02.06.2013 Views

Mikrobølgespektroskopi på KIKU - Techmedia

Mikrobølgespektroskopi på KIKU - Techmedia

Mikrobølgespektroskopi på KIKU - Techmedia

SHOW MORE
SHOW LESS

You also want an ePaper? Increase the reach of your titles

YUMPU automatically turns print PDFs into web optimized ePapers that Google loves.

60 år med<br />

mikrobølgespektroskopi<br />

ved <strong>KIKU</strong><br />

Niels Wessel Larsen og Thorvald Pedersen


I 4 artikler omtales den forskning, der siden 1949 er udført vha. mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Kemisk Institut ved Københavns<br />

Universitet (<strong>KIKU</strong>). Anledningen er, at den sidste fastansatte medarbejder nu er gået <strong>på</strong> pension, og at afdelingen nedlægges.<br />

Det spektroskopiske laboratorium fl yttede fra UKL <strong>på</strong> Nørrevold til H.C. Ørsted Instituttet i 1963. Frem til 2004 hed det Kemisk<br />

Laboratorium 5 (KL5), en betegnelse der benyttes i artiklerne.<br />

<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong><br />

<strong>KIKU</strong> – teorien bag rotationsspektre<br />

Her beskrives teorien bag mikrobølgespektroskopien, der blev indført i 1949 <strong>på</strong><br />

Københavns Universitet. Det var en omstændelig proces at udnytte udstyret optimalt<br />

Af Niels Wessel Larsen og Thorvald Pedersen<br />

Efter 2. Verdenskrig<br />

blev det muligt at<br />

erhverve mikrobølgekilder<br />

kaldet klystroner fra<br />

amerikanske overskudslagre.<br />

Professor Børge<br />

Bak (BB) rejste til USA<br />

og hentede refl eksklystroner<br />

med hjem til<br />

Danmark.<br />

Et mikrobølgespektrometer<br />

bestod af en celle<br />

i form af en evakueret<br />

bølgeleder af messing<br />

(ca. 3 m lang og med et<br />

indvendigt tværsnit <strong>på</strong><br />

ca. 1x2 cm).<br />

Ned gennem bølgelederen<br />

var der trukket<br />

en Stark-elektrode, som<br />

var isoleret fra væggene<br />

med et par tefl onstrimler.<br />

Det blev <strong>på</strong>trykt en<br />

jævnspænding <strong>på</strong> typisk<br />

1000 V (Stark-spændingen)<br />

moduleret med<br />

en fi rkantbølge med<br />

en frekvens <strong>på</strong> 50 kHz<br />

(for at forbedre signal/støjforholdet,<br />

men også<br />

for at måle molekylers<br />

dipolmoment). Cellen<br />

havde vinduer bestående af glimmer (Marieglas), som tillod<br />

mikrobølgerne at passere ind fra klystronen gennem den ene<br />

ende og ud til detektoren (en krystaldetektor) gennem den anden.<br />

Klystronens frekvens var enormt præcis (op til 0,01 MHz<br />

ved 23 GHz), men frekvensen måtte varieres manuelt ved at<br />

variere klystronens rumfang rent mekanisk, først med en hånddrevet<br />

mikrometerskrue, senere med en motor.<br />

Omkring 1970 kom der et kommercielt mikrobølgespektrometer<br />

<strong>på</strong> markedet fra Hewlett-Packard. Sådan et blev anskaffet<br />

og senere blev endnu et købt af Universitetet i Uppsala (og<br />

hentet hjem af forfatterne, fi gur 1).<br />

Det stof, der skulle undersøges, blev lukket ind i bølgelederen<br />

med et typisk tryk <strong>på</strong> 50 µ (50 mikrometer Hg). Og nu blev frekvensen<br />

varieret og absorptionsfrekvenser registreret. I mikrobølgeområdet<br />

(10-50 GHz) er der tale om rotationsovergange,<br />

dvs. overgange mellem rotationsenerginiveauer.<br />

Rotationsenerginiveauer<br />

For lineære molekyler som f.eks. OCS er rotationsenerginiveauerne<br />

givet ved det simple udtryk:<br />

23 23i, 91, nr. 5, 2010<br />

SPEKTROSKOPI<br />

Figur 1. Det komplette Hewlett Packard mikrobølgespektrometer. På topbordet ses en bølgeleder, der gennem et antal bøjninger<br />

leder mikrobølgerne ind i den 2 m lange polystyrenisolerede stofcelle. Under bordet ser man til venstre hanerne som benyttes<br />

til at lede gassen ind i cellen. I midterafdelingen en forstærker og et meter til måling af Starkspænding og krystalstrøm<br />

(Starkspændingsgeneratoren skulle have været <strong>på</strong> den tomme plads, men benyttes p.t. i det andet instrument). Til højre ses<br />

mikrobølgegeneratoren (en såkaldt Backward Wave Oscillator - BWO) med tilhørende power supply og styreenhed. Nederst en<br />

hjemmebygget mikrocomputer til styring og dataopsamling.<br />

Foto: Michael Barrett Boesen.<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 5, 2010<br />


SPEKTROSKOPI<br />

hvor B kaldes rotationskonstanten og er udtrykt ved molekylets<br />

inertimoment, I, om en akse vinkelret <strong>på</strong> molekylet og gennem<br />

dets tyngdepunkt. J er rotationskvantetallet, som kun kan<br />

antage de heltallige værdier 0,1,2, ...<br />

For rotationsovergangene i det lineære molekyle gælder den<br />

simple udvalgsregel: ΔJ=1 ved absorption og en absorptionsovergangs<br />

mikrobølgefrekvens vil da være givet ved:<br />

For OCS fi nder man J = 1→2 overgangen ved ν = 4B =<br />

24325,92 MHz. Denne overgang/frekvens blev i mange år benyttet<br />

som reference ved kalibrering af klystronerne.<br />

For ikke-lineære molekyler er der ikke ét men 3 hovedinertimomenter;<br />

man taler om inertiellipsoiden, og hovedinertimomenterne<br />

er inertimomenterne omkring ellipsoidens 3<br />

hovedakser.<br />

Hvis alle hovedinertimomenterne er ens, er molekylet en<br />

sfærisk top. Methan er en sfærisk top (det engelske ord ”top”<br />

skal forstås som det danske ”snurretop”), men fra et mikrobølgespektroskopisk<br />

synspunkt er methan ikke interessant, for det<br />

har ikke noget mikrobølgespektrum. Det skyldes, at molekyler<br />

må have et permanent dipolmoment for at kunne absorbere<br />

mikrobølger. Det lineære molekyle CO 2 har derfor heller ikke<br />

noget mikrobølgespektrum.<br />

Hvis 2 af hovedinertimomenterne er lige store, taler man om<br />

en symmetrisk top. Methylfl uorid og benzen er symmetriske<br />

toppe. Methylfl uorid er en prolat symmetrisk top, idet de 2<br />

største hovedinertimomenter er lige store (I b = I c). Benzen er en<br />

oblat symmetrisk top, og nu er det de 2 mindste inertimomenter,<br />

der er ens (I a = I b), idet konventionen vedr. aksebetegnelserne<br />

a, b, c gælder:<br />

I a ≤ I b ≤ I c<br />

og tilsvarende for de 3 rotationskonstanter:<br />

A ≥ B ≥ C<br />

For den prolate top, hvor I b = I c (B = C), gælder<br />

udtrykket:<br />

Og for den oblate top, hvor I a = I b (A = B), tilsvarende:<br />

K = 0,1……. J<br />

energi-<br />

Benzen er igen et dårligt valgt eksempel, fordi det ikke har<br />

noget dipolmoment. PH 3 og PF 3 er eksempler <strong>på</strong> oblate toppe<br />

med dipolmoment og derfor med mikrobølgespektrum. (Begge<br />

eksempler kan ændres fra oblate til prolate toppe, hvis XPXvinklen<br />

(X=H, F) gøres passende lille).<br />

Vi vender nu tilbage til den sidste og største gruppe molekyler:<br />

de asymmetriske toppe hvor A >B > C.<br />

Den asymmetriske top<br />

Ud over pyridinmolekylet blev furan, pyrrol og andre femleddede<br />

heterocykler også undersøgt af Børge Bak og hans gruppe<br />

<strong>på</strong> KL5.<br />

Der eksisterer ikke eksplicitte energiudtryk for de asymmetriske<br />

toppe. Man er henvist til at diagonalisere en energimatrix<br />

for hver værdi af rotationskvantetallet J (som stadig er et ”godt”<br />

kvantetal):<br />

Særudgave Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 5, X, 2010<br />

24 3<br />

er matricer af dimension (2J+1)×(2J+1).<br />

Energiniveauerne, der kommer ud af processen, og som udgør<br />

diagonalen i energimatricen efter diagonaliseringen, betegnes:<br />

Hvor indekset τ løber fra –J til +J. Og endelig bliver overgangene<br />

betegnet:<br />

Før computerne rigtig vandt indpas, var man henvist til at slå op<br />

i tabeller. Man skrev energiudtrykket:<br />

Hvor var den tabellerede funktion. τ er det ovennævnte<br />

indeks for energiniveauerne. κ kaldes ”asymmetriparameteren”,<br />

og den er defi neret som:<br />

κ løber kontinuerligt fra -1 i den prolate-top-grænse (A = B)<br />

til 1 i den oblate-top-grænse (B = C). Tabellerne (kaldet King,<br />

Hainer og Cross’ tabeller) angav f.eks. for J = 1:<br />

for κ= -1, -0,9, -0,8..…1, ret grovmaskede<br />

tabeller, som givet linjernes præcision var vanskelige<br />

at interpolere i. BB og medarbejdere måtte derfor i begyndelsen<br />

starte med nogle antagelser om molekylernes struktur, fi nde de<br />

hertil svarende rotationskonstanter og derefter energiniveauerne<br />

ud fra tabellerne. Da Lise Nygaard kom til (hun hed da Lise<br />

Hansen), brugte hun en mekanisk håndregnemaskine til det<br />

krævende arbejde med at diagonalisere energimatricerne, når<br />

Figur 2. Pyridinmolekylet er et eksempel <strong>på</strong> en asymmetrisk top. Pyridin har<br />

været med i laboratoriets forskning fra starten og tjener her som gennemgående<br />

eksempel (se artikel 2).


tabellerne ikke var nøjagtige nok, mens Georg Ole Sørensen<br />

overtog beregningerne, da computerne havde vundet indpas.<br />

Substitution vha. Kraitchmanns formler<br />

Problemet med bestemmelse af atomernes koordinater har med<br />

molekylernes nulpunktsvibrationer at gøre. Den ultimative<br />

struktur er ligevægtsstrukturen, r e. Den kendes kun for meget<br />

små og simple molekyler, især toatomige. I princippet kan r estrukturer<br />

beregnes ved kvantekemiske beregninger QCC, men<br />

for større molekyler er der tale om meget omfattende beregninger,<br />

og det er svært at vide, om man har nået målet.<br />

μ<br />

Figur 3. Kraitchmanns formel for det plane molekyle. M er molekylets totale<br />

masse og Δm masseændringen ved substitutionen.<br />

De koordinater, man beregner ud fra Kraitchmanns formler<br />

bruges til beregning af substitutionsstrukturen r s. Man håber at<br />

reducere vibrationsbidragene og således komme tættere <strong>på</strong> den<br />

eftertragtede r e. Det blev bl.a. udnyttet i arbejdet med pyridin.<br />

Læs videre i artikel 2.<br />

Litteraturhenvisninger er af pladshensyn lagt ud <strong>på</strong> Dansk Kemis<br />

hjemmeside, www.danskkemi.dk, hvorfra man kan hente<br />

dem.<br />

E-mail-adresser<br />

Niels Wessel Larsen: nwl@kiku.dk<br />

Thorvald Pedersen: thorpe@tdcadsl.dk<br />

OKEMIKRYDS<br />

T<br />

I 14 I<br />

N 20 21\18<br />

24 21 K A R<br />

5\23 R R 26 27\24 N<br />

32\28 A C 29 T A<br />

32 6 34\33 L G<br />

H 2 O 2<br />

V<br />

Se Kemikryds<br />

Side 42, 10 > vandret<br />

Dandiag A/S l Mårkærvej 9 l 2630 Tåstrup<br />

T: 4343 3057 l www.dandiag.dk l dandiag@dandiag.dk<br />

Contract Laboratory<br />

More than 16 years of experience in chemical<br />

and microbiological GMP analyses for the<br />

pharmaceutical industry<br />

Analyses according to pharmacopoeias or<br />

methods developed and validated in-house<br />

Large facilities for stability and photo stability<br />

studies at ICH and individual conditions<br />

DB Lab A/S<br />

Tel: +45 6593 2920<br />

dblab@dblab.dk<br />

www.dblab.dk<br />

Viaflo prisfald <strong>på</strong> alle pipetter<br />

20% Viaflo Vision<br />

enkelt og<br />

multikanals pipetter<br />

og<br />

15% Viaflo Voyager<br />

multikanals pipetter<br />

Viaflo prisfald <strong>på</strong> udvalgte spidser<br />

6-10%<br />

Standard spidser<br />

Bokse & Sterile<br />

21%<br />

Sterile Filter Spidser<br />

Priserne er sænket fra d. 1. april 2010<br />

_________________<br />

RING eller SKRIV<br />

Bestil en DEMO<br />

More than a lab<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. X, 2010 25 4<br />

