Projet de l'UMR EPOC - Environnements et paléoenvironnements ...

Septembre 2009
Projet
Rapport 3.4
UMR 5805 EPOC
Environnements et Paléoenvironnements
Océaniques et Continentaux
Etablissements principaux :
Responsable :
Université Bordeaux 1 – CNRS
Antoine GREMARE
1

TABLE DES MATIERES
Préambule................................................................................................................................................1
Projets scientifiques des équipes ...........................................................................................................25
Transferts Géochimiques des Métaux à l’interface continent océan : TGM ..................................27
Physico- et Toxico-Chimie de l’Environnement : LPTC................................................................31
Ecotoxicologie Aquatique : EA ......................................................................................................39
ECOlogie et BIOgéochimie des écosystèmes Côtiers : ECOBIOC................................................47
Modélisation Expérimentale et Télédétection en HYdrodynamique Sédimentaire : METHYS ....57
Paléoclimats : PALEO....................................................................................................................65
Sédimentologie : SEDIMENTO .....................................................................................................73
Groupes de travail .................................................................................................................................79
Annexe 1 ...............................................................................................................................................83
Bilan scientifique du LPTC ............................................................................................................85
Production scientifique du LPTC durant le précédent quadriennal ................................................95
Annexe 2 .............................................................................................................................................153
Plan de formation 2011-2014 .......................................................................................................155
3

PREAMBULE
5

I. AUTOANALYSE
Le cœur de notre projet est constitué par la
fusion de l’UMR 5805 Environnements et
Paléoenvironnements Océaniques (EPOc) et de
l’équipe Laboratoire de Physico-Toxico
Chimie (LPTC) de l’UMR 5255 Institut des
Sciences Moléculaires (le bilan du LPTC pour
le quadriennal 2007-2010 ainsi que sa
production scientifique sont fournis en Annexe
I). Ces entités sont de tailles très différentes.
Afin de rendre compte au mieux des
motivations nous conduisant à proposer cette
fusion, nous avons néanmoins choisi d’exposer
successivement et quasi symétriquement :
1. les points forts et les points faibles de ces
deux structures, puis
2. les opportunités et menaces affectant la
nouvelle UMR résultant de leur
regroupement.
Afin de clarifier la lecture des paragraphes
concernant les points forts et faibles, les
passages concernant plus spécifiquement le
LPTC figurent en italiques. La fusion proposée
conduit à la création d’une nouvelle UMR :
Environnements et Paléoenvironnements
Océaniques et Continentaux (EPOC). Le
lecteur devra donc prêter une attention
particulière à l’utilisation des sigles EPOc
(ancienne UMR) et EPOC (nouvelle UMR).
I.1. POINTS FORTS
I.1.1. Des structures pluridisciplinaires et
dynamiques
Si les sciences de l’environnement sont par
essence pluridisciplinaire, il n’en demeure pas
moins que, pour être réellement efficace, la
pluridisciplinarité se doit de reposer sur des
socles disciplinaires forts. Or, les recherches
dans ce domaine se sont historiquement
développées « disciplinairement » et leur
organisation actuelle traduit encore très
largement cet état de fait. Les actions conduites
par l’INSU et l’InEE ont néanmoins fait
évoluer les choses sur ce dernier point et la
tendance actuelle consiste clairement à
favoriser une approche intégrée des études
environnementales au sein de structures
incluant un large spectre de sciences « dures »
et parfois même des composantes relevant des
SHS.
EPOc a devancé cette tendance en s’inscrivant
volontairement depuis 15 ans (date de fusion
du DGO, du LOB et du LEESA 1 ) dans une
démarche pluridisciplinaire au service des
sciences de l’environnement marin, et ce
depuis l’échelle locale (écosystèmes littoraux
et zones associées) jusqu’à l’échelle globale
(marges océaniques, océan profond, systèmes
climatiques). A son niveau, celui de la chimie
de l’environnement, le LPTC s’inscrit
résolument dans cette même démarche
pluridisciplinaire qu’il applique à la
compréhension des mécanismes conditionnant
la contamination des écosystèmes par des
composés organiques et l’impact écotoxicologique
associé.
EPOc
Les compétences d’EPOc concernant les
écosystèmes et géosystèmes côtiers et littoraux
recouvrent des domaines allant de
l'hydrosédimentologie côtière à l'écotoxicologie,
en passant par l'écologie,
l’écophysiologie, la géochimie, et la
biogéochimie. L'ensemble est soutenu par
plusieurs programmes nationaux (e.g., ANR,
LEFE, LITEAU et EC2CO) et régionaux (e.g.,
Diagnostic de la qualité des milieux littoraux et
Réponses scientifiques face à la problématique
ostréicole). Des personnels d’EPOc
s'investissent fortement dans la coordination
d'actions ou de réseaux nationaux concernant
les écosystèmes littoraux (présidence du
RNSM, coordination du SOMLIT). Au niveau
régional, ce sont des scientifiques d'EPOc qui
coordonnent :
1. la mise en place de deux nouveaux projets
consacrés respectivement à l'estuaire de la
Gironde et au Bassin d'Arcachon dont l'un
des enjeux est la mise en place
d'interactions entre sciences « dures » et
SHS,
2. le RRLA.
Le domaine des marges continentales et de
l’océan profond rassemble au sein d’EPOc
deux communautés relevant des divisions ST
et OA de l’INSU : sédimentologues et
géophysiciens de surface, et paléocéano-
1 Un glossaire est fourni en partie VI
1

graphes. La présence de ces deux ensembles
conséquents au sein d’un même laboratoire
permet, chance unique dans le paysage
français, l’étude intégrée des archives
sédimentaires depuis la caractérisation des
dépôts et leurs mécanismes de mise en place,
jusqu’à la reconstitution des caractéristiques
physiques, chimiques et biologiques de
l’environnement marin dans son passé récent.
Le rôle de l’océan en tant qu’acteur primordial
de la variabilité climatique est également un
sujet important traité par les
paléocéanographes d’EPOc. Ces recherches
sont essentiellement soutenues par les
programmes et les actions des divisions ST
(e.g., Action MARGES) et OA (e.g., LEFE-
EVE) de l’INSU. EPOc est également un
partenaire privilégié des divisions géosciences
marines et sédimentologie de l’IFREMER et
du SHOM, ainsi que de l’IFP, de la DGA et de
grands groupes industriels (TOTAL, GDF…).
Ses scientifiques jouent un rôle majeur dans la
stratégie d’implémentation (e.g., présidence de
la CNFE-Evaluation et du CIRMAT,
participations à la CNFE-Programmation et au
CSTF, participations au panel IODP et au
consortium IMAGES), de coordination (e.g.,
mission polaire CADO, missions IMAGES) et
de valorisation des campagnes
océanographiques nationales et internationales.
Au-delà de ces engagements, le dynamisme
d’EPOc transparait de l’analyse de l’évolution
de sa production scientifique. La moyenne de
publications (de type ACL) par équivalent
chercheur et par an est voisine de 2,3 et en
progression significative par rapport au
précédent quadriennal (i.e., 2,0). Cette
production témoigne de l’ouverture
internationale d’EPOc puisque 35% des
publications de type ACL sont co-signées par
des scientifiques étrangers. Un effort
significatif a été accompli pour l’encadrement
des doctorants avec le passage de 11 HDR
depuis 2005 (plus 4 qui le seront d’ici à la fin
de l’année) ce qui porte la proportion à 60%
pour l’ensemble des C et EC de l’UMR. La
capacité des EC d’EPOc à concilier
enseignement de qualité, encadrement
d’étudiants et production scientifique se trouve
par ailleurs attestée par la forte proportion
(53%) des EC de l’UMR titulaires de la PEDR.
LPTC
Les scientifiques du LPTC s’attachent à
comprendre la dynamique et le devenir des
composés (micropolluants) organiques.
Quelles sont leur biodisponibilité et leur
mobilité ? Comment se dégradent-ils et quels
sont les produits de cette dégradation ? Quels
sont les bons outils pour détecter et quantifier
les contaminants organiques dans
l'environnement ? En parallèle, ils cherchent
à :
1. élucider les interactions entre les
substances chimiques et les structures
biologiques susceptibles d'être perturbées,
2. mettre au point des méthodes fiables
d’évaluation de la toxicité et de
caractérisation des réponses
toxicologiques ou adaptatives des
organismes aquatiques exposés.
Pour ce faire, le LPTC met en œuvre une
approche pluridisciplinaire associant chimie et
biologie.
Le LPTC inscrit ses recherches dans une
logique interdisciplinaire liant présence et
effet des contaminants chimiques organiques
pour mieux appréhender la notion de qualité
de l’environnement et celle de risque chimique.
Il s’attache à aborder les problématiques
environnementales de façon intégrée et à
développer des concepts méthodologiques et
scientifiques susceptibles d’être généralisés.
Le LPTC ne décline par conséquent pas ses
actions dans les seuls écosystèmes littoraux et
côtiers, mais également dans les écosysystèmes
continentaux et même dans l’atmosphère dont
le rôle de source et de réacteur est essentiel à
la compréhension globale des cycles des
contaminants en milieu aquatique. Ses
recherches sont soutenues par des
programmes conduits au niveau :
1. régional (e.g., Réponses scientifiques face
à la problématique ostréicole, projet
OSCAR, projet AQUITOX),
2. national (e.g., programmes PNETOX,
PRIMEQUAL, ANR, LEFE-CHAT,
LITEAU, EC2CO ; GDR IMOPHYS,
MONALISA et EXECO),
3. international (e.g., programmes SWIFT-
WFD, Feeding Fats Safety, ERANET-
AMPERA ; réseaux d’excellence ACCENT,
INTROP et REMER).
2

Le LPTC a également développé de
nombreuses collaborations institutionnelles
(e.g., CEMAGREF, IFREMER, INERIS, INRA,
IFP) et industrielles (e.g., Danone, Smurfit,
Petrobras, Suez, Veolia, Total).
A l'échelon régional, les scientifiques du LPTC
sont des acteurs majeurs de plusieurs
opérations ayant trait à la recherche
environnementale (e.g., GIS-Matériaux pour
l’Environnement, AIRAQ, mise en place et
coordination d’un réseau ECOTOX, projet
GAGILAU). Parallèlement à ces actions
purement scientifiques, des personnels du
LPTC s'investissent également dans
l’accompagnement de la recherche dans le
domaine de l’Environnement via leur
participation à :
1. des conseils scientifiques d’organismes de
recherche et/ou d’expertise (e.g., INSU,
IRD, ONEMA et INERIS),
2. des programmes (e.g., Seine-aval, ANR
CP2D, PNCA, LEFE-CHAT, UVED),
3. des comités d’experts de plusieurs agences
(e.g., AFSSA, AFSSET).
Le niveau de production scientifique
(3,8 publications de type ACL par équivalent
chercheur et par an dont 39 % co-signées par
des scientifiques étrangers) témoigne du fort
dynamisme scientifique d’un laboratoire dont
les personnels sont dans leur majorité
trentenaires et quadragénaires. Ce même
dynamisme transparait de la politique
volontariste de mise en place d’une démarche
Qualité soutenue par le CNRS.
A une époque où la recherche scientifique
souffre d’un déficit d’image et où elle apparaît
parfois coupée de la société civile, les
personnels d’EPOc et du LPTC sont enfin
pleinement impliqués dans les activités de
communication, notamment par la rédaction
d’articles de vulgarisation, la tenue de
conférences grand public et des interventions
dans les médias.
I.1.2. Des structures localisées en Aquitaine
La Région Aquitaine possède une large variété
d’écosystèmes présentant des caractéristiques
physiographiques particulières ainsi que des
valeurs sociétales et patrimoniales importantes.
Il s’agit de :
1. l’Estuaire de la Gironde (le plus vaste
estuaire naturel européen) et de ses
afférents,
2. du Bassin d’Arcachon qui abrite le plus
vaste herbier intertidal de phanérogames
marines européen et est le siège d’intenses
activités touristique et conchylicole,
3. de la côte aquitaine qui héberge elle aussi
une forte activité touristique et est sujette à
des modifications morphologiques importantes,
4. de la marge aquitaine qui présente des
caractéristiques géologiques uniques du
point de vue de la diversité des processus
de construction des corps sédimentaires
(vallées incisées au nord, canyon de
Capbreton au Sud, un des plus profonds du
monde) et de la qualité stratigraphique des
archives paléoenvironnementales.
Ces systèmes constituent autant de zones
ateliers privilégiées pour mettre en œuvre des
thématiques scientifiques générales dans les
domaines de l’écotoxicologie, de l’océanographie
côtière et des géosciences marines.
Leur existence est une des raisons qui motivent
le fort soutien des collectivités locales, et en
tout premier lieu de la Région Aquitaine
(Première région de France en termes de
soutien financier à la Recherche), aux
recherches conduites par EPOc et le LPTC. Ce
soutien entre dans le cadre d’une politique
pensée sur le long terme. Il est essentiel pour :
1. l’opération immobilière projetée sur le site
d’Arcachon,
2. l’élaboration de programmes fédérateurs
permettant une mise en œuvre de
l’interdisciplinarité en relation avec la
demande sociétale,
3. la conduite d’une politique dynamique en
termes de renouvellement et de
modernisation de nos parcs d’équipements.
1.1.3. Des structures ouvertes sur le terrain et
avec de fortes capacités analytiques
Du fait de leur complexité et notamment de
leur fort degré de variabilité spatio-temporelle,
3

les stratégies d’étude des environnements
aquatiques reposent largement sur :
1. un accès fréquent au milieu,
2. le couplage entre observation et
expérimentation.
Ces contraintes impliquent de disposer d’une
bonne accessibilité au milieu et d’une
excellente continuité « terrain-laboratoire ».
Pour ce qui concerne EPOc et le LPTC, ces
deux impératifs se trouvent encore renforcés
par la diversité des écosystèmes ateliers (cf.
I.1.2.).
Dans ce contexte, la complémentarité des sites
de Talence (accès à l’estuaire de la Gironde et
à son bassin versant ainsi qu’à l’océan ouvert)
et d’Arcachon (accès au Bassin d’Arcachon et
à la côte aquitaine, expérimentation) constitue
sans nul doute un atout. Le rattachement
d’EPOc à l’OASU lui permet par ailleurs de
disposer d’un navire de station, vecteur
essentiel d’accès au milieu marin, dont la
gestion est assurée par l’INSU. Ces facilités
d’accès au terrain sont complétées par des
capacités analytiques du meilleur niveau pour
ce qui concerne par exemple les carottes
sédimentaires (systèmes SCOPIX-XRF), les
métaux (ICPMS) et les images (télédétection et
actographie). La plate-forme analytique du
LPTC constitue elle aussi un ensemble
extrêmement performant qui a été encore
renforcé par l’acquisition récente de nouveaux
équipements (e.g., GC/MS/MS, GC/TOF,
GC/IRMS et LC/MS/MS). Cette plate-forme se
situe notamment au meilleur niveau
international pour l’analyse des composés
organiques par spectrométrie de masse. Elle
est opérée par des personnels possédant un
très haut niveau de technicité.
I.2. POINTS FAIBLES
1.2.1. Des spectres disciplinaires larges et des
groupes fonctionnels de taille souvent limitée
Dans une UMR au spectre aussi large que celui
d’EPOc, chacune des composantes
disciplinaires aspire à conserver une bonne
lisibilité dans son domaine propre. Cette
revendication est souvent d’autant plus
marquée que la composante en question est
dynamique et que sa thématique se situe à
l’une des extrémités du spectre disciplinaire de
l’unité. Dans ce contexte, le maintien de la
cohésion du laboratoire et de la coordination
de sa dynamique scientifique nécessite une
attention et un travail continu. Ce point est
capital. Il explique notamment la démarche
participative qui a été adoptée pour
l’élaboration de notre projet, ainsi que certains
de nos choix en termes de structuration (e.g., le
concept de thématique, cf. II.1. et II.3) et de
gouvernance (e.g., la meilleure association des
responsables d’équipe à la structure de
direction par l’intermédiaire de leur
participation au Conseil de Direction Elargi, cf.
II.6.).
Le passage d’un contexte de pluridisciplinarité
à une interdisciplinarité effective est loin d’être
trivial. Pour ce qui concerne EPOc, cette
difficulté transparait même au sein des équipes
dont certaines présentent un éventail
thématique large qui induit la formation de
groupes fonctionnels de petite taille
relativement indépendants et pas toujours
lisibles vis à vis de l’extérieur. Cet état de fait
est probablement en partie responsable d’un
manque de leadership dans des programmes
internationaux ; situation d’autant plus
paradoxale que :
1. l’analyse de la production de l’UMR fait
clairement apparaître une forte composante
internationale (cf. I.1.1.), et
2. quand EPOc se trouve en position de
coordonner des actions internationales
d’envergure (e.g., ECORS), cela ne se
traduit pas nécessairement par le montage
d’un programme international du fait d’un
bon ancrage régional et/ou de
financements nationaux suffisants.
Une tendance similaire est également tangible
au sein du LPTC qui, du fait de l’ampleur des
thématiques qu’il aborde est parfois confronté
à une dispersion/dilution de son potentiel en
matière de recherche. Un seul individu se
trouve alors être le point clé d’une compétence
ce qui ne permet pas d’avoir un relai ou un
soutien efficace. Cet état de fait se trouve
accentué du fait de la structure d’âge des
personnels du laboratoire (cf. I.1.1.) qui
impose à un petit nombre de scientifiques
confirmés une très/trop forte implication dans
les domaines du pilotage de la recherche, de
l’enseignement et de la communication.
4

1.2.2. Des laboratoires multi-sites dont
certains locaux sont peu adaptés
Les personnels d’EPOc se répartissent entre les
sites de Talence et d’Arcachon qui sont séparés
d’une soixantaine de kilomètres soit une
distance très inférieure à celle séparant d’autres
stations marines françaises de leur campus
principal. La géographie le rendant possible, il
nous semble essentiel qu’un lien fort soit
maintenu entre le site d’Arcachon et le campus
de Talence. Un tel lien constitue en effet une
garantie de pouvoir :
1. accéder à une grande diversité
d’écosystèmes ateliers (cf. I.1.2.),
2. évoluer dans des environnements
intellectuels et technologiques stimulants.
Cette volonté réaffirmée, il convient de ne
pas occulter les problèmes posés par la bilocalisation
tant en termes de recherche
que d’enseignement.
Le degré de fonctionnalité des locaux diffère
grandement entre les deux sites. La vétusté des
installations de la station marine d’Arcachon
est patente. Le positionnement actuel des
personnels sur chacun des sites résulte
largement de l’histoire et de l’impossibilité à
effectuer des remaniements significatifs du fait
de l’exiguïté du site arcachonnais Cette
répartition ne prend par conséquent pas en
compte les évolutions intervenues dans la
structuration d’EPOc. La logique de création
de l’équipe ECOBIOC a par exemple consisté
à rassembler les communautés de biologistes et
de biogéochimistes marins d’EPOc.
Historiquement ces deux communautés sont
réparties sur les sites arcachonnais (pour les
biologistes) et talençais (pour les
biogéochimistes) ce qui complique les
interactions entre ces deux groupes. Une autre
difficulté importante réside dans le fait que la
quasi-totalité des enseignements dispensés par
les personnels EC localisés à Arcachon a lieu
sur le campus de Talence. Ceci engendre des
navettes incessantes entre les deux sites ainsi
que les pertes de temps et d’énergie qui en
découlent.
Les personnels du LPTC sont actuellement
localisés sur 3 sites :
1. le bâtiment A12 du Campus de Talence qui
abrite une grande partie des activités en
Physico-Chimie de l’Environnement ;
2. le bâtiment B2 de ce même campus qui
abrite les activités de Toxicologie de
l’Environnement ; et enfin
3. l’IUT de Périgueux où sont localisés 4 EC
rattachés à UB4.
Une demande forte a été formulée depuis
plusieurs années pour que les deux
composantes talençaises soient regroupées
afin de renforcer la cohésion des activités de
recherche et leur pérennisation. Comme
EPOc, le LPTC souffre également du caractère
peu ou pas adapté de ses locaux à certaines
activités (e.g., culture cellulaire et biologie
moléculaire).
I.2.3. Une articulation entre activités de
recherche et d’enseignement à reconsidérer
L’offre d’enseignement associée aux contours
scientifiques actuels d’EPOc apparaît peu
satisfaisante. Les intitulés des spécialités
(ENVOLH) ou des parcours (FDEA) du
Master STEE sont trop compliqués et ne font
pas référence à des mots clefs bien identifiés.
Ils sont par conséquent peu lisibles et pas assez
attractifs pour les étudiants. La situation
actuelle n’est pas non plus optimale du point
de vue de la mise en œuvre de
l’interdisciplinarité :
1. au niveau Master, l’océanographie
biologique est enseignée dans le parcours
FDEA au contraire des autres composantes
de l’océanographie qui le sont au sein de la
spécialité ENVOLH ;
2. les enseignements des composantes
chimiques et biologiques de
l’écotoxicologie sont dispensés de manière
indépendante au sein de deux filières
(QUALENC et FDEA) respectivement
portées par les UFR de Chimie et de
Biologie.
I.2.4. La mauvaise intégration du LPTC à
l’ISM
Enfin un dernier point faible, spécifique au
LPTC est sa mauvaise intégration à son UMR
actuelle de rattachement : l’ISM. Après
quelques tentatives de projets montés en
commun avec d’autres groupes, l’impossibilité
à concrétiser des rapprochements par des
actions communes est en effet assez
rapidement apparue si bien que le LPTC se
5

trouve aujourd’hui largement isolé à
l’intérieur de l’ISM.
I.3. LES OPPORTUNITES
I.3.1. La fusion EPOc-LPTC
L’exercice d’autoanalyse montre qu’EPOc et
le LPTC partagent un même dynamisme et le
même intérêt pour les sciences de
l’environnement. Ces points communs les ont
tous les deux, à des niveaux différents,
conduits à mener des politiques scientifiques
fondées sur la pluridisciplinarité, avec comme
objectif la mise en œuvre d’une
interdisciplinarité effective. Le seul point de
recouvrement significatif des spectres
disciplinaires de ces deux entités concerne
l’écotoxicologie. Et encore devrait-on plutôt ici
parler de complémentarité puisque EPOc est
plus spécialisé dans l’étude des contaminants
métalliques et le LPTC dans celle des
contaminants organiques. Complémentarité
disciplinaire, intérêts scientifiques communs et
approches stratégiques partagées font que les
scientifiques d’EPOc et du LPTC collaborent
de longue date dans de nombreux programmes
régionaux et nationaux ce qui leur a permis de
mieux se connaître et de s’apprécier.
Dans ce contexte, la fusion EPOc-LPTC
apparaît des plus naturelles. Elle n’en constitue
pas moins une formidable opportunité qui
permettra de mettre en œuvre une approche
plus intégrée de l’étude des écosystèmes
aquatiques. Les avantages d’une telle
démarche sont multiples et l’on se limitera
simplement à mentionner ici l’intérêt :
1. pour les chimistes de l’environnement et
les écotoxicologistes d’intégrer leurs
mesures dans un ensemble d’observations
plus vaste ce qui leur permettra de mieux
interpréter les variations spatio-temporelles
des concentrations de contaminants et de
leurs effets toxiques,
2. pour les chimistes de l’environnement de
bénéficier de connaissances approfondies
sur l’écologie et l’écophysiologie de leurs
organismes modèles là encore dans le
souci d’une meilleure interprétation des
résultats obtenus,
3. pour les écologistes et les biogéochimistes
d’initier ou de réorienter l’étude de certains
processus dans une optique de transfert de
contaminants,
4. de croiser des estimations de la qualité des
écosystèmes obtenues par des approches
différentes, et enfin
5. d’une collaboration entre paléocéanographes
et chimistes pour la mise en
œuvre de nouveaux marqueurs
moléculaires.
La fusion EPOc-LPTC se traduira par la
création d’une nouvelle UMR
(Environnements et Paléoenvironnements
Océaniques et Continentaux, EPOC)
regroupant environ 125 personnels permanents
(74 C/EC et 51 ITARF) plus un ensemble
d’environ 70-80 doctorants, post-doctorants,
personnels contractuels et moniteurs. Intégré à
l’OASU, consacrant la quasi-totalité de son
potentiel à l’étude des environnements et
paléoenvironnements aquatiques et s’appuyant
sur des infrastructures performantes, un tel
ensemble deviendra encore plus visible au plan
national et international.
I.3.2. Opérations immobilières sur les sites de
Talence et d’Arcachon
L’un des points faibles communs à EPOc et au
LPTC réside dans la dispersion des personnels
et des moyens entre plusieurs sites. Si
l’exercice d’autoanalyse a établi qu’il était
souhaitable de conserver la dualité des sites de
Talence et d’Arcachon, il a également
démontré qu’il était indispensable d’établir une
logique de répartition des moyens et des
activités entre ces sites de manière à tirer au
mieux parti de leur complémentarité. Dans ce
contexte, notre projet s’appuie sur deux
opérations immobilières :
1. la réfection des locaux de Talence et le
transfert de l’OASU et du LAB sur le
campus de Talence,
2. la création du POA sur le site d’Arcachon.
La première de ces deux opérations s’appuie
largement sur le Plan Campus PPP qui va
permettre de rénover les locaux de Talence et
de déménager l‘OASU et le LAB depuis leur
site actuel de Floirac vers Talence. Cette
dernière opération est présentée en détail dans
le document de Prospectives de l’OASU. Elle
est prévue à proximité immédiate du bâtiment
6

B18 (soit le site actuel d’EPOc-Talence) et
propose notamment, dans son hypothèse la
plus ambitieuse, la création d’une carothèque
et de locaux d’accueil pour de nouvelles
équipes. Ce projet de carothèque est déjà
ancien et a une portée internationale de part la
valeur scientifique des carottes à conserver. Sa
réalisation est maintenant devenue essentielle à
la bonne conservation des carottes utilisées par
les équipes SEDIMENTO et PALEO, dont les
capacités de stockage sont largement
dépassées. La rénovation des locaux de
Talence va également permettre d’optimiser
les espaces laboratoires dans l’optique du
déménagement des équipes METHYS et
ECOBIOC (partie talençaise) vers Arcachon.
La création du POA permettra quant à elle de
rassembler sur un même site les compétences
d’EPOC relatives à l’étude des environnements
actuels. Cette opération concerne quatre
équipes :
- Les océanographes physiciens (Equipe
METHYS) dont les intérêts majeurs
concernent l’hydrodynamique, le transport
sédimentaire et l’évolution
morphodynamique des environnements
littoraux.
- Les écologues et biogéochimistes (Equipe
ECOBIOC) qui étudient la biodiversité, les
réseaux trophiques et plus largement le
fonctionnement des écosystèmes côtiers
ainsi que leurs interactions avec le
changement global,
- Les chimistes de l’environnement et les
écotoxicologistes spécialisés dans l’étude
des contaminants organiques (Equipe
LPTC) qui étudient les cycles
biogéochimiques des contaminants
organiques et leur impact toxique.
- Les écotoxicologistes spécialisés dans
l’étude des contaminants métalliques
(Equipe EA) qui étudient les
fonctionnements et les dysfonctionnements
dans les écosystèmes aquatiques face aux
contaminants en utilisant une large gamme
d’outils allant de l’éthologie à la biologie
moléculaire.
D’un point de vue opérationnel une telle
infrastructure se situera au meilleur niveau
national et européen de par :
1. sa conception de novo totalement intégrée,
2. la coexistence de moyens d’accès au
terrain, de dispositifs expérimentaux et
d’outils analytiques performants,
3. le fait que ces moyens soient très
préférentiellement dédiés à l’étude des
systèmes aquatiques côtiers et littoraux.
I.4. LES MENACES
Les deux principales menaces que nous avons
identifiées ont trait à la non réalisation des
deux opportunités exposées ci dessus (cf. I.3.).
La fusion EPOc-LPTC est essentielle du point
de vue :
1. de la mise en œuvre de l’interdisciplinarité
dans le domaine des sciences de
l’environnement,
2. du positionnement au meilleur niveau
national et international de la composante
« Environnements actuels » de la nouvelle
UMR,
3. de la structuration de la recherche en
écotoxicologie en Aquitaine.
Elle est également susceptible de bénéficier
aux études conduites en paléoclimatologie,
notamment pour ce qui concerne l’utilisation
et/ou le développement de marqueurs
organiques. Cette fusion est enfin importante
pour l’OASU puisqu’elle contribue à élargir
son périmètre par un agrandissement de son
« premier cercle » (cf. le document de
Prospectives de l’OASU). Cette opération est
complexe ne serait-ce que parce qu’elle fait
intervenir trois instituts du CNRS et deux
universités. Sa non réalisation serait
extrêmement dommageable, pour ne pas dire
plus, relativement aux enjeux ainsi qu’à la
réflexion collective conduite depuis plusieurs
mois autour de ce projet.
Sur le moyen terme, la réalisation effective des
opérations immobilières projetées dans le
cadre du prochain contrat quadriennal est quant
à elle essentielle à la viabilité de la nouvelle
UMR (cf. III.2.1.)
7

II. PROJET
Notre projet vise à améliorer l’état actuel de la
structuration de la recherche concernant les
environnements aquatiques sensu largo sur le
site de Bordeaux par la création d’un
ensemble regroupant EPOc et le LPTC. Ce
nouvel ensemble (EPOC) sera tout à la fois :
1. plus intégré en termes de recherche et de
gouvernance,
2. mieux visible au plan national et
international,
3. plus efficace du point de vue de son
adossement à des filières d’enseignement
et de ses infrastructures.
II.1. LA STRUCTURATION
Parallèlement à ce souci de visibilité sur la
thématique environnementale au sens large, et
toujours dans un souci de s’appuyer sur des
socles disciplinaires forts, un second objectif
consiste à renforcer la lisibilité de chacun des
grands champs disciplinaires constitutifs
d’EPOC vis à vis des tutelles et tout
particulièrement des Instituts du CNRS. C’est
dans cette optique que les équipes sont
regroupées en trois thématiques d’importances
globalement comparables: écotoxicologie,
océanographie côtière et géosciences
marines relevant respectivement prioritairement
de l’InC/InEE, de l’INSU/InEE et de
l’INSU (cf. Figure 1).
Notre projet réaffirme le rôle des équipes en
tant que noyau principal de la structuration de
la recherche au sein de la future UMR. Ces
équipes sont au nombre de sept :
- Transferts Géochimiques des Métaux à
l’interface continent océan (TGM),
- Physico- et Toxico-Chimie de
l’Environnement (LPTC),
- Ecotoxicologie Aquatique (EA),
- ECOlogie et BIOgéochimie des
écosystèmes Côtiers (ECOBIOC),
- Modélisation Expérimentale et Télédétection
en HYdrodynamique
Sédimentaire (METHYS),
- PALEOclimats (PALEO),
- Sédimentologie (SEDIMENTO).
Les principales évolutions de leurs contours
concernent la thématique écotoxicologie avec
l’arrivée du LPTC et la division de l’ex-équipe
GEMA en deux entités indépendantes: EA et
TGM. Ces choix ont été faits afin :
1. d’assurer une intégration « en douceur » du
LPTC n’obérant notamment pas ses liens
avec la communauté des chimistes,
2. d’identifier clairement les trois souscomposantes
de la thématique
Ecotoxicologie que sont les approches à
dominante biogéochimique (TGM),
chimique (LPTC) et biologique (EA).
Nous anticipons cependant que la structuration
de cette thématique évoluera lors de futures
contractualisations. Pour ce qui concerne les
thématiques océanographie côtière et
géosciences marines, les équipes sont
inchangées à quelques rattachements
individuels près. Cette continuité reflète pour
partie le succès de restructurations entreprises
lors du dernier contrat quadriennal (e.g., la
création d’ECOBIOC). Elle n’est néanmoins
en aucun cas synonyme d’immobilisme
puisque trois responsables d’équipe sur quatre
ont été renouvelés et que des responsabilités
collectives importantes ont ainsi été confiées à
de jeunes chercheurs (X. Crosta) et
enseignants-chercheurs (X. de Montaudouin et
S. Zaragosi).
II.2. LES RATTACHEMENTS
Du fait de sa multidisciplinarité, EPOc est
actuellement rattachée à l’INSU et à l’InEE.
Cette pluridisciplinarité se trouve encore
renforcée par la fusion avec le LPTC qui est
quant à lui rattaché à l’InC. Il nous semble par
conséquent tout à la fois légitime et cohérent
de revendiquer un rattachement d’EPOC à ces
trois instituts avec comme tutelle principale
l’INSU dont le périmètre nous paraît le mieux
en adéquation avec l’étendue de nos activités.
Ce rattachement principal marque également
notre appartenance et notre fort attachement à
la structure fédérative que constitue l’OASU.
EPOC reste bien entendu au premier chef
8

attachée à l’UB1 (qui l’a accompagné pendant
l’ensemble de la gestation de son projet) à
laquelle viennent s’ajouter à titre plus
secondaire l’EPHE (comme lors de la
contractualisation précédente) et l’UB4 (du fait
de la fusion avec le LPTC). Côté MESR enfin,
EPOC dépend principalement du DSTP 3
(Sciences de la terre et de l’univers, espace), et
secondairement des DSTP 10 (Sciences
agronomiques et écologiques) et 4 (Chimie).
De manière générale, les personnels d’EPOC
conserveront leur affiliation à leur Institut
actuel ainsi qu’à leurs sections actuelles du
Comité National de la Recherche Scientifique
et/ou du CNU. Ceci est notamment le cas pour
la relation liant les personnels du LPTC et
l’InC.
II.3. LES THEMATIQUES ET LE
POSITIONNEMENT
Les thématiques d’EPOC ont été identifiées
comme importantes par les trois instituts de
rattachement potentiels de l’UMR. Françoise
Gaill (Directrice Scientifique de l’InEE) et
Francis Sécheresse (Directeur Scientifique
Adjoint de l’InC) nous ont personnellement
fait part de leur intérêt pour la thématique
écotoxicologie. Cet intérêt s’est notamment
matérialisé par la tenue d’un atelier intitulé
« Ecologie chimique et chimie écologique »
pendant le colloque InEE de Rennes, et par le
séminaire de prospective InEE-INRA qui se
tiendra fin Septembre. L’océanographie
côtière est quant à elle mentionnée à plusieurs
reprises (les interfaces incluant les régions
côtières et les marges, et les milieux incluant
l’étude des processus intervenant sur les
marges) comme un domaine prioritaire dans le
document de Prospectives 2006-2011 de la
CSOA. Ce même document, ainsi que les
appels d’offres INSU et INSU/InEE qualifient
également de prioritaires certains des sujets
(milieux polaires et glaciers, zone tropicale,
chantier Méditerranée, étude des événements
abrupts de changement climatiques,
interactions climats et sociétés, derniers 2000
ans) abordés dans le cadre de la thématique
géosciences marines.
Chacune des équipes d’EPOC présente des
perspectives propres (cf. le corps du
document Prospectives ci-après) qui
constituent la base du projet scientifique. A
cette granularité plus fine, ces prospectives
s’inscrivent là encore bien dans les domaines
considérés comme prioritaire par les
organismes de rattachement. Il n’est pas
question de donner ici une liste exhaustive et
on se limitera à souligner certains points
particulièrement significatifs :
l’évaluation de la qualité/santé des
écosystèmes conduite par TGM, LPTC,
EA et ECOBIOC (Axe 1) qui fait écho au
thème « Evaluation environnementale »
mis en avant par l’InEE ainsi qu’à la
nécessité de détecter et si possible de
quantifier, la présence d'agents chimiques
et biologiques réputés toxiques à l’état de
traces mise en avant par l’InC
l’analyse de la biodiversité et de sa relation
avec le fonctionnement des écosystèmes
(ECOBIOC axes 2 et 3), thème de
recherche mis en avant conjointement par
l’INSU et L’InEE
l’étude des zones marines sous l’influence
des grands fleuves (TGM ; ECOBIOC),
thème de recherche mis en avant par
l’INSU
l’évaluation de la réponse des écosystèmes
au changement global (ECOBIOC, axe 3),
thème de recherche mis en avant par
l’INSU
L’analyse de l’impact des vagues sur la
morphologie des littoraux (METHYS),
thème mis en avant par l’INSU en relation
notamment avec la modification des
fréquences d’occurrences d’événements
extrêmes de type tempêtes ou crues
l’étude des variations climatiques aux
hautes latitudes (PALEO, axe 1), en zone
tropicale (PALEO, axe 2) et en région
Méditerranéenne (PALEO, axe 3) ; ainsi
que l’étude des interactions entre climats et
sociétés (PALEO, action transverse) ;
thèmes mis en avant par l’INSU et par ST.
l’évaluation des transferts sédimentaires et
bilans de matière vers l'océan profond ainsi
que l’étude du rôle de la sédimentation
événementielle dans ces flux
(SEDIMENTO, axe 2), thème de recherche
mis en avant par l’INSU.
9

Figure 1 : Structuration scientifique d’EPOC. Les équipes sont associées en trois thématiques. On notera
le lien entre les structurations des activités de recherche et d’enseignement (au niveau Master). La
hauteur des rectangles matérialisant les équipes est proportionnelle à leur nombre de personnels
permanents (C, EC et ITARF). Les seuls personnels ITARF de l’OASU mentionnés sont ceux intervenant
majoritairement en soutien à EPOC (informatique et bases de données).
10

De manière générale, l’insertion de nos trois
thématiques dans les tissus régionaux et
nationaux est excellente (cf. I.1.1.). Le
positionnement au niveau international est
parfois moins satisfaisant, notamment en
termes de leadership (cf. I.2.1.). Au cours de la
prochaine période de contractualisation, nous
continuerons à travailler en collaboration
étroite avec les collectivités locales. Nous
veillerons également à inscrire nos thématiques
scientifiques dans le cadre de questionnements
généraux ainsi qu’à ne pas limiter nos actions
aux seuls écosystèmes régionaux qui n’en
continueront pas moins à constituer des
modèles privilégiés. Nous nous efforcerons
enfin de mieux traduire ces deux aspects
complémentaires de notre démarche par une
participation accrue et plus lisible à des projets
internationaux. Des premiers efforts allant dans
ce sens seront notamment réalisés dans le
cadre du Réseau Européen des Stations
Marines (MARS) qui prend la relève des REX
MARBEF et Marine Genomics, ainsi que dans
celui de la préparation du projet d’Observatoire
côtier JERICO porté par l’IFREMER (cf.
II.4.1.).
II.4. L’ANIMATION SCIENTIFIQUE
II.4.1. Les plates-formes techniques et les
groupes de travail
Parallèlement à la réaffirmation du rôle central
des équipes, le développement de
l’interdisciplinarité constitue pour EPOC un
objectif majeur qui sera recherché par le biais
de deux approches complémentaires : la
mise en place de plates-formes et de groupes
de travail. Les plates-formes expérimentales et
analytiques seront étroitement adossées aux
équipes via des référents scientifiques
possédant les meilleures compétences dans les
domaines concernés et épaulés à terme par des
personnels ITARF (cf. le document de
prospectives de l’OASU). Ces plates-formes
sont au nombre de sept (Expérimentation/accès
terrain, Mesures physiques, Analyses
faunistiques, Chimie, Isotopie, Biologie
moléculaire, Analyses des carottes
sédimentaires). Elles favoriseront
l’interdisciplinarité par la mise en contact de
scientifiques d’horizons différents autour d’une
approche et/ou d’une méthodologie. Les
groupes de travail visent quant à eux à fédérer
certaines des activités scientifiques des équipes
de l’UMR. Dans un premier temps, ils
concerneront la modélisation (resp.: P.
Lecroart) et les observations automatisées à
haute fréquence (resp.: B. Sautour).
II.4.2. L’aide aux projets innovants
En complément de ces dispositifs, EPOC
entend mettre en place une structure destinée à
favoriser l’émergence de projets innovants
portés en particulier (mais pas nécessairement
uniquement!) par de jeunes C et EC. Nous
mettrons pour cela en place un appel d’offres
interne qui sera totalement financé sur
ressources propres (cf. II.7.) et géré par un
comité dont la présidence sera assurée par le
chargé d’animation scientifique (cf. II.6.). Ce
comité sélectionnera un à deux projets par an
sur la base de l’innovation et/ou de
l’interdisciplinarité qui pourront être financés à
une hauteur maximale de 15k€. Les activités
ainsi soutenues seront évaluées par le biais
d’un rapport écrit et d’une intervention dans le
cadre de la série de séminaires internes de
l’UMR (cf. II.4.3.). Une aide (mise en contact,
rédaction, décharge) sera apportée aux jeunes
porteurs des projets les plus prometteurs afin
que ceux-ci puissent faire l’objet et/ou être
incorporées à des programmes nationaux et
internationaux.
II.4.3. Les séminaires internes
Nous poursuivrons enfin notre série de
séminaires internes. Un effort particulier sera
consacré à l’articulation des actions entre sites
par le développement de l’outil
« visioconférences ». Nous mettrons également
en place un financement permettant aux
doctorants et post doctorants de chacune des
trois thématiques d’inviter chaque année trois
conférenciers extérieurs qu’ils choisiront. Dans
toute la mesure du possible, ces trois
conférences seront rassemblées au sein d’une
seule et même journée de manière à créer un
événement mobilisant l’ensemble de l’UMR.
II.5. LA LIAISON RECHERCHE-
ENSEIGNEMENT
Les directives de cadrage données par le
ministère de l’Enseignement Supérieur sur la
définition des nouvelles offres d’enseignement
précisent que les filières de Master doivent être
11

adossées à des structures de recherche. C’est
dans cette logique qu’EPOC a coordonné sa
structuration scientifique avec la réflexion
engagée dans le cadre du Master Sciences de la
Terre Environnement et Ecologie de l’UB1.
Les trois thématiques scientifiques définies
plus haut (cf. II.3.) sont par conséquent
étroitement associées à autant de
spécialités/parcours de ce Master ; ce qui
renforce la lisibilité et la cohérence des
activités de recherche et d’enseignement
conduites par les personnels d’EPOC (cf.
Figure 1). Le chargé de mission
« Enseignement » (cf. II.6.) veillera
notamment au maintien de cette bonne
adéquation pendant l’ensemble de la période
de contractualisation.
II.6 LA GOUVERNANCE
Les structures de gouvernance d’EPOC
reposent sur quatre niveaux de
responsabilité (cf. Figure 2A) :
1. la cellule de Direction qui comprend le
Directeur, le Directeur adjoint et
l’administrateur,
2. des chargés de mission (Animation de la
recherche, Enseignement et ITA) qui sont
rattachés à cette cellule,
3. les responsables de site,
4. les responsables d’équipe. Les personnes
en charge de ces différents niveaux de
gouvernance sont listées à la Figure 2B.
Cette structuration présente deux évolutions
importantes par rapport à la précédente. La
première est la création de trois postes de
chargé de mission dont les rôles ont pour partie
été évoqués ci-dessus (Animation scientifique
cf. II.4. et Enseignement cf. II.5.). La création
du poste de chargé de mission ITA/IATOS
répond à une recommandation émise par la
section 19 lors de la dernière évaluation
d’EPOc. Ce chargé de mission assurera
l’interface entre la cellule de direction et les
personnels techniques d’EPOC. Il fournira
notamment une assistance à la rédaction des
dossiers et à la préparation des concours. Il
agira en forte interaction avec les responsables
de services mutualisés, de sites et d’équipes.
La seconde inflexion est l’épaulement de
chaque responsable de site par un personnel
ITARF qui assurera l’interface avec les
services des organismes de rattachement (en
particulier la DPI pour ce qui concerne UB1).
Ce modèle a fonctionné très efficacement pour
le site d’Arcachon lors de la dernière période
de contractualisation et est donc étendu à
l’ensemble des sites de l’UMR.
Elles sont regroupées au sein de deux conseils :
le Conseil de Direction qui se réunit de
manière hebdomadaire et a en charge la
gestion opérationnelle de l’UMR, et le Conseil
de Direction Elargi qui se réunit selon une
périodicité mensuelle et a en charge la
définition et le suivi de la mise en œuvre de la
politique scientifique de l’UMR. Ce dernier
point concerne notamment l’établissement et
l’application d’actions coordonnées dans les
domaines de la programmatique et des
équipements scientifiques. Ces deux conseils
sont complétés par le Conseil de laboratoire
dont la composition est statutaire et qui se
réunit au moins deux fois par an ainsi que par
la convocation d’assemblées générales en cas
d’événements particulièrement importants.
12

