raketna imunoelektroforeza) . . . . 301<br />

Diagnostični primer A: na kromosom X vezana agamaglobulinemija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 302<br />

Diagnostični primer B: kronična granulomatozna bolezen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 303<br />

Diagnostični primer C: kronična limfocitna levkemija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 304<br />

Diagnostični primer D: aids . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 305<br />

Opis metod za tehnično izvedbo nalog A, B, C in D . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 306<br />

Analiza diferencialne krvne slike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 306<br />

Določitev titra protiteles proti tetanusnemu in davičnemu toksinu z MPK . . . . . . . . . . . . . . . 307<br />

Določanje C-reaktivnega proteina v serumu z aglutinacijo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 307<br />

Limfocitne vrste in podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 307<br />

Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov v testu fagocitoze<br />

s FITC obarvanih E. coli in v testu oksidacije barvila dihidrorodamin 123 . . . . . . . . . . . . . . . 312<br />

Določanje serumskih protiteles razredov IgM, IgA, IgG s testom ELISA . . . . . . . . . . . . . . . . . 314<br />

Razprava A: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 316<br />

Razprava B: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 316<br />

Razprava C: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 317<br />

Razprava D: . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 317<br />

POGLAVJE 7<br />

Laboratorijske tehnike in materiali . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 319<br />

Osnovni aparati in drugi pripomočki za delo v mikrobiološkem laboratoriju . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321<br />

Mikroskop: svetlobni, s temnim poljem, fluorescenčni . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />

Navodila za mikroskopiranje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324<br />

Odvzem in prenos kužnin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 325<br />

Načini odvzema kužnine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 325<br />

Prenos kužnin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326<br />

Laboratorijske tehnike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326<br />

Neposredni razmaz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326<br />

Izdelava razmaza iz hemokulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327<br />

Izdelava razmaza sputuma za barvanje po Gramu in vrednotenje mikroskopskega preparata . . 327<br />

Izdelava neposrednega mikroskopskega preparata iz likvorja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327<br />

Izdelava razmazov in barvanje bakterij iz čiste kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327<br />

Tehnike barvanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328<br />

Tehnika barvanja po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328<br />

Tehnika barvanja z metilenskim modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329<br />

Tehnika barvanja po Ziehl-Neelsenu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329<br />

Tehnika barvanja po Giemsi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 330<br />

Tehnika barvanja debele kaplje krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 331<br />

Tehnika barvanja spor po Schaeffer-Fultonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 331<br />

Bakteriološka gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332<br />

Vrste gojišč . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332<br />

6


KAZALO VSEBINE<br />

Osnovna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 332<br />

Obogatena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333<br />

Tioglikolatni bujon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333<br />

Krvni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />

Čokoladni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />

Agar po Schaedlerju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />

Bogatitvena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />

Diferencialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />

Agar po Drigalskem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />

CLED (Cystine, Lactose, Electrolyte Deficient agar) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />

Selektivna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />

Agar XLD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />

CNA Columbia agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />

MacC (MacConkey agar) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />

Specialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />

Agar BG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />

Karmali agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />

Agar CYA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />

Kromogena gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />

MRSA kromogeno gojišče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />

Zasejavanje kužnin na gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />

Postopek zasejavanja iztrebka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />

Postopek zasejavanja sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />

Hemokultura . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />

Postopek zasejavanja urina s kvantitativno metodo in določitev koncentracije<br />

mikroorganizmov v urinu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />

Osamitev bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />

Prepoznava (identifikacija) bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />

Izdelava čiste kulture iz mešane kulture bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />

Postopki za identifikacijo bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />

Prepoznava bakterij po fizioloških in biokemičnih lastnostih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />

Biokemična identifikacija po Gramu pozitivnih in negativnih kokov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />

Dokaz katalaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342<br />

Dokaz oksidaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342<br />

Navzočnost vezane koagulaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />

Navzočnost proste koagulaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />

Deoksiribonukleaza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />

Navzočnost hemolize beta ali alfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />

Bacitracinski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />

Optohinski test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />

Satelitni fenomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />

Test PYR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />

Test razgradnje arabinoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />

Fermentacija sladkorjev glukoze in maltoze (Hissovi sladkorji) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />

Test CAMP . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 346<br />

Biokemična identifikacija po Gramu negativnih bacilov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 346<br />

Biokemična vrsta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />

Test za dokaz razgradnje glukoze, laktoze ali obeh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />

Test za dokaz nastanka indola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />

