Mikrobølgespektroskopi på KIKU - Techmedia
Mikrobølgespektroskopi på KIKU - Techmedia
Mikrobølgespektroskopi på KIKU - Techmedia
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
60 år med<br />
mikrobølgespektroskopi<br />
ved <strong>KIKU</strong><br />
Niels Wessel Larsen og Thorvald Pedersen
I 4 artikler omtales den forskning, der siden 1949 er udført vha. mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Kemisk Institut ved Københavns<br />
Universitet (<strong>KIKU</strong>). Anledningen er, at den sidste fastansatte medarbejder nu er gået <strong>på</strong> pension, og at afdelingen nedlægges.<br />
Det spektroskopiske laboratorium fl yttede fra UKL <strong>på</strong> Nørrevold til H.C. Ørsted Instituttet i 1963. Frem til 2004 hed det Kemisk<br />
Laboratorium 5 (KL5), en betegnelse der benyttes i artiklerne.<br />
<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong><br />
<strong>KIKU</strong> – teorien bag rotationsspektre<br />
Her beskrives teorien bag mikrobølgespektroskopien, der blev indført i 1949 <strong>på</strong><br />
Københavns Universitet. Det var en omstændelig proces at udnytte udstyret optimalt<br />
Af Niels Wessel Larsen og Thorvald Pedersen<br />
Efter 2. Verdenskrig<br />
blev det muligt at<br />
erhverve mikrobølgekilder<br />
kaldet klystroner fra<br />
amerikanske overskudslagre.<br />
Professor Børge<br />
Bak (BB) rejste til USA<br />
og hentede refl eksklystroner<br />
med hjem til<br />
Danmark.<br />
Et mikrobølgespektrometer<br />
bestod af en celle<br />
i form af en evakueret<br />
bølgeleder af messing<br />
(ca. 3 m lang og med et<br />
indvendigt tværsnit <strong>på</strong><br />
ca. 1x2 cm).<br />
Ned gennem bølgelederen<br />
var der trukket<br />
en Stark-elektrode, som<br />
var isoleret fra væggene<br />
med et par tefl onstrimler.<br />
Det blev <strong>på</strong>trykt en<br />
jævnspænding <strong>på</strong> typisk<br />
1000 V (Stark-spændingen)<br />
moduleret med<br />
en fi rkantbølge med<br />
en frekvens <strong>på</strong> 50 kHz<br />
(for at forbedre signal/støjforholdet,<br />
men også<br />
for at måle molekylers<br />
dipolmoment). Cellen<br />
havde vinduer bestående af glimmer (Marieglas), som tillod<br />
mikrobølgerne at passere ind fra klystronen gennem den ene<br />
ende og ud til detektoren (en krystaldetektor) gennem den anden.<br />
Klystronens frekvens var enormt præcis (op til 0,01 MHz<br />
ved 23 GHz), men frekvensen måtte varieres manuelt ved at<br />
variere klystronens rumfang rent mekanisk, først med en hånddrevet<br />
mikrometerskrue, senere med en motor.<br />
Omkring 1970 kom der et kommercielt mikrobølgespektrometer<br />
<strong>på</strong> markedet fra Hewlett-Packard. Sådan et blev anskaffet<br />
og senere blev endnu et købt af Universitetet i Uppsala (og<br />
hentet hjem af forfatterne, fi gur 1).<br />
Det stof, der skulle undersøges, blev lukket ind i bølgelederen<br />
med et typisk tryk <strong>på</strong> 50 µ (50 mikrometer Hg). Og nu blev frekvensen<br />
varieret og absorptionsfrekvenser registreret. I mikrobølgeområdet<br />
(10-50 GHz) er der tale om rotationsovergange,<br />
dvs. overgange mellem rotationsenerginiveauer.<br />
Rotationsenerginiveauer<br />
For lineære molekyler som f.eks. OCS er rotationsenerginiveauerne<br />
givet ved det simple udtryk:<br />
23 23i, 91, nr. 5, 2010<br />
SPEKTROSKOPI<br />
Figur 1. Det komplette Hewlett Packard mikrobølgespektrometer. På topbordet ses en bølgeleder, der gennem et antal bøjninger<br />
leder mikrobølgerne ind i den 2 m lange polystyrenisolerede stofcelle. Under bordet ser man til venstre hanerne som benyttes<br />
til at lede gassen ind i cellen. I midterafdelingen en forstærker og et meter til måling af Starkspænding og krystalstrøm<br />
(Starkspændingsgeneratoren skulle have været <strong>på</strong> den tomme plads, men benyttes p.t. i det andet instrument). Til højre ses<br />
mikrobølgegeneratoren (en såkaldt Backward Wave Oscillator - BWO) med tilhørende power supply og styreenhed. Nederst en<br />
hjemmebygget mikrocomputer til styring og dataopsamling.<br />
Foto: Michael Barrett Boesen.<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 5, 2010<br />
▼
SPEKTROSKOPI<br />
hvor B kaldes rotationskonstanten og er udtrykt ved molekylets<br />
inertimoment, I, om en akse vinkelret <strong>på</strong> molekylet og gennem<br />
dets tyngdepunkt. J er rotationskvantetallet, som kun kan<br />
antage de heltallige værdier 0,1,2, ...<br />
For rotationsovergangene i det lineære molekyle gælder den<br />
simple udvalgsregel: ΔJ=1 ved absorption og en absorptionsovergangs<br />
mikrobølgefrekvens vil da være givet ved:<br />
For OCS fi nder man J = 1→2 overgangen ved ν = 4B =<br />
24325,92 MHz. Denne overgang/frekvens blev i mange år benyttet<br />
som reference ved kalibrering af klystronerne.<br />
For ikke-lineære molekyler er der ikke ét men 3 hovedinertimomenter;<br />
man taler om inertiellipsoiden, og hovedinertimomenterne<br />
er inertimomenterne omkring ellipsoidens 3<br />
hovedakser.<br />
Hvis alle hovedinertimomenterne er ens, er molekylet en<br />
sfærisk top. Methan er en sfærisk top (det engelske ord ”top”<br />
skal forstås som det danske ”snurretop”), men fra et mikrobølgespektroskopisk<br />
synspunkt er methan ikke interessant, for det<br />
har ikke noget mikrobølgespektrum. Det skyldes, at molekyler<br />
må have et permanent dipolmoment for at kunne absorbere<br />
mikrobølger. Det lineære molekyle CO 2 har derfor heller ikke<br />
noget mikrobølgespektrum.<br />
Hvis 2 af hovedinertimomenterne er lige store, taler man om<br />
en symmetrisk top. Methylfl uorid og benzen er symmetriske<br />
toppe. Methylfl uorid er en prolat symmetrisk top, idet de 2<br />
største hovedinertimomenter er lige store (I b = I c). Benzen er en<br />
oblat symmetrisk top, og nu er det de 2 mindste inertimomenter,<br />
der er ens (I a = I b), idet konventionen vedr. aksebetegnelserne<br />
a, b, c gælder:<br />
I a ≤ I b ≤ I c<br />
og tilsvarende for de 3 rotationskonstanter:<br />
A ≥ B ≥ C<br />
For den prolate top, hvor I b = I c (B = C), gælder<br />
udtrykket:<br />
Og for den oblate top, hvor I a = I b (A = B), tilsvarende:<br />
K = 0,1……. J<br />
energi-<br />
Benzen er igen et dårligt valgt eksempel, fordi det ikke har<br />
noget dipolmoment. PH 3 og PF 3 er eksempler <strong>på</strong> oblate toppe<br />
med dipolmoment og derfor med mikrobølgespektrum. (Begge<br />
eksempler kan ændres fra oblate til prolate toppe, hvis XPXvinklen<br />
(X=H, F) gøres passende lille).<br />
Vi vender nu tilbage til den sidste og største gruppe molekyler:<br />
de asymmetriske toppe hvor A >B > C.<br />
Den asymmetriske top<br />
Ud over pyridinmolekylet blev furan, pyrrol og andre femleddede<br />
heterocykler også undersøgt af Børge Bak og hans gruppe<br />
<strong>på</strong> KL5.<br />
Der eksisterer ikke eksplicitte energiudtryk for de asymmetriske<br />
toppe. Man er henvist til at diagonalisere en energimatrix<br />
for hver værdi af rotationskvantetallet J (som stadig er et ”godt”<br />
kvantetal):<br />
Særudgave Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 5, X, 2010<br />
24 3<br />
er matricer af dimension (2J+1)×(2J+1).<br />
Energiniveauerne, der kommer ud af processen, og som udgør<br />
diagonalen i energimatricen efter diagonaliseringen, betegnes:<br />
Hvor indekset τ løber fra –J til +J. Og endelig bliver overgangene<br />
betegnet:<br />
Før computerne rigtig vandt indpas, var man henvist til at slå op<br />
i tabeller. Man skrev energiudtrykket:<br />
Hvor var den tabellerede funktion. τ er det ovennævnte<br />
indeks for energiniveauerne. κ kaldes ”asymmetriparameteren”,<br />
og den er defi neret som:<br />
κ løber kontinuerligt fra -1 i den prolate-top-grænse (A = B)<br />
til 1 i den oblate-top-grænse (B = C). Tabellerne (kaldet King,<br />
Hainer og Cross’ tabeller) angav f.eks. for J = 1:<br />
for κ= -1, -0,9, -0,8..…1, ret grovmaskede<br />
tabeller, som givet linjernes præcision var vanskelige<br />
at interpolere i. BB og medarbejdere måtte derfor i begyndelsen<br />
starte med nogle antagelser om molekylernes struktur, fi nde de<br />
hertil svarende rotationskonstanter og derefter energiniveauerne<br />
ud fra tabellerne. Da Lise Nygaard kom til (hun hed da Lise<br />
Hansen), brugte hun en mekanisk håndregnemaskine til det<br />
krævende arbejde med at diagonalisere energimatricerne, når<br />
Figur 2. Pyridinmolekylet er et eksempel <strong>på</strong> en asymmetrisk top. Pyridin har<br />
været med i laboratoriets forskning fra starten og tjener her som gennemgående<br />
eksempel (se artikel 2).