Figure 2 : Structuration de la gouvernance (A) et organigramme (B) d’EPOC.
II.7. LA GESTION FINANCIERE
Le budget annuel moyen d’EPOc est voisin de
deux millions d’euros (soutien de base,
subventions d’investissement, ressources
propres). Ce montant va significativement
augmenter avec l’arrivée du LPTC d’où la
nécessité indispensable d’un soutien des
organismes de rattachement sous la forme de
poste(s) de gestionnaire(s) supplémentaire(s)
dont les premières demandes ont été formulées
en 2009 (cf. III.3.). Les procédures de gestion
financière s’avérant particulièrement lourdes et
les organismes présentant des savoir-faire
différents, nous souhaitons par ailleurs que
l’UMR puisse continuer à être gérée
conjointement par l’UB1 et le CNRS.
13

III. ADEQUATION DES MOYENS DE L’UNITE AVEC LE PROJET
Pour mener à bien ce projet, l’UMR pourra
s’appuyer sur ses capacités actuelles en termes
financiers matériels et humains qui sont
conséquentes. L’accroissement de la taille de
l’UMR résultant de la fusion avec le LPTC
ainsi que certains volets de notre projet
nécessiteront cependant un soutien fort de nos
organismes de rattachement.
III.1 MOYENS FINANCIERS
Les moyens financiers dont dispose EPOC
peuvent être subdivisés en soutiens récurrents
et en ressources contractuelles. Les principes
généraux selon lesquels ces moyens irrigueront
les différents niveaux de gouvernance de
l’unité sont présentés à la Figure 3.
Figure 3 : Schéma de principe décrivant les flux financiers à l’intérieur d’EPOC. Les codes couleurs
se réfèrent à l’origine des moyens et l’épaisseur des flèches donne une idée (très) qualitative de
l’intensité des flux en question.
III.1.1. LES SOUTIENS RECURRENTS
L’UMR EPOC va significativement s’agrandir
avec l’arrivée du LPTC. Il est essentiel que les
soutiens en crédit récurrent de fonctionnement
des tutelles CNRS et MESR augmentent dans
les mêmes proportions. A titre indicatif, cette
fusion engendrera une augmentation de 20 %
des personnels permanents (C, EC et ITARF).
Une autre manière d’évaluer l’effort nécessaire
consiste à considérer la somme des soutiens de
base actuellement versés à EPOc et au LPTC
par le CNRS et le MESR, soit respectivement
112 et 163 k€ pour EPOc et 25 et 43 k€ pour le
LPTC.
Même si les crédits correspondants transiteront
par l’OASU, nous pensons important de
souligner qu’un effort semblable sera
nécessaire pour la dotation Maintenance et
Infrastructures du futur POA (cf. III.2.1.) ;
effort qui devrait néanmoins se trouver facilité
par le transfert de l’OASU et du LAB du site
de Floirac vers le campus de Talence (cf. le
document de prospectives de l’OASU).
III.1.2. LES RESSOURCES CONTRAC-
TUELLES
Les ressources programmatiques et
contractuelles représentent environ 75 % des
moyens financiers d’EPOc. Au sein d’EPOC,
le dixième de ces revenus (hors salaires et
équipements) sera mutualisé de manière à
dégager les marges financières au bon
fonctionnement des services communs et de la
politique d’animation scientifique. L’utilisation
des 90 % restants sera ensuite supervisée par
les responsables scientifiques des opérations
concernées.
14

III.2 LES MOYENS MATERIELS
III.2.1. Les infrastructures
Le caractère multi-sites d’EPOC constitue un
réel atout, notamment en termes d’accessibilité
à une diversité d’écosystèmes modèles
présentant des caractéristiques différentes. Il
s’avère par contre pénalisant sur certains
aspects dont la gestion des moyens financiers
et informatiques, et les déplacements fréquents
des enseignants-chercheurs. Ce caractère
multi-sites se doit par conséquent d’être limité
(i.e., à un seul site sur les campus de Talence et
d’Arcachon). Ceci pose clairement la question
de la relocalisation de l’équipe LPTC. EPOC
souffre par ailleurs de la vétusté avérée de
certains de ses locaux (notamment la station
marine) qui est incompatible avec la mise en
œuvre d’une recherche du meilleur niveau
international et pose parfois même problème
du strict point de vue des obligations légales de
sécurité.
sont estimés à 7885 m 2 (SHON) auxquels il
faut ajouter 2004 m 2 pour les activités sociales
et culturelles (dont le transfert du Musée de la
société scientifique d’Arcachon) et 1739 m 2 de
stationnements couverts (cf. Tableau I). Le
tout représente par conséquent une surface
SHON de 11 628 m 2 .
La réalisation de cette opération reste
compliquée du fait de son montage financier
qui repose en grande partie sur la vente du
terrain actuellement occupé par la station
marine. Il est absolument capital qu’elle se
réalise effectivement durant la prochaine
période de contractualisation. Il est
également essentiel que son dimensionnement
soit compatible avec les objectifs
mentionnés au paragraphe précédent en
termes d’accueil d’équipes.
Deux opérations immobilières sont envisagées
lors de la prochaine période de
contractualisation :
1. la relocalisation de l’OASU et du LAB sur
le campus de Talence (cf. le document de
prospectives de l’OASU), et
2. la création sur le site d’Arcachon du POA
qui est destiné à accueillir les équipes
LPTC, EA, ECOBIOC et METHYS.
Sur le long terme, seule cette dernière
permettra d’équilibrer au mieux les avantages
et les inconvénients du caractère multi-sites
d’EPOC et de régler efficacement ses
problèmes en termes d’hygiène et de sécurité.
Des progrès extrêmement significatifs ont été
effectués ces derniers mois quant à la
réalisation pratique de cette opération qui
bénéficie du plein soutien de l’UB 1 et de la
Région Aquitaine. Nous disposons maintenant
d’un nouveau site situé sur le Petit Port
d’Arcachon en plein accord avec la Mairie
d’Arcachon et le Conseil Général de la
Gironde. L’étude de faisabilité est terminée et
intègre notamment une solution architecturale
ménageant une liaison forte entre la ville et le
port de plaisance (cf. Figure 4). Les besoins en
termes de surface directement utilisables pour
les activités d’enseignement et de recherche
15

Figure 4 : Etude volumétrique d’implantation du POA sur le site du Petit Port d’Arcachon
16

Tableau I : Récapitulatif des surfaces projetées pour le POA. On notera que le tiers de ces surfaces est
lié soit à des spécificités du site (stationnements couverts), soit à des spécificités de l’opération en elle
même (vie sociale et culturelle)
17

III.2.2. Les équipements
Un de nos objectifs consiste à renforcer et à
faire évoluer l’éventail du parc et des
compétences analytiques d’EPOC. Pour ce qui
concerne les équipements scientifiques, ceci
implique de poursuivre la politique de
jouvence et d’acquisition de nouveaux
équipements conduite lors de la précédente
période de contractualisation. Pour ces deux
rubriques, nos priorités identifiées à ce jour
sont :
Jouvence (9 équipements) :
- Absorption Atomique pour EA
- ADCP avec système de transmission pour
la plate-forme Mesures physiques
- Bouée houlographe pour METHYS
- EA-IRMS pour la plate-forme Isotopie
- GC pour la plate-forme Chimie
- HPLC pour la plate-forme Chimie
- Laser à eximères pour LPTC
- LC-GC-MS pour la plate-forme Chimie
- Spectrofluorimètre tridimensionnel pour
LPTC
Nouvelles acquisitions (9 équipements) :
- Banc GEOTEK pour la plate-forme
Analyse des carottes sédimentaires
- Chromatographie ionique pour ECOBIOC
- Cytomètre de paillasse pour EA, LPTC et
ECOBIOC
- Cytomètre trieur de cellules pour EA,
LPTC et ECOBIOC
- Détecteur d’isotopes radiogéniques de type
« Broad Energy » pour SEDIMENTO
- Granulomètre laser in situ pour METHYS
- ICPMS multicollecteur haute résolution
pour la plate-forme Chimie
- Photomètre automatique SEAMEL pour
METHYS
- Système autonome S,T,P pour la plateforme
Mesures physiques
III.3 LES MOYENS HUMAINS
III.3.1. Les personnels C et EC
EPOC souhaite maintenir sa politique active de
recrutement lors du prochain quadriennal.
Cependant, force est de constater que la
pyramide des âges a évolué et que le gros des
recrutements d’EC consécutif aux départs en
retraite massifs de dernières années est
pratiquement terminé pour EPOC. Les
perspectives de créations de postes EC étant
limitées, nous conduirons une politique active
de recrutements de personnels CNRS. Nous
nous efforcerons tout d’abord de présenter des
candidats de valeur aux concours des
différentes sections du Comité National de la
Recherche Scientifique dont relève EPOC.
Nous nous appuierons également sur
l’attractivité accrue d’EPOC (notamment du
fait de la création de nouvelles infrastructures)
et sur les outils mis en place au niveau régional
et national (chaires d’excellence) pour attirer
des chercheurs titulaires.
Dans ce contexte, nous nous sommes
volontairement limités à deux profils par
équipe et avons choisi de ne pas établir d’ordre
de priorité.
TGM :
« Géochimie des métaux » (cadre A)
« Modélisation biogéochimique des métaux
dans les systèmes fluvio-estuariens et côtiers »
LPTC :
« Interactions des contaminants organiques
avec la Matière Organique Dissoute et
réactivité »
« Toxicologie prédictive : méthode in silico »
(cadre A)
EA :
« Ecotoxicologie aquatique, génétique »
« Ecotoxicologie aquatique » (cadre A)
METHYS :
« Propriétés des sédiments en milieux côtier »
« Modélisation et/ou télédétection de l’hydrodynamique
sédimentaire des environnements
lagunaires »
ECOBIOC :
« Ecologie pélagique »
« Biogéochimie du carbone ; échange de CO2
avec l’atmosphère »
PALEO :
« Isotopie de la silice »
« Modélisation intégrée du climat »
SEDIMENTO :
« Modélisation sédimentologique »
« Sédimentologie Marine » (cadre A)
18

III.3.2. Les personnels ITARF
Dans l’optique du renforcement de l’éventail
des compétences analytiques d’EPOC, la
politique de recrutement des personnels
ITARF au cours de la prochaine période de
contractualisation reposera principalement sur :
1. le gréement des plates-formes analytiques
et expérimentales en lien avec l’OASU,
2. la recherche d’un juste équilibre dans le
niveau d’aide technique apporté aux
différentes équipes.
Sur la base de la contractualisation précédente,
nous estimons que le taux de renouvellement
des personnels ITARF au sein du seul EPOc
est voisin de 15 postes. Ce nombre est
compatible avec le dimensionnement de notre
propre réflexion, soit 23 postes dont 6 font
d’ores et déjà l’objet d’une demande (et dont
on peut donc espérer qu’ils seront accordés
avant le début de la prochaine période de
contractualisation)
Les besoins ont été regroupés, sans classement
de priorité, en trois catégories : Services
communs, Plates-formes et équipes. Ceux
faisant d’ores et déjà l’objet d’une demande
auprès des tutelles sont listés en italiques.
Services communs (4 postes) :
- 1 AI gestionnaire, poste sollicité auprès de
UB1 et au travers de l’OASU en 2009. Ce
poste vient en complément du recrutement
éventuel d’Hélène Juguelin dans le cadre
de la fusion avec le LPTC.
- 2 AJT, dont un sollicité en 2009 via
l’OASU, pour l’entretien de la station
marine d’Arcachon
- 1 T plongeur professionnel pour la mise en
place du service plongée ; à solliciter de
préférence auprès de l’INSU.
Plates-formes (7 postes) :
- 1 AI destiné à la plate-forme de Biologie
moléculaire, poste sollicité auprès de
l’INSU et au travers de l’OASU en 2009
- 1 T Isotopes stables pour la plate-forme
d’isotopie, poste sollicité en 2009 auprès
de l’INSU et UB1
- 1 IE pour la plate-forme Analyses
faunistiques
- 1 T chimie analytique pour la plate-forme
Chimie
- 1 T biologie animale pour la plate-forme
Expérimentation
- 1 T pour la plate-forme Mesures physiques
- 1 AI pour la plate-forme Analyse de
carottes sédimentaires
Equipes (12 postes) :
Les équipes TGM et EA n’ont pas de demande
spécifique hors plates-formes.
LPTC :
- 1 IR chimie analytique
- 1 IE chimie physique
- 1 IE calcul scientifique
- 1 IE instrumentation en chimie analytique
- 1 T chimiste destiné au site de Périgueux
METHYS :
1 IE mesures physiques, poste sollicité auprès
de l’UB1 en 2009
ECOBIOC :
- 1 IE chimiste, poste sollicité auprès de
l’INSU en 2009
- 1 IE électronicien/traitement du signal
PALEO :
- 1 T préparation d’échantillons
- 1 IR biomarqueurs moléculaires
SEDIMENTO :
- 1 T analyses sédimentologiques
- 1 T lithopréparation
19

IV. LA FORMATION PERMANENTE, L’HYGIENE ET LA SECURITE
IV.1 LA FORMATION PERMANENTE
Le recours à la formation permanente est
depuis longtemps considéré à EPOc comme un
outil puissant au service de l’UMR et de ses
personnels. Le passage vers EPOC ne changera
en rien cet état de fait. Nous comptons au
contraire utiliser fortement cet outil dans une
optique d’amélioration des performances et
d’amélioration des carrières des ITARF, en
relation notamment avec la mise en place des
plates-formes analytiques et expérimentales.
Notre plan de formation est présenté en
Annexe II. Il prend une nouvelle fois en
compte la multidisciplinarité de notre UMR et
privilégie les formations dans les domaines de
l’instrumentation et du terrain, de la
bureautique et de l’informatique, de
l’apprentissage des langues, et bien entendu de
l’hygiène et de la sécurité.. EPOC continuera
par ailleurs à valoriser au mieux les
compétences internes en organisant plusieurs
formations qui seront ouvertes non seulement
aux personnels d’EPOC mais également aux
extérieurs.
IV.2 L’HYGIENE ET LA SECURITE
EPOC continuera à accorder la plus grande
importance aux questions d’hygiène et de
sécurité. En cela, elle s’inscrira dans la
continuité des efforts entrepris lors de la
dernière période de contractualisation. Pour ces
aspects les plus lourds, elle s’appuiera
également sur les opérations immobilières qui
verront le jour durant le prochain contrat
quadriennal. Nous utiliserons enfin notre plan
de formation permanente pour assurer aux
mieux la sécurité des personnels de l’UMR (cf.
IV.1.).
Notre approche consistera à analyser les
risques dans chacune des grandes catégories
suivantes :
1. infrastructures,
2. opérations de terrain,
3. chimie,
4. biologie et
5. physique (incluant les risques
radiologiques).
Les ateliers mis en place lors de la
contractualisation précédente sont chargés de
conduire l’ensemble de ces analyses pour la fin
de l’année 2009. Leurs rendus seront tout
d’abord utilisés pour rédiger un livret destiné à
informer les nouveaux entrants des risques
auxquels ils sont susceptibles d’être confrontés
au sein d’EPOC. Ils seront également
examinés en CLHS à la lumière :
1. du caractère plus ou moins prégnant des
risques en question,
2. de l’ampleur des actions à entreprendre
pour y pallier.
Sur la base de ces deux éléments, un calendrier
des opérations/démarches sera établi. Il
prévoira des actions soit immédiates, soit
associées aux futures opérations immobilières
conduites sur les sites de Talence et
d’Arcachon.
Au delà de cette logique générale, les
paragraphes qui suivent listent les questions
d’hygiène et de sécurité d’ores et déjà
identifiées comme posant problème.
Risques liés aux infrastructures :
La vétusté des installations de la station marine
d’Arcachon atteint aujourd’hui un niveau plus
que critique. Cet état de fait induit des risques
électriques et d’incendies particulièrement
élevés. Le bâtiment B18 du site de Talence et
ses annexes sont également destinés à
accueillir la nouvelle UMR sur le long terme.
Ils souffrent également de problèmes
importants dont les plus prégnants ont trait au
risque électrique, à des fissures dont les
conséquences structurelles n’ont à notre
connaissance pas été évaluées, et au
dysfonctionnement des monte-charges. En
relation avec ses tutelles, et en premier lieu
l’UB1, nous continuerons à réaliser ou bien à
susciter la réalisation des aménagements les
plus indispensables. Nous insistons néanmoins
sur le fait qu’une solution réellement
satisfaisante à ces problèmes d’infrastructures
ne sera atteinte qu’avec l’achèvement des
opérations immobilières prévues sur les sites
d’Arcachon et de Talence.
20

Risques liées aux opérations de terrain :
Les opérations de terrain constituent une
composante extrêmement importante de
l’activité d’EPOC. A ce titre, elles ont déjà fait
l’objet d’une analyse exhaustive. A l’issue de
cet exercice, un guide des procédures à
respecter a été défini et approuvé par le CLHS.
Nous veillerons et aiderons à son application
par l’ensemble des équipes d’EPOC. De
même, un groupe est en charge de la gestion du
navire de station et de la transmission des
consignes de sécurité à bord, en partenariat
avec l’armement de l’INSU. Nous souhaitons
de plus mettre en place un service de plongée
au sein d’EPOC, et ce dans le respect
scrupuleux de la législation dans le domaine,
ce qui impliquera un soutien des tutelles sous
la forme de postes (plongeur professionnel
cf. IV.3.2.) et de matériel (compresseur).
Risques chimiques :
Les deux principaux risques identifiés
concernent le bon fonctionnement des
sorbonnes (sites de Talence et d’Arcachon) et
la localisation du bunker de produits chimiques
(Bâtiment B18 de Talence). Pour ce qui
concerne le premier de ces deux points, nous
continuerons la politique de mise en sécurité
entamée lors de la contractualisation
précédente (e.g., remplacement de la sorbonne
de microscopie de la station marine
d’Arcachon, installation de nouvelles
sorbonnes dans le laboratoire de
lithopréparation). De manière plus générale,
nous nous inscrirons dans le cadre du marché
en cours de négociation pour l’ensemble de
l’UB1. La généralisation des bonnes pratiques
en termes de chimie à l’intérieur de l’UMR
bénéficiera enfin grandement de la fusion avec
le LPTC qui possède une expérience reconnue
dans le domaine.
domaines tels que l’écotoxicologie et la
microbiologie. Nous veillerons donc tout
particulièrement à la bonne prise en compte de
ces risques au sein du POA.
Risques physiques :
La non-conformité de la zone contrôlée
réservée à l’utilisation des radioisotopes à la
station marine d’Arcachon nous a conduit à
stopper totalement l’utilisation de ces produits.
En accord avec les services de l’UB1 en charge
de la radioprotection. Il a été convenu que la
source contenue dans le conteneur à
scintillations de la station marine serait
conservée à l’intérieur du château de plomb de
ce même compteur jusqu’à son déménagement
vers le nouveau bâtiment où des locaux aux
normes seront aménagés. D’ici là, la zone
correspondante sera balisée et les déchets
accumulés évacués. La situation sur le site de
Talence (risques liés aux équipements
SCOPIX-XRF) est par contre satisfaisante.
Risques biologiques :
Les risques biologiques ont également déjà fait
l’objet d’une analyse poussée. Ils sont liés à la
manipulation de microorganismes pathogènes
et à celle d’organismes génétiquement
modifiés. Leur prise en compte actuelle semble
satisfaisante. Nous anticipons néanmoins que
les risques de cette nature vont évoluer (et
globalement augmenter) du fait de l’évolution
des techniques et ou des approches dans des
21

V. TRANSFERT ET VALORISATION DE L’INFORMATION SCIENTIFIQUE ET
TECHNIQUE
Depuis de nombreuses années, EPOc et le
LPTC s’attachent à valoriser leurs travaux de
recherche par le biais d’une association de
médiation des sciences (liée à EPOc) ainsi que
par l’activité de cellules de transfert de
technologies.
V.1 L’ASSOCIATION OCEAN
Créée en 1995 à l’initiative de doctorants du
DGO, l’association Océan diffuse la culture et
les connaissances dans le domaine des sciences
et de l'histoire des environnements vers un
public le plus large possible (plus de 35000
personnes en 2008). Océan est liée à EPOc par
une convention et est considérée comme sa
cellule de transfert culturel et pédagogique.
Océan emploie plusieurs anciens doctorants
d’EPOc, et de nombreux membres actuels de
l’UMR sont impliqués dans la direction et la
gestion d’Océan. L’association propose un
large éventail d’activités au grand public
(conférences, sorties sur le fleuve, cours du
3 ème âge…). Ses liens avec EPOC seront
maintenus au cours de la prochaine période de
contractualisation.
contaminants organiques et plus
particulièrement dans le domaine ultra-traces,
de leurs impacts et de leurs effets sur
l’environnement. Le CDTA emploie un
ingénieur en CDI, et d’autres personnels en
CDD suivant les contrats.
L’activité de ces deux cellules sera poursuivie
lors de la prochaine période de
contractualisation. Nous réfléchirons
également à la pertinence de les fusionner.
V.2 CELLULES DE TRANSFERT
G.E.O. TRANSFERT est une Cellule de
Transfert de Technologie de l’association
ADERA qui entre dans le dispositif de
transfert de technologie mis en place par la
Région Aquitaine. La cellule participe à la
valorisation des recherches menées par EPOc
dans deux domaines principaux :
- Etude et surveillance de la qualité des eaux
- Télédétection et modélisation
G.E.O. Transfert emploie actuellement deux
personnes possédant un doctorat obtenu à
l’UMR EPOc.
Le LPTC possède également une cellule de
transfert, le CDTA (Centre de Développement
et de Transfert Analytique) dont la direction
scientifique est assurée par Hélène Budzinski,
L’objectif principal de la cellule est de
transférer vers le tissu industriel le savoir-faire
du laboratoire dans le domaine de l’analyse des
22

VI. GLOSSAIRE
ACMO : Agent Chargé de la Mise en Oeuvre des règles d'hygiène et de sécurité.
ADERA : Association pour le Développement de l’Enseignement et des Recherches auprès
des universités, des centres de Recherche et des entreprises d’Aquitaine
AFSSA : Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments
AFSSET : Agence Française de Sécurité Sanitaire de l’Environnement et du Travail
AST : Action Scientifique Transverse
CENBG : Centre d'Etude Nucléaires de Bordeaux-Gradignan (UMR 579)
CIRMAT : Comité Inter-Régional Manche ATlantique
CLHS : Comité Local d’Hygiène et de Sécurité
CNAP : Corps National des Astronomes et Physiciens
CNFE : Commission Nationale Flotte et Engins
CNU : Comité National des Universités
CSTF : Comité Scientifique et Technique de la Flotte
CTAI : Centre de Traitement Automatisé de l'Information
DGO : Département de Géologie et d’Océanographie (ancienne entité d’EPOc)
EC2CO : Ecosphère Continentale et Côtière (programme de l’INSU)
ENVOLH : Master ENVironnement, Océanographie Littorale et Hauturière (UB1)
EPHE : Ecole Pratique des Hautes Etudes
EPOc : Environnements et Paléoenvironnements Océaniques (UMR 5805)
EPOC : Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux (UMR
proposée pour la période 2011-2014)
FDEA : Fonctionnement et Dysfonctionnement des Ecosystèmes Aquatiques (UB1)
GC/IRMS : Gas Chromatography Isotope Ratio Mass Spectrometry
GC/MS : Gas Chromatography Mass Spectrometry
GC/TOF : Gas Chromatography Time Of Flight
GE
: Géoressources et Environnement (EA en demande de labellisation, EGID – UB3)
HFNI : Haute Fréquence, Non Invasive (méthode de valvométrie)
ICPMS : Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometer
IMAGES : International Marine pAst Global changE Study
InC
: Institut de Chimie (Institut du CNRS)
InEE : Institut Environnement et Ecologie (Institut du CNRS)
INERIS : Institut National de l’Environnement industriel et des RISques
INRA : Institut National de Recherche Agronomique
IODP : Integrated Ocean Drilling Program
IPGQ : Institut de Préhistoire et Géologie du Quaternaire (équipe de PACEA)
IPREM : Institut Pluridisciplinaire de Recherche sur l'Environnement et les Matériaux
(UPPA)
IRD : Institut de Recherche pour le Développement
ISM : Institut des Sciences Moléculaires (UMR 5255)
LAB : Laboratoire d'Astrophysique de Bordeaux (UMR 5804)
LC/MS : Liquid Chromatography Mass Spectrometry
LEESA : Laboratoire d’Ecotoxicologie des Systèmes Aquatiques (ancienne entité d’EPOc)
LEFE : Les Enveloppes Fluides et l’Environnement
LEFE-CHAT : Action chimie atmosphérique de LEFE
LEFE-CYBER : Action Biogéochimique de LEFE
LEFE-EVE : Action Paléoclimatologie de LEFE
LEFE-IDAO : Action Hydrodynamique de LEFE
LOB : Laboratoire d’Océanographie Biologique (ancienne entité d’EPOc)
LPTC : Laboratoire de Physico-Toxico Chimie (équipe de l' ISM qui rejoint l'UMR EPOC)
MAGEST : MArel Gironde ESTuaire (réseau de surveillance automatisé)
OA
: Océan-Atmosphère (Département de l'INSU)
OASU : Observatoire Aquitain des Sciences de l'Univers
OMP : Observatoire Midi-Pyrénées (OSU toulousain)
23

ONEMA : Office Nationale de l’Eau et des Milieux Aquatiques
ORQUE : Observatoire de Recherche sur la Qualité de l'Environnement (UPPA & UB1)
PACEA : Préhistoire à l’Actuel Culture, Environnement, Anthropologie, UMR 5199
regroupant l'équipe IPGQ (préhistoriens) et l'équipe LAPP (anthropologues); tutelle
CNRS-Institut SHS
POA : Pôle Océanographique Aquitain (nouvelle infrastructure sur le site d’Arcachon)
PPP : Partenariat Public Privé
RE
: Radioactivité et Environnement (équipe de l'UMR CENBG)
RNSM : Réseau National des Stations Marines
RRLA : Réseau de Recherche Littoral Aquitain
SCOPIX-XRF : Radiographie numérique et fluorescence par RX
SHON : Surface Hors Oeuvre Nette
SIC : Surfaces et Interfaces Continentales
SO
: Service d'Observation (label national INSU)
SOLAQUI : Service d'Observation du Littoral AQUItain
SOMLIT : Service d'Observation en Milieu LITtoral (SO océan-atmosphère INSU)
ST
: Sciences de la Terre (Département de l'INSU)
UB1 : Université Bordeaux I Sciences et Technologies
UB4 : Université Bordeaux 4 Montesquieu
UFR STM : UFR des Sciences de la Terre et de la Mer (UB1)
UMS OASU : Unité Mixte de Service 2567
UVED : Université Virtuelle Environnement et Développement Durable
24

PROJETS SCIENTIFIQUES
DES EQUIPES
25

TRANSFERTS GEOCHIMIQUES DES METAUX A
L’INTERFACE CONTINENT OCEAN : TGM
Responsable : Gérard BLANC
AXE 1 : Transferts Métalliques du
continent vers l’océan
EA
Ecotoxocologie
LPTC
Contaminants organiques
ECOBIOC
Réseaux trophiques
Biogéochimie
METHYS
Modélisation
hydrodynamique
Gérard BLANC (PU)
Alexandra COYNEL (MCF)
Jörg SCHÄFER (MCF)
Cécile BOSSY (IE)
Lionel DUTRUCH (IE)
Doctorants :
Thi Ha DANG
Laurent LANCELEUR
Aurélie LARROSE
Emilie STRADY
Les politiques de prévention, négociées au
niveau CEE/ONU à Genève et au niveau
français, dans le cadre du « Grenelle
Environnement », incitent les gestionnaires de
la ressource en eau à une obligation de
résultats sur l’amélioration durable de la
qualité des eaux douces, de transition et
marines. Les métaux et plus généralement les
Eléments Traces Métalliques (ETM), sont
considérés comme des polluants
indestructibles, pour certains toxiques à de très
faibles doses et ayant des impacts nocifs à
grande distance de leur zone d’émission.
L’équipe TGM étudie les transferts
géochimiques des métaux à l’interface
continent-océan. Sa principale caractéristique
est d’associer des approches en Géologie, en
Géochimie et en Ecotoxicologie. Le barycentre
se situe au niveau des cycles géochimiques des
ETM. Toutefois, la reconnaissance des
mécanismes de l’érosion et de leurs effets sur
le transport de matière est associée à des
avancées sur la détermination de la
biodisponibilité et de la bioaccumulation des
métaux. L’équipe travaille depuis la typologie
du bassin versant jusqu’à l’échelle moléculaire
dans le but de renseigner, pour un métal donné,
ses origines géogènes et/ou anthropiques, la
nature et la répartition de ses formes
chimiques, ses interactions avec les
constituants du milieu, et son devenir dans les
organismes vivants.
L’équipe est visible au niveau national et
international de par :
−
ces travaux d’observation et de bilans
géochimiques sur le bassin versant
expérimental Garonne-Gironde,
− ses compétences analytiques sur la
spéciation des métaux dans différentes
matrices naturelles qui lui offrent des
possibilités de collaborations avec
l’industrie.
27

Ses recherches s’inscrivent dans les
prospectives de l’INSU et de l’INEE (actions
ST et EC 2 CO) et de l’ARN CEP (ex-VMC).
Les collaborations historiques, avec nos
collègues des équipes EA et LPTC nous
positionnent au sein de la thématique
« ECOTOXICOLOGIE » de l’UMR et dans la
dynamique du Pôle Océanographique Aquitain
(POA). La création du programme Franco-
Canadien GAGILAU et du GIS COCHISE
renforceront ce positionnement lors du
prochain contrat quadriennal. Notre champ
d’investigation associe des recherches
holistiques et réductionnistes pour obtenir des
savoirs fondamentaux relatifs aux transferts
métalliques du continent vers l’océan. Cette
thématique constitue l’axe de recherche unique
de l’équipe TGM.
Nos travaux viseront à documenter la
connaissance des cycles géochimiques des
métaux dans le contexte de la forte
anthropisation des zones côtières et des
changements environnementaux à l’échelle
planétaire. Bien que liées entre elles, les
questions qui retiendront notre attention sont
présentées ci-après sous forme d’actions de
recherche.
ACTION 1 : QUEL EST LE ROLE DE
L’EROSION DANS LES TRANSFERTS
METALLIQUES ?
L’érosion hydrique des sols résulte de
processus naturels modifiés par les activités
humaines et contribue aux apports métalliques
du continent vers l’océan. Nous chercherons à
définir les typologies des bassins versants en
fonction de leurs vulnérabilités à l’érosion
incluant la lithologie des bassins drainés et les
indices de sensibilité à l’érosion. Les forts
contrastes de transport de matière décrits dans
le bassin Adour-Garonne nous permettent de
transposer notre expérience à d’autres bassins
versants connus pour l’importance de leur
transport sédimentaire. Ainsi, des opportunités
de recherche en Asie du sud-est, (Vietnam,
Taiwan,…) devraient permettre de tester la
robustesse des paramètres typologiques en
zones tropicales sur la prédiction des flux de
matière, de caractériser les bruits de fonds
géochimiques et les sources anthropiques en
ETM, et de hiérarchiser les mécanismes
macroscopiques des transferts métalliques vers
l’aval. L’identification des forçages sur
l’érosion permettra de proposer des scenarii
prédictifs des transferts particulaires en climats
tempérés et tropicaux. Ces travaux s’inscrivent
dans le cadre du programme INSU-ST (e.g.
RIVERSONG), et de l’ANR blanche
internationale (projet déposé en 2009).
L’originalité de notre démarche s’appuie sur
notre expérience de suivi temporel des
paramètres de terrain en climat tempéré et le
développement de la modélisation statistique,
rendu possible par le recrutement en 2007
d’Alexandra Coynel sur un profil transferts
fluvio-estuariens, SIG et traitements
géostatistiques des données. Ces nouveaux
outils nous permettent d’aborder de façon
réaliste les problèmes de spatialisation des
données, notamment au niveau de résultats
cartographiques de métaux sédimentaires en
estuaire et zones côtières. Ces résultats sont
confrontables à ceux des modèles
hydrodynamiques et utilisables par les
gestionnaires et les exploitants (e.g. CG,
SMIDDEST, PAB).
ACTION 2 : QUELS SONT LES BILANS DE
MASSE DES TRANSFERTS METALLIQUES
EN ZONES COTIERES ?
Lors du dernier contrat quadriennal, des
résultats significatifs ont été obtenus sur les
transferts fluvio-estuariens des concentrations
dissoutes de Cd, Cu, Hg, As, Mo, V, et U.
Notre objectif est double, et consiste
maintenant à :
1. développer des études portant sur des ETM
très utilisés aujourd’hui dans des
applications industrielles et parfois
assimilés à des nanoparticules (e.g. Ag, et
le groupe des platinoïdes),
2. enrichir nos modèles de bilans de masse en
considérant les processus responsables de
la modification des Kd (partition
particulaires/dissous) dans les zones
estuariennes aval et les zones côtières.
Ce double objectif nécessite de nous investir
conjointement sur le développement :
1. d’observations de terrain permettant
l’amélioration de la connaissance des flux
nets particulaires à l’embouchure de la
Gironde et de la Charente,
2. de nouveaux protocoles techniques
permettant l’amélioration des précisions et
des sensibilités analytiques sur des
échantillons à matrices marines.
28

Notre approche est originale car elle se nourrit
de données pluridisciplinaires comme la
détermination des vitesses résiduelles de
courants tidaux par ADCP, la détermination
des extensions des panaches turbides par
télédétection, et l’utilisation des données issues
de modélisation hydrodynamique (Siam-2D,
Mars-3D) (thèse A. Dabrin). Ces études
s’inscrivent dans le cadre de programmes
régionaux et nationaux ayant pour objectif la
réduction des sources en polluants métalliques
des huîtres de Marennes-Oléron. Les
concentrations métalliques en Cd, Cu et Ag
mesurées aujourd’hui dans des huîtres
sauvages obligent à réduire les sources
métalliques dont toutes ne sont pas identifiées.
A court terme, nous espérons pouvoir produire
un guide d’exploitation des zones estuariennes
et côtières utilisables par les gestionnaires pour
la régulation durable des concentrations en Cd
et autres métaux des huîtres de Marennes-
Oléron. A plus long terme, nous espérons
contribuer à la pérennisation de l’ostréiculture
Oléronnaise et au développement durable de
l’aquaculture en zone côtière. Les apports en
ETM de l’agglomération de Bordeaux sont
encore inconnus. Les travaux en collaboration
avec S. Norra de l’université de Karlsruhe
incluent la minéralogie fine des particules
urbaines et leur altération dans les gradients
estuariens. Lors du prochain contrat
quadriennal, nous proposerons un modèle
quantitatif des transferts métalliques issus du
bassin versant urbain de Bordeaux. Ce projet
(ETIAGE) intéresse la Lyonnaise des eaux et
la CUB.
ACTION 3 : QUEL EST LE ROLE DES
PROCESSUS BIOGEOCHIMIQUES SUR LES
TRANSFERTS METALLIQUES ?
Bien que très utile en terme de compréhension
des mécanismes macroscopiques et également
d’un point de vue pratique et économique pour
développer des tests simples permettant
d’évaluer la biodisponibilité d’un métal, la
concentration totale métallique ne constitue
pas toujours un indicateur pertinent pour
décrire le cycle biogéochimique des métaux
et/ou le risque écotoxologique. La spéciation,
forme du métal à l’état dissous, colloïdal et
particulaire doit également être considérée.
Lors du prochain contrat quadriennal, nous
poursuivrons nos investigations sur le rôle des
gradients transitoires (salés, turbides et redox)
sur les modifications de spéciation spécifiques
à chaque métal et sur leurs conséquences en
terme de phénomènes d’addition, soustraction
et stabilisation.
La spéciation peut être ionique, moléculaire et
opérationnelle. Son étude implique des
développements technologiques constants que
TGM poursuivra avec un « up grade » attendu
vers les mesures dynamiques à haute fréquence
in et ex situ par voltamétrie. Nous souhaitons
développer des méthodes de traçage et de la
modélisation géochimique dans le but de
quantifier précisément le rôle des mécanismes
de sorption des métaux entre des eaux douces,
intermédiaires et marines et des particules
lithiques, organiques et vivantes (plancton,
benthos).
Nous continuerons nos développements
méthodologiques sur le dopage isotopique
notamment pour quantifier expérimentalement
les processus induisant des modifications de
spéciation par voie bactérienne dans les
sédiments et la colonne d’eau. Ce type
d’expérimentation a fait l’objet d’une demande
ARN CES portée par le BRGM. Une méthode
utilisant les isotopes stables du Cd a été mise
au point dans le but de quantifier
expérimentalement la contamination de l’huître
par la voie trophique (thèse d’E. Strady,
programme « Défi Cd, EC 2 CO Cytrix »). Les
premiers résultats sont très encourageants et
ouvrent des possibilités énormes
d’expérimentation en écotoxicologie en
utilisant désormais des concentrations en
métaux comparables à celles mesurées dans le
milieu naturel.
Le potentiel humain au sein de TGM est
aujourd’hui insuffisant pour développer
complètement une approche de modélisation
géochimique. Nous avons par conséquent initié
des collaborations sur cette thématique. Des
résultats préliminaires, utilisant les isothermes
de Langmuir et de Freundlich (Thèse M.
Masson), montrent des convergences
significatives entre la modélisation
expérimentale et les données de terrain. En
étroite collaboration avec M. Tercier-Weber du
CABE de l’Université de Genève, M. Masson
travaille sur la modélisation géochimique
(code Visual MINTEQ) des variabilités
journalières et saisonnières de la spéciation de
As, Cd, Cu dans l’estuaire de la Gironde et le
Riou-Mort (Aveyron). J. Schäfer travaille avec
29

A. Turner (Université de Plymouth) sur la
modélisation géochimique de Ag (codes Visual
MINTEQ et WHAM) dans les gradients salés et
turbides de l’estuaire de la Gironde. Nous
exploiterons au mieux le retour d’expérience
de ces actions pour proposer lors du prochain
contrat quadriennal de la modélisation
biogéochimique des métaux dans les systèmes
fluvio-estuariens et côtiers. Le recrutement
d’un chercheur sur cette thématique est
néanmoins clairement à envisager.
ACTION 4 : QUEL EST LE ROLE DES
CHANGEMENTS ENVIRONNEMENTAUX
PLANETAIRES SUR LES TRANSFERTS DES
METAUX A L’ECHELLE REGIONALE ?
Les modèles d’évolution climatique du GIEC
prévoient un fort réchauffement de l’Aquitaine
(e.g. 4 à 5° C en fin du siècle) associé à un
déficit de pluviosité de 25 à 30 %. Conjugués à
la montée attendue du niveau marin, de tels
changements devraient se traduire par une
« marinisation » forte de l’estuaire de la
Gironde accompagnée d’une augmentation des
périodes d’étiage fluvial (e.g. canicule de l’été
2003). Dans ce contexte, l’approfondissement
du chenal de navigation est également
susceptible de favoriser les entrées marines.
Les observations météorologiques suggèrent
par ailleurs une augmentation de la fréquence
des évènements extrêmes (e.g. tempêtes de
1999 et 2009, crues éclairs et inondations de
2003). Il faut s’attendre dans le siècle en cours
à une augmentation de la réactivité biogéochimique
estuarienne due à de plus forts
gradients salés, turbides et rédox, plus
contrastés saisonnièrement.
La banque de données acquises depuis plus de
10 ans sur le Bassin versant Garonne-Gironde
nous a permis de proposer des modèles
empiriques de transport, essentiellement
dépendant de l’hydrologie. Ces résultats seront
exploités pour proposer une modélisation
numérique intégrée prenant en compte les
variabilités possibles des sources et des
transferts métalliques d’amont en aval en
fonction des changements hydro-climatiques et
des aménagements anthropiques locaux
prévisibles. Ces variabilités incluent les
discontinuités majeures que sont les barrages et
les villes, les aménagements fluviaux et
estuariens, la remédiation de sites pollués et les
changements de plans d’occupation des sols.
Ces sorties de modèle devront pouvoir être
exploitées comme outil de gestion de la
ressource en eau jusqu’en 2050. Cette
modélisation sera développée en collaboration
avec le LMTG/OMP dans le cadre du
programme GAGILAU et de l’ANR CEP. Elle
se nourrira de travaux visant à lever des
inconnues telles que :
1. l’impact de l’agglomération bordelaise,
2. les conséquences de la dépoldérisation
sachant que nos données montrent un fort
piégeage des métaux issus notamment de
l’agriculture dans les marais et tourbières,
et enfin,
3. l’impact des productions pélagiques et
benthiques sur les redistribution des ETM.
30

PHYSICO- ET TOXICO-CHIMIE DE
L’ENVIRONNEMENT : LPTC
Responsable : Hélène BUDZINSKI
ECOBIOC
Multistress
Géochimie
Ecotoxicologie
Aquatique
Multistress
Approche
écosystémique
AXE 1
Sources et présence des
polluants organiques
- Développements analytiques
- Echantillonneurs passifs
- Méthode EDA
LPTC
AXE 2
Interactions polluants
organiques - milieux
- Transformation des polluants
chimiques
- Interaction Contaminants
Organiques / Matière
Organique
Développements d’outils analytiques
Instrumentation – Spectrométrie de masse
Modélisation
AXE 3
Mécanismes d’action et
effets toxiques à différents
niveaux d’intégration
biologique et sur différents
stades de vie
- Approche in silico
- Développements de bio-tests
- Effets au niveau du cycle de
vie
TGM
Géochimie des métaux
traces
Hélène Budzinski
Marie-Hélène Devier
Patrick Pardon
Valérie Guillet
Ludovic Tuduri
Eric Villenave
Patrick Mazellier
Edith Parlanti
Jérôme Cachot
Jean-François Narbonne
Nathalie Geneste
Jean-Luc Giraudel
Blandine Davail
Bénédicte Morin
Doctorants: N. Abou Mrad, S.
Azoury, A. Belles, MJ.
Capdeville, A. Crespo, J. Grossin
Debattista, R. Kanan, A.
Kouzayha, Y. Moussaoui, F.
Murcia, C. Soulier
Doctorants: M. Cazaunau, P.
Danial-Fortin, C. De Perre, A.
Guillon, J. Ringuet, C. Rio,
Morajkar Pranay
Doctorants: I. Barjhoux, N.
Creusot, J. Gonzalez, AL. Scelo,
L. Vicquelin
Personnel technique: S. Augagneur, C. Clérandeau, MA. Cordier, PM. Flaud, F. Ibalot, K. Le Menach, L. Peluhet
Le rejet continu de substances chimiques
toxiques constitue un facteur préoccupant de la
dégradation de la qualité de l’environnement.
Les risques de contamination des écosystèmes
et par conséquent les risques sanitaires associés
augmentent du fait de la production croissante
de composés manufacturés ainsi que de la
diversité des produits utilisés et dispersés. Les
contaminants chimiques concernés sont très
nombreux et comprennent tant des métaux, que
des hydrocarbures, des pesticides ou encore
des composés pharmaceutiques. Le milieu
aquatique est particulièrement touché de par
son rôle de réceptacle ultime des polluants, ce
qui est préoccupant du fait de la sensibilité des
espèces qui y résident, de sa contribution aux
cycles globaux des principaux éléments et de
son usage en tant que ressource d’eau potable.
L’atmosphère joue quant à elle un rôle
important :
1. en tant que vecteur majeur du transport
de nombreuses espèces chimiques,
2. comme réacteur pour les processus
physico-chimiques conditionnant la
formation et/ou dégradation des composés,
31