7


PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

Test za dokaz razgradnje glukoze − metil rdeče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />

Test za dokaz razgradnje glukoze do acetoina − Voges-Proskauer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />

Test za dokaz zmožnosti razgradnje citrata – citrat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />

Test za dokaz navzočnosti ureaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />

Dokaz gibljivosti bakterij − gojišče po Winkleju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350<br />

Komercialni testi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350<br />

Odčitavanje API 20 E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350<br />

Vrednotenje API NH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 351<br />

Ugotavljanje antigenske zgradbe bakterijskega seva . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352<br />

Serološke metode za dokazovanje bakterijskih okužb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352<br />

Določanje občutljivosti bakterij za antibiotike − antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352<br />

Difuzijski antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 353<br />

Izdelava difuzijskega antibiograma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354<br />

Minimalna inhibitorna koncentracija, določena z metodo difuzijskega<br />

gradienta – E-test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354<br />

Odčitavanje E-testov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355<br />

Dilucijski antibiogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355<br />

Določanje MIK in MBK z dilucijsko metodo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355<br />

Določitev laktamaz beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 356<br />

Spremni list za mikrobiološke preiskave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 357<br />

Izbor preparatov medicinsko pomembnih mikrobov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 359<br />

Izbor preparatov medicinsko pomembnih parazitov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 360<br />

Slika 1. Postopek pri prelitju mikrobne kulture, kužnine ali krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24<br />

Slika 2. Postaja za izpiranje oči . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24<br />

Slika 3. Postopek izpiranja oči . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24<br />

Slika 4. Pravilno umivanje in razkuževanje rok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25<br />

Slika 5. N. gonorrhoeae v brisu uretre, barvano z metilenskim modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43<br />

Slika 6. A: N. gonorrhoeae na krvnem agarju. B: N. gonorrhoeae – fermentacija sladkorjev . . . . . . . . . 44<br />

Slika 7. Potek testa za določitev povzročitelja angine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65<br />

Slika 8. Odčitavanje rezultatov testa STREP A. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65<br />

Slika 9. A: Mikroskopska slika B. fragilis; B: Kultura B. fragilis z diskom metronidazola . . . . . . . . . . . 78<br />

Slika 10. Mikroskopska slika mešane okužbe − vzorec iz abscesa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78<br />

Slika 11. Bolniku med operacijo aseptično odvzamejo gnoj iz abscesa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80<br />

Slika 12. Tipična mikroskopska slika C. perfringens. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89<br />

Slika 13. Rast na KA; toplo-hladna hemoliza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89<br />

Slika 14. Tipična mikroskopska slika C. tetani . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90<br />

Slika 15. Tipična mikroskopska slika C. botulinum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 90<br />

Slika 16. Plinska gangrena . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92<br />

Slika 17. Hitri test za dokaz enterotoksina pri C. difficile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95<br />

Slika 18. Izvedba urikulta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 101<br />

Slika 19. Odčitavanje pozitivnega rezultata urikulta s shemo za oceno števila bakterijskih kolonij . . . . 101<br />

Slika 20. API 20E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109<br />

Slika 21. Test API Listeria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115<br />

Slika 22. API 20NE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121<br />

Slika 23. Restrikcijski vzorci referenčnih borelijskih vrst . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133<br />

Slika 24. Trak z nanesenimi borelijskimi antigeni: pozitivna kontrola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135<br />

Slika 25. B. burgdorferi sensu lato v mikroskopu s temnim poljem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135<br />

Slika 26. Elektroforeza pridelka PCR v agaroznem gelu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136<br />

8


KAZALO VSEBINE<br />

Slika 27. Celična kultura z značilnimi klamidijskimi vključki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144<br />

Slika 28. Priprava vzorca za določitev antigenov bakterije H. pylori v iztrebku . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149<br />

Slika 29. Prikaz pozitivnega, negativnega in neveljavnega rezultata v testu za dokaz<br />

antigena H. pylori . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150<br />

Slika 30. Posredna imunofluorescena: Legionella pneumophila – pozitiven rezultat . . . . . . . . . . . . . . 152<br />

Slika 31. Fotografija značilnih kolonij M. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 163<br />

Slika 32. Diagnostično pomembne strukture posameznih glivnih rodov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 179<br />

Slika 33. Teden dni stare kolonije A. fumigatus, A. flavus, A. niger na SABA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180<br />

Slika 34. A: Aspergillus spp. – konidiofore, vezikule, fialide, konidiji. B: A. fumigatus,<br />

obarvan z modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180<br />

Slika 35. A: C. albicans, pseudomicelij z značilnimi terminalnimi klamidosporami na<br />

koruznem agarju. B: C. albicans na kromogenem gojišču, obarvana zeleno . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 187<br />