tabellerne ikke var nøjagtige nok, mens Georg Ole Sørensen<br />
overtog beregningerne, da computerne havde vundet indpas.<br />
Substitution vha. Kraitchmanns formler<br />
Problemet med bestemmelse af atomernes koordinater har med<br />
molekylernes nulpunktsvibrationer at gøre. Den ultimative<br />
struktur er ligevægtsstrukturen, r e. Den kendes kun for meget<br />
små og simple molekyler, især toatomige. I princippet kan r estrukturer<br />
beregnes ved kvantekemiske beregninger QCC, men<br />
for større molekyler er der tale om meget omfattende beregninger,<br />
og det er svært at vide, om man har nået målet.<br />
μ<br />
Figur 3. Kraitchmanns formel for det plane molekyle. M er molekylets totale<br />
masse og Δm masseændringen ved substitutionen.<br />
De koordinater, man beregner ud fra Kraitchmanns formler<br />
bruges til beregning af substitutionsstrukturen r s. Man håber at<br />
reducere vibrationsbidragene og således komme tættere <strong>på</strong> den<br />
eftertragtede r e. Det blev bl.a. udnyttet i arbejdet med pyridin.<br />
Læs videre i artikel 2.<br />
Litteraturhenvisninger er af pladshensyn lagt ud <strong>på</strong> Dansk Kemis<br />
hjemmeside, www.danskkemi.dk, hvorfra man kan hente<br />
dem.<br />
E-mail-adresser<br />
Niels Wessel Larsen: nwl@kiku.dk<br />
Thorvald Pedersen: thorpe@tdcadsl.dk<br />
OKEMIKRYDS<br />
T<br />
I 14 I<br />
N 20 21\18<br />
24 21 K A R<br />
5\23 R R 26 27\24 N<br />
32\28 A C 29 T A<br />
32 6 34\33 L G<br />
H 2 O 2<br />
V<br />
Se Kemikryds<br />
Side 42, 10 > vandret<br />
Dandiag A/S l Mårkærvej 9 l 2630 Tåstrup<br />
T: 4343 3057 l www.dandiag.dk l dandiag@dandiag.dk<br />
Contract Laboratory<br />
More than 16 years of experience in chemical<br />
and microbiological GMP analyses for the<br />
pharmaceutical industry<br />
Analyses according to pharmacopoeias or<br />
methods developed and validated in-house<br />
Large facilities for stability and photo stability<br />
studies at ICH and individual conditions<br />
DB Lab A/S<br />
Tel: +45 6593 2920<br />
dblab@dblab.dk<br />
www.dblab.dk<br />
Viaflo prisfald <strong>på</strong> alle pipetter<br />
20% Viaflo Vision<br />
enkelt og<br />
multikanals pipetter<br />
og<br />
15% Viaflo Voyager<br />
multikanals pipetter<br />
Viaflo prisfald <strong>på</strong> udvalgte spidser<br />
6-10%<br />
Standard spidser<br />
Bokse & Sterile<br />
21%<br />
Sterile Filter Spidser<br />
Priserne er sænket fra d. 1. april 2010<br />
_________________<br />
RING eller SKRIV<br />
Bestil en DEMO<br />
More than a lab<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. X, 2010 25 4<br />
Særudgave af:<br />
dansk kemi, 91, nr. 5, 2010
SPeKTroSKoPI<br />
I 4 artikler, hvoraf dette er den 2., omtales den forskning, der siden 1949 er udført vha. mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Kemisk Institut<br />
ved Københavns Universitet (<strong>KIKU</strong>). Anledningen er, at den sidste fastansatte medarbejder nu er gået <strong>på</strong> pension, og at afdelingen<br />
nedlægges. Det spektroskopiske laboratorium flyttede fra UKL <strong>på</strong> Nørrevold til H.C. Ørsted Instituttet i 1963. Frem til 2004 hed det<br />
Kemisk Laboratorium 5 (KL5), en betegnelse der benyttes i artiklerne.<br />
<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong> -<br />
pyridin<br />
I beskrivelsen af arbejdet med mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Københavns Universitet<br />
har forfatterne valgt pyridin som gennemgående eksempel. Dels fordi det var med fra<br />
begyndelsen, og dels fordi aromatiske heterocykler spillede en stor rolle i laboratoriets<br />
forskning<br />
Af niels Wessel Larsen og Thorvald Pedersen<br />
Kemisk Laboratorium fik den første artikel om mikrobølgespektroskopi<br />
<strong>på</strong> laboratoriets publikationsliste i 1949. Det var B.<br />
Bak, Erik Stenberg Knudsen og Erhardt Madsens: ”Microwave<br />
Absorption of Some Organic Vapours” (Phys. Rev. 75; 1622-<br />
1623). I dag ville sådan en artikel næppe blive optaget i noget<br />
seriøst tidsskrift. Den indeholder blot en rapport om 6 organiske<br />
molekylers absorptioner i mikrobølgeområdet uden forsøg <strong>på</strong><br />
tilordning af kvantetal og med en usikkerhed <strong>på</strong> frekvensangivelserne<br />
<strong>på</strong> ± 5 MHz.<br />
John Rastrup Andersen havde en stor andel i bygningen af<br />
det ”endelige” spektrometer. Det beskriver Bak i ”A Microwave<br />
Spectroscope and a Review of Microwave Spectroscopy” fra en<br />
kongres i Stockholm i 1952: Transactions of Instruments and<br />
Measurements Conference. Hermed er vi klar til at tage hul<br />
<strong>på</strong> pyridin, hvorom der i artiklen fra 1949 stod, at der ikke var<br />
noget signal.<br />
Pyridins substitutionsstruktur – et langt sejt træk<br />
Det er molekylernes inertimomenter, der i sidste ende bestemmer<br />
mikrobølgespektrenes absorptioner. Derfor får man højst<br />
3 oplysninger ud<br />
af at tyde et molekylesmikrobølgespektrum;<br />
for<br />
plane molekyler<br />
som pyridin er det<br />
kun 2.<br />
I pyridin er der<br />
i princippet 11<br />
atomer, som skal<br />
fastlægges, før en<br />
struktur er <strong>på</strong> plads<br />
(figur 1).<br />
Figur 1. Pyridin med de indlagte hovedakser.<br />
Inertimomentet om c-aksen, som er vinkelret <strong>på</strong><br />
molekylets plan, er lig med summen af inertimomenterne<br />
om a-aksen og b-aksen.<br />
Særudgave dansk kemi, af: 91, dansk nr. 8, kemi, 201091,<br />
nr. 8, 2010<br />
Pga. molekylets<br />
symmetri er der<br />
kun 7 ikke-ækvivalente<br />
atomer.<br />
26<br />
Molekylets planearitet betyder, at der kun kræves 2 koordinater<br />
pr. atom. For at fastlægge de 7 atomers positioner kræves der<br />
10 uafhængige strukturparametre i form af bindingslængder og<br />
-vinkler. Da mikrobølgespektrene af hvert nyt isotopsubstitueret<br />
molekyle bidrager med 2 inertimomenter, burde det være nok at<br />
optage mikrobølgespektre af 5 ”isotoper” af pyridin inklusive<br />
”modermolekylet”.<br />
Imidlertid er der gode grunde til at indføre ”substitutionsstrukturen”,<br />
hvor man erstatter atomet i hver af de 7 positioner<br />
med en isotop. Differenserne mellem modermolekylets og det<br />
isotopsubstituerede molekyles inertimomenter bruges til at fastlægge<br />
koordinaterne x, y for det substituerede atom vha. Kraitchmanns<br />
formler (1953) (se artikel 1, nr. 5, side 23-25).<br />
I tabel 1 ses koordinaterne og i tabel 3 substitutionsstrukturen<br />
for pyridin.<br />
Det kemiske arbejde med at syntetisere de specifikt mærkede<br />
molekyler er en formidabel opgave. Den blev løst ved KL5 for<br />
pyridin og for flere af de 5-leddede heterocykler. Der er særlig<br />
ét navn, der bør nævnes i denne sammenhæng: nu afdøde magister<br />
Jørgen Tormod Nielsen (JTN). Han forestod, enten alene eller<br />
sammen med talrige specialestuderende og amanuenser, det<br />
kolossale syntesearbejde. (En af os (TP) og nu ligeledes afdøde<br />
cand.polyt. Georg Ole Sørensen brugte adskillige måneder med<br />
modelforsøg før det endelige: at erstatte O i furan med 15 NH<br />
for at opnå 15 N-pyrrol, i et pyrolyse-eksperiment hvor furan og<br />
15 NH3 blev ledt gennem et flere hundrede grader varmt kvartsrør).<br />
Sjovt nok har JTN ikke været involveret i fremstillingen af<br />
pyridin-molekylets isotopsubstituerede.<br />
Pyridinstrukturbestemmelsens Odyssé<br />
strækker sig over knap 25 år<br />
Og det er muligt at følge den ved at nærlæse de artikler, der blev<br />
udgivet i perioden. Her gengivet i korte resumeer.<br />
1 (1953) Microwave Investigation of Pyridine; BB, JRA;<br />
JCP 21; 1305-1306.<br />
21 linjer beregnes ud fra en model og sammenlignes med
Atom a B<br />
N –1,3923±0,0004<br />
C(2) –0,6928±0,0004 1,1401±0,0003<br />
C(3) 0,6999±0,0004 1,1953±0,0003<br />
C(4) 1,4124±0,0002<br />
H(2) –1,27588±0,00001 2,05689±0,00002<br />
H(3) 1,20561±0,00002 2,15254±0,00004<br />
H(4) 2,49423±0,00001<br />
Tabel 1. r s -koordinater for pyridin.<br />
“strong lines”, det passer ikke alt for godt, og konklusionen skal<br />
senere vise sig at være overoptimistisk.<br />
2 Forkortelse (1953) Pyridinmolekylets Fulde navn/status struktur; BB; Kemisk Maanedsblad;<br />
BB 34; 43-46. Børge Bak (†)/Professor<br />
I<br />
JRA<br />
denne afhandling<br />
John<br />
i Kemisk<br />
Rastrup-Andersen<br />
Maanedsblad<br />
(†)/amanuensis<br />
(der senere blev til<br />
Dansk Kemi) giver BB en redegørelse for resultaterne, som blev<br />
fundet LH/LN i 1. De skal Lise senere Hansen/Lise vise sig at være Nygaard forkerte (†) lektor jfr. 3. Konklusion:<br />
NCK ”Al begyndelse Niels Clauson-Kaas er svær”. (†)/uafhængig<br />
GOS Georg Ole Sørensen (†)/lektor<br />
3 (1954) Microwave Spectrum of Pyridine; BB, LH, JRA;<br />
JCP<br />
LM<br />
22; 565.<br />
Leo Mahler/specialestuderende<br />
Amerikanske NRA forskere Niels har Rastrup-Andersen/specialestuderende<br />
i mellemtiden foretaget en egentlig<br />