3. comme source importante de pollution
chimique pour l’environnement aquatique,
4. par son impact sur le changement
climatique.
Les recherches concernant les impacts des
polluants et/ou contaminants chimiques sur les
écosystèmes et sur l’homme doivent se
focaliser sur :
1. l’approfondissement des connaissances sur
leur présence, leur transfert, leur
biodisponibilité, leurs transformations
(biotique et abiotique), leurs cibles
toxiques,
2. les mécanismes moléculaires qui
conditionnent leur toxicité,
3. les mécanismes d’interaction au sein des
écosystèmes (incluant l’homme) (perturbations
par exemple du fonctionnement
des communautés ou des écosystèmes euxmêmes).
C’est dans ce contexte et dans une démarche
résolument pluridisciplinaire associant
chimistes analyticiens, physico-chimistes,
biochimistes, toxicologues et biologistes que se
situent les perspectives de recherche de
l’équipe LPTC. Notre volonté est de continuer
à développer des approches interdisciplinaires
pour couvrir l’ensemble du continuum depuis
la présence jusqu’aux effets des contaminants
chimiques organiques. Des méthodologies
originales seront développées pour rechercher
et caractériser ces polluants (qui sont souvent à
l’état de traces) et étudier leur distribution
(spéciation) environnementale. Nous
étudierons également les phénomènes
biotiques et abiotiques qui conditionnent la
présence et la toxicité des contaminants
chimiques dans l’environnement. Un des défis
dans ce domaine résidera notamment dans la
prise en compte des produits de dégradation/
transformation (métabolites, photoproduits,
…). Une partie de nos travaux se
focalisera sur les processus avec l’étude de la
réactivité des polluants en phases gazeuse et
liquide, mais également en phase hétérogène à
l’interface gaz-particule. Une autre partie de
nos travaux sera axée sur la modélisation
moléculaire et sur l’étude des relations
structures-activités. Nous étudierons enfin les
mécanismes qui conditionnent la toxicité des
polluants chimiques tout au long du cycle de
vie des espèces et à différents niveaux
d’organisation biologique d’espèces modèles.
Nos travaux viseront à améliorer la prise en
compte des effets des mélanges à faibles doses
correspondant à une exposition chronique
continue et diffuse. Notre projet scientifique
pour les quatre prochaines années s’articule par
conséquent autour de trois grands axes
positionnés dans la thématique
« Ecotoxicologie » de l’UMR EPOC :
1. Sources et présence des polluants
organiques ;
2. Interactions polluants organiques–
milieux ;
3. Effets toxiques à différents stades de
développement et à différents niveaux
d’organisation biologique.
Au-delà de ces trois axes thématiques, trois
actions transverses structurent notre activité de
recherche :
1. Développements d’outils analytiques,
2. Instrumentation – Spectrométrie de masse,
3. Modélisation.
Ces activités se retrouvent dans l’ensemble des
axes et des actions associées. Elles permettent
de développer les outils qui seront utilisés pour
la résolution de nos questions de recherche.
Nos recherches s’inscrivent dans les priorités
définies tant au niveau national
qu’international. Les prospectives du FP7, du
GTN Environnement, de la DGRI comme
celles de différents instituts de recherche
fondamentale ou appliquée (INSU, InEE, InC,
INERIS, IRD, CEMAGREF, INRA,
AFSSET..) pointent en effet du doigt la
nécessité de progresser fortement sur la
connaissance et la prise en compte de la
contamination chimique organique (ces
dernières années ayant vu l’émergence
notamment des études sur les perturbateurs
endocriniens et les composés
pharmaceutiques). Nos problématiques de
recherche trouvent parfaitement leur place
dans les programmes Ec2CO, SIC, ANR CEP,
ANR ECOTECH, ANR CES, … ainsi que
dans les appels d’offre européens. Les
créations du GDR EXECO (EXposition aux
contaminants chimiques et effets
Ecocotoxicologiques le long du COntinuum
milieu continental-milieu côtier, co-porté par le
32

LPTC et IFREMER), du programme Franco-
Canadien GAGILAU (Garonne, Gironde, St
Laurent) et du GIS COCHISE (COntaminants
CHImiques, Surveillance et Ecotoxicologie
marines) renforceront encore ce
positionnement. La prise en compte des
métaux est clairement complémentaire de celle
des contaminants organiques. Il s’agit là d’une
des motivations du rapprochement du LPTC et
d’EPOC que de pouvoir compléter l’approche
organique par l’étude des espèces inorganiques
que mènent les équipes « Ecotoxicologie
Aquatique » et « Transfert et Géochimie des
Métaux». Il est par ailleurs essentiel d’associer
à l’étude de la contamination chimique, celle
des paramètres environnementaux. Cette
démarche intégrée constitue une autre
motivation de la fusion LPTC/EPOC qui
devrait permettre d’enrichir notre appréhension
de la contamination chimique par les
approches de l’équipe ECOBIOC qui
s’intéresse aux fonctionnements des
écosystèmes aquatiques. Dans l’optique
d’appréhender les changements globaux
comme la pollution et l’évolution climatique
ainsi que leurs impacts, il est en effet essentiel
de coupler l’étude des facteurs anthropiques
comme la contamination chimique à celle des
facteurs naturels.
AXE 1 : SOURCES ET PRESENCE DES
POLLUANTS ORGANIQUES
Responsable : H. Budzinski
Une meilleure caractérisation des impacts
sanitaires et environnementaux liés à la
présence des composés organiques passe
nécessairement par une meilleure connaissance
de leurs cycles biogéochimiques. Dans cette
optique, il est important d'approfondir la
connaissance des sources elles-mêmes, des
voies d’introduction et d’émission des
composés, et de qualifier et quantifier la
présence des polluants chimiques organiques
dans l’Environnement. Ces connaissances
constituent les bases fondamentales qui
permettront de mieux caractériser l’exposition
des organismes à ces composés et in-fine les
effets induits et reliés à cette contamination.
ACTION 1.1 : DEVELOPPEMENTS
ANALYTIQUES
Afin d’appréhender l’ensemble du continuum
de contamination, des points sources aux
milieux où les concentrations sont les moins
élevées du fait des phénomènes de dilution
après dispersion dans l’environnement, de
nouveaux développements de méthodologies
analytiques ultra-traces, adaptées à la
complexité des différentes matrices et aux
différents domaines de concentration (entre le
µg/L et le pg/L), seront nécessaires. Des
méthodes d’analyse dites ultra-traces (ppt) et
de type « multi-résidus » seront mises en place
puisque la pollution liée aux contaminants
organiques est de fait multi-composés, multiclasses,
et multi-matrices. Les développements
porteront tant sur la phase de préparation ellemême
(extraction/reconcentration/purification)
que sur la phase d’analyse (méthodes de
spectrométrie de masse en tandem ou de haute
résolution). Dans de nombreux cas, les niveaux
de concentrations pertinents pour l’étude du
comportement de ces composés sont inférieurs
au ng/L car ce sont des niveaux à partir
desquels apparaissent des effets toxiques (cas
des hormones par exemple). Notre recherche
portera sur des contaminants d’intérêt majeur
comme les composés pharmaceutiques, les
produits de soin corporel (contaminants
d’origine domestique), les détergents et
désinfectants (utilisés en très grande quantité),
les perturbateurs endocriniens ; mais aussi des
contaminants plus classiques pour lesquels il
est toujours nécessaire d’améliorer nos
connaissances comme les pesticides, les
hydrocarbures, les PCB (PolyChloro-
Biphényles) et PBDE (PolyBromo-
DiphénylEthers). Nous continuerons également
à développer des recherches sur les composés
organiques volatils tant dans les domaines
atmosphériques qu’aquatiques mais avec des
nouvelles approches. En raison de
méthodologies non maîtrisées, ces composés
n’ont été que peu étudiés dans le compartiment
aquatique alors même qu’ils peuvent avoir un
impact toxicologique (cas des BTEX
(Benzène, Toluène, Ethyl-benzène, Xylène)
cancérigènes, des solvants chlorés ou encore
des produits de chloration générés lors des
traitements de l’eau). Avec l’amélioration des
techniques de préparation de l’échantillon et
plus particulièrement des méthodes intégrant
l’échantillonnage, l’extraction et l’analyse
33

(comme les méthodes SPME - Solid Phase
Micro Extraction - et SBSE - Stir Bar Sorptive
Extraction), il devient maintenant possible
d’étudier ces polluants chimiques de manière
pertinente et ainsi de renseigner leur risque
écotoxicologique et/ou sanitaire. Des
développements instrumentaux et
méthodologiques, permettant d’appréhender
leur distribution (tant moléculaire
qu’environnementale) qui conditionne les
échanges et les transferts, seront mis en place
pour l’ensemble de ces composés : application
des échantillonneurs passifs dans le cas des
pesticides dans l’air ; échantillonneurs passifs
pour le milieu aquatique ; prélèvements
atmosphériques bas et haut débits, couplés ou
non à la spectrométrie de masse isotopique ou
à temps de vol pour les hydrocarbures volatils ;
méthodologies multi-résidus et multi-matrices
dans le domaine ultra-traces ; nouvelles
méthodologies pour l’analyse des composés
très hydrophiles et des contaminants chimiques
organiques de hauts poids moléculaires.
ACTION 1.2 : DEVELOPPEMENTS
D’ECHANTILLONNEURS PASSIFS
Le développement des échantillonneurs passifs
constituera une de nos priorités de recherche.
Ces dispositifs permettent une mesure de la
pollution chimique intégrée spatialement et
temporellement. Le nombre de composés à
analyser, d’écosystèmes et de sources
d’émission ou d’introduction à contrôler étant
très conséquent (voire dépassant les capacités
actuelles de suivi), un enjeu consiste
clairement à développer de nouvelles
méthodologies d’analyse :
1. adaptées aux spécificités des milieux
aquatiques et atmosphériques (milieu dilué,
variabilité spatiale, variabilité temporelle,
difficulté d’accès, mélange complexe, …),
2. répondant à une logique d’intégration,
d’augmentation de fréquence, et de
diminution de coût.
De nouveaux systèmes d’échantillonnage
intégratif seront développés afin de disposer de
méthodologies analytiques compatibles avec
les exigences en termes de rapidité, de limites
de quantification, de nombre d’échantillons
traités et de fiabilité de l’analyse
environnementale moderne de « screening ».
ACTION 1.3 : DEVELOPPEMENTS DE
METHODOLOGIES BIO-ANALYTIQUES
En raison du nombre important de
contaminants chimiques potentiels, il est
impossible d’être exhaustif. Il est de plus
difficile d’établir le lien entre présence de
composés et effets toxiques. Depuis plusieurs
années, des méthodes alternatives basées sur
des bio-tests ont été développées. Il s’agit des
méthodes dites bio-analytiques ou EDA (Effect
Directed Analysis). Les tests biologiques
permettent de détecter la présence de composés
toxiques présents et peuvent dans certains cas
renseigner sur le mode d’action et la nature de
leurs effets toxiques. Nous nous proposons de
mettre en œuvre une approche EDA pour la
mise en évidence des composés toxiques
présents dans les échantillons environnementaux.
En effet, il est maintenant devenu
indispensable de s’orienter vers des méthodes
de « screening » moléculaires non dirigées en
raison de l’existence d‘apports en
contaminants dont ni la structure ni les effets
ne sont connus (e.g., pesticides, produits
pharmaceutiques, détergents, cosmétiques,
produits naturels rejetés par l'homme... mais
aussi les molécules résultant de la
transformation des composés initiaux). Comme
nous l’avons déjà indiqué, une des difficultés
rencontrées pour une évaluation correcte de
l’état de contamination des systèmes
écologiques provient du caractère multicontaminants
(multi-sources, multi-classes
chimiques). Pour pallier les limites de
l’analyse chimique (spécificité, coût), il
apparaît intéressant de se tourner vers une
évaluation biologique des effets potentiels, en
utilisant des bio-tests. Certains bio-tests sont
spécifiques de mécanismes d’action alors que
d’autres sont plus globaux en termes d’effets
toxiques et donc plus intégrateurs. De manière
générale, ces tests peuvent s’avérer plus
rapides, plus économiques et surtout plus
pertinents pour évaluer la toxicité potentielle
globale d’un ensemble de substances présentes
dans l’environnement que des analyses
chimiques seules. De plus, les bio-tests sont
particulièrement adaptés à la recherche des
fractions toxiques obtenues à partir des extraits
chimiques totaux et donc à la recherche et à
l’identification des principales substances
chimiques contribuant aux effets toxiques.
Nous chercherons à développer une approche
combinant analyses chimiques et bio-tests de
34

toxicité (cf. axe 3) dans une logique de suivi de
la qualité chimique de l’environnement (en
mettant un accent particulier sur le milieu
aquatique dont la qualité est un enjeu majeur
pour les ressources vivantes).
AXE 2 : INTERACTIONS POLLUANTS
ORGANIQUES – MILIEUX
Responsable : E. Villenave
La majorité des polluants organiques présents
dans l’eau et l’atmosphère sont réactifs. Leurs
interactions avec le milieu ne sont encore pas
bien comprises, notamment leurs mécanismes
de formation, transformation et de transfert à
toutes les échelles. Nous continuerons par
conséquent à approfondir l'étude des processus
abiotiques (complexation, photo-oxydation,
sédimentation, oxydation radicalaire...) qui
conditionnent la présence des polluants
chimiques dans l'Environnement. Dans les
écosystèmes naturels, la réactivité des
composés organiques est contrôlée par un
grand nombre de paramètres physiques et
chimiques mais également biologiques. Plus
particulièrement, les interactions entre ces
composés et les autres constituants chimiques
présents dans le milieu conditionnent leur
spéciation et donc leur biodisponibilité voire
leur toxicité vis-à-vis du biota, mais aussi, à
une autre échelle, leurs impacts sur les
changements globaux.
ACTION 2.1 : ETUDE DE LA
TRANSFORMATION DES POLLUANTS
CHIMIQUES
Il est essentiel d’étudier l’ensemble des
processus physico-chimiques qui définissent le
temps de vie des différents composés. Il s’agira
de les inclure in-fine dans l’évaluation de la
qualité globale de l’Environnement car, s’ils
sont certes responsables de la disparition de
certaines espèces chimiques, ils peuvent
également contribuer à l’apparition d’autres
produits susceptibles de se révéler plus
toxiques ou avoir plus d’impacts indirects que
les composés parents. Considérant déjà le
nombre important de composés à prendre en
compte dans les problématiques
environnementales, un challenge considérable
consiste à s’intéresser de manière plus
systématique aux produits de transformation.
Deux points essentiels seront étudiés :
1. l’oxydation atmosphérique des composés
organiques en phase gazeuse et à
l’interface gaz-surface,
2. la photo-transformation des contaminants
chimiques organiques en milieu aquatique.
Dans les deux cas, un des points forts de notre
démarche consistera à proposer un couplage
laboratoire/terrain en développant des
méthodologies expérimentales originales
(réacteurs, expérimentations, cinétique et
spéciation) dont les résultats seront confrontés
à la réalité du terrain.
Ainsi, afin de mieux comprendre l’ensemble
des étapes décrivant l’émission, le transport, le
devenir et les impacts locaux ou globaux des
polluants organiques dans l’environnement, il
est nécessaire d’appréhender le compartiment
atmosphérique qui est notamment le siège de
processus de dégradations chimiques ou
photochimiques complexes, que ce soit en
phase gazeuse ou en phase condensée
(aérosols, nuages ...). Nous poursuivrons donc
l’étude de la réactivité homogène et hétérogène
(détermination de paramètres cinétiques et
mécanistiques) des grandes classes de
polluants atmosphériques menée depuis
plusieurs années au travers de projets de
recherche et de collaborations nationales et
internationales. Ces travaux permettront
notamment de proposer de nouvelles relations
du type structure-réactivité et par là même
d’améliorer la qualité des modèles de la chimie
atmosphérique ; dans un souci soit d’une
meilleure appréhension de la qualité de l’air,
soit d’une meilleure connaissance des impacts
sur les changements climatiques (vieillissement
de l’aérosol organique). Le point fort
de ce type d’activité repose sur la
complémentarité des approches cinétiques,
analytiques, théoriques (modélisation) et
toxicologiques, réunies au sein de notre équipe.
Nos perspectives portent sur deux points
majeurs actuellement dans la recherche en
chimie atmosphérique, en relation avec la
détermination des sources de polluants, et
l’échantillonnage nécessaire à la compréhension
des processus radicalaires. Nous
continuerons d’abord l’étude des processus
d’oxydation par OH, Cl ou l’ozone des
composés organiques volatils complexes en
réacteur et chambres de simulation (application
35

aux composés mono-aromatiques méthylsubstitués
et aux composés mono-terpéniques
avec exploration de nouvelles voies
réactionnelles à l’aide d’approches
expérimentales originales). Nous
développerons également l’étude des processus
hétérogènes en présence d’oxydants
radicalaires, non plus seulement à l’obscurité
mais en présence de lumière (application à la
formation des aérosols organiques secondaires
issus de l’oxydation des composés
aromatiques, au vieillissement photochimique
des particules de suie issues de la combustion
de carburants multiples, apport de l’approche
isotopique moléculaire pour le traçage des
sources des composés particulaires, formation
de composés particulaires substitués
potentiellement toxiques ou génotoxiques).
Nous étudierons parallèlement la réactivité,
sous l’action de la lumière, des contaminants
chimiques organiques dans le milieu aquatique.
Compte tenu de la grande variété des structures
chimiques des contaminants et des
compositions des milieux récepteurs, les études
systématiques seront ciblées sur les
contaminants dont la présence à forte
concentration dans le milieu naturel et/ou
l’écotoxicité élevée sont reconnues. L’étude
des phénomènes de phototransformation est
pertinente pour de nombreux composés à usage
pharmaceutique reconnus notamment pour
avoir des propriétés photosensibilisantes, donc
une photochimie accessible par irradiation
solaire. Les phénomènes de dégradation des
micropolluants organiques peuvent également
être induits par absorption de la lumière par la
Matière Organique Dissoute (MOD). Ce
processus produit des entités réactives qui
réagissent avec les contaminants et les
dégradent. Nous nous intéresserons
particulièrement aux radicaux hydroxyles et
oxygène singulet qui sont majoritaires dans le
compartiment aquatique. L’étude des
phénomènes de (photo)dégradation des
contaminants présents dans les eaux
superficielles et des modifications d’effets
toxiques lors de la (photo)transformation est
tout à fait pertinente compte tenu des risques
potentiels qui y sont associés (e. g. la
photodégradation de dérivés de type
benzophénone -utilisés comme écran solairegénère
des photo-produits hydroxylés ayant
une activité de perturbateurs endocriniens ;
certains photo-produits du furosémide (agent
diurétique) montrent un potentiel mutagène).
D’autres entités réactives, formées à partir des
constituants des eaux, interviennent dans les
processus de dégradation des micropolluants
(radicaux carbonate et chlorure notamment en
milieu marin). Devant le manque de données
concernant la réactivité en solution aqueuse de
ces radicaux, nous proposons d’étudier cette
réactivité à partir de polluants modèles tels que
les amines ou les pesticides de type
phénylurée.
ACTION 2.2 : ETUDE DES INTERACTIONS
MATIERE ORGANIQUE - CONTAMINANTS
ORGANIQUES
La matière organique dissoute/colloïdale
(MOD au sens large) interagit avec les
contaminants, et conditionne de ce fait leur
transport, leur spéciation et donc leur
biodisponibilité voire leur toxicité. Bien que
reconnues indiscutables, ces interactions
restent très peu documentées. La
caractérisation précise de ce matériel complexe
est nécessaire afin d’approfondir son rôle dans
le transfert des contaminants, leur
bioaccumulation et leur impact toxique vis-àvis
des organismes. Différentes approches sont
envisagées pour étudier le rôle joué par la
MOD sur la distribution des contaminants dans
l’environnement aquatique. L’isolement, la
caractérisation et l’étude des propriétés de la
MOD constituent encore un défi tant au niveau
national qu’international. Bien que la
fluorescence soit une technique de choix pour
la distinction de masses d’eaux d’origines
différentes et la différentiation des composants
organiques macromoléculaires, elle ne permet
pas une caractérisation moléculaire précise des
différents constituants de la MOD. L’un des
obstacles majeurs consiste, dans un contexte
souvent compliqué par de fortes salinités, une
forte dilution et un environnement chimique
complexe, à isoler des quantités suffisantes de
MOD. Le travail de développement des
techniques de concentration et d’extraction de
la MOD sera par conséquent poursuivi
notamment pour des eaux à forte salinité
(salinité > 30) en finalisant l’optimisation du
couplage électrodialyse (pour dessaler les
eaux) / osmose inverse (pour concentrer la
MOD). Le développement d’un système de
fractionnement par flux/force avec flux
asymétrique (Asymmetric-Flow Field-Flow
Fractionation – AF4) offre de nouvelles
36

perspectives dans la caractérisation et la
séparation des biopolymères et des
macromolécules colloïdales. Cette technique,
très complémentaire des méthodes de
fractionnement par la taille, déjà utilisée dans
l’équipe, devrait permettre d’obtenir une
caractérisation plus fine de la MOD mais aussi
de ses interactions avec les contaminants,
notamment en utilisant un couplage AF4 /
spectrométrie de masse.
AXE 3 : MECANISMES D’ACTION ET
EFFETS TOXIQUES DES POLLUANTS
ORGANIQUES A DIFFERENTS NI-
VEAUX D’INTEGRATION BIOLOGIQUE
ET SUR DIFFERENTS STADES DE VIE
D’ESPECES AQUATIQUES MODELES
La réglementation européenne en matière de
protection de la santé humaine et de
l’environnement s’est considérablement
renforcée ces dernières années (Directive
Biocide, Directive Cadre sur l’Eau,
réglementation REACH, Stratégie pour le
Milieu Marin). Ces nouvelles législations
imposent notamment de :
1. produire des connaissances sur le devenir
dans l’environnement, les mécanismes
d’action et les effets biologiques des
nouvelles substances chimiques et,
2. développer des outils fiables, sensibles et
pertinents pour l’analyse prédictive ou
rétrospective des risques engendrés par ces
substances.
Les nouvelles dispositions européennes sur
l’expérimentation animale recommandent par
ailleurs le recours à des méthodes alternatives
telles que des tests in vitro, des tests in vivo sur
embryons et larves de poissons et d’invertébrés
et l’approche in silico pour l’évaluation de la
toxicité des nouvelles substances chimiques.
ACTION 3.1 : APPROCHE IN SILICO
Dans cette optique, le potentiel cancérogène
d’une substance mutagène peut être évalué en
modélisant sa capacité à être métabolisée par
les cytochromes P450 (CYP450). Cet aspect
sera notamment étudié avec les Hydrocarbures
Aromatiques Polycycliques (HAP). Nous
utiliserons les méthodes de simulation
moléculaire (dynamique moléculaire, arrimage
moléculaire et outils connexes) afin de
caractériser les différences d’activation
observées expérimentalement pour différents
HAP vis-à-vis de plusieurs familles de
CYP450 (notamment 1A1 et 1A2). La
modélisation moléculaire peut en effet
permettre de mesurer les affinités de liaison
HAP-AhR-CYP450 et ainsi d’élaborer des
relations de type structure – «activité de
métabolisation». En outre, les mécanismes
moléculaires de la mutagenèse pourraient être
appréhendés in silico au moyen de la
dynamique moléculaire. Ce type d’analyse
devrait permettre de mettre en évidence et de
caractériser les distorsions structurales de la
double hélice d’ADN au voisinage des lésions
primaires de l’ADN. Ces déformations seront
mises en relation avec des résultats
expérimentaux (tels que la mesure de l’activité
de réparation par excision de nucléotides ou de
bases, la mise en évidence de la nature des
lésions induites, …) issus de la littérature ou
obtenus au laboratoire sur modèles cellulaires.
Nous étudierons in silico les mécanismes
d’activation des récepteurs du type tyrosinekinase
(récepteur du facteur de croissance
épidermique) impliqués dans de nombreux
cancers sporadiques ou chimio-induits. Nous
proposons enfin d’utiliser les méthodes non
linéaires (e.g. réseaux de neurones artificiels),
pouvant prendre en compte simultanément des
variables de nature différentes, afin de
développer des relations du type structureactivité
quantitatives. Un des objectifs consiste
à améliorer l'adaptation des cartes autoorganisatrices
et de mettre au point des outils
directement utilisables (par exemple par la
création de packages pour le logiciel R).
ACTION 3.2 : DEVELOPPEMENTS DE BIO-
TESTS
Afin de compléter la liste des tests in vitro de
toxicité existants, nous proposons de
développer des tests de cytotoxicité, de
génotoxicité (test des comètes, test
micronoyaux) et de perturbations
endocriniennes (dosage de la vitellogénine et
des hormones stéroïdiennes) sur différents
types de lignées cellulaires et de cultures
primaires obtenues à partir de poissons et
d’autres espèces aquatiques. Ces tests
permettront non seulement d’évaluer la toxicité
de composés chimiques ou d’extrait
environnementaux mais également d’étudier le
37

mode d’action et les effets des polluants sur
des modèles cellulaires non mammifères (cf.
axe 1). Ils sont susceptibles à terme de
constituer des alternatives à l’expérimentation
animale. Dans cette optique, nous proposons
également de développer des tests
d’écotoxicité sur des embryons et des prolarves
de poissons. Des tests de ce type
existent déjà pour l’évaluation de la toxicité de
polluants hydrophiles ou d’effluents liquides
(OCDE TG210 et TG212). En revanche, aucun
test satisfaisant n’existe à l’heure actuelle pour
l’évaluation de l’écotoxicité des substances
hydrophobes ou des matrices sédimentaires.
Nous proposons de développer un test embryolarvaire
sur un poisson modèle ainsi que sur
une ou deux espèces autochtones. Nous
privilégierons un mode d’exposition réaliste
d’un point de vue environnemental (sédimentcontact)
et une approche multi-marqueurs
permettant de prendre en compte les effets
induits à différents niveaux d’organisation
biologique et ceci pour des molécules toxiques
à modes d’action variés. Outre le
développement et la validation du protocole de
contamination du sédiment et d’exposition des
embryons, nous définirons les marqueurs
d’effets les plus sensibles et les plus pertinents
et optimiserons leur mesure sur les embryons
et/ou les larves.
Nous souhaitons mettre à profit ces tests
embryo-larvaires pour l’étude des polluants
organiques tels que les HAP, les pesticides, les
alkyl-phénols ou les substances pharmaceutiques,
en relation avec les thèmes
développés dans les axes 1 et 2. Ils doivent
également permettre d’évaluer et de
caractériser les effets de polluants en mélange
et d’étudier les effets matriciels sur la
biodisponibilité et la toxicité de ces substances.
Nous développerons pour cela des méthodes
d’analyse :
1. des polluants ou de leurs métabolites dans
les embryons et larves ainsi que,
2. des marqueurs d’effets pour différentes
fonctions et à différents niveaux
d’intégration biologique.
Les modes d’actions des polluants pouvant être
très variés, nous développerons une approche
de type protéomique pour une caractérisation
plus fine et précise des effets à l’échelle
moléculaire. Par ailleurs, des analyses par RT-
PCR quantitative et hybridation in situ seront
également utilisées pour suivre l’expression de
gènes impliqués dans des processus
biologiques variés (biotransformation et
élimination des toxiques, réparation des lésions
de l’ADN, stress oxydatif, métabolisme
général, stéroïdogénèse).
ACTION 3.3 : ETUDE DES EFFETS AU
NIVEAU DU CYCLE DE VIE
Un autre projet de recherche concernera la
caractérisation des effets des polluants
organiques sur l’ensemble du cycle de vie de
quelques espèces modèles (medaka japonais,
poisson zèbre, truite, huître creuse) en
associant des mesures d’effets du niveau
moléculaire jusqu’au niveau physiologique.
Les principales fonctions biologiques
(croissance, reproduction, intégrité génétique,
immunité …) seront examinées afin de dresser
un diagnostic fiable de l’état de santé des
animaux exposés. L’objectif ultime consiste
d’une part à déterminer les stades de
développement les plus vulnérables et d’autre
part à modéliser les conséquences de cette
exposition à l’échelle d’une population en
utilisant notamment des modèles d’allocation
d’énergie (DEB) ou de dynamique des
populations (individu centré). Ces recherches
seront menées en collaboration avec
IFREMER (Dr. V. Loizeau).
Enfin, dans le but de prédire les conséquences
des changements hydro-climatiques futurs à
l’échelle locale ou planétaire sur l’état de santé
des espèces aquatiques, il nous paraît essentiel
d’étudier les effets combinés de la pollution et
de l’augmentation de température et/ou de la
réduction des teneurs en O 2 dissous dans les
eaux sur les espèces aquatiques et plus
particulièrement sur les espèces piscicoles dont
tout ou partie du développement embryonnaire
est réalisé au contact du sédiment. Dans un
premier temps, ces travaux seront conduits sur
une ou deux espèces modèles dans les
conditions contrôlées de laboratoire. Ils seront
ensuite étendus à des espèces autochtones
(salmonidés, esturgeon) au sein d’un ou deux
sites ateliers.
38

ECOTOXICOLOGIE AQUATIQUE : EA
Responsable : Jean-Charles MASSABUAU
AXE 1
Impact des métaux traces
sur les organismes aquatiques
Magalie Baudrimont
AXE 2
Santé de l’environnement / santé
humaine
Jean-Paul Bourdineaud
AXE 3
Impact des algues toxiques
sur les bivalves
Damien Tran
ECOBIOC
Parasitologie,
bactériologie
LPTC
- Contamination métallique et
résilience
- Réponses adaptatives en
conditions multi-stress
- Interactions nanoparticulesorganismes
et santé
- Approche biomoléculaire des
impacts en écotoxicologie
- Analyse du comportement de
bivalves in-situ: la valvométrie
HFNI
Modélisation statistique
- Impact sur l’huitre et la
palourde: du comportement insitu
aux gènes clocks
Contaminants
organiques
TGM
Géochimie des métaux
traces
Magalie Baudrimont
Agnès Feurtet-Mazel
Patrice Gonzalez
Alexia Legeay
Régine Maury-Brachet
Jean-Paul Bourdineaud
Michel Le Hénaff
Jean-Charles Massabuau
Gilles Durrieu,
Doctorant: Mohamedou Sow
Damien Tran
Doctorants: Sébastien Cambier, Ika
Paul-Pont, Sophie Renault, Adeline
Arini, Simona Al Kaddissi
Doctorants: Nicolas Orieu
Doctorant: Audrey Mat
Personnel technique: Pierre Ciret, Véronique Duflo, Bruno Etcheverria, Nathalie Mesmer-Dudons
L’équipe Ecotoxicologie Aquatique étudie
l’impact des contaminants dans les milieux
aquatiques (eaux douces et eaux marines) et les
organismes associés. Notre cœur de métier est
la biologie et nous sommes initialement
spécialisés dans l’impact des métaux traces
bien que notre approche se soit élargie dans un
contexte multi-stress. Nous étudions les
fonctionnements et les dysfonctionnements à
des concentrations faibles mais « chroniques »
de contaminants. Une des spécificités de notre
équipe dans le paysage national et
international, est l’interdisciplinarité qui mêle
des spécialistes de l’écotoxicologie, l’écophysiologie
(physiologie respiratoire), la
biochimie, la biologie moléculaire et les
mathématiques appliquées. Ces spécialités
majeures sont soutenues par quatre plateaux
techniques en analyse chimique métaux,
anatomie morpho-fonctionnelle (microscopie
39
optique et électronique), électronique -
informatique et zootechnique.
L’ensemble nous permet d’étudier les
processus envisagés du terrain, proche ou
lointain (Guyane ou Nouvelle Calédonie), au
laboratoire en mettant en œuvre des outils rares
au plan national (dispositifs expérimentaux
pour plans d’analyse multifactoriel) ou bien
même unique au niveau national et
international (valvométrie HFNI : Haute
Fréquence, Non Invasive).
Alors que les chimistes du LPTC rejoignent
l’UMR, et dans le but d’augmenter la visibilité
de nos spécificités réciproques, nous avons
choisi de faire évoluer pour ce nouveau
quadriennal la structuration de l’ancienne
équipe GEMA à l’intérieur de la nouvelle
thématique ECOTOXICOLOGIE. A côté du
LPTC, spécialisé en chimie organique, on
trouve maintenant l’équipe TGM (ex

composante Talence de l’équipe GEMA),
spécialisée en chimie des métaux traces et
l’équipe « Ecotoxicologie Aquatique » (ex
composante Arcachon de l’équipe GEMA),
spécialisée en biologie. Ce renforcement et
cette restructuration soulignent l’importance
croissante de notre domaine de recherche qui
est particulièrement bien identifié par les
tutelles et les gouvernements. Nos recherches
s’inscrivent dans les problématiques
scientifiques des programmes nationaux et
internationaux (cf. Grenelle de l’environnement
et SNRI Sciences de l’Environnement,
document de prospectives de l’INSU, et textes
fondateurs de l’INEE). Notre volonté est de
continuer à contribuer significativement à
l'évolution des démarches d'évaluation et de
gestion des risques écotoxicologiques, enjeux
sociétaux particulièrement forts. Nos
recherches seront financées par des
programmes en cours ou débutant dans les
deux prochaines années, ainsi que par des
réponses aux appels d’offre nationaux et
internationaux.
Nous sommes totalement partie prenante de la
restructuration de l’écotoxicologie nationale
(perspective d’un pôle d’excellence «Grand
Sud-Ouest», GSO ; GIS Ecotoxicologie et
restructuration de l’enseignement à Bordeaux)
où notre équipe apporte toute sa spécificité. Au
niveau international, les collaborations passées
se renforcent (Canada, Vietnam, Nouvelle-
Calédonie) et de nouvelles possibilités, en
partie sous-tendues par nos développements
technologiques, apparaissent (Norvège,
Canada, USA).
Notre démarche est composée de trois axes
principaux et d’un axe transverse. L’impact
des contaminations métalliques sur les
organismes aquatiques, axe 1, s’inscrit dans
la continuité des travaux de l’équipe.
L’écosystème aquatique y est envisagé dans sa
globalité, depuis la cellule jusqu’aux
populations en passant par l’organisme et en
incluant la problématique multi-stress. Les
outils les plus pertinents y sont utilisés comme
l’approche génétique pour détecter les impacts
les plus précoces. L’axe 2, santé de
l’environnement/santé humaine repose sur
une approche fondamentale des mécanismes de
toxicité et de détection d’effets précoces. On y
développe une approche moléculariste des
mécanismes de toxicité et de protection de la
cellule et des technologies nouvelles (valvométrie
HFNI) utilisées pour obtenir en temps
réel des informations sur la santé de
l’environnement. Nous y étudions enfin de
nouvelles approches substitutives aux antibiotiques
pour réduire la contamination des
milieux aquacoles. L’étude de l’impact des
algues toxiques, axe 3, problématique en plein
essor, constitue également une thématique
nouvelle au sein de l’équipe. Nous développerons
enfin un axe transverse «Modélisation
statistique» qui correspond à la mise au point
de nouveaux outils pour le traitement des
grandes quantités de données issues d’analyses
génétiques (SAGE, puces à ADN) et de suivis
éthologiques automatisés en valvométrie.
AXE 1 : IMPACT DES CONTAMINA-
TIONS METALLIQUES SUR LES
ORGANISMES AQUATIQUES
Responsable : M. Baudrimont
Il s’agit ici d’étudier les mécanismes de
contamination et d’impacts de polluants
métalliques à différents niveaux d’organisation
biologique (depuis le niveau moléculaire
jusqu’aux biocénoses). Les approches seront
développées :
1. sur le terrain et en conditions contrôlées de
laboratoire,
2. dans le respect des niveaux d’exposition
prévalant in situ,
3. de façon à expliciter les processus mis en
jeu en milieu naturel.
Nous orienterons nos recherches vers une prise
en compte croissante des différents stress
(agents pathogènes, conditions hypoxiques,
polluants organiques, efflorescences toxiques,
etc.) simultanément rencontrés dans le milieu
naturel. Ces situations de type «multistress»
seront étudiées en collaboration avec d’autres
équipes de l’UMR (dont ECOBIOC et LPTC)
ou bien d’autres organismes. Enfin, l’essor
croissant des nanotechnologies nous amène à
aborder l’impact toxique des nanoparticules
métalliques (polluants émergents) sur les
organismes aquatiques.
Nos modèles biologiques occupent des maillons
trophiques et des biotopes diversifiés qui
leur confèrent des intérêts écologiques
complémentaires. Les communautés diatomiques
périphytiques sont composées d’espèces
ubiquistes, responsables d’une grande part de
la production primaire, et présentent des
40

niveaux de tolérance variables vis à vis des
facteurs environnementaux et de
contamination. Les bivalves filtreurs dulçaquicoles
et marins constituent d’excellents
indicateurs de la pollution métallique des
systèmes aquatiques de par :
1. leurs capacités de bioaccumulation
importantes,
2. leur caractère sédentaire,
3. leur résistance aux changements de
l’environnement.
Les crustacés et les poissons constituent des
niveaux d’organisation supérieurs présentant
différents régimes alimentaires. Tour à tour
proies et prédateurs, ils jouent un rôle clé dans
la contamination des réseaux trophiques, la
modification de leur structure et in-fine de leur
fonctionnement.
ACTION 1.1 : MECANISMES DE CONTAMI-
NATION PAR LES METAUX ET IMPACTS
TOXIQUES
L’impact des contaminations métalliques est
abordé à différents niveaux d’organisation
biologique, en alliant des approches
moléculaires en laboratoire, sur des espèces
modèles comme le poisson zèbre Danio rerio,
et des approches écosystémiques telles que
celles développées dans le cadre de
programmes comme «Mercure en Guyane –
Phases I et II».
En laboratoire, nos travaux sur le poisson zèbre
constitueront la suite logique des résultats
obtenus lors des analyses SAGE que nous
avons conduites sur l’impact des
contaminations par le Cd et le MeHg. Une
dizaine de gènes dont le rôle est encore
inconnu voient leur expression fortement
modulée lors d’expositions à ces deux métaux.
Nous allons maintenant caractériser le rôle des
protéines codées par ces gènes. Cette démarche
s’appuiera sur des approches couplées de
génomique, de protéomique et d’écotoxicologie
afin de mieux comprendre les
mécanismes moléculaires mis en jeu.
Des études plus spécifiques seront menées afin
de comparer la réponse de l’écrevisse après
exposition à un polluant métallique (Cd) ou un
polluant radiologique ( 238 U et 233 U). Nous
identifierons et comparerons les cibles
cellulaires responsables d’un même effet après
exposition à des concentrations comparables
d’U et de Cd. Une approche résolument
pluridisciplinaire nous permettra d’évaluer la
bioaccumulation, la distribution tissulaire/
cellulaire, les effets sur la physiologie
respiratoire et cardiaque, le métabolisme et
l’expression de plusieurs gènes d’intérêt des
stress métallique et oxydant.
Des études portant sur la sensibilité aux
pollutions métalliques d’une espèce menacée
de disparition en Europe de l’Ouest, la moule
perlière Margaritifera margaritifera seront
également développées. Seules quelques
populations reliques subsistent en France,
notamment dans la Dronne (Dordogne) où
elles sont susceptibles d’être affectées par des
pollutions métalliques. Compte-tenu de
l’intérêt écologique et patrimonial majeur de
cette espèce, et de la quasi absence de données
écotoxicologiques la concernant, ces recherches
seront novatrices. Elles nécessiteront
en particulier des développements au niveau
génétique pour cloner et séquencer des gènes
d’intérêt impliqués dans les principales
fonctions métaboliques et de détoxication.
Des approches novatrices seront développées
également sur les biofilms diatomiques de
façon à coupler l’analyse des communautés
avec des études de biologie moléculaire (gènes
cibles à caractériser impliqués dans le
métabolisme mitochondrial, la réponse au
stress oxydatif, la détoxication et la
photosynthèse). Le but est de comprendre
l’impact génétique causé par les contaminations
métalliques induisant des modifications
de composition dans la structure des
communautés.
Nous continuerons à développer l’approche
écosystémique déjà mise en œuvre en Guyane.
L’objectif consiste à mieux comprendre les
transferts de mercure dans l’environnement et
en particulier à préciser l’origine (naturelle ou
anthropique) de cette contamination. Les
processus de transformation seront étudiés en
utilisant les modalités de fractionnement
isotopique du mercure dans différents
compartiments : sédiments, sols, plantes
aquatiques, mollusques d’eau douce, poissons
et, in fine, amérindiens. Des analyses de
traceurs trophiques (δ 15 N et δ 13 C) seront
réalisées sur certains échantillons afin de
pouvoir déterminer avec précision le niveau
trophique des espèces échantillonnées. La
technique d’analyse dite des «Rapports Isotopiques
de Mercure inorganique et organique»,
41

technologie de pointe unique en France,
complètera pour la première fois cette analyse
(financement par un Projet Inter-régional Midi-
Pyrénées & Aquitaine, 2009/2010).
ACTION 1.2 : REMEDIATION ET CAPACITE
DE RESILIENCE DES ECOSYSTEMES
L’objectif consiste à caractériser les cinétiques
de décontamination et les capacités de
récupération des organismes aquatiques
(biofilms diatomiques, bivalves, poissons)
après remédiation d’un site industriel rejetant
originellement du Cd et du Zn (bassin
industriel de Decazeville). Nous étudierons
l’évolution des assemblages interspécifiques
algaux, à partir du couplage entre approches
expérimentales en canaux au laboratoire et
études de terrain. Les réponses aux niveaux
physiologique, biochimique et génétique dans
des conditions naturelles d’exposition seront
analysées sur les modèles bivalves et poissons,
soit à partir de la mise en cage des bivalves
directement in situ, soit à partir
d’expérimentations en laboratoire après
exposition des poissons par les eaux naturelles
du terrain. L’intérêt d’étudier par exemple les
réponses biochimiques de détoxication
(induction des métallothionéines - MTs) et la
quantification de l’expression de plusieurs
gènes impliqués dans différentes fonctions
métaboliques est clairement établi pour
caractériser les atteintes toxiques engendrées.
Le caractère réversible ou irréversible de ces
atteintes sera établi pour mieux comprendre les
processus de résilience des écosystèmes, en
complémentarité avec les études menées sur le
biofilm diatomique (ANR RESYST
2009/2011). Ces travaux se poursuivront dans
le cadre du projet ETIAGE (2010/2013) par la
mise en cage de bivalves filtreurs dans la
Garonne au niveau de l’agglomération
bordelaise.
ACTION 1.3 : REPONSES ADAPTATIVES EN
CONDITIONS «MULTISTRESS»
Les organismes des écosystèmes littoraux,
milieux à forte productivité et diversité
biologique soumis à des activités anthropiques
croissantes, subissent des situations de type
«multistress». Ces dernières années, nous
avons étudié les interactions entre pollution
métallique, contamination bactériologique et
infestation parasitaire chez deux espèces de
bivalves exploités, la coque (Cerastoderma
edule) et la palourde japonaise (Ruditapes
philippinarum). Un nouveau facteur de stress,
la présence d’efflorescences toxiques, sera
abordé chez la palourde. L’originalité est
d’adopter une méthodologie permettant une
approche intégrée des interactions (neutralisme,
synergie ou antagonisme) entre les
facteurs agissant sur les réponses génétique,
cellulaire, immunitaire, physiologique,
comportementale et populationnelle. Par
ailleurs, et dans la continuité de 2 projets en
cours, nous poursuivrons notre étude de l’état
de contamination (organique et inorganique)
de l’huître C. gigas du Bassin d’Arcachon dans
le contexte des difficultés actuelles de
l’ostréiculture (Projets Région OSCAR et
ANR RIPOST, 2009-2012). Chez la palourde
(Projet Liteau, 2009-2012), nous poursuivrons
la caractérisation moléculaire de l’agent
étiologique de la maladie du muscle brun
(collaboration avec ECOBIOC), et nous
déterminerons ses modalités de dispersion.
Dans le prolongement des études déjà menées
sur l’anguille (Anguilla anguilla), nous
développerons des études in situ dans l’estuaire
de la Gironde pour tenir compte à la fois du
caractère de « multipollution » du site (métaux,
HAP, PCBs, pesticides, …) et des hypoxies
transitoires que l’on y rencontre. Nous
chercherons ainsi à confirmer la réalité des
impacts mis en évidence au laboratoire avec le
Cd seul. Sur le terrain, nous prendrons en
compte l’apport trophique (nourriture à partir
de crevettes contaminées naturellement ou
témoins) et la physico-chimie du milieu (T,
salinité, O 2 , pH, MES). Des approches couplées
en conditions simplifiées mais contrôlées
de laboratoire seront également réalisées de
façon à tester les impacts de «cocktails» de
contaminants majeurs préalablement identifiés
in situ. Un second objectif, toujours relatif à
l’étude de l’état de santé de l’anguille,
concerne le développement d’une puce à ADN
spécifique pour détecter et évaluer l’impact
d’une exposition chronique aux polluants. Ce
volet sera développé dans la perspective
d’acquisition de nouvelles connaissances sur
des mécanismes de toxicité prévalant in situ,
par la comparaison de différents estuaires. Il
est pour l’instant envisagé dans le cadre d’une
collaboration Aquitaine-Québec en cours sur la
perchaude (Perca flavescens), qui devrait
s’étendre à l’anguille dans le cadre d’une
comparaison des estuaires de la Gironde et du
St Laurent (projet GAGILAU 2010-2015,
France/Québec).
42

