11520009 Resistens Final Report - Spildevandsinfo.dk
11520009 Resistens Final Report - Spildevandsinfo.dk
11520009 Resistens Final Report - Spildevandsinfo.dk
Create successful ePaper yourself
Turn your PDF publications into a flip-book with our unique Google optimized e-Paper software.
Antibiotikaresistente bakterier i spildevand<br />
Undersøgelse af spredning fra Rigshospitalet til<br />
Renseanlæg Lynetten<br />
Lynettefællesskabet I/S<br />
Rapport<br />
Marts 2012
Go<strong>dk</strong>endt af:<br />
X<br />
Approved by<br />
Signed by: Ulf Nielsen<br />
This report has bred under the DHI Business Management System<br />
certified by DNV to comply with<br />
ISO 9001: Quality Management System<br />
13-03-2012
Antibiotikaresistente bakterier i<br />
spildevand<br />
Undersøgelse af spredning fra<br />
Rigshospitalet til Renseanlæg Lynetten<br />
Klient Lynettefællesskabet I/S<br />
Klientens repræsentant Kim Rindel<br />
Projekt nr. <strong>11520009</strong><br />
Klassifikation Tilhører klienten<br />
Forfattere Christine Anna Hastrup<br />
Claus Jørgensen<br />
Jette Wille Lentz Fredskilde<br />
Ulf Nielsen<br />
i
INDHOLDSFORTEGNELSE<br />
1 BAGGRUND ................................................................................................................. 1<br />
2 FORMÅL ....................................................................................................................... 2<br />
3 MÅLEPROGRAM .......................................................................................................... 3<br />
3.1 Prøvetagningsprogram .................................................................................................. 3<br />
3.1.1 Rigshospitalet ............................................................................................................... 3<br />
3.1.2 Renseanlæg Lynetten ................................................................................................... 4<br />
3.2 Analyseprogram ............................................................................................................ 5<br />
3.2.1 Tabletmetoden .............................................................................................................. 7<br />
3.2.2 E-Test (Epsilometer Test) ............................................................................................. 7<br />
3.2.3 MALDI-TOF-MS ............................................................................................................ 7<br />
3.2.4 Ribotypning ................................................................................................................... 7<br />
4 RESULTATER OG DISKUSSION ................................................................................. 9<br />
4.1 Forekomst af bakterier og resistens .............................................................................. 9<br />
4.2 E. coli – ribotyper og resistensmønstre ....................................................................... 11<br />
4.3 Klebsiella – ribotyper og resistensmønstre .................................................................. 14<br />
5 KONKLUSION ............................................................................................................ 16<br />
6 ANBEFALINGER ........................................................................................................ 17<br />
7 REFERENCER ........................................................................................................... 18<br />
BILAG A.................................................................................................................................... 23<br />
BILAG B.................................................................................................................................... 25<br />
BILAG C ................................................................................................................................... 27<br />
BILAG D ................................................................................................................................... 29<br />
BILAG E.................................................................................................................................... 31<br />
BILAG F .................................................................................................................................... 33<br />
i DHI
ii DHI
1 BAGGRUND<br />
Der har været et stigende forbrug af antibiotika i Danmark siden starten af 00’erne<br />
(Statens Serum Institut, 2010). Et stigende antibiotikaforbrug medfører øget<br />
antibiotikaresistens. Tidligere undersøgelser og måleprogrammer har vist, at<br />
antibiotikaresistente bakterier forekommer i hospitalsspildevand, på renseanlæg, og i<br />
vandmiljøet (Lynettefællesskabet, 2004; Lynettefællesskabet, 2007; Miljøstyrelsen,<br />
2002). Hvis mennesker eksponeres for spildevand, er der en risiko for at blive inficeret.<br />
Hvis der er tale om infektion med antibiotikaresistente patogene bakterier, kan<br />
behandlingen besværliggøres eller i særligt uheldige tilfælde umuliggøres.<br />
Baggrunden for dette projekt er et ønske om at undersøge spredningen af<br />
hospitalsspecifik antibiotikaresistens til kloakker, renseanlæg og vandmiljø med henblik<br />
på at forbedre datagrundlaget for at vurdere risikoen for at blive inficeret med<br />
antibiotikaresistente bakterier. I Danmark bliver 10 % af humane antibiotika anvendt på<br />
hospitaler (Statens Serum Institut, 2010). Der forekommer multiresistente bakterier på<br />
hospitalerne. Hospitalernes antibiotikaforbrug giver samtidig et øget selektionspres,<br />
hvor væksten af følsomme bakterier hæmmes, og væksten af modstandsdygtige<br />
bakterier fremmes. Dette kan medføre, at antibiotikaresistente bakterier har en fordel<br />
over for mere følsomme bakterier i spildevand med antibiotika.<br />
For at undersøge, om antibiotikaresistens kan spores direkte tilbage til specifikke<br />
hospitaler, er Rigshospitalet valgt som case. Infektionshygiejnisk Enhed (IHE) på<br />
Rigshospitalet har opbygget en databank med ribotyper (rRNA-profiler) af alle<br />