Særudgave af:<br />

dansk kemi, 91, nr. 5, 2010


SPeKTroSKoPI<br />

I 4 artikler, hvoraf dette er den 2., omtales den forskning, der siden 1949 er udført vha. mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Kemisk Institut<br />

ved Københavns Universitet (<strong>KIKU</strong>). Anledningen er, at den sidste fastansatte medarbejder nu er gået <strong>på</strong> pension, og at afdelingen<br />

nedlægges. Det spektroskopiske laboratorium flyttede fra UKL <strong>på</strong> Nørrevold til H.C. Ørsted Instituttet i 1963. Frem til 2004 hed det<br />

Kemisk Laboratorium 5 (KL5), en betegnelse der benyttes i artiklerne.<br />

<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong> -<br />

pyridin<br />

I beskrivelsen af arbejdet med mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Københavns Universitet<br />

har forfatterne valgt pyridin som gennemgående eksempel. Dels fordi det var med fra<br />

begyndelsen, og dels fordi aromatiske heterocykler spillede en stor rolle i laboratoriets<br />

forskning<br />

Af niels Wessel Larsen og Thorvald Pedersen<br />

Kemisk Laboratorium fik den første artikel om mikrobølgespektroskopi<br />

<strong>på</strong> laboratoriets publikationsliste i 1949. Det var B.<br />

Bak, Erik Stenberg Knudsen og Erhardt Madsens: ”Microwave<br />

Absorption of Some Organic Vapours” (Phys. Rev. 75; 1622-<br />

1623). I dag ville sådan en artikel næppe blive optaget i noget<br />

seriøst tidsskrift. Den indeholder blot en rapport om 6 organiske<br />

molekylers absorptioner i mikrobølgeområdet uden forsøg <strong>på</strong><br />

tilordning af kvantetal og med en usikkerhed <strong>på</strong> frekvensangivelserne<br />

<strong>på</strong> ± 5 MHz.<br />

John Rastrup Andersen havde en stor andel i bygningen af<br />

det ”endelige” spektrometer. Det beskriver Bak i ”A Microwave<br />

Spectroscope and a Review of Microwave Spectroscopy” fra en<br />

kongres i Stockholm i 1952: Transactions of Instruments and<br />

Measurements Conference. Hermed er vi klar til at tage hul<br />

<strong>på</strong> pyridin, hvorom der i artiklen fra 1949 stod, at der ikke var<br />

noget signal.<br />

Pyridins substitutionsstruktur – et langt sejt træk<br />

Det er molekylernes inertimomenter, der i sidste ende bestemmer<br />

mikrobølgespektrenes absorptioner. Derfor får man højst<br />

3 oplysninger ud<br />

af at tyde et molekylesmikrobølgespektrum;<br />

for<br />

plane molekyler<br />

som pyridin er det<br />

kun 2.<br />

I pyridin er der<br />

i princippet 11<br />

atomer, som skal<br />

fastlægges, før en<br />

struktur er <strong>på</strong> plads<br />

(figur 1).<br />

Figur 1. Pyridin med de indlagte hovedakser.<br />

Inertimomentet om c-aksen, som er vinkelret <strong>på</strong><br />

molekylets plan, er lig med summen af inertimomenterne<br />

om a-aksen og b-aksen.<br />

Særudgave dansk kemi, af: 91, dansk nr. 8, kemi, 201091,<br />

nr. 8, 2010<br />

Pga. molekylets<br />

symmetri er der<br />

kun 7 ikke-ækvivalente<br />

atomer.<br />

26<br />

Molekylets planearitet betyder, at der kun kræves 2 koordinater<br />

pr. atom. For at fastlægge de 7 atomers positioner kræves der<br />

10 uafhængige strukturparametre i form af bindingslængder og<br />

-vinkler. Da mikrobølgespektrene af hvert nyt isotopsubstitueret<br />

molekyle bidrager med 2 inertimomenter, burde det være nok at<br />

optage mikrobølgespektre af 5 ”isotoper” af pyridin inklusive<br />

”modermolekylet”.<br />

Imidlertid er der gode grunde til at indføre ”substitutionsstrukturen”,<br />

hvor man erstatter atomet i hver af de 7 positioner<br />

med en isotop. Differenserne mellem modermolekylets og det<br />

isotopsubstituerede molekyles inertimomenter bruges til at fastlægge<br />

koordinaterne x, y for det substituerede atom vha. Kraitchmanns<br />

formler (1953) (se artikel 1, nr. 5, side 23-25).<br />

I tabel 1 ses koordinaterne og i tabel 3 substitutionsstrukturen<br />

for pyridin.<br />

Det kemiske arbejde med at syntetisere de specifikt mærkede<br />

molekyler er en formidabel opgave. Den blev løst ved KL5 for<br />

pyridin og for flere af de 5-leddede heterocykler. Der er særlig<br />

ét navn, der bør nævnes i denne sammenhæng: nu afdøde magister<br />

Jørgen Tormod Nielsen (JTN). Han forestod, enten alene eller<br />

sammen med talrige specialestuderende og amanuenser, det<br />

kolossale syntesearbejde. (En af os (TP) og nu ligeledes afdøde<br />

cand.polyt. Georg Ole Sørensen brugte adskillige måneder med<br />

modelforsøg før det endelige: at erstatte O i furan med 15 NH<br />

for at opnå 15 N-pyrrol, i et pyrolyse-eksperiment hvor furan og<br />

15 NH3 blev ledt gennem et flere hundrede grader varmt kvartsrør).<br />

Sjovt nok har JTN ikke været involveret i fremstillingen af<br />

pyridin-molekylets isotopsubstituerede.<br />

Pyridinstrukturbestemmelsens Odyssé<br />

strækker sig over knap 25 år<br />

Og det er muligt at følge den ved at nærlæse de artikler, der blev<br />

udgivet i perioden. Her gengivet i korte resumeer.<br />

1 (1953) Microwave Investigation of Pyridine; BB, JRA;<br />

JCP 21; 1305-1306.<br />

21 linjer beregnes ud fra en model og sammenlignes med


Atom a B<br />

N –1,3923±0,0004<br />

C(2) –0,6928±0,0004 1,1401±0,0003<br />

C(3) 0,6999±0,0004 1,1953±0,0003<br />

C(4) 1,4124±0,0002<br />

H(2) –1,27588±0,00001 2,05689±0,00002<br />

H(3) 1,20561±0,00002 2,15254±0,00004<br />

H(4) 2,49423±0,00001<br />

Tabel 1. r s -koordinater for pyridin.<br />

“strong lines”, det passer ikke alt for godt, og konklusionen skal<br />

senere vise sig at være overoptimistisk.<br />

2 Forkortelse (1953) Pyridinmolekylets Fulde navn/status struktur; BB; Kemisk Maanedsblad;<br />

BB 34; 43-46. Børge Bak (†)/Professor<br />

I<br />

JRA<br />

denne afhandling<br />

John<br />

i Kemisk<br />

Rastrup-Andersen<br />

Maanedsblad<br />

(†)/amanuensis<br />

(der senere blev til<br />

Dansk Kemi) giver BB en redegørelse for resultaterne, som blev<br />

fundet LH/LN i 1. De skal Lise senere Hansen/Lise vise sig at være Nygaard forkerte (†) lektor jfr. 3. Konklusion:<br />

NCK ”Al begyndelse Niels Clauson-Kaas er svær”. (†)/uafhængig<br />

GOS Georg Ole Sørensen (†)/lektor<br />

3 (1954) Microwave Spectrum of Pyridine; BB, LH, JRA;<br />

JCP<br />

LM<br />

22; 565.<br />

Leo Mahler/specialestuderende<br />

Amerikanske NRA forskere Niels har Rastrup-Andersen/specialestuderende<br />

i mellemtiden foretaget en egentlig<br />

tilordning FM af pyridins Fernando mikrobølgespektrum Mata/spansk videnskabsmand<br />

i den forstand, at<br />

de har fundet de 3 rotationskonstanter, der kan reproducere<br />

spektret.<br />

MJQ Atom<br />

BB og medarbejdere<br />

María a José Quintana/ B<br />

må krybe til korset og erklære sig<br />

N –1,3923±0,0004<br />

spansk videnskabskvinde<br />

enige.<br />

C(2) –0,6928±0,0004 1,1401±0,0003<br />

† vedkommende er nu afdød.<br />

4 (1954) C(3) Mikrobølgeundersøgelser 0,6999±0,0004 <strong>på</strong> Københavns 1,1953±0,0003 Universitet<br />

C(4) Kemisk Laboratorium; 1,4124±0,0002 BB; Kemisk Maanedsblad; 35;<br />

81-84.<br />

H(2) –1,27588±0,00001 2,05689±0,00002<br />

For BB er strukturen alfa og omega, men med 10 strukturparametre<br />

H(3) forekommer 1,20561±0,00002 det lidt futilt at gætte 2,15254±0,00004<br />

<strong>på</strong> en struktur. Dog må<br />

det H(4) medgives, at 2,49423±0,00001<br />

gruppen nu har inddraget de 3 monodeutererede<br />

pyridiner (se videre i 5), så der nu er 8 uafhængige oplysninger.<br />

(Husk, at kun 2 af de 3 inertimomenter tæller med, fordi<br />

molekylet er plant).<br />

Forkortelse Parameter<br />

Eksperimenter<br />

MW Fulde navn/status ED+<br />

QCC <strong>på</strong> PC<br />

a b<br />

22 min 6t 27 min<br />

BB NC(2) 1,3376 Børge Bak 1,344 (†)/Professor 1,3402 1,3337<br />

JRA C(2)C(3)<br />

C(3)C(4)<br />

LH/LN<br />

C(2)H(2)<br />

1,3938 John Rastrup-Andersen 1,399 1,3985 (†)/amanuensis 1,3905<br />

1,3916 1,398 1,3963 1,3883<br />

Lise Hansen/Lise Nygaard (†) lektor<br />

1,0865 1,059(av) 1,0924 1,0841<br />

NCK C(3)H(3) 1,0826 Niels Clauson-Kaas Do. (†)/uafhængig 1,0901 1,0812<br />

GOS C(4)H(4) 1,0818 Georg Ole Do. Sørensen (†)/lektor 1,0907 1,0818<br />

LM<br />

C(6)NC(2)<br />

NC(2)C(3)<br />

NRA<br />

C(2)C(3)C(4)<br />

116,94<br />

Leo Mahler/specialestuderende<br />

116,1 117,30 117,43<br />

123,80 124,6 123,62 123,50<br />

118,53<br />

Niels Rastrup-Andersen/specialestuderende<br />

117,8 118,49 118,51<br />

FM NC(2)H(2) 116,01 Fernando 115,2 Mata/spansk 116,13 videnskabsmand 116,17<br />

