甘蓝cer1同源基因预测及分析 - abc
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甘 蓝 基 因 组 中 cer1 同 源 序 列 获 得<br />
• 利 用 拟 南 芥 cer1cDNA 序 列 对 甘 蓝 基 因 组 序<br />
列 进 行 Blastn, 分 别 在 第 8 号 染 色 体 , 第 3 号 染<br />
色 体 和 第 4 号 染 色 体 上 找 到 同 源 序 列 , 利 用<br />
Cutseq 脚 本 分 别 截 取 同 源 序 列 附 近 NDA 序 列 。<br />
• 利 用 Weblab 工 具 augustus(v2.1) 进 行 序 列<br />
分 析 , 并 将 候 选 基 因 预 测 的 蛋 白 进 行 在<br />
NCBI 上 进 行 blast, 获 得 候 选 3 个 候 选 基 因 ,<br />
分 别 位 于 8 号 ,3 号 ,4 号 染 色 体 上 。
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