multiresistente E. coli og Klebsiella, som er identificeret på Rigshospitalet siden 2005.<br />
E. coli eller Klebsiella betegnes som multiresistent, hvis den er resistent over for to af<br />
følgende tre antibiotika: Gentamicin, cefuroxim og ciprofloxacin. Endvidere omfatter<br />
databanken profilerne for de identificerede vancomycin-resistente enterokokker (VRE).<br />
Ved sammenligning af ribotyper af antibiotikaresistente bakterier fundet i<br />
Rigshospitalets spildevand, på Renseanlæg Lynetten og i Øresund med ribotyperne i<br />
IHE’s databank vil det være muligt at vurdere, om den nedstrøms målte<br />
antibiotikaresistens kan spores tilbage til Rigshospitalet. Nærværende projekt vil<br />
dermed bidrage til mere viden omkring sammenhængen mellem hospitalerne og<br />
antibiotikaresistens i vandmiljøet.<br />
1
2 FORMÅL<br />
Formålet med undersøgelsen er at screene for spredningen af hospitalsspecifik<br />
antibiotikaresistens fra hospitaler til renseanlæg og vandmiljø. Der arbejdes konkret<br />
med Rigshospitalet og Renseanlæg Lynetten, som Rigshospitalet afleder til. Samtidig<br />
undersøges forekomsten af vancomycin-resistente enterokokker på renseanlæg og i<br />
vandmiljø. Herunder er det formålet at:<br />
udtage prøver fra henholdsvis Rigshospitalet, Renseanlæg Lynetten og Øresund<br />
identificere og isolere antibiotikaresistente bakterier fra de tre lokaliteter<br />
anvende ribotypning til kortlægning af rRNA-profiler af de fundne<br />
antibiotikaresistente bakterier<br />
sammenligne rRNA-profilerne af de fundne antibiotikaresistente bakterier med<br />
rRNA-profiler i Rigshospitalets databank for at afklare, om de fundne<br />
antibiotikaresistente bakterier kan spores tilbage til Rigshospitalet.<br />
2
3 MÅLEPROGRAM<br />
3.1 Prøvetagningsprogram<br />
Der er taget prøver fra følgende tre lokaliteter:<br />
Rigshospitalet<br />
Renseanlæg Lynetten<br />
Kongedybet i Øresund<br />
3.1.1 Rigshospitalet<br />
Der blev udtaget spildevandsprøver fra Rigshospitalet tirsdag den 30. august 2011<br />
mellem kl. 10.00 og kl. 10.30. Prøverne blev taget i brønden på<br />
personaleparkeringspladsen langs Blegdamsvej (markeret med en stjerne på Figur 3-1).<br />
Figur 3-1 Kort over Rigshospitalets område, hvor prøvetagningsbrønden er markeret med en stjerne.<br />
Bygninger, der afleder spildevand til prøvetagningsbrønden, er markeret med pile til<br />
prøvetagningsbrønden. Det originale billede er udlånt af Rigshospitalet.<br />
Pumper, der afleder regn- og drænvand til prøvetagningsbrønden, blev standset under<br />
prøvetagningen. Det forventes dermed, at prøverne udelukkende består af sanitært<br />
spildevand.<br />
Fordelingen af spildevand, der afledes til prøvetagningsbrønden, er ifølge teknisk<br />
personale på Rigshospitalet estimeret til ca. 90% fra centralbygningen, sydbygningen og<br />
mellembygningen og ca. 10 % fra epidemi- og infektionsafdelingen (stiplet linje).<br />
Der blev udtaget ialt ca. 30 liter spildevand. Spildevandet blev efter prøvetagning<br />
sammenblandet i forholdet 90:10, jf. ovenstående.<br />
Figur 3-2 viser prøvetagningsbrønden.<br />
3
Figur 3-2 Billede af prøvetagningsbrønden ved Rigshospitalet med prøvetagningsudstyr.<br />
3.1.2 Renseanlæg Lynetten<br />
Der blev udtaget tre prøver fra Renseanlæg Lynetten: Én fra indløbet, én fra indløbet til<br />
biologisk rensning og én fra udløbet. Vand fra indløbet til biologisk rensning er primært<br />
renset, men ikke biologisk renset, og i tilfælde af højt flow med overløb vil vandet fra<br />
indløbet til biologisk rensning være sammenligneligt med overløbsvandet, da overløb<br />
sker efter primær rensning.<br />
Prøverne blev taget som flowproportionelle døgnprøver fra kl. 9 den 29. august 2011 til<br />
kl. 9 den 30. august 2011. Hver prøve blev taget i en PE-dunk med et volumen på 5<br />
liter. Prøverne blev opbevaret på køl.<br />
Der var flere kraftige regnbyger i Københavnsområdet i prøvetagningsperioden.<br />
3.1.3 Kongedybet, Øresund<br />
Sedimentprøver blev indsamlet i Kongedybet i Øresund tæt på udløbet fra Renseanlæg<br />
Lynetten. Indsamlingen fandt sted den 29. august 2011. Sedimentet blev indsamlet fra<br />
en RHIB (Rigid-Hulled Inflatable Boat) ved brug af en grab i 6,8 meters dybe. Punktet,<br />
hvor sedimentet blev indsamlet, har koordinaterne N55º41.761’ E012º38.890’. Dette<br />
punkt er cirka 200 meter fra udløbet fra Lynetten.<br />
Muslingerne blev indsamlet i en 10-liters plastspand ca. 50 meter fra punktet, hvor<br />
sedimentet blev indsamlet. Efter indsamling blev muslingerne transporteret til DHIs<br />
laboratorier i plastspanden, hvorefter muslingerne blev renset og skallerne fjernet.<br />
4
Figur 3-3 Kort over København og Kongedybet i Øresund (Eniro/Krak, 2011). Prøvetagningsstedet for<br />
sediment og muslinger er markeret med rødt.<br />
3.2 Analyseprogram<br />
Analyser blev udført i DHIs laboratorier samt på IHEs laboratorier på Rigshospitalet.<br />
<strong>Resistens</strong>bestemmelserne omfattede tre typer af testbakterier: Escherichia coli,<br />
Klebsiella pneumoniae og enterokokker. Protokoller for bestemmelserne fremgår af<br />
Bilag A-C. Der blev i alt analyseret for resistens over for fem antiobiotika. Tabel 3-1 er<br />
en oversigt over antibiotika og testbakterier anvendt i analyserne.<br />
Tabel 3-1 Antibiotika og tilhørende anvendelsesområder samt testbakterier og anvendte breakpoints for<br />
hvert antibiotikum<br />
Antibiotikum Anvendelse Testbakterie(r)<br />
Ciprofloxacin<br />
Hospitaler og<br />
primærsektor<br />
Cefuroxim Hospitaler<br />
Gentamicin Hospitaler<br />
Meropenem Hospitaler<br />
E. coli og<br />
Klebsiella<br />
E. coli og<br />
Klebsiella<br />
E. coli og<br />
Klebsiella<br />
E. coli og<br />
Klebsiella<br />
5<br />
Breakpoint<br />
[µg/ml] 1<br />
Vancomycin Hospitaler Enterokokker 4<br />
1. (EUCAST, 2011)<br />
For spildevandsprøverne fra Rigshospitalet og Renseanlæg Lynetten blev der testet for<br />
resistens for alle tre typer testbakterier.<br />
Bestemmelse af ”suspekte E. coli” blev gennemført ved spredning af spildevandsprøven<br />
i triplikat på Oxoid Brilliance agar, der er en selektiv agar for coliforme bakterier. Alle<br />