ACTION 1.4 : INTERACTIONS NANO-
PARTICULES/ORGANISMES ET TOXICITE
L’essor de l’utilisation des nanoparticules d’or
(AuNp) pose la question de leur devenir dans
l’environnement en général et dans les
écosystèmes aquatiques en particulier. Nous
avions engagé des travaux concernant
l’interaction et l’impact d‘AuNp fonctionnalisées
(chargées positivement) chez deux
espèces d’eau douce, une algue phytoplanctonique
(Scenedesmus subspicatus) et un
bivalve filtreur (Corbicula fluminea). La
capacité des AuNp à pénétrer les cellules de
ces deux modèles et à y générer des impacts
toxiques a été démontrée. Des travaux se
poursuivent actuellement sur des biofilms
diatomiques naturels de façon à caractériser
l’impact des AuNp sur les diatomées et sur la
capacité de recolonisation du biofilm après
contamination. L’impact de la charge des
nanoparticules (+ ou -) est également abordé.
Au vu de nos résultats, et de la potentialité du
biofilm à être brouté par des maillons
trophiques supérieurs, la question du transfert
potentiel de ces particules le long des chaines
trophiques, et in fine, de leur impact toxique
sur une espèce piscicole menacée telle que
l’anguille européenne sera abordée. Nous
comparerons les impacts toxiques de
nanoparticules de même composition chimique
mais de taille et/ou d’enrobage différents.
Nous développerons également des approches
comparatives des effets engendrés par des
nanoparticules de même taille ou forme, mais
de composition différente, par exemple, par
l’utilisation de nanoparticules de silice, composé
a priori inerte chimiquement, pour ainsi
déconvoluer les impacts liés à des effets
physiques et chimiques. Grâce à la mise au
point de la puce à ADN chez l’anguille, nous
essaierons enfin de caractériser spécifiquement
le patron d’expression des gènes correspondant
à la contamination à différents types de
nanoparticules chez cette espèce.
AXE 2 : SANTE DE L’ENVIRON-
NEMENT/SANTE HUMAINE
Responsable : JP Bourdineaud
Cet axe a pour but d’aborder des problèmes de
santé de l’environnement (protection et
diagnostic précoce) par une approche
réductionniste et fondamentaliste. On y utilise
largement au laboratoire les outils de la
biochimie et de la biologie moléculaire sur des
préparations cellulaires ou sub-cellulaires. On
cherche aussi à y développer des technologies
innovantes pour poser les bases d’une
symptomatologie animale en milieu marin, en
ligne, ouverte au public, reposant sur l’analyse
in-situ du comportement de bivalves en
situations naturelles. L’approche va jusqu’à la
santé humaine, en utilisant le modèle murin.
ACTION 2.1 : PROJET FLAVOBACTERIES,
VACCINATION, PROBIOTIQUES
Flavobacterium psychrophilum est une
bactérie Gram-négative psychrophile qui
infecte les poissons, majoritairement les salmonidés.
Au niveau mondial, les coûts induits par
les flavobactérioses sur les poissons d’élevage
sont évalués en millions d’euros annuels en
raison des pertes d’exploitation et des dépenses
liées aux traitements. Du fait des contraintes
législatives et écologiques qui limitent
l’utilisation des antibiotiques, la lutte contre la
flavobactériose repose sur la mise au point de
méthodes précoces de détection/identification
du pathogène afin de limiter la propagation de
la maladie et d’un vaccin indisponible à ce
jour.
Nous chercherons à limiter la dissémination de
la flavobactérie par la mise au point d’une
technique de routine performante (Q-PCR)
permettant l’identification précoce du portage
de F. psychrophilum par les «œufs/alevins».
Des essais de vaccination seront conduits à
l’aide de cocktails antigéniques de complexité
croissante. Les épisodes de flavobactériose
interviennent fréquemment sur des alevins
dont la taille est incompatible avec la
vaccination par injection. Aussi, nous
privilégierons la vaccination par voie orale afin
d’offrir un recours sur les stades les plus
précoces. On vérifiera l’efficacité de la
protection du cocktail antigénique, vis-à-vis du
système digestif par l’encapsulation dans des
particules biodégradables. C’est dans ce
contexte que la synthèse des nanoparticules
organiques et leur fonctionnalisation par
greffage d’antigènes protéiques de F.
psychrophilum seront initiées. Différents
paramètres seront analysés : les impacts
possibles des nanoparticules sur le système
immunitaire, leur devenir dans l’organisme,
l’évaluation quantitative de F. psychrophilum
dans différents tissus hôtes et les réponses
génétique et protéique à l’infection. Un des
buts déclarés est la limitation du rejet
d’antibiotiques par l’aquaculture dans le milieu
naturel.
43

ACTION 2.2 : IMPACT TOXICOLOGIQUE DU
MERCURE ABSORBE PAR VOIE ALIMEN-
TAIRE CHEZ LA SOURIS ET LE RAT
Dans le cadre des recherches sur l’impact
toxicologique du mercure absorbé par voie
alimentaire, le modèle murin sera utilisé et les
interrogations porteront sur les effets d’un
régime typique d’un français bon
consommateur de poissons, source principale
de mercure. Les effets du méthylmercure
contenu dans la chair de poisson seront
abordés chez l’animal adulte contaminé
chroniquement, sur des rates femelles gravides,
et sur leur progéniture. Plus précisément, les
impacts possibles sur le comportement cognitif
des animaux, sur la fonction mitochondriale,
sur l’expression génique et protéique dans
divers tissus seront abordés.
ACTION 2.3 : MATIERES ORGANIQUES
DISSOUTES ET BIO-DISPONIBILITE DU
MERCURE
L’influence des matières organiques dissoutes
et notamment de l’acide humique sur la
mobilisation et la biodisponibilité du mercure
dans la colonne d’eau sera étudié chez le
poisson zèbre en tant que modèle animal.
Après obtention d’un catalogue de gènes
stimulés et réprimés par le méthylmercure,
nous caractériserons fonctionnellement une
petite sélection de ces gènes et évaluerons leur
importance quant à la résistance de l’animal
face à ce toxique. Ces préoccupations
rejoignent celles de l’action 2.2 de l’équipe
LPTC sur le rôle de MOD.
ACTION 2.4 : DETOXICATION CELLULAIRE
ET TRANSPORTEURS DE TYPE ABC
Les transporteurs de type ABC sont une
solution élégante de détoxication des métaux
par pompage. Nous établissons actuellement
l’inventaire de tous les gènes des sous-familles
ABCB et ABCC du poisson zèbre dont
l’expression est susceptible d’être stimulée par
des métaux toxiques. Nous vérifierons chez la
bactérie et la levure la fonction éventuelle de
protection par pompage des métaux. Ce sujet
est financé par l’ANR SEST, «Transporteurs
actifs». De récentes données d’expression
génique obtenues chez le poisson zèbre
contaminé par voie alimentaire au
méthylmercure incitent à vérifier la fonction de
certains gènes dont l’activité est modifiée par
ce toxique, et notamment ceux du transporteur
lysosomal Laptm4 et de la nucléosidediphospho-kinase
Ndpk2.
ACTION 2.5 : ANALYSE DU COMPORTE-
MENT DE BIVALVES IN-SITU : LA
VALVOMETRIE HFNI (HAUTE FREQUENCE,
NON INVASIVE)
Le suivi en ligne, depuis n’importe quel
ordinateur dans le monde, d’indices biologiques
de l’état de santé d’un environnement
aquatique est aujourd’hui possible. Depuis
2006, nous avons développé un système basé
sur l’analyse en temps réel du comportement
de bivalves et sa publication sur internet
(http://www.domino.u-bordeaux.fr/molluscan_eye).
L’idée est que face à une perturbation, les
bivalves modifient leur activité valvaire ou
grandissent anormalement. Le principe de
notre système est l’acquisition haute fréquence
du comportement valvaire de mollusques,
l’autonomie sur le terrain (≥ 12 mois), la
modélisation statistique, l’analyse en ligne, la
production journalière de graphiques «prédigérés».
A ce jour, les aspects technologiques
et la fiabilité en climats tempérés et tropicaux
sont réglés à 95 %. Les prochains challenges
sont une fiabilisation à 99,9…% (collaboration
avec la PME Eukrea), la mesure in situ de la
température et de la pression, le couplage avec
des sondes multi-paramètres, le développement
de sources énergétiques pour conditions
polaires et la gestion de masses de données de
plus en plus grandes pour le traitement de
séries longues et de tendances.
Au delà de ces perfectionnements technologiques,
nous poursuivrons l’analyse des
principes de base régissant le comportement
d’un bivalve in-situ (éthologie). Nous
continuerons ces analyses au laboratoire et sur
le terrain en les étendant à de nouveaux sites
proches ou lointains, sous des pressions
environnementales différentes. Quatre grandes
questions sont abordées :
1. la gestion des échanges respiratoires et
trophiques au cours de l’année,
2. l’impact des algues toxiques (cf Axe 3),
3. l’impact du réchauffement global en
Nouvelle Calédonie et en Arctique,
4. le biomonitoring en ligne et public.
Encore unique au niveau international en
termes de technicité, ce projet a ouvert de
44

nombreuses collaborations. Nous continuerons
les projets sur les algues toxiques avec Ifremer
et le LEMAR de Brest. Nous collaborerons
avec Ifremer Argenton pour la détection
précoce de pontes chez l’huître. Au niveau
international, plusieurs projets sont soumis en
Norvège avec Akvaplan-Niva pour la
surveillance de champs pétroliers (Mer de
Barents, Lofoten – Tromsø - Vardø VTS et
Isfjord Radio, Univ. du Svalbard). Nous
sommes impliqués dans le projet international
arctique «The Kongsforden System – a
flagship programme». Nous participons au
projet européen INTEREG Arc Atlantique
PORTO-NOVO sur la qualité de l’eau dans les
ports. Nous sommes sollicités dans l’estuaire
du St Laurent. En Nouvelle-Calédonie, nous
travaillerons sur l’éthologie des bénitiers avec
l’IRD (surveillance Goro Nickel et
paléoclimats).
AXE 3 : IMPACT DES ALGUES
TOXIQUES SUR LES BIVALVES
Responsable : D. Tran
Cet axe de recherche est centré sur les bivalves
filtreurs (principal modèle, l’huître Crassostrea
gigas), cibles privilégiées d’intoxication
dans l’écosystème aquatique et vecteur de
contamination pour l’homme (genres étudiés :
Alexandrium et Pseudo-Nitzchia, produisant
respectivement les phycotoxines «PSP»
paralysantes et «ASP» amnésiantes). Nous
étudierons les mécanismes de détection,
contamination et tolérance chez le bivalve.
Notre angle d’approche, totalement original,
est celui de la perturbation des rythmes
biologiques. Nous l’aborderons du niveau
moléculaire au niveau comportemental
(valvométrie HFNI) en étudiant les gènes de
l’horloge biologique qui régissent ces rythmes.
Nous participerons à l’approche multistress
chez la palourde Ruditapes philippinarum, qui
inclut maintenant la présence d’efflorescences
toxiques, en réalisant l’analyse comportementale
par valvométrie (Axe 1, Action 1.3). Ces
travaux s’inscrivent dans des programmes
régionaux (Région Aquitaine, SIBA),
nationaux (Liteau 3) et internationaux
(ARMORICA, Gagilau, cf Axe 2, action 5),
avec des collaborations en cours (LEMAR
Brest, Ifremer Brest et Arcachon) ou prévu
(Ifremer Sète sur l’étang de Thau). Des
demandes de financement EC2CO et ANR
jeune chercheur/blanche, sont prévues pour
supporter cette recherche. Une allocation de
thèse fléchée du ministère nous a été attribuée
sur le sujet pour la rentrée universitaire 2009.
La stratégie sera basée sur 3 approches :
ACTION 3.1 : ETUDE IN SITU DES RYTHMES
BIOLOGIQUES DE REFERENCE DES
BIVALVES PAR VALVOMETRIE HFNI ET DE
LEUR PERTURBATION LORS D’EFFLO-
RESCENCES ALGALES TOXIQUES
Le but sera de caractériser in-situ le
comportement des bivalves tout d’abord en
absence de contamination, en analysant les
paramètres biologiques (e.g., nourritures,
gamétogénèse) et abiotiques (e.g., température,
vitesse du courant, amplitude des marées) qui
régissent les rythmes comportementaux. En
parallèle, en utilisant les événements naturels,
leur perturbation sera recherchée lors
d’efflorescences toxiques. Les deux sites
d’analyse privilégiés seront localisés dans le
Bassin d’Arcachon (bouée 13 à l’entrée du
Bassin et jetée d’Eyrac à l’intérieur du Bassin).
Nous avons également un projet d’équipement
à Thau (lagune de Méditerranée nordoccidentale),
un écosystème plus chaud et sans
marée également exposé aux algues toxiques.
ACTION 3.2 : ETUDES EXPERIMENTALES
AU LABORATOIRE DE L’IMPACT DES
ALGUES TOXIQUES SUR L’EXPRESSION
DES RYTHMES BIOLOGIQUES
Nous chercherons à isoler au laboratoire, par
une approche réductionniste, les facteurs
abiotiques qui règlent les rythmes biologiques
sans, puis, avec algues toxiques. Cette
approche sera conduite en manipulant en
conditions simplifiées mais contrôlées, deux
paramètres clés qui peuvent régir le
comportement des huîtres sur le terrain, la
vitesse du courant et la pression hydrostatique.
Nous utiliserons une colonne à marée et un
anneau de vitesse, tous deux instrumentés et
pilotés par ordinateur. Nous rechercherons les
mécanismes physiologiques intervenant lors
d’une efflorescence d’algues toxiques, leur
impact et les conséquences en retour sur les
processus de contamination.
45

ACTION 3.3 : ETUDE DES MECANISMES
MOLECULAIRES MIS EN ŒUVRE DANS LA
REPONSE AUX ALGUES TOXIQUES CHEZ
LES BIVALVES FILTREURS
Nous étudierons la chaîne d’événements qui
va, lors d’efflorescences d’algues toxiques, de
la réponse moléculaire aux modifications du
comportement et des rythmes biologiques du
bivalve, indicateurs subtils et précoces d’une
perturbation de l’écosystème.
AXE TRANSVERSE «MODELISATION
STATISTIQUE»
Responsable : G Durrieu
L’objectif est d’utiliser des méthodes
statistiques classiques mais aussi d’en créer de
nouvelles pour traiter et modéliser les données
recueillies dans les 3 axes. L’équipe manipule
en effet de plus en plus souvent de grands
ensembles de données (projets «puce à ADN»
et valvométrie HFNI). La modélisation
statistique est un des outils qui nous permettra
de traiter et d’analyser ces masses de données
et d’y discriminer les phénomènes d’intérêt. La
démarche repose sur l’utilisation de modèles
non paramétriques basés sur des estimateurs
robustes, utilisant le moins d’hypothèses
possibles afin de s’ajuster avec fidélité aux
données. L’ensemble de ces travaux s’inscrit
dans une collaboration avec des collègues
biologistes et mathématiciens de l’Université
de Toronto (Dr L Briollais), l’Université de
Lille 1 (Dr F Schmitt) et de l’Institut de
Mathématiques de Bordeaux (Profs B Bercu et
J Saracco).
En ce qui concerne l’analyse comportementale
journalière des bivalves, le but est à nouveau
d’augmenter les performances des estimateurs,
en utilisant maintenant des estimateurs
récursifs, tout en gardant des temps de calculs
courts. Jusqu’à présent, nous avions développé
des estimateurs non récursifs. L’intérêt du
récursif sur un enregistrement en continu, est
que c’est une estimation point par point qui
permet de corriger à l’étape n, l’estimation
fournie à n-1 par addition d'un terme correctif
dépendant de l'écart entre la prédiction et la
mesure effectuée. L’adéquation modèle/
données brutes est significativement améliorée.
Nous proposons d’étudier le comportement
asymptotique de ces estimateurs et de leur
dérivée pour optimiser les estimations de
vitesses et d’accélérations. L’intérêt analytique
est que la fermeture des valves étant
commandée par un(deux) muscle(s)
adducteur(s), la vitesse de fermeture est aussi
celle de contraction de ces muscles. La vitesse
d’ouverture est le résultat du relâchement
musculaire et des propriétés élastiques du
ligament charnière qui joue le rôle de ressort.
Nos mesures donneront donc un meilleur accès
en ligne à la physiologie musculaire de
l’animal, à la physiologie de la charnière des
valves et aux états de réactivité lors d’un stress
caractérisé par des mouvements de fermetures
partielles rapides. Ces muscles étant les seuls
muscles squelettiques du bivalve, la
valvométrie HFNI donnera ainsi accès à la
totalité des muscles squelettiques de l’animal.
L’acquisition des données dans le domaine des
puces à ADN et SAGE est très coûteuse. Le
but est de déceler si un gène est
différentiellement exprimé. Les méthodes de
statistique séquentielle que nous développons
sont spécifiquement adaptées à ce type de
situation où le paramètre dominant est la
précision que l’on souhaite obtenir. La
définition d’une règle d’arrêt indique si on peut
arrêter l’expérience après les n premières
mesures ou si on doit continuer avec une
nouvelle observation ou un nouveau lot
d’observations. Nos derniers travaux (Durrieu
et Briollais, 2009) présentent les fondements
de cette approche. Nous proposons d’étendre
ce résultat au cas multivarié pour l’étude
conjointe d’un ensemble de gènes.
46

ECOLOGIE ET BIOGEOCHIMIE DES
ECOSYSTEMES COTIERS : ECOBIOC
Responsable : Xavier de MONTAUDOUIN
AXE 1
Santé des populations, qualité des
écosystèmes
AXE 2
Couplage biologie/biogéochimie
à l’interface eau/sédiment
AXE 3
Flux de matière à l’échelle
des écosystèmes
Equipes EA
& LPTC
Multistress
Equipe
Sédimento
- Ecopathologie
- Bioévaluation de la qualité des
milieux
- Environnements nonstationnaires
- Bioturbation
- Diversité fonctionnelle /
biogéochimie
Taxonomie
- Flux biogéochimiques
- Flux trophiques
- Fonctionnement des
écosystèmes
Equipe
Methys
Couplage
hydrodynamique
Equipe LPTC
Biomarqueurs
MOP
Ecosystèmes (semi-)abrités
Guy Bachelet
Hugues Blanchet
Frédéric Garabétian
Micheline Grignon-Dubois
Florence Jude
Xavier de Montaudouin
Natalie Raymond
Jean-Claude Sorbe
Pierre Anschutz
Aurélie Ciutat
Bruno Deflandre
Jean-Claude Duchêne
Antoine Grémare
Pascal Lecroart
Olivier Maire
Gwenaël Abril
Yolanda Del Amo
Henri Etcheber
Benoît Sautour
Nicolas Savoye
(Post-)doctorants : Tu Do,
Guillaume Meisterhans, Ika Paul-
Pont, Alicia Roméro
(Post-)doctorants : Guillaume
Bernard, Romain Chassagne,
Marie-Lise Delgard, Aurélie
Mouret, Lucie Pastor
(Post-)doctorants : Mathieu
Canton, Sophie Dubois, Eric
Goberville, Aimé-Roger Nzigou,
Flora Salvo, Etudiant
Personnel technique: Sabrina Bichon; Line Bourasseau; Michel Leconte; René Parra; Dominique Poirier ;
Bernadette Rezzonico
Les recherches de l’équipe ECOBIOC
s’adressent spécifiquement à la structuration
du vivant ainsi qu’à son rôle dans le
fonctionnement des écosystèmes côtiers. Ces
systèmes présentent une diversité et une
productivité biologiques élevées. La forte
biomasse et sa dynamique de transformation
conduisent à l’élaboration de réseaux
trophiques complexes qui traduisent des
interactions fortes entre les sels nutritifs, la
matière organique et les organismes vivants.
Les processus de recyclage y sont
particulièrement importants si bien que la
minéralisation de la matière organique à
l’interface eau sédiment et les flux de sels
nutritifs qui en résultent vers la colonne d’eau
y contrôlent parfois la production primaire
pélagique. La connaissance du fonctionnement
des écosystèmes côtiers constitue un
préambule obligatoire à l’évaluation de leurs
dysfonctionnements potentiels. Elle ne peut
être appréhendée que par la prise en
considération du couplage entre les trois
compartiments mentionnés ci-dessus, sels
nutritifs, matière organique et organismes. Ce
couplage s’appuie sur des processus physiques
(e.g., le pompage tidal) et biologiques (e.g ., la
bioturbation). Dans ce dernier cas, les
interactions sont clairement bidirectionnelles
puisque la faune benthique est par exemple
tout à la fois dépendante de la quantité et de la
nature de la matière organique présente dans le
milieu, et en retour capable d’affecter
significativement le devenir de cette matière.
47

L’équipe ECOBIOC s’appuie sur une forte
interdisciplinarité. Certains de ses membres
possèdent des bases taxonomiques solides dans
des groupes aussi diversifiés que la microflore
procaryotique, le phyto- et le zooplancton,
ainsi que le benthos et appréhendent la
dynamique des populations, notamment de
systèmes complexes proies/prédateurs ou
hôtes/parasites. D’autres sont spécialisés dans
la mesure de processus biologiques (nutrition
et bioturbation) qui ont des répercussions
significatives en terme de biogéochimie.
D’autres encore sont spécialisés dans le dosage
et l’interprétation de biomarqueurs (acides
aminés et rapports isotopiques) renseignant sur
l’origine et la qualité nutritionnelle de la
matière organique. Enfin, les biogéochimistes
de l’équipe possèdent toutes les compétences
requises pour quantifier et modéliser la
diagenèse précoce. Cet ensemble, relativement
unique au plan national et encore renforcé par
des recrutements récents, permet d’afficher des
objectifs ambitieux qui s’articulent autour de
trois axes fortement interconnectés. L’Axe 1 :
Santé des populations, qualité des
écosystèmes rassemble toutes les compétences
ayant trait à l’analyse de la diversité biologique
aux niveaux spécifique et infraspécifique. Les
travaux correspondants permettront d’identifier
les connexions entre structures des
peuplements, dynamique des populations et
qualité écologique des écosystèmes. Reposant
sur une paramétrisation mécanistique de la
bioturbation et sur des outils novateurs
(voltammétrie, profileur sédimentaire,
actographe), l’Axe 2 : couplage biologie/
biogéochimie à l’interface eau-sédiment
s’intéressera à l’impact de la diversité de la
faune benthique sur les cycles
biogéochimiques. Il s’appuiera sur une
définition fonctionnelle de cette diversité telle
qu’appréhendée dans l’Axe 1. Les flux de
matière seront appréhendés en termes de bilan
mais seront également analysés au niveau des
processus mis en jeu dans l’Axe 3 : Flux de
matière à l’échelle des écosystèmes.
L’origine, la qualité et le devenir de la matière
organique particulaire (MOP), notamment
détritique, constituent un ensemble de
questions encore mal contraintes à ce jour qui
seront abordées en relation étroite avec
l’Axe 2.
S’agissant de systèmes côtiers dont l’étude
nécessite une excellente accessibilité, ces
recherches seront tout d’abord mises en œuvre
au sein des écosystèmes emblématiques de la
Région Aquitaine (estuaire de la Gironde,
bassin d’Arcachon, côte sableuse océanique).
L’équipe possède néanmoins les compétences
qui la conduisent sur d’autres terrains,
nationaux (Méditerranée, Loire, Bretagne,
Marennes-Oléron, Pays Basque…) et
internationaux (Amazone, Espagne, Maroc,
…). Un des objectifs pour le futur quadriennal
consiste d’ailleurs à renforcer ce type de
positionnement.
AXE 1 : SANTE DES POPULATIONS,
QUALITE DES ECOSYSTEMES
Responsables : H. Blanchet – N. Raymond
Cet axe a pour objectif d’éclairer les relations
de causalité entre qualité écologique des
écosystèmes côtiers, l’état de santé des
organismes et des populations ainsi que les
caractéristiques structurales des communautés
résidentes. La qualité d’un écosystème pourra
dès lors être estimée à partir de l’analyse de la
structure de ses communautés, de la santé de
ses populations (dynamique, charge en
pathogènes) et de l’activité de ses organismes.
ACTION 1.1 : ETAT DE SANTE ET
DYNAMIQUE DES POPULATIONS
Les populations de filtreurs, essentiellement
des mollusques bivalves, exercent un impact
majeur sur le fonctionnement des écosystèmes
littoraux. L’évaluation de la santé de leurs
populations constitue donc un élément
incontournable de l’expertise de la qualité de
l’environnement et de la gestion des stocks
exploités. Nous chercherons à replacer les
maladies et stress de ces organismes dans un
contexte environnemental global (interactions
abiotiques et biotiques, évolution du climat,
interactions parasites/organismes libres).
L’originalité de cette approche
«d’écopathologie» tient à une forte
interdisciplinarité entre écotoxicologues,
microbiologistes, généticiens et écologues.
La pression exercée par les parasites sur les
populations-hôtes mollusques (principalement
coques et palourdes) sera abordée selon une
stratégie déjà mise au point et prenant en
compte l’omniprésence, la durabilité et la
complexité des interactions impliquées. Se
basant sur nos principaux modèles (trématodes,
protozoaires Perkinsus), l’accent sera mis sur
48

la variabilité spatio-temporelle des systèmes
parasites-hôtes en relation avec les paramètres
environnementaux (e.g., température, salinité,
diversité biologique). Les démarches suivies
iront de la comparaison de systèmes (bassin
d’Arcachon/lagune de Moulay Bousselham au
Maroc) à des approches expérimentales in situ
(caging) et en laboratoire (infestation
expérimentale), en passant par l’exploitation de
séries temporelles longues.
In situ les bivalves sont soumis, non pas aux
seuls parasites mais bien à une multitude de
stress environnementaux ou chimiques qui
déclenchent dans leurs tissus ou organes des
réponses biologiques de type dommage ou
défense. L’étude de la vulnérabilité et de
l’adaptabilité des organismes soumis à des
stress multiples (trématodes, bactéries, métaux)
a été initiée lors de la précédente
contractualisation en collaboration avec les
personnels de la future équipe Ecotoxicologie
Aquatique. Cette démarche sera poursuivie
afin de parvenir à une meilleure
compréhension :
1. des interactions entre les différents stress,
2. des mécanismes impliqués,
3. des adaptations comportementales et
fonctionnelles (du gène à la population).
Notre découverte récente d’une pathologie
émergente à forte prévalence chez la palourde
(Maladie du Muscle brun, BMD) suscite une
attente sociétale pressante. Notre ambition, en
collaboration avec l’équipe EA et le
département de virologie de l’INRA (Jouy-en-
Josas), est de comprendre la dynamique de
cette pathologie et d’en isoler l’agent
infectieux (probablement un virus).
ACTION 1.2 : QUALITE ECOLOGIQUE DES
ECOSYSTEMES ET COMPOSITION DES
COMMUNAUTES
Ce volet propose une vision synoptique de la
qualité d’un habitat et/ou d’un écosystème à
travers la mise en évidence des schémas
d’organisation de différentes communautés
(procaryotes, eucaryotes, métazoaires ;
planctoniques et/ou benthiques ; auto-, mixoou
hétérotrophes), de leur diversité aux
différentes échelles de temps et d’espace et
leur mise en relation avec les caractéristiques
reflétant la qualité du milieu.
Un premier objectif consiste à déterminer les
relations entre les facteurs environnementaux,
la diversité de la flore microbienne du
sédiment et celle des bivalves endogés.
L’étude de la structure et de la diversité des
communautés microbiennes autotrophes
(procaryotes et eucaryotes) est classiquement
réalisée à l’aide d’outils d’observation en
microscopie et d’analyse en cytométrie en flux.
Afin de mieux appréhender l’aspect très
dynamique de ces communautés, nous
développerons l’analyse automatique du nanoet
du microphytoplancton par FlowCam
associé au logiciel PhytoImage. De même,
nous mettrons en œuvre un PhytoPAM pour la
quantification relative des biomasses de
différents groupes phytoplanctoniques selon
leur signature pigmentaire. Pour prolonger des
travaux antérieurs, et valoriser la mise en place
des outils adaptés au sein du laboratoire
(plateforme de biologie moléculaire), nous
chercherons à intégrer des dimensions spatiales
et temporelles. La caractérisation de la
diversité des flores microbiennes sera réalisée
par des approches culturales et moléculaires.
Nous aborderons également la problématique
de la qualité sanitaire du milieu par
l’identification des sources de contamination
fécale (Microbial Source Tracking) dans une
perspective de gestion (DCE 2000/60).
Un deuxième objectif consiste à étudier les
schémas de répartition des communautés
d’invertébrés benthiques dans les estuaires
(incluant des zones peu connues du point de
vue biologique comme celle d’influence de la
marée dynamique), les lagunes et les zones
côtières à l’échelle des façades Manche-
Atlantique et Méditerranée. Ces travaux sur les
eaux de transition seront réalisés à partir de
grandes bases de données rassemblant les
informations acquises à l’échelle nationale
métropolitaine dont l’UMR EPOC a en charge
la réalisation et la gestion (base de données
nationale du Réseau National des Stations
Marines) ou l’acquisition et le traitement des
données (base de données sur les estuaires,
baies et lagunes).
Les travaux consisteront à :
1. dégager les grands patrons d’organisation
des communautés benthiques,
2. tester les méthodes de bioévaluation de la
qualité du milieu,
49

3. proposer une approche multicritères
originale pour la détermination de la
qualité écologique de ces milieux.
Les techniques d’imagerie sédimentaire (cf
Plateforme carottes sédimentaires d’EPOC)
complèteront l’analyse de la faune benthique
en produisant des indicateurs supplémentaires
basés sur l’épaisseur de la couche oxydée, les
signes d’activité biologique et leur intensité.
Au cours de la prochaine période de
contractualisation, nous développerons :
1. un logiciel permettant l’objectivation du
traitement des images de profils
sédimentaires,
2. de nouveaux indicateurs dérivés de ce
nouvel outil (Post-doctorat d’A. Roméro).
Ces outils seront appliqués dans des
écosystèmes présentant des situations
écologiques variées (pro delta et extrémité de
la zone de dilution du Rhône, Vasière Ouest
Gironde, Bassin d’Arcachon) pour évaluer les
méthodes de bioévaluation basées sur l’analyse
de la composition de la faune benthique.
L’analyse d’images dynamiques (actographie)
permettra enfin de comparer l’intensité et la
fréquence de leur activité en fonction des
modifications de la qualité du milieu.
L’attention sera enfin portée sur les espèces
introduites, élément important de la qualité
écologique et de l’intégrité des écosystèmes
littoraux. Dans ce cadre, nous étudierons les
effets de l’invasion de l’huître du Pacifique
Crassostrea gigas sur la biodiversité benthique
du Bassin d’Arcachon. En parallèle, nous
étudierons les effets des substances
allélopathiques produites par les macrophytes
marines qui jouent un rôle considérable dans
l’établissement d’espèces envahissantes et dans
la structuration des communautés végétales.
Nous chercherons par conséquent à
caractériser qualitativement et quantitativement
ces substances, les conditions de leur
synthèse et leur mode d’action.
AXE 2 : COUPLAGE BIOLOGIE/
BIOGEOCHIMIE A L’INTERFACE EAU-
SEDIMENT
Responsables : P. Anschutz – A. Ciutat
L’existence de compétences fortes dans les
domaines de l’écologie et de la biogéochimie
benthique constitue un des atouts de l’équipe
ECOBIOC au plan national et international.
Cet état de fait s’est encore trouvé renforcé par
des recrutements récents qui ont permis de
parfaire le continuum entre ces deux
disciplines, et d’intégrer une composante
microbiologique. Cette situation nous permet
maintenant d’envisager une étude réellement
intégrée du fonctionnement de l’interface eausédiment.
Nos recherches seront organisées en
trois actions :
1. l’étude biogéochimique des environnements
non stationnaires,
2. l’étude mécanistique des processus de
bioturbation, et enfin,
3. l’étude des interactions biologiebiogéochimie
par l’évaluation de l’impact
de la diversité de la macrofaune benthique
sur la minéralisation de la matière
organique sédimentaire, par l’analyse
conjointe des effets de la régression des
herbiers à zostères du bassin d’Arcachon
sur la bioturbation et la biogéochimie des
sédiments, ainsi que par l'étude des
perturbations des communautés
microbiennes benthiques causées par la
bioturbation.
ACTION 2.1 : BIOGEOCHIMIE BENTHIQUE
DANS DES ENVIRONNEMENTS NON
STATIONNAIRES
Nos travaux récents en biogéochimie
benthique se sont orientés vers un
environnement particulièrement instationnaire
: les zones intertidales. La prospective
qui se dégage de ces études préliminaires se
décline en trois questions principales.
1. Quelles sont les parts respectives de la
micro-hétérogénéité spatiale et de
l'évolution temporelle dans le bilan global
des flux à l’interface sédimentaire en zone
intertidale ? Nous apporterons des
réponses grâce au développement récent
des techniques de micro-mesures in situ
des principaux composés liés à la
minéralisation de la matière organique
ainsi qu’à l’utilisation de plans
d’échantillonnage hiérarchisés des
microprofils sédimentaires.
2. Quelle est la contribution des processus
benthiques des plages tidales sableuses
dans le flux de matière vers l'océan côtier ?
50

La compilation des données obtenues et
l'acquisition de nouveaux suivis spatiotemporels
de la chimie des eaux
interstitielles en zone tidale perméable,
associées au développement d’un modèle
couplé réaction-transport en milieu poral
insaturé, permettront de préciser la notion
de "bioréacteurs" que constituent les
plages tidales.
3. Quels sont les paramètres et/ou les
propriétés du milieu qui contrôlent les flux
benthiques en zone intertidale ? Des plans
d'expérience seront développés pour tester
in vitro le rôle des temps
d'immersion/émersion (c'est-à-dire la
position sur l'estran) dans les sédiments
sableux sur les processus de minéralisation
de la matière organique.
Nous aborderons aussi la biogéochimie
benthique par une approche plus théorique en
se focalisant sur les transferts d'énergie au
cours de la diagenèse précoce. Cette approche
nous permettra en définitive d'établir les
limites du possible en termes de trajet
réactionnel lors de la minéralisation de la
matière organique dans les environnements
non-stationnaires étudiés. La séquence des
réactions de minéralisation de la matière
organique a été déduite des contraintes
thermodynamiques propres à chaque réaction
et de l’analyse fine des profils verticaux de
distribution des espèces chimiques. Il s'agit
maintenant d'établir un schéma
thermodynamiquement correct de la diagenèse
précoce afin de mieux borner les zones et les
moments où les réactions se font, en incluant
des réactions alternatives (du cycle de N par
exemple), de perfectionner la modélisation de
la minéralisation du carbone organique en
incluant ces réactions alternatives et finalement
de mieux cerner le lien entre les flux exportés
vers le sédiment et la diagenèse.
ACTION 2.2 : APPROCHE MECANISTIQUE
DE LA BIOTURBATION
Le terme de bioturbation recouvre deux
processus différents par lesquels la faune
benthique affecte la minéralisation de la
matière organique sédimentée :
1. le remaniement sédimentaire (i.e. les
mouvements de particules sédimentaires
induits par la faune),
2. la bioirrigation (i.e. le mélange des
composés dissous contenus dans l’eau
interstitielle du fait de la faune).
Il s’agit donc d’un processus majeur affectant
les propriétés physiques, chimiques et
biologiques de l’interface eau-sédiment. Il
convient tout à la fois de le caractériser et de le
mesurer avec la plus grande précision possible.
La mesure du remaniement sédimentaire
associe classiquement expérimentation (qui
permet d’obtenir des profils verticaux de
traceurs) et modélisation qui permet par
ajustement à ces profils de déduire des
coefficients traduisant l’intensité du
remaniement sédimentaire. Jusqu’à récemment
le modèle biodiffusif était le plus
communément utilisé. Le remaniement
sédimentaire y est caractérisé par une seule
grandeur (Db). Ce modèle suppose notamment
des déplacements particulaires extrêmement
fréquents et de faible amplitude. Ses conditions
d’application font maintenant débat et il tend
actuellement à être remplacé par des modèles
de type « random walk » dont la
paramétrisation repose sur le « resting time »
(temps de repos entre deux mouvements
consécutifs d’une même particule) et la « step
length » (distance moyenne parcourue par une
particule lors d’un déplacement). L’existence
de ces deux grandeurs complique l’ajustement
de ces modèles qui n’a pour l’instant été réalisé
qu’à deux reprises dont une fois par notre
propre équipe en collaboration avec des
chercheurs du NIOO (Pays-Bas). Notre groupe
est internationalement reconnu pour sa maîtrise
des protocoles expérimentaux permettant une
vision 2D de la bioturbation à partir de
l’analyse automatisée de séquences d’images
de la colonne sédimentaire en présence de
traceurs fluorescents. Nous allons raffiner ces
protocoles expérimentaux (acquisition très
haute fréquence, analyse des changements de
nature et des trajectoires des pixels) de manière
à déterminer expérimentalement les « resting
times » et les « step lengths » d’invertébrés
benthiques appartenant à des groupes
fonctionnels différents. Cette même approche
sera ensuite appliquée à des assemblages
d’espèces reconstitués, puis à des
communautés in situ par utilisation de
l’imagerie sédimentaire. Dans tous les cas,
nous comparerons les résultats obtenus
51

directement par l’expérimentation et par la
modélisation (coll. NIOO).
Les mesures de bioirrigation font
classiquement intervenir des traceurs inertes
dont les évolutions des concentrations (dans la
colonne d’eau ou dans des profils
sédimentaires) lors d’incubation permettent de
dériver des flux. Nous mettrons en œuvre ces
techniques au laboratoire. Nous développerons
également des collaborations, notamment avec
le NIOO qui développe des protocoles basés
sur l’utilisation et le suivi en continu des
concentrations de fluorescéine. Cette dernière
approche conduit à une mesure dynamique qui
nous permettra de mettre en relation les
variations d’activité de la faune benthique
(mesurées par actographie automatisée) et
celles de la bioirrigation. Ces travaux
constitueront un parallèle de ceux déjà
conduits pour l’étude des interactions entre
activité et remaniement sédimentaire.
ACTION 2.3 : COUPLAGE BIOLOGIE/
BIOGEOCHIMIE
Cette action mobilisera l’ensemble de l’équipe
autour de trois questions distinctes :
1. l’impact de la diversité de la faune
benthique sur la minéralisation de la
matière organique,
2. l’impact de la régression de l’herbier à
zostères sur la bioturbation et les
processus biogéochimiques, et enfin,
3. l’impact de la bioturbation sur la
diversité microbienne.
Effet de la diversité fonctionnelle de la
macrofaune sur la dynamique de
minéralisation de la matière organique. La
relation entre diversité et fonction est une
question récurrente mais toujours d’actualité
dans un contexte de forte perte de diversité.
Nous chercherons à déterminer si la prise en
compte de la biodiversité de la faune benthique
améliore ou non la description des variations
spatio-temporelles de l’intensité de la
bioturbation et des flux d’éléments biogènes à
l’interface eau-sédiment. Dans l’affirmative,
une seconde question concernera
l’identification de la composante de la diversité
responsable de ces variations (richesse
spécifique, diversité des groupes fonctionnels
ou bien présence d’espèces clés). Une
troisième question concernera enfin l’étude des
relations liant bioturbation, minéralisation et
flux à l’interface, ainsi que la comparaison de
leurs relations avec la diversité de la faune
benthique. Ces questions seront abordées à
partir :
1. d’études de terrain conduites sur une large
variété de sites présentant des
caractéristiques écologiques (température,
salinité, courants, quantité et qualité de
matière organique, diversité faunistique)
variées, et,
2. d’une approche hiérarchisée considérant
successivement les effets sur la
minéralisation de la matière organique :
des facteurs du milieu, des caractéristiques
quantitatives et qualitatives de la matière
organique (lien avec l’axe 3), et de la
diversité de la faune (lien avec l’axe 1).
Effet de la régression des herbiers à zostères
sur la bioturbation et le fonctionnement
biogéochimique de l’interface eau-sédiment.
Le Bassin d’Arcachon abrite le plus vaste
herbier à zostères naines d’Europe. Pour des
raisons encore inexpliquées, cet herbier est
actuellement en forte régression, ce qui est
susceptible d’affecter significativement les flux
de reminéralisation à l’interface eau-sédiment,
et donc de perturber significativement le
fonctionnement de cet écosystème puisque le
sédiment y est une source importante de sels
nutritifs. Afin d’évaluer ces conséquences
potentielles, nous conduirons une approche
comparative de la bioturbation et des
principaux processus biogéochimiques en zone
d’herbiers et sur des sédiments nus. Ce travail
fait l’objet de deux thèses (G. Bernard et M.L.
Delgard) qui démarreront toutes deux à
l’automne 2009 et dont les stratégies
d’échantillonnage spatial et temporel seront
communes.
Diversité microbienne benthique : distribution
en fonction de la stratification verticale et
perturbations par la bioturbation. Les effets de
la bioturbation sur les communautés
procaryotes benthiques sont très mal connus.
Nous étudierons l’effet de la bioturbation sur la
diversité fonctionnelle et spécifique des
communautés bactériennes du sédiment. Ces
communautés seront caractérisées par des
52

approches culturales (sélection de fractions
fonctionnelles) et moléculaires (typage). Ces
deux niveaux alimenteront des approches de
terrain (caractérisation par typage moléculaire
de communautés complexes échantillonnées à
différentes échelles) et des approches
expérimentales (manipulation de la diversité
bactérienne à partir d’une collection d’isolats
lors d’expérimentations de laboratoire).
AXE 3 : FLUX DE MATIERE A
L’ECHELLE DES ECOSYSTEMES
Responsables : Y. Del Amo – N. Savoye
Situés à l’interface entre le continent, l’océan
et l’atmosphère, les écosystèmes côtiers sont
caractérisés par de forts échanges de matière et
d’énergie avec les systèmes adjacents et sont le
siège d’importantes transformations de
matière, le tout conduisant à une multiplicité
des flux de matières. L’axe interdisciplinaire
«flux de matière à l’échelle des écosystèmes»
regroupe des spécialistes en biogéochimie et
biologie dont les recherches s’articulent autour
des flux de matière dans les méta-écosystèmes
côtiers (notion englobant l’ensemble des
écosystèmes interconnectés avec ou ayant une
influence sur les écosystèmes côtiers). Les
principales actions envisagées dans le cadre du
prochain quadriennal se focalisent autour :
1. de flux étudiés aux interfaces (continentocéan,
eau-atmosphère et sédimentatmosphère,
l’interface eau-sédiment
faisant l’objet d’études de processus fins
dans le cadre de l’axe 2),
2. de flux (en particulier trophiques) étudiés
au sein de sous-systèmes (e.g. eaux
douces, estuaires, baies, lagunes) des métaécosystèmes,
et enfin,
3. de l’évolution à long terme des
écosystèmes. Ces actions seront centrées
sur des systèmes modèles considérés
isolément (e.g. l’Amazone en tant que
grand fleuve mondial, le bassin
d’Arcachon en tant que lagune tempérée
semi-fermée) ou bien au contraire sur la
comparaison d’une série de systèmes
(approche multi-écosystémique).
ACTION 3.1 : FLUX DE CO 2 AUX
INTERFACES EAU-ATMOSPHERE ET
SEDIMENT-ATMOSPHERE
Le rôle des eaux continentales et littorales dans
le cycle global du carbone revêt un intérêt
croissant, dans le contexte actuel de
réchauffement climatique et d’augmentation
des perturbations anthropiques. Le peu de
données disponibles à ce jour indiquent que,
malgré leur modeste superficie, ces zones
émettent des quantités de CO 2 du même ordre
de grandeur que celles résultant du pompage
par la biosphère terrestre. Nous allons tout
d’abord développer des protocoles de
quantification des flux adaptés à ces
écosystèmes (mesure de flux de CO 2 et/ou de
pression partielle dans les eaux couplée à des
procédures d’upscaling s’appuyant sur la
télédétection). Nous chercherons également à
comprendre les processus biogéochimiques en
jeu dans la composante aquatique du cycle du
carbone ; notamment les rôles de la production
primaire, de la respiration et des flux de
matière organique sur les échanges de CO 2 .
Nous avons déjà appliqué ces deux approches
avec succès aux systèmes estuariens et aux
réservoirs hydro-électriques tropicaux. Nous
allons maintenant les transposer aux régions
temporairement exondées que sont les zones
intertidales du bassin d’Arcachon et les plaines
d’inondation du fleuve Amazone. Dans le
bassin d’Arcachon, nous mesurerons (pour la
première fois en zone intertidale) les flux de
CO 2 par la méthode de l’eddy covariance.
Nous mettrons ensuite ces flux en relation
avec :
1. les métabolismes benthiques et pélagiques
au cours des cycles de marée, et,
2. les évolutions de biomasses d’herbiers de
zostères naines déduites d’images
satellites.
Dans le fleuve Amazone (ANR Carbama),
nous suivrons l’évolution temporelle et spatiale
de la pCO 2 dans les eaux et nous la relierons
avec les niveaux de respiration et de
production primaire aquatique. Le rôle des
floraisons phytoplanctoniques intenses dans les
lacs de plaine d’inondation sur le bilan net de
carbone du système fluvial sera ensuite
quantifié en couplant les mesures de terrain à
l’analyse des surfaces aquatiques et de la
couleur de l’eau (images satellites).
53

