Ersti-Broschüre 2011/12 - Fachbereich Mathematik und Informatik

ekt in eine Datenbank füttern kann, wird mittels computergestützter
Mathematik nochmal getestet, ob es tatsächlich
eine Relation zwischen Medikament und Zielprotein gibt.
Das ist sehr arbeitsintensiv. Lässt sich das Ergebnis bestätigen,
wird es in einer Datenbank abgelegt, mit deren Hilfe
sich später komplexe Netzwerke aufbauen lassen. Nun kann
man mit bereits existierenden Programmen, bis zu 10.000
Substanzen an zum Beispiel Tumorzellinien testen und
schauen, wie diese das Zellwachstum beeinflussen.
Herr Preissner, womit beschäftigt sich Ihre Arbeitsgruppe?
Unser Forschungsinteresse gilt der Protein-Protein Interaktion
und der Proteinstruktur-Theorie, also der Frage: Warum
faltet sich eine bestimmte Sequenz in eine bestimmte
Struktur?
Im Gegensatz zur Arbeitsgruppe von Professor Pries,
in der das Verständnis komplexer Zusammenhänge im
Vordergrund steht, herrscht bei Ihnen eine gewisse
Sammelleidenschaft.
Ja. Wir sammeln alle möglichen Biomoleküle aus Zellen und
Organismen, sogenannte Targets, und schauen uns z. B.
an, welche Medikamente auf diese wirken. Mittels des automatischen
Text-Mining werden dann schriftliche Arbeiten
nach Informationen durchsucht. Da das Verfahren noch
nicht so sicher ist, dass man die gewonnenen Ergebnisse di-
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Was ist das Ziel Ihrer Arbeit?
Ziel unserer Arbeit ist es, dass die gesammelten Daten und
die daraus gewonnen Erkenntnisse den Patienten zugute
kommen, etwa in der Krebstherapie. Wir möchten verhindern,
dass Patienten Therapien bekommen, die gar nicht
anschlagen, weil das Target auf das das Medikament wirken
soll überhaupt nicht mehr vorhanden oder durch starke Mutationen
der Tumorzellen bereits zerstört worden ist. Das
große Ziel ist es also, eine Brücke von den erstellten Netzwerken
bis hin zur therapeutischen Empfehlung für den Patienten
zu schlagen.
Wie setzt sich die Arbeitsgruppe zusammen?
Die Arbeitsgruppe besteht zurzeit zu einem Drittel aus Bioinformatikern.
Der Rest sind Physiker, Mathematiker und
manchmal auch Chemiker, halt bunt gemischt.
Bieten Sie auch Praktika an?
Für Praktika bietet sich unsere Arbeitsgruppe nicht so an.
Bei uns geht es ja nicht nur um Moleküle, sondern auch um
Proteine, Signalkaskaden und die Frage, wie man das dann
zu den Tierexperimenten und Patienten bringt. Das ist ein
weites Feld. Mit kleinen Molekülen kommen die meisten sofort
klar, aber in dem Augenblick, wo es um Proteine geht,
braucht es eine Weile, ehe man die Sekundärstruktur und
die Dynamik, die dahinter steckt begreift. Daher haben wir
ein Interesse daran, Studenten nicht nur für einige Wochen,
als Praktikanten, sondern längerfristig als studentische
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