Slika 36. C. albicans, kužnina, barvanje po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 188<br />

Slika 37. A: M. canis, makrokonidiji, obarvani z modrilom; B: T. mentagrophytes,<br />

spiralne hife, obarvane z modrilom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202<br />

Slika 38. M. canis, teden dni stara kolonija na dermatofitnem gojišču . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203<br />

Slika 39. Shema obravnave vzorca blata, poslanega na ugotavljanje okužbe s črevesnimi paraziti . . . 212<br />

Slika 40. Inokulacija kužnine v gojišču »InPouch« . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 217<br />

Slika 41. Shema obravnave vzorca seruma, poslanega za ugotovitev okužbe s parazitom<br />

Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 220<br />

Slika 42. Razporeditev vzorcev za izvedbo indirektnega hemaglutinacijskega testa za<br />

kvantitativno določanje protiteles proti Echinococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 234<br />

Slika 43. Test westernblot za dokazovanje protiteles proti ehinokoknim antigenom . . . . . . . . . . . . . . 235<br />

Slika 44. Primer pozitivnega in negativnega rezultata pri metodi neposredne imunfluorescence . . . 257<br />

Slika 45. Izvedba hitrega testa za dokaz antigenov RSV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257<br />

Slika 46. Dinamika nastajanja specifičnih protiteles pri okužbi z EBV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265<br />

Slika 47. Pozitivni in negativni rezultati testa monospot za dokaz okužbe z EBV . . . . . . . . . . . . . . . . 265<br />

Slika 48. Princip reverzne hibridizacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 273<br />

Slika 49. Shematski prikaz genotipizacije HCV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 276<br />

Slika 50. Določanje odpornosti CMV za protivirusna zdravila . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 282<br />

Slika 51. Neposredna in posredna imunofluorescenčna tehnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288<br />

Slika 52. Prikaz rezultatov pretočne citometrije v obliki točkovnih diagramov . . . . . . . . . . . . . . . . . . 290<br />

Slika 53. Shematični prikaz mikroprecipitacije v kapilari . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293<br />

Slika 54. Shema nanašanja antigenov v testu RID za določanje koncentracije sestavine C3c<br />

komplementnega sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293<br />

Slika 55. Točkast graf za analizo rezultatov C3c . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 294<br />

Slika 56. Izvedba antistreptolizinskega testa (AST) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 295<br />

Slika 57. Aglutinacija s kardiolipinom označenih lateksnih delcev v testu RPR<br />

za določanje protiteles pri okužbi z bakterijo Treponema pallidum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 296<br />

Slika 58. Encimsko-imunski preskus – direktna tehnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 297<br />

Slika 59. ELISA – določevanje protiteles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 298<br />

Slika 60. Izvedba testa za ugotavljanje sestavin, ki so potrebne za aktivacijo komplementnega sistema . . . 299<br />

Slika 61. Shema za izvedbo testa za ugotavljanje dejavnosti komplementnega sistema<br />

po alternativni poti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 300<br />

Slika 62. Slika gela s precipitati C3d/dg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301<br />

Slika 63. Preiskovanec A: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 309<br />

Slika 64. Preiskovanec B: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 309<br />

Slika 65. Preiskovanec C: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 310<br />

Slika 66. Preiskovanec D: limfocitne podvrste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 311<br />

9


PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

Slika 67. Preiskovanec A: fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov<br />

v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 312<br />

Slika 68. Preiskovanec B: fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov<br />

v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 313<br />

Slika 69. Preiskovanec C: Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov<br />

v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 313<br />

Slika 70. Preiskovanec D: Fagocitna in oksidativna zmožnost monocitov in granulocitov<br />

v testu fagocitoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314<br />

Slika 71. Shema pipetiranja na mikrotitrsko ploščo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 315<br />

Slika 72. Avtoklav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321<br />

Slika 73. Varnostna komora . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321<br />

Slika 74. Laboratorijski hladilnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 321<br />

Slika 75. Bakteriološki inkubator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />

Slika 76. Suhi sterilizator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />

Slika 77. Laboratorijska centrifuga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />

Slika 78. Bunsenov gorilnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />

Slika 79. Bakteriološke zanke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />

Slika 80. Posoda za varno odlaganje kužnih odpadkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 322<br />

Slika 81. Deli svetlobnega mikroskopa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 323<br />

Slika 82. Kaj zmanjšuje učinkovitost razločevanja opazovanih predmetov v svetlobnem mikroskopu? . . 324<br />