ACTION 3.2 : FLUX DE MATIERE ORGA-
NIQUE PARTICULAIRE DU CONTINENT A
L’OCEAN
A l’échelle globale, les apports continentaux
constituent une source de carbone organique
significative pour le milieu marin.
Paradoxalement, la quantité de carbone
terrigène dans les océans est faible ce qui
implique des processus de
piégeage/reminéralisation importants en zone
côtière. Les processus de reminéralisation sont
particulièrement accentués dans les estuaires
qui constituent une source de CO 2 pour
l’amosphère. La MOP présente dans les
estuaires est d’origine allochtone (terrestre,
anthropique, marine, d’eau douce) et
autochtone (production micro- et
macrophytique). La quantification des flux de
MOP aux interfaces de ces systèmes est donc
nécessaire à la compréhension de leur
fonctionnement. Les flux de carbone organique
particulaire (COP) entrant dans les estuaires
seront estimés et leur impact sur l’oxygénation
des eaux évalué. Deux estuaires contrastés
seront étudiés : la Loire (estuaire à production
phytoplanctonique élevée subissant de fortes
hypoxies ; projet AMELIE) et la Gironde
(estuaire turbide ; programmes MAGEST et
SOMLIT). L’impact de la ville de Bordeaux
sur l’estuaire de la Gironde sera également
investigué (projet ETIAGE). Par ailleurs, les
flux de COP de différentes origines
(autochtones et allochtones) sortant de
l’estuaire de la Gironde seront estimés en
couplant une approche isotopique
(échantillonnage et analyse SOMLIT ; voir
également l’action 3.3) et la modélisation
hydrodynamique (collaboration avec l’équipe
METHYS).
ACTION 3.3 : ETUDE DES RESEAUX
TROPHIQUES
L’étude des réseaux trophiques permet de
décrire le fonctionnement de la biocénose d’un
point de vue holistique, et d’évaluer les
propriétés émergentes (stabilité, complexité,
recyclage) des écosystèmes. Leur modélisation
permet d'obtenir une vision synthétique du
mode de fonctionnement mais également
d'estimer le rôle de certains groupes
d'organismes d'intérêt particulier (e.g.
suspensivores exploités). Du point de vue
trophique, une des particularités des
écosystèmes côtiers réside dans la multiplicité
de l’origine (autochtone vs allochtone), de la
qualité (labile vs réfractaire) et des différents
réservoirs (matériel terrestre, macro et
microphytes aquatiques) de la MOP. Dans ce
contexte, nos recherches viseront
successivement à déterminer :
1. Quelles sont l’origine et la qualité de la
MOP ?,
2. Quelle fraction de la MOP soutient les
réseaux trophiques ?, et enfin,
3. Quels sont les liens et les flux trophiques
entre les compartiments des réseaux
trophiques ?
Origine et qualité de la matière organique
particulaire : Cette étude sera conduite selon
deux approches. Dans des écosystèmes
modèles, origine et qualité seront évaluées, à
partir de campagnes de terrain, à l’aide d’une
approche multiparamétrique fine combinant la
mesure de rapports de biomasse, de rapports
isotopiques et de biomarqueurs (acides aminés
totaux et disponibles et/ou alcanes linéaires ;
thèse S. Dubois, collaboration avec l’équipe
LPTC). Les écosystèmes ciblés sont des
systèmes semi-fermés de type lagune (bassin
d’Arcachon), baie (baie de Vilaine) et aber
(rade de Brest). La seconde approche est multiécosystémique
: l’approche analytique sera
plus simple (rapports biomassiques et
isotopiques) mais l’étude s’élargira à un jeu
d’écosystèmes présentant un éventail de
caractéristiques morphologiques, hydrodynamiques
et biogéochimiques : des systèmes
ouverts mésotrophes (Manche) et oligotrophes
(Méditerranée), des systèmes semi-fermés
eutrophes (aber, baie, lagune atlantiques) et un
estuaire fortement turbide (Gironde). Cette
approche s’appuie sur des jeux de données
existants (SOMLIT) ainsi que sur des données
à venir. L’approche ‘écosystèmes modèles’
permettra d’une part de quantifier le plus
finement possible les différentes sources et la
qualité de la MOP et d’autre part de fournir des
jeux de données pour l’étude trophique stricto
sensu. L’approche multi-écosystémique
permettra de mieux appréhender les forçages
(climatiques, hydrodynamiques, biogéochimiques,
anthropiques, etc.) de l’origine
et de la qualité de la MOP.
Fractions soutenant le réseau trophique : cette
étude s’intéressera principalement aux
consommateurs primaires et visera à
54

déterminer quelles fractions du pool de MOP
sont préférentiellement utilisées par ces
consommateurs. Nous comparerons les
signatures isotopiques des fractions de la MOP
et celles des consommateurs primaires.
L’utilisation de modèles nous permettra de
quantifier les proportions de chacune des
fractions assimilées par les consommateurs.
Les consommateurs seront ciblés en fonction
de leur rôle clef dans le fonctionnement de
l’écosystème, ceci en s’appuyant sur des
données concernant l’abondance et la biomasse
de la faune (thèse de S. Dubois, lien avec l’axe
1). L’écosystème ciblé est le bassin
d’Arcachon sur lequel se concentre une grande
partie des forces de l’équipe. Une partie de
l’étude y sera notamment dédiée à Crassostrea
gigas, consommateur primaire majeur au sein
de cet écosystème.
Fonctionnement trophique des écosystèmes :
cette étude intégrative consistera à caractériser
le fonctionnement des réseaux trophiques en
milieu côtier et estuarien, à l’aide de la
modélisation inverse. Les objectifs consistent :
1. à identifier le rôle du vivant sur les flux de
matière et d’énergie en milieu côtier via les
réseaux trophiques en réalisant des bilans
équilibrés et biologiquement crédibles des
réservoirs et flux de matière et d’énergie,
2. à déterminer le rôle des différentes
composantes biologiques dans le
fonctionnement trophique de ces zones, et
enfin,
3. à caractériser, de manière synthétique, le
fonctionnement du réseau trophique par les
techniques d’analyse des réseaux.
L’objectif est de comparer le
fonctionnement trophique de différents
écosystèmes et d’établir des relations entre
le mode de fonctionnement trophique et les
particularités physico-chimiques des
écosystèmes, leur biodiversité, voire leur
état de préservation (projet COMPECO et
prolongements, liens avec l’axe 1). Les
travaux de terrain et de modélisation
spécifiquement réalisés par l’équipe
porteront sur l’estuaire de la Gironde et sur
le Bassin d’Arcachon. (thèse R. Nzigou).
ACTION 3.4 : EVOLUTION A LONG TERME
DES ECOSYSTEMES
La période actuelle est caractérisée par des
évolutions marquées des écosystèmes. Ces
évolutions semblent même s’accélérer sous
l’effet conjugué du changement global et des
modifications de la biodiversité. L’impact
relatif de ces forçages est plus ou moins
marqué suivant les écosystèmes. De même, les
modifications induites ne sont temporellement
homogènes ni aux échelles inter-annuelles, ni
aux échelles intra-annuelles.
Dans ce contexte, notre objectif consiste à
caractériser fonctionnellement les
modifications observées et leur impact sur
l’écosystème. Il s’agira dans un premier temps
d’identifier, à partir des chroniques de données
existantes (SOMLIT et SOGIR notamment) :
- les modifications récentes majeures,
- les périodes (typologie des saisons,
années), et,
- les principaux forçages impliqués.
Nous nous attacherons ensuite aux
modifications de fonctionnement pour les
périodes ainsi identifiées. L’étude portera
d’une part sur l’estuaire de la Gironde pour
lequel une chronique trentenaire existe et pour
lequel des modifications à cette échelle ont
déjà été mises en évidence (séries SOGIR et
SOMLIT, financement de thèse acquis pour un
démarrage à l’automne 2009). Nos travaux
porteront également sur une série
d’écosystèmes présentant un large éventail de
caractéristiques morphologiques, hydrodynamiques
et biogéochimiques (exploitation
des données du réseau SOMLIT notamment
dans le cadre de la thèse d’E. Goberville et de
ses prolongements possibles).
55

MODELISATION EXPERIMENTALE ET
TELEDETECTION EN
HYDRODYNAMIQUE SEDIMENTAIRE :
METHYS
Responsable : Philippe Bonneton
AXE 1
Mesures et fonctionnement
hydro-sédimentaire des
environnements littoraux
AXE 2
Modélisation et analyse physique
des processus hydrosédimentaires
- Environnements turbides
-Vulnérabilité des littoraux
sableux
-Processus hydrodynamiques en
milieu peu profond
-Modélisation de l’évolution
morphodynamique des littoraux
sableux
Equipe Ecobioc
Couplages hydrodynamique/
biologie
Flux aux interfaces
Circulations littorales
Dynamique des plages sableuses
Equipe
Sédimentologie
Dynamique plateau interne
Réseau MAGEST
Jean-Marie Froidefond
Nadia Sénéchal
Aldo Sottolichio
Thésards et post-doc
Aurélie Dehouck, Florian Ganthy,
Caroline Pétus, Marjorie
Schmeltz
Personnel technique:
Natalie Bonneton
Philippe Bonneton
Bruno Castelle
Vincent Marieu
Jean-Paul Parisot
Thésards et post-doc
François Batifoulier, Anne-Claire
Bennis, Florent Birrien,
Clément Gandon, Marion Tissier
Les recherches de l’équipe METHYS visent à
mieux comprendre et modéliser les
phénomènes hydrodynamiques et
sédimentaires côtiers et plus particulièrement
ceux concernant les environnements
littoraux que sont les plages sableuses et les
systèmes lagunaires et estuariens. Notre projet
s’articule autour de deux axes de recherche
complémentaires. Le premier concerne le
fonctionnement hydro-sédimentaire des
environnements littoraux et côtiers. Des
observations in situ et à distance, combinées à
l’utilisation de modèles à l’échelle d’un
système, permettent de mieux comprendre et
prévoir son évolution et celle des écosystèmes
associés. Pendant ce quadriennal, un effort
important portera sur la réponse des
environnements littoraux à l’évolution des
forçages dans le cadre du changement
climatique. Le deuxième axe de recherche
porte sur la modélisation et l’analyse
physique des processus hydrosédimentaires.
Son principal objectif est de
progresser dans la compréhension et la
modélisation des processus physiques
fondamentaux contrôlant la dynamique
littorale. Une action majeure de cet axe
concernera le développement d’une
modélisation houle-courant tridimensionnelle
permettant de faire converger en une même
approche les modèles de circulation côtière et
littorale.
57

AXE 1 : MESURES ET FONCTION-
NEMENT HYDRO-SEDIMENTAIRE DES
ENVIRONNEMENTS LITTORAUX ET
COTIERS
Responsable : A. Sottolichio
Le domaine littoral est un environnement
sensible car soumis au double impact du
changement climatique (élévation du niveau de
la mer, modification du régime de houles,
inondations) et des activités humaines
(urbanisation, aménagements…) qui n’ont
cessé d’augmenter durant ces dernières années.
Comprendre le fonctionnement hydrosédimentaire
des environnements littoraux est
crucial pour prédire leur évolution et celle des
écosystèmes associés. Cet objectif nécessite
d’observer et de comprendre des processus
complexes intervenant à une échelle spatiotemporelle
locale, puis de les intégrer dans des
modèles de plus grande échelle (i.e., celle des
changements des écosystèmes associés). Cet
axe a comme objectif général de progresser
dans cette compréhension, en associant des
mesures in situ avec des méthodes de mesures
à distance (télédétection spatiale, aéroportée ou
fixe). L’application de modèles numériques à
l’échelle du système permet ensuite de décrire
et comprendre le fonctionnement en réponse
aux forçages, en intégrant des modèles de
processus (cf Axe 2). Ces recherches auront
comme site atelier privilégié les écosystèmes
aquitains emblématiques que sont l’estuaire de
la Gironde et le bassin d’Arcachon. Elles se
dérouleront également dans des régions plus
éloignées comme le panache Adour, l’estuaire
de la Loire, ou bien la lagune de Celestun au
Mexique.
ACTION 1.1 : DYNAMIQUE DES
ENVIRONNEMENTS TURBIDES
Les environnements turbides présentent une
concentration en sédiments en suspension plus
élevée que celle des systèmes adjacents. Ils
sont classiquement associés à des zones
dominées par la présence de sédiments fins
cohésifs : estuaires, lagunes, panaches fluviaux
ou sous-marins. Les sédiments en suspension
modifient la transparence de l'eau et donc la
production primaire. Ils constituent un support
de matière minérale et/ou organique
susceptible de servir de vecteur à des
contaminants. Les sédiments fins génèrent de
plus des flux de dépôt et d’érosion, qui
contribuent aux changements morphologiques
des environnements.
La connaissance des environnements turbides
est par conséquent essentielle à une
compréhension globale des écosystèmes
littoraux et nous nous donnons pour objectif de
progresser dans la connaissance :
1. des mécanismes qui pilotent les flux de
sédiments en suspension dans la colonne
d'eau,
2. de leur variabilité en fonction des forçages
hydrodynamiques, saisonniers et
climatiques,
3. des méthodes de quantification avec
utilisation privilégiée de la télédétection.
Transport des sédiments fins
Ce volet s’articule autour de trois objectifs
spécifiques :
Le premier concerne la réponse hydrosédimentaire
des structures turbides
estuariennes aux variations à long terme des
forçages. Prédire l’évolution hydromorphologique
dans un contexte de
changement global est un enjeu majeur pour la
gestion des estuaires dans les années à venir.
Ce sujet est encore peu abordé car il nécessite
au préalable une étude rétrospective fine et des
modèles robustes intégrant suffisamment de
processus sédimentaires (floculation, érosion,
consolidation). Nous disposons du modèle
SiAM3D (Ifremer) qui a été mis en place dans
la Gironde pour étudier cette réponse dans un
estuaire bien documenté. Le réseau de mesures
MAGEST permettra la validation de ce modèle
ainsi que la description de la dynamique des
suspensions dans le contexte actuel. Nous
analyserons ensuite la sensibilité des flux
sédimentaires aux forçages hydrodynamiques
externes à l’échelle des 50 dernières années, ce
qui permettra de hiérarchiser les facteurs
responsables des évolutions à long terme
observées au sein d’un estuaire turbide (coll.
Ifremer et Cemagref).
Le deuxième objectif est plus méthodologique.
Il concerne la quantification des flux
sédimentaires par méthodes acoustiques. Des
méthodes d’inversion du signal acoustique sont
58

développées depuis peu pour déterminer la
concentration en sédiments en suspension dans
les milieux côtiers à partir de vélocimétres
ADV et ADCP. Dans le cas des turbidités
fortes, ces inversions ne sont pas encore bien
établies. Nous avons développé une inversion
semi-empirique originale qui permet de
quantifier avec un ADV les concentrations
jusqu’à 15 g.l -1 (Sottolichio et al., 2009, en
révision). Nous comptons étendre cette
inversion aux concentrations proches de la
crème de vase estuarienne (au-delà de 30 g.l -1 ).
Puis nous appliquerons ces inversions à des
données in situ pour décrire l’évolution de la
crème de vase (coll. LEGI). Ces inversions
seront également utilisées pour estimer les
remises en suspension instantanées lors
d’évènements de courte durée, comme la
propagation du mascaret qui se développe en
amont des estuaires lors des grandes viveseaux.
Le troisième objectif concerne l’étude des
interactions physiques entre les sédiments fins
et les herbiers sur les estrans vaseux
lagunaires. La turbidité, la sédimentation ou
l’érosion des fonds conditionnent en partie le
fonctionnement écologique des environnements
lagunaires. Or, la modélisation et la
quantification de ces facteurs se heurtent à la
non-prise en compte des herbiers dans les
formules classiquement utilisées en dynamique
sédimentaire. Nous évaluerons l’effet
spécifique des herbiers de zostères sur les flux
d’érosion/dépôt au travers de suivis continu
altimétrie-biométrie, puis nous établirons des
paramétrisations semi-empiriques adaptées.
Nous les appliquerons enfin dans un modèle
établi à l’échelle d’une lagune pour quantifier
l’effet saisonnier des herbiers sur les flux
sédimentaires et les bilans globaux d’érosionsédimentation
(coll. Ifremer).
Modélisation optique et dynamique des
panaches par télédétection
Il s’agit principalement d’une recherche
méthodologique concernant l’inversion de
données optiques (spectres de réflectance) afin
de quantifier les concentrations en particules
minérales, en phytoplancton et en CDOM des
eaux côtières de surface. Ces recherches,
financées par le SHOM, seront conduites sur
plus de 400 spectres de réflectance acquis dans
les eaux côtières de l’Atlantique et du
Pacifique. L’inversion sera basée sur les
propriétés optiques inhérentes (IOP, logiciel
WASI) et en relation avec le modèle de
transfert radiatif HYDROLIGHT. Dans un
cadre plus appliqué, des recherches seront
menées sur la dynamique du panache de
l’Adour à partir d’images satellites MODIS
prises à 3 heures d’intervalle (satellite Terra et
Aqua) dans le cadre d’une convention avec le
CNES (programme TOSCA). Ces recherches
font suite aux travaux de thèse de C. Petus
(bourse Cifre/Lyonnaise des Eaux) et aux
collaborations avec l’AZTI (Espagne). Par
ailleurs, l’étude des turbidités dans le Bassin
d’Arcachon (projet Région OSQUAR) fera
appel aux données satellites du programme
KALIDEOS-Littoral (CNES). Malgré le départ
de N. Martiny, son remplacement dès 2010
permettra de poursuivre les projets en cours et
de développer des actions nouvelles sur cette
thématique.
ACTION 1.2 : VULNERABILITE DES
LITTORAUX SABLEUX
Les environnements sableux sont généralement
très dynamiques et en ajustement permanent
avec le forçage extérieur (houle et marée).
Leur dynamique est contrôlée par des
processus allant de la macro-échelle (contrôle
géomorphologique, climatologie de la houle et
variations du niveau marin) à la micro-échelle
avec les caractéristiques du sédiment et les
processus turbulents. Cette action vise
principalement à mieux appréhender la
dynamique du littoral aux échelles
événementielles, saisonnières et pluriannuelles,
afin de mieux apprécier cette
vulnérabilité. Nous aborderons deux types
d’environnements : les plages sableuses et les
embouchures lagunaires.
En termes de vulnérabilité, nous étudierons la
réponse des plages aux forçages
hydrodynamiques, en particulier lors de
conditions énergétiques et post-énergétiques.
Nous nous intéresserons plus particulièrement
à la réponse du haut de plage en soulignant le
rôle de la configuration des barres sableuses
littorales et de la marée qui peut moduler aussi
bien le temps d’action des processus le long du
profil de plage que leur intensité (données
ECORS et nouvelles campagnes, interactions
59

avec l’action 2-2). A partir d’outils statistiques
s’appuyant sur des données récurrentes
(système vidéo en fonctionnement depuis 2007
et relevés topographiques mensuels), nous
étudierons des tendances pluri-annuelles que
de récentes études ont mis en évidence, et nous
identifierions les paramètres clés qui
permettent d’expliquer la variance du système
aux différentes échelles temporelles
(évènementielle à pluri-annuelles). Une
comparaison sera alors proposée avec d’autres
types d’environnements (Pocket beach,
embayed beach, coll. University of Waikato,
NIWA, CASAGEC).
De récentes études ont mis en évidence que le
jet de rive est le principal processus impliqué
dans l’érosion du haut de plage et des dunes
lors d’événements énergétiques. De plus, il
peut présenter une très forte variabilité le long
de la côte (variabilité « longshore »). De
récents travaux ont bien proposé une
paramétrisation de l’amplitude du jet de rive,
mais ils ont peu ou pas abordé sa variabilité
longshore. Ils ont de plus essentiellement porté
sur des plages réflectives. Les données
acquises lors du précédent quadriennal
(ECORS) vont permettre d’étendre ces travaux
à d’autres environnements tout en étudiant la
variabilité longshore et les interactions avec la
morphologie. La structure spatio-fréquentielle
du jet de rive (processus gravitaire ou non), et
de son interaction avec celle de la zone de surf,
est également un élément clé de la réponse de
la plage que nous aborderons conjointement
avec l’action 2.1 et des collaborations
internationales (University of Waikato, NIWA,
NPS, Scripps Institution of Oceanography).
Les environnements lagunaires et les échanges
avec l’océan sont principalement contrôlés par
la morphologie des embouchures. L’étude
quantitative de ces environnements reste très
délicate car les mesures in situ y sont difficiles.
Nous mettrons en œuvre une approche couplée
télédétection/mesures in situ pour étudier le
bassin d’Arcachon pris comme modèle d’une
embouchure soumise à une forte énergie de
houle et de marée. De précédentes études ont
en effet mis en évidence des phénomènes de
contournement des passes (« by-passing »)
dont les mécanismes sont mal connus et pas
quantifiés. La télédétection spatiale et/ou
aéroportée sera utilisée pour analyser le
déplacement des bancs intertidaux dans les
passes et le long du littoral. Les données in situ
permettront de mieux caractériser l’impact des
vagues dans le transport sédimentaire,
principalement dominé par les courants de flot
et de jusant. Ces recherches (Projet Région
OSQUAR) utiliseront le système CIMEL
d’enregistrement automatique pour les
corrections atmosphériques. Ces analyses
seront développées grâce au programme
pluriannuel du CNES (KALIDEOS-Littoral),
avec l’aide de l’INRA, en collaboration avec
l’AST «Télédétection spatiale» de l’OASU et
en collaboration avec l’Université de
Bourgogne, suite au départ de N. Martiny.
AXE 2 : MODELISATION ET ANALYSE
PHYSIQUE DES PROCESSUS HYDRO-
SEDIMENTAIRES
Responsable : B. Castelle
Le milieu littoral est caractérisé par des
processus physiques instationnaires, très
énergétiques, qui interagissent entre eux avec
une dynamique fortement non-linéaire. Ces
interactions sont présentes à toutes les échelles
spatio-temporelles, par exemple à petite
échelle les interactions vague/vague conduisant
au déferlement, à meso-échelle la dynamique
des macrostructures tourbillonnaires et à plus
grandes échelles les phénomènes de rétroaction
entre l’hydrodynamique et les barres sableuses
littorales. L’objectif principal des recherches
développées dans cet axe est de progresser
dans la compréhension et la modélisation de
ces phénomènes hydro-sédimentaires. Un point
fort de notre démarche, par rapport à la
communauté scientifique nationale et
internationale travaillant dans ce domaine,
consiste à associer de façon étroite l’analyse de
mesures in situ hautes fréquences, la
modélisation théorique et numérique et, dans le
cadre de collaborations, la modélisation
physique en laboratoire. Cette démarche passe
par une étape d’identification et de
hiérarchisation des processus physiques, puis
une phase de modélisation explicite des
processus et finalement par une intégration des
processus dans des modèles de plus grande
échelle. Cette dernière phase est réalisée en
interaction étroite avec l’axe 1. Nos recherches
s’appuient sur de nombreuses collaborations
nationales et internationales dans les domaines
de l’océanographie physique, la mécanique des
fluides, l’ingénierie côtière et les
60

mathématiques appliquées. Elles
s’effectuent en forte interaction avec des
formations dont l’enseignement est basé
sur la même démarche pluridisciplinaire
(ex. : MATMECA à Bordeaux 1 et
MASTER OACOS-Côtier à l’UPMC).
ACTION 2.1 : PROCESSUS HYDRO-
DYNAMIQUES EN MILIEU PEU PROFOND
L’onde de marée et les vagues, lorsqu’elles se
propagent en milieu peu profond, ont une
dynamique qui devient fortement non-linéaire.
Cette transformation induit des processus
hydrodynamiques très intenses et
instationnaires qui influent fortement sur le
transport sédimentaire (cf. actions 1 et 2 de
l’axe 1). De par la complexité des processus
physiques mis en jeu et la difficulté de réaliser
des mesures dans ces environnements très
énergétiques, notre connaissance des
phénomènes hydrodynamiques reste très
incomplète. Dans le cadre de ce quadriennal,
nos efforts vont porter principalement sur
l’analyse des processus instationnaires
ondulatoires et tourbillonnaires induits par
les vagues en milieu littoral, ainsi que sur
l’étude des échanges hydro-dynamiques
entre le littoral et le plateau continental.
Processus instationnaires ondulatoires et
tourbillonnaires induits par les vagues
La dynamique non-linéaire des vagues après
déferlement reste un problème ouvert, en
particulier dans la zone de swash. Nous
analyserons les contributions respectives des
composantes gravitaires et infragravitaires
dans la dynamique de la zone de swash et nous
étudierons l’excursion maximale du jet de rive
lors de tempêtes (ANR MISEEVA). La
transformation des vagues en zone de surf et de
swash conduit au développement de
macrostructures tourbillonnaires, qui jouent
un rôle essentiel dans les processus de
transport et de mélange en milieu littoral. Nous
analyserons les mécanismes de formation de
ces macrostructures et quantifierons les
échanges de masses résultant entre le littoral et
le proche plateau continental. La
compréhension de ces processus reposera sur
l’analyse des données acquises récemment lors
des campagnes de mesures ECORS,
d’expériences de laboratoire (projet MODLIT
(RELIEFS/INSU)), mais aussi sur de nouvelles
campagnes in situ. Celles-ci associeront des
méthodes vidéo novatrices, permettant de
caractériser l’hydrodynamique de surface, à
des suivis de bouées dérivantes spécifiquement
développées pour des zones affectées par le
déferlement.
La modélisation instationnaire des processus
hydrodynamiques associés au déferlement des
vagues représente un véritable défi
scientifique. A l’heure actuelle, aucun modèle
ne peut décrire de façon satisfaisante
l’ensemble des principaux processus
hydrodynamiques liés à la transformation des
vagues en présence de déferlement. La
principale difficulté réside dans la
modélisation simultanée des processus de
dispersion et de dissipation d’énergie des
vagues. Cette difficulté concerne de la même
façon la modélisation des tsunamis et des
mascarets. En collaboration avec l’I3M, l’IMB,
l’ENS Ulm et dans le cadre de l’ANR
MathOcean, nous allons poursuivre le
développement du modèle SURF-WB (initié
dans le cadre d’une collaboration IMB et
EPOC, Marche et coll. (2007)) en introduisant
une nouvelle méthode numérique hydride
(volume fini / différence finie) permettant de
résoudre correctement les termes dispersifs des
équations de Green-Naghdi, tout en préservant
les bonnes performances actuelles du code en
terme de dissipation d’énergie des vagues
déferlées et de gestion des mouvements de la
ligne d’eau en zone de swash. Nous utiliseront
les données de laboratoire MODLIT, puis
celles in situ du projet ECORS, pour valider
SURF-WB et améliorer ces capacités à
reproduire les mécanismes de génération et de
transport des macrostructures tourbillonnaires.
Nous nous appuierons aussi sur les résultats de
la campagne de mesures consacrée à la
propagation du mascaret dans le système
Gironde/Garonne/Dordogne, qui sera réalisée
en octobre 2010. Outre l’intérêt que représente
ce phénomène pour la dynamique sédimentaire
de cet environnement estuarien (cf. action 1-1),
ce mascaret est le phénomène ondulatoire
naturel le plus approprié (car prédictible
contrairement aux tsunamis) pour tester la
capacité de SURF-WB à reproduire
simultanément les processus nonhydrostatiques
(dispersifs) et dissipatif
(déferlement).
61

Echanges hydrodynamiques entre le littoral et
le plateau continental
On connait mal les processus
hydrodynamiques dans la zone infralittorale,
qui se situe à l’interface entre le domaine
littoral dominé par le forçage de la houle et le
domaine côtier caractérisé par une forte
variabilité verticale et influencée par la rotation
terrestre. Notre objectif, dans le cadre du projet
EPIGRAM (LEFE/IDAO et ANR), consiste à
étudier l’impact des vagues sur la circulation
de la zone infralittorale et en particulier à
caractériser l’extension vers le large des
courants sagittaux ainsi que leur rôle dans les
échanges entre le littoral et le plateau
continental. Dans ce contexte, nous allons nous
appuyer sur des travaux théoriques récents
(Ardhuin et coll. (2008)), afin de développer
une modélisation couplée houle-courant
tridimensionnelle (couplage des codes
MARS3D et SWAN), permettant de décrire la
zone côtière dans sa totalité, y compris la zone
de déferlement. Nous travaillerons ensuite à
l’adaptation de ce type de modèle 3D à des
embouchures lagunaires, ainsi qu’à la mise en
œuvre de méthodes de simulations des grandes
échelles (LES) permettant de décrire la
dynamique tourbillonnaire de ces
environnements peu profonds et les échanges
de matières entre la lagune et le plateau
continental.
ACTION 2.2 : MODELISATION DE
L’EVOLUTION MORPHODYNAMIQUE DES
LITTORAUX SABLEUX
Lors des épisodes de temps calme, les barres
sableuses littorales migrent lentement vers le
bord, développant des structures rythmiques
tridimensionnelles, jusqu’à se connecter au
rivage, accélérant ainsi la reconstruction de la
plage. Pendant les épisodes énergétiques, les
barres migrent en général rapidement vers le
large, cette migration étant associée à une
disparition des structures tridimensionnelles et
à une érosion du haut de plage. Même si ce
comportement général est admis par
l’ensemble de la communauté, les processus
complexes et fortement non-linéaires régissant
ces phases d’accrétion et d’érosion sont encore
très mal compris, et donc modélisés. De
nombreuses questions restent ouvertes
concernant les interactions entre les différentes
entités de la plage (haut de plage, barre(s)
sableuse(s), corps sédimentaires plus au large)
et leur réponse aux changements de régimes de
houle.
Récemment, nous avons initié avec le code
MORPHODYN une étude théorique sur les
interactions entre ces différentes entités de la
plage (Castelle et al., soumis). Les résultats
montrent sur des cas idéalisés que les
contributions respectives de la réfraction des
vagues, de la localisation et de l’intensité du
déferlement au-dessus de(s) barre(s) plus au
large (externe(s)) vont, à travers une
modulation spatiale du champ de vagues sur la
barre interne ou le haut de plage, forcer des
structures sableuses tridimensionnelles
couplées à la morphologie plus au large. Ce
mécanisme vient également se superposer à
celui d’auto-organisation (fruit de la
rétroaction positive entre le champ de vague,
les courants induits et le transport
sédimentaire) qui jusqu’à présent était supposé
contrôler à lui seul la dynamique
tridimensionnelle des barres. La superposition
de ces deux mécanismes semble pouvoir
expliquer la forte irrégularité des systèmes
internes. Il semble également que ce
mécanisme puisse être étendu à d’autres types
de corps sédimentaires tels que les croissants
de plage ou dans certains cas les oscillations du
trait de côte. Nous voulons poursuivre ces
travaux théoriques et confronter le modèle à
des conditions réelles, en présence de la marée
et de changements de régimes de houle (Thèse
Timothy Price, UU-EPOC).
Une autre préoccupation majeure en
modélisation morphodynamique littorale est la
simulation du comportement des plages
pendant les épisodes de tempête. En effet, au
lieu de bi-dimensionnaliser les structures
tridimensionnelles, les modèle numériques
continuent de les développer jusqu’à obtenir
des morphologies irréalistes. A travers
l’exploitation de données vidéo et terrain
couvrant plusieurs décennies sur plusieurs
plages du monde (coll. UU et axe 1-2), nous
déterminerons les seuils fonctions des
conditions de houle et de marée qui permettent
de distinguer les épisodes de bidimensionnalisation
des épisodes de tridimensionnalisation,
et identifierons les
processus contrôlant ce changement de régime
morphodynamique. Dans le cadre de la thèse
de Clément Gandon (SHOM-EPOC), la
62

description 3D de l’hydrodynamique forcée
par les vagues avec le code MARS3D
permettra de mieux comprendre la structure
des courants et des flux sédimentaires audessus
des barres pendant les épisodes de
tempête et de quantifier les échanges hydrosédimentaires
entre les franges littorales et le
plateau continental. Ces avancées scientifiques
devraient permettre de mieux comprendre les
processus contrôlant la bi-dimensionnalisation
des barres.
Nous développerons des méthodes
d’assimilation de données vidéo dans les
modèles numériques (MORPHODYN/
MARS2D) afin de reconstruire la bathymétrie.
Cette méthode va être élaborée sur la base de
données unique collectée pendant l’expérience
MODLIT (RELIEFS/INSU, coll. LEGI) fin
2008 et sera ensuite appliquée à la dynamique
des plages de poche dans le pays basque
(Thèse EPOC-LASAGEC) où des relevés
bathymétriques réguliers sont effectués depuis
plusieurs années, et où l’application de la
méthode sera plus simple que sur les plages
ouvertes. L’objectif final est de disposer d’un
outil capable de reconstruire chaque jour la
bathymétrie de la plage ce qui représente un
intérêt fort en termes de base de données pour
les modèles hydro-sédimentaires, de gestion
des zones côtière et de sécurité des activités
littorales.
63

PALEOCLIMATS : PALEO
Responsable : Xavier CROSTA
L’équipe Paléoclimats étudie la dynamique
passée du climat à l’échelle du Quaternaire et
du Néogène et à toutes les latitudes par
l’analyse des archives naturelles marines et
terrestres. Sa spécificité dans le paysage
national repose sur une forte multidisciplinarité
qui lui permet d’étudier :
1. les processus élémentaires de l’ensemble
des grands compartiments du système
climatique de la Terre (Océan,
Atmosphère, Cryosphère, Biosphère) et
leurs interactions ;
2. le continuum Continent-Océan ;
3. les téléconnexions entre les différentes
ceintures climatiques.
Une autre originalité de l’équipe Paléoclimats
repose sur le développement d’outils
(diatomées et dinokystes pour reconstruire le
couvert de banquise, pollens et microcharbons
dans les carottes marines qui permettent
d’établir un lien direct entre environnements
terrestres et conditions océaniques ; couplage
rapports isotopiques – éléments traces dans les
coraux) et de plates-formes (système
d’imagerie RX-SCOPIX actuellement couplé
au banc XRF core-scanner, et à un banc de
propriétés physiques GEOTEK dans un proche
avenir) uniques dans le paysage national.
résulte de sa multi-disciplinarité, des acquis
scientifiques obtenus lors des précédents
quadriennaux, de l’émergence de nouvelles
problématiques scientifiques et des enjeux
sociétaux identifiés par la division Océan-
Atmosphère de l’INSU. La nouvelle structure
permet une lisibilité accrue du positionnement
des membres de l’équipe ainsi que de
nombreuses interactions entre les membres des
trois axes.
Les recherches conduites par l’équipe
Paléoclimats s’inscrivent dans les
problématiques scientifiques des programmes
nationaux et internationaux (cf. le document de
prospective OA –études aux interfaces en se
focalisant sur les processus d’échanges et/ou
de couplage, études dans les zones critiques
sensible aux évènements extrêmes « la
Méditerranée, les Pôles, les régions
tropicales– et le document de prospective
65

PAGES). Les recherches seront financées par
des programmes en cours ou qui débuteront
dans les deux prochaines années, ainsi que par
des réponses aux appels d’offre nationaux et
européens. Les collaborations avec les
partenaires des communautés de la
modélisation climatique, de la biologie, de la
physique et de la chimie marines, et du
domaine des SHS seront renforcées afin :
1. de rendre compte de l’ensemble des
mécanismes liés à la signature des proxies
paléoclimatiques,
2. d’intégrer formellement le couplage des
grands compartiments du système
climatique,
3. d’ouvrir notre démarche aux enjeux
sociétaux.
AXE 1 : ZONES POLAIRES –INTER-
ACTIONS ENTRE LA CRYOSPHERE,
L’OCEAN, L’ATMOSPHERE ET LA
BIOSPHERE DANS LES ZONES
POLAIRES
Responsable : F. Eynaud
La glace des zones polaires représente un
compartiment unique du système climatique de
la Terre par bien des aspects. Premièrement,
elle se trouve sous plusieurs formes (calottes
de glace, plates-formes de glace flottante et
banquise) présentant chacune une dynamique
particulière. Deuxièmement, elle se situe à
l’interface des autres compartiments du
système climatique (océan, atmosphère,
continent). Les interactions entre la cryosphère
et les autres compartiments modulent/
amplifient les flux d’énergie solaire liées aux
variations de l’orbite terrestre et sont
responsables des climats passés dans les hautes
et moyennes latitudes. Une attention
particulière sera portée à la dynamique passée
de la banquise et à son impact sur la circulation
thermohaline et le climat global, sachant que
l’équipe Paléoclimats est la seule, au niveau
national, à pouvoir estimer le couvert de
banquise à partir de séries sédimentaires.
L’étude des interactions entre la cryosphère,
l’océan, l’atmosphère et la biosphère et de
leurs relations avec les climats passés des
hautes latitudes sera principalement abordée
dans le cadre des deux actions suivantes.
ACTION 1.1 : INTERACTIONS ENTRE LA
CRYOSPHERE ET CIRCULATION THERMO-
HALINE
Les phases d'instabilités climatiques qui
ponctuent le Quaternaire constituent de riches
et rares documents susceptibles d'aider la
communauté scientifique à écrire le scénario
du climat terrestre à venir. En effet, la grande
hétérogénéité qui les caractérise tant en
amplitude qu'en fréquence, sous, qui plus est,
des contextes de forçages naturels très
différents, ouvre une large gamme d'analogues
potentiels au changement en cours.
S'il a été observé que les réservoirs
atmosphériques, cryosphériques, océaniques et
biosphériques répondent grossièrement de
concert, la logique sous-tendant l'enchaînement
temporel de leurs réponses est encore ignorée.
Par exemple, la non linéarité et l'asymétrie des
phases de bascules climatiques en réponse aux
forçages orbitaux restent toujours non
élucidées. Notre ignorance est encore plus
grande pour ce qui a trait aux échelles suborbitales.
Il est pourtant essentiel de résoudre
ces paradigmes, notamment dans les zones
polaires où le couplage cryosphère/océan de
surface n'a encore jamais été modélisé. La
dynamique de la cryosphère affecte l’intensité
et la position des courants de surface ainsi que
les phénomènes convectifs, alors qu'en retour
l'état de surface de l'océan module l’extension
de la glace de mer.
Cette action s’appuiera sur l'expertise de notre
équipe dans la reconstitution des paramètres
océaniques de surface (température, salinité,
productivité, couvert de banquise...) et sera
focalisée sur de nouvelles séries sédimentaires
à forts taux de sédimentation. L'intégration de
ces paramètres sur des séries temporelles haute
résolution permettra d'obtenir une information
clé : la composante dynamique de la
circulation océanique. De surcroît, la
collaboration avec la communauté des
modélisateurs (notamment au travers du
programme INSU LEFE-EVE, Projet RISCC),
nous permettra d’établir des scénarii couplés
modèles/données et donc de mieux
comprendre le rôle de l'océan, tout en réduisant
les incertitudes des reconstructions climatiques
produites.
66

