Spinozerebelläre Ataxie Typ 17: Suche nach modifizierenden ...

Ergebnisse
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Anschließend wurden die DNA-Proben sequenziert, die Daten mit dem Programm
SeqScape v2.5 ausgewertet und die ermittelte Nukleotidsequenz mit der Referenzsequenz
aus der NCBI-Datenbank (GenBank reference sequence NM_199047.2) verglichen. Um
eine möglichst genaue und sichere Auswertung zu ermöglichen, wurde doppelsträngig
sequenziert. Außerdem wurde Exon 1 des TBPL2-Gens wegen seiner Länge in 2
Abschnitte aufgeteilt, die getrennt voneinander sequenziert wurden.
Auswertung Familie A
Im Exon 1 konnte ein Basenaustausch von Guanin zu Cytosin nachgewiesen werden
(c.92GC). Dieser Austausch an Nukleotid-Position 92 des TBPL2-Gens führt zu einem
Austausch von Arginin zu Prolin in der Aminosäure-Sequenz des TATA- Bindeprotein
like 2 (p.R31P) und wurde bereits als Polymorphismus publiziert (refSNP ID: rs8019270
in der NCBI-Datenbank). Alle acht DNA-Proben aus Familie A wiesen an dieser Position
eine Sequenzvariation auf, wobei sowohl die homozygote (I 1 und II 2 ) als auch die
heterozygote Form (I 2 , II 1 , II 3 , II 4 , II 5 und II 6 ) zu beobachten war. In Abbildung 3.3.2 ist
dieser SequenzAusschnitt beispielhaft dargestellt.
A T T A C G G T C C A
A T T A C G G T C C A
87 92 97 87 92 97
Abb. 3.3.2
Ausschnitt aus der Sequenzierung des Exon 1 des TBPL2-Gens mit dem Austausch
c.92GC. Links ist die Sequenz einer Probe gezeigt, die heterozygot für die Basen Guanin
und Cytosin ist. Rechts ist eine Probe dargestellt, die einen homozygoten Basenaustausch
aufweist. Die Zahlen geben die Nukleotidposition an (Nukleotid +1 ist
die Base des ATG-Startcodon).