violette kolonier blev talt som ”suspekte E. coli”, idet der ikke blev gennemført<br />
yderligere verifikation af de enkelte kolonier. Brilliance agaren var enten uden<br />
antibiotika eller med antibiotika, henholdsvis ciprofloxacin (1 mg/l), gentamicin (4<br />
1<br />
8<br />
4<br />
8
mg/l) og cefuroxim (8 mg/l). De angivne koncentrationer af ciprofloxacin, gentamicin<br />
og cefuroxim er breakpoints, og bakteriekolonier dyrket ved eller over denne<br />
antibiotikakoncentration må anses for at være resistente (EUCAST, 2011).<br />
For bestemmelse af ”suspekte Klebsiella” blev der spredt spildevandsprøve i enkelt<br />
udsæd på blodagar og i dobbelt udsæd på HiCrome TM agar, en selektiv agar for<br />
Klebsiella. For begge typer agar blev der lavet plader uden antibiotika samt plader med<br />
Ciprofloxacin (1 mg/l), Gentamicin (4 mg/l) og Cefuroxim (8 mg/l) tilsat agaren. Alle<br />
lilla-mangenta røde kolonier blev talt som ”suspekte Klebsiella”.<br />
Figur 3-4 Billede af E. coli, coliforme og ikke coliforme bakterier dyrket på Oxoid Brilliance agar. Foto:<br />
DHI.<br />
For at teste for multiresistens blev der udvalgt fem E. coli og Klebsiella fra hver plade<br />
med henholdsvis ciprofloxacin, gentamicin og cefuroxim. De udvalgte kolonier blev<br />
overført til nye agarplader, en plade pr. koloni. Kolonierne blev testet for Ciprofloxacin-,<br />
Gentamicin-, Cefuroxim- og Meropenemresistens ved tabletmetoden. MALDI-<br />
TOF-MS blev brugt til artsbestemmelse. Udvalgte isolater blev ribotypet og E-testet.<br />
For bestemmelse af suspekte Enterokokker blev der spredt prøve i duplikat på Slanezt<br />
agar uden antibiotika samt på agar med Vancomycin (4 mg/l). Der blev testet for<br />
Vancomycinresistens ved tabletmetoden, og artsbestemmelse blev gennemført med<br />
MALDI-TOF-MS. Udvalgte isolater blev ribotypet og E-testet.<br />
For muslingeprøverne blev muslingekødet blendet i et våd vægt:volumen forhold på<br />
1:10. Bakterier blev dyrket i MacConkey bouillon uden antibiotika samt med<br />
henholdsvis Ciprofloxacin (1 mg/l), Gentamicin (4 mg/l) og Cefuroxim (8 mg/l).<br />
Samme procedure blev fulgt for sedimentprøverne.<br />
6<br />
Violet:<br />
E. coli<br />
Pink:<br />
coliform<br />
Blå:<br />
Ej coliform<br />
eller E. coli
3.2.1 Tabletmetoden<br />
Tabletmetoden bruges til bestemmelse af resistens over for forskellige antibiotika.<br />
Tabletmetoden er baseret på diffusion af antibiotika i agar.<br />
Resultaterne af tabletmetoden er for hvert antibiotikum enten følsom, intermediær eller<br />
resistent. Hvis resultatet er følsom, betyder det, at bakterien ikke har nogen påviste<br />
resistensmekanismer mod det pågældende antibiotikum. I medicinsk forstand betyder<br />
følsom, at antibiotikummet forventes at have virkning ved standarddosis. Hvis resultatet<br />
er intermediær, betyder det, at bakterien har nedsat følsomhed over for det pågældende<br />
antibiotikum. Medicinsk kan dette betyde, at stoffet evt. kræver en højere dosering, eller<br />
at stoffet opkoncentreres på infektionsstedet. Hvis resultatet er resistent, betyder det, at<br />
bakterien har en til flere resistensmekanismer, som gør, at bakterien ikke påvirkes af det<br />
pågældende antibiotikum. Dette bevirker, at en infektion med denne bakterie ikke vil<br />
kunne behandles med det pågældende antibiotikum (Dansk Selskab for Klinisk<br />
Mikrobiologi, 2004).<br />
3.2.2 E-Test (Epsilometer Test)<br />
E-test bruges til at fastlægge MICkoncentrationen<br />
for bakterier. Testen består af<br />
en plastikstrip påført antibiotika i stigende<br />
koncentration ned langs længden af strippen.<br />
Strippen placeres på en agarplade og inkuberes.<br />
Der opstår en hæmningszone omkring strippen,<br />
som vist på Figur 3-5. MIC (Minimum<br />
Inhibition Concentration) værdien aflæses<br />
direkte på strippen og angiver den laveste<br />
antibiotika koncentration, der skal til for at<br />
hæmme bakteriernes vækst (Dansk Selskab for<br />
Klinisk Mikrobiologi, 2004).<br />
3.2.3 MALDI-TOF-MS<br />
MALDI-TOF-MS er i dette studie brugt til artsbestemmelse af bakterier baseret på<br />
proteiner. Det er en koblet analysemetode bestående af tre dele: MALDI (Matrix<br />
Assisted Laser Desorption Ionization), TOF (Time of Flight) og MS (Mass<br />
Spectrometry). Proteiner fra de bakterier, der ønskes artsbestemt, ekstraheres og<br />
indlejres i en matrix. Matrixen beskydes med en laserstråle, hvis energi bevirker, at<br />
proteinmolekyler ioniseres. Efterfølgende accelereres proteinmolekylerne i et elektrisk<br />
felt. De ioniserede molekylers forskellige masser gør, at forskellige molekyler får<br />
forskellige hastigheder, som registreres og danner et spektrum. Spektret er specifikt for<br />
den pågældende mikroorganisme, som identificeres ved sammenligning med kendte<br />
referencespektre i en database (OUH, 2009).<br />
3.2.4 Ribotypning<br />
Ribotypning er en metode, der anvendes til at identificere bakteriestammer. Metoden<br />
virker ved, at en bakteriestamme isoleres, og der ekstraheres genomisk DNA. DNA’et<br />
kappes med et restriktionsenzym og separeres ved gelelektroforese. 16S og 23S rRNA<br />
bruges som probe. Gelen fotograferes og analyseres digitalt på en computer, hvor<br />
billedet sammenlignes med tidligere undersøgte bakterier i en database. Ribotypen er<br />
således en slags fingeraftryk, der fortæller om DNA’et som koder for rRNA.<br />
7<br />
Figur 3-5 Eksempel på agarplade med Etest<br />
(kilde: Wikipedia)
Ribotypning anvendes som fast procedure på Rigshospitalet, udført af<br />
Infektionshygiejnisk Enhed, ved udredning af infektionsudbrud samt ved overvågning<br />
af særlige bakterietyper i forbindelse med eventuel spredning af infektioner og analyse<br />
til sammenligning af resistente bakterier (Infektionshygiejnisk Enhed, 2007).<br />
8
4 RESULTATER OG DISKUSSION<br />
4.1 Forekomst af bakterier og resistens<br />
Der blev fundet multiresistente bakterier (resistente for mindst to antibiotika) i<br />
spildevandsprøverne, mens de hverken blev fundet i sedimentprøverne eller i<br />
muslingerne. De følgende resultater er derfor kun for spildevandsprøverne. Tabel 4-1<br />