Les périodes ciblées seront celles où le
système climatique s'emballe à savoir les
terminaisons et inceptions glaciaires, les
évènements abrupts (HE, DO) voire les
évènements "discrets" holocènes. Les sites
ateliers seront principalement l’Atlantique
Nord Est depuis l’Arctique jusqu'aux zones
tempérées, en relation avec le chantier
Méditerranée.
ACTION 1.2 : L’HOLOCENE DANS LES
ZONES POLAIRES
Le réchauffement actuel est fortement marqué
dans les régions polaires, avec cependant une
grande hétérogénéité spatiale. Le projet LEFE-
EVE TARDHOL a permis d’acquérir un
ensemble d’enregistrements marins holocènes
qui montrent que cette hétérogénéité était déjà
présente dans le passé. Les phases climatiques
parcourant l’Holocène, et la réponse des divers
compartiments, ne sont pas en phase entre l’Est
et l’Ouest des zones polaires. Ce projet n’a
cependant pas permis de déterminer les
causes/forçages de ces déphasages et de la
rythmicité holocène. Au cours de ce
quadriennal, nous étudierons de nouvelles
séries sédimentaires en haute résolution
(annuelle à séculaire) pour compléter les
résultats déjà obtenus. L’approche multiindicateurs
permettra d’étudier la dynamique
des compartiments climatiques dans une région
donnée, de les confronter aux mêmes
paramètres des autres régions afin de quantifier
les relations de phase entre les réponses
climatiques des différentes zones et d’en tirer
des informations sur les forçages. Nous
renforcerons nos collaborations avec les
communautés de glaciologues (LSCE et
LGGE) et de modélisateurs (Vrije Université
d’Amsterdam et Louvain-La-Neuve) afin de
développer des approches intégrées
(observation – modélisation – assimilation)
prenant en compte les mécanismes de couplage
entre les différents compartiments climatiques
(projets ANR CLIMICE et ESF PolarClimate
HOLOCLIP). A terme, cette Action permettra
de mettre en évidence les processus mis en jeu
dans la variabilité climatique naturelle subrécente
(forçages, rétroactions entre les divers
compartiments du système climatique interne)
et devrait, ainsi, permettre de mieux
déconvoluer la variabilité forcée d’origine
anthropique (variabilité hors fréquence,
amplitudes différentes, …) de la variabilité
naturelle dans les régions polaires afin de
réduire les incertitudes sur les évolutions
futures.
Une attention particulière sera portée aux
derniers 2000 ans et à l’Optimum Climatique
Holocène qui peut servir d’analogue au
réchauffement actuel. Les sites ateliers seront
principalement les zones côtières de la Terre
de Wilkes (Antarctique de l’Est) et de la
Péninsule Antarctique (Antarctique de l’Ouest)
pour l’Hémisphère Sud et GIN Seas
(Groënland-Islande-Norvège) ainsi que le
Détroit de Fram pour l’Hémisphère Nord.
AXE 2 : ZONES TROPICALES - BILANS
HYDRIQUE ET GEOCHIMIQUE
Responsable : B. Malaizé
Les zones tropicales sont les régions où le
rayonnement solaire moyen annuel est le plus
élevé. Ce surplus d’énergie (par rapport aux
moyennes et hautes latitudes) a des
conséquences immédiates sur le climat dans
cette région, mais aussi plus globalement, via
les transferts méridionaux entretenus par les
circulations atmosphériques et océaniques. A
ce titre, la compréhension des processus
climatiques des basses latitudes constitue un
enjeu primordial pour la compréhension du
système climatique planétaire. Trois
phénomènes particuliers seront étudiés.
Premièrement, la migration saisonnière et la
position moyenne de la zone de convergence
intertropicale (ITCZ) et ses conséquences sur
les réservoirs atmosphériques et océaniques.
Deuxièmement, la variabilité interdécennale
du phénomène El Niňo-Southern Oscillation
(ENSO). Troisièmement, la dynamique passée
des zones à oxygène minimum (ZOM) et leur
rôle de médiateur du stock en nutriments de
l’océan global. Une attention particulière sera
portée au forçage astronomique à l’origine de
ces phénomènes.
ACTION 2.1 : DYNAMIQUE DE L’ITCZ
Le bilan hydrique des basses latitudes est
contrôlé par plusieurs paramètres de
l’insolation. Le maximum des précipitations
tropicales est souvent relié à un minimum de
précession. Mais pour favoriser l’installation
de ces précipitations, la position latitudinale de
la Zone de Convergence Inter-tropicale
67

(ITCZ), dépendante de l’indice d’obliquité, est
nécessaire. Nous étudierons les liens entre le
forçage astronomique et la position de l’ITCZ,
et des précipitations associées, sur des périodes
climatiques à forts contrastes hydriques autour
des continents américain et africain. La
localisation des carottes sélectionnées pour
cette étude permettra de rendre compte de
l’hétérogénéité spatiale de la migration
saisonnière actuelle et passée de l’ITCZ.
Autour du continent américain, nous nous
focaliserons sur les périodes entre 4500-3000
ans calendaires BP (cal ans BP), entre 1000-
0 cal ans BP (forte sécheresse dans toute la
bande tropicale, changement drastique de
végétation sur l’Ile de Pâques, …). Ces études
à haute résolution temporelle s’appuieront sur
des séries coralliennes provenant de l’atoll de
Clipperton et de spéléothèmes récoltés au
Pérou (projet LEFE-EVE CLIPPER), ainsi que
sur des séries lacustres et marines de part et
d’autre de l’Amérique Centrale (projet ANR
CHOCOLATE). Les études couvriront un
large spectre analytique de la
micropaléontologie à la géochimie isotopique
et élémentaire, ainsi que les biomarqueurs
moléculaires, qui permettra de reconstruire les
caractéristiques des masses d’eaux océaniques
(température, salinité, …), l’hydrologie des
systèmes lacustres (niveau lacustre, conditions
benthiques, …), et les transferts continentocéan
(BIT index) sous l’impact de
l’alternance des phases arides et des phases
humides.
Autour du continent africain, les migrations
Nord-Sud de l'ITCZ ne sont apparemment pas
synchrones entre les régions occidentales et
orientales. Nous nous focaliserons sur l’étude
haute résolution de séries sédimentaires
prélevées au large de l’Afrique de l’Ouest et
dans l’éventail sous-marin du Nil. Plusieurs
périodes extrêmes telles que la période humide
Nabtienne (~14000-5500 cal ans BP), la
période humide Saharienne (~72000-88000 cal
ans BP) et la Mid Pleistocene Transition vers
900.000 cal ans BP seront détaillées.
L’approche multi-indicateurs permettra de
reconstruire les caractéristiques physiques et
chimiques des masses d’eaux océaniques ainsi
que les phases de transports éoliens
(sécheresses) et les phases de crues (fortes
précipitations).
ACTION 2.2 : DYNAMIQUE ET FORÇAGES
DE L’ENSO
Bien que nous ayons progressé dans la
compréhension des mécanismes d’ENSO, il
existe toujours de fortes lacunes quant au
déterminisme de la variabilité inter-décennale
de ce phénomène. Est-elle liée à d’autres
phénomènes présents dans le Pacifique (la
Pacifique Decadal Oscillation (PDO) par
exemple), ou bien est elle une conséquence de
la nature non symétrique d’ENSO (qui pourrait
ainsi engendrer la PDO) ? Si ENSO subit une
influence extérieure, prend-elle sa source dans
les tropiques ou aux moyennes latitudes, voire
aux basses latitudes ? Autant de questions qui
ne pourront être résolues que par la génération
de longues séries temporelles qui permettront
d’adresser le caractère inter-décennal de cette
variabilité. Nous proposons par conséquent de
poursuivre notre effort d’analyse de séries
coralliennes sur le dernier millénaire et sur des
périodes clefs du dernier cycle climatique,
dans des zones fortement influencées par
ENSO, essentiellement le Pacifique Ouest
tropical et Clipperton à l’Est pour rendre
compte de la variabilité spatiale de ce
phénomène et de la migration de l’ITCZ. Les
traceurs traditionnels (éléments traces et
isotopes stables) seront utilisés en priorité pour
tracer les conditions de surface (température,
salinité en relation avec les processus
évaporation-précipitation, circulation
océanique), mais de nouveaux traceurs seront
également testés (Bore, isotopes du Zinc) pour
reconstruire le pH des océans et la productivité
de surface en relation avec la profondeur de la
thermocline.
ACTION 2.3 : DYNAMIQUE DES ZOM
Les régions océaniques de basses latitudes
associées aux principaux courants de bordure
Est hébergent les zones à oxygène minimum
(ZOM) dont la variabilité actuelle est, en
particulier, sous l’influence conjointe de la
position de l’ITCZ et du phénomène ENSO.
Dans le cadre de cet axe, nous nous
attacherons à étudier :
1. la réponse des ZOM aux variations
climatiques globales et locales rapides
depuis la dernière glaciation,
68

2. l’impact des ZOM sur le climat en
particulier au travers de la pompe
biologique et les processus dénitrifiants.
Nous focaliserons notre travail sur l’étude de
sédiments de surface et de carottes
sédimentaires provenant des marges
péruviennes et équatoriennes disponibles via
une collaboration bilatérale avec l’Université
de Kiel, incluant un co-encadrement de thèse
dont les analyses sont financées en partie par le
projet COMICS (LEFE-EVE). D’autres
collaborations sont également prévues avec des
équipes américaines (Univ. Massachussets) et
d’autres équipes allemandes (Geomar) dont
l’intérêt pour :
1. les processus et mécanismes actuels
opérant en surface et dans la colonne
d’eau,
2. ainsi que la modélisation,
permettront à terme une meilleure
interprétation des signaux sédimentaires. Les
carottes sont localisées dans et autour de la
ZOM actuelle du Pacifique Est. Leur analyse
permettra de documenter les variations passées
de son extension. Les outils utilisés (XRF corescanner,
isotopes stables de la matière
organique, teneurs élémentaires C-N-Si,
biomarqueurs…) permettront de documenter
les variations passés des processus dénitrifiants
et de les confronter aux facteurs forçants
(productivité et oxygénation).
Ce travail devrait être complété par une
campagne en mer (mission Galoper, classée P1
par la Commission Nationale Flotte et Engins
– Evaluation) en 2010 ou 2011. Les
enregistrements prévus permettraient, entre
autres, d’élargir nos travaux spatialement vers
le Nord (Colombie) et l’Ouest (Galapagos)
ainsi que temporellement par l’acquisition
d’enregistrements plus longs.
AXE 3 : TELECONNEXIONS POLES-
TROPIQUES
Responsable : MF. Sanchez-Goňi
A la différence des autres axes qui
s’attacheront à comprendre les interactions
entre les divers compartiments du système
climatique interne dans une région climatique
donnée, l’Axe 3 visera à documenter les
téléconnexions entre les hautes et les basses
latitudes Nord au travers des forçages qu’elles
exercent sur les moyennes latitudes. Une
attention particulière sera portée à la région
méditerranéenne de par :
1. sa localisation géographique idéale entre
Atlantique Nord et Afrique/Asie Mineure
et des processus et forçages climatiques
associés à ces régions (banquise,
circulation thermohaline, obliquité pour les
hautes latitudes et mousson, précession
pour les basses latitudes),
2. la disponibilité d’enregistrements
permettant une bonne couverture spatiale,
3. les enjeux socio-économiques associés à
cette région.
Dans un deuxième temps, les régions
tempérées d’Amérique du Nord et de l’Europe
de l’Ouest pourront être étudiées.
ACTION 3.1 : CHANTIER MEDITERRANEE :
FORÇAGES DES HAUTES ET BASSES
LATITUDES NORD
Le climat du Bassin Méditerranéen présente
une forte saisonnalité dont la variabilité
actuelle est liée aux changements de
l’Oscillation Nord Atlantique (NAO) et des
phénomènes tropicaux et sub-tropicaux ainsi
qu’à des processus de rétroaction locaux liés,
par exemple, à l’humidité des sols ou à la
décharge de grands fleuves dont le Nil dans sa
partie orientale. Malgré la méconnaissance de
l’évolution future de la mousson et de la fonte
du Groenland, les prédictions de l’IPCC
(Intergovernmental Panel on Climate Change)
suggèrent une saisonnalité plus forte et une
sécheresse accrue en Méditerranée.
Bien que peu nombreuses, les archives
paléoclimatiques ont montré que la rentrée
d’eau douce dans l’Atlantique Nord, en
réponse à la fonte des calottes américaines et
fenno-scandinaves, a modifié de façon
importante la circulation thermohaline et
produit des réorganisations atmosphériques
affectant instantanément la Méditerranée et
les régions affectées par la mousson. Les
mécanismes de transmission de ces
perturbations et leur impact sur l’intensité de
la mousson et de la saisonnalité en
Méditerranée sont toutefois loin d’être
compris, les modèles climatiques sur cette
problématique étant encore grossiers. Nous
étudierons (pollen, microcharbons,
69

dinokystes, foraminifères, sédimentologie,
traceurs isotopiques et élémentaires,
biomarqueurs) plusieurs séquences
sédimentaires bien datées prélevées en mer
Méditerranée couvrant les derniers cycles
climatiques. La comparaison détaillée de ces
séquences avec celles de l’Atlantique Nord et
de l’Océan Indien permettra, en étroite
collaboration avec des modélisateurs, une
mise en corrélation fiable des perturbations en
Atlantique Nord, des changements du climat
méditerranéen et de l’intensité de la mousson
sous différentes conditions climatiques. A
terme, ces études permettront d’évaluer le
degré de téléconnexion entre les hautes
latitudes et les systèmes tropicaux et
subtropicaux.
Nous souhaiterions par ailleurs tester si un
mécanisme atmosphérique de type NAO, qui
résulte de nos jours en un dipôle climatique
entre l’Amérique du Nord et l’Europe de
l’Ouest, pourrait expliquer les complexités
climatiques observées sur la marge Ouest
européenne et la marge orientale nord
américaine (et les continents adjacents) au
moment des entrées d’eau douce en
Atlantique Nord. La période ciblée est les
derniers 450.000 ans et, en particulier, les
deux derniers cycles climatiques et leurs
changements climatiques abruptes. Les sites
ateliers se situent dans l'Est, le centre et
l'Ouest de la Méditerranée ainsi que la marge
Est américaine.
OPERATIONS TRANSVERSES
Parallèlement aux activités conduites dans les
trois axes, l’équipe Paléoclimats entend
développer des opérations transverses, se
nourrissant de et nourrissant les axes
principaux, pour estimer et prévoir les impacts
environnementaux des changements globaux
afin, entre autres, de répondre aux demandes
sociétales.
ACTION 1 : PALEOCLIMATS ET SOCIETES
Cette action regroupe deux contextes
temporels au cours desquels les relations entre
les sociétés humaines et le climat sont
différentes. Premièrement, un contexte
préhistorique durant lequel l’Homme subit les
variations climatiques tout en essayant de
s’adapter et de survivre. Deuxièmement, un
contexte historique au cours duquel l’Homme
subit les variations climatiques mais influe
également sur le climat de par sa
sédentarisation et ses activités industrielles,
agricoles ou culturelles.
L’étude du contexte préhistorique s’appuiera
sur une forte collaboration avec des
préhistoriens (UMR 5199 PACEA) afin
d’évaluer la capacité des populations humaines
à s’adapter aux situations environnementales
reflétées par les séquences paléoclimatiques
marines, terrestres et de glace. Ces nouvelles
informations, couplées aux données
paléoclimatiques et aux données
archéologiques déjà disponibles, nous
permettront de préciser comment les
changements climatiques ont influencé
l’évolution et la distribution des populations.
Ces recherches seront supportées par
l’intégration de modélisations climatiques
forcées par certains paramètres
paléoclimatiques (SST, précipitations,
insolation…).
L’étude du contexte historique s’appuiera sur
une forte collaboration avec des
archéogéologues (PACEA, IFEA Pérou,
MNHN Paris) afin de déconvoluer les
variations environnementales du contexte
sociétal (eg. lutte de clans). Pour chaque
chantier, l’équipe Paléoclimats se focalisera
sur l’étude de séries sédimentaires lacustres et
marines à proximité de sites civilisés. Les
interactions climat-sociétés seront abordées :
1. dans les domaines arctique et subarctique
où la variabilité climatique et océanique
des derniers 2000 ans est supposée avoir
fortement influencée la dynamique de
colonisation des populations vikings en
direction du Groenland et de Terre Neuve ;
2. dans les zones tropicales américaines
continentales ainsi que sur les îles
adjacentes des Caraïbes et du Pacifique où
la dynamique de l’ITCZ est supposée avoir
fortement influencée les civilisations
Mayas (Péninsule du Yucatan), Saladoïdes
(Caraïbes), Chachapoyas (Nord Pérou), et
Rapa Nui (Ile de Pâques).
70

ACTION 2 : DEVELOPPEMENTS DE PRO-
XIES ET DEVELOPPEMENTS ANALYTIQUES
L’étude des environnements et climats passés
nécessite une connaissance approfondie des
traceurs (proxies) permettant la reconstruction
indirecte des paramètres environnementaux,
mais aussi le développement d’outils
analytiques de plus en plus performants tant
sur le plan du type d’analyse que de la quantité
et qualité des mesures. L’équipe Paléoclimats
poursuivra son effort de développement/
calibration des traceurs microfossiles
carbonatés, siliceux et organiques, notamment
concernant les biomarqueurs, afin d’optimiser
les reconstructions quantitatives des
paramètres environnementaux et des traceurs
géochimiques et isotopiques afin d’optimiser
les estimations de paléoproductivité et de
circulation océanique. Dans cette optique, nous
étudierons la formation des signaux
biologiques et biogéochimiques dans l’océan
de surface, leur transfert dans la colonne d’eau,
leur enfouissement et préservation dans les
sédiments marins grâce à des prélèvements
d’eau et de plancton, des pièges à particules et
des carottes d’interface (projet de l’Université
de Kiel SFB 754, ANR FORCLIM, ANR
CLIMICE).
L’équipe Paléoclimats a récemment acquit un
XRF core-scanner et des microscopes
motorisés couplés à l’analyse automatisée
d’images qui permettent l’accès à de nouvelles
données géochimiques, micropaléontologiques
et sédimentologiques. Ces nouveaux équipements
seront développés afin de valider les
mesures, puis de définir et calibrer de
nouveaux proxies.
71

SEDIMENTOLOGIE : SEDIMENTO
Responsable : Sébastien ZARAGOSI
De nombreuses questions sociétales (devenir
des polluants, vulnérabilité des zones côtières,
importance des événements extrêmes,
exploitation et surexploitation des ressources,
etc.) ne peuvent être traitées sans données sur
le sous-sol océanique. Dans ce contexte, les
objectifs de l’équipe Sédimentologie consistent
à :
1. étudier le fonctionnement et l’architecture
des systèmes sédimentaires marins depuis
le proche continent jusqu’aux
environnements profonds,
2. quantifier les transferts sédimentaires et
bilans de matière vers l’océan profond,
3. connaître l’impact de la sédimentation
événementielle et des événements
extrêmes sur ces systèmes.
L’équipe Sédimentologie fait partie de la
thématique « Géosciences marines » de l’UMR
EPOC. L’équipe s’est structurée en deux axes
thématiques. L’axe 1, Héritage et processus
sédimentaire sur la morphogénèse des
marges représente la continuité des actions
traditionnellement menées par l’équipe. Cet
axe émarge principalement au comité
thématique « Ressources géologiques et
développement durable » de l’INSU ST. L’axe
2, Transferts et archives sédimentaires
représente la poursuite de recherches qui se
sont développées au cours du dernier contrat
quadriennal. Cet axe émarge aux comités
thématiques « Couplage Terre interne-Terre
externe » et « Risques et catastrophes
telluriques » de l’INSU ST.
Une partie des recherches conduites au sein de
l’équipe ayant de fortes implications
industrielles, l’équipe est intégrée
nationalement dans les réseaux de recherche et
à l’action thématique INSU Actions MARGES
qui regroupent des EPIC-EPST (BRGM,
IFREMER, SHOM, IFP, …) et des industriels
(AREVA, GDF-SUEZ, TOTAL,…).
73

AXE 1 : HERITAGE ET PROCESSUS
SEDIMENTAIRES SUR LA
MORPHOGENESE DES MARGES
Responsable : H. Gillet
Les marges sont à la fois une zone de piégeage
et de transfert sédimentaire. Leur morphologie
dépend d’une part des processus
hydrodynamiques et sédimentaires actuels qui
modifient la couverture récente (influence de la
néotectonique et du climat) et de leur structure
qui s’exprime en surface (héritage, tectonique,
fluide).
Cet axe de recherche constitue une continuité
des travaux de l’équipe qui, jusqu’alors, a
obtenu la majorité de ses résultats sur les
marges passives dominées par les apports
silicoclastiques et sur des périodes de temps
courtes pour lesquels le principal facteur de
contrôle externe sur la répartition des dépôts
est le climat. Dans le prochain quadriennal, cet
axe sera élargi à des systèmes plus complexes
(production carbonatée, marges tectoniquement
actives) et les dépôts seront étudiés
sur des échelles de temps plus longues où
l’influence de la tectonique et de l’eustatisme
ne sont plus négligeables.
Dans ce cadre, le développement des outils de
modélisation hydrodynamique ou stratigraphique
devient une nécessité. Il permettra
en effet d’intégrer les deux forçages
(hydrodynamique et héritage) pour comprendre
la formation et l’évolution des marges à
différentes échelles de temps.
Nous nous efforcerons de répondre à deux
questions principales, l’une ayant trait au
contrôle externe (surface), l’autre au contrôle
profond (structure).
ACTION 1.1. QUELS SONT LES PROCESSUS
SEDIMENTAIRES RECENTS QUI AGISSENT
SUR LA MORPHOLOGIE ACTUELLE DES
MARGES ET QUELS SONT LEURS
FACTEURS DE CONTROLE ?
Nous proposons, dans un premier temps, de
relier les processus hydrodynamiques aux
dépôts instantanés, par des mesures in situ sur
le fond marin (courantométrie, turbidimétrie,
piège à sédiments, …) et par le prélèvement
des dépôts associés à l’aide de carottiers
d’interface. La réalisation conjointe de mesures
récurrentes ou sur de longues périodes de
temps permettra le suivi de l’évolution des
corps sédimentaires (sur le plateau aquitain) ou
des cicatrices de glissement (dans la tête du
canyon de Capbreton), et ainsi d’obtenir une
analyse des processus qui ont une période de
retour pluri-annuelle pour laquelle
l’observation in-situ est insuffisante.
Il deviendra alors possible d’étudier la
variabilité spatiale des corps sédimentaires à
l’échelle kilométrique (par exemple les bancs,
placages sableux, sillons érosifs, vasières…)
sur le plateau continental et leur taux de
préservation à l’échelle pluri-annuelle ou
décennale. Nous mettrons l’accent sur :
1. l’influence des obstacles sur le transport
sédimentaire,
2. le transport des sédiments de densités
différentes de celle du quartz : matière
organique (marge ouest-Afrique),
sédiments carbonatés (Bahamas)…).
Les résultats seront comparés à ceux acquis par
l’équipe dans les environnements silicoclastiques
et qui ont fait sa réputation
internationale. Des comparaisons seront
également conduites avec les dépôts anciens
(SE de la France) en vue d’expliquer la genèse
des hétérogénéités primaires d’origine
sédimentaires observées à l’échelle du faciès
(centimètre-mètre) dans des dépôts
d’apparence massive à l’échelle de la sismique
industrielle, par exemple des barres gréseuses
ou calcarénitiques de plusieurs mètres de
puissance. Cette recherche dans les dépôts
anciens, nouvelle pour l’équipe implique :
1. le maintien et l’élargissement de nos
partenariats industriels (hétérogénéités
dans les réservoirs avec des implications
dans la récupération des hydrocarbures, des
réservoirs d’eau ou du stockage de CO 2 ) ;
2. et le « placement » des étudiants de Master
et Doctorat.
ACTION 1.2. : QUEL EST LE ROLE DE
L’HERITAGE ET DE LA STRUCTURE DES
MARGES SUR LEUR MORPHOLOGIE
ACTUELLE ?
Outre les processus actuels ou récents
(Quaternaire), la morphologie des marges
résulte du contrôle profond qui s’exprime en
surface, soit par la création de reliefs
(tectonique cassante, salifère, volcans de
boues,…) ou d’apports profonds (fluides) qui
vont influencer, soit le transfert sédimentaire
(formation d’obstacles), soit le déclenchement
74

des processus eux-mêmes (liquéfaction,
séismicité).
Nos travaux s’appuieront sur la description de
dépôts restreints et des corps sédimentaires qui
modèlent les marges de l’échelle de la dizaine
de mètres à celle de la dizaine voire de la
centaine de kilomètres : systèmes turbiditiques
profonds et masses glissées en bas de pente,
canyons, cicatrices de glissement et
pockmarks. Ils nécessiteront l’acquisition :
1. de données bathymétriques et d’imagerie
de très haute résolution pour la description
des morphologies,
2. de données de sismique réflexion HR et
THR pour l’analyse des géométries
internes, des structures tectoniques ou des
zones de remontées de fluides.
AXE 2 : TRANSFERTS ET ARCHIVES
SEDIMENTAIRES
Responsable : S. Schmidt
Cet axe de recherche vise à reconstruire les
flux de matière vers l’océan à différentes
échelles temporelles, c’est-à-dire depuis
l’échelle saisonnière jusqu’au million
d’années. Il s’articule autour de plusieurs
questions.
ACTION 2.1. : COMMENT S’EFFECTUENT
LES TRANSFERTS DE PARTICULES DES
ZONES COTIERES AUX GRANDS FONDS A
L’ACTUEL ? QUELS IMPACTS ONT LA
PERTURBATION ANTHROPIQUE ET LE
RECHAUFFEMENT GLOBAL SUR CES
MECANISMES ?
De leur source continentale à l’océan profond,
les sédiments du domaine côtier et du plateau
continental se déplacent sous l’effet des
forçages hydro-météorologiques et des
activités humaines. Ces mouvements et la
turbidité qu’ils induisent affectent les
évolutions du trait de côte et des vasières ainsi
que la transparence des eaux côtières. Les
mouvements sédimentaires en milieu marin
résultent d’une combinaison de facteurs
dynamiques naturels et anthropiques :
- apports par les fleuves – largement
modifiés au cours des dernières décennies
du fait de l’aménagement des cours d’eau ;
- remise en suspension sous l’effet des
courants de marée, des vagues, de la houle
et des activités humaines ;
- transferts de sédiment sous l’effet des
vagues, des courants de dérive depuis la
côte, au travers du plateau continental vers
les grands fonds.
Une meilleure compréhension de l’ensemble
de ces processus requiert la connaissance des
entrées/sorties du système : apports par les
fleuves, piégeage par les estuaires, pertes
nettes sur les pentes continentales, souvent
accélérées en présence de canyons sousmarins.
Il est également important de
caractériser les flux de sédiments sur
l’ensemble du plateau continental, leur
variabilité à différentes échelles de temps, la
prise en compte des évènements exceptionnels
et leurs tendances, en fonction des forçages
naturels actuels et prévisibles.
Dans le Golfe de Gascogne, le programme
ECOFER s’était concentré sur le transfert dans
le canyon du Cap Ferret. Les enregistrements
des pièges à particules, obtenus dans le cadre
de l’ANR FORCLIM (2006-2009), ont montré
des fortes variations saisonnières, plus
marquées en hiver, des flux particulaires sur la
marge aquitaine. Il est maintenant nécessaire
de relier ces flux avec les apports par les
fleuves et les transferts sédimentaires sur le
plateau.
L’estuaire de la Gironde est la principale
source de matériel sédimentaire pour la marge
aquitaine. Saisir l’évolution des apports
sédimentaires de la Gironde face aux
changements climatiques et aux impacts
anthropiques nécessite une base de données
que le réseau de surveillance MAGEST
propose d’acquérir sur plusieurs années. Les
transferts depuis le plateau seront appréhendés
au moyen de futures missions instrumentées
(ADCP, pièges à sédiments) dans le Golfe de
Gascogne.
ACTION 2.2 : PEUT-ON RECONSTRUIRE
D’UNE FAÇON FIABLE LES PALEO-FLUX
DES GRANDS SYSTEMES FLUVIATILES A
PARTIR DE LEURS DEPOTS PROFONDS ?
Pour pouvoir anticiper l’évolution future des
systèmes fluviatiles, il est primordial de
connaître leur évolution naturelle. Mais
l’absence d’enregistrements de très longue
75

durée ne permet pas de connaître directement
la réponse de ces systèmes face aux forçages :
1. basses fréquences comme l’impact de la
tectonique affectant les bassins versants,
2. hautes fréquences comme les cycles
climato-eustatiques ou les variations
abruptes du climat.
Une solution consiste à approcher cette
évolution à partir de l’analyse des dépôts
profonds de grands systèmes fluviatiles. En
effet, l’évolution des flux sédimentaires, de la
fréquence des écoulements gravitaires, de la
nature granulométrique et minéralogique des
dépôts profonds peut être, dans certains cas,
reliée directement à l’évolution du régime
hydrologique de la source sédimentaire. Cette
approche sera appliquée sur les dépôts
profonds issus de fleuves majeurs situés dans
des contextes climatiques et tectoniques
différents (Nil, Danube, Paléo-fleuve
Manche, …). Ce travail devrait nous permettre
de mettre en évidence les processus contrôlant
les flux, et ce, qu’ils soient autocycliques
comme la morphologie du bassin ou bien
allocycliques comme le climat, l’eustatisme et
la tectonique.
ACTION 2.3 : QUELLE EST LA PART DE LA
SEDIMENTATION EVENEMENTIELLE DANS
LES FLUX VERS L’OCEAN PROFOND ?
L’enregistrement sédimentaire est par essence
non continu. Le bruit de fond de la
sédimentation (pluie pélagique) est entrecoupé
par des événements sédimentaires
« instantanés ». Ces derniers témoignent de
phénomènes de haute énergie, à savoir les
tsunamis, tempêtes, crues majeures, débâcles
glaciaires, éruptions volcaniques, séismes…
L’analyse des archives sédimentaires permet
d’identifier ces événements, qui s’expriment
sous la forme de séquences élémentaires de
dépôt, et de déterminer les mécanismes de
sédimentation en identifiant les conditions
hydrodynamiques de leur mise en place. Cette
étape d’identification permet, à terme, en
s’appuyant sur la datation des événements, de
déterminer leur fréquence et d’établir des
calendriers. Ces données permettent de faire la
part de ces apports instantanés dans les flux
vers l’océan profond. Elles sont en outre
essentielles pour définir les temps de retour des
phénomènes et constituent dès lors un élément
important dans le dimensionnement des
risques. Ces données devraient également
permettre d’estimer l’influence du forçage
climato-eustatique sur la récurrence des
processus gravitaires.
Ce travail nécessite également de préciser la
part des apports depuis le domaine continental
(crues) et côtier (tempêtes, backwashs de
tsunamis…) au regard des remaniements
depuis le plateau continental et/ou le talus.
Cette question scientifique centrale et
fondamentalement multidisciplinaire devra être
abordée dans des contextes climatiques et
tectoniques différents. Les différents chantiers
sur lesquels travaillent les chercheurs de
l’équipe permettront cette approche (Sumatra,
Chili, les Canaries, la Réunion, Islande, marge
du Nil et Golfe d’Oman).
ACTION 2.4 : QUELLES SONT LES
MODALITES DE L’ENREGISTREMENT
SEDIMENTAIRE DE LA PALEOSISMICITE ?
Le passage des ondes sismiques dans les séries
sédimentaires induit une accélération
susceptible de perturber l’enregistrement
sédimentaire en provoquant la fracturation
et/ou la liquéfaction des sédiments
préalablement déposés. L’accélération cosismique
peut également provoquer,
particulièrement dans les bassins confinés, une
mise en oscillation de la colonne d’eau. Cette
dernière conduit à une érosion des sédiments
superficiels et à leur re-sédimentation. Enfin,
les séismes sont des facteurs de déclenchement
d’instabilités gravitaires co-sismiques.
Déterminer la part de chacun de ces processus
est capital pour l’analyse de l’enregistrement
sédimentaire de la paléosismicité et la
construction des calendriers de la sismicité
passée. Les chantiers principaux où sont menés
ces travaux sont la mer de Marmara, le Golfe
de Corinthe et le Golfe d’Oman. Les approches
seront basées pour l’essentiel sur l’analyse des
dépôts dans les carottes marines (structures
sédimentaires, variations granulométriques en
réponse à l’accélération co-sismique) et sur la
datation des dépôts récents (radio-isotopes à
très courte durée de vie, radiocarbone) pour
l’établissement des calendriers paléosismiques.
On s’attachera, en particulier, à discriminer les
structures co-sismiques s.s. de celles liées au
passage des ondes de tsunami et aux effets de
seiches (structures en réponse à l’oscillation de
la colonne d’eau). Les équipements du
laboratoire de Sédimentologie (radiographie X,
76

micro granulométrie, lithopréparation de
sédiments mous) sont bien adaptés à ce type
d’études.
AXES TRANSVERSES
AT 1 : MODELISATION
La modélisation est devenue un outil
indispensable de validation des concepts
d’érosion, transport et dépôt des sédiments
(modélisation hydrodynamique et
géotechnique) ou de géométrie spatiotemporelle
(4D) des corps et des systèmes
sédimentaires (modélisation stratigraphique).
L’équipe est investie dans des projets de
mesures in situ des processus. Ces mesures
ainsi que les dépôts associés peuvent être
comparés à des résultats de modèles
hydrodynamiques classiques ou de modèles
physiques simplifiés (par exemple basés sur le
concept des automates cellulaires), moins
coûteux en temps et de ce fait, potentiellement
capable de reproduire la sédimentation et
l’érosion en plus du transport. Le thème
classique de l’analyse des instabilités
sédimentaires, que ce soit dans les dépôts
actuels ou anciens, nécessite toujours une
phase de modélisation mécanique
(géotechnique) afin de valider l’action d’un ou
de plusieurs facteurs agissant sur leur
déclenchement (pente, taux de sédimentation,
remontée de fluides, érosion, séisme, houle…).
Ces résultats de modélisation sont une aide à
l’interprétation des processus par l’analyse des
structures sédimentaires ou de l’identification
des sources. En outre, l’équipe est en train
d’acquérir des jeux de données considérables
sur certains sites aussi bien dans l’ancien
(Annot) que dans le récent (Golfe de
Gascogne, Cadix). Ces bases de données sont
suffisantes pour alimenter correctement des
modèles stratigraphiques. Le recrutement d’un
enseignant chercheur en « Modélisation
sédimentologique » au cours de ce quadriennal
devra permettre de développer cet axe
transverse.
réseau de surveillance MAGEST propose
d’acquérir. Ce réseau MAGEST (MArel
Gironde ESTuaire) est basé sur le déploiement
de quatre stations automatisées (Marel :
Libourne, Portets, Port de Bordeaux, Pauillac)
qui mesurent: température, salinité, turbidité et
taux d’oxygène des eaux estuariennes, et les
transmettent toutes les 10 minutes à l’OASU
(http://www.magest.u-bordeaux1.fr/). Le personnel
de l’équipe sédimentologie est
fortement impliqué dans sa coordination et sa
mise en œuvre depuis sa mise en place en
2005. L’installation d’une cinquième station à
l’embouchure, pour contraindre les flux
exportés, est en cours de discussion.
En domaine profond, les techniques
d’observation sont, pour des raisons évidentes
d’accessibilité, plus discontinues. Elles
consistent essentiellement en la pose de
courantomètres et de pièges à sédiment. Au
cours du dernier quadriennal, en collaboration
avec le SHOM, l’IFREMER et le BIAF,
plusieurs canyons des marges métropolitaines
(canyons du Var, de Capbreton, d’Audierne et
de Blackmud) ont été instrumentés. Ces efforts
d’instrumentation seront maintenus pendant le
prochain contrat quadriennal.
AT 2 : OBSERVATION
Saisir l’évolution de l’estuaire de la Gironde,
principale source de matériel sédimentaire du
Golfe de Gascogne, face aux changements
climatiques et aux impacts anthropiques
nécessite des données conséquentes que le
77

LES GROUPES DE TRAVAIL
Dans sa nouvelle configuration, l’UMR EPOC
comptera sept équipes réparties en trois
thématiques : Ecotoxicologie, Océanographie
Côtière et Géosciences Marines. L’une des
caractéristiques de ce nouvel ensemble
consistera donc en une accentuation de la
pluridisciplinarité qui était déjà forte au sein
d’EPOC lors de la précédente
contractualisation. Dans ce contexte, il apparaît
essentiel de développer des actions favorisant
les interactions entre équipes et par là, la mise
en œuvre d’une interdisciplinarité effective. La
mise en œuvre de plates-formes
expérimentales et analytiques (voir par ailleurs
dans ce document et dans le document
Prospectives de l’OASU) est un élément qui va
dans ce sens à partir d’une mutualisation de
potentiels techniques de l’UMR. La création de
groupes de travail vise quant à elle à créer des
communautés de scientifiques trans-équipes
autour d’objets/objectifs communs dont deux
ont été identifiés à ce jour :
1. la modélisation,
2. le développement de nouvelles techniques
d’observations automatisées à haute
fréquence.
Groupe de travail 1 : Modélisation
(Responsable : P. Lecroart)
La modélisation s’apparente à une procédure
de simplification d’une réalité dans le but de
mieux l’appréhender et de la comprendre.
Dans cette acception très générale, elle
constitue de manière explicite ou implicite,
l’essence même du travail du chercheur qui
s’intéresse à la compréhension du
fonctionnement de l’environnement. La
modélisation constitue par conséquent un
domaine d’expertise scientifique transversal
dans la mesure où les mêmes approches/
procédures peuvent être appliquées à différents
domaines d’études. Depuis quelques années se
sont développées de nouvelles méthodes en
modélisation qui font appel à des outils
mathématiques et physiques de complexité
croissante en relation avec le développement
des méthodes numériques et des capacités de
calculs des ordinateurs. S’il est difficile pour
une seule et même personne de maîtriser
l’ensemble de ces méthodes, chacune d’entre
elles peut par contre s’appliquer à des champs
disciplinaires différents.
Le développement de la modélisation au sein
de laboratoires pluridisciplinaires se fait
souvent par l’intermédiaire des équipes qui
ressentent chacune, et de manière largement
indépendante, tout l’intérêt de s’approprier
l’outil « Modélisation ». Il en résulte une
situation caractérisée par la coexistence au sein
de l’UMR de petits groupes de modélisation
abrités par les équipes et n’interagissant que
peu entre eux. La future UMR comporte douze
modélisateurs répartis entre quatre équipes. La
modélisation est concentrée dans l’équipe
METHYS mais dispersée dans les autres
équipes. Trois domaines de compétences
peuvent être définis :
1. modélisation statistique,
2. traitement du signal,
3. simulation numérique appliquée à l’étude
des processus physiques, biologiques et
chimiques.
Une telle situation n’est clairement pas
optimale pour plusieurs raisons :
1. elle ne permet pas à l’UMR dans son
ensemble d’être lisible dans le domaine de
la modélisation,
2. elle ne favorise pas en interne l’attribution
de moyens techniques et humains,
3. elle limite les échanges entre communautés
d’expérimentateurs et de modélisateurs, et
enfin,
4. elle complique le recrutement de nouveaux
modélisateurs par l’UMR.
Le rôle des équipes en tant que maillon
essentiel de la structuration scientifique de
l’UMR EPOC étant réaffirmé, et l’objectif
affiché étant de promouvoir l’interdisciplinarité,
il n’apparaissait pas opportun de
créer de novo une équipe « Modélisation ». La
formation d’un groupe de travail (structure
souple relevant directement du Chargé de
Mission « Animation scientifique ») autour de
cette thématique vise par contre à limiter les
79

effets pervers mentionnés ci-dessus. Elle
répond également à l’incitation forte des
précédents comités d’évaluation de l’UMR
EPOC et de l’AERES à faire émerger des
projets innovants.
Le groupe de travail « Modélisation » de la
future UMR EPOC intéragira étroitement avec
les modélisateurs des autres laboratoires
bordelais en tirant partie des ressources
humaines remarquables dans le domaine de la
modélisation numérique, des mathématiques
appliquées et de la dynamique des fluides
(Ecoles d’Ingénieurs MATMECA et
ENSEIRB, Laboratoire MAB, TREFLE).
Le Groupe de Travail « Modélisation » restera
une structure légère, entièrement financée par
les ressources propres de l’UMR. Son action
sera principalement constituée par la mise en
place d’une série régulière de réunions et
d’ateliers qui permettront de :
1. Partager l’expertise et initier des actions
de formation : le Groupe de Travail
permettra une amélioration des pratiques
en terme de modélisation par le partage des
compétences et des rendus d’expérience.
En liaison avec le plan de formation de
l’UMR, il initiera des actions de formation
des personnels permanents et des
doctorants à des approches et des logiciels
spécifiques (e.g., R, MATLAB). Il
participera également à l’amélioration de la
formation des étudiants dans le domaine de
la modélisation.
2. Développer la modélisation au sein
d’EPOC : Le Groupe de Travail sera en
charge de définir et de proposer à la
Direction de l’UMR une politique de
développement des activités de modélisation
en étroite concertation avec les
équipes thématiques. Cette politique
comprendra à la fois des aspects techniques
(initiation d’une réflexion sur la mise en
commun des moyens existants et
élaboration de nouveaux projets
d’équipement), et scientifiques (information
des personnels du laboratoire sur
les compétences et les ressources
présentes, définition de nouveaux projets
(dont des thèses) incluant de la
modélisation, accompagnement des
doctorants concernés).
3. Améliorer la lisibilité de la modélisation
dans et hors EPOC : Le Groupe de Travail
facilitera notamment l’implantation de
nouveaux modélisateurs au sein des
équipes d’EPOC. Il constituera également
une interface privilégiée entre EPOC et les
autres laboratoires pour ce qui concerne les
activités et le partenariat en matière de
modélisation.
Groupe de travail 2 : Observations
automatisées à Haute Fréquence
(Responsable : B. Sautour)
En milieu marin, le concept d’Océanographie
opérationnelle et les opérations d’observation
automatisée de terrain (de type Argo) se sont
historiquement développés dans l’océan ouvert
avec, par analogie avec la météorologie, un
fort accent porté sur les données physiques
(température, salinité, courant). Le programme
Mercator a maintenant fait la démonstration de
la pertinence et de la viabilité de ce concept en
milieu hauturier si bien qu’un intérêt de plus en
plus grande est portée à son extension à la zone
côtière en lien avec la gestion des milieux et
des risques. L’objectif opérationnel consiste à
acquérir des données à une fréquence
cohérente avec les processus s’exprimant en
milieu côtier en s’affranchissant des
contraintes opérationnelles de terrain.
L’objectif scientifique consiste à caractériser
les variations aux différentes échelles
temporelles, afin d’optimiser la connaissance
des processus et de prendre en compte la
nécessité de plus en plus prégnante d’apporter
des réponses en « quasi temps réel »,
notamment à des fins de gestion.
La forte productivité des zones côtières et leur
sensibilité au contexte actuel de changement
global ainsi qu’à l’exploitation et à
l’anthropisation du milieu, induit la nécessité
de suivis de variables environnementales
descriptives des forçages mais aussi
d’indicateurs du fonctionnement et de la
qualité écologique des écosystèmes. De tels
indicateurs sont principalement de nature
biogéochimique et biologique. Autant
l’acquisition automatisée des principaux
paramètres physico-chimiques est maintenant
rodée et fiable, autant celle des données
biogéochimiques et biologiques (hors biomasse
phytoplanctonique) nécessite encore un travail
conséquent de développement. La mise en
80

place d’observatoires opérationnels du milieu
côtier qui soient crédibles dans une optique de
gestion passe par clairement par ce type de
développements.
Les personnels d’EPOC possèdent une
expérience intéressante dans ce domaine qui
résulte principalement d’opérations pilotées
individuellement par les équipes : réseau
MAGEST pour les équipes ECOBIOC et
SEDIMENTO, observations vidéo des plages
aquitaines pour METHYS, suivi en temps réel
du degré d’ouverture des mollusques
lamellibranches par valvométrie HFNI pour
EA, et mesure de flux intégré spatialement par
eddy covariance pour ECOBIOC. Cet
ensemble se trouve encore renforcé par les
compétences en termes d’imagerie
sédimentaire et de traitement d’images vidéo
des personnels récemment recrutés au sein
d’ECOBIOC. Il convient maintenant de
coordonner ces initiatives à l’échelle de l’UMR
par la création d’un Groupe de travail consacré
à l’acquisition automatisée de données haute
fréquence.
L’action de ce groupe de travail sera triple.
Elle permettra de :
1) Parfaire la mise au point et d’initier la
conception de nouveaux capteurs
biogéochimiques et biologiques. A ce jour,
nous avons identifié quatre opérations de
ce type :
a. la poursuite de la mise au point de la
valvométrie HFNI qui est pratiquement
totalement achevée pour les
milieux tempérés et tropicaux mais
nécessite encore certains
développements en milieu arctique (cf.
Axe 2 des prospectives de l’équipe
EA),
b. le développement de processus automatiques
de traitements des images de
profils sédimentaires en vue de la
fourniture de données sur la qualité
écologique des milieux à des échelles
de temps compatibles avec des
observatoires opérationnels (i.e., 6
jours pour MECATOR) (cf. Axe 1 de
l’équipe ECOBIOC),
c. La mise au point de systèmes
d’acquisition et de traitement au
travers de traits de vie essentiels des
organismes benthiques que sont le
recrutement et l’activité épi-benthique,
d. la mise en place d’un suivi du
fonctionnement global de l’écosystème
au travers de son métabolisme
(respiration/photo-synthèse, eddy
covariance) sous la dépendance de la
qualité et de la quantité des apports
marins et continentaux (activité des
producteurs primaires et recyclage de
la matière organique). L’application de
cette méthode au littoral sera
poursuivie (mise au point technique et
théorique complexe, inhérente aux
spéci-ficités du milieu intertidal). Les
objectifs à moyens termes seront
orientés vers une approche quantitative
et le développement de routines de
calcul des flux et des corrélations avec
les paramètres environnementaux ainsi
que le couplage avec un système sous
l’eau (interface eau-sédiment pendant
l’immersion). La mise au point de
l’ensemble de ces capteurs sera pour
l’essentiel réalisée dans la partie
interne du Bassin d’Arcachon.
2) Partager l’expertise existante. Ce volet
sera conduit à partir d’une série de
réunions et d’ateliers. Il vise à faire
bénéficier la mise au point des nouveaux
capteurs de l’expérience déjà acquises par
les personnels d’EPOC en termes de :
a. sites et stratégies d’acquisition,
b. signification/redondance/complémentarité
des paramètres,
c. problèmes et solutions techniques
(alimentation en énergie, trans-mission
des données, calibration maintenance
des systèmes),
d. stockage/traitement/diffusion des
données.
3) Tester la faisabilité de la mise en place
d’une station permettant un suivi
opérationnel en milieu littoral: Cette
opération consistera à instrumenter le site
dit « Bouée 13 » à l’entrée du Bassin
d’Arcachon dans une optique de suivi
opérationnel. Elle sera dans un premier
temps réalisé dans le cadre d’un projet
régional qui prévoit le mouillage conjoint :
d’un ADCP, d’une sonde multi-paramètres
81