MJQ C(2)C(3)H(3)<br />

Ringvinklers<br />

sum<br />

120,12 María José Mangler Quintana/ 120,23<br />

720 spansk videnskabskvinde<br />

718,8 720,00<br />

120,23<br />

720,01<br />

a b<br />

B3LYP/ aug cc-PVDZ † vedkommende B3LYP/ aug er nu cc-PVTZ afdød.<br />

Tabel 2. Forkortelser af navne brugt i oversigten samt status.<br />

27<br />

BB Børge Bak (†)/Professor<br />

JRA John Rastrup-Andersen (†)/amanuensis<br />

LH/LN Lise Hansen/Lise Nygaard (†) lektor<br />

NCK Niels Clauson-Kaas SPEKTROSKOPI<br />

(†)/uafhængig<br />

GOS Georg Ole Sørensen (†)/lektor<br />

5 (1954) Microwave Determination of the Structure of Pyri-<br />

LM Leo Mahler/specialestuderende<br />

dine; BB, LH, JRA; JCP 22; 2013-2017.<br />

Her NRA kommer forskrifterne Niels Rastrup-Andersen/specialestuderende<br />

for fremstillingen af [2-D]-, [3-D]- og<br />

[4-D]-pyridinerne. FM Fernando De starter Mata/spansk fra brompyridinerne videnskabsmand for positionerne<br />

MJQ 2 og 3 og fra María chlorpyridin José Quintana/ for 4-positionen. I alle tilfælde<br />

tilsættes zinkpulver spansk og Dvidenskabskvinde SO . Oprensningen sker via et kom-<br />

2 4<br />

pleks med HgCl og HCl (et såkaldt Ladenburg-kompleks),<br />

2<br />

hvorfra pyridinen † siden vedkommende frigøres med er nu NaOH-pulver. afdød.<br />

Nu følger optagelsen og tydningen af spektrene samt beregningen<br />

af rotationskonstanterne.<br />

De 8 uafhængige inertimomenter bruges til at fastlægge en<br />

partiel struktur, idet der gættes <strong>på</strong> CH-afstandene. Der må have<br />

været pres <strong>på</strong>, siden vi hele tiden skal have præmature strukturer.<br />

Det er som om, det at fremstille de isotopsubstituerede molekyler<br />

og tyde og forstå spektrene ikke er nok, selvom det trods<br />

alt er her, tyngden i arbejdet ligger.<br />

Eksperimenter QCC <strong>på</strong> PC<br />

Parameter MW ED+<br />

a<br />

22 min<br />

b<br />

6t 27 min<br />

NC(2) 1,3376 1,344 1,3402 1,3337<br />

C(2)C(3) 1,3938 1,399 1,3985 1,3905<br />

C(3)C(4) 1,3916 1,398 1,3963 1,3883<br />

C(2)H(2) 1,0865 1,059(av) 1,0924 1,0841<br />

C(3)H(3) 1,0826 Do. 1,0901 1,0812<br />

C(4)H(4) 1,0818 Do. 1,0907 1,0818<br />

C(6)NC(2) 116,94 116,1 117,30 117,43<br />

NC(2)C(3) 123,80 124,6 123,62 123,50<br />

C(2)C(3)C(4) 118,53 117,8 118,49 118,51<br />

NC(2)H(2) 116,01 115,2 116,13 116,17<br />

C(2)C(3)H(3) 120,12 Mangler 120,23 120,23<br />

Ringvinklers<br />

sum<br />

720 718,8 720,00 720,01<br />

a b<br />

B3LYP/ aug cc-PVDZ B3LYP/ aug cc-PVTZ<br />

Tabel 3. Pyridins r s -struktur, 3 strukturer fundet dels ved ED+ (elektrondiffraktion<br />

plus oplysninger fra mikrobølge (MW) og ab-initio (QCC)-beregninger,<br />

jfr. W. Pyckhout et al., J. Mol. Struct., 156(1987) 315-329) og dels ved<br />

QCC (ved NWL).<br />

6 (1955) MW-spectra of Deuterated Pyridines; Structure of<br />

Pyridine; BB, LH, JRA; Microchim Acta; 512-516.<br />

Dette er i det store og hele en gentagelse af 5.<br />

7 (1958) Synthesis of 2-13C and 3-13C Pyridines; BB, NCK;<br />

Acta Chem Scand; 995-998<br />

4 sider i Acta er, hvad det kan blive til med disse 2 vildt imponerende<br />

totalsynteser. De starter begge med en blanding<br />

af KCN og K13CN. For at komme til [2-13C]-pyridin reageres<br />

cyanidet med 1,3-dibrompropan, herved fås glutarsyredinitril,<br />

hvor der er 13C i den ene nitrilgruppe. Ved en omsætning med<br />

63% eddikesyre dannes glutarsyreimid, der først reduceres med<br />

LiAlH til 2,5 dihydroxypiperidin, som dernæst oxideres med<br />

4<br />

sølvacetat til slutproduktet.<br />

For at komme til [3-13C]-pyridin reagerer cyaniderne først<br />

med chloreddikesyre. Herved erstattes Cl med CN, dernæst forestres<br />

både cyanidgruppen og COOH-gruppen med ethanol til<br />

malonsyrediethylester. Nu reduceres og halogeneres denne ester<br />

til 1,3-dibrompropan, og så går det ellers videre som for 2-13C pyridin. Disse og andre lignende totalsynteser blev laboratoriet<br />

berømt for (og der kommer endnu 2 for pyridin jfr. 9).<br />

t<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 8, 2010


SPeKTroSKoPI<br />

10 (1974) MW-spectra of<br />

Forfatterne Niels Wessel Larsen (tv.) og Thorvald Pedersen (th.) foran MW-spektrometret.<br />

Foto: Michael Barrett Boesen.<br />

8 (1958) Complete Structure of Pyridine by MW-Spectra;<br />

BB, LHN, JRA; J. Mol. Spec. 2; 361-368<br />

Så får vi igen en ”komplet” struktur, som mangler 3 CCH-vinkler.<br />

Måske var substitutionsmetoden ikke (aner)kendt <strong>på</strong> det<br />

tidspunkt, men en substitutionsstruktur er i hvert fald ikke, det<br />

vi får her. Den kommer først til i 1974, jfr. 10, efter synteserne<br />

af de 2 sidste manglende isotoper, jfr. 9.<br />

15N and 4-13C Pyridine; GOS, LM, NRA; J. Mol.<br />

Structure; 119-126<br />

Det fortaber sig i glemslen, hvorfor der<br />

skulle gå 9 år mellem syntesen af de 2<br />

molekyler og optagelsen af deres mikrobølgespektre.<br />

Men BB er nok gået i gang<br />

med andre projekter som f.eks. NMR, som<br />

han også fik sat i værk <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong>. Også det,<br />

at han ikke er med <strong>på</strong> afhandlingen, tyder<br />

<strong>på</strong> dette. Det kan være forklaringen <strong>på</strong>, at<br />

ordet ”structure” ikke nævnes i titlen, <strong>på</strong><br />

trods af at r -strukturen nu ser dagens lys,<br />

s<br />

den ultimative struktur set med mikrobølge-øjne.<br />

Koordinaterne, som de er fundet<br />

ud fra differenser mellem modermolekylets<br />

og det specifikt mærkede molekyle jfr.<br />

Kraitchmanns formler fik lov at stå i 3 år,<br />

Molekyle før Publikationsår<br />

de blev revideret i 1977 jfr. 11.<br />

Furan 1955; 1955; 1962; 1962; 1962; 1978<br />

Pyrrol 11 1956; (1977) 1964; Microwave 1969 Spectra of Pyridine<br />

Thiophen and 1956: Monodeuterated 1960; 1961 Pyridines. Revised<br />

Thiazol Molecular 1962;1971 Structure of Pyridine. FM,<br />

1,3,4-Thiadiazol MJQ, 1962; GOS; 1965; J. 1966; Mol. 1971 Struct.42; 1-5.<br />

I dette 1,3,4-Oxadiazol arbejde repareres 1966; der <strong>på</strong> 1972 nogle gamle målinger jfr. 5.<br />

Problemet Pyrazol er, at N-atomet 1974 i pyridin har en såkaldt kvadrupolkerne<br />

1,2,3-Triazol (en atomkerne med 1974 et elektrisk kvadrupolmoment), som<br />

interagerer Pyridin-N-oxid med rotationen, 1983 så de enkelte rotationslinjer får en<br />

finstruktur, Ethylenimin der ytrer sig 1971; som 1972 en forbredning af linjerne med en<br />

nedsat præcision <strong>på</strong> målingerne til følge, dersom finstrukturen<br />

er uopløst. I de nye målinger, som publiceres, er finstrukturen<br />

opløst, så frekvenserne nu er mere nøjagtige. Det fører til en<br />

bedre bestemmelse af hydrogenatomernes koordinater, også<br />

strukturen bliver markant forbedret.<br />

9 (1965) Preparation of 15N and 4-13C Pyridine; BB, GOS,<br />

LM; Acta Chem. Scand.; 19; 2001-2002<br />

Syntesen af [ 15N]-pyridin tager udgangspunkt i glutaconsyredialdehyd,<br />

OCH–CH=CH–CH –CHO. Det blev omsat med<br />

2<br />

15NH4NO , og uden nærmere detaljer om mekanismen kom der<br />

3<br />

[ 15N]- pyridin ud af det.<br />

Syntesen af [4-13C]-pyridin begynder med Ba14CO . Herfra<br />

3<br />

frigøres 14CO , som reduceres til formaldehyd. Igen uden forkla-<br />

2<br />

rende reaktionsligninger får vi at vide, at formaldehyd plus ammoniak<br />

omsættes med CH –CO–CH –COOC H (aceteddike-<br />

3 2 2 5<br />

syreethylester; systematisk: 3-oxobutansyreethylester), og at det<br />

efter et par trin giver [4-13C]-2,3,5,6-pyridintetracarboxylsyre, som decarboxyleres til det ønskede produkt. Puha, sikke en<br />

omgang og den blev kun fundet værdig til 1½ side i Acta.<br />

Molekyle Publikationsår<br />

Furan 1955; 1955; 1962; 1962; 1962; 1978<br />

Pyrrol 1956; 1964; 1969<br />

Thiophen 1956: 1960; 1961<br />

Thiazol 1962;1971<br />

1,3,4-Thiadiazol 1962; 1965; 1966; 1971<br />

1,3,4-Oxadiazol 1966; 1972<br />

Pyrazol 1974<br />

1,2,3-Triazol 1974<br />

Pyridin-N-oxid 1983<br />

Ethylenimin 1971; 1972<br />

Tabel 4. Strukturer af heterocykler.<br />

Særudgave dansk kemi, af: 91, dansk nr. 8, kemi, 2010 91, nr. 8, 2010<br />

28<br />

Molekyle Publikationsår<br />

Fluorbenzen 1957; 1966; 1968<br />

Phenol 1969; 1969; 1974; 1979<br />

Nitrobenzen 1971; 1971; 1971<br />

Benzonitril 1961; 1962; 1962; 1971<br />

Anilin 1974<br />

Phenylphosphin 1987<br />

Dioxadiazathiapentalen 1977; 1984<br />

Cyklobuten 1968; 1968; 1969; 1969<br />

Tabel 5. Strukturer af benzenderivater og andre cykliske molekyler.<br />

Litteraturhenvisningerne er af pladshensyn lagt ud <strong>på</strong> Dansk<br />