tilordning FM af pyridins Fernando mikrobølgespektrum Mata/spansk videnskabsmand<br />
i den forstand, at<br />
de har fundet de 3 rotationskonstanter, der kan reproducere<br />
spektret.<br />
MJQ Atom<br />
BB og medarbejdere<br />
María a José Quintana/ B<br />
må krybe til korset og erklære sig<br />
N –1,3923±0,0004<br />
spansk videnskabskvinde<br />
enige.<br />
C(2) –0,6928±0,0004 1,1401±0,0003<br />
† vedkommende er nu afdød.<br />
4 (1954) C(3) Mikrobølgeundersøgelser 0,6999±0,0004 <strong>på</strong> Københavns 1,1953±0,0003 Universitet<br />
C(4) Kemisk Laboratorium; 1,4124±0,0002 BB; Kemisk Maanedsblad; 35;<br />
81-84.<br />
H(2) –1,27588±0,00001 2,05689±0,00002<br />
For BB er strukturen alfa og omega, men med 10 strukturparametre<br />
H(3) forekommer 1,20561±0,00002 det lidt futilt at gætte 2,15254±0,00004<br />
<strong>på</strong> en struktur. Dog må<br />
det H(4) medgives, at 2,49423±0,00001<br />
gruppen nu har inddraget de 3 monodeutererede<br />
pyridiner (se videre i 5), så der nu er 8 uafhængige oplysninger.<br />
(Husk, at kun 2 af de 3 inertimomenter tæller med, fordi<br />
molekylet er plant).<br />
Forkortelse Parameter<br />
Eksperimenter<br />
MW Fulde navn/status ED+<br />
QCC <strong>på</strong> PC<br />
a b<br />
22 min 6t 27 min<br />
BB NC(2) 1,3376 Børge Bak 1,344 (†)/Professor 1,3402 1,3337<br />
JRA C(2)C(3)<br />
C(3)C(4)<br />
LH/LN<br />
C(2)H(2)<br />
1,3938 John Rastrup-Andersen 1,399 1,3985 (†)/amanuensis 1,3905<br />
1,3916 1,398 1,3963 1,3883<br />
Lise Hansen/Lise Nygaard (†) lektor<br />
1,0865 1,059(av) 1,0924 1,0841<br />
NCK C(3)H(3) 1,0826 Niels Clauson-Kaas Do. (†)/uafhængig 1,0901 1,0812<br />
GOS C(4)H(4) 1,0818 Georg Ole Do. Sørensen (†)/lektor 1,0907 1,0818<br />
LM<br />
C(6)NC(2)<br />
NC(2)C(3)<br />
NRA<br />
C(2)C(3)C(4)<br />
116,94<br />
Leo Mahler/specialestuderende<br />
116,1 117,30 117,43<br />
123,80 124,6 123,62 123,50<br />
118,53<br />
Niels Rastrup-Andersen/specialestuderende<br />
117,8 118,49 118,51<br />
FM NC(2)H(2) 116,01 Fernando 115,2 Mata/spansk 116,13 videnskabsmand 116,17<br />
MJQ C(2)C(3)H(3)<br />
Ringvinklers<br />
sum<br />
120,12 María José Mangler Quintana/ 120,23<br />
720 spansk videnskabskvinde<br />
718,8 720,00<br />
120,23<br />
720,01<br />
a b<br />
B3LYP/ aug cc-PVDZ † vedkommende B3LYP/ aug er nu cc-PVTZ afdød.<br />
Tabel 2. Forkortelser af navne brugt i oversigten samt status.<br />
27<br />
BB Børge Bak (†)/Professor<br />
JRA John Rastrup-Andersen (†)/amanuensis<br />
LH/LN Lise Hansen/Lise Nygaard (†) lektor<br />
NCK Niels Clauson-Kaas SPEKTROSKOPI<br />
(†)/uafhængig<br />
GOS Georg Ole Sørensen (†)/lektor<br />
5 (1954) Microwave Determination of the Structure of Pyri-<br />
LM Leo Mahler/specialestuderende<br />
dine; BB, LH, JRA; JCP 22; 2013-2017.<br />
Her NRA kommer forskrifterne Niels Rastrup-Andersen/specialestuderende<br />
for fremstillingen af [2-D]-, [3-D]- og<br />
[4-D]-pyridinerne. FM Fernando De starter Mata/spansk fra brompyridinerne videnskabsmand for positionerne<br />
MJQ 2 og 3 og fra María chlorpyridin José Quintana/ for 4-positionen. I alle tilfælde<br />
tilsættes zinkpulver spansk og Dvidenskabskvinde SO . Oprensningen sker via et kom-<br />
2 4<br />
pleks med HgCl og HCl (et såkaldt Ladenburg-kompleks),<br />
2<br />
hvorfra pyridinen † siden vedkommende frigøres med er nu NaOH-pulver. afdød.<br />
Nu følger optagelsen og tydningen af spektrene samt beregningen<br />
af rotationskonstanterne.<br />
De 8 uafhængige inertimomenter bruges til at fastlægge en<br />
partiel struktur, idet der gættes <strong>på</strong> CH-afstandene. Der må have<br />
været pres <strong>på</strong>, siden vi hele tiden skal have præmature strukturer.<br />
Det er som om, det at fremstille de isotopsubstituerede molekyler<br />
og tyde og forstå spektrene ikke er nok, selvom det trods<br />
alt er her, tyngden i arbejdet ligger.<br />
Eksperimenter QCC <strong>på</strong> PC<br />
Parameter MW ED+<br />
a<br />
22 min<br />
b<br />
6t 27 min<br />
NC(2) 1,3376 1,344 1,3402 1,3337<br />
C(2)C(3) 1,3938 1,399 1,3985 1,3905<br />
C(3)C(4) 1,3916 1,398 1,3963 1,3883<br />
C(2)H(2) 1,0865 1,059(av) 1,0924 1,0841<br />
C(3)H(3) 1,0826 Do. 1,0901 1,0812<br />
C(4)H(4) 1,0818 Do. 1,0907 1,0818<br />
C(6)NC(2) 116,94 116,1 117,30 117,43<br />
NC(2)C(3) 123,80 124,6 123,62 123,50<br />
C(2)C(3)C(4) 118,53 117,8 118,49 118,51<br />
NC(2)H(2) 116,01 115,2 116,13 116,17<br />
C(2)C(3)H(3) 120,12 Mangler 120,23 120,23<br />
Ringvinklers<br />
sum<br />
720 718,8 720,00 720,01<br />
a b<br />
B3LYP/ aug cc-PVDZ B3LYP/ aug cc-PVTZ<br />
Tabel 3. Pyridins r s -struktur, 3 strukturer fundet dels ved ED+ (elektrondiffraktion<br />
plus oplysninger fra mikrobølge (MW) og ab-initio (QCC)-beregninger,<br />
jfr. W. Pyckhout et al., J. Mol. Struct., 156(1987) 315-329) og dels ved<br />
QCC (ved NWL).<br />
6 (1955) MW-spectra of Deuterated Pyridines; Structure of<br />
Pyridine; BB, LH, JRA; Microchim Acta; 512-516.<br />
Dette er i det store og hele en gentagelse af 5.<br />
7 (1958) Synthesis of 2-13C and 3-13C Pyridines; BB, NCK;<br />
Acta Chem Scand; 995-998<br />
4 sider i Acta er, hvad det kan blive til med disse 2 vildt imponerende<br />
totalsynteser. De starter begge med en blanding<br />
af KCN og K13CN. For at komme til [2-13C]-pyridin reageres<br />
cyanidet med 1,3-dibrompropan, herved fås glutarsyredinitril,<br />
hvor der er 13C i den ene nitrilgruppe. Ved en omsætning med<br />
63% eddikesyre dannes glutarsyreimid, der først reduceres med<br />
LiAlH til 2,5 dihydroxypiperidin, som dernæst oxideres med<br />
4<br />
sølvacetat til slutproduktet.<br />
For at komme til [3-13C]-pyridin reagerer cyaniderne først<br />
med chloreddikesyre. Herved erstattes Cl med CN, dernæst forestres<br />
både cyanidgruppen og COOH-gruppen med ethanol til<br />
malonsyrediethylester. Nu reduceres og halogeneres denne ester<br />
til 1,3-dibrompropan, og så går det ellers videre som for 2-13C pyridin. Disse og andre lignende totalsynteser blev laboratoriet<br />
berømt for (og der kommer endnu 2 for pyridin jfr. 9).<br />
t<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 8, 2010
SPeKTroSKoPI<br />
10 (1974) MW-spectra of<br />
Forfatterne Niels Wessel Larsen (tv.) og Thorvald Pedersen (th.) foran MW-spektrometret.<br />
Foto: Michael Barrett Boesen.<br />
8 (1958) Complete Structure of Pyridine by MW-Spectra;<br />
BB, LHN, JRA; J. Mol. Spec. 2; 361-368<br />
Så får vi igen en ”komplet” struktur, som mangler 3 CCH-vinkler.<br />
Måske var substitutionsmetoden ikke (aner)kendt <strong>på</strong> det<br />
tidspunkt, men en substitutionsstruktur er i hvert fald ikke, det<br />
vi får her. Den kommer først til i 1974, jfr. 10, efter synteserne<br />
af de 2 sidste manglende isotoper, jfr. 9.<br />
15N and 4-13C Pyridine; GOS, LM, NRA; J. Mol.<br />
Structure; 119-126<br />
Det fortaber sig i glemslen, hvorfor der<br />
skulle gå 9 år mellem syntesen af de 2<br />
molekyler og optagelsen af deres mikrobølgespektre.<br />
Men BB er nok gået i gang<br />
med andre projekter som f.eks. NMR, som<br />
han også fik sat i værk <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong>. Også det,<br />
at han ikke er med <strong>på</strong> afhandlingen, tyder<br />
<strong>på</strong> dette. Det kan være forklaringen <strong>på</strong>, at<br />
ordet ”structure” ikke nævnes i titlen, <strong>på</strong><br />
trods af at r -strukturen nu ser dagens lys,<br />
s<br />
den ultimative struktur set med mikrobølge-øjne.<br />
Koordinaterne, som de er fundet<br />
ud fra differenser mellem modermolekylets<br />
og det specifikt mærkede molekyle jfr.<br />
Kraitchmanns formler fik lov at stå i 3 år,<br />
Molekyle før Publikationsår<br />
de blev revideret i 1977 jfr. 11.<br />
Furan 1955; 1955; 1962; 1962; 1962; 1978<br />
Pyrrol 11 1956; (1977) 1964; Microwave 1969 Spectra of Pyridine<br />
Thiophen and 1956: Monodeuterated 1960; 1961 Pyridines. Revised<br />
Thiazol Molecular 1962;1971 Structure of Pyridine. FM,<br />
1,3,4-Thiadiazol MJQ, 1962; GOS; 1965; J. 1966; Mol. 1971 Struct.42; 1-5.<br />
I dette 1,3,4-Oxadiazol arbejde repareres 1966; der <strong>på</strong> 1972 nogle gamle målinger jfr. 5.<br />
Problemet Pyrazol er, at N-atomet 1974 i pyridin har en såkaldt kvadrupolkerne<br />
1,2,3-Triazol (en atomkerne med 1974 et elektrisk kvadrupolmoment), som<br />
interagerer Pyridin-N-oxid med rotationen, 1983 så de enkelte rotationslinjer får en<br />
finstruktur, Ethylenimin der ytrer sig 1971; som 1972 en forbredning af linjerne med en<br />
nedsat præcision <strong>på</strong> målingerne til følge, dersom finstrukturen<br />
er uopløst. I de nye målinger, som publiceres, er finstrukturen<br />
opløst, så frekvenserne nu er mere nøjagtige. Det fører til en<br />
bedre bestemmelse af hydrogenatomernes koordinater, også<br />
strukturen bliver markant forbedret.<br />
9 (1965) Preparation of 15N and 4-13C Pyridine; BB, GOS,<br />
LM; Acta Chem. Scand.; 19; 2001-2002<br />
Syntesen af [ 15N]-pyridin tager udgangspunkt i glutaconsyredialdehyd,<br />
OCH–CH=CH–CH –CHO. Det blev omsat med<br />