viser de fundne koncentrationer af suspekte E. coli, suspekte Klebsiella, suspekte<br />
enterokokker og coliforme bakterier i spildevandsprøverne.<br />
Bakterie<br />
E. coli<br />
Klebsiella<br />
Coliforme<br />
Enterokokker<br />
Tabel 4-1 Total koncentration af suspekte E. coli, suspekte Klebsiella, suspekte enterokokker og<br />
coliforme bakterier i spildevandet fra hvert prøvetagningssted samt koncentrationen af hver<br />
type bakterie resistent over for udvalgte antibiotika fra hvert prøvetagningssted.<br />
Prøvetagningssted<br />
Total<br />
Ciprofloxacin<br />
resistente<br />
bakterier<br />
9<br />
Cefuroxim<br />
resistente<br />
bakterier<br />
Gentamicin<br />
resistente<br />
bakterier<br />
Vancomycin<br />
resistente<br />
bakterier<br />
[kim/ml] [kim/ml] % [kim/ml] % [kim/ml] % [kim/ml]<br />
Rigshospitalet 22.700 7.140 31 1.050 5 1.090 5 -<br />
RL tilløb 31.800 1.270 4 1.000 3 1.320 4 -<br />
RL tilløb bio 40.100 1.730 4 1.180 3 909 2 -<br />
RL udløb 1.550 59 4 55 4 55 4 -<br />
Rigshospitalet 39.500 10.200 26 16.000 41 10.000 25 -<br />
RL tilløb 69.400 2.270 3 2.180 3 1.070 2 -<br />
RL tilløb bio 49.500 1.770 4 1.910 4 1.800 4 -<br />
RL udløb 2.880 82 3 64 2 82 3 -<br />
Rigshospitalet 50.900 14.500 28 9.460 19 6.270 12 -<br />
RL tilløb 89.600 2.720 3 2.820 3 1.729 2 -<br />
RL tilløb bio 93.700 2.820 3 2.950 3 1.409 2 -<br />
RL udløb 5.500 104 2 105 2 100 2 -<br />
Rigshospitalet 39.100 - - - (5)<br />
RL tilløb 26.600 - - - (27)<br />
RL tilløb bio 1.080 - - - (< 5)<br />
RL udløb 2.910 - - - (36)<br />
( ) Kolonier kunne ikke verificeres som enterokokker på IHE<br />
Der ses en tendens til, at koncentrationen af total kimtal er lavere i spildevandet fra<br />
Rigshospitalet end i tilløbet til Renseanlæg Lynetten, mens den laveste koncentration<br />
blev observeret i det rensede spildevand. Renseeffektiviteten over renseanlægget for de<br />
målte bakterier ligger omkring 95%. En rensningsgrad på 95% ses ofte, men<br />
rensningsgrader på > 99% er ikke udsædvanlige (Erichsen et al., 2006).<br />
Der er generelt fundet flere suspekte Klebsiella end suspekte E. coli. Klebsiella og E.<br />
coli tilhører begge gruppen af coliforme bakterier. Summen af E. coli og Klebsiella<br />
burde derfor være mindre end eller lig med koncentrationen af totale coliforme<br />
bakterier. Generelt var der god overensstemmelse, idet niveauerne var ens, som det
Antibiotikum<br />
fremgår af Tabel 4-1. Dog ses det, at for mange af prøverne er summen af suspekte<br />
Klebsiella og suspekte E. coli lidt højere end koncentrationen af totale coliforme (13%<br />
til 92% højere). Det skyldes, at selektiviteten af de anvendte agar er forskellig, og at<br />
man derfor ikke umiddelbart kan sammenligne tallene. Endvidere kan det skyldes, at<br />
nogle af de suspekte Klebsiella og de suspekte E. coli ikke var Klebsiella eller E. coli.<br />
Det ses også, at der generelt var flere resistente bakterier i spildevandsprøverne fra<br />
Rigshospitalet end i prøverne fra Renseanlæg Lynetten. Koncentrationen af resistente<br />
bakterier i Renseanlæg Lynettens tilløb og tilløb til biologisk rensning var nogenlunde<br />
ens, mens den laveste koncentration blev målt i udløbet. Andelen af resistente bakterier<br />
i tilløb og udløb fra Lynetten var 2% til 4%, mens andelen af resistente bakterier var<br />
væsentligt højere i spildevandet fra Rigshospitalet (12% til 31%) med undtagelse af<br />
cefuroxim og gentamicin resistente suspekte E. coli, hvor kun 5% var resistente.<br />
De resistente bakterier, der findes i spildevandet, kommer enten fra inficerede patienter,<br />
er dannet i kloakken ved celledeling (vertikal overførsel) eller ved udveksling af<br />
genetisk materiale mellem bakterier (horisontal overførsel). Ved en intensiv anvendelse<br />
af antibiotika forventes der at ske en selektion af resistente bakterier, så en større andel<br />
af patienterne udskiller resistente bakterier til spildevandet. Ved en høj koncentration af<br />
antibiotika i spildevandet forventes det, at resistente bakterier vil have en<br />
konkurrencemæssig fordel og dermed have en forøget koncentration og procentvis<br />
andel. En stor andel af de antibiotika, der anvendes i oplandet til Renseanlæg Lynetten,<br />
bliver brugt på Rigshospitalet (se Tabel 4-2). Dette stemmer overens med, at de højeste<br />
andele af resistente bakterier blev fundet ved Rigshospitalet. Desuden ses det, at andelen<br />
af resistente bakterier generelt var højest for cefuroxim og ciprofloxacin, hvilket<br />
stemmer med, at forholdet mellem den beregnede koncentration af antibiotikum i<br />
spildevandet set i forhold til breakpoint koncentration var højest for disse.<br />
Tabel 4-2 Forbrug og beregnet spildevandskoncentration af de antibiotika, der er anvendt i studiet (DHI<br />
2011). Tabellen viser endvidere antibiotikakoncentrationen i de agar, som er anvendt til<br />
tællingerne (breakpoint), samt forholdet mellem beregnet antibiotikakoncentration i<br />
spildevandet og forholdet mellem beregnet antibiotikakoncentration (Rigshopitalet og<br />
Renseanlæg Lynetten) og koncentration i agar.<br />
Forbrug<br />
RH<br />
Forbrug<br />
RL<br />
opland<br />
Forbrug<br />
RH<br />
Konc.<br />
spildevand<br />
RH<br />
10<br />
Konc.<br />
tilløb RL<br />
Konc<br />
agar<br />
*Spildevand<br />
(RH)/Agar<br />
*Spildevand<br />
(RL)/Agar<br />
(kg/år) (kg/år) % (µg/l) (µg/l) (µg/l) % %<br />
Cefuroxim 156 276 56 646 4,7 8000 8 0,1<br />
Gentamicin 0,9 2,3 38 3,6 0,04 4000 0,1 0,001<br />
Ciprofloxacin 51 184 28 211 3,1 1000 21 0,3<br />
Meropenem 74,7 89 84 310 1,5<br />
*Den beregnede koncentration i spildevandet/koncentrationen i agar benyttet til tælling<br />
På baggrund af prøvetagninger er det ikke muligt at vurdere indholdet af multiresistente<br />
bakterier opstrøms Rigshospitalet. Det er muligt, at nogle patienter inficeret med<br />
multiresistente bakterier på Rigshospitalet forlader hospitalet, mens de stadig bærer<br />
multiresistente bakterier. Dette vil medføre, at den multiresistente bakteriestamme både<br />
vil være til stede i Rigshospitalets spildevand og i husspildevandet fra patientens hjem.<br />
Der blev ikke fundet vancomycin resistente enterokokker i spildevandet.