équipée de capteurs de température,
salinité, turbidité et fluorescence, ainsi
qu’un système de valvométrie HFNI. Ce
système sera complété au fur et à mesure
des progrès réalisés sur la mise au point de
nouveaux capteurs. L’analyse conjointe
Du fait des montants financiers en jeu et à la
différence du précédent, ce groupe de travail
ne sera pas uniquement financé par les
ressources propres de l’UMR. Il inscrira au
contraire les différents volets de son action au
sein de programmes régionaux (OSQUAR
pour la faisabilité d’une station multiinstrumentée),
et de réseaux nationaux
(opération acquisition haute fréquence du
Réseau National des stations Marines) ainsi
que d’un projet européen (JERICO, projet
d’observatoire côtier dont IFREMER est le
coordonateur et le RNSLM un des partenaires)
pour le développement de nouveaux capteurs
biologiques et biogéochimiques.
82

ANNEXE 1
Bilan scientifique du LPTC (en anglais)
Production scientifique du LPTC
83

ENVIRONMENTAL CHEMISTRY AND TOXICOLOGY GROUP – LPTC
INTRODUCTION
The LPTC research works include studies
on the intercompartmental transport and
transfer, reactivity, bioaccumulation,
biotransformation and toxicity of organic
contaminants. It focuses on the analytical
developments needed to analyze organic
contaminants in various environmental
compartments (water-air-soil) in ultra-trace
concentrations. The LPTC develops
original methods to identify and describe
organic pollutants, as well as to study how
they interact with dissolved and particulate
organic matter. Studies are conducted on
biotic and abiotic processes that affect the
presence and transformation
(homogeneous and heterogeneous) of
chemical contaminants in the environment.
The LPTC also conducts research on
structure-activity relationships using
molecular modeling. Lastly, the laboratory
studies the processes affecting toxicity and
conducts ecotoxicology research involving
biomarkers of exposure and effect.
The research performed in recent years
focuses on the following three topics:
• Research on the source, presence and
transfer of organic chemical pollutants
• Research on the oxidation reactions of
organic chemical pollutants
• Research on the toxic effects of organic
pollutants
The LPTC uses a multi-disciplinary approach
combining chemistry and environmental
toxicology. These studies on chemical hazards
using original molecular methods and concepts
have been published in high impact scientific
journals, and have given rise to numerous
industrial partnerships (TOTAL, SUEZ,
DANONE, FORD…), institutional
partnerships (IFREMER, CEMAGREF, INRA,
WWF, Agences de l’Eau, INERIS), and
academic partnerships (University of Le
Havre, University of Brest, University of Pau,
University of Grenoble, University of
Montpellier, CNRS Orléans…). The LPTC is
recognized nationally and internationally for
its expertise and participates in numerous
networks (ACCENT, European Network of
Excellence, ESF INTROP, GDR IMOPHYS
and MONALISA), European initiatives
(SWIFT-WFD, Feeding Fats Safety,
ERANET-AMPERA) and national programs
(ANR PRECODD, ANR SEST, ANR
“Blanche”, ANR VMC, PRIMEQUAL,
PNETOX, LITEAU, INSU-LEFE, INSU-
Ec2Co).
RESEARCH ON THE SOURCE,
PRESENCE AND TRANSFER OF
ORGANIC CHEMICAL POLLUTANTS
H. Budzinski, MH. Devier, L. Tuduri, C.
Garnier, E. Parlanti, M. Montury, V. Guillet, P.
Fornier, M. Lamotte (coll. INRA, University of
Le Havre, University of Montpellier,
University of Toulouse, CEMAGREF, Ifremer,
INERIS, CSIC Barcelone, INIA Madrid,
University of Lille, IFP, University of Agadir-
Maroc)
Research on chemical contaminants, in
addition to providing obvious toxicological
benefits, helps identify contaminant sources
and describe the transformation processes
involved. However, applying these concepts
can be difficult. The studies involve the
molecular analysis of specific compounds and
series of isomer and/or congener compounds
present in trace or ultra-trace concentrations
(ppb or ppt) in highly complex matrices.
Developing the powerful analytical tools
necessary was the first part of the laboratory’s
work. Moreover, it is important to learn more
about the presence and sources of chemical
contaminants in the environment and to study
how they are dispersed, transported and
transferred. This is the second topic studied by
the laboratory. Studies were conducted on a
number of organic contaminants, including
flame retardants, (polychlorobiphenyls - PCB,
polybromo-diphenylether - PBDE), pesticides,
plasticizers, detergents, hydrocarbons, and
pharmaceutical substances. 80% of the
research was conducted on water, and 20% on
atmosphere. The work is summarized below
through various examples: developing new
tools; pharmaceutical substances; organic
85

matter; bioavailability, bioaccumulation and
trophic transfer.
DEVELOPING NEW SAMPLING AND
ANALYTICAL TOOLS
One of the difficulties encountered in
accurately assessing the contamination of
environmental systems is that there are
multiple contaminants (multiple sources,
multiple chemical classes) and
considerable temporal and spatial
variability. Analyzing several classes of
compounds requires the use of different
protocols, and each protocol involves
different sample preparation methods. The
analytical methods cannot be automated
and are time-consuming, costly, and
require large quantities of solvent. To
achieve fast and reliable analytical
methods in line with today’s environmental
screening concern, we developed two
approaches: 1) passive samplers for water 2
and air 3 ; 2) solid phase microextraction
methods combined with on line
detections 4 .
A POCIS after deployment in water for 3
weeks
Assessing the contamination of the aquatic
environment is difficult and requires an
appropriate sampling strategy, with
2 Togola A., Budzinski H. 2007 Development of
Polar Organic Integrative Samplers for Analysis of
Pharmaceuticals in Aquatic Systems. Anal. Chem.
79, 6734-6741
3
Wang J., Tuduri L., Millet M., Briand O.,
Montury M. T., Hung H. 2009 Flexibility of solidphase
microextraction for passive sampling of
atmospheric pesticides. J. Chrom. A, 1216, 3031-
3037
4 Wang J., Tuduri L., Mercury M., Millet M.,
Briand O., Montury M. 2009 Sampling atmospheric
pesticides with SPME: Laboratory developments
and field study. Env. Poll., 157, 365-370
painstaking and complex sampling
methods. In order to mitigate these
problems and obtain an integrated image
over time of the contamination of the
dissolved phase of the water column,
POCIS TM (Polar Organic Contaminant
Integrative Sampler) systems to detect
hydrophilic compounds have been
developed 2 . These systems also have the
advantage of pre-concentrating the
contamination of the dissolved phase in a
relatively simple matrix. Integrative
samplers were tested in the lab to
document their behavior under different
temperature and salinity conditions. The
POCIS gave very promising results. This
non-selective sampling technique (all polar
compounds) provides a non-oriented vision
of the compounds present in an aquatic
ecosystem.
In order to describe air quality, the
atmosphere being is a major vector in the
diffusion of pollutants, the LPTC also
developed the use of “autonomous”
passive samplers. They present several
advantages. In particular they are easy to
use, inexpensive and they do not disturb
the environment, but the calibration of the
systems can be difficult. Accordingly, the
first studies looked at this issue, with the
design of a generator of standard
atmospheres for pesticides and the
acquisition of physical and chemical data
such as compound-passive sampler
partition coefficients. A first type of passive
sampler, SPME 3 , was used to study the
contamination of confined atmospheres
(agricultural greenhouses). Additionally,
another type of passive sampler,
polyurethane foam disks (PUF disks), was
also used 5 .
PHARMACEUTICAL SUBSTANCES
Pharmaceutical substances are compounds
known as “emerging contaminants.”
Though it is clear that they are present,
5 Tuduri L., Harner T., Hung H. 2006 Polyurethane
foam (PUF) disks passive air samplers: Wind effect
on sampling rates. Env. Poll., 144, 2, 377-383
86

little is known about their behavior, fate
and environmental and health impacts.
Researchers have been studying these
contaminants for less than 10 years. In
France, the LPTC was one of the first
laboratories to look at these compounds
and develop original methods to describe
them 6 . The protocols obtained were then
applied in monitoring different aquatic
environments to provide an initial estimate
of the global level of contamination of
French aquatic environments, such as the
Atlantic estuaries (Seine, Gironde, Adour).
More targeted studies documented the
behavior of these emerging contaminants
from their point of introduction to their
dissemination in the environment (model
cases of “La Jalles d’Eysines” and “La
Calanque de Cortiou”) 7,8 .
ORGANIC MATTER
It is important to describe and monitor
dissolved macromolecular organic matter
(DOM) in aquatic environments to
complexity of the macromolecular organic
material, the low concentrations of organic
material and high salinity levels. Dissolved
organic material has not been sufficiently
studied to determine how it evolves in
natural aquatic systems, specifically in
estuary and coastal systems, and how it
interacts with contaminants (transport,
bioavailability). During the last four years,
the studies conducted under the national
programs ECODYN, GIS ECOBAG and
GDR IFREMER MONALISA have helped
accurately describe DOM and how it
evolves in estuary and coastal systems in
different seasons and based on various
environmental parameters, and have
defined new fluorescence indices to define
and classify DOM 9 . To deal with the
problems related to the salinity of marine
waters, we developed and optimized a
seawater desalting method by
electrodialysis (ED) combined with reverse
osmosis (RO) to reduce the salt content of
the seawater while minimizing DOM
Experiments on Eurytemora affinis
understand its role in the xenobiotic cycle.
Isolating, describing and studying the
properties of DOM still represents a
challenge both nationally and
internationally. The originality and
specificity of the work of the LPTC are
related to the aquatic environments
studied, namely coastal and marine waters.
The analytical difficulties result from the
6
Togola A., Budzinski H., 2007 Analytical
development for analysis of pharmaceuticals in
water samples by SPE and GC-MS. Anal. Bioanal.
Chem. 388, 627-635
7 Labadie P., Budzinski H. 2005 Determination of
steroidal hormone profiles along the Jalle d’Eysines
river (near Bordeaux, France) Environ. Sci.
Technol., 39, 14, 5113-5120
8
Togola A., Budzinski H. 2008 Multi-residue
analysis of pharmaceutical compounds in aqueous
samples. J. Chrom. A., 1177, 150-158
changes and losses. We have demonstrated
the potential of ED plus RO as a noninvasive
method to isolate and concentrate
marine DOM 10 .
BIOAVAILABILITY,
BIOACCUMULATION AND TROPHIC
TRANSFER OF ORGANIC
CONTAMINANTS
9 Huguet A., Vacher L., Relexans S., Saubusse S.,
Froidefond J.M., Parlanti E. Properties of
fluorescent dissolved organic matter in the Gironde
Estuary. Org. Geochem., 2009, 40, 706–719
10 Huguet A., Roux-De Balmann H., Parlanti E.
2009 Fluorescence spectroscopy applied to the
optimisation of a desalting step by electrodialysis
for the characterisation of marine organic matter. J.
Membrane Sci., 326, 186-196
87

Although numerous research programs
have helped determine the chemical
pollution levels of aquatic environments
(marine and freshwater), it is still difficult
to achieve an accurate assessment of the
toxic impact on living organisms and the
effects of the contaminants to which they
are exposed. The use of species identified
as sentinel species requires in-depth studies
on the processes that control
bioavailability, biotransformation and
related toxic effects 11 .
Studies have been initiated and are still
under way to look at the transfers of
organic chemical contaminants in
microcosms both from the sediment
compartment and the dissolved phase and
the trophic pathways in the case of model
molecules. The laboratory observations
were compared to the results obtained from
monitoring the natural environment. In the
first phase of our work, we developed
experimental tools (biomonitoring
techniques in natural systems by
transplantation of organisms; exposure
systems in the laboratory; experimental
tanks). The model species developed
belong to different trophic levels:
Crustaceans (copepods), mollusks, fish
(bream, sole). This research was conducted
under the programs GIS-ECOBAG, GDR
IMOPHYS and SEINE-AVAL. It was
continued under a European initiative (LRI
initiative) and an INSU project (ECODYN,
DECIME project). Models were developed
in collaboration with a team of Spanish
researchers (INIA, Madrid) to include the
processes studied (transfer, accumulation
and transformation) 12 .
RESEARCH ON THE OXIDATION
REACTIONS OF ORGANIC CHEMICAL
POLLUTANTS
E. Villenave, P. Mazellier, H. Budzinski (Coll.
INERIS, University of Szeged - Hungary,
University of Abobo Adjamé – Côte d’Ivoire,
Academy of Science and Technology of
Vietnam – Hanoi – Vietnam, University Blaise
Pascal, LGGE Grenoble, ICARE Orléans, Ford
Motor Co).
All pollutants and/or organic contaminants
present in the atmosphere or water undergo
complex transformations including direct
phototransformation and reactions with
radicals (hydroxyl, chlorine, nitrous oxides,
carbonate), excited states (singlet oxygen,
photosensitized organic matter) and other more
targeted oxidants (ozone).
Our research aims to shed light on the
processes involved in the formation and/or
breakdown of organic compounds (in gas
phase, liquid phase or at the gas-particle
interface). These processes not only affect the
quality of the air and water, but they also have
a direct impact on the Environment, through
climate change for example. Our approach
consists in determining the kinetic parameters
(reaction rate constants, quantum yields,
branching ratios) and analytical parameters
(structure of reaction products) of these
reactions. It is important to understand these
parameters to improve the quality of
atmospheric and aquatic chemical simulation
models by providing modelers with useful
structure-activity relationships (SARs).
11 Cailleaud K., Forget-Leray J., Peluhet L., Le
Menach K., Souissi S., Budzinski H. 2009 Tidal
influence on the distribution of hydrophobic
organic contaminants in the Seine Estuary and
Biomarker responses on the copepod Eurytemora
affinis. Env. Poll., 157, 64-71
12 Alonso E., Tapie N., Budzinski H., Le Ménach
K., Peluhet L., Tarazona J.V. 2008 A model for
estimating the potential biomagnification of
chemicals in a generic food web: Preliminary
development. Environ. Sci. Poll. Res. 15, 31-40
88

Organic
Contaminants /
Pollutants
Atmospheric
Compartment
UV or solar
irradiation
Radical Reaction
Oxidation
Degradation
Kinetic study
Study of
byproducts
Mechanisms
SARs
INTERESTING REACTIONS IN
ATMOSPHERIC CHEMISTRY
At present, we are primarily working on two
topics. The first is kinetic and mechanistic
research on gas phase radical reactions, and the
second is research on the fate of persistent
organic compounds associated with particles
and the formation of secondary organic
aerosols (SOA) from the atmospheric
oxidation of volatile organic compounds
(VOC).
Gas phase radical reactions are important for
two reasons. First, they are the main vectors
for the formation of tropospheric ozone and the
HOx oxidant balance defining the lifetime of
compounds emitted in the air. Secondly they
are intermediates in the formation of less
volatile oxidation compounds leading to the
secondary formation of aerosols composed of
liquid or solid particles having a direct impact
on visibility, radiative budget and climate
changes. The oxidation of aldehydes initiated
by Cl radical was studied experimentally for a
series of aldehydes including acetaldehyde and
butanal, to provide a whole range of structure
activity relations, in part in collaboration with
J.C. Loison and M.T. and J.C. Rayez of the
ISM, and T.J. Wallington of Ford Motor
Co 13,14 ; These reactions are important for the
atmospheric chemistry taking place in the
13
Aquatic
Compartment
à traiter
Le Crâne J.-P., Villenave E., Hurley M.D.,
Wallington T.J., Ball J.C. 2005 Atmospheric
chemistry of propionaldehyde: kinetics and
mechanisms of reactions with OH radicals and Cl
atoms, UV spectrum and self reaction kinetics of
CH 3 CH 2 C(O)O 2 radicals at 298 K. J. Phys. Chem.
A, 109, 11837-11850
14
Le Crâne J.-P., Rayez M.-T., Rayez J.-C.,
Villenave E. 2006 A reinvestigation of the kinetics
and the mechanism of the CH 3 C(O)O 2 + HO 2
reaction using both experimental and theoretical
approaches. Phys. Chem. Chem. Phys., 8, 2163-
2171
marine boundary layer, and because atomic
chlorine is often used as a free radical initiator
in laboratory experiments on VOC oxidation.
In another study we looked at the reactions of
the OH radical, one of the main oxidant of the
atmosphere, with a series of monoterpenes. We
determined the branching ratio of the OH
radical addition pathways and hydrogen atom
abstraction pathways on α-pinene, β-pinene, γ-
terpinene and d-limonene. It was demonstrated
that the abstraction pathway was far from
negligible (up to 40%) and should therefore be
taken into account in the oxidation simulation
models of biogenic compounds. Biogenic
compounds are very important, as they are the
main SOA precursors, along with monoaromatic
compounds.
In recent years, we have done a number of
heterogeneous chemistry studies at the gassurface
interface. We looked in particular at
two groups of persistent organic pollutants
(POPs) and their oxidation products,
polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) and
polybromodiphenylethers (PBDEs), under the
POPSTART project financed by the ANR
Blanc Chimie 2005 and coordinated by the
LPTC. The heaviest atmospheric PAHs
originated from the incomplete combustion of
organic matter are adsorbed on particles due to
their formation pathway and their physical and
chemical properties. Their heterogeneous
reactivity was investigated for different types
of particles (carbonaceous and mineral, model
and natural) with different oxidants (OH, NO 2
and O 3 ), with particular attention to pyrene,
benzo(a)pyrene and dibenz(a,l)pyrene, which
are considered toxic by the US EPA. The main
oxidation products were described in the
laboratory and measured in the atmosphere in
collaboration with INERIS during various field
campaigns, to have a global approach of the
89

issue 15,16 . The results show that the
heterogeneous reactions can be very fast (faster
than in gas phase) and they must therefore be
included in POP transport and dispersion
models of the atmosphere. These studies were
successfully paired for the first time in France
with studies on the genotoxicity of the
products formed by these processes. Similar
research, developed on PBDEs has shown that
these compounds are relatively inert except in
the case of reactions with hydroxyl radical in
which polybrominated phenols are formed.
All of these studies have been carried out in
the context of two European networks,
ACCENT (FP6 NoE) and INTROP (ESF), and
the national programs PRIMEQUAL of the
MEEDDAT and LEFE-ChAT of the CNRS-
INSU
REACTIONS IN AQUEOUS
ENVIRONMENTS
Direct photolysis reactions can be caused by
sunlight (λ > 290 nm) or by UV radiations
(254 nm or λ > 220 nm) sometimes used in
water and wastewater disinfection. Our recent
work focused on emerging contaminants:
hormones (estradiol, ethinyl estradiol,
progesterone, testosterone) and
pharmaceuticals (non-steroidal antiinflammatory
drugs - NSAIDs). As regards the
kinetic aspect, based on laboratory
experiments, we projected their behavior under
solar or UV irradiation. The lifetime of
diclofenac and naproxen (NSAID) is from 1 to
2 sunny days representative of central Europe
conditions and the transformation rates of
diclofenac and progesterone are 40% and 10%
respectively under water disinfection
conditions. Research on these reactions is
highly relevant, and, although the toxic effects
of the parent compounds are documented, we
must take into account the formation of
degradation products and study the evolution
15 Albinet A., Leoz-Garziandia E., Budzinski H.,
Villenave E. 2007 Polycyclic aromatic
hydrocarbons (PAHs), nitrated PAHs and
oxygenated PAHs in ambient air of the Marseilles
area (South of France): Concentrations and sources.
Sci. Tot. Environ., 384, 280-292
16 Albinet A., Leoz-Garziandia E., Budzinski H.,
Villenave E., Jaffrezo J.L. 2008 Nitrated and
oxygenated derivatives of polycyclic aromatic
hydrocarbons in the ambient air of two French
alpine valleys. Part 1: Concentrations, sources and
gas/particle partitioning. Atm. Environ., 42, 43-54
of the toxicity during these processes. As
regards the “degradation products” aspect,
analyses by liquid and gas chromatography
paired with mass spectrometry have
demonstrated the complementarity of the two
techniques. Certain by-products were detected
only by one of the two techniques 17 . Moreover
it was shown that progesterone and
testosterone underwent photoisomerization due
to the presence of the α,β-unsaturated ketone
function. This research was conducted under
cooperation with the University of Abobo
Adjamé (Côte d’Ivoire) and the University of
Szeged (Hungary).
Though the reactivity of hydroxyl radical is
well known in liquid phase, other radicals have
been studied in literature, but not addressed
concretely, in particular carbonate radical and
chlorine radical formed by oxidation of the
corresponding anions. Recently, we looked at
the reactivity of carbonate radical with model
molecules and compared it with that of
hydroxyl radical. We used various processes to
generate carbonate radical more or less
selectively, including H 2 O 2 /UV/HCO 3 - ,
Co(NH 3 ) 5 CO 3 + / UV, TiO 2 /UV/HCO 3 - . We
combined all the data to determine the specific
nature of the carbonate radical reaction. When
phenol was used as the first model compound,
the reactivity was roughly 100 times slower
but the reaction generated the same byproducts
as hydroxyl radical 18 . However, with fenuron
(a phenylurea herbicide), the reactivity was
still 100 times smaller, but byproducts specific
to the carbonate radical reaction were
observed 19 . Identical observations were made
with a series of triazines. The most interesting
case is diclofenac (diphenamine substitute) for
which reactivity with carbonate radical is
approximately the same as with hydroxyl
radical, but with different byproducts. It is
clear that the specificity of the carbonate
radical reaction is greater in the case of active
17
Mazellier P., Méïté L. De Laat J. 2008
Phototransformation of estradiol and
ethinylestradiol in aqueous solution. Chemosphere,
73, 1216-1223
18 Busset C., Mazellier P., Sarakha M., De Laat J.
2007 Photochemical generation of carbonate
radicals and their reactivity with phenol. J.
Photochem. Photobiol. A: Chem., 185, 127-132
19 Mazellier P., Busset C., Delmont A. De Laat J.
2007 A comparison of Fenuron degradation by
hydroxyl and carbonate radicals in aqueous
solution. Water Res., 41, 4585-4594
90

nitrogen compounds. It is important to use a
wide range of techniques to obtain a complete
vision of the processes at work, including timeresolved
spectroscopy, kinetic modeling and
gas chromatography-mass spectrometry. This
research program will be continued under the
REACTING project (collaboration with the
LCME - UMR CNRS 6008 and the LPMM -
UMR CNRS 6505, ANR Blanc Chimie 2008,
coordinated by LPTC).
RESEARCH ON THE TOXIC EFFECTS
OF ORGANIC CHEMICAL
POLLUTANTS
J. Cachot, J.F. Narbonne, H. Budzinski, MH.
Devier, B. Morin, B. Davail, N. Geneste, A.
Carpy (Coll. University of Georgia, North
Carolina State University, Ifremer, Universities
of Brest, Caen and Le Havre, CBMN, CTIS,
INERIS, Institute of Biomedical Chemistry of
the Russian Academy of Medical Sciences).
European regulations in human health and
environmental protection have become
stricter in recent years, with the biocide
directive, the water framework directive,
REACH regulations and the marine
strategy directive. These new laws call for
producing knowledge on the fate,
processes and biological effects of new
chemical substances, and developing
reliable, sensitive tools for predictive and
retrospective risk assessment. LPTC’s
research work falls within these two
categories of ecotoxicology. In the past
four years our research has focused on
measuring vitellogenin-like (VTG-l)
proteins in mussels to detect endocrine
disruption activity. It has been
demonstrated that the expression of this
protein is significantly higher in males and
females subsequent to exposure to
bisphenol A. Likewise, it has been
demonstrated that exposure to dialkylphthalate
and tetrabromodiphenyl-ether
caused an increase in VTG-l and premature
spawning in mussels 20 . In the freshwater
20 Aarab N., Lemaire-Gony S., Unruh E., Hansen
P.D., Larsen B.K., Andersen O.K. Narbonne J.F.
2006 Preliminary study of responses in mussel
(Mytilus edulis) exposed to bisphenol A, dialkyl
mollusk Corbicula fulminea, immune
system markers and lysosomes were
studied. Research showed that exposure of
adult individuals to TBT induces
immunotoxic and cytotoxic responses 21
and that exposure to cadmium significantly
decreases the phagocytic activity of
hemocytes and increases the number and
size of lysosomes in the digestive gland 22 .
Other studies have been conducted to
develop new molecular tools on a fish
model (rainbow trout) and cellular models
(cell lines and primary culture) to assess
the impact of industrial wastewater
discharges on freshwater ecosystems.
These studies were conducted in the
context of Phd work in collaboration with
TOTAL Corporation in Lacq, which
possesses dynamic freshwater mesocosms.
Juvenile female trout were exposed to
various pollutants, diquat, agral and
cadmium alone or in combination. The
experiment was conducted over 21 days
followed by a 50-day depuration period.
We analyzed the toxic responses at various
levels of biological organization and for
various biological functions, namely
growth, reproduction and genetic integrity.
After 7 days of exposure, the DNA
breakage rate (comet assay) of erythrocytes
in trout exposed to different contaminants
was significantly higher than in the control
trout. All the contaminants tested resulted
in DNA damage, which confirms the value
of the comet assay in monitoring
environmental pollution. Unexpectedly, we
detected the presence of 11-
ketotestosterone in juvenile trout, as well
as a marked drop in estradiol levels after
phthalate and tetrabromodiphenyl ether. Aquat.
Toxicol., 78S, S86-S92
21 Champeau O., Auffret M., Cajaraville M.P.,
Basseres A., Narbonne J.F. 2007 Immunological
and cytotoxicological responses of the Asian clam,
Corbicula fluminea (M.), experimentally exposed to
cadmium. Biomarkers, 12, 173-187
22
Champeau O. and Narbonne J.F. Effect of
tributylin and 17b-estradiol on immune and
lysosomal systems of Asian clam Corbicula
fluminea (M.) 2008 Environ. Toxicol. Pharm.,
21,323-330
91

exposure to nonylphenol, which continued
after exposure was stopped. Though this
was unexpected in trout, similar results
have been obtained in turbot in the
presence of contamination by
nonylphenol 23,24 . In juvenile turbots,
exposure to nonylphenol, a mixture of
North Sea Oil (NSO) or a mixture of
nonylphenol and NSO induced VTG
(nonylphenol only) and a decrease in
plasma androgens in males. These
experiments show the value of monitoring
steroid hormones in addition to measuring
VTG, to study endocrine disruptors in
aquatic environments. European sturgeon
is another model in which plasma
parameters have been monitored to identify
environmental factors that potentially
impact reproduction in hatcheries, in
particular factors that inhibit spawning.
The 5-year data show major variations
depending on the sex and reveal sturgeon
specificities 25 that may be used as a
reference for sturgeon species subjected to
environmental constraints in their natural
environment. These experiments show the
value of monitoring steroid hormones in
addition to measuring VTG, to study
endocrine disruptors in aquatic
environments.
Over the last four years, our research has
also focused on the environmental risk
assessment of PAHs. A vast field study
was conducted under the Seine-Aval
program to determine the magnitude and
nature of the contamination of the Seine
estuary and assess the potential
ecotoxicological consequences on the
aquatic fauna. The study revealed severe
PAH contamination of the sediment in the
upstream portion of the estuary and the
high genotoxic and embryotoxic potential
of the sediment. It was shown that PAHs
and to a lesser extent more polar organic
pollutants that have not yet been identified
are highly involved in this genotoxicity 26 .
The studies also showed that despite PAH
accumulation in the tissues, this did not
appear to induce major genotoxic effects in
bivalves 27 . However, fish such as flounder
that spend the first two years of life in the
estuary accumulate little or no PAHs but
present abnormally high levels of DNA
adducts and develop liver tumors.
Experiments were conducted under
controlled conditions to study PAH
transfer and effects on embryos and
juveniles in a fish model, the Japanese
medaka. The research showed that PAHs
can penetrate the chorion of the egg and
induce immediate effects on the survival,
development and genetic integrity of the
embryos. The fish were followed for 8
months after hatching. They showed
delayed effects such as elevated larval
mortality, skeletal malformations (see
figure below) mutations and tumor
development 28 . These studies have
23 Aarab N., Davail-Cuisset B., Minier C., Unruh
E., Hansen P.D., Larsen B.K., Andersen O.K.,
Narbonne J.F. 2006 Plasma sex steroids and
vitellogenin levels related to gonad development in
immature turbot (Scophtalmus maximus)
experimentally exposed to environmental
contaminations. Marine Environ. Res., 62, 265-266
24 Labadie P., Budzinski H. 2006 Alteration of
steroid hormone in juvenile turbot (Psetta maxima)
exposed to nonylphenol, bisphenol A,
tetrabromodipheny ether 47, diallylphthalate, oil,
and oil spiked with alkylphenols. Arch. Environ.
Contam. Toxicol., 50, 552-561
25
Davail-Cuisset B., Lacomme S., Viaene E.,
Rouault T., Davail S., Lepage M., Gonthier P.,
Williot P. 2008 Hormonal profile in adults of
Atlantic European sturgeon, Acipenser sturio,
adapted to hatchery in France. Cybium, 33, 28-30
26 Cachot J., Geffard O., Augagneur S., Lacroix S.,
Le Menach K., Peluhet L., Couteau J., Denier X.,
Devier M.H., Pottier D, Budzinski H. 2006
Evidence of genotoxicity related to high PAH
content of sediments in the upper part of the Seine
estuary (Normandy, France). Aquat. Toxicol., 79,
257-267
27 Rocher B., Le Goff J., Peluhet L., Briand M.,
Manduzio H., Gallois J., Devier M.H., Geffard O.,
Gricourt L., Augagneur S., Budzinski H., Pottier
D., André V., Lebailly P., Cachot J. 2006
Genotoxicant accumulation and cellular defence
activation in bivalves chronically exposed to
waterborne contaminants from the Seine river.
Aquat. Toxicol., 79, 65-77
28 Cachot J., Law M., Pottier M., Peluhet L., Norris
M., Budzinski H., Winn R. Characterization of
toxic effects of sediment associated organic
92

demonstrated that (i) PAHs can be
transferred directly to fish embryos via
water or sediment; (ii) fish are highly
sensitive to PAHs at early stages of
development, and (iii) PAHs have a wide
variety of mechanisms of action and
effects.
Prevalence of spinal deformities in 10 weekold
medaka exposed for 10 days at the
embryonic stage to a reference sediment spiked
with DMSO solvent, 30 µg/g of B[a]P or three
different concentrations of an organic extract
(OE) of sediment from the Seine estuary. X-ray
of a healthy fish (A) and a fish with severe
lordosis (B)
Outside the experimental approach, and in
compliance with the REACH directive
which aims to reduce animal testing by
using predictive theoretical models, some
of our research focused on developing
structure activity relationships (SAR and
QSAR) and studying interactions between
xenobiotics and biological receptors to
understand the mechanisms of action,
interaction and the effects of xenobiotics
on organisms. In one study, the 3D
structure of the rainbow trout estrogen
receptor was modeled by homology with
human estrogen receptor, and a QSAR
model was derived based on binding
affinity data to predict which endocrine
disrupters are likely to bind to this target 29 .
pollutants using the λ transgenic medaka. Environ.
Sci. Technol. 2007, 4, 7830-7836
29 Marchand-Geneste N., Cazaunau M., Carpy A.,
Laguerre M., Porcher J.M., Devillers J. 2006
Homology model of the rainbow trout estrogen
receptor (rtERalpha) and docking of endocrine
disrupting chemicals (EDCs). SAR QSAR Environ.
Res., 17, 93-105
Additionally, all the SAR and QSAR
models derived for endocrine disruptors
were collected and analyzed (150
publications) 30 . Based on this bibliographic
analysis, a unique approach using
endocrine activity profiles rather than
unique endpoints to gauge the complexity
of endocrine disruption was discussed
through a SAR study performed on 11,416
chemicals and 13 endocrine activities.
Various multivariate analyses and
graphical displays were used for deriving
structure-activity relationships based on
specific structural features (e.g. phenol,
mercapto) 31,32 . Through the combined use
of homology modeling and molecular
docking, we have studied the interactions
between complex neonicotinoid
insecticides and honeybee nicotinic
acetylcholine receptors (nAChR) to derive
structure toxicity models in order to
distinguish highly toxic insecticides from
low toxicity pesticides 33 .
HIGHLIGHTS
One of our main strong points is the
originality of our work taking into
consideration the chemical pollution from
its origin to its impact on organisms,
conducted both in aquatic and atmospheric
environments, and in homogeneous and
heterogeneous chemistry. We work at
environmentally realistic concentrations,
30 Devillers J., Doré J.C., Marchand-Geneste N.,
Porcher J.M., Poroikov V. 2006 Modeling the
endocrine disruption profile of xenobiotics. Lecture
Series on Computer and Computational Sciences, 6,
1-3
31 Devillers J., Marchand-Geneste N., Doré J.C.,
Porcher J.M., Poroikov V. 2007 Endocrine
disruption profile analysis of 11,416 chemicals
from chemometrical tools. SAR QSAR Environ.
Res., 18, 181-193
32 Devillers et al, (2009) Endocrine Disruption
Modeling, CRC Press, J. Devillers ed., Boca Raton,
USA, 2009
33
Rocher A., Marchand-Geneste N. 2008
Homology modelling of the Apis mellifera nicotinic
acetylcholine receptor (nAChR) and docking of
imidacloprid and fipronil insecticides and their
metabolites. SAR QSAR Environ. Res., 19, 245-
261
93

develop ultra-trace methods, new biotests
and perform experiments both at the
laboratory scale but also in the field.
Another strength is that we consider
chemical mixtures and take into account
the complexity of the natural matrices. We
couple chemistry and biology,
experimental work and modeling, and we
perform applied studies as well as
fundamental work.
Our kinetic, analytical, theoretical and
toxicological approaches are undertaken by
a multidisciplinary team within a single
research group, which is absolutely unique
in France.
Our expertise has been rewarded through
participation in the Network of Excellence
ACCENT (6 th PCRD), the ESF program
INTROP, European initiatives and various
Scientific Committees and invitations to
international conferences. More than 90%
of our research is self-financed (ANR,
LEFE-ChAt and EC2CO programs of the
INSU, PRIMEQUAL, PNETOX, LITEAU
programs of the MEEDDAT).
development of specific and cuttingedge
analytical methods
advise and expertise
analytical facility access
analytical and toxicological staff
training
Running costs of the unit is around 120
keuros per year, split for salaries and
investment in analytical instrumentation.
One engineer (under contract for several
years) is managing the toxicological
aspect while various contractual
researchers have been recruited during the
5-year period. Some noteworthy.
CDTA “CENTRE DE DEVELOPPEMENT
ET DE TRANSFERT ANALYTIQUE”
The CDTA (Centre de Développement et
de Transfert Analytique) is a Research
Transfer Unit supported by the
Environmental Chemistry and Toxicology
Group (LPTC) whose scientific supervisor
is H. Budzinski. The CDTA has two main
activities :
« Organic Analysis » supervised by H.
Budzinski
« Toxicology » supervised by J.F.
Narbonne
The main objective of the Unit is to
transfer the know-how of the laboratory in
trace analyses of organic contaminants and
in environmental studies of impact and
effects of organic contaminants to private
industry and companies. CDTA offers :
analytical measurements
feasability studies
94

PRODUCTION SCIENTIFIQUE DU
LPTC
DURANT LE PRECEDENT
QUADRIENNAL
95

Peer-reviewed Papers listed in International
Databases (2005-2009) (ACL)
2005
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Experimental study of termal craking of crude oil
light aromatic fraction. 1.Separation and
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Oil & Gas Sci. Technol., 2005, 60, 681-695
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Detection and quantification of PAH in drinking
water by front-face fluorimetry on a solid sorbent
and PLS analysis
Anal. Bioanal. Chem., 2005, 382, 4, 1103-1110
3. Belfatmi R., Ait-Lyazidi S., Lamotte M., Fornier
de Violet P.
Oxidation of humic substances prior to the
detection of PCBs and PAHs in natural waters by
fluorometry on solid sorbent.
Polycyclic Aromatic Compounds, 2005, 25, 5, 407-
419
4. Belfatmi R., Lamotte M., Ait-Lyazidi S., Fornier
de Violet P.
Detection of PCBs in natural waters by front face
fluorometry on solid sorbent on account of their
fluorescence quantum yields and interaction with
humic substances.
Chemosphere, 61, 761-769
5. Collins E.M., Sidebottom H.W., Wenger J.C., Le
Calvé S., Mellouki A., Le Bras G., Villenave E.,
Wirtz K.
The influence of reaction conditions on the
photooxidation of diisopropyl ether.
J. Photochem. Photobiol. A, 2005, 176, 86-97
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Delegue M.H.
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J. Environ. Monit., 2005, 7, 3, 224-240
8. ESCODD (European Standards Committee on
Oxidative DNA Damage (Morin B.)), Gedik C.-M.,
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Establishing the background level of base oxidation
in human lymphocyte DNA: results from an interlaboratory
validation study.
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9. Garnier C., Pižeta I., Mounier S., Cuculić V.,
Benaïm J.Y.
An analysis of distinguishing composite dissolved
metal-ligand systems measurable by stripping
voltammetry.
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Mobility and potential toxicity of sediment-bound
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Analysis of particulate polycyclic aromatic
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Anal. Bioanal. Chem., 2005, 383, 122-131
21. Pižeta I., Billon G., Omanović D., Cuculić V.,
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Pseudopolarography of lead (II) in sediment and in
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97