2<br />
15NH4NO , og uden nærmere detaljer om mekanismen kom der<br />
3<br />
[ 15N]- pyridin ud af det.<br />
Syntesen af [4-13C]-pyridin begynder med Ba14CO . Herfra<br />
3<br />
frigøres 14CO , som reduceres til formaldehyd. Igen uden forkla-<br />
2<br />
rende reaktionsligninger får vi at vide, at formaldehyd plus ammoniak<br />
omsættes med CH –CO–CH –COOC H (aceteddike-<br />
3 2 2 5<br />
syreethylester; systematisk: 3-oxobutansyreethylester), og at det<br />
efter et par trin giver [4-13C]-2,3,5,6-pyridintetracarboxylsyre, som decarboxyleres til det ønskede produkt. Puha, sikke en<br />
omgang og den blev kun fundet værdig til 1½ side i Acta.<br />
Molekyle Publikationsår<br />
Furan 1955; 1955; 1962; 1962; 1962; 1978<br />
Pyrrol 1956; 1964; 1969<br />
Thiophen 1956: 1960; 1961<br />
Thiazol 1962;1971<br />
1,3,4-Thiadiazol 1962; 1965; 1966; 1971<br />
1,3,4-Oxadiazol 1966; 1972<br />
Pyrazol 1974<br />
1,2,3-Triazol 1974<br />
Pyridin-N-oxid 1983<br />
Ethylenimin 1971; 1972<br />
Tabel 4. Strukturer af heterocykler.<br />
Særudgave dansk kemi, af: 91, dansk nr. 8, kemi, 2010 91, nr. 8, 2010<br />
28<br />
Molekyle Publikationsår<br />
Fluorbenzen 1957; 1966; 1968<br />
Phenol 1969; 1969; 1974; 1979<br />
Nitrobenzen 1971; 1971; 1971<br />
Benzonitril 1961; 1962; 1962; 1971<br />
Anilin 1974<br />
Phenylphosphin 1987<br />
Dioxadiazathiapentalen 1977; 1984<br />
Cyklobuten 1968; 1968; 1969; 1969<br />
Tabel 5. Strukturer af benzenderivater og andre cykliske molekyler.<br />
Litteraturhenvisningerne er af pladshensyn lagt ud <strong>på</strong> Dansk<br />
Kemis hjemmeside, www.danskkemi.dk, hvorfra man kan hente<br />
dem.<br />
Rettelse – I 1. artikel - side 24, øverst i venstre spalte – skal<br />
formlen for det lineære molekyles absorptionsfrekvenser ændres<br />
til: n = 2B(J+1).<br />
E-mail-adresser<br />
Niels Wessel Larsen: nwl@kiku.dk<br />
Thorvald Pedersen: thorpe@tdcadsl.dk
Litteraturhenvisninger til artiklerne<br />
<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong> (I og II)<br />
Af N.W. Larsen og T. Pedersen<br />
Heterocykler<br />
Furan<br />
B. Bak, L. Hansen og J. Rastrup-Andersen: Microwave spectra of<br />
deuterated furans. Structure of the furan molecule. Disc. Faraday Soc.<br />
19, 30-38 (1955)<br />
L. Nygaard: Furans molekylspektre, struktur og thermodynamiske<br />
funktioner. Licentiatafhandling, DTH (1955)<br />
B. Bak, J. Tormod Nielsen og M. Schottländer: Synthesis of alpha-<br />
and beta carbon isotopically labelled furans. Acta Chem. Scand. 16,<br />
123-126 (1962).<br />
B. Bak, J. Tormod Nielsen og M. Schottländer: Preparation of 18Olabelled<br />
furan.<br />
Acta Chem. Scand. 16, 771 (1962).<br />
B. Bak, D. Christensen, W.B. Dixon, L. Hansen Nygaard, J. Rastrup<br />
Andersen og M. Schottlander: The complete structure of furan. J.<br />
Mol. Spectrosc. 9, 124 129 (1962).<br />
F. Mata, M.C. Martin og G.O. Sørensen: Microwave spectra of deuterated<br />
furans. Revised molecular structure of furan. J. Mol. Structure<br />
48, 157-163 (1978)<br />
Pyrrol<br />
B. Bak, D. Christensen, L. Hansen og J. Rastrup-Andersen: Microwave<br />
determination of the structure of pyrrole. J. Chem. Phys. 24,<br />
720-725 (1956)<br />
B. Bak, T. Pedersen og G.O. Sørensen: Preparation of 2-13C, 3-13C<br />
and 15N enriched pyrroles. Conversion of furan to pyrrole. Acta<br />
Chem. Scand. 18, 275-276 (1964).<br />
L. Nygaard, J. Tormod Nielsen, J. Kirchheiner, G. Maltesen, J.<br />
Rastrup- Andersen og G.O. Sørensen: Microwave spectra of isotopic<br />
pyrroles. Molecular structure, dipole moment and 14N quadrupole<br />
coupling constants of pyrrole. J. Mol. Structure 3, 491-506 (1969)<br />
Thiophen<br />
B. Bak, D. Christensen, J. Rastrup-Andersen og E. Tannenbaum:<br />
Microwave spectra of thiophene, 2- and 3-monodeutero, 3,3'-dideutero,<br />
and tetradeuterothiphene. Structure of the thiophene molecule. J.<br />
Chem. Phys. 25, 892-896 (1956)<br />
B. Bak, J. Christiansen og J. Tormod Nielsen: Preparation of carbon<br />
isotopically labelled thiophenes. Acta Chem. Scand. 14, 1865-1866<br />
(1960)<br />
B. Bak, D. Christensen, L. Hansen Nygaard og J. Rastrup-Andersen:<br />
The structure of thiophene.<br />
J. Mol. Spectrosc. 7, 58 63 (1961)<br />
Thiazol<br />
B. Bak, D.H. Christensen L. Hansen Nygaard og J. Rastrup Andersen:<br />
Microwave spectrum and dipole moment of thiazole. J. Mol. Spectrosc.<br />
9, 222 224 (1962)<br />
L. Nygaard, E. Asmussen, J.H. Høg, R.C. Mahaswari, C.H. Nielsen,<br />
I.B. Petersen, J. Rastrup-Andersen og G.O. Sørensen: Microwave<br />
spectra of isotopic thiazoles. Molecular structure and 14N quadrupole<br />
coupling constants of thiazole. J. Mol. structure 8, 225-233 (1971),<br />
erratum ibid 9, 220 (1971)<br />
1,3,4-thiadiazol<br />
B. Bak, D. Christensen, L. Hansen Nygaard, L. Lipschitz og<br />
J. Rastrup Andersen: Microwave spectra of 1,3,4 thiadiazole and 34S<br />
1,3,4 thiadiazole. Dipole moment of 1,3,4 thiadiazole. J. Mol. Spectrosc.<br />
9, 225 227 (1962)<br />
B. Bak, C. Hylling Christensen, D. Christensen, T. Stroyer Hansen, E.<br />
Jonas Pedersen og J. Tormod Nielsen: Preparation of 1,3,4 thiadiazol<br />
and its (2-D),<br />
(2,5-D2),(2 13C), and (3-15N) isotopic species. Acta Chem. Scand.<br />
19, 2434 2435 (1965)<br />
B. Bak, L. Nygaard, E. Jonas Pedersen og J. Rastrup-Andersen: Microwave<br />
spectra of isotopic 1,3,4 thiadiazoles. Molecular structure of<br />
1,3,4 thiadiazole.<br />
J. Mol. Spectrosc. 19, 283 289 (1966)<br />
L. Nygaard, R. Lykke Hansen og G.O. Sørensen: Nuclear quadrupole<br />
coupling and centrifugal distortion in the microwave spectrum of<br />
1,3,4-thiadiazole. J. Mol. Structure 9, 163-172 (1971)<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 5/8, 2010<br />
1,3,4-oxadiazol<br />
B. Bak, J. Tormod Nielsen, O. Faurskov Nielsen, L. Nygaard, J.<br />
Rastrup-Andersen og P.A. Steiner: Microwave spectrum and dipole<br />
moment of 1,3,4-oxadiazole. J. Mol. Spectrosc. 19, 458-460 (1966)<br />
L. Nygaard, R. Lykke Hansen, J. Tormod Nielsen, J. Rastrup-Andersen,<br />
G.O. Sørensen og P.A. Steiner: Microwave spectra of isotopic<br />
1,3,4-oxadiazoles. Molecular structure, 14N quadrupole coupling<br />
constants, and centrifugal distortion constants of 1,3,4-oxadiazole.<br />
J. Mol. Structure 12, 59-69 (1972).<br />
Pyrazol<br />
L. Nygaard, D. Christen, J. Tormod Nielsen, E. Jonas Pedersen, O.<br />
Snerling, E. Vestergaard og G.O. Sørensen: Microwave spectra of<br />
isotopic pyrazoles and molecular structure of pyrazole.<br />
J. Mol. Structure 22, 401-413 (1974)<br />
1,2,3-Triazol<br />
G.O. Sørensen, L. Nygaard og M. Begtrup: Microwave spectrum of<br />
1-deuterio-1,2,3-triazole.<br />
J. Chem. Soc. Chem. Comm. 605-606 (1974)<br />
Pyridin-N-Oxid<br />
G.O. Sørensen, Å. Tang-Pedersen og E. Jonas Pedersen: Preparation<br />
and microwave spectra of [18O]pyridine N-oxide and deuterated pyridine<br />
N-oxide. Complete molecular structure of pyridine N-oxide. J.<br />
Mol. Structure 101, 263-268 (1983)<br />
Ethylenimin<br />
B. Bak og S. Skaarup: The substitution structure of ethylenimine.<br />
J. Mol. Structure 10, 385-391 (1971)<br />
S. Skaarup: Ethylenimine inversion barrier and CH2group twist. Acta<br />
Chem. Scand. 26, 4190-4192 (1972)<br />
Benzenderivater etc.<br />
Fluorbenzen<br />
B. Bak, D. Christensen, L. Hansen-Nygaard og E. Tannenbaum: Microwave<br />
determination of the structure of fluorobenzene. J. Chem.<br />
Phys. 26, 134-137 (1957)<br />
I. Bojesen og T. Pedersen: Preparation of a mixture of<br />
mono-13C-fluorobenzenes.<br />
Acta Chem. Scand. 20, 895-896 (1966)<br />
L. Nygaard, I. Bojesen, T. Pedersen og J. Rastrup-Andersen: Structure<br />
of fluorobenzene.<br />
J. Mol. Structure 2, 209-215 (1968).<br />
Phenol<br />
T. Pedersen og N. Wessel Larsen: Preparation of 2-D, 3-D and<br />
4-D-phenol.<br />
J. Labelled Comp. 5, 196-196 (1969)<br />
T. Pedersen, N. Wessel Larsen og L. Nygaard: Microwave spectra of<br />
the six monodeuteriophenols. Molecular structure, dipole moment,<br />
and barrier to internal rotation of phenol. J. Mol. Structure 4, 59-77<br />
(1969).<br />
N. Wessel Larsen: En mikrobølge- og fjern-infrarødspektroskopisk<br />
undersøgelse af struktur og indre rotation af phenol, 4-halogenphenol<br />
og thiophenol. Licentiatafhandling, KU (1974)<br />
N. Wessel Larsen: Microwave spectra of the six mono-13C-substituted<br />
phenols and of some monodeuterated species of phenol. Complete<br />
substitution structure and absolute dipole moment. J. Mol. Structure<br />
51, 175-190 (1979)<br />
Nitrobenzen<br />
J.H. Høg, L. Nygaard og G.O. Sørensen: Microwave spectrum and<br />
planarity of nitrobenzene. J. Mol. Structure 7, 111-121 (1971)<br />
J.H. Høg: Synthesis of o-, m- and p-deuterio, [15N]- and mono[18O]<br />
nitrobenzene. J. Labelled Comp. 7, 179-181 (1971)<br />
J.H. Høg: A study of nitrobenzene. Microwave spectra, force field,<br />
molecular structure, inertial defect and vibrationally excited states.<br />
Licentiatafhandling, KU (1971).