4.2 E. coli – ribotyper og resistensmønstre<br />
Tabel 4-3 viser resultaterne af resistensbestemmelser gennemført af IHE af E. coli i<br />
spildevandprøverne. Der blev analyseret 15 stammer fra hver af de fire<br />
spildevandsprøver. Hver spildevandsprøve blev spredt på tre agarplader tilsat<br />
antibiotika, henholdsvis ciprofloxacin, cefuroxim og gentamicin, for at selektere for<br />
resistente stammer. Fra hver agarplade blev der udtaget fem E. coli stammer. Hver<br />
stamme blev rendyrket på en ny agarplade, og resistens over for ciprofloxacin,<br />
cefuroxim, gentamicin og meropenem blev testet ved tabletmetoden. Resultatet F er<br />
markeret med grøn skrift og indikerer en følsom stamme, I er markeret med gul skrift<br />
og indikerer en intermediær stamme, og R er markeret med rød skrift og indikerer en<br />
resistent stamme.<br />
Det ses, at de stammer, der er isoleret fra agarplader tilsat ciprofloxacin, alle er bestemt<br />
til at være ciprofloxacinresistente. Det samme gælder for cefuroxim. For gentamicin er<br />
prøven fra RL tilløb en undtagelse, idet alle stammer er følsomme over for gentamicin.<br />
Det formodes, at der er tale om en laboratoriefejl, idet stammer fremdyrket på en<br />
agarplade med gentamicin burde være resistente overfor gentamicin.<br />
Tabel 4-3 <strong>Resistens</strong>mønstre for de 15 dyrkede E. coli stammer fra spildevandsprøverne fra henholdsvis<br />
Rigshospitalet, tilløb til RL, tilløb til biologisk rensning på RL og udløb fra RL. F betyder, at<br />
stammen er følsom, I betyder intermediær og R betyder resistent.<br />
Dyrket på plade<br />
med<br />
ciprofloxacin<br />
Dyrket på plade<br />
med cefuroxim<br />
Dyrket på plade<br />
med gentamicin<br />
ciprofloxacin<br />
Rigshospitalet RL tilløb RL tilløb bio. RL udløb<br />
cefuroxim<br />
gentamicin<br />
meropenem<br />
ciprofloxacin<br />
11<br />
cefuroxim<br />
gentamicin<br />
meropenem<br />
R F F F R R F F R F F F R R F F<br />
R F F F R F R F R R F F R R F F<br />
R F F F R F F F R R F F R F R R<br />
R F F F R F F F R R F F R F F R<br />
R F F F R I F F R R F F R F F R<br />
F R R F F R F F R R F F R R F F<br />
F R R F R R F F F R F F F I F F<br />
F R R F R R F F R R R F F R F F<br />
R R R F F R F F R R F F R R F F<br />
R R R F R R F F F R F F F R F F<br />
F F R F F I I F F R R F F F R F<br />
F I R F F F F F R F R F F I R F<br />
F F R F F F F F R F R F F I R F<br />
R R R F F F F F F R R F R F R F<br />
R R R F F F F F F I R F<br />
ciprofloxacin<br />
cefuroxim<br />
gentamicin<br />
meropenem<br />
ciprofloxacin<br />
cefuroxim<br />
gentamicin<br />
meropenem
Der blev fundet 7 multiresistente E. coli stammer med 4 forskellige resistensmønstre på<br />
Rigshospitalet, 3 multiresistente E. coli stammer med 3 forskellige resistensmønstre i<br />
tilløbet til Lynetten, 11 multiresistente E. coli stammer med 5 forskellige<br />
resistensmønstre i tilløbet til biologisk rensning og 7 multiresistente E. coli stammer<br />
med 4 forskellige resistensmønstre i udløbet fra Lynetten. 16 multiresistente E. coli<br />
stammer blev udvalgt til ribotypning. De ribotypede stammer er markeret med en grå<br />
kasse i Tabel 4-3.<br />
Resultaterne af ribotypningen af de udvalgte E. coli stammer er vist i Tabel 4-4. Af de<br />
16 ribotypede E. coli stammer var der 10 forskellige ribotyper. 9 af de 10 ribotyper var i<br />
forvejen kendt og en del af Rigshospitalets databank, hvilket betyder, at de tidligere er<br />
forekommet på Rigshospitalet. Den ene ukendte ribotype blev fundet i tilløbet til<br />
biologisk rensning på RL og blev tildelt ribotypenummeret 876-S6.<br />
Ribotype 70-S4 blev identificeret i spildevandet fra tilløbet til RL og i tilløbet til<br />
biologisk rensning på RL. Selvom ribotypen er den samme, viser Tabel 4-4, at de<br />
analyserede E. coli stammer har forskellige resistensmønstre.<br />
Ribotype 129-S1 blev identificeret i spildevandsprøverne fra alle fire<br />
prøvetagningssteder, henholdsvis Rigshospitalet, tilløb til RL, tilløb til biologisk<br />
rensning på RL og udløb fra RL. Alle fire 129-S1 stammer har forskellige<br />
resistensmønstre.<br />
Tabel 4-4 Ribotyper for de analyserede multiresistente E. coli fundet i spildevandet fra Rigshospitalet,<br />
tilløb til RL, tilløb til biologisk rensning på RL og udløb fra RL. <strong>Resistens</strong> over for Ciprofloxacin,<br />
Cefuroxim, Gentamicin og meropenem er også vist. F betyder følsom, I betyder intermediær,<br />
og R betyder resistent. De ribotyper, der er identificeret fra mere end et prøvetagningssted, er<br />
markeret med fed skrift.<br />
Prøvetagningssted<br />
Rigshospitalet<br />
RL tilløb<br />
RL tilløb bio<br />
ciprofloxacin<br />
cefuroxim<br />
12<br />
gentamicin<br />
meropenem<br />
Ribotype<br />
F R R F 70-S3<br />
F R R F 129-S1<br />
R R R F 163-S2<br />
R R R F 163-S2<br />
R F R F 70-S4<br />
R R F F 70-S4<br />
R R F F 129-S1<br />
R R F F 70-S4<br />
F R R F 125-S2<br />
R F R F 129-S1<br />
R R R F 104-S1<br />
R F R F 876-S6
RL udløb<br />
R R F F 71-S2<br />
R R R F 129-S1<br />
R R F F 424-S2<br />
R F R F 166-S7<br />
På den ene side indikerer fundet af en multiresistent E. coli ribotype 129-S1 i alle<br />
prøverne, at multiresistente E. coli fra Rigshospitalet kan nå Renseanlæg Lynetten og<br />
blive udledt, enten gennem renseanlægget eller i forbindelse med en overløbshændelse.<br />
På den anden side indikerer forskellene i deres resistensmønstre, at de fundne E. coli<br />
type 129-S1 stammer fra forskellige kilder.<br />
Ribotypning er baseret på forskelle i den DNA, der koder for de ribosomale subunits<br />
5S, 16S og 23S. Det betyder, at der godt kan være forskelle i den øvrige del af det<br />
kromosomale DNA, selvom ribotypen er den samme. Desuden kan samme ribotype<br />
bære plasmider med forskellige resistensegenskaber. Derfor kan to stammer af samme<br />
ribotype have forskellige resistensmønstre. Det er f.eks. vist for quinolone kromosomalt<br />
båret (GyrA) resistens i Clostridium dificile (Carman et al., 2009).<br />
Kromosomalt bårne resistensegenskaber ændrer sig ikke over kort tid, da det kræver en<br />