Slika 83. Mikroskopiranje z imerzijo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324<br />

Slika 84. Bris žrela . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 325<br />

Slika 85. Odvzem brisa uretre pri moškem in brisa cerviksa pri ženski . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 325<br />

Slika 86. Odvzem srednjega curka urina . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 326<br />

Slika 87. Priprava mikroskopskega razmaza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 327<br />

Slika 88. Barvanje po Gramu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 328<br />

Slika 89. Oblika in razporeditev bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329<br />

Slika 90. Razporeditev bičkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 329<br />

Slika 91. Priprava razmaza krvi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 330<br />

Slika 92. Barvanje spor po Schaeffer-Fultonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 331<br />

Slika 93. Navadni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333<br />

Slika 94. Tioglikolatni bujon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 333<br />

Slika 95. Krvni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />

Slika 96. Čokoladni agar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 334<br />

Slika 97. Agar po Schaedlerju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 335<br />

Slika 98. Različna diferencialna gojišča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 336<br />

Slika 99. Agar BG (Bordet Gengou) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />

Slika 100. Kromogeno gojišče za gojenje MRSA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 337<br />

Slika 101. Zasejavanje kužnine na gojišče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />

Slika 102. Redčenje vzorca na gojišču . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 338<br />

Slika 103. Priprava ustrezne razredčine urina za kvantitativno urinokulturo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />

Slika 104. Zasejavanje in štetje kolonij pri kvantitativni urinokulturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339<br />

Slika 105. Priprava čiste kulture . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />

Slika 106. Značilne oblike bakterijskih kolonij od zgoraj in v prerezu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 340<br />

Slika 107. Po Gramu pozitivne in po Gramu negativne bakterije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />

Slika 108. Značilna rast v bujonu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />

Slika 109. Anaerobni lonec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 341<br />

Slika 110. Dokaz katalaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 342<br />

Slika 111. Dokaz oksidaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />

10


KAZALO VSEBINE<br />

Slika 112. Dokaz koagulaze na predmetniku . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />

Slika 113. Dokaz koagulaze v epruveti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 343<br />

Slika 114. Hemoliza beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />

Slika 115. Hemoliza alfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 344<br />

Slika 116. Satelitni fenomen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />

Slika 117. Test PYR . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />

Slika 118. Hissovi sladkorji za dokaz bakterijske vrste Neisseria/Moraxella . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 345<br />

Slika 119. CAMP fenomen, ki je značilen za skupino B beta hemolitičnih streptokokov<br />

(S. agalactiae) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 346<br />

Slika 120. Fermentativna (enterobakterije) in oksidativna (nefermentativni po Gramu<br />

negativni bacili) razgradnja glukoze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 347<br />

Slika 121. Značilne reakcije na dvojnem sladkorju . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />

Slika 122. Gojišče za dokazovanje razgradnje triptofana do indola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />

Slika 123. Metil rdeče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 348<br />

Slika 124. Reakcija Voges-Proskauer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />

Slika 125. Gojišče za dokaz citrata kot edinega vira ogljika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />

Slika 126. Dokaz navzočnosti ureaze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349<br />

Slika 127. Gojišče za ugotavljanje gibljivosti bakterij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350<br />

Slika 128. API 20E . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 351<br />

Slika 129. Izdelava difuzijskega antibiograma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354<br />

Slika 130. Izdelava difuzijskega antibiograma z avtomatskim polagalcem diskov . . . . . . . . . . . . . . . . 354<br />

Slika 131. Določanje MIK z E-testom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355<br />

Slika 132. Določanje minimalne inhibitorne in minimalne baktericidne koncentracije antibiotika . . . 355<br />

Slika 133. Inaktivacija penicilina z laktamazo beta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 356<br />

Slika 134. Obrazec spremnega lista . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 357<br />

Razpredelnica 1. Pregled sterilizacijskih postopkov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27<br />

Razpredelnica 2. Priporočeni temperatura, čas delovanja in tlak pri sterilizaciji s toploto . . . . . . . . . . 27<br />

Razpredelnica 3. Nekatera razkužila in njihovo delovanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29<br />

Razpredelnica 4. Barvilne in biokemične značilnosti Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34<br />

Razpredelnica 5. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za Enterococcus spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37<br />

Razpredelnica 6. Ugotavljanje občutljivosti za vankomicin in teikoplanin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37<br />

Razpredelnica 7. Barvilne in biokemične značilnosti M. catarrhalis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39<br />