Kemis hjemmeside, www.danskkemi.dk, hvorfra man kan hente<br />

dem.<br />

Rettelse – I 1. artikel - side 24, øverst i venstre spalte – skal<br />

formlen for det lineære molekyles absorptionsfrekvenser ændres<br />

til: n = 2B(J+1).<br />

E-mail-adresser<br />

Niels Wessel Larsen: nwl@kiku.dk<br />

Thorvald Pedersen: thorpe@tdcadsl.dk


Litteraturhenvisninger til artiklerne<br />

<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong> (I og II)<br />

Af N.W. Larsen og T. Pedersen<br />

Heterocykler<br />

Furan<br />

B. Bak, L. Hansen og J. Rastrup-Andersen: Microwave spectra of<br />

deuterated furans. Structure of the furan molecule. Disc. Faraday Soc.<br />

19, 30-38 (1955)<br />

L. Nygaard: Furans molekylspektre, struktur og thermodynamiske<br />

funktioner. Licentiatafhandling, DTH (1955)<br />

B. Bak, J. Tormod Nielsen og M. Schottländer: Synthesis of alpha-<br />

and beta carbon isotopically labelled furans. Acta Chem. Scand. 16,<br />

123-126 (1962).<br />

B. Bak, J. Tormod Nielsen og M. Schottländer: Preparation of 18Olabelled<br />

furan.<br />

Acta Chem. Scand. 16, 771 (1962).<br />

B. Bak, D. Christensen, W.B. Dixon, L. Hansen Nygaard, J. Rastrup<br />

Andersen og M. Schottlander: The complete structure of furan. J.<br />

Mol. Spectrosc. 9, 124 129 (1962).<br />

F. Mata, M.C. Martin og G.O. Sørensen: Microwave spectra of deuterated<br />

furans. Revised molecular structure of furan. J. Mol. Structure<br />

48, 157-163 (1978)<br />

Pyrrol<br />

B. Bak, D. Christensen, L. Hansen og J. Rastrup-Andersen: Microwave<br />

determination of the structure of pyrrole. J. Chem. Phys. 24,<br />

720-725 (1956)<br />

B. Bak, T. Pedersen og G.O. Sørensen: Preparation of 2-13C, 3-13C<br />

and 15N enriched pyrroles. Conversion of furan to pyrrole. Acta<br />

Chem. Scand. 18, 275-276 (1964).<br />

L. Nygaard, J. Tormod Nielsen, J. Kirchheiner, G. Maltesen, J.<br />

Rastrup- Andersen og G.O. Sørensen: Microwave spectra of isotopic<br />

pyrroles. Molecular structure, dipole moment and 14N quadrupole<br />

coupling constants of pyrrole. J. Mol. Structure 3, 491-506 (1969)<br />

Thiophen<br />

B. Bak, D. Christensen, J. Rastrup-Andersen og E. Tannenbaum:<br />

Microwave spectra of thiophene, 2- and 3-monodeutero, 3,3'-dideutero,<br />

and tetradeuterothiphene. Structure of the thiophene molecule. J.<br />

Chem. Phys. 25, 892-896 (1956)<br />

B. Bak, J. Christiansen og J. Tormod Nielsen: Preparation of carbon<br />

isotopically labelled thiophenes. Acta Chem. Scand. 14, 1865-1866<br />

(1960)<br />

B. Bak, D. Christensen, L. Hansen Nygaard og J. Rastrup-Andersen:<br />

The structure of thiophene.<br />

J. Mol. Spectrosc. 7, 58 63 (1961)<br />

Thiazol<br />

B. Bak, D.H. Christensen L. Hansen Nygaard og J. Rastrup Andersen:<br />

Microwave spectrum and dipole moment of thiazole. J. Mol. Spectrosc.<br />

9, 222 224 (1962)<br />

L. Nygaard, E. Asmussen, J.H. Høg, R.C. Mahaswari, C.H. Nielsen,<br />

I.B. Petersen, J. Rastrup-Andersen og G.O. Sørensen: Microwave<br />

spectra of isotopic thiazoles. Molecular structure and 14N quadrupole<br />

coupling constants of thiazole. J. Mol. structure 8, 225-233 (1971),<br />

erratum ibid 9, 220 (1971)<br />

1,3,4-thiadiazol<br />

B. Bak, D. Christensen, L. Hansen Nygaard, L. Lipschitz og<br />

J. Rastrup Andersen: Microwave spectra of 1,3,4 thiadiazole and 34S<br />

1,3,4 thiadiazole. Dipole moment of 1,3,4 thiadiazole. J. Mol. Spectrosc.<br />

9, 225 227 (1962)<br />

B. Bak, C. Hylling Christensen, D. Christensen, T. Stroyer Hansen, E.<br />

Jonas Pedersen og J. Tormod Nielsen: Preparation of 1,3,4 thiadiazol<br />

and its (2-D),<br />

(2,5-D2),(2 13C), and (3-15N) isotopic species. Acta Chem. Scand.<br />

19, 2434 2435 (1965)<br />

B. Bak, L. Nygaard, E. Jonas Pedersen og J. Rastrup-Andersen: Microwave<br />

spectra of isotopic 1,3,4 thiadiazoles. Molecular structure of<br />

1,3,4 thiadiazole.<br />

J. Mol. Spectrosc. 19, 283 289 (1966)<br />

L. Nygaard, R. Lykke Hansen og G.O. Sørensen: Nuclear quadrupole<br />

coupling and centrifugal distortion in the microwave spectrum of<br />

1,3,4-thiadiazole. J. Mol. Structure 9, 163-172 (1971)<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 5/8, 2010<br />

1,3,4-oxadiazol<br />

B. Bak, J. Tormod Nielsen, O. Faurskov Nielsen, L. Nygaard, J.<br />

Rastrup-Andersen og P.A. Steiner: Microwave spectrum and dipole<br />

moment of 1,3,4-oxadiazole. J. Mol. Spectrosc. 19, 458-460 (1966)<br />

L. Nygaard, R. Lykke Hansen, J. Tormod Nielsen, J. Rastrup-Andersen,<br />

G.O. Sørensen og P.A. Steiner: Microwave spectra of isotopic<br />

1,3,4-oxadiazoles. Molecular structure, 14N quadrupole coupling<br />

constants, and centrifugal distortion constants of 1,3,4-oxadiazole.<br />

J. Mol. Structure 12, 59-69 (1972).<br />

Pyrazol<br />

L. Nygaard, D. Christen, J. Tormod Nielsen, E. Jonas Pedersen, O.<br />

Snerling, E. Vestergaard og G.O. Sørensen: Microwave spectra of<br />

isotopic pyrazoles and molecular structure of pyrazole.<br />

J. Mol. Structure 22, 401-413 (1974)<br />

1,2,3-Triazol<br />

G.O. Sørensen, L. Nygaard og M. Begtrup: Microwave spectrum of<br />

1-deuterio-1,2,3-triazole.<br />

J. Chem. Soc. Chem. Comm. 605-606 (1974)<br />

Pyridin-N-Oxid<br />

G.O. Sørensen, Å. Tang-Pedersen og E. Jonas Pedersen: Preparation<br />

and microwave spectra of [18O]pyridine N-oxide and deuterated pyridine<br />

N-oxide. Complete molecular structure of pyridine N-oxide. J.<br />

Mol. Structure 101, 263-268 (1983)<br />

Ethylenimin<br />

B. Bak og S. Skaarup: The substitution structure of ethylenimine.<br />

J. Mol. Structure 10, 385-391 (1971)<br />

S. Skaarup: Ethylenimine inversion barrier and CH2group twist. Acta<br />

Chem. Scand. 26, 4190-4192 (1972)<br />

Benzenderivater etc.<br />

Fluorbenzen<br />

B. Bak, D. Christensen, L. Hansen-Nygaard og E. Tannenbaum: Microwave<br />

determination of the structure of fluorobenzene. J. Chem.<br />

Phys. 26, 134-137 (1957)<br />

I. Bojesen og T. Pedersen: Preparation of a mixture of<br />

mono-13C-fluorobenzenes.<br />

Acta Chem. Scand. 20, 895-896 (1966)<br />

L. Nygaard, I. Bojesen, T. Pedersen og J. Rastrup-Andersen: Structure<br />

of fluorobenzene.<br />

J. Mol. Structure 2, 209-215 (1968).<br />

Phenol<br />

T. Pedersen og N. Wessel Larsen: Preparation of 2-D, 3-D and<br />

4-D-phenol.<br />

J. Labelled Comp. 5, 196-196 (1969)<br />

T. Pedersen, N. Wessel Larsen og L. Nygaard: Microwave spectra of<br />

the six monodeuteriophenols. Molecular structure, dipole moment,<br />

and barrier to internal rotation of phenol. J. Mol. Structure 4, 59-77<br />

(1969).<br />

N. Wessel Larsen: En mikrobølge- og fjern-infrarødspektroskopisk<br />

undersøgelse af struktur og indre rotation af phenol, 4-halogenphenol<br />

og thiophenol. Licentiatafhandling, KU (1974)<br />

N. Wessel Larsen: Microwave spectra of the six mono-13C-substituted<br />

phenols and of some monodeuterated species of phenol. Complete<br />

substitution structure and absolute dipole moment. J. Mol. Structure<br />

51, 175-190 (1979)<br />

Nitrobenzen<br />

J.H. Høg, L. Nygaard og G.O. Sørensen: Microwave spectrum and<br />

planarity of nitrobenzene. J. Mol. Structure 7, 111-121 (1971)<br />

J.H. Høg: Synthesis of o-, m- and p-deuterio, [15N]- and mono[18O]<br />

nitrobenzene. J. Labelled Comp. 7, 179-181 (1971)<br />

J.H. Høg: A study of nitrobenzene. Microwave spectra, force field,<br />

molecular structure, inertial defect and vibrationally excited states.<br />

Licentiatafhandling, KU (1971).


Benzonitril<br />

B. Bak, J. Tormod Nielsen og L. Lipschitz: Preparation of benzonitrile,<br />

isotopically labelled in the cyanide group. Acta Chem. Scand.<br />

15, 949 (1961)<br />

B. Bak, D. Christensen, W.B. Dixon, L. Hansen Nygaard og J.<br />

Rastrup- Andersen: Benzene ring distortion by one substituent. Microwave<br />

determination of the complete structure of benzonitrile. J.<br />

Chem. Phys. 37, 2027 2031 (1962)<br />

B. Bak, D. Christensen, W.B. Dixon, L. Hansen Nygaard og J.<br />

Rastrup- Andersen: Benzene ring distortion by one substituent. Microwave<br />

determination of the complete structure of benzonitrile. J.<br />

Chem. Phys. 37, 2027 2031 (1962)<br />

B. Bak, J.J. Christiansen, L. Lipschitz og J. Tormod Nielsen: Preparation<br />

of 1-13C enriched benzonitrile, mono-13C enriched benzene, and<br />

a mixture of mono-13C enriched benzonitriles. Acta Chem. Scand. 16,<br />

2318-2320 (1962)<br />

J. Casado, L. Nygaard og G.O. Sørensen: Microwave spectra of isotopic<br />

benzonitriles. Refined molecular structure of benzonitrile. J. Mol.<br />

Structure 8, 211-224 (1971)<br />

Anilin<br />

D.G. Lister, J.K. Tyler, J.H. Høg og N. Wessel Larsen: The microwave<br />

spectrum, structure and dipole moment of aniline. J. Mol. Structure<br />

23, 253-264 (1974)<br />

Phenylphosphin<br />

N. Wessel Larsen og T. Steinarsson: Conformation, barrier to internal<br />

rotation, and structure of the PH2-group in phenylphosphine, studied<br />

by microwave spectroscopy. J. Mol. Spectrosc. 123, 405-425 (1987)<br />

1,6-dioxa-2,5-diaza-6aë4-thiapentalen<br />

T. Pedersen, S.V. Skaarup og C.T. Pedersen: Structure and dipole moment<br />

of 1,6-dioxa-6aë4-thiapentalene from microwave spectra. Acta<br />

Chem. Scand. B31, 711-718 (1977)<br />

N. Wessel Larsen, L. Nygaard, T. Pedersen, C.T. Pedersen og H.<br />

Davy: Structure and electric dipole moment of 1,6-dioxa-2,5-diaza-<br />

6aë4-thiapentalene from microwave spectra. J. Mol. Structure 118,<br />

89-95 (1984)<br />

Cyclobuten<br />

B. Bak og J.J. Led: Preparation of [1-13C], [3-13C], [1-D], and [3-D]<br />

enriched cyclobutenes. J. Labelled Comp. 4, 22-27 (1968)<br />

J.J. Led: Præparation og mikrobølgespektre af cyclobuten samt [1-<br />

13C]-, [3-13C]-, [1-D]- og<br />

[3-D]-cyclobuten. Cyclobutens struktur. Licentiatafhandling, DTH<br />

(1968)<br />

B. Bak, J.J. Led, L. Nygaard, J. Rastrup-Andersen og G.O. Sørensen:<br />

Microwave spectra of<br />

isotopic cyclobutenes. Molecular structure of cyclobutene. J. Mol.<br />

Structure 3, 369-378 (1969)<br />

B. Bak og J.J. Led: Bent bonds in cyclopropane, cyclobutenes. Molecular<br />

structure of cyclobutene. J. Mol. Structure 3, 379-384 (1969)<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 5/8, 2010<br />