mutation. Der kan dog være hurtige fænotypiske ændringer, da den resistente egenskab<br />
ikke udtrykkes under alle forhold (se Schreiber, 2011), men det forventes, at<br />
dyrkningsforholdene ved resistensbestemmelserne er ensartet, så de fænotypiske<br />
ændringer ikke vil blive detekteret med de metoder, der er anvendt i nærværende studie.<br />
Kromosomalt bårne resistensegenskaber forventes derfor ikke at ændre sig på den korte<br />
tid, der er mellem Rigshospitalet og Renseanlæg Lynetten. Derimod kan plasmidbårne<br />
resistensegenskaber ændre sig over relativt kort tid ved horizontal overførsel mellem<br />
bakterier. F.eks. beregnede Marcinek et al. (1998), at der skete mellem 10 4 og 10 8<br />
plasmidoverførsler pr. 4 timer i et renseanlæg. Der er derfor sandsynligt, at der sker en<br />
ændring af de plasmidbårne resistensegenskaber mellem Rigshospitalet og<br />
Renseanlægget.<br />
<strong>Resistens</strong> over for ciprofloxacin, cefuroxim, gentamicin og meroponem kan både være<br />
båret kromosomalt og ved plasmider (Schumacher et al., 1996; Suh Yah. 2010; Center<br />
for Disease Control, 2010; Cheung et al., 2005; Fujisawa-Kon et al., 1981, Kaufhold &<br />
Potgieter, 1993). Det betyder, at resistensmønstrene i princippet godt kan ændre sig på<br />
vej ned igennem kloaksystemet ved horisontal overførsel af plasmider.<br />
Det er også muligt at samme ribotype har eksisteret på Rigshospitalet med forskellige<br />
ribotyper. Ved opslag i Rigshospitalets database kan det ses, at der fra januar 2008 til<br />
december 2011 har været identificeret 90 isolater af E. coli ribotype 129-S1. De 90<br />
isolater har et varierende resistensmønster, hvilket tyder på, at det er en klon, der har<br />
været længe på Rigshospitalet, eller som muterer hurtigt (Andersen, 2012).<br />
Det konkluderes, at der er fundet multiresistente E. coli ribotype 129-S1 ved alle<br />
prøvetagningssteder. Da de har forskellige resistensmønstrer, er det sandsynligt, at de E.<br />
coli ribotype 129-S1, der er fundet ved Renseanlæg Lynetten, ikke er de samme som de,<br />
der er fundet ved Rigshospitalet. Men det kan ikke udelukkes, at det er de samme, da<br />
resistensmønstret kan ændre sig på vejen gennem kloaksystemet.<br />
13
4.3 Klebsiella – ribotyper og resistensmønstre<br />
Tabel 4-5 viser resistensmønstre for Klebsiella stammer dyrket fra spildevandsprøverne<br />
fra Rigshospitalet og indløbet til RL. Der blev ikke isoleret nogle resistente Klebsiella<br />
stammer i spildevandet fra indløbet til biologisk rensning på RL eller i udløbet fra RL.<br />
Der blev generelt ikke fundet lige så mange multiresistente Klebsiella stammer som<br />
resistente E. coli stammer. Der var 10 multiresistente Klebsiella stammer fra<br />
spildevandsprøven fra Rigshospitalet med 3 forskellige resistensmønstre. Der var 2<br />
multiresistente Klebsiella stammer fra spildevandet fra tilløbet til RL, og begge<br />
stammer havde samme resistensmønster. De multiresistente Klebsiella stammer, der<br />
blev udvalgt til ribotypning, er markeret med en grå kasse i Tabel 4-5.<br />
Tabel 4-5 <strong>Resistens</strong>mønstre for de 10 dyrkede Klebsiella stammer fra spildevandsprøven fra<br />
Rigshospitalet og de to stammer fra tilløb til RL.<br />
Fra agarplade<br />
med<br />
ciprofloxacin<br />
Fra agarplade<br />
med cefuroxim<br />
Fra agarplade<br />
med gentamicin<br />
ciprofloxacin<br />
Rigshospitalet RL tilløb<br />
cefuroxim<br />
14<br />
gentamicin<br />
meropenem<br />
R R R F R R F F<br />
R R R F R R F F<br />
R I R F<br />
R R R F<br />
R R R F<br />
I R R F<br />
R R R F<br />
R R R F<br />
R R R F<br />
R R R F<br />
Resultaterne af ribotypningen af de udvalgte Klebsiella stammer er vist i Tabel 4-6. Der<br />
blev fundet tre ribotyper ialt. To af de tre udvalgte stammer fra Rigshospitalet havde<br />
samme ribotype, 876-S1.<br />
ciprofloxacin<br />
cefuroxim<br />
gentamicin<br />
meropenem
Tabel 4-6 Ribotyper for de analyserede multiresistente Klebsiella fundet i spildevandet fra<br />
Rigshospitalet, tilløb til RL, tilløb til biologisk rensning på RL og udløb fra RL. <strong>Resistens</strong> over<br />
for ciprofloxacin, cefuroxim, gentamicin og meropenem er også vist. F betyder følsom, I<br />
betyder intermediær, og R betyder resistent.<br />
Prøvetagningssted<br />
Rigshospitalet<br />
ciprofloxacin<br />
cefuroxim<br />
15<br />
gentamicin<br />
meropenem<br />
Ribotype<br />
R R R F 876-S1<br />
I R R F 876-S1<br />
R R R F 233-S7<br />
RL tilløb R R F F 111-S6
5 KONKLUSION<br />
Hove<strong>dk</strong>onklusion af nærværende projekt er, at det ikke kan udelukkes, at de<br />
multiresistente bakterier fundet ved Renseanlæg Lynetten stammer fra Rigshospitalet.<br />
Konklusionerne kan opdeles baseret på testbakterierne E. coli, Klebsiella og<br />
enterokokker.<br />
For E. coli blev 16 stammer udvalgt til ribotypning. Samme ribotype, 129-S1, blev<br />
fundet ved alle fire prøvetagningssteder, både på Rigshospitalet og Renseanlæg<br />
Lynetten. Der er således mulighed for, at resistente bakterier af denne ribotype ved<br />
Renseanlæg Lynetten er kommet fra Rigshospitalet. Bakterierne med ribotype 129-<br />
S1 fra de fire prøvetagningssteder har dog alle forskellige resistensmønstre, hvilket<br />
vil sige, at de er resistente for forskellige antibiotika. Stammerne er således ikke<br />
ens, selvom de har samme ribotype.<br />
Forskellen i resistensmønstre kan skyldes flere ting. Det er muligt, at bakterierne<br />
har fået/tabt resistensegenskaber over for visse antibiotika via overførsel med andre<br />
bakterier i kloaksystemet. Det er også muligt, at samme ribotype er forekommet på<br />
Rigshospitalet med forskellige resistensmønstre.<br />
Der blev udvalgt 4 Klebsiella stammer til ribotypning, tre fra Rigshospitalets<br />
spildevand og én fra tilløbet til Renseanlæg Lynetten. Ribotypen fra tilløbet til RL<br />
var forskellig fra ribotyperne identificeret i Rigshospitalets spildevand.<br />
Der blev ikke fundet vancomycinresistente enterokokker.<br />
Dertil kan tilføjes, at det kun er et begrænset antal stammer, der er udvalgt til ribotypning. Det er<br />