Razpredelnica 8. Diagnostična razpredelnica za ugotavljanje biokemičnih značilnosti M. catarrhalis . . 41<br />

Razpredelnica 9. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. aureus . . . . . . . 55<br />

Razpredelnica 10. Ugotavljanje občutljivosti za vankomicin in teikoplanin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56<br />

Razpredelnica 11. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije S. pyogenes . . . . 67<br />

Razpredelnica 12. Razpredelnica za oceno ustreznosti odvzetega sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70<br />

Razpredelnica 13. Razpredelnica za vnos inhibicijskih con za antibiogram bakterije<br />

S. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71<br />

Razpredelnica 14. Ugotavljanje občutljivosti za penicilin in cepotaksin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72<br />

Razpredelnica 15. Razpredelnica za določitev MIK pri neznani anaerobni bakteriji . . . . . . . . . . . . . . . 82<br />

Razpredelnica 16. Kultivacijske in biokemične značilnosti klostridijev . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91<br />

Razpredelnica 17. Razpredelnica za vpis podatkov za interpretacijo urinokulture . . . . . . . . . . . . . . . . . 99<br />

Razpredelnica 18. Antibiotiki, ki so primerni za zdravljenje okužb, povzročenih z enterobakterijami . . 100<br />

Razpredelnica 19. Ocena kvalitete sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105<br />

Razpredelnica 20. Antibiotiki, primerni za zdravljenje okužb s H. influenzae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106<br />

Razpredelnica 21. Antibiotiki, primerni za zdravljenje okužb s K. pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112<br />

Razpredelnica 22. Ugotavljanje navzočnosti laktamaze beta razširjenega spektra (ESBL) . . . . . . . . . 112<br />

11


PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

Razpredelnica 23. Biokemični testi značilni za razlikovanje listerij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115<br />

Razpredelnica 24. Kultivacija likvorja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117<br />

Razpredelnica 25. Razpredelnica za identifikacijo listerij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117<br />

Razpredelnica 26. Razpredelnica za ugotavljanje kvalitete sputuma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122<br />

Razpredelnica 27. Razpredelnica z antibiotiki, ki so primerni za zdravljenje okužb<br />

z nefermentativnimi bakterijami . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 123<br />

Razpredelnica 28. Kauffmann-Whiteova razpredelnica antigenske zgradbe<br />

bakterij iz taksonomske vrste Salmonella enterica subsp. enterica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128<br />

Razpredelnica 29. Biokemična identifikacija kampilobaktrov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139<br />

Razpredelnica 30. Razpredelnica za vnos rezultatov testiranja Campylobacter spp. na<br />

odpornost za antibiotike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 141<br />

Razpredelnica 31. Koncentracije in količine reagentov, potrebnih za izvedbo testa<br />

PCR za dokaz Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 165<br />

Razpredelnica 32. Značilnosti netreponemskih in treponemskih testov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168<br />

Razpredelnica 33. Razpredelnica za ugotavljanje občutljivosti za antimikotik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 184<br />

Razpredelnica 34. Značilnosti različnih vrst kvasovk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 189<br />

Razpredelnica 35. Fiziološke značilnosti kvasovk, API 20C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 191<br />

Razpredelnica 36. Razpredelnica za ugotavljanje MIK za antimikotike . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 192<br />

Razpredelnica 37. Fiziološke značilnosti kvasovk, API 20C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 199<br />

Razpredelnica 38. Razpredelnica za ugotavljanje MIK za antimikotike flukonazol,<br />

vorikonazol, amfotericin in caspofungin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 200<br />

Razpredelnica 39. Razdelitev dermatofitov glede na naravno nahajališče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 202<br />

Razpredelnica 40. Najpogostejši povzročitelji gastroenteritisov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250<br />

Razpredelnica 41. Danes znani tipi hantavirusov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 261<br />

Razpredelnica 42. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 1) . . . 266<br />

Razpredelnica 43. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 2) . . . 266<br />

Razpredelnica 44. Rezultat dokazovanja specifičnih protiteles proti virusu Epstein Barr (primer 3) . . . 267<br />

Razpredelnica 45. Virusne beljakovine, nanesene na nitrocelulozno membrano testa<br />

westernblot, za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268<br />

Razpredelnica 46. Interpretacija testa westernblot za dokaz okužbe s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 269<br />

Razpredelnica 47. Poročilo rezultatov potrditvenega testa westernblot za dokaz okužbe<br />

s HIV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 270<br />

Razpredelnica 48. Poročilo rezultatov genotipizacije HCV . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 277<br />