Benzonitril<br />
B. Bak, J. Tormod Nielsen og L. Lipschitz: Preparation of benzonitrile,<br />
isotopically labelled in the cyanide group. Acta Chem. Scand.<br />
15, 949 (1961)<br />
B. Bak, D. Christensen, W.B. Dixon, L. Hansen Nygaard og J.<br />
Rastrup- Andersen: Benzene ring distortion by one substituent. Microwave<br />
determination of the complete structure of benzonitrile. J.<br />
Chem. Phys. 37, 2027 2031 (1962)<br />
B. Bak, D. Christensen, W.B. Dixon, L. Hansen Nygaard og J.<br />
Rastrup- Andersen: Benzene ring distortion by one substituent. Microwave<br />
determination of the complete structure of benzonitrile. J.<br />
Chem. Phys. 37, 2027 2031 (1962)<br />
B. Bak, J.J. Christiansen, L. Lipschitz og J. Tormod Nielsen: Preparation<br />
of 1-13C enriched benzonitrile, mono-13C enriched benzene, and<br />
a mixture of mono-13C enriched benzonitriles. Acta Chem. Scand. 16,<br />
2318-2320 (1962)<br />
J. Casado, L. Nygaard og G.O. Sørensen: Microwave spectra of isotopic<br />
benzonitriles. Refined molecular structure of benzonitrile. J. Mol.<br />
Structure 8, 211-224 (1971)<br />
Anilin<br />
D.G. Lister, J.K. Tyler, J.H. Høg og N. Wessel Larsen: The microwave<br />
spectrum, structure and dipole moment of aniline. J. Mol. Structure<br />
23, 253-264 (1974)<br />
Phenylphosphin<br />
N. Wessel Larsen og T. Steinarsson: Conformation, barrier to internal<br />
rotation, and structure of the PH2-group in phenylphosphine, studied<br />
by microwave spectroscopy. J. Mol. Spectrosc. 123, 405-425 (1987)<br />
1,6-dioxa-2,5-diaza-6aë4-thiapentalen<br />
T. Pedersen, S.V. Skaarup og C.T. Pedersen: Structure and dipole moment<br />
of 1,6-dioxa-6aë4-thiapentalene from microwave spectra. Acta<br />
Chem. Scand. B31, 711-718 (1977)<br />
N. Wessel Larsen, L. Nygaard, T. Pedersen, C.T. Pedersen og H.<br />
Davy: Structure and electric dipole moment of 1,6-dioxa-2,5-diaza-<br />
6aë4-thiapentalene from microwave spectra. J. Mol. Structure 118,<br />
89-95 (1984)<br />
Cyclobuten<br />
B. Bak og J.J. Led: Preparation of [1-13C], [3-13C], [1-D], and [3-D]<br />
enriched cyclobutenes. J. Labelled Comp. 4, 22-27 (1968)<br />
J.J. Led: Præparation og mikrobølgespektre af cyclobuten samt [1-<br />
13C]-, [3-13C]-, [1-D]- og<br />
[3-D]-cyclobuten. Cyclobutens struktur. Licentiatafhandling, DTH<br />
(1968)<br />
B. Bak, J.J. Led, L. Nygaard, J. Rastrup-Andersen og G.O. Sørensen:<br />
Microwave spectra of<br />
isotopic cyclobutenes. Molecular structure of cyclobutene. J. Mol.<br />
Structure 3, 369-378 (1969)<br />
B. Bak og J.J. Led: Bent bonds in cyclopropane, cyclobutenes. Molecular<br />
structure of cyclobutene. J. Mol. Structure 3, 379-384 (1969)<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 5/8, 2010<br />
Strukturer af nogle ikke-cykliske molekyler<br />
B. Bak, E. Stenberg Knudsen, E. Madsen og J. Rastrup-Andersen:<br />
Preliminary analysis of the microwave spectrum of ketene. Phys. Rev.<br />
79, 190 (1950)<br />
B. Bak, R. Sloan og D. Williams: Microwave investigation of SCSe.<br />
Phys. Rav. 80, 101-102 (1950)<br />
B. Bak, J. Bruhn og J. Rastrup-Andersen: Microwave spectrum and<br />
structure of SiD3F. J. Chem. Phys. 21, 753-754, (1953)<br />
B. Bak, J. Bruhn og J. Rastrup-Andersen: Microwave spectrum and<br />
structure of SiD3Cl. J. Chem. Phys. 21, 753-754, (1953)<br />
F.A. Andersen, B. Bak og J. Rastrup-Andersen: Microwave investigation<br />
of tertiary butyl fluoride. Acta Chem. Scand. 7, 643-651 (1953)<br />
B. Bak, D. Christensen, L. Hansen-Nygaard og E. Tannenbaum: Microwave<br />
determination of the structure of trifluorobutyne. J. Chem.<br />
Phys. 26, 241-243 (1957)<br />
B. Bak, L. Hansen-Nygaard og J. Rastrup-Andersen: The structure of<br />
tertiary butyl isocyanide. J. Mol. Spectrosc. 2,54-57 (1958)<br />
B. Bak, D. Christensen, L. Hansen-Nygaard og J. Rastrup-Andersen:<br />
The structure of vinyl fluoride. Spectrochim. Acta 13, 120-124 (1958)<br />
B. Bak, S. Detoni, L. Hansen-Nygaard, J. Tormod Nielsen og J.<br />
Rastrup- Andersen: Microwave determination of the structure of ethyl<br />
fluoride. Spectrochim. Acta 16, 376-383 (1960)<br />
D.R. Lide, Jr. og D. Christensen: An improved structure determination<br />
for vinyl fluoride. Spectrochim. Acta 17, 665-668 (1961)<br />
D.R. Lide Jr. (NBC, Washington) og D. Christensen: Molecular structure<br />
of propylene. J. Chem. Phys. 35, 1374 1378 (1961)<br />
B. Bak, D. Christensen, J. Christiansen, L. Hansen Nygaard og<br />
J. Rastrup Andersen: Microwave spectrum and internal barrier of<br />
rotation of methyl ketene. Spectrochim. Acta 18, 1421 1424 (1962)<br />
B. Bak, S. Detoni, L. Hansen-Nygaard og J. Rastrup-Andersen: Microwave<br />
investigation of ethyl fluoride (Bologna, 1959). Adv. Mol.<br />
Spectrosc. Pergamon (1962)<br />
B. Bak, J. Christiansen og J. Tormod Nielsen: Preparation of 300-500<br />
mg quantities of isotopic methyl ketenes. Acta Chem. Scand. 19, 2252-<br />
2253 (1965)<br />
B. Bak, J.J. Christiansen, K. Kunstmann, L. Nygaard og J. Rastrup-<br />
Andersen: Microwave spectrum, molecular structure, barrier to internal<br />
rotation, and dipole moment of methylketene. J. Chem. Phys. 45,<br />
883-887 (1966)<br />
L. Nygaard: A revised structure of ethyl fluoride. Spectrochim. Acta<br />
22, 1261-1266 (1966)<br />
E. Hirota, R. Sugisaki, C.J. Nielsen og G.O. Sørensen: Molecular<br />
structure and internal motion of formamide from microwave spectrum.<br />
J. Mol. Spectrosc. 49, 251-267 (1974)<br />
M. Stubgaard: En mikrobølgespektroskopisk undersøgelse af formamids<br />
struktur. Licentiatafhandling, KU (1978)<br />
G.O. Sørensen, T. Pedersen, H. Dreizler, A. Guarnieri og A.P. Cox:<br />
Microwave spectra of nitromethane and D3-nitromethane. J. Mol.<br />
Structure 97, 77-82 (1983)
SPeKtroSKoPI<br />
I 4 artikler, hvoraf dette er den 3., vil vi omtale den forskning, som er udført ved hjælp af mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Kemisk<br />
Institut ved Københavns Universitet (<strong>KIKU</strong>). Anledningen er, at den sidste fastansatte medarbejder (NWL) nu er gået <strong>på</strong> pension,<br />
og at afdelingen nedlægges. Det spektroskopiske laboratorium flyttede fra UKL <strong>på</strong> Nørrevold til H.C. Ørsted Instituttet i 1963 og<br />
frem til 2004 hed det Kemisk Laboratorium 5 (KL5), en betegnelse, der benyttes i artiklerne.<br />
<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong> -<br />
phenol<br />
Med phenol som eksempel analyseres resultater fra mikrobølgespektrene<br />
Af niels Wessel larsen og thorvald Pedersen<br />
Tidligere blev bestemmelsen af substitutionsstrukturer for<br />
molekyler i gasfase omtalt. I denne og den følgende artikel vil<br />
bestemmelse af potentialfunktioner for indre bevægelse med<br />
stor amplitude, specielt indre rotation, blive omtalt for endnu en<br />
række i gasfase.<br />
Det første forsøg<br />
Allerede i 1953 publicerede B.B., L.N. og J.R.A. et forsøg <strong>på</strong> at<br />
undersøge den indre rotation i molekylet 1,1,1-trifluor-2-butyn.<br />
Methylgruppen og trifluormethylgruppen er adskilt af to enkeltbindinger<br />
og en triplebinding, så man vil forvente en lav barriere<br />
eller næsten fri indre rotation. Molekylet er en symmetrisk<br />
top, og spektret består af brede linjer omkring de forventede<br />
frekvenser, 2B(J+1), jfr. artikel i majnummeret af Dansk Kemi.<br />
Linjernes bredde blev set<br />
som en virkning af den<br />
indre rotation, men man<br />
kom ikke frem til kvantitative<br />
resultater.<br />
Da man i 1967 ved<br />
KL5 begyndte at studere<br />
Figur 1. Phenol i den ene af sine to ligevægtskonfigurationer.<br />
En af hovedakserne<br />
(b-aksen) og den indre rotationsakse, som<br />
stort set falder sammen med a-aksen, er<br />
indtegnet.<br />
phenol, manifesterede<br />
den indre rotation sig helt<br />
anderledes klart. På alle<br />
de steder i spektret, hvor<br />
man for en almindelig<br />
asymmetrisk top ville<br />
forvente en enkelt linje,<br />
observeredes i stedet to<br />
linjer med en indbyrdes<br />
afstand <strong>på</strong> omkring 112<br />
MHz. Det skal her bemærkes,<br />
at bredden af de<br />
enkelte linjer kun er ca.<br />
0,1–0,5 MHz, så der er<br />
tale om en relativt stor<br />
opsplitning. Man kunne nu vælge at lade som ingenting, benytte<br />
midtpunktet mellem de to linjer som den observerede frekvens,<br />
bestemme de 3 normale inertimomenter for molekylet, endda gå<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9, 2010<br />
b<br />
50<br />
v=3<br />
v=2<br />
v=1<br />
v=0<br />
Figur 2. Potentialfunktionen i enheden cm -1 (1 cm -1 = 11,96 J/mol) for den indre<br />
rotation i phenol. Torsionsenerginiveauerne er indtegnet med blåt. For v=0 og<br />
v=1 kan tunnelopsplitningen ikke ses <strong>på</strong> figuren, mens den er tydelig for v=3.<br />
videre med isotopsubstitution og sluttelig nå frem til substitutionsstrukturen,<br />
som var KL5’s speciale. Dette blev faktisk også<br />
gjort, men naturligvis opstod interessen for at forstå, hvad der<br />
var <strong>på</strong> færde og for at finde ud af hvilke molekylære oplysninger,<br />
der kunne udledes af den nye information. Det viser sig, at<br />
den observerede opsplitning er direkte knyttet til det kvantemekaniske<br />
fænomen, tunneleffekt, og at opsplitningens størrelse<br />
er en overordentlig følsom indikator for størrelsen af energibarrieren<br />
for den indre rotation.<br />
Indre rotation og tunneleffekt, med phenol som eksempel<br />
I ligevægtsstrukturen af phenol ligger alle atomer, inkl. de to<br />
atomer i OH-gruppen i samme plan. Lad os sige at H i OHgruppen<br />
ligger til højre i molekylet, som i figur 1. Den indre<br />
rotation består nu i, at OH-gruppen drejer omkring den indre<br />
rotationsakse, mens phenylgruppen bliver liggende. Drejningen<br />
beskrives ved vinklen, g, således at for g=0˚ ser molekylet ud<br />
som i figur 1 og den potentielle energi har minimum. Energien<br />
vokser med g til et maksimum ved 90˚. Ved g=180˚ har vi igen<br />
minimum, osv. Phenol har altså to ækvivalente ligevægtskonfigurationer<br />
(g=0˚ og g=180˚), den potentielle energi beskrives
v=0<br />
v=0<br />
Figur 3. Nærbillede af grundtilstanden i phenol. De brune kurver er sandsynlighedsfordelinger<br />
(kvadratet <strong>på</strong> bølgefunktionerne) for A: en stationær<br />
tilstand; fordelingen har samme sandsynlighed i de to minima og ændres ikke<br />
med tiden. B: en lokaliseret tilstand for hvilken sandsynligheden vil oscillere<br />
mellem de to minima.<br />
ved funktionen V(g) = ½V 2 (1-cos(2g)), hvor V 2 er højden af barrieren,<br />