Strukturer af nogle ikke-cykliske molekyler<br />

B. Bak, E. Stenberg Knudsen, E. Madsen og J. Rastrup-Andersen:<br />

Preliminary analysis of the microwave spectrum of ketene. Phys. Rev.<br />

79, 190 (1950)<br />

B. Bak, R. Sloan og D. Williams: Microwave investigation of SCSe.<br />

Phys. Rav. 80, 101-102 (1950)<br />

B. Bak, J. Bruhn og J. Rastrup-Andersen: Microwave spectrum and<br />

structure of SiD3F. J. Chem. Phys. 21, 753-754, (1953)<br />

B. Bak, J. Bruhn og J. Rastrup-Andersen: Microwave spectrum and<br />

structure of SiD3Cl. J. Chem. Phys. 21, 753-754, (1953)<br />

F.A. Andersen, B. Bak og J. Rastrup-Andersen: Microwave investigation<br />

of tertiary butyl fluoride. Acta Chem. Scand. 7, 643-651 (1953)<br />

B. Bak, D. Christensen, L. Hansen-Nygaard og E. Tannenbaum: Microwave<br />

determination of the structure of trifluorobutyne. J. Chem.<br />

Phys. 26, 241-243 (1957)<br />

B. Bak, L. Hansen-Nygaard og J. Rastrup-Andersen: The structure of<br />

tertiary butyl isocyanide. J. Mol. Spectrosc. 2,54-57 (1958)<br />

B. Bak, D. Christensen, L. Hansen-Nygaard og J. Rastrup-Andersen:<br />

The structure of vinyl fluoride. Spectrochim. Acta 13, 120-124 (1958)<br />

B. Bak, S. Detoni, L. Hansen-Nygaard, J. Tormod Nielsen og J.<br />

Rastrup- Andersen: Microwave determination of the structure of ethyl<br />

fluoride. Spectrochim. Acta 16, 376-383 (1960)<br />

D.R. Lide, Jr. og D. Christensen: An improved structure determination<br />

for vinyl fluoride. Spectrochim. Acta 17, 665-668 (1961)<br />

D.R. Lide Jr. (NBC, Washington) og D. Christensen: Molecular structure<br />

of propylene. J. Chem. Phys. 35, 1374 1378 (1961)<br />

B. Bak, D. Christensen, J. Christiansen, L. Hansen Nygaard og<br />

J. Rastrup Andersen: Microwave spectrum and internal barrier of<br />

rotation of methyl ketene. Spectrochim. Acta 18, 1421 1424 (1962)<br />

B. Bak, S. Detoni, L. Hansen-Nygaard og J. Rastrup-Andersen: Microwave<br />

investigation of ethyl fluoride (Bologna, 1959). Adv. Mol.<br />

Spectrosc. Pergamon (1962)<br />

B. Bak, J. Christiansen og J. Tormod Nielsen: Preparation of 300-500<br />

mg quantities of isotopic methyl ketenes. Acta Chem. Scand. 19, 2252-<br />

2253 (1965)<br />

B. Bak, J.J. Christiansen, K. Kunstmann, L. Nygaard og J. Rastrup-<br />

Andersen: Microwave spectrum, molecular structure, barrier to internal<br />

rotation, and dipole moment of methylketene. J. Chem. Phys. 45,<br />

883-887 (1966)<br />

L. Nygaard: A revised structure of ethyl fluoride. Spectrochim. Acta<br />

22, 1261-1266 (1966)<br />

E. Hirota, R. Sugisaki, C.J. Nielsen og G.O. Sørensen: Molecular<br />

structure and internal motion of formamide from microwave spectrum.<br />

J. Mol. Spectrosc. 49, 251-267 (1974)<br />

M. Stubgaard: En mikrobølgespektroskopisk undersøgelse af formamids<br />

struktur. Licentiatafhandling, KU (1978)<br />

G.O. Sørensen, T. Pedersen, H. Dreizler, A. Guarnieri og A.P. Cox:<br />

Microwave spectra of nitromethane and D3-nitromethane. J. Mol.<br />

Structure 97, 77-82 (1983)


SPeKtroSKoPI<br />

I 4 artikler, hvoraf dette er den 3., vil vi omtale den forskning, som er udført ved hjælp af mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Kemisk<br />

Institut ved Københavns Universitet (<strong>KIKU</strong>). Anledningen er, at den sidste fastansatte medarbejder (NWL) nu er gået <strong>på</strong> pension,<br />

og at afdelingen nedlægges. Det spektroskopiske laboratorium flyttede fra UKL <strong>på</strong> Nørrevold til H.C. Ørsted Instituttet i 1963 og<br />

frem til 2004 hed det Kemisk Laboratorium 5 (KL5), en betegnelse, der benyttes i artiklerne.<br />

<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong> -<br />

phenol<br />

Med phenol som eksempel analyseres resultater fra mikrobølgespektrene<br />

Af niels Wessel larsen og thorvald Pedersen<br />

Tidligere blev bestemmelsen af substitutionsstrukturer for<br />

molekyler i gasfase omtalt. I denne og den følgende artikel vil<br />

bestemmelse af potentialfunktioner for indre bevægelse med<br />

stor amplitude, specielt indre rotation, blive omtalt for endnu en<br />

række i gasfase.<br />

Det første forsøg<br />

Allerede i 1953 publicerede B.B., L.N. og J.R.A. et forsøg <strong>på</strong> at<br />

undersøge den indre rotation i molekylet 1,1,1-trifluor-2-butyn.<br />

Methylgruppen og trifluormethylgruppen er adskilt af to enkeltbindinger<br />

og en triplebinding, så man vil forvente en lav barriere<br />

eller næsten fri indre rotation. Molekylet er en symmetrisk<br />

top, og spektret består af brede linjer omkring de forventede<br />

frekvenser, 2B(J+1), jfr. artikel i majnummeret af Dansk Kemi.<br />

Linjernes bredde blev set<br />

som en virkning af den<br />

indre rotation, men man<br />

kom ikke frem til kvantitative<br />

resultater.<br />

Da man i 1967 ved<br />

KL5 begyndte at studere<br />

Figur 1. Phenol i den ene af sine to ligevægtskonfigurationer.<br />

En af hovedakserne<br />

(b-aksen) og den indre rotationsakse, som<br />

stort set falder sammen med a-aksen, er<br />

indtegnet.<br />

phenol, manifesterede<br />

den indre rotation sig helt<br />

anderledes klart. På alle<br />

de steder i spektret, hvor<br />

man for en almindelig<br />

asymmetrisk top ville<br />

forvente en enkelt linje,<br />

observeredes i stedet to<br />

linjer med en indbyrdes<br />

afstand <strong>på</strong> omkring 112<br />

MHz. Det skal her bemærkes,<br />

at bredden af de<br />

enkelte linjer kun er ca.<br />

0,1–0,5 MHz, så der er<br />

tale om en relativt stor<br />

opsplitning. Man kunne nu vælge at lade som ingenting, benytte<br />

midtpunktet mellem de to linjer som den observerede frekvens,<br />

bestemme de 3 normale inertimomenter for molekylet, endda gå<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9, 2010<br />

b<br />

50<br />

v=3<br />

v=2<br />

v=1<br />

v=0<br />

Figur 2. Potentialfunktionen i enheden cm -1 (1 cm -1 = 11,96 J/mol) for den indre<br />

rotation i phenol. Torsionsenerginiveauerne er indtegnet med blåt. For v=0 og<br />

v=1 kan tunnelopsplitningen ikke ses <strong>på</strong> figuren, mens den er tydelig for v=3.<br />

videre med isotopsubstitution og sluttelig nå frem til substitutionsstrukturen,<br />

som var KL5’s speciale. Dette blev faktisk også<br />

gjort, men naturligvis opstod interessen for at forstå, hvad der<br />

var <strong>på</strong> færde og for at finde ud af hvilke molekylære oplysninger,<br />

der kunne udledes af den nye information. Det viser sig, at<br />

den observerede opsplitning er direkte knyttet til det kvantemekaniske<br />

fænomen, tunneleffekt, og at opsplitningens størrelse<br />

er en overordentlig følsom indikator for størrelsen af energibarrieren<br />

for den indre rotation.<br />

Indre rotation og tunneleffekt, med phenol som eksempel<br />

I ligevægtsstrukturen af phenol ligger alle atomer, inkl. de to<br />

atomer i OH-gruppen i samme plan. Lad os sige at H i OHgruppen<br />

ligger til højre i molekylet, som i figur 1. Den indre<br />

rotation består nu i, at OH-gruppen drejer omkring den indre<br />

rotationsakse, mens phenylgruppen bliver liggende. Drejningen<br />

beskrives ved vinklen, g, således at for g=0˚ ser molekylet ud<br />

som i figur 1 og den potentielle energi har minimum. Energien<br />

vokser med g til et maksimum ved 90˚. Ved g=180˚ har vi igen<br />

minimum, osv. Phenol har altså to ækvivalente ligevægtskonfigurationer<br />

(g=0˚ og g=180˚), den potentielle energi beskrives


v=0<br />

v=0<br />

Figur 3. Nærbillede af grundtilstanden i phenol. De brune kurver er sandsynlighedsfordelinger<br />

(kvadratet <strong>på</strong> bølgefunktionerne) for A: en stationær<br />

tilstand; fordelingen har samme sandsynlighed i de to minima og ændres ikke<br />

med tiden. B: en lokaliseret tilstand for hvilken sandsynligheden vil oscillere<br />

mellem de to minima.<br />

ved funktionen V(g) = ½V 2 (1-cos(2g)), hvor V 2 er højden af barrieren,<br />

figur 2. De lave energiniveauer omkring minimum minder<br />

nydeligt om en harmonisk oscillator, hvis energiniveauer er<br />

givet ved kvantetallet v (v=0,1,2,…), E v /h = n(v+1/2), hvor n er<br />

den harmoniske frekvens.<br />

Sandsynligheden er den samme for at finde molekylet omkring<br />

hver af de to ækvivalente minimumskonfigurationer (figur<br />

3A), men tvinger man det til at befinde sig omkring g=0˚ (figur<br />

3B), vil det uden ydre <strong>på</strong>virkninger omdannes til den anden<br />

plane form svarende til g=180˚, selvom dets energi er langt mindre<br />

end barrieren. Dette fænomen kaldes tunneleffekten og er<br />

en konsekvens af kvantemekanikken. Da den nye form af molekylet<br />

er helt ækvivalent med den første, vil molekylet straks<br />

gå tilbage til den første form og så fremdeles. På en måde har<br />

vi at gøre med en spontan kemisk reaktion. Blot er reaktant og<br />

produkt det samme. Det skal bemærkes, at der ikke er tale om<br />

termisk molekylbevægelse; tunneleffekten er aktiv selv ved det<br />

absolutte nulpunkt.<br />

Omdannelsen fra den ene form til den anden vil ske med en<br />

ganske bestemt frekvens, kaldet tunnelfrekvensen, der præcist<br />

svarer til den opsplitning, der sker af energiniveauerne. Jo større<br />

molekylets energi er, dvs. jo nærmere det er <strong>på</strong> toppen af potentialfunktionen,<br />

desto hurtigere vil omdannelsen ske, og desto<br />

større er opsplitningen. For de to laveste niveauer er der ingen<br />

synlig opsplitning <strong>på</strong> figuren, mens det fjerde niveau er kraftigt<br />

opsplittet. I grundtilstanden for phenol (v=0) er tunnelfrekven-<br />

A<br />

B<br />

t<br />

51<br />

KOM OG BESØG OS PÅ SCANLAB D. 28-30 SEPTEMBER<br />

I FINDER OS I HAL C3-111<br />

Scanlab tilbud med op til 30% rabat <strong>på</strong> udvalgte produkter!<br />