Razpredelnica 49. Najpomembnejše molekule (antigeni), ki jih odkrivamo za<br />

opredeljevanje limfocitnih populacij . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 288<br />

Razpredelnica 50. Normalne vrednosti limfocitnih populacij pri zdravih odraslih ljudeh . . . . . . . . . 290<br />

Razpredelnica 51. Spremembe aktivnosti in koncentracije posameznih sestavin<br />

komplementnega sistema pri nekaterih boleznih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 301<br />

Razpredelnica 52. Predvidene normalne vrednosti za test ugotavljanja fagocitne<br />

in oksidativne zmožnosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 312<br />

Razpredelnica 53. Povečava, potrebna za opazovanje različnih mikrobov . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 324<br />

Razpredelnica 54. Shema za identifikacijo po Gramu pozitivnih in po Gramu negativnih kokov . . . . . 342<br />

Razpredelnica 55. Shema za identifikacijo po Gramu negativnih bacilov – enterobakterij . . . . . . . . . 346<br />

Razpredelnica 56. Različne enterobakterije razgrajujejo različne substrate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 347<br />

Razpredelnica 57. Interpretacija rezultatov testa API NH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352<br />

Razpredelnica 58. Antibiotiki, ki jih lahko testiramo pri po gramu pozitivnih<br />

in negativnih bakterijah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 353<br />

Razpredelnica 59. Nekatere bakterije in bolezni, ki jih le-te povzročajo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 358<br />

12


SEZNAM KRATIC<br />

Seznam kratic<br />

AHFITC (anti human FITC) – s FITC obarvana protitelesa proti človeškim imunoglobulinom<br />

aids (acquired immune deficiency syndrome) – sindrom pridobljene imunske pomanjkljivosti<br />

AP (Alternative Pathway) – alternativna pot aktivacije komplementnega sistema<br />

API (Analytical Profile Index Systems) – komercialni testi za dokazovanje bakterijskih povzročiteljev bolezni<br />

API 20E – diagnostični sistem za identifikacijo po Gramu negativnih enterobakterij<br />

API NH – diagnostični sistem za identifikacijo po Gramu negativnih enterobakterij<br />

ARS – akutni retrovirusni sindrom<br />

AST – antistreptolizinski test<br />

ATCC (American Type Culture Collection) – zbirka trajnih celičnih linij<br />

BAL – bronhoalveolarna lavaža<br />

BCYE (Buffered Charcoal Yeast Extract) – obogateno in selektivno gojišče za legionele<br />

bDNA (branched-chain) – razvejana DNA<br />

BG (Bordet Gengou) – agar za gojenje bakterije Bordetella pertussis<br />

BSA (Bovine Serum Albumin) – goveji serumski albumin<br />

CagA – citotoksični protein – encim, značilen za bakterijo Helicobacter pylori<br />

CAMP (Christie Atkins Munch-Peterson) – test za identifikacijo beta hemolitičnih steptokokov skupine B<br />

CAPD (Continous Ambulatory Peritoneal Dialysis) – peritonealna dializa<br />

CCD (Charge Coupled Device) – fotoelektrična kamera<br />

CD (Cluster of Differentiation) – monoklonska protitelesa proti antigenom na limfocitih, tudi antigeni<br />

na limfocitih<br />

CDC (Center for Disease Control) – center za nalezljive bolezni – najbolj znani iz Atlante v ZDA<br />

CDV – cidofovir<br />

NK – naravne celice ubijalke<br />

CFW – fluorescenčno barvilo (kalkofluor belo, angl. CalcouFluor White, CFW)<br />

CLED (Cystine, Lactose, Electrolyte Deficient agar) – agar za izvedbo kvantitativne urinokulture<br />

CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) – zbirka mednarodnih mikrobioloških standardov<br />

CMV – citomegalovirus<br />

CNA (Columbia agar) – selektivno gojišče, ki omogoča rast po Gramu pozitivnih bakterij<br />

CPU – citopatogeni učinek<br />

CRP – C-reaktivni protein<br />

CT – računalniška tomografija<br />

CTXФ – lizogeni bakteriofag<br />

CVK – centralni venski kateter<br />

CYA (Charcoal Yeast Agar) – agar, ki omogoča rast legionelam<br />

ČA – čokoladni agar<br />

13


PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

DIF – direktni (neposredni) imunofluorescenčni test<br />

DKS – diferencialna krvna slika<br />

DNK – deoksiribonukleinska kislina<br />

dNTP – deoksiribonukleotid<br />

DOB – virus Dobrava<br />

DRIG – agar po Drigalskem<br />

EAEC – enteroagregativna E. coli<br />

EBV – virus Epstein Barr<br />

ECACC (European Collection (Agency) of Cell Cultures) – zbirka trajnih celičnih linij –<br />

podobno kot v ZDA ATCC<br />

EDTA (Ethylene Diamine Tetraacetic Acid) – antikoagulans – helator kalcijevih in magnezijevih ionov<br />