muligt, at der har været andre ribotyper, som er forekommet ved mere end et af<br />
prøvetagningsstederne, men som bare ikke er blevet identificeret.<br />
16
6 ANBEFALINGER<br />
For at få mere viden omkring kilder til multiresistente bakterier i oplandet til<br />
Renseanlæg Lynetten kræves videre undersøgelser af spildevandet i oplandet til<br />
renseanlægget. Metoden med ribotypning af multiresistente stammer kan ikke<br />
fastlægge, hvorfra en bestemt bakterie stammer. Metoden kan derimod påvise, at en<br />
stamme fundet ved renseanlægget er den samme som en stamme identificeret ved en<br />
specifik kilde (i dette tilfælde Rigshospitalet). Resultaterne af nærværende studie har på<br />
denne måde vist, at der er en vis sandsynlighed for, at nogle af de multiresistente<br />
bakterier fundet ved Renseanlæg Lynetten stammer fra Rigshospitalet. Resultaterne kan<br />
dog ikke udelukke, at de multiresistente stammer fundet ved renseanlægget kommer fra<br />
andre kilder i oplandet, da indholdet af multiresistente bakterier og deres ribotyper ikke<br />
kendes for f.eks. husspildevand.<br />
Det videre arbejde med sporing af resistens i oplandet til Renseanlæg Lynetten<br />
anbefales at indeholde prøvetagning af spildevand flere steder i oplandet samt<br />
efterfølgende ribotypning af fundne multiresistente stammer. Prøver af spildevand taget<br />
opstrøms fra Rigshospitalet vil belyse indholdet af multiresistente bakterier og deres<br />
ribotyper i spildevand uden påvirkning af et hospital. Sammen med prøver fra<br />
Rigshospitalet vil det være muligt at lave en sammenligning, der giver et billede af, om<br />
der er visse ribotyper, der primært er hospitalsspecifikke, og om der generelt er stor<br />
forskel på indholdet af multiresistente bakterier i hospitalsspildevand og husspildevand.<br />
Flere prøver vil gøre det muligt mere nøjagtigt at bedømme, om Rigshospitalet er en<br />
betydelig kilde til multiresistente bakterier på Renseanlæg Lynetten.<br />
En fremtidig undersøgelse kunne også indeholde prøvetagning og ribotypning af<br />
multiresistente bakterier i spildevand fra andre hospitaler i oplandet for at belyse, om de<br />
ribotyper, der er kendt fra Rigshospitalet, er specifikke for Rigshospitalet, eller om de er<br />
fælles for hospitaler generelt.<br />
17
7 REFERENCER<br />
Andersen, L. P., 2012<br />
Personlig kommunikation om tidligere forekomst af ribotyper på Rigshospitalet<br />
Carman R. J., Genheimer, C. W., Rafii, F., Park, M., Hiltonsmith, M. F. & Lyerly, D.<br />
M., 2009<br />
Diversity of moxifloxacin resistance during a nosocomial outbreak of a predominantly<br />
ribotype ARU027 Clostridium difficile diarrhea<br />
Anaerobe, 15, s. 244-248<br />
Center for Disease Control, 2010<br />
Laboratory Detection of Imipenem or Meropenem Resistance in Gram-negative Organisms<br />
http://www.cdc.gov/HAI/settings/lab/lab_imipenem.html#a5<br />
Cheung, T. K. M., Wai Chu, Y., Yu Chu, M., Ha Ma, C., Hung Yung, R. W. & Man<br />
Kam, K., 2005<br />
Plasmid-mediated resistance to ciprofloxacin and cefotaxime in clinical isolates of Salmonellsa<br />
enterica serotype Enteritidis in Hong Kong<br />
Journal of Antimocrobial Chemotherapy, 56, s. 586-589<br />
Dansk Selskab for Klinisk Mikrobiologi, 2004<br />
Dansk Selskab for Klinisk Mikrobiologis referencegruppe vedrørende antibiotika<br />
resistensbestemmelse- Klaringsrapport<br />
http://www.dskm.<strong>dk</strong>/pdf/rapporter/DSKM-rapporter/klaringsrapport-RETTET.pdf<br />
DHI, 2011<br />
Pharmaceuticals Database<br />
Eniro/Krak, 2011<br />
Kort over København og Øresund<br />
http://map.krak.<strong>dk</strong>/<br />
Erichsen, A.E., Kaas, H., Dannisøe, J., Mark, O. og Jørgensen, C., 2006<br />
Etablering af badevandsprofiler og varslingssystemer i henhold til EU's nye<br />
badevandsdirektiv<br />
Miljøprojekt Nr. 1101<br />
EUCAST, 2011<br />
Data from the EUCAST MIC distribution website<br />
European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing<br />
http://eucast.org<br />
Fujisawa-Kon, N., Ike, Y., Shimizu, S. Motohashi, K., Hashimoto, H. & Mitsuhashi, S.,<br />
1981<br />
Identification of R plasmids mediating gentamicin resistance from Escherichia coli<br />
strains in Japan<br />
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 19(6), s. 1070<br />
Infektionshygiejnisk Enhed, 2007<br />
18
Årsberetning 2007<br />
http://www.rigshospitalet.<strong>dk</strong>/NR/rdonlyres/D9F7172B-190D-4DA0-81B3-<br />
E347DE24F197/0/IHE%C3%A5rsberetning2007.pdf<br />
Kaufhold, A. & Potgieter, E., 1993<br />
Chromosomally mediated high-level gentamicin resistance in Streptococcus mitis<br />
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 37(12), s. 2740-2742<br />
Lynettefællesskabet I/S, 2004<br />
Måleprogram- Antibiotikaresistens I spildevand fra et sygehus og et boligområde<br />
Samarbejdsprojekt mellem Lynettefællesskabets Miljøgruppe og Statens Serum Institut.<br />
Rapport udarbejdet af DHI.<br />
Lynettefællesskabet I/S, 2007<br />
Kortlægning og vurdering af spildevand med antibiotika og resistente bakterier fra<br />
hospitaler<br />
Rapport udarbejdet af DHI.<br />
Marcinek, H., Wirth, R., Muscholl-Silberhorn, A. & Gauer, M.,1998<br />
Enterococcus faecalis gene transfer under natural conditions in municipal sewage water<br />
treatment plants<br />
Applied Environmental Microbiology, 64(2), s. 626-632<br />
Miljøstyrelsen, 2002<br />
Occurrence and fate of antibiotic resistant bacteria in sewage<br />
Miljøprojekt Nr. 722<br />
OUH, 2009<br />
Årsrapport 2009<br />
Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Odense Universitetshospital<br />
Statens Serum Institut, 2010<br />
Fakta om antibiotikaforbrug: Antibiotikaforbrug i Danmark<br />
http://www.ssi.<strong>dk</strong>/Smitteberedskab/Om%20overvaagning/Antibiotikaforbrug/Fakta%20<br />
om%20antibiotikaforbrug.aspx<br />
Schreiber, C., 2011<br />
Einträge, Vorkommen, Verbreitung und gesundheitliche Bedeutung<br />
antibiotikaresistenter Bakterien in Abwasser und Gewässern<br />
Ph.D., Rheinischen Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn<br />