Introduktion af nye produkter til super gode priser!<br />

FlipTube<br />

_________________<br />

Download Scanlab tilbuddene <strong>på</strong> vores web-side<br />

Ring og hør nærmere!<br />

Deltag i en lodtrækning om et<br />

“Romantisk weekendophold for 2 personer”<br />

- Medbring en kopi af annoncen eller<br />

af vores Nyhedsbrev<br />

- Gå til Biohit’s stand C2-131<br />

og udfyld deltager informationerne.<br />

- Medbring og aflever informationerne<br />

<strong>på</strong> Dandiag’s stand C3-111<br />

og du deltager i lodtrækningen.<br />

Vinderen vil blive kontaktet,<br />

samt offentlig<br />

gjort <strong>på</strong> www.dandiag.dk<br />

mandag d. 4. oktober<br />

Dandiag A/S l Mårkærvej 9 l 2630 Tåstrup<br />

T: 4343 3057 l www.dandiag.dk l dandiag@dandiag.dk<br />

Anzeige_Maskin_Aktuelt_90x130_Anzeige_Maskin_Aktuelt_90x130 24.08.10 1<br />

Eksklusiv hos DENIOS:<br />

•det største udvalg af produkter<br />

til miljøbeskyttelse og sikkerhed<br />

•professionel rådgivning i<br />

overensstemmelse med<br />

gældende bestemmelser<br />

•perfekte specialløsninger<br />

MILJØBESKYTTELSE OG SIKKERHED<br />

På rette vej med sikkerhed:<br />

Gennem mere end 20 år har DENIOS været banebrydende<br />

indenfor industriel miljøbeskyttelse og arbejdssikkerhed.<br />

Vores produkter gennemgår strenge kvalitetskontroller – selvfølgelig<br />

også med hensyn til regler, godkendelser og dokumentationer.<br />

DENIOS’ ingeniører garanterer en kompetent og individuel rådgivning,<br />

personlig tilpasning og hurtig service til enhver tid.<br />

DENIOS ApS • Dannevirkevej 6 • 7000 Fredericia • Tlf. 76 24 40 80<br />

info@denios.dk • www.denios.dk<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9, 2010


SPeKtroSKoPI<br />

Figur 4. Gradvis overgang mellem to ekstremer. Til venstre er der ingen barriere,<br />

der er fri indre rotation, og energien er proportional med kvadratet <strong>på</strong><br />

m-kvantetallet (m= 0,1,2,…). Til højre er barrieren så høj (1400 cm -1 ), at der<br />

ikke er nogen synlig opsplitning af de laveste energiniveauer – de minder om<br />

energierne for en harmonisk oscillator, hvor energiniveauerne er givet ved<br />

kvantetallet v (v=0,1,2,…), og er proportionale med v+1/2. Som altid afhænger<br />

det sete dog af øjnene der ser: Hvis man bruger meget fine mikrobølgebriller,<br />

kan man nemt se den indre rotation. Den lodrette linje angiver phenol.<br />

sen n T = 56 MHz og energiopsplitningen ΔE = hn T . Molekylet<br />

vil således omdannes 56 mio. gange pr. sekund.<br />

I ammoniak og anilin ses en helt analog tunneleffekt: den ene<br />

pyramidiske form vil omdannes til den anden i en uendelighed,<br />

som en paraply der klapper om. Den molekylære bevægelse, der<br />

kan fortsætte i omdannelsen, kaldes paraplysvingningen.<br />

I chirale molekyler, f.eks. D- og L-former af aminosyrer, må<br />

man <strong>på</strong> samme måde principielt forvente, at en D-form omdannes<br />

til den tilsvarende L-form. Barrieren er så høj i dette tilfælde,<br />

at omdannelsen vil tage ekstremt lang tid og som bekendt<br />

i praksis ikke finder sted.<br />

For mange ”almindelige” kemiske reaktioner – specielt hydrogenoverførselsreaktioner<br />

- giver tunneleffekten et væsentligt<br />

bidrag til reaktionshastigheden. Det lette hydrogenatom kan<br />

passere reaktionsbarrieren, selvom den kinetiske energi er lavere<br />

end toppen af reaktionsbarrieren. Som eksempel kan nævnes<br />

reaktioner, hvor OH-radikalet fjerner et hydrogenatom fra<br />

carbonhydrider og derved bidrager til at rense atmosfæren for<br />

methan m.m.<br />

Opsplitningens afhængighed af molekylets egenskaber<br />

Et fjerde inertimoment, I Top , er inertimomentet af den del af<br />

molekylet, der udfører den indre rotation. I phenol er det typisk<br />

OH-gruppen. Man kan principielt selv vælge, hvilken del<br />

af molekylet man vil betragte som toppen, og det viser sig, at<br />

det inertimoment, som får betydning for tunnelopsplitningens<br />

størrelse, er det reducerede inertimoment: I Red =I Top *I Ramme /<br />

(I Top +I Ramme ). Og betydningen af I Red er enorm: Udskiftes H i<br />

hydroxylgruppen med D (deuterium) bliver det reducerede iner-<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9, 2010<br />

52<br />

timoment ca. dobbelt så stort, mens tunnelfrekvensen falder fra<br />

56 MHz til 0,22 MHz. En tilsvarende virkning <strong>på</strong> opsplitningen<br />

ses ved ændring af barrierehøjden, som dog ikke kan ændres<br />

ved isotopsubstitution. I figur 4 ses, hvordan energiniveauerne<br />

ændres, når barrieren varieres fra 0 og opefter.<br />

Opsplitningen bestemmes altså hverken af barrieren eller af<br />

det reducerede inertimoment i sig selv. Det afgørende er produktet<br />

af de to: Jo større produktet V 2 *I Red er, desto mindre er<br />

opsplitningen. Bestemmelse af potentialfunktionen kræver altså<br />

kendskab til det reducerede inertimoment. Det er derfor vigtigt<br />

også at undersøge isotopsubstituerede molekyler, som kan levere<br />

den nødvendige strukturinformationen.<br />

Hvorfor er opsplitningen i spektrene dobbelt så stor som<br />

tunnelfrekvensen?<br />

De linjer, der ses i mikrobølgespektrene, er overgange fra én<br />

rotationstilstand til en anden, og begge tilstandes energiniveauer<br />

er opsplittet i en nedre og en øvre torsionstilstand, figur<br />

5. Spørgsmålet er om torsionstilstanden ændres under rotationsovergangen<br />

eller ej. I det første tilfælde bliver afstanden mellem<br />

de to linjer to gange torsionsopsplitningen, mens de to linjer<br />

falder sammen i tilfælde to. For phenol siger udvalgsreglerne, at<br />

vi har at gøre med det første tilfælde.<br />

Begrundelse for udvalgsreglerne<br />

Rotationsudvalgsreglerne afgøres<br />

af retningen af molekylets<br />

dipolmoment, mere præcist af<br />

dipolmomentets komponenter<br />

langs molekylets tre hovedakser,<br />

a, b og c. Hvis der er en dipolkomponent<br />

langs a-aksen fås<br />

a-udvalgsregler etc. I phenol falder<br />

a-aksen næsten sammen med<br />

den indre rotationsakse, mens<br />

b-aksen er vinkelret <strong>på</strong> a-aksen<br />

og ligger i molekylets plan (figur<br />

1). Der skulle altså principielt<br />

være mulighed for både a- og budvalgsregler;<br />

men det viser sig at<br />

b-komponenten er langt større end<br />

a-komponenten, så der i praksis<br />

kun ses b-inducerede overgange.<br />

Torsionsudvalgsreglerne for en<br />

Rot 2<br />

Rot 1<br />

given rotationsovergang er bestemt af, om dipolmomentet er<br />

uændret eller skifter fortegn under en indre rotation <strong>på</strong> 180˚. Af<br />

symmetrigrunde er der kun de to muligheder. Det ses at b-komponenten<br />

er bundet til OH-gruppen og derfor skifter fortegn.<br />

Det betyder, at vi har at gøre med tilfælde I, så vi i spektrene ser<br />

opsplitningen <strong>på</strong> 112 MHz.<br />

Litteraturhenvisninger er af pladshensyn lagt ud <strong>på</strong> Dansk Kemis<br />

hjemmeside, www.danskkemi.dk, hvorfra man kan hente<br />

dem.<br />

E-mail-adresser<br />

Niels Wessel Lasen: nwl@kiku.dk<br />

Thorvald Pedersen: thorpe@tdcadsl.dk<br />

Ø<br />

N<br />

Ø<br />

N<br />

I II<br />

Figur 5. Mulige overgange mellem<br />

to rotationstilstande, som<br />

begge er torsionsopsplittede i en<br />

nedre tilstand (N) og en øvre (Ø).<br />

I: torsionstilstanden ændres ved<br />

overgangen. II: torsionstilstanden<br />

bevares ved overgangen


SPeKtroSKoPi<br />

I 4 artikler, hvoraf dette er den sidste, vil vi omtale den forskning, som er udført vha. mikrobølgespektroskopi <strong>på</strong> Kemisk Institut<br />

ved Københavns Universitet (<strong>KIKU</strong>). Anledningen er, at den sidste fastansatte medarbejder (NWL) nu er gået <strong>på</strong> pension, og at<br />

afdelingen nedlægges. Det spektroskopiske laboratorium flyttede fra UKL <strong>på</strong> Nørrevold til H.C. Ørsted Instituttet i 1963 og frem til<br />

2004 hed det Kemisk Laboratorium 5 (KL5), en betegnelse, der benyttes i artiklerne.<br />

<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong><br />

– substituerede benzenringe<br />

Teorien for indre rotation og inversion i molekyler blev beskrevet i artikel 3. Her omtales<br />

sådanne bevægelser i en række substituerede benzenringe<br />

Af Niels Wessel larsen og thorvald Pedersen<br />

De to første artikler (Dansk Kemi nr. 5 og 8, 2010) handlede<br />

om strukturbestemmelse. I artikel 3 (Dansk Kemi nr. 9, 2010)<br />

blev teorien for indre rotation og inversion beskrevet med<br />

phenol som udgangspunkt. I denne sidste artikel ser vi nærmere<br />

<strong>på</strong> disse bevægelser i et antal substituerede benzenringe og <strong>på</strong><br />

virkningen af yderligere substitution i benzenringen.<br />

Parasubstitution i phenol<br />

Et halogenatom i parastilling i phenol ændrer ikke molekylets<br />

symmetri, og det reducerede inertimoment forbliver næsten<br />

uændret; derimod kommer der en stor komponent af dipolmomentet<br />

i a-aksens retning (molekylets længderetning). I modsætning<br />

til phenol selv, hvor man kun ser de torsionsopsplittede<br />

b-rotationsovergange, ser man derfor også a-linjer, der – i hvert<br />

fald i første tilnærmelse – er uopsplittede, jfr. artikel 3. Som<br />

det fremgår af tabel 1, sænker et halogenatom i parastilling<br />

den indre rotationsbarriere. For fluor er virkningen ganske stor,<br />

nemlig 207 cm -1 eller 17%, mens den for chlor og brom kun er<br />

henholdsvis ca. 5% og ca. 3%. Figur 1 forklarer effekten vha.<br />

resonansformler.<br />

Anilin (C 6 H 5 NH 2 , figur 2)<br />

I modsætning til phenol er anilin et ikke-plant molekyle.<br />

Tabel 1.<br />

Molekyle V 2 (cm -1 )<br />

Phenol 1213<br />

4-Fluorphenol 1006<br />

4-Chlorphenol 1148<br />

4-Bromphenol 1172<br />

Tabel 1. Barriere for indre rotation. V 2 , i 4-halogenphenoler.<br />

Tabel 2.<br />

Molekyle V i (cm -1 ) V 2 (cm -1 )<br />

Anilin 524 2000<br />

4-Fluoranilin 596 1570<br />

Tabel 2. Barriere for inversion, V i , og for indre rotation, V 2 , i anilin og<br />

4-fluoranilin.<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 11, 2010<br />