EGTA (Ethylene Glycol Tetraacetic Acid) – helator kalcijevih in magnezijevih ionov, vendar z mnogo<br />

večjo afiniteto do kalcijevih ionov kot EDTA<br />

EHEC – enterohemoragična E. coli<br />

EIA ali ELISA (Enzyme Immuno Assay ali Enzyme Linked Immunosorbent Assay) –<br />

encimsko imunski test<br />

EIEC – enteroinvazivna E. coli<br />

EIT – encimsko-imunski test<br />

EM – elektronska mikroskopija<br />

env – gen, ki kodira ovojnično virusno beljakovino<br />

EPEC – enteropatogena E. coli<br />

ESBL (Extended Spectrum Beta Lactamases) – enterobakterije z razširjenim spektrom laktamaz beta<br />

ETEC – enterotoksigena E. coli<br />

FALS (Forward Angle Light Scatter) – detektor v pretočnem citometru, ki meri svetlobo v smeri izvora<br />

FITC – FluoresceinIzoTioCianat<br />

FOS – foskarnet<br />

FSC (Forward SCatter) – ime za os v histogramu FSC-SSC na kateri so prikazani dogodki, ki jih<br />

zazna detektor FALS<br />

FTA – ABS (Fluorescent Treponemal Antibody – ABSorption) – imunofluorescenčni test za<br />

dokazovanje protiteles proti bakteriji Treponema pallidum<br />

gag – strukturna virusna beljakovina<br />

GAS-PAK – sistem za gojenje anaerobnih bakterij<br />

GCV – ganciklovir<br />

HAART (Highly Active Antiretroviral Therapy) – način medikamentoznega zdravljenja okužbe s HIV<br />

HBV – virus hepatitisa B<br />

HCV – virus hepatitisa C<br />

HIV – virus pridobljene imunske pomanjkljivosti<br />

HLA (Human Leukocyte Antigens) – antigeni poglavitnega sistema tkivne skladnosti pri človeku<br />

14


SEZNAM KRATIC<br />

HLAR (High-Level Aminoglycoside Resistance) – povečana odpornost proti aminoglikozidom<br />

HMRS – hemoragična mrzlica z renalnim sindromom<br />

HPS – hantavirusni pljučni sindrom<br />

HPV – humani papiloma virus<br />

I – (Indeterminate) – nedoločljivo<br />

IFT – imunofluorescenčni test<br />

IgA – imunoglobulin razreda A<br />

IgG – imunoglobulin razreda G<br />

IgM – imunoglobulin razreda M<br />

IHA – indirektni (posredni) hemaglutinacijski test<br />

IIF – indirektni (posredni) imunofluorescenčni test<br />

KA – krvni agar<br />

KIA (Kligler Iron Agar) – agar za gojenje enteričnih, po Gramu negativnih bakterij<br />

KLL – kronična limfocitna levkemija<br />

KNS – za koagulazo negativni stafilokoki<br />

KOPB – kronična obstruktivna pljučna bolezen<br />

KRA – koruzni agar<br />

LCR (Ligase Chain Reaction) – metoda pomnoževanja z verižno rekacijo z ligazo<br />

LGV – LimfoGranuloma Venerum – spolno prenosljiva bolezen<br />

LIA (Line Immuno Assay) – molekularni test za dokaz protiteles proti rekombinantnim antigenom<br />

npr. T. pallidum<br />

LOS – LipoOligoSaharid<br />

M (Membrane protein) – membranski protein, pomemben za razlikovanje streptokokov<br />

MAC (Membrane Attack Complex) – tudi terminalni kompleks ali C5b-9 – končna faza ubijanja celic<br />

s komplementom<br />

MacC (MacConkey agar) – selektivno in diferencialno gojišče, ki omogoča rast po Gramu<br />

negativnim bakterijam, zavira pa rast po Gramu pozitivnih bakterij<br />

MBK – minimalna baktericidna koncentracija<br />

MGB (Minor Groove Binder) – hibridizacijska sonda za označevanje na novo nastale DNK<br />

v reakciji PCR<br />

MH – gojišče Mueller – Hinton<br />

MIK – minimalna inhibitorna koncentracija<br />

MKP – modificirno Kelly – Pettenkoferjevo gojišče za gojenje borelij<br />

MOMP (Major Outer Membrane Protein) – poglavitna beljakovina zunanje ovojnice pri C. trachomatis<br />