Schumacher, H., Skibsted, U., Skov, R. & Scheibel, J., 1996<br />
Cefuroxime Resistance in Escherichia coli. Resistance Mechanisms and Prevalence.<br />
APMIS- Acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica, 104, s. 531-<br />
538<br />
Suh Yah, C., 2010<br />
Plasmid-Encoded Multidrug Resistance: A case study of Salmonella and Shigella from<br />
neteric diarrhea sources among humans<br />
Biological Research, 43, s. 141-148<br />
19
21<br />
B I L A G
BILAG A<br />
Protokol for bestemmelse af resistens mod ciprofloxacin, gentamicin og cefuroxim<br />
hos Escherichia coli og coliforme<br />
Definition<br />
Suspekte E. coli defineres som violette kolonier på Oxoid Brilliance E. coli/coliform selective<br />
agar (CM1046). Coliforme defineres som lyserøde kolonioer på Oxoid Brilliance E.<br />
coli/coliform selective agar (CM1046) efter inkubation i 24 timer ved 44 °C.<br />
Prøvetagning og transport<br />
Prøverne er udtaget, og transport er arrangeret af DHI - UAI.<br />
Reagenser<br />
Trypton-saltvand:<br />
Trypton 1,0 g, natriumklorid 8,5 g<br />
Oxoid Brilliance E. coli/coliform selective agar (CM1046) (28.1 g/l) med og uden antibiotika.<br />
Natrium-cefuroxim, Sigma-Aldrich C4417-1G. Der opløses 80 mg i 10 ml MQ vand og tilsat<br />
1,00 ml/l agar.<br />
Gentamicin opløsning, Sigma-Aldrich G1397-10ML (50 mg/l). Der tilsættes 80 µl/l agar.<br />
Ciprofloxacin. Sigma-Aldrich 17850-5G-F. Der afvejes 100 mg/100 ml sterilt MQ-vand med 1<br />
ml 1M HCl og tilsættes 1 ml/l agar.<br />
Udførelse<br />
Der laves 10-fold fortyndingsrække.<br />
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i duplikat på Brilliance uden antibiotika.<br />
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i duplikat på Brilliance tilsat ciprofloxacin<br />
(1 mg/l), gentamicin (4 mg/l) eller cefuroxim (8 mg/l).<br />
Plader inkuberes ved 44 °C i 22-26 timer.<br />
Aflæsning<br />
Alle violette kolonier tælles som suspekte E. coli.<br />
Alle pink kolonier tælles som coliforme.<br />
Alle tydeligt blå eller farveløse kolonier anses for at være andre end E. coli eller coliforme.<br />
Kolonier, der er pink, men med svag blå nuance, tælles som coliforme.<br />
Det ene sæt plader sendes til IHE efter tælling.<br />
Kontroller<br />
E. coli ATCC 25922 er følsom over for ciprofloxacin (MIC < 0,015 mg/l), gentamicin (MIC =<br />
0,1 – 1 µg/ml) og cefuroxim (MIC = 2 – 8 µg/ml) og anvendes som positiv kontrol. Spredes også<br />
på agar uden antibiotika for substratkontrol.<br />
23
BILAG B<br />
Protokol for bestemmelse af resistens mod vancomycin hos suspekte<br />
enterokokker<br />
Definition<br />
Suspekte enterokokker defineres som bakterier der ved 44 °C ± 0,5 °C kan vokse på Slanetz &<br />
Bartley Agar (Oxoid) under reduktion af TTC.<br />
Prøvetagning og transport<br />
Prøverne er udtaget, og transport er arrangeret af DHI - UAI.<br />
Reagenser<br />
Pepton-saltvand (ISO8199:1988)<br />
Pepton 1,0 g, natriumklorid 8,5 g<br />
Vancomycin, Sigma-Aldrich 861987-250mg. Der er opløst 40 mg/10 ml MQ-vand og tilsat 1<br />
ml/l agar.<br />
Slanetz & Bartley (Oxoid) agar.<br />
Udførelse<br />
Der laves 10-fold fortyndingsrække.<br />
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i duplikat på Slanezt agar uden antibiotika.<br />
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i duplikat på Slanezt agar med vancomycin<br />
(4 µg/ml).<br />
Plader inkuberes ved 44°C ± 0,5°C i 44 ± 4 timer.<br />
Alle kolonier, der vokser frem som røde kolonier, tælles. Der laves ikke verifikation.<br />
Andelen af suspekte enterokokker, der vokser på agar med antibiotika, beregnes.<br />
Kontroller<br />
Enterococcus faecalis ATCC 29212 anvendes som positiv kontrol (MIC 2 – 6 mg/l). Spredes<br />
også på agar uden antibiotika for substratkontrol.<br />
25
BILAG C<br />
Protokol for bestemmelse af resistens mod ciprofloxacin, gentamicin og<br />
cefuroxim hos suspekte Klebsiella<br />
Definition<br />
Suspekte Klebsiella sp. defineres her som kolonier, der giver ”purple-magenta” farvede kolonier<br />
på HiCrome Klebsiella Selective Agar efter inkubation i 24 timer ved 37 °C.<br />
Prøvetagning og transport<br />
Prøverudtagning og transport arrangeres af DHI - UAI.<br />
Reagenser:<br />
Pepton-saltvand (ISO8199:1988)<br />
Pepton 1,0 g, natriumklorid 8,5 g<br />
Natrium-cefuroxim, Sigma-Aldrich C4417-1G. Der er opløst 80 mg i 10 ml MQ vand og tilsat<br />
1,00 ml/l agar.<br />
Gentamicin opløsning, Sigma-Aldrich G1397-10ML (50 mg/l). Der tilsættes 80 µl/l agar.<br />
Ciprofloxacin. Sigma-Aldrich 17850-5G-F. Der afvejes 100 mg/100 ml sterilt MQ-vand med 1<br />
ml 1M HCl og tilsættes 1 ml/l agar.<br />
Udførelse<br />
Der lave 10-fold fortyndingsrække.<br />
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i dublikat på HiCrome Klebsiella<br />
Selective Agar uden antibiotika.<br />
Der spredes 0,1 ml af prøve og fortyndinger af prøve i dublikat på HiCrome Klebsiella<br />
Selective Agar tilsat ciprofloxacin (1 mg/l), gentamicin (4 mg/l) eller cefuroxim (8 mg/l).<br />
Plader inkuberes ved 37 °C i 22-26 timer.<br />
Alle ”purple-magneta” kolonier tælles som suspekte Klebsiella sp.<br />
Hvis der er stor usikkerhed om vurdering af positive kolonier, føres et passende udvalg (cirka 5<br />
fra hver prøve uden antibiotikum og 5 fra hver prøve med gentamicin) videre på HiCrome<br />
Klebsiella Selective Agar for yderligere verifikation. Klebsiella sp er store fede kolonier.<br />
Kontroller<br />
Der anvendes ikke kontroller, idet det antages, at antibiotika aktiviteten kontrolleres i forbindelse<br />
med undersøgelse af E. coli. Årsagen er, at vi ikke har en kontrolstamme med kendt følsomhed.<br />
27
Analyser, muslingeprøver<br />
DHI: Muslingekød blendes 10 % (gwt/vol) og spredes som angivet for spildevandsprøver.<br />
Desuden dyrkes op i MacConkey bouillon med og uden antibiotika (ciprofloxacin 1 mg/l,<br />
gentamicin 4 mg/l, eller cefuroxim 8 mg/l). Rør sendes til IHE.<br />
28
BILAG D<br />
IHEs resultater for enterokokker dyrket på Slanetz agar.<br />
29
BILAG E<br />
31
BILAG F<br />
IHEs resultater for E.coli, Klebsiella og enterokokker i sedimentprøverne fra Kongedybet.<br />
33