28<br />

Figur 1. Resonansformler for phenol og 4-fluorphenol.<br />

a er en af de resonansformler, der kan begrunde en partiel dobbeltbindingskarakter<br />

af CO-bindingen og dermed en stabilisering af den plane konfiguration;<br />

b er den analoge formel for 4-fluorphenol;<br />

c dobbeltbindingskarakteren er flyttet til CF-bindingen. Da b og c gensidigt<br />

udelukker hinanden, svækkes stabiliseringen af den plane konfiguration i dette<br />

molekyle.<br />

Figur 2. Anilin i ligevægtskonfigurationen.<br />

Phenyl-N-fragmentet er plant, men analogt med ammoniak har<br />

man en pyramidisk struktur omkring nitrogenatomet med de to<br />

aminohydrogenatomer <strong>på</strong> samme side af phenyl-N-planet. Den<br />

dominerende stor-amplitudebevægelse er inversionen omkring<br />

N og ikke den indre rotation af aminogruppen.<br />

Tunnelfrekvensen for inversionen blev ikke observeret i<br />

mikrobølgespektrene. Den er så høj, at den slet ikke ligger i<br />

mikrobølgeområdet. I samarbejde med Flemming Nicolaisen<br />

(også en tidligere KL5 medarbejder) blev den direkte overgang<br />

mellem de to opsplittede inversionstilstande observeret ved<br />

40,8 cm -1 (1224 GHz) i det tilgrænsende fjerninfrarøde område.<br />

Hvad angår den indre rotation var tunnelopsplitningen til<br />

gengæld for lille til at kunne observeres; men overgange med


Figur 4. Potentialfunktioner (cm -1 ) og torsionsenerginiveauer i thiophenol (tv.) og 4-fluorthiophenol (th.).<br />

Figur 3. Phenylphosphin i ligevægtskonfigurationen.<br />

relation til torsionsbevægelsen i anilin kunne igen ses i fjerninfrarødspektrene.<br />

Den model, der var udviklet til brug ved<br />

den indre rotation i phenol, kunne både bruges til inversionsbevægelse<br />

og den indre rotation i anilin. Resultater for anilin og<br />

4-fluoranilin er samlet i tabel 2. Ligesom i phenol aftager den<br />

indre rotationsbarriere ved fluorsubstitution i parastilling, mens<br />

inversionsbarrieren stiger. Begge effekter kan ses som et resultat<br />

af at CN-bindingens dobbeltbindingskarakter mindskes pga.<br />

den konkurrerende CF-dobbeltbindingskarakter, jfr. figur 1.<br />

Phenylphosphin (C 6 H 5 PH 2 , figur 3)<br />

Denne anilinhomolog minder - mikrobølgespektroskopisk<br />

set - <strong>på</strong> mange måder mere om phenol end om anilin. For det<br />

første er barrieren for inversion omkring phosphor så høj, at<br />

Tabel 3.<br />

Molekyle DE (MHz) V 2 (cm -1 )<br />

C 6 H 5 PH 2 1239 94<br />

C 6 H 5 PHD 221 91<br />

C 6 H 5 PD 2 66 86<br />

Tabel 3. Torsionsopsplitning, DE, og indre rotationsbarriere, V 2 , for tre isotopomere<br />

af phynylphosphin.<br />

Tabel 4.<br />

Molekyle V 2 (cm -1 )<br />

Phenol 1213<br />

Thiophenol 277<br />

4-Fluorthiophenol 63<br />

Tabel 4. Barriere for indre rotation, V 2 , i halogenphenoler.<br />

SPeKtroSKoPi<br />

dens virkning ikke observeres i spektrene. Dernæst ligger<br />

de to hydrogenatomer i phosphingruppen <strong>på</strong> hver sin side af<br />

phenylplanet, så b-overgange bliver tilladt i spektrene ligesom<br />

i phenol. Endelig er barrieren for indre rotation langt mindre<br />

end i anilin, ja endog langt mindre end i phenol, hvilket betyder,<br />

at man ser store tunnelopsplitninger i spektrene.<br />

Foruden modermolekylet blev to isotopsubstituerede molekyler<br />

undersøgt, se tabel 3. Egentlig burde barrieren være<br />

uafhængig af, hvilken isotop der er brugt. De små forskelle<br />

skyldes virkningen af andre molekylbevægelser end torsionen.<br />

F.eks. kan man forestille sig, at vibrationsmidlede<br />

PD-bindinger er kortere end de tilsvarende PH-bindinger. En<br />

sådan forkortelse betyder en lille formindskelse af toppens<br />

inertimoment. Da der i beregningerne ikke er taget hensyn til<br />

denne effekt, finder man i stedet en lavere barriere for de deutererede<br />

molekyler.<br />

Thiophenol (C 6 H 6 SH) og 4-fluorthiophenol<br />

Disse molekyler er plane ligesom phenol, så barriererne er<br />

bestemt ud fra opsplittede b-rotationsovergange. I thiophenol<br />

blev der foruden mikrobølgedata også benyttet data fra<br />

fjerninfrarøde spektre. Barrieren er ca. 4 gange lavere end<br />

i phenol, se tabel 4, og ligesom for phenol medfører et fluoratom<br />

i parastilling en sænkning af barrieren - faktisk ligeså<br />

meget absolut set (214 cm -1 ) som fra phenol til 4-fluorphenol.<br />

Figur 4 viser de meget forskellige potentialfunktioner med<br />

torsionsenerginiveauer for thiophenol og 4-fluorthiophenol.<br />

For 4-fluorthiophenol var opsplitningen i torsionsgrundtilstanden<br />

så stor, at det ikke lykkedes at tilordne linjerne i mikrobølgespektret.<br />

I stedet blev barrieren bestemt ved at benytte<br />

spektrene af det S-deutererede molekyle (C 6 H 6 SD).<br />

Nitrobenzen (C H NO )<br />

6 5 2<br />

Også for dette molekyle er r -strukturen bestemt. Molekylet<br />

s<br />

er plant i ligevægtskonfigurationen, men af flere grunde ses<br />

der ingen torsionsopsplitning. For det første er der af symmetrigrunde<br />

ingen b-komponent af dipolmomentet. For det<br />

andet er barrieren så høj og toppens inertimoment så stort, at<br />

opsplitningen vil være forsvindende selv med mikrobølgeøjne.<br />

Endelig er der en helt speciel effekt, der skyldes, at de to oxygenatomer<br />

har spin 0. Det betyder, at halvdelen af torsionsenergierne,<br />

nærmere betegnet dem med ulige m-kvantetal, slet<br />

ikke eksisterer. Fjerninfrarøde spektre kan ikke benyttes, da<br />

torsionsovergangen er forbudt.<br />

Når barrieren alligevel blev bestemt, skyldtes det hovedsageligt,<br />

at man har observeret mikrobølgespektrene af 4<br />

forskellige torsionsanslåede tilstande i 9 forskellige isotopo-<br />

29 Særudgave af:<br />

dansk kemi, 91, nr. 11, 2010<br />

s


SPeKtroSKoPi<br />

Figur 6. 2-Fluornitrobenzen i ligevægtskonfigurationen.<br />

Nyt om...<br />

… En morderisk skørhat<br />

Et molekyle med kun fire<br />

carbonatomer, cycloprop-<br />

2-encarboxylsyre, er<br />

dødeligt giftigt. En paddehat<br />

af slægten skørhat,<br />

Russula subnigricans,<br />

har ført til flere dødsfald<br />

i Japan og Taiwan efter<br />

indtagelse af blot et par<br />

stykker. Svampen indeholder<br />

cyclopropenen, der<br />

er termisk ustabil og end<br />

ikke tåler inddampning<br />

til tørhed. Men den lever<br />

alligevel længe nok til at<br />

fremkalde rhabdomyolose, dvs. nedbrydning af muskelvæv,<br />

hvorved der frigives mængder af myoglobin. Det ødelægger<br />

nyrerne og resulterer i nyresvigt og død. Svampen er en<br />

særdeles habil syntetiker, der producerer en lang række komplicerede<br />

og usædvanlige forbindelser, deriblandt det optisk<br />

aktive, men stort set ugiftige russuphelol.<br />

Carsten Christophersen<br />

Identification of the toxic trigger in mushroom poisoning. M. Matsuura,<br />

Y. Saikawa, K. Inui, K. Nakae, M. Igarashi, K. Hashimoto og M.<br />

Nakata. Nature Chemical Biology 2009, side 465-467.<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 11, 2010<br />

30<br />

Figur 5. Potentialfunktion (cm-1) for nitrobenzen<br />

med de laveste torsionsenerginiveauer<br />

indtegnet. Rotationskonstanterne er bestemt for<br />

de 4 laveste tilstande. Figuren viser to forskellige<br />

potentialfunktioner, som eksperimenterne<br />

ikke kan skelne imellem, fordi de er ens inden<br />

for det vinkelinterval (-30°, 30°), der dækkes af<br />

de undersøgte tilstande. Differencen f(g) mellem<br />

de to potentialfunktioner er praktisk talt 0 i<br />

hele dette interval, mens den viste sandsynlighedsfordeling<br />

for den øverste af de undersøgte<br />

tilstande er 0 uden for intervallet.<br />

Figur 7. Potentialfunktionen (cm-1) for 2-fluornitrobenzen har en lille barriere<br />

omkring den plane konfiguration.<br />

mere af molekylet. Alle disse rotationskonstanter, og primært<br />

ændringer i rotationskonstanter mellem grundtilstanden og de<br />

torsionsanslåede tilstande, blev brugt til at tilpasse potentialfunktionen<br />

for den indre rotation, figur 5. Det var nødvendigt<br />

at udvide potentialfunktionen så den nu også indeholder et led<br />

med cos(4g): V(g) = ½V 2 (1-cos(2g))+ ½V 4 (1-cos(4g)). Differensfunktionen<br />

i figuren indeholder endnu et led og er givet<br />

ved udtrykket (enhed cm -1 )<br />

f(g) = 102(1-cos(2g))-47(1-cos(4g)) +10(1-cos(6g))<br />

Fluornitrobenzener<br />

2-Fluornitrobenzen (figur 6) er særlig interessant, fordi fluoratomet<br />

tvinger nitrogruppen til at dreje ud af phenylringen.<br />

Dvs. at der ud over den relativt høje barriere ved 90˚ også er<br />

en mindre barriere ved 0˚, se figur 7. Det giver tunneleffekt<br />

mellem de to minima omkring ±30˚. Tunnelopsplitningen<br />

vokser, jo mere energiniveauerne nærmer sig den lille barrieretop.<br />

Rotationskonstanterne er bestemt for de laveste torsionstilstande,<br />

markeret med 1 til 6 <strong>på</strong> figuren, men den detaljerede<br />

potentialfunktion baseret <strong>på</strong> disse konstanter endnu ikke<br />

er publiceret.<br />

Litteraturhenvisninger er af pladshensyn lagt ud <strong>på</strong> Dansk<br />

Kemis hjemmeside, www.danskkemi.dk, hvorfra man kan<br />

hente dem.<br />

E-mail-adresser<br />

Niels Wessel Lasen: nwl@kiku.dk<br />

Thorvald Pedersen: thorpe@tdcadsl.dk


Litteraturhenvisninger til artiklerne<br />

<strong>Mikrobølgespektroskopi</strong> <strong>på</strong> <strong>KIKU</strong> (III og IV)<br />