figur 2. De lave energiniveauer omkring minimum minder<br />
nydeligt om en harmonisk oscillator, hvis energiniveauer er<br />
givet ved kvantetallet v (v=0,1,2,…), E v /h = n(v+1/2), hvor n er<br />
den harmoniske frekvens.<br />
Sandsynligheden er den samme for at finde molekylet omkring<br />
hver af de to ækvivalente minimumskonfigurationer (figur<br />
3A), men tvinger man det til at befinde sig omkring g=0˚ (figur<br />
3B), vil det uden ydre <strong>på</strong>virkninger omdannes til den anden<br />
plane form svarende til g=180˚, selvom dets energi er langt mindre<br />
end barrieren. Dette fænomen kaldes tunneleffekten og er<br />
en konsekvens af kvantemekanikken. Da den nye form af molekylet<br />
er helt ækvivalent med den første, vil molekylet straks<br />
gå tilbage til den første form og så fremdeles. På en måde har<br />
vi at gøre med en spontan kemisk reaktion. Blot er reaktant og<br />
produkt det samme. Det skal bemærkes, at der ikke er tale om<br />
termisk molekylbevægelse; tunneleffekten er aktiv selv ved det<br />
absolutte nulpunkt.<br />
Omdannelsen fra den ene form til den anden vil ske med en<br />
ganske bestemt frekvens, kaldet tunnelfrekvensen, der præcist<br />
svarer til den opsplitning, der sker af energiniveauerne. Jo større<br />
molekylets energi er, dvs. jo nærmere det er <strong>på</strong> toppen af potentialfunktionen,<br />
desto hurtigere vil omdannelsen ske, og desto<br />
større er opsplitningen. For de to laveste niveauer er der ingen<br />
synlig opsplitning <strong>på</strong> figuren, mens det fjerde niveau er kraftigt<br />
opsplittet. I grundtilstanden for phenol (v=0) er tunnelfrekven-<br />
A<br />
B<br />
t<br />
51<br />
KOM OG BESØG OS PÅ SCANLAB D. 28-30 SEPTEMBER<br />
I FINDER OS I HAL C3-111<br />
Scanlab tilbud med op til 30% rabat <strong>på</strong> udvalgte produkter!<br />
Introduktion af nye produkter til super gode priser!<br />
FlipTube<br />
_________________<br />
Download Scanlab tilbuddene <strong>på</strong> vores web-side<br />
Ring og hør nærmere!<br />
Deltag i en lodtrækning om et<br />
“Romantisk weekendophold for 2 personer”<br />
- Medbring en kopi af annoncen eller<br />
af vores Nyhedsbrev<br />
- Gå til Biohit’s stand C2-131<br />
og udfyld deltager informationerne.<br />
- Medbring og aflever informationerne<br />
<strong>på</strong> Dandiag’s stand C3-111<br />
og du deltager i lodtrækningen.<br />
Vinderen vil blive kontaktet,<br />
samt offentlig<br />
gjort <strong>på</strong> www.dandiag.dk<br />
mandag d. 4. oktober<br />
Dandiag A/S l Mårkærvej 9 l 2630 Tåstrup<br />
T: 4343 3057 l www.dandiag.dk l dandiag@dandiag.dk<br />
Anzeige_Maskin_Aktuelt_90x130_Anzeige_Maskin_Aktuelt_90x130 24.08.10 1<br />
Eksklusiv hos DENIOS:<br />
•det største udvalg af produkter<br />
til miljøbeskyttelse og sikkerhed<br />
•professionel rådgivning i<br />
overensstemmelse med<br />
gældende bestemmelser<br />
•perfekte specialløsninger<br />
MILJØBESKYTTELSE OG SIKKERHED<br />
På rette vej med sikkerhed:<br />
Gennem mere end 20 år har DENIOS været banebrydende<br />
indenfor industriel miljøbeskyttelse og arbejdssikkerhed.<br />
Vores produkter gennemgår strenge kvalitetskontroller – selvfølgelig<br />
også med hensyn til regler, godkendelser og dokumentationer.<br />
DENIOS’ ingeniører garanterer en kompetent og individuel rådgivning,<br />
personlig tilpasning og hurtig service til enhver tid.<br />
DENIOS ApS • Dannevirkevej 6 • 7000 Fredericia • Tlf. 76 24 40 80<br />
info@denios.dk • www.denios.dk<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9, 2010
SPeKtroSKoPI<br />
Figur 4. Gradvis overgang mellem to ekstremer. Til venstre er der ingen barriere,<br />
der er fri indre rotation, og energien er proportional med kvadratet <strong>på</strong><br />
m-kvantetallet (m= 0,1,2,…). Til højre er barrieren så høj (1400 cm -1 ), at der<br />
ikke er nogen synlig opsplitning af de laveste energiniveauer – de minder om<br />
energierne for en harmonisk oscillator, hvor energiniveauerne er givet ved<br />
kvantetallet v (v=0,1,2,…), og er proportionale med v+1/2. Som altid afhænger<br />
det sete dog af øjnene der ser: Hvis man bruger meget fine mikrobølgebriller,<br />
kan man nemt se den indre rotation. Den lodrette linje angiver phenol.<br />
sen n T = 56 MHz og energiopsplitningen ΔE = hn T . Molekylet<br />
vil således omdannes 56 mio. gange pr. sekund.<br />
I ammoniak og anilin ses en helt analog tunneleffekt: den ene<br />
pyramidiske form vil omdannes til den anden i en uendelighed,<br />
som en paraply der klapper om. Den molekylære bevægelse, der<br />
kan fortsætte i omdannelsen, kaldes paraplysvingningen.<br />
I chirale molekyler, f.eks. D- og L-former af aminosyrer, må<br />
man <strong>på</strong> samme måde principielt forvente, at en D-form omdannes<br />
til den tilsvarende L-form. Barrieren er så høj i dette tilfælde,<br />
at omdannelsen vil tage ekstremt lang tid og som bekendt<br />
i praksis ikke finder sted.<br />
For mange ”almindelige” kemiske reaktioner – specielt hydrogenoverførselsreaktioner<br />
- giver tunneleffekten et væsentligt<br />
bidrag til reaktionshastigheden. Det lette hydrogenatom kan<br />
passere reaktionsbarrieren, selvom den kinetiske energi er lavere<br />
end toppen af reaktionsbarrieren. Som eksempel kan nævnes<br />
reaktioner, hvor OH-radikalet fjerner et hydrogenatom fra<br />
carbonhydrider og derved bidrager til at rense atmosfæren for<br />
methan m.m.<br />
Opsplitningens afhængighed af molekylets egenskaber<br />
Et fjerde inertimoment, I Top , er inertimomentet af den del af<br />
molekylet, der udfører den indre rotation. I phenol er det typisk<br />
OH-gruppen. Man kan principielt selv vælge, hvilken del<br />
af molekylet man vil betragte som toppen, og det viser sig, at<br />
det inertimoment, som får betydning for tunnelopsplitningens<br />
størrelse, er det reducerede inertimoment: I Red =I Top *I Ramme /<br />
(I Top +I Ramme ). Og betydningen af I Red er enorm: Udskiftes H i<br />
hydroxylgruppen med D (deuterium) bliver det reducerede iner-<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9, 2010<br />
52<br />
timoment ca. dobbelt så stort, mens tunnelfrekvensen falder fra<br />
56 MHz til 0,22 MHz. En tilsvarende virkning <strong>på</strong> opsplitningen<br />
ses ved ændring af barrierehøjden, som dog ikke kan ændres<br />
ved isotopsubstitution. I figur 4 ses, hvordan energiniveauerne<br />
ændres, når barrieren varieres fra 0 og opefter.<br />
Opsplitningen bestemmes altså hverken af barrieren eller af<br />
det reducerede inertimoment i sig selv. Det afgørende er produktet<br />
af de to: Jo større produktet V 2 *I Red er, desto mindre er<br />
opsplitningen. Bestemmelse af potentialfunktionen kræver altså<br />
kendskab til det reducerede inertimoment. Det er derfor vigtigt<br />
også at undersøge isotopsubstituerede molekyler, som kan levere<br />
den nødvendige strukturinformationen.<br />
Hvorfor er opsplitningen i spektrene dobbelt så stor som<br />
tunnelfrekvensen?<br />
De linjer, der ses i mikrobølgespektrene, er overgange fra én<br />
rotationstilstand til en anden, og begge tilstandes energiniveauer<br />
er opsplittet i en nedre og en øvre torsionstilstand, figur<br />
5. Spørgsmålet er om torsionstilstanden ændres under rotationsovergangen<br />
eller ej. I det første tilfælde bliver afstanden mellem<br />
de to linjer to gange torsionsopsplitningen, mens de to linjer<br />
falder sammen i tilfælde to. For phenol siger udvalgsreglerne, at<br />
vi har at gøre med det første tilfælde.<br />
Begrundelse for udvalgsreglerne<br />
Rotationsudvalgsreglerne afgøres<br />
af retningen af molekylets<br />
dipolmoment, mere præcist af<br />
dipolmomentets komponenter<br />
langs molekylets tre hovedakser,<br />
a, b og c. Hvis der er en dipolkomponent<br />
langs a-aksen fås<br />
a-udvalgsregler etc. I phenol falder<br />
a-aksen næsten sammen med<br />
den indre rotationsakse, mens<br />
b-aksen er vinkelret <strong>på</strong> a-aksen<br />
og ligger i molekylets plan (figur<br />
1). Der skulle altså principielt<br />
være mulighed for både a- og budvalgsregler;<br />
men det viser sig at<br />
b-komponenten er langt større end<br />
a-komponenten, så der i praksis<br />
kun ses b-inducerede overgange.<br />
Torsionsudvalgsreglerne for en<br />
Rot 2<br />
Rot 1<br />
given rotationsovergang er bestemt af, om dipolmomentet er<br />
uændret eller skifter fortegn under en indre rotation <strong>på</strong> 180˚. Af<br />
symmetrigrunde er der kun de to muligheder. Det ses at b-komponenten<br />
er bundet til OH-gruppen og derfor skifter fortegn.<br />
Det betyder, at vi har at gøre med tilfælde I, så vi i spektrene ser<br />
opsplitningen <strong>på</strong> 112 MHz.<br />
Litteraturhenvisninger er af pladshensyn lagt ud <strong>på</strong> Dansk Kemis<br />
hjemmeside, www.danskkemi.dk, hvorfra man kan hente<br />
dem.<br />
E-mail-adresser<br />
Niels Wessel Lasen: nwl@kiku.dk<br />
Thorvald Pedersen: thorpe@tdcadsl.dk<br />
Ø<br />
N<br />
Ø<br />
N<br />
I II<br />
Figur 5. Mulige overgange mellem<br />
to rotationstilstande, som<br />
begge er torsionsopsplittede i en<br />
nedre tilstand (N) og en øvre (Ø).<br />
I: torsionstilstanden ændres ved<br />
overgangen. II: torsionstilstanden<br />
bevares ved overgangen
SPeKtroSKoPi<br />
I 4 artikler, hvoraf dette er den sidste, vil vi omtale den forskning, som er udført vha. mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Kemisk Institut<br />
ved Københavns Universitet (<strong>KIKU</strong>). Anledningen er, at den sidste fastansatte medarbejder (NWL) nu er gået <strong>på</strong> pension, og at<br />
afdelingen nedlægges. Det spektroskopiske laboratorium flyttede fra UKL <strong>på</strong> Nørrevold til H.C. Ørsted Instituttet i 1963 og frem til<br />
2004 hed det Kemisk Laboratorium 5 (KL5), en betegnelse, der benyttes i artiklerne.<br />
<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong><br />
– substituerede benzenringe<br />
Teorien for indre rotation og inversion i molekyler blev beskrevet i artikel 3. Her omtales<br />
sådanne bevægelser i en række substituerede benzenringe<br />
Af Niels Wessel larsen og thorvald Pedersen<br />
De to første artikler (Dansk Kemi nr. 5 og 8, 2010) handlede<br />
om strukturbestemmelse. I artikel 3 (Dansk Kemi nr. 9, 2010)<br />
blev teorien for indre rotation og inversion beskrevet med<br />
phenol som udgangspunkt. I denne sidste artikel ser vi nærmere<br />
<strong>på</strong> disse bevægelser i et antal substituerede benzenringe og <strong>på</strong><br />