MPK – mikroprecipitacije v kapilari<br />

MR – metil rdeče<br />

MRSA (Methicillin-Resistant S. aureus) – proti meticilinu odporen S. aureus<br />

NAD – nikotinamid adenin dinukleotid<br />

15


PRAKTIKUM IZ MIKROBIOLOGIJE IN IMUNOLOGIJE ZA ŠTUDENTE MEDICINE<br />

NASBA (Nucleic Acid Sequence Based Amplification) – metoda, primerna za odkrivanje okužbe<br />

s HIV – alternativa PCR<br />

NCAM (Neural Cell Adhesion Molecule) izoforma adhezijske molekule živčnih celic na naravnih<br />

celicah ubijalkah<br />

NS – (Non Susceptible) – ni občutljiv<br />

ORSAB – MRSA kromogeno gojišče<br />

PAF – protein akutne faze vnetja<br />

PBS – fosfatni pufer<br />

PCR – verižna reakcija s polimerazo<br />

PE (PhycoErythrin) – rdeče fluorescirajoče barvilo<br />

PFGE (Pulsed-Field Gel Electrophoresis) – metoda elektroforeze v utripajočem električnem polju<br />

pol – gen, ki kodira virusni encim<br />

PTLD – posttransplantacijska limfoproliferativna bolezen<br />

PUU – virus Puumala<br />

PYR (L-pirolidonil-beta-naftilamid) – test za dokaz enterokokov<br />

RALS (Right Angle Light Scatter) – detektor v pretočnem citometru, ki meri lomljeno svetlobo<br />

RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) – polimorfizem restrikcijskega odseka<br />

RIA (Radio Immuno Assay) – radioimunski preskus<br />

RID – radialna imunodifuzija<br />

RIEF – raketna imunoelektroforeza<br />

RNK – ribonukleinska kislina<br />

ROS (Reactive Oxidative Species) – reaktivne kisikove zvrsti, pomembne za oksidativni način<br />

ubijanja mikrobov v fagocitih<br />

RPR (Rapid Plasma Reagin) – test za odkrivanje antikardiolipinskih protiteles pri sifilisu<br />

RSV– respiratorni sincicijski virus<br />

RT-PCR – pomnoževanje nukleinskih kislin z verižno reakcijo s polimerazo v realnem času<br />

RVK – reakcija vezave komplementa<br />

S – (Susceptible) –občutljiv<br />

S-DD – (Susceptible – Dose Dependent) – občutljiv, odvisen od doze<br />

SCID (Severe Combined Immune Deficiency) – težka kombinirana imunska pomanjkljivost<br />

SDA (Strand Displacement Assay) – metoda pomnoževanja z verižno rekacijo<br />

SEO – virus Seoul<br />

SLE – sistemski lupus eritematosus<br />

SN – virus Sin Nombre<br />

SSC (Side SCatter) – ime za os v histogramu FSC-SSC, na kateri so prikazani dogodki, ki jih zazna<br />

detektor RALS<br />

STREP A – hitri test za dokaz antigena S. pyogenes<br />

TCBS – gojišče (Tiosulfat, Citrat, žolčne soli (Bile), Saharoza)<br />

16


SEZNAM KRATIC<br />

TCR – T-celični receptorji<br />

TEM – transmisijska elektronska mikroskopija<br />

tio – tioglikolatni bujon<br />

TMA – metoda pomnoževanja nukleinskih kislin – pomnoževanje s transkripcijo<br />

TMB – tetrametil benzidin<br />

TPHA – test pasivne hemaglutinacije za določitev protiteles proti bakteriji Treponema pallidum<br />

UZ – ultrazvok<br />

VacA – vakuolizirajoči toksin – encim, značilen za bakterijo Helicobacter pylori – povzroča nastanek<br />

vakuol v epitelijskih celicah želodca<br />

VDRL (Veneral Disease Research Laboratories) – kardiolipinski test za dokaz sifilisa, ekvivalenten<br />

testu RPR (Rapid Plasma Reagin)<br />

VP (Voges-Proskauer) – test za dokaz razgradnje glukoze do acetoina<br />

VRE (Vancomycin-Resistant Enterococcus) – enterokok, odporen za vankomicin<br />

VTM – virusni transportni medij<br />

WB – test westernblot<br />

XLD (Xylose, Lysin, Deoxycholate agar) – gojišče, ki omogoča rast salmonel, zavira rast po Gramu<br />

pozitivnih bakterij<br />

17

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!