Af N.W. Larsen og T. Pedersen<br />

BENZENDERIVATER<br />

Phenol, thiophenol og derivater heraf<br />

T. Pedersen og N. Wessel Larsen: Preparation of 2-D, 3-D and 4-Dphenol.<br />

J. Labelled Comp. 5, 196-196 (1969)<br />

T. Pedersen, N. Wessel Larsen og L. Nygaard: Microwave spectra of<br />

the six monodeuteriophenols. Molecular structure, dipole moment,<br />

and barrier to internal rotation of phenol. J. Mol. Structure 4, 59-77<br />

(1969)<br />

N. Wessel Larsen, E. Mathier, A. Bauder og H.H. Günthard: Analysis<br />

of microwave and infrared transitions of phenol by rotation-internal<br />

rotation theory. Phenol-OD. J. Mol. Spectrosc. 47, 183-188 (1973)<br />

N. Wessel Larsen og F.M. Nicolaisen: Far-infrared gas spectra of<br />

phenol, 4-fluorophenol, thiophenol and some deuterated species. Barrier<br />

to internal rotation. J. Mol. Structure 22, 29-43 (1974)<br />

N. Wessel Larsen: En mikrobølge- og fjern-infrarødspektroskopisk<br />

undersøgelse af struktur og indre rotation af phenol, 4-halogenphenol<br />

og thiophenol. Licentiatafhandling, KU (1974)<br />

N. Wessel Larsen: Microwave spectra of the six mono-13C-substituted<br />

phenols and of some monodeuterated species of phenol. Complete<br />

substitution structure and absolute dipole moment. J. Mol. Structure<br />

51, 175-190 (1979)<br />

N. Wessel Larsen: Microwave spectra and internal rotation of 4-fluorophenol,<br />

4-chlorophenol and 4-bromophenol. J. Mol. Structure 144,<br />

83-99 (1986)<br />

N. W. Larsen og L Schulz: Internal rotation and structure of thiophenol<br />

and 4-flourothiophenol studied by microwave spectroscopy<br />

and quantum chemistry. J. Mol. Struct. 920, 30-39 (2009)<br />

Anilin<br />

D.G. Lister, J.K. Tyler, J.H. Høg og N. Wessel Larsen: The microwave<br />

spectrum, structure and dipole moment of aniline. J. Mol. Structure<br />

23, 253-264 (1974)<br />

Phenylphosphin<br />

N. Wessel Larsen og T. Steinarsson: Conformation, barrier to internal<br />

rotation, and structure of the PH2-group in phenylphosphine, studied<br />

by microwave spectroscopy. J. Mol. Spectrosc. 123, 405-425 (1987)<br />

Nitrobenzen og derivater<br />

J.H. Høg: Synthesis of o-, m- and p-deuterio, [15N]- and mono[18O]<br />

nitrobenzene. J. Labelled Comp. 7, 179-181 (1971)<br />

J.H. Høg: A study of nitrobenzene. Microwave spectra, force field,<br />

molecular structure, inertial defect and vibrationally excited states.<br />

Licentiatafhandling, KU (1971)<br />

T. Correll, N. Wessel Larsen og T. Pedersen: Equilibrium configuration<br />

and barriers of four fluorine substituted nitrobenzenes, obtained<br />

by microwave spectroscopy. J. Mol. Structure 65, 43-49 (1980)<br />

N. W. Larsen: Internal rotation potential and relaxation of structure in<br />

nitrobenzene studied by microwave spectroscopy supported by quantum<br />

chemistry. J. Mol. Struct. 963, 100-105 (2010)<br />

N. W. Larsen og O. Vesterlund Nielsen: 2-fluornitrobenzene. To be<br />

published.<br />

2-Fluorbenzylalkohol<br />

K.-V. Hansen og T. Pedersen: Microwave spectra and conformational<br />

properties of 2-fluorobenzylalcohol, its deuterated analogue and 2-hydroxybenzotrifluoride.<br />

J. Mol. Structure 97, 311-314 (1983)<br />

Fluorbenzoylfluoride<br />

N. Wessel Larsen, T. Pedersen og B.F. Sørensen: Microwave spectrum<br />

and potential for internal rotation of 3-fluorobenzoyl fluoride. J. Mol.<br />

Spectrosc. 129, 223-231 (1988)<br />

N. Wessel Larsen, T. Pedersen og B.F. Sørensen: Microwave spectrum<br />

and barrier to internal rotation of 4-fluorobenzoyl fluoride. Dipole<br />

moments for benzoyl fluoride and 4-fluorobenzoyl fluoride. J. Mol.<br />

Spectrosc. 128, 370-383 (1988)<br />

ANDRE MOLEKYLER<br />

1,2,3-trifluor-2-butyn<br />

B. Bak, L. Hansen og J. Rastrup-Andersen: Experimental evidence<br />

of restricted rotation in CH 3 -C≡C-CF 3 . J. Chem. Phys. 21, 1612-1613<br />

(1953)<br />

B. Bak, D. Christensen, L. Hansen-Nygaard og E. Tannenbaum: Microwave<br />

determination of the structure of trifluorobutyne. J. Chem.<br />

Phys. 26, 241-243 (1957)<br />

Ethylfluorid<br />

B. Bak, S. Detoni, L. Hansen-Nygaard, J. Tormod Nielsen og J.<br />

Rastrup- Andersen: Microwave determination of the structure of ethyl<br />

fluoride. Spectrochim. Acta 16, 376-383 (1960)<br />

L. Nygaard: A revised structure of ethyl fluoride. Spectrochim. Acta<br />

22, 1261-1266 (1966)<br />

Methylketen<br />

B. Bak, D. Christensen, J. Christiansen, L. Hansen Nygaard og<br />

J. Rastrup Andersen: Microwave spectrum and internal barrier of<br />

rotation of methyl ketene. Spectrochim. Acta 18, 1421 1424 (1962)<br />

B. Bak, J. Christiansen og J. Tormod Nielsen: Preparation of 300-500<br />

mg quantities of isotopic methyl ketenes. Acta Chem. Scand. 19, 2252-<br />

2253 (1965)<br />

110) B. Bak, J.J. Christiansen, K. Kunstmann, L. Nygaard og J.<br />

Rastrup-Andersen: Microwave spectrum, molecular structure, barrier<br />

to internal rotation, and dipole moment of methylketene. J. Chem.<br />

Phys. 45, 883-887 (1966)<br />

Ethylenimin<br />

B. Bak og S. Skaarup: The substitution structure of ethylenimine. J.<br />

Mol. Structure 10, 385-391 (1971)<br />

S. Skaarup: Ethylenimine inversion barrier and CH 2 group twist. Acta<br />

Chem. Scand. 26, 4190-4192 (1972)<br />

Formamid<br />

E. Hirota, R. Sugisaki, C.J. Nielsen og G.O. Sørensen: Molecular<br />

structure and internal motion of formamide from microwave spectrum.<br />

J. Mol. Spectrosc. 49, 251-267 (1974)<br />

Stubgaard: En mikrobølgespektroskopisk undersøgelse af formamids<br />

struktur. Licentiatafhandling, KU (1978)<br />

N-methylmethylenimine<br />

B. Bak, N. Wessel Larsen og H. Svanholt: Pyrolytic production and<br />

microwave spectra of light and heavy N-methylmethylenimine. Acta<br />

Chem. Scand. A31, 755-758 (1977)<br />

1,6-dioxa-6aë 4 -thiapentalene<br />

T. Pedersen, S.V. Skaarup og C.T. Pedersen: Structure and dipole moment<br />

of 1,6-dioxa-6aë 4 -thiapentalene from microwave spectra. Acta<br />

Chem. Scand. B31, 711-718 (1977)<br />

484) N. Wessel Larsen, L. Nygaard, T. Pedersen, C.T. Pedersen og H.<br />

Davy: Structure and electric dipole moment of 1,6-dioza-2,5-diaza-<br />

6aë 4 -thiapentalene from microwave spectra. J. Mol. Structure 118,<br />

89-95 (1984)<br />

Furfurylamin<br />

385) T. Pedersen: Conformation of furfurylamin. Preliminary results<br />

from a microwave investigation. J. Mol. Structure 64, 277-279 (1980)<br />

I. Hedgecock, N. Wessel Larsen, L. Nygaard, T. Pedersen og G.O.<br />

Sørensen: Conformation of furfurylamine studied by microwave spectra<br />

of five deuterated isotopomers of furfurylamine. J. Mol. Structure<br />

223, 33-44 (1990)<br />

Ethylvinylether<br />

N.L. Owen og G.O. Sørensen: Microwave spectrum conformation,<br />

and barrier to internal rotation of ethyl vinyl ether. J. Phys. Chem. 83,<br />

1483-1488 (1979)<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9/11, 2010


Nitromethan<br />

G.O. Sørensen, T. Pedersen, H. Dreizler, A. Guarnieri og A.P. Cox:<br />

Microwave spectra of nitromethane and D 3 -nitromethane. J. Mol.<br />

Structure 97, 77-82 (1983)<br />

G.O. Sørensen: Structural relaxation in nitromethanelike molecules. J.<br />

Chem. Phys. 105 (10), 3942-3949 (1996)<br />

Ethylnitrit<br />

N. Hansen, F. Temps, H. Mäder og N.W. Larsen: Analysis of internal<br />

rotations in ethyl nitrite using molecular beam Fourier transform microwave<br />

spectroscopy. Phys. Chem. Chem. Phys. 1, 3219-3233 (1999)<br />

1,4-difluor-2-butyn<br />

N.W. Larsen og H.A. Christiansen: Internal rotation and dipole moment<br />

of 1,4-difluoro-2-butyn studied by microwave spectroscopy.<br />

Asian Chem.Lett. vol 4, no 1&2, 25-31 (2000)<br />

H.A. Christiansen, M. Wandel, E.A. Philipp og N.W. Larsen: Deuterium<br />

labelling and preparation of 1,4-dihydroxy-, 1,4-dichloro- and<br />

1,4-difluoro-2-butyne. Asian Chem. Letters, vol. 7, 2&3, 47-52 (2003)<br />

BF 2 OH<br />

981) A. Perrin, M. Carvajal-Zaera, Z. Dutkiewicz, J.-M. Flaud, D.<br />

Collet, H. Bürger, J. Demaison, F. Willaert, H. Mäder og N.W. Larsen:<br />

High-resolution infrared and microwave study of 10 BF 2 OH and<br />

11 BFOH: the 5 1 , 6 1 , 7 1 , 8 1 , 9 1 and 8 1 9 1 vibrationally excited states. Molecular<br />

Physics, vol. 102, no 14-15, 1641-1652 (2004)<br />

TEORI<br />

T. Pedersen, N. Wesssel Larsen og H. Dreizler: Selection rules for<br />

rotor transistions in completely asymmetric molecules with planar top<br />

and frame and a twofold barrier. Z. Naturforsch. 24a, 649-652 (1969)<br />

T. Pedersen: Isomeri og potentiel energi. Dansk kemi 51, 129-131<br />

(1970)<br />

Særudgave af: dansk kemi, 91, nr. 9/11, 2010<br />

F. Jørgensen og T. Pedersen: A projector formulation for the Van<br />

Vleck transformation. I. Degenerate case. Mol. Phys. 27, 33-47 (1974),<br />

errata ibid. 28, 599 (1974)<br />

F. Jørgensen og T. Pedersen: A projector formulation for the Van<br />

Vleck transformation. II. Neardegenerate case. Mol. Phys. 27, 959-968<br />

(1974) errata ibid. 28, 599 (1974)<br />

T. Pedersen: Bredbånds mikrobølgespektroskopi, et redskab til konformationsanalyse.<br />

Dansk kemi 55, nr. 3, 16-20 (1974)<br />

F. Jørgensen: Effective hamiltonians. Mol. Phys. 29, 1137-1164 (1975)<br />

F. Jørgensen, T. Pedersen og A. Chedin: A projector formulation for<br />

the Van Vleck transformation III. Generalization and relation to the<br />

contact tranformation. Mol. Phys. 30, 1377-1395 (1975)<br />

318) T. Pedersen: Effective hamiltonian and effective dipole operator<br />

in the principal axis method (PAM). Mol. Phys. 32, 407-418 (1976)<br />

G.O. Sørensen: A new approach to the Hamiltonian of nonrigid molecules.<br />

Topics Curr. Chem. 82, 97-175 (1979)<br />

N. Wessel Larsen og T. Pedersen: Bestemmelse af molekylers konformation<br />

i gasfasen ved mikrobølgespektroskopi. Chemisk Tidende<br />

19-25 (maj 1979)<br />

G.O. Sørensen og T. Pedersen: Symmetry and microwave spectrum of<br />

nitromethane. Stud. Phys. Theor. Chem. 23 (Symmetries Prop. Non-<br />

Rigid Mol.), 219-236 (1983)<br />

T. Pedersen: Symmetri og struktur i kemien. Naturens Verden, 270-<br />

278 (1987)<br />

G.O. Sørensen: Effective vibration-rotation Hamiltonian of a molecule<br />

with a large-amplitude internal motion. J. Maruani (ed.) Molecules in<br />

Physics Chemistry, and Biology, Vol. II, 335-348 (1988) Kluwer Acad<br />

Publ.<br />

T. Pedersen: (H2O) 2 - et tunnelmonster. Aurum 3, 10-23 (1989)

Hooray! Your file is uploaded and ready to be published.

Saved successfully!

Ooh no, something went wrong!