virkningen af yderligere substitution i benzenringen.<br />
Parasubstitution i phenol<br />
Et halogenatom i parastilling i phenol ændrer ikke molekylets<br />
symmetri, og det reducerede inertimoment forbliver næsten<br />
uændret; derimod kommer der en stor komponent af dipolmomentet<br />
i a-aksens retning (molekylets længderetning). I modsætning<br />
til phenol selv, hvor man kun ser de torsionsopsplittede<br />
b-rotationsovergange, ser man derfor også a-linjer, der – i hvert<br />
fald i første tilnærmelse – er uopsplittede, jfr. artikel 3. Som<br />
det fremgår af tabel 1, sænker et halogenatom i parastilling<br />
den indre rotationsbarriere. For fluor er virkningen ganske stor,<br />
nemlig 207 cm -1 eller 17%, mens den for chlor og brom kun er<br />
henholdsvis ca. 5% og ca. 3%. Figur 1 forklarer effekten vha.<br />
resonansformler.<br />
Anilin (C 6 H 5 NH 2 , figur 2)<br />
I modsætning til phenol er anilin et ikke-plant molekyle.<br />
Tabel 1.<br />
Molekyle V 2 (cm -1 )<br />
Phenol 1213<br />
4-Fluorphenol 1006<br />
4-Chlorphenol 1148<br />
4-Bromphenol 1172<br />
Tabel 1. Barriere for indre rotation. V 2 , i 4-halogenphenoler.<br />
Tabel 2.<br />
Molekyle V i (cm -1 ) V 2 (cm -1 )<br />
Anilin 524 2000<br />
4-Fluoranilin 596 1570<br />
Tabel 2. Barriere for inversion, V i , og for indre rotation, V 2 , i anilin og<br />
4-fluoranilin.<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 11, 2010<br />
28<br />
Figur 1. Resonansformler for phenol og 4-fluorphenol.<br />
a er en af de resonansformler, der kan begrunde en partiel dobbeltbindingskarakter<br />
af CO-bindingen og dermed en stabilisering af den plane konfiguration;<br />
b er den analoge formel for 4-fluorphenol;<br />
c dobbeltbindingskarakteren er flyttet til CF-bindingen. Da b og c gensidigt<br />
udelukker hinanden, svækkes stabiliseringen af den plane konfiguration i dette<br />
molekyle.<br />
Figur 2. Anilin i ligevægtskonfigurationen.<br />
Phenyl-N-fragmentet er plant, men analogt med ammoniak har<br />
man en pyramidisk struktur omkring nitrogenatomet med de to<br />
aminohydrogenatomer <strong>på</strong> samme side af phenyl-N-planet. Den<br />
dominerende stor-amplitudebevægelse er inversionen omkring<br />
N og ikke den indre rotation af aminogruppen.<br />
Tunnelfrekvensen for inversionen blev ikke observeret i<br />
mikrobølgespektrene. Den er så høj, at den slet ikke ligger i<br />
mikrobølgeområdet. I samarbejde med Flemming Nicolaisen<br />
(også en tidligere KL5 medarbejder) blev den direkte overgang<br />
mellem de to opsplittede inversionstilstande observeret ved<br />
40,8 cm -1 (1224 GHz) i det tilgrænsende fjerninfrarøde område.<br />
Hvad angår den indre rotation var tunnelopsplitningen til<br />
gengæld for lille til at kunne observeres; men overgange med
Figur 4. Potentialfunktioner (cm -1 ) og torsionsenerginiveauer i thiophenol (tv.) og 4-fluorthiophenol (th.).<br />
Figur 3. Phenylphosphin i ligevægtskonfigurationen.<br />
relation til torsionsbevægelsen i anilin kunne igen ses i fjerninfrarødspektrene.<br />
Den model, der var udviklet til brug ved<br />
den indre rotation i phenol, kunne både bruges til inversionsbevægelse<br />
og den indre rotation i anilin. Resultater for anilin og<br />
4-fluoranilin er samlet i tabel 2. Ligesom i phenol aftager den<br />
indre rotationsbarriere ved fluorsubstitution i parastilling, mens<br />
inversionsbarrieren stiger. Begge effekter kan ses som et resultat<br />
af at CN-bindingens dobbeltbindingskarakter mindskes pga.<br />
den konkurrerende CF-dobbeltbindingskarakter, jfr. figur 1.<br />
Phenylphosphin (C 6 H 5 PH 2 , figur 3)<br />
Denne anilinhomolog minder - mikrobølgespektroskopisk<br />
set - <strong>på</strong> mange måder mere om phenol end om anilin. For det<br />
første er barrieren for inversion omkring phosphor så høj, at<br />
Tabel 3.<br />
Molekyle DE (MHz) V 2 (cm -1 )<br />
C 6 H 5 PH 2 1239 94<br />
C 6 H 5 PHD 221 91<br />
C 6 H 5 PD 2 66 86<br />
Tabel 3. Torsionsopsplitning, DE, og indre rotationsbarriere, V 2 , for tre isotopomere<br />
af phynylphosphin.<br />
Tabel 4.<br />
Molekyle V 2 (cm -1 )<br />
Phenol 1213<br />
Thiophenol 277<br />
4-Fluorthiophenol 63<br />
Tabel 4. Barriere for indre rotation, V 2 , i halogenphenoler.<br />
SPeKtroSKoPi<br />
dens virkning ikke observeres i spektrene. Dernæst ligger<br />
de to hydrogenatomer i phosphingruppen <strong>på</strong> hver sin side af<br />
phenylplanet, så b-overgange bliver tilladt i spektrene ligesom<br />
i phenol. Endelig er barrieren for indre rotation langt mindre<br />
end i anilin, ja endog langt mindre end i phenol, hvilket betyder,<br />
at man ser store tunnelopsplitninger i spektrene.<br />
Foruden modermolekylet blev to isotopsubstituerede molekyler<br />
undersøgt, se tabel 3. Egentlig burde barrieren være<br />
uafhængig af, hvilken isotop der er brugt. De små forskelle<br />
skyldes virkningen af andre molekylbevægelser end torsionen.<br />
F.eks. kan man forestille sig, at vibrationsmidlede<br />
PD-bindinger er kortere end de tilsvarende PH-bindinger. En<br />
sådan forkortelse betyder en lille formindskelse af toppens<br />
inertimoment. Da der i beregningerne ikke er taget hensyn til<br />
denne effekt, finder man i stedet en lavere barriere for de deutererede<br />
molekyler.<br />
Thiophenol (C 6 H 6 SH) og 4-fluorthiophenol<br />
Disse molekyler er plane ligesom phenol, så barriererne er<br />
bestemt ud fra opsplittede b-rotationsovergange. I thiophenol<br />
blev der foruden mikrobølgedata også benyttet data fra<br />
fjerninfrarøde spektre. Barrieren er ca. 4 gange lavere end<br />
i phenol, se tabel 4, og ligesom for phenol medfører et fluoratom<br />
i parastilling en sænkning af barrieren - faktisk ligeså<br />
meget absolut set (214 cm -1 ) som fra phenol til 4-fluorphenol.<br />
Figur 4 viser de meget forskellige potentialfunktioner med<br />
torsionsenerginiveauer for thiophenol og 4-fluorthiophenol.<br />
For 4-fluorthiophenol var opsplitningen i torsionsgrundtilstanden<br />
så stor, at det ikke lykkedes at tilordne linjerne i mikrobølgespektret.<br />
I stedet blev barrieren bestemt ved at benytte<br />
spektrene af det S-deutererede molekyle (C 6 H 6 SD).<br />
Nitrobenzen (C H NO )<br />
6 5 2<br />
Også for dette molekyle er r -strukturen bestemt. Molekylet<br />
s<br />
er plant i ligevægtskonfigurationen, men af flere grunde ses<br />
der ingen torsionsopsplitning. For det første er der af symmetrigrunde<br />
ingen b-komponent af dipolmomentet. For det<br />
andet er barrieren så høj og toppens inertimoment så stort, at<br />
opsplitningen vil være forsvindende selv med mikrobølgeøjne.<br />
Endelig er der en helt speciel effekt, der skyldes, at de to oxygenatomer<br />
har spin 0. Det betyder, at halvdelen af torsionsenergierne,<br />
nærmere betegnet dem med ulige m-kvantetal, slet<br />
ikke eksisterer. Fjerninfrarøde spektre kan ikke benyttes, da<br />
torsionsovergangen er forbudt.<br />
Når barrieren alligevel blev bestemt, skyldtes det hovedsageligt,<br />
at man har observeret mikrobølgespektrene af 4<br />
forskellige torsionsanslåede tilstande i 9 forskellige isotopo-<br />
29 Særudgave af:<br />
dansk kemi, 91, nr. 11, 2010<br />
s
SPeKtroSKoPi<br />
Figur 6. 2-Fluornitrobenzen i ligevægtskonfigurationen.<br />
Nyt om...<br />
… En morderisk skørhat<br />
Et molekyle med kun fire<br />
carbonatomer, cycloprop-<br />
2-encarboxylsyre, er<br />
dødeligt giftigt. En paddehat<br />
af slægten skørhat,<br />
Russula subnigricans,<br />
har ført til flere dødsfald<br />
i Japan og Taiwan efter<br />
indtagelse af blot et par<br />
stykker. Svampen indeholder<br />
cyclopropenen, der<br />
er termisk ustabil og end<br />
ikke tåler inddampning<br />
til tørhed. Men den lever<br />
alligevel længe nok til at<br />
fremkalde rhabdomyolose, dvs. nedbrydning af muskelvæv,<br />
hvorved der frigives mængder af myoglobin. Det ødelægger<br />
nyrerne og resulterer i nyresvigt og død. Svampen er en<br />
særdeles habil syntetiker, der producerer en lang række komplicerede<br />
og usædvanlige forbindelser, deriblandt det optisk<br />
aktive, men stort set ugiftige russuphelol.<br />
Carsten Christophersen<br />
Identification of the toxic trigger in mushroom poisoning. M. Matsuura,<br />
Y. Saikawa, K. Inui, K. Nakae, M. Igarashi, K. Hashimoto og M.<br />
Nakata. Nature Chemical Biology 2009, side 465-467.<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 11, 2010<br />
30<br />
Figur 5. Potentialfunktion (cm-1) for nitrobenzen<br />
med de laveste torsionsenerginiveauer<br />
indtegnet. Rotationskonstanterne er bestemt for<br />
de 4 laveste tilstande. Figuren viser to forskellige<br />
potentialfunktioner, som eksperimenterne<br />
ikke kan skelne imellem, fordi de er ens inden<br />
for det vinkelinterval (-30°, 30°), der dækkes af<br />
de undersøgte tilstande. Differencen f(g) mellem<br />
de to potentialfunktioner er praktisk talt 0 i<br />
hele dette interval, mens den viste sandsynlighedsfordeling<br />
for den øverste af de undersøgte<br />
tilstande er 0 uden for intervallet.<br />
Figur 7. Potentialfunktionen (cm-1) for 2-fluornitrobenzen har en lille barriere<br />
omkring den plane konfiguration.<br />
mere af molekylet. Alle disse rotationskonstanter, og primært<br />
ændringer i rotationskonstanter mellem grundtilstanden og de<br />
torsionsanslåede tilstande, blev brugt til at tilpasse potentialfunktionen<br />
for den indre rotation, figur 5. Det var nødvendigt<br />
at udvide potentialfunktionen så den nu også indeholder et led<br />
med cos(4g): V(g) = ½V 2 (1-cos(2g))+ ½V 4 (1-cos(4g)). Differensfunktionen<br />
i figuren indeholder endnu et led og er givet<br />
ved udtrykket (enhed cm -1 )<br />
f(g) = 102(1-cos(2g))-47(1-cos(4g)) +10(1-cos(6g))<br />
Fluornitrobenzener<br />
2-Fluornitrobenzen (figur 6) er særlig interessant, fordi fluoratomet<br />
tvinger nitrogruppen til at dreje ud af phenylringen.<br />
Dvs. at der ud over den relativt høje barriere ved 90˚ også er<br />
en mindre barriere ved 0˚, se figur 7. Det giver tunneleffekt<br />
mellem de to minima omkring ±30˚. Tunnelopsplitningen<br />
vokser, jo mere energiniveauerne nærmer sig den lille barrieretop.<br />
Rotationskonstanterne er bestemt for de laveste torsionstilstande,<br />
markeret med 1 til 6 <strong>på</strong> figuren, men den detaljerede<br />
potentialfunktion baseret <strong>på</strong> disse konstanter endnu ikke<br />
er publiceret.<br />
Litteraturhenvisninger er af pladshensyn lagt ud <strong>på</strong> Dansk<br />
Kemis hjemmeside, www.danskkemi.dk, hvorfra man kan<br />
hente dem.<br />
E-mail-adresser<br />
Niels Wessel Lasen: nwl@kiku.dk<br />
Thorvald Pedersen: thorpe@tdcadsl.dk
Litteraturhenvisninger til artiklerne<br />
<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong> (III og IV)<br />
Af N.W. Larsen og T. Pedersen<br />
BENZENDERIVATER<br />
Phenol, thiophenol og derivater heraf<br />
T. Pedersen og N. Wessel Larsen: Preparation of 2-D, 3-D and 4-Dphenol.<br />
J. Labelled Comp. 5, 196-196 (1969)<br />
T. Pedersen, N. Wessel Larsen og L. Nygaard: Microwave spectra of<br />
the six monodeuteriophenols. Molecular structure, dipole moment,<br />
and barrier to internal rotation of phenol. J. Mol. Structure 4, 59-77<br />
(1969)<br />
N. Wessel Larsen, E. Mathier, A. Bauder og H.H. Günthard: Analysis<br />
of microwave and infrared transitions of phenol by rotation-internal<br />
rotation theory. Phenol-OD. J. Mol. Spectrosc. 47, 183-188 (1973)<br />
N. Wessel Larsen og F.M. Nicolaisen: Far-infrared gas spectra of<br />
phenol, 4-fluorophenol, thiophenol and some deuterated species. Barrier<br />
to internal rotation. J. Mol. Structure 22, 29-43 (1974)<br />
N. Wessel Larsen: En mikrobølge- og fjern-infrarødspektroskopisk<br />
undersøgelse af struktur og indre rotation af phenol, 4-halogenphenol<br />
og thiophenol. Licentiatafhandling, KU (1974)<br />
N. Wessel Larsen: Microwave spectra of the six mono-13C-substituted<br />
phenols and of some monodeuterated species of phenol. Complete<br />
substitution structure and absolute dipole moment. J. Mol. Structure<br />
51, 175-190 (1979)<br />
N. Wessel Larsen: Microwave spectra and internal rotation of 4-fluorophenol,<br />
4-chlorophenol and 4-bromophenol. J. Mol. Structure 144,<br />
83-99 (1986)<br />
N. W. Larsen og L Schulz: Internal rotation and structure of thiophenol<br />
and 4-flourothiophenol studied by microwave spectroscopy<br />
and quantum chemistry. J. Mol. Struct. 920, 30-39 (2009)<br />
Anilin<br />
D.G. Lister, J.K. Tyler, J.H. Høg og N. Wessel Larsen: The microwave<br />
spectrum, structure and dipole moment of aniline. J. Mol. Structure<br />
23, 253-264 (1974)<br />
Phenylphosphin<br />
N. Wessel Larsen og T. Steinarsson: Conformation, barrier to internal<br />
rotation, and structure of the PH2-group in phenylphosphine, studied<br />
by microwave spectroscopy. J. Mol. Spectrosc. 123, 405-425 (1987)<br />
Nitrobenzen og derivater<br />
J.H. Høg: Synthesis of o-, m- and p-deuterio, [15N]- and mono[18O]<br />
nitrobenzene. J. Labelled Comp. 7, 179-181 (1971)<br />
J.H. Høg: A study of nitrobenzene. Microwave spectra, force field,<br />
molecular structure, inertial defect and vibrationally excited states.<br />
Licentiatafhandling, KU (1971)<br />
T. Correll, N. Wessel Larsen og T. Pedersen: Equilibrium configuration<br />
and barriers of four fluorine substituted nitrobenzenes, obtained<br />
by microwave spectroscopy. J. Mol. Structure 65, 43-49 (1980)<br />
N. W. Larsen: Internal rotation potential and relaxation of structure in<br />
nitrobenzene studied by microwave spectroscopy supported by quantum<br />
chemistry. J. Mol. Struct. 963, 100-105 (2010)<br />
N. W. Larsen og O. Vesterlund Nielsen: 2-fluornitrobenzene. To be<br />
published.<br />
2-Fluorbenzylalkohol<br />
K.-V. Hansen og T. Pedersen: Microwave spectra and conformational<br />
properties of 2-fluorobenzylalcohol, its deuterated analogue and 2-hydroxybenzotrifluoride.<br />
J. Mol. Structure 97, 311-314 (1983)<br />
Fluorbenzoylfluoride<br />
N. Wessel Larsen, T. Pedersen og B.F. Sørensen: Microwave spectrum<br />
and potential for internal rotation of 3-fluorobenzoyl fluoride. J. Mol.<br />
Spectrosc. 129, 223-231 (1988)<br />
N. Wessel Larsen, T. Pedersen og B.F. Sørensen: Microwave spectrum<br />
and barrier to internal rotation of 4-fluorobenzoyl fluoride. Dipole<br />
moments for benzoyl fluoride and 4-fluorobenzoyl fluoride. J. Mol.<br />
Spectrosc. 128, 370-383 (1988)<br />
ANDRE MOLEKYLER<br />
1,2,3-trifluor-2-butyn<br />
B. Bak, L. Hansen og J. Rastrup-Andersen: Experimental evidence<br />
of restricted rotation in CH 3 -C≡C-CF 3 . J. Chem. Phys. 21, 1612-1613<br />
(1953)<br />
B. Bak, D. Christensen, L. Hansen-Nygaard og E. Tannenbaum: Microwave<br />
determination of the structure of trifluorobutyne. J. Chem.<br />
Phys. 26, 241-243 (1957)<br />
Ethylfluorid<br />
B. Bak, S. Detoni, L. Hansen-Nygaard, J. Tormod Nielsen og J.<br />
Rastrup- Andersen: Microwave determination of the structure of ethyl<br />
fluoride. Spectrochim. Acta 16, 376-383 (1960)<br />
L. Nygaard: A revised structure of ethyl fluoride. Spectrochim. Acta<br />
22, 1261-1266 (1966)<br />
Methylketen<br />
B. Bak, D. Christensen, J. Christiansen, L. Hansen Nygaard og<br />
J. Rastrup Andersen: Microwave spectrum and internal barrier of<br />
rotation of methyl ketene. Spectrochim. Acta 18, 1421 1424 (1962)<br />
B. Bak, J. Christiansen og J. Tormod Nielsen: Preparation of 300-500<br />
mg quantities of isotopic methyl ketenes. Acta Chem. Scand. 19, 2252-<br />
2253 (1965)<br />
110) B. Bak, J.J. Christiansen, K. Kunstmann, L. Nygaard og J.<br />
Rastrup-Andersen: Microwave spectrum, molecular structure, barrier<br />
to internal rotation, and dipole moment of methylketene. J. Chem.<br />
Phys. 45, 883-887 (1966)<br />
Ethylenimin<br />
B. Bak og S. Skaarup: The substitution structure of ethylenimine. J.<br />
Mol. Structure 10, 385-391 (1971)<br />
S. Skaarup: Ethylenimine inversion barrier and CH 2 group twist. Acta<br />
Chem. Scand. 26, 4190-4192 (1972)<br />
Formamid<br />
E. Hirota, R. Sugisaki, C.J. Nielsen og G.O. Sørensen: Molecular<br />
structure and internal motion of formamide from microwave spectrum.<br />
J. Mol. Spectrosc. 49, 251-267 (1974)<br />
Stubgaard: En mikrobølgespektroskopisk undersøgelse af formamids<br />
struktur. Licentiatafhandling, KU (1978)<br />
N-methylmethylenimine<br />
B. Bak, N. Wessel Larsen og H. Svanholt: Pyrolytic production and<br />
microwave spectra of light and heavy N-methylmethylenimine. Acta<br />
Chem. Scand. A31, 755-758 (1977)<br />
1,6-dioxa-6aë 4 -thiapentalene<br />
T. Pedersen, S.V. Skaarup og C.T. Pedersen: Structure and dipole moment<br />
of 1,6-dioxa-6aë 4 -thiapentalene from microwave spectra. Acta<br />
Chem. Scand. B31, 711-718 (1977)<br />
484) N. Wessel Larsen, L. Nygaard, T. Pedersen, C.T. Pedersen og H.<br />
Davy: Structure and electric dipole moment of 1,6-dioza-2,5-diaza-<br />
6aë 4 -thiapentalene from microwave spectra. J. Mol. Structure 118,<br />
89-95 (1984)<br />
Furfurylamin<br />
385) T. Pedersen: Conformation of furfurylamin. Preliminary results<br />
from a microwave investigation. J. Mol. Structure 64, 277-279 (1980)<br />
I. Hedgecock, N. Wessel Larsen, L. Nygaard, T. Pedersen og G.O.<br />
Sørensen: Conformation of furfurylamine studied by microwave spectra<br />
of five deuterated isotopomers of furfurylamine. J. Mol. Structure<br />
223, 33-44 (1990)<br />
Ethylvinylether<br />
N.L. Owen og G.O. Sørensen: Microwave spectrum conformation,<br />
and barrier to internal rotation of ethyl vinyl ether. J. Phys. Chem. 83,<br />
1483-1488 (1979)<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9/11, 2010
Nitromethan<br />
G.O. Sørensen, T. Pedersen, H. Dreizler, A. Guarnieri og A.P. Cox:<br />
Microwave spectra of nitromethane and D 3 -nitromethane. J. Mol.<br />
Structure 97, 77-82 (1983)<br />
G.O. Sørensen: Structural relaxation in nitromethanelike molecules. J.<br />
Chem. Phys. 105 (10), 3942-3949 (1996)<br />
Ethylnitrit<br />
N. Hansen, F. Temps, H. Mäder og N.W. Larsen: Analysis of internal<br />
rotations in ethyl nitrite using molecular beam Fourier transform microwave<br />
spectroscopy. Phys. Chem. Chem. Phys. 1, 3219-3233 (1999)<br />
1,4-difluor-2-butyn<br />
N.W. Larsen og H.A. Christiansen: Internal rotation and dipole moment<br />
of 1,4-difluoro-2-butyn studied by microwave spectroscopy.<br />
Asian Chem.Lett. vol 4, no 1&2, 25-31 (2000)<br />
H.A. Christiansen, M. Wandel, E.A. Philipp og N.W. Larsen: Deuterium<br />
labelling and preparation of 1,4-dihydroxy-, 1,4-dichloro- and<br />
1,4-difluoro-2-butyne. Asian Chem. Letters, vol. 7, 2&3, 47-52 (2003)<br />
BF 2 OH<br />
981) A. Perrin, M. Carvajal-Zaera, Z. Dutkiewicz, J.-M. Flaud, D.<br />
Collet, H. Bürger, J. Demaison, F. Willaert, H. Mäder og N.W. Larsen:<br />
High-resolution infrared and microwave study of 10 BF 2 OH and<br />
11 BFOH: the 5 1 , 6 1 , 7 1 , 8 1 , 9 1 and 8 1 9 1 vibrationally excited states. Molecular<br />
Physics, vol. 102, no 14-15, 1641-1652 (2004)<br />
TEORI<br />
T. Pedersen, N. Wesssel Larsen og H. Dreizler: Selection rules for<br />
rotor transistions in completely asymmetric molecules with planar top<br />
and frame and a twofold barrier. Z. Naturforsch. 24a, 649-652 (1969)<br />
T. Pedersen: Isomeri og potentiel energi. Dansk kemi 51, 129-131<br />
(1970)<br />
Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9/11, 2010<br />
F. Jørgensen og T. Pedersen: A projector formulation for the Van<br />
Vleck transformation. I. Degenerate case. Mol. Phys. 27, 33-47 (1974),<br />
errata ibid. 28, 599 (1974)<br />
F. Jørgensen og T. Pedersen: A projector formulation for the Van<br />
Vleck transformation. II. Neardegenerate case. Mol. Phys. 27, 959-968<br />
(1974) errata ibid. 28, 599 (1974)<br />
T. Pedersen: Bredbånds mikrobølgespektroskopi, et redskab til konformationsanalyse.<br />
Dansk kemi 55, nr. 3, 16-20 (1974)<br />
F. Jørgensen: Effective hamiltonians. Mol. Phys. 29, 1137-1164 (1975)<br />
F. Jørgensen, T. Pedersen og A. Chedin: A projector formulation for<br />
the Van Vleck transformation III. Generalization and relation to the<br />
contact tranformation. Mol. Phys. 30, 1377-1395 (1975)<br />
318) T. Pedersen: Effective hamiltonian and effective dipole operator<br />
in the principal axis method (PAM). Mol. Phys. 32, 407-418 (1976)<br />
G.O. Sørensen: A new approach to the Hamiltonian of nonrigid molecules.<br />
Topics Curr. Chem. 82, 97-175 (1979)<br />
N. Wessel Larsen og T. Pedersen: Bestemmelse af molekylers konformation<br />
i gasfasen ved mikrobølgespektroskopi. Chemisk Tidende<br />
19-25 (maj 1979)<br />
G.O. Sørensen og T. Pedersen: Symmetry and microwave spectrum of<br />
nitromethane. Stud. Phys. Theor. Chem. 23 (Symmetries Prop. Non-<br />
Rigid Mol.), 219-236 (1983)<br />
T. Pedersen: Symmetri og struktur i kemien. Naturens Verden, 270-<br />
278 (1987)<br />
G.O. Sørensen: Effective vibration-rotation Hamiltonian of a molecule<br />
with a large-amplitude internal motion. J. Maruani (ed.) Molecules in<br />
Physics Chemistry, and Biology, Vol. II, 335-348 (1988) Kluwer Acad<br />
Publ.<br />
T. Pedersen: (H2O) 2 - et tunnelmonster. Aurum 3, 10-23 (1989)