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Mar. Environ. Res., 2006, 62, 185-186
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38. Dartiguelongue C., Behar F., Budzinski H.,
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Thermal stability of dibenzothiophene in closed
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Characterization of strawberry varieties by SPME-
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Belzer W., Froude F., Murphy C., Poissant L.
A review of Currently Used Pesticides (CUPs) in
Canadian air and precipitation. Part 2: Regional
information and perspectives.
Atmos. Environ., 2006, 40, 1579-1589
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PolyUrethane Foam (PUF) disks passive air
samplers: Wind effect on sampling rates.
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6. Catastini C., Mullot J. U., Boukari S., Mazellier
P., Levi Y., Cervantes P., Ormsby J.N.
Assessment of antineoplastic drugs in effluents of
two hospitals.
European Journal of Water Quality, 2008, 39, 171-
180
7. Narbonne J.F.
Les pesticides ont-ils des effets sur la santé ?
NAFAS, 2008, 6, 49-56
2009
8. De Perre C., Crespo A., Abou Mrad N., Le
Ménach K., Jaber F., Parlanti E., Budzinski H.
Intérêt de la micro-extraction sur phase solide
couplée à la chromatographie en phase gazeuse et
à la spectrométrie de masse pour l’analyse des
hydrocarbures aromatiques polycycliques dans les
eaux.
Spectra Analyse, 2009, 266, 28-35
Non Peer-reviewed Papers not listed into
International Databases (2005-2009) (ASCL)
2005
1. Villenave E., Budzinski H.
Les Poly Bromo Diphenyl Ethers : un nouveau
problème environnemental ?
Air Pur (APPA): Les polluants organiques
persistants, 2005, 21-28
2006
2. Davail-Cuisset B., Tison C., Perazzolo L.M.
Hybridation in situ appliquée à l’étude de
l’ovogenèse de la truite arc-en-ciel.
Revue Française d’Histotechnologie, 2006, 19(1),
17-29
3. Traoré K. S., Mamadou K., Dembele A., Lafrance
P., Mazellier P., Houenou P.
Contamination de l’eau souterraine par les
pesticides en régions agricoles en Côte d’Ivoire
(centre, sud et sud ouest).
Journal Africain des Sciences de l’Environnement,
2006, 1, 1-9
2007
4. Traoré K. S., Dembele A., Mamadou K., Baba S.
D., Mazellier P., Legube B., Lafrance P.,
Houenou P.
Degradation photochimique d'un fongicide de la
famille des benzimidazoles.
European Journal of Scientific Research, 2007, 19,
162-173
5. Traoré K. S., Mamadou K., Dembele A., Yao K.,
Bekro Y. A., Mazellier P., Legube B., Houenou P.
Etude cinétique de la dégradation de l’Endosufane
en solution aqueuse par oxydation photocatalytique
et par photolyse.
Afrique Science, 2007, 3, 362-377
2008
6. Devillers J., Budzinski H.
Utilisation de l’abeille pour caractériser le niveau
de contamination de l’environnement par les
xénobiotiques.
Bulletin Technique Apicole, 2008, 35, 168-178
Scientific Books and Book Chapters (OS)
2005
1. George C., Aumont B., Bessagnet B., Rossi M.,
Schwell M., Seigneur C., Villenave E.
Physico-chimie et transport (Chapitre IV).
Pollution par les particules atmosphériques : état
des connaissances et perspectives de recherche.
La Documentation Française, Paris, 2005, 131-161
2. C. Amiard-Triquet, J.-C. Amiard, H. Budzinski, E.
Chauvet, M. El Hourch, D. Fichet, A. Geffard, O.
Geffard, M. Gnassia-Barelli, A.-Y. Jeantet, K. Le
Menach, P. Miramand, G. Radenac, M. Romeo
Comment combler la lacune entre approche
écologique (bioindicateurs) et écotoxicologiques
(biomarqueurs) en vue d’un diagnotic de la qualité
du milieu estuarien et côtier ?
Dans : Programme national d’écotoxicologie :
avancées récentes de la recherche, La
Documentation française, Paris, 2005, 313-329
2006
3. Narbonne J.F.
Alimentation et risques chimiques : Etat des lieux.
Santé et Droits de l’Homme : Les nouvelles
insécurités. Editions Médecine & Hygiène Chêne-
Bourg, Suisse, 2006, 211-217
106

2007
4. Narbonne J.F.
Pesticides : Dictionnaire des risques.
Armand Colin Paris, 2° Edition, 2007, 358-363
5. Narbonne JF, Clerandeau C, Daubeze M, Morin B
Data management of Biomarkers: Integration of
MPI as a tool for environmental pollution
monitoring, UNEP/MAP/MED POL: Proceedings
of the workshop on the MED POL Biological
Effects Programme: Achievements and Future
Orientation (Alessandria, Italy, 20-21 december
2006.
MAP Technical Report series, UNEP/MAP:
Athens, 2007, N°166
6. Tuduri L., Waite D., Harner T., Montury M.
Stratégies alternatives pour l'échantillonnage des
pesticides dans l'air: Microextraction sur phase
solide (SPME)-Disques de polyuréthanes (PUF-D)
Pesticides: Impacts environnementaux, gestion et
traitements. Ecole Nationale des Ponts et Chausées
ed., 2007, 31-39
2009
7. Devillers J., Doucet J.P., Panaye A., Marchand-
Geneste N., Porcher J.M.
Structure-activity modeling of a diverse set of
androgen receptor ligands.
Endocrine Disruption Modeling, CRC Press, J.
Devillers ed., Boca Raton, USA, 2009
8. Marchand-Geneste N., Devillers J., Doré J.C.,
Porcher J.M.
e-endocrine disrupting chemical databases for
deriving SAR and QSAR models.
Endocrine Disruption Modeling, CRC Press, J.
Devillers ed., Boca Raton, USA, 2009
9. Marchand-Geneste N., Devillers J.
Comparative modeling review of nuclear hormone
receptor superfamily.
Endocrine Disruption Modeling, CRC Press, J.
Devillers ed., Boca Raton, USA, 2009
10. Narbonne J.F.
Les risques chimiques : De la terre à la table.
IFN/ECRIN Paris, 2009, in press
11. Porcher J.M., Devillers J., Marchand-Geneste N.
Mechanisms of endocrine disruptions: a tentative
overview.
Disruption Modeling, CRC Press, J. Devillers ed.,
Boca Raton, USA, 2009
12. Amiard JC., Bodineau L., Bragigand V., Minier
C., Budzinski H.
Quantification of contaminant. Chapitre 3 dans :
Environmental Assessment of Estuarine
Ecosystems: A Case Study. Eds. C. Amiard-
Triquet, P. S. Rainbow, Series: Environmental and
Ecological Risk Assessment. CRC Press, Boca
Raton, 2009
13. Forget J., Souissi S. DevrekerD., Cailleaud K.,
Budzinski H.
Ecological status of the planktonic copepod
Eurytemora affinis In the Seine estuary
Chapitre 10 dans : Environmental Assessment of
Estuarine Ecosystems: A Case Study. Eds. C.
Amiard-Triquet, P. S. Rainbow, Series:
Environmental and Ecological Risk Assessment.
CRC Press, Boca Raton, 2009
Scientific Books and Book Chapters for the
General Public (OV)
2008
1. Couteau J., Flaman J.-M., Leboulenger F., Urban
P., Frébourg T., Pompon D., Cachot J.
Construction d’une souche de levure transgénique
pour l’évaluation et la caractérisation des risques
environnementaux associés aux substances
mutagènes.
Programme PNETOX, Ministère de l’Ecologie et
du Développement Durable (Ed.).
Invited Lectures in International Meetings (INV)
2005
1. Garnier C., Mounier S., Lenoble V., Gonzalez
J.L., Seppecher P., Benaïm J.Y.
Modelling of dissolved natural organic matter
properties by a “chimio-type”.
1 st International Workshop on Organic Matter
Modeling, Toulon, France.
2. Garrigues P.
Which analytical needs for Environmental
Chemists?
7 th Polish Conference on Analytical Chemistry,
Torun, Poland
3. Tuduri L., Waite D.T., Harner T., Montury M.
New strategies for sampling pesticides in air:
passive and active approaches.
4 th international symposium of pesticides in food
and the environment in Mediterranean countries,
Kusadasi, Turquie.
107

4. Waite D.T., Cessna A.J., Quiring D.V., Harner T.,
Blanchard P., Tuduri L.
Atmospheric Concentrations of Current-Use
Pesticides in Saskatchewan - Spatial and Temporal
Trends.
88 th Canadian Chemistry Conference, Saskatoon,
Canada.
5. Yao Y., Harner T., Blanchard P., Tuduri L., Waite
D.T., Belzer W., Froude F., Murphy C., Poissant
L., Sproull J.
Canadian Atmospheric Network for Currently Used
Pesticides (CANCUP): The First National Pesticide
Air Surveillance
88 th Canadian Chemistry Conference, Saskatoon,
Canada.
2006
6. Budzinski H.
Pharmaceutical substances: emergent
contaminants in marine systems.
CIESM Workshop on Marine Sciences and Public
Health. Genève, Suisse
7. Budzinski H., Villenave E., Perraudin E., Estève
W., Cazaunau M., Miet K.
Analytical Developments and Kinetics of
Polyaromatic Compounds Adsorbed on Soot
Particles.
ASEFI 2006 : Atmospheric Soot : Environmental
Fate and Impact 2006, Arcachon, France
8. Cachot J.
Genotoxicity assessment in aquatic environments.
French-American Workshop on biomarkers,
Charlestown, USA
9. Villenave E., Budzinski H., Estève W., Perraudin
E., Cazaunau M., Miet K.
Heterogeneous Reactivity of Polycyclic Aromatic
Hydrocarbons of Atmospheric
Interest: an Overview.
19 th International Symposium on Gas Kinetics,
Orléans, France
2007
10. Budzinski H., LeMenach K., Mazéas O., Le-Du
M., Morin B., Akcha F., Burgeot T.
Exposure of marine organisms to Polycyclic
Aromatic Hydrocarbons (PAHs): Use of PAH
metabolites to track the impact of hydrocarbon
inputs in relation to their toxic impacts.
ISPAC 21 st meeting
11. Budzinski H., Togola A.
Pharmaceutical substances: emergent
contaminants in marine and estuarine systems.
ECOBIM 2007, Rimouski, Canada
12. Cachot J., André V., Law M., Burgeot T., Cherel
Y., Winn R., Budzinski H.
Comparative responses of fish and bivalves to the
pollution of the Seine estuary (France).
ECOBIM 2007, Rimouski, Canada
13. Budzinski H.
Analyzing metabolites to characterize the animal
exposure and toxic effects related to organic
contaminants : application to the case of PAH-type
pollution.
Joint CSIC – Waters ENVIRONMENTAL
SUMMIT, Barcelone, Espagne
2008
14. Budzinski H., Burgeot T., Farcy E., Lagadic L.,
Auffret M., Allenou J.P., Renault T., Gabellec R.,
Le Goic N., Menard D.
Effets des pesticides en estuaire de Vilaine.
Premier colloque international sur les estuaires
marocains, Agadir, Maroc
15. Narbonne J.F.
Contamination du Delta du Rhône par les PCBs:
Implications sanitaires
1 er colloque international sur les estuaires
marocains, Agadir, Maroc
16. Villenave E.
Heterogeneous chemistry in the atmosphere.
Breathe-Totecat Marie-Curie Meeting, Lille, France
17. Villenave E.
OH formation in RC(O)+O 2 reactions.
Future trends in laboratory studies on atmospheric
chemical kinetics SPARC-IGAC-INTROP
Workshop, Cambridge, UK
18. Budzinski H.
Substances pharmaceutiques nouveaux
contaminants des systèmes aquatiques.
2 ème Congrès des sciences analytiques (CSA 2008),
Casablanca, Maroc.
19. Villenave E., Miet K., Cazaunau M., Budzinski
H. et Cachot J.
Analytical developments, reactivity and toxicity of
polycyclic aromatic compounds associated to
atmospheric particles.
1 st Sino-French JointWorkshop on Atmospheric
Environment, Beijing, China
2009
20. Villenave E., Loison J.C., Rayez M.-T., Rayez
J.-C.
Branching ratios between the abstraction and
addition channels in the reactions of OH radicals
with monoterpenes.
ESF Introp Final Conference on Tropospheric
Chemistry, Portoroz, Slovénie
108

21. Budzinski H, Soulier C, Lardy S, Capdeville
M.J., Tapie N, Vrana B, Miege C, Ait Aissa S.
Passive samplers for chemical substance
monitoring and associated toxicity assessment in
water.
Xenowac (Xenobiotics in the Urban Water Cycle)
Chypre
22. Budzinski H., Soulier C., Tapie N., Vrana B., Aït
Aïssa S.
Passive samplers for chemical substance
monitoring and associated toxicity assessment in
water.
ISTA14 Metz, France
Invited Lectures in National Meetings (INV)
2005
1. Tuduri L., Harner T., Waite D., Montury M.
Stratégies possibles pour l'échantillonnage des
pesticides dans l'air, méthodes actives et passives
35 ème congrès du Groupe Français des Pesticides,
Marne La Vallée, France.
2. Villenave E.
Histoire de la pollution atmosphérique.
9 ème journée nationale annuelle des verriers,
Bordeaux, France
3. Budzinski H., Togola A., Legrand J.
Pharmaceutical substances : emergent
contaminants of the aquatic media.
Société Française de Chimie, Eurochem, Nancy,
France
2006
4. Davail-Cuisset B.
Hybridation in situ appliquée à l’étude de
l’ovogenèse de la truite arc-en-ciel.
19 ème Congrès national de l’Association Française
d’Histotechnologie, La Rochelle, France
5. Davail-Cuisset B.
Hormonal profile and plasma vitellogenin profile in
adults of critically endangered sturgeon, Acipenser
sturio.
Workshop on Broodstock management of the
critically endangered sturgeon A. sturio, Cémagref
ECOSEMA, France
6. Davail-Cuisset B.
Etude histologique et hybridation in situ de
l’ovogenèse de la truite arc-en-ciel.
Congrès annuel de l’Association Française
d’histotechnologie, La Rochelle, France
2007
7. Villenave E.
Chimie hétérogène des polluants organiques dans
la basse atmosphère: impact sur la qualité de l'air
9 ème journées francophones des jeunes physicochimistes,
Maubuisson, France
2008
8. Cachot J.
Utilisation du médaka transgénique Lambda 310
pour l’évaluation de la génotoxicité des polluants
aquatiques.
7 ème journée d’animation scientifique transgénèse
poisson-modèle. INRA Paris, France
9. Budzinski H.
Les challenges actuels de la chimie
environnementale et le rôle de la spectrométrie de
masse.
JFSM (Journées Française de la Spectrométrie de
Masse), Grenoble, France
10. Budzinski, H., Lardy, S., LeMenach, K., Togola,
A., Augagneur, S. Murcia F., Tapie N.
Couplage capteurs passifs et biotests de toxicité
pour la mise en évidence de composés présents en
phase dissoute.
Séminaire Aquaref : « échantillonneurs passifs et
méthodes alternatives de prélèvement », Cestas,
France
11. Budzinski H., Augagneur S., Tapie N., Le
Menach K., Peluhet L., Lardy S. Ait-Aissa S.
Nouvelles approches pour qualifier la
contamination chimique des milieux aquatiques :
échantillonneurs passifs et biotests
ECOBIM, Bordeaux, France
12. Budzinski H., Augagneur S., Tapie N., Le
Menach K., Peluhet L., Lardy S. Ait-Aissa S.
Nouvelles approches pour qualifier la
contamination chimique des milieux aquatiques :
échantillonneurs passifs et biotests
5 ème Journées Techniques Eaux et Déchets, INSA
Toulouse, France
2009
13. Villenave E.
Cinétique chimique: synthèse de la recherche en
amont.
Colloque INSU LEFE, Brest, France
14. Cachot J.
Utilisation du médaka japonais Oryzias latipes
Lambda cII pour la caractérisation des effets
génotoxiques et embryotoxiques des polluants
aquatiques.
Colloque de l’ARET, Grande Galerie de
l’Evolution, Paris, France
109

15. Budzinski, H.
Analyse de Substances pharmaceutiques dans
l'environnement aquatique
Colloque "Analyse de traces et ultra-traces : enjeux
et perspectives",Paris, France
16. Budzinski H.
Substances pharmaceutiques : nouveaux
contaminants des systemes aquatiques.
Université de tous les savoirs «Le développement
durable : la croissante verte, comment ?»,
Bordeaux, France
Seminars in Universities and Private Companies
2005
1. Davail B.
Etude de la gamétogenèse de l’esturgeon atlantique
européen (Acipenser sturio) adapté en
écloserie par le suivi de paramètres plasmatiques
hormonaux.
Cemagref, C.R.E.A., Saint-Seurin-sur l’Isle, France
2. Davail B.
Suivi des taux plasmatiques hormonaux chez
l’esturgeon atlantique européen, Acipenser sturio.
Comité Consultatif sur l’esturgeon européen,
C.R.E.A., Cemagref, Saint-Seurin-sur l’Isle, France
3. Guillet V.
Goût de Lumière : caractérisation et
reconnaissance par analyse des volatils.
Société Courvoisier, Jarnac, France
4. Parlanti E.
Applications de la fluorimétrie à l’analyse des
eaux. Caractérisation de la matière organique
dissoute.
Journée « Mesures Optiques en Eaux et
Assainissement », LCPC-GEMCEA, Paris, France
5. Togola A., Budzinski H.
Les substances pharmaceutiques dans
l’environnement : cas de la calanque de Cortiou
Séminaire de travail du programme MEDICIS,
Toulon, France
6. Rabiet M., Elbaz-Poulichet F., Togola A.,
Brissaud F., Seidel JL., Budzinski H.
Caractérisation de l’anomalie de Gadolinium (Gd)
dans les effluents de station d’épuration et de
l’environnement aquatique.
EFFEMER, Risques sanitaires et écologiques des
résidus de médicaments dans les eaux, Montpellier,
France
7. Budzinski H., Togola A.
Présence des résidus de médicaments dans les
différents compartiments du milieu aquatique.
EFFEMER, Risques sanitaires et écologiques des
résidus de médicaments dans les eaux, Montpellier,
France
8. Budzinski H.
Les contaminants chimiques organiques et
inorganiques en estuaire de Seine.
Séminaire Seine-Aval, Rouen, France
2006
9. Budzinski H.
Impacts environnementaux des nouveaux
contaminants dans l’environnement : De
l’identification des agents chimiques toxiques à la
mise en évidence des impacts toxiques dans le
milieu naturel par une approche couplant chimie
biologie dite de “Toxicity Identification Evaluation
(TIE)”.
Lancement du programme pluridisciplinaire «
Chimie Durable », Campus Gérard Mégie, Paris,
France
10. Budzinski H., Mazéas O., Le Dû M.
Exposure of marine organisms to Polyaromatic
Hydrocarbons (PAHs): Use of PAH metabolites to
study the link
exposure/bioavailability/biotransformation.
GDR IMOPHYS, La Rochelle, France
11. Budzinski H., Togola A., Lardy S., Le Menach
K., Augagneur S., Peluhet L.
Substances pharmaceutiques : nouveaux
contaminants des systèmes aquatiques ?
Journée du CRCM, Bordeaux, France
12. Budzinski H., Villenave E.
Etude de l’oxydation de polluants organiques
associés aux particules atmosphériques :
développements analytiques, réactivité et toxicité :
Application aux composés aromatiques
polycycliques (CAP), aux poly-bromo-diphényléthers
(PBDE) et à leurs produits d’oxydation.
Inauguration de l’ISM, Bordeaux, France
13. Cachot J., Norris M., Law M., Budzinski H.,
Pottier D., Le Menach K., Lacroix S., André V.,
Gallois J., Winn R.
Evaluation of biological effects induced by chronic
exposure to a mixture of PAH on a fish model, the
Lambda cII Japanese Medaka. I. Embryo exposure.
Séminaire du GDR IMOPHYS, La Rochelle,
France
110

14. Crespo A., LeMenach K., Garnier C., Parlanti E.,
Budzinski H.
Etude intégrée sur la présence et le devenir des
Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques dans le
Bassin d’Arcachon: identification des sources, des
mécanismes de transferts eau-particules-sédiments,
évaluation de la biodisponibilité et du potentiel
génotoxique.
1 ère Journée autour du Bassin d’Arcachon,
Arcachon, France
15. Dévier M.H., Budzinski H.
PAH and PBDE levels in feeding fats.
Meeting of the Feeding Fats Safety European
program, Barcelone, Spain
16. Dévier M.H., Budzinski H.
Activities and prospects of the 2 nd year: PAH and
PBDE levels in the different exposure trials.
Meeting of the Feeding Fats Safety European
program, Uppsala, Suède.
17. Garnier C., Lesven L., Billon G.
Développement de micro-électrodes pour la mesure
in-situ d'éléments traces.
Séminaire du programme de recherche
STARDUST (INTERREG III), Villeneuve d’Ascq,
France
18. Huguet A., Parlanti E.
Concentration par nanofiltration et osmose inverse.
Séminaire du Groupement de Recherche
MONALISA, Toulon, France
19. Narbonne J.F.
Sécurité alimentaire : Risques chimiques du champ
à l’assiette.
Congrès ADLF, Strasbourg, France
20. Omanović D., Cmuk P., Pižeta I., Louis Y.,
Nicolau R., Garnier C.
Trace metal complexation in natural waters:
Pseudopolarography and Metal complexing
capacity (MCC).
Séminaire du Groupement de Recherche
MONALISA, Toulon, France
21. Parlanti E.
Applications de la fluorimétrie à l’analyse des
eaux. Caractérisation de la matière organique
dissoute.
Laboratoire EDYTEM – Université de Savoie,
LeBourget du Lac, France
2007
22. Budzinski H.
What could be the input of chemistry in
ecotoxicology to access the chemical risk?
GDR IMOPHYS, Nantes, France
111
23. Budzinski H.
Les substances pharmaceutiques : nouveaux
contaminants des écosystèmes aquatiques.
Journée Thématique OASU "L'observation de la
Planète et de l'Univers", Bordeaux, France
24. Budzinski H., Togola A.
Présence des résidus de médicaments dans les
différents compartiments du milieu aquatique.
Journée de l’école doctorale des sciences chimiques
de l’Université Blaise Pascal, Clermont-Ferrand,
France
25. Budzinski H., Togola A., Murcia F.
Les contaminants émergents des systèmes
aquatiques : cas des substances pharmaceutiques.
Journée ECOBAG « Normes et Risques »,
Toulouse, France
26. Cachot J.
Effets toxiques et risque écotoxicologique des HAP
vis à vis des espèces aquatiques. Vers le
développement de nouveaux outils et de nouvelles
stratégies d’étude.
Séminaire du laboratoire ISM-LPTC,
Bordeaux,France
27. Crespo A., De Perre C., Lemenach K., Parlanti
E., Budzinski H.
Etude intégrée sur la présence et le devenir de la
contamination en hydrocarbures aromatiques
polycycliques dans le Bassin d’Arcachon.
2 nde Journée autour du Bassin d’Arcachon,
Arcachon, France
28. De Perre C., Budzinski H., Parlanti E.
Etude des interactions matière organique /
contaminants organiques dans l’environnement.
École Chercheur INRA « Interactions matières
organiques et micropolluants - Méthodes de
caractérisation et modélisation », La Grande-Motte,
France
29. Dévier M.H., Budzinski H.
Levels of PAHs and PBDEs in animal tissues and
rate of transfer from feed: Preliminary results of
the WP4 activity.
Meeting of the Feeding Fats safety European
Program, Bologne Italie (COI)
30. Dévier M.H., Budzinski H.
Levels of PAHs and PBDEs in animal tissues and
rate of transfer from feed: Tasks accomplished and
future prospects in WP4.
Meeting of the Feeding Fats safety European
Program, Barcelone, Espagne
31. Dévier M.H., Budzinski H.
Levels of PAHs and PBDEs in animal tissues and
rate of transfer from feed.
Meeting of the Feeding Fats safety European
Program, Florence, Italie.

32. Garnier C.
Caractérisation des interactions entre la Matière
Organique Dissoute et les métaux traces,
application à l'étude de systèmes naturels.
Séminaire de l’UMR TCEM (INRA), Villenave
d’Ornon, France
33. Giraudel J.L.
Les volatils de la fraises : écriture et comparaison
des signatures chimiques.
Commission internationale des industries agricoles
et alimentaires, Paris, France
34. Le Dû-Lacoste M., Budzinski H., Morin B.,
Akcha F., Burgeot T.
Intérêt de l’étude de la biotransformation des HAP
chez les organismes marins (poissons) dans la
surveillance environnementale - Relation
exposition-génotoxicité.
Séminaire du programme ANR Sole BEMOL,
Nantes, France
35. Le Dû-Lacoste M., Budzinski H., Morin B.,
Akcha F., Burgeot T.
Exposure of marine organisms to polycyclic
aromatic hydrocarbons (PAHs): use of PAH
metabolites in monitoring programs for a better
understanding of PAH contamination.
GDR IMOPHYS, Nantes, France
36. Narbonne J.F.
L’Homme toxique : De la contamination à l’impact
santé publique.
11° NATURAVIGNON, Association AENIR,
Avignon, France
37. Narbonne J.F.
Risques alimentaires : Les nouveaux concepts.
Ritrovarsi, PhytoQuant, Monaco.
38. Narbonne J.F.
L’alimentation est-elle toxique ?
Longevity 2007, 2 ème congrès sur la médecine
préventive : Prévention du cancer, Palais des rois de
Majorque, Perpignan, France
39. Parlanti E.
Application de la fluorescence à la caractérisation
de la matière organique dissoute (MOD) dans les
eaux naturelles (milieux marin et estuarien).
Journée de la fluorescence des matières organiques
dissoutes, Campus SupAgro-INRA, Montpellier,
France
40. Parlanti E.
Application de la fluorescence à la caractérisation
de la matière organique.
École Chercheur INRA « Caractérisation des
Matières Organiques en relation avec les processus
de dégradation et stabilisation », La Rochelle,
France
41. Tuduri L.
Nouveaux outils pour le prélèvement de molécules
organiques dans l’air: Monitoring environnemental
et évaluation de l’exposition humaine.
Département Santé Environnement-Santé Travail,
Faculté de Médecine, Université de Montréal,
Canada.
2008
42. Budzinski H., Dévier M.H.
Transfer of PAHs and PBDEs from feed to animals.
Meeting of the Feeding Fats safety European
Program, Barcelone, Spain
43. Garnier C., Laperruque C., Lenoble V., Pižeta I.,
Gonzalez JL.
Monitoring of trace elements in environment:
Helpfulness of micro-electrodes compared to passive
samplers.
13 th summer university, Tuzla, Bosnie Herzégovine.
44. Giraudel J.L.
Utilisation des cartes auto-organisatrices en
chimiométrie.
Société des Experts Chimistes de France : Journée
“Chimiométrie et expertise chimique”, Paris,
France
45. Mazellier P.
Les Procédés Avancés d’Oxydation dans le
traitement de l’eau.
Université El Jadida, Maroc.
46. Narbonne J.F.
Consommations Alimentaires de produits de la mer
et apports en Acides Gras Oméga 3, approche
Bénéfice / Risque.
Colloque Mer et Santé, Université Internationale de
la Mer, Cagnes sur Mer, France
47. Narbonne J.F.
Les Toxiques dans notre assiette.
Salon des Médecines Naturelles (MEDNAT),
Lausanne, Suisse.
48. Narbonne J.F.
Les polluants persistants et les filières de
traitement des déchets, évolution depuis 20 ans.
Colloque Scientifique « Déchets et Santé »
Traitement des déchets et santé publique, Agen,
France
49. Narbonne J.F.
New contaminants and new approaches AFSSA
Priorities.
Séminaire international Eurofins, Paris, France
50. Narbonne J.F.
Les Pesticides: Evaluation des Risques.
Association Les Jardins du Cœur, Paris, France
112

51. Crespo A., De Perre C., Le Ménach K., Parlanti
E., Budzinski H.
Etude intégrée sur la présence et le devenir de la
contamination en hydrocarbures aromatiques
polycycliques dans le Bassin d'Arcachon
Journée du Bassin d’Arcachon, France
2009
52. Murcia F., Le Menach K., Pardon P., Augagneur
S., Auby I., Budzinski H.
Approche multirésidus pour le suivi des pesticides
dans différents compartiments de l’environnement
aquatiques du bassin d’Arcachon
Séminaire Arcachon, France
53. Budzinski H, Soulier C, Abu Mrad N., Lardy S.,
Capdeville M.J., Tapie N., Vrana B., Ait Aissa S.
Passive samplers for chemical substance
monitoring and associated toxicity assessment in
water
GDR-I EXECO
54. Capdeville MJ., Pardon P., Budzinski H.
Development of a method for a multi-class analysis
of pharmaceuticals in water
Séminaire Agilent, Paris, France
Oral Presentations in International Meetings
(COM)
2005
1. Bouïrik B., Mazellier P., Kherbeche A., Legube B.
Detoxification et disinfection des eaux de surface
par couplage photocatalyse-photosensibilisation.
5 th International Symposium on Environment and
Process Engineering, Fès, Maroc.
2. Bouïrik B., Mazellier P., Kherbeche A., Legube B.
Detoxification et disinfection des eaux de surface
par couplage photocatalyse-photosensibilisation.
5 th International Symposium on Environment and
Process Engineering, Fès, Maroc.
3. Busset C., Mazellier P., De Laat J.
Reactivity of carbonate radical in aqueous solution.
17 th International Ozone Association World
Congress, Strasbourg, France.
4. Cailleaud K., Forget-Leray J., Souissi S.,
Budzinski H.
Bioaccumulation and effects of organic
contaminants of the Seine estuary on a calanoid
copepod Eurytemora affinis : a microcosm study.
15 th Society of Environmental Toxicology and
Chemistry (SETAC)-Europe Annual Meeting,
Lille, France
5. Cailleaud K., Budzinski H., Souissi S., Forget-
Leray J.
Multidisciplinary study of the effect of organic
compounds on a calanoid copepod, Eurytemora
affinis from biochemical to behavioural behaviour :
a microcosm study.
9 th International Conference On Copepoda (ICOC),
Hammamet, Tunisie
6. Carpy A., Marchand-Geneste N.
e-Bioinformatics and rational drug design.
CMTPI 2005, Shanghai, Chine.
7. Codony R, Bondioli P., Dutta P., Rodriguez-
Estrada M., Abad E., Budzinski H., Baucells M., E.
Blas E., Parini M.
Feeding fat safety project, improving the use of
feeding fat material coming from by- or coproducts
from the food chain : a quality and safety
approach.
ISF 26th World congress and exhibition, Praque,
République Tchèque
8. Davail-Cuisset B., Lacomme S., Pelard M.,
Rouault T., Lepage M., Williot P.
Hormonal profile in adults of critically endangered
sturgeon, Acipenser sturio, adapted to hatchery
conditions.
5 th International Symposium on Sturgeon, Ramsar,
Iran.
9. Decourtye A., Budzinski H., Le Menach K.,
Devillers J.
The proboscis extension response as a method to
evaluate the sublethal effects of pesticides on the
honey bee.
15 th Society of Environmental Toxicology and
Chemistry (SETAC)-Europe Annual Meeting,
Lille, France
10. Devillers J., Carpy A., Marchand-Geneste N.,
Porcher J.M.
SAR and QSAR Modeling of Endocrine Disruptors.
CMTPI 2005, Shanghai, Chine.
11. Legube B., Sawadogo A., Autissier L., Mazellier
P., Bouirik B., Kherbeche A
Complementarities of heterogeneous photocatalysis
and photosensibilization to produce drinking water
from a river water - Preliminary results of the
AQUACAT project.
8 th International Conference on solar energy and
applied photochemistry – 5 th International
Workshop on environmental photochemistry,
Louxor, Egypte.
113

12. Marchand-Geneste N., Cazaunau M., Carpy A.,
Laguerre M., Porcher J.M., Devillers J.
Molecular basis of endocrine disruption: modeling
the rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) estrogen
receptor (rtER).
CMTPI 2005, Shanghai, Chine.
13. Mazellier P., Méïté L., De Laat J.
Degradation of Two Pharmaceuticals by Light and
Reactive Oxygen Species: Diclofenac and
Ethynylestradiol.
8 th International Conference on solar energy and
applied photochemistry – 5th International
Workshop on environmental photochemistry,
Louxor, Egypte.
14. Mazellier P., Méité L., De Laat J.
Photochemical transformation of emerging
pollutants in aqueous solution: example of
Diclofenac and Ethynylestradiol.
6 th European Meeting of Environmental Chemistry,
Belgrade, Serbie.
15. Olu-Le Roy K., Le Goff A., Fifis A., Caprais
JC., Budzinski H., Riera P., Khripounoff A., Sibuet
M.
Spatial distribution and nutrition patterns of
megafauna on a giant pockmark in the gulf of
Guinea.
3 rd Seep and Vent Biology Symposium, San Diego,
USA
16. Rabiet M., Togola A., Elbaz-Poulichet F.,
Brissaud F., Seidel JL., Budzinski H.
Impact of a wastewater in a medium-sized
Mediterranean watershed.
15 th Society of Environmental Toxicology and
Chemistry (SETAC)-Europe Annual Meeting,
Lille, France
17. Rocher B., Manduzio H., Geffard O., Le Menach
K., Peluhet L., Augagneur S., Pottier D.,
Leboulenger F., Budzinski H., Cachot J.
Evidence for relationships between enzymatic
biomarker responses and pollution loads in mussel
species collected along a pollution gradient.
PRIMO 13, Alessandria, Italie.
18. Tapie, F. Daverat, R. Maury Brachet, P. Elie, A.
Boudou, H. Budzinski
Polycontamination of Eels in the Gironde estuary
(metals, and organic pollutants).
Fish and Diadromy in Europe, Bordeaux, France
19. Tocqué E., Béhar F., Budzinski H., Lorant F.
Carbon isotopic balance of kerogen effluents in a
closed system.
American Association of Petroleum Geologists
(AAPG) symposium, Paris, France
20. Villenave E.
Réactivité de radicaux peroxyles issus de
l’oxydation de composés organiques volatils :
spectroscopie et mécanismes.
Colloque "Interface Spectroscopie-Chimie
atmosphérique", Lille, France
21. Waite D.T., Cessna A.J., Quiring D.V., Harner
T., Blanchard P and Tuduri L.
Atmospheric Concentrations of Current-Use
Pesticides in Saskatchewan - Spatial and Temporal
Trends
40 th Annual Western Canada Trace Organic
Workshop, Winnipeg, Canada.
22. Yao Y., Tuduri L., Harner T, Blanchard P.,
Waite D.T., Poissant L., Li, Y.F., Murphy C.,
Belzer W., Aulagnier F.
Canadian pesticide air sampling campaign.
Dioxin 2005, Toronto, Canada.
2006
23. Bouraoui Z., Clerandeau C., Banni M., Narbonne
J.F., Bousseta H.
Evaluation de la NAD(P)H réductase et la GST en
réponse à une courte exposition de B(a)P et Cu
chez le polychète Néréis diversicolor.
2 ième Colloque Euro-Méditerranéen de
biosurveillance des écosystèmes aquatiques :
aspects Protéomiques et génomiques, Sousse,
Tunisie
24. Budzinski H.
Pharmaceutical Substances: Emergent
Contaminants of the Aquatic Systems.
1 st thematic workshop of the EU project NORMAN
– Chemical Analysis Of Emerging, Mao, Espagne
25. Budzinski H., Estève W., Perraudin E., Miet K.,
Villenave E.
Heterogeneous Reactivity of PAHs Adsorbed on
Atmospheric Particles
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays-Bas
26. Cachot J., Law M., Norris, M., Le Menach K.,
Budzinski H., Winn R.
The use of embryos of the Lambda cII transgenic
medaka for environmental risk assessment.
Application to the sediments of the Seine estuary
(Normandy, France).
36 th Annual Meeting of the European
Environmental Mutagen Society, Prague,
République Tchéque
114

27. Devillers J., Marchand-Geneste N., Doré J.C.,
Porcher J.M., Poroikov V.
Modeling the endocrine disruption profile of
xenobiotics.
International Conference of Computational
Methods in Sciences and Engineering, Chania,
Crète
28. Garrigues P,
What have we learnt on Environmental Chemistry
in the last ten years ?
1 st European Chemistry Congress, Budapest,
Hungary
29. Lesven L., Mikkelsen Ø., Skogvold S., Billon G.,
Garnier C., Johnsen C., Schrøder K.
Speciation studies of iron in a river water system
entering brackish and estuarine water zones, 11 th
International Conference on Electroanalysis,
Bordeaux, France.
30. Minier C., Denier X., Knigge T., Cachot J., Hill
E.M., Abarnou A
A pollution monitoring study involving contaminant
and biomarker measurements in the Seine Estuary
using zebra mussels (Dreissena polymorpha).
Third conference on Metals in the Environment,
Vilnius, Lituanie
31. Narbonne J.F.
Risk-Based Consumption Advice for Farmed and
Wild fish sold in European markets.
PCB Workshop, Zakopane, Pologne
32. Tapie N., Budzinski H.
PCBs and PBDEs in French Estuaries: Analytical
methodology and environmental results.
1 st European Chemistry Congress, Budapest,
Hongrie
33. Togola A., Budzinski H.
Development of Polar Organic Compounds
Integrative Sampler (POCIS) for study of
pharmaceuticals.
2 nd International Passive Sampling Workshop and
Symposium (IPSW 2006), Bratislava, Slovaquie
34. Togola A., Budzinski H.
Study of Pharmaceuticals on aquatic
compartments: sources, behaviour and fate.
1 st European Chemistry Congress, Budapest,
Hongrie
2007
35. Albinet A., Leoz-Garziandia E., Budzinski H.,
ViIlenave E., Jaffrezo J.-L.
Physicochemical Characterization of Nitrated and
Oxy- Polycyclic Aromatic
Hydrocarbons in the Atmospheres of two French
Alpine Valleys.
European Aerosol Conference (EAC), Salzberg,
Autriche
115
36. Amiard-Triquet C., Durou C., Amiard JC., Berthe
T., Billon G., Budzinski H., Créach A., Roméo M.,
Debenay JP., Deloffre J., Denis F., Denis L., Ferrero
T., Gillet P., Hummel P., Mouneyrac C., Ouddane
B., Petit F., Poirier L., Quillet L., Smith B.,
Sylvestre F.
A comprehensive methodology for the assessment
of the health status of estuarine ecosystems.
ICES meeting, Helsinki, Finland
37. Boukari S., Delmont A., Catastini C., Karpel N.,
Mazellier P.
Dosage de deux médicaments anticancéreux
(étoposide et méthotrexate) dans des eaux
résiduaires.
7 ème Congrès International du Groupement de
Recherche Universitaire sur les Techniques de
Traitement et d'Epuration des Eaux, Pau, France.
38. Budzinski H., LeMenach K., Mazéas O., Le-Du
M., Morin B., Akcha F., Burgeot T.
Exposure of marine organisms to Polycyclic
Aromatic Hydrocarbons (PAHs): Use of PAH
metabolites to track the impact of hydrocarbon
inputs in relation to their toxic impacts.
ISPAC 21 st meeting, Trondheim, Norvège
39. Budzinski H., Togola A., Lardy S., Le Menach
K.
Pharmaceutical substances: emergent
contaminants of the aquatic systems.
CIESM 38 th congress, Istanbul, Turquie
40. Cachot J., André V., Law M., Burgeot T., Cherel
Y., Winn R., Budzinski H.
Comparative responses of fish and bivalves to the
pollution of the Seine estuary (France).
ECOBIM 2007, Rimouski, Canada
41. Cachot J., Minier C., Law M., Pottier D., Schleis
J., Peluhet L., Norris M., Budzinski H., Winn R.
The use of embryos of the Lambda cII transgenic
Medaka to assess short and long term effects of
sediment-sorbed pollutants: Application to
sediments of the Seine estuary (Normandy, France).
PRIMO 14, Florianópolis, Brézil
42. Catastini C., Boukari S., Mullot J.-U., Cervantès
P., Mazellier P., Levi Y.
Devenir de molécules anticancéreuses provenant
des rejets hospitaliers.
Colloque de l’ASEES « Les xénobiotiques dans les
eaux naturelles et dans le cycle des eaux destinées à
la consommation humaine », Luxembourg

43. Devillers J., Panaye A., Doucet J.P., Marchand-
Geneste N., Porcher J.M.
Linear vs nonlinear QSAR models for androgen
receptor binding affinity of natural and man-made
chemicals.
17 th SETAC Europe Annual Meeting, Porto,
Portugal
44. Devillers J., Panaye A., Doucet J.P., Marchand-
Geneste N., Porcher J.M.
Structure-activity modeling of a diverse set of
androgen receptor ligands.
4 rd International Symposium on Computational
Methods in Toxicology and Pharmacology
integrating Internet Resources, Moscou, Russie
45. Guillet V., Favé C., Montury M.
Extension of microwave/SPME method to quantify
pesticide residues in tomato plants.
V th MGPR International Symposium, Agadir,
Maroc
46. Lardy-Fontan S, Coulon S, Le Menach K, Martin
Ruel S, Choubert J.M, Coquery M, Budzinski H.
Wastewater treatment plant faced to detergents and
pharmaceutical substances. What processes to
succeed in the decrease of their load to aquatic
systems?
Congrès EMEC, Inverness, Ecosse.
47. Lehtonen K., Budzinski H., Turja R., Leivuori M.,
Dévier M.H.
Deployment of caged mussels (Mytilus spp.) as a
method to study chemical pollution in the Baltic
Sea: a case study in the Archipelago Sea (SW
Finland).
ICES meeting, Helsinki, Finland
48. Marchand-Geneste N., Devillers J., Doré J.C.,
Porcher J.M.
e-endocrine disrupting chemical databases for
deriving QSAR models.
4 rd International Symposium on Computational
Methods in Toxicology and Pharmacology
integrating Internet Resources, Moscou, Russie
49. Mazellier P., De Laat J.
Comparison of Fenuron degradation by hydroxyl
and carbonate radicals in aqueous solution.
8 th European Meeting of Environmental Chemistry,
Inverness, Ecosse
50. Méité L., Szabo R., Mazellier P., De Laat J.
Cinétique de phototransformation de polluants
émergents en solution aqueuse diluée.
7 ème Congrès International du Groupement de
Recherche Universitaire sur les Techniques de
Traitement et d'Epuration des Eaux, Pau, France.
51. Miet K., Budzinski H. Villenave E.
Heterogeneous reactivity of NO 2 and O 3 with
pyrene and two of its derivatives adsorbed on
atmospheric model particles.
21 th International Symposium on Polynuclear
Aromatic Compounds, Trondheim, Norvège
52. Miet K., Cazaunau M. Estève W., Perraudin E.,
Flaud P.-M., Budzinski H., Villenave E.
Chimie hétérogène des polluants organiques dans
la basse atmosphère: impact sur la
qualité de l'air.
9 ème journées francophones des jeunes physicochimistes,
Maubuisson, France
53. Morin B., Clérandeau C., Salata R.C., Scavennec
M., Taberly J., Bassères A., Narbonne J.F.
Potential value of the 8-oxodG, DNA strand breaks
and micronuclei measurements for monitoring
fresh water environments in rainbow trout.
17 th Society of Environmental Toxicology and
Chemistry (SETAC)-Europe Annual Meeting,
Porto, Portugal
54. Narbonne JF, Clérandeau C., Daubèze M.
Application de l’index MPI à la surveillance d’un
milieu estuarien mettant en œuvre des moules en
cages
ECOBIM mai 2007, Rimouski, Canada.
55. Narbonne J.F.
Chlordecone in French Caribbean: An example of
misuse of pesticides.
5° MGPR Symposium: Pesticides in Food and the
Environment, Agadir, Maroc
56. Quivet E., Marrakchi Fayoumi M., Cazaunau M.,
Le Menach K., Flaud P.-M., Budzinski H.,
Villenave E.
Fate of Deca-Brominated Diphenyl Ether (BDE-
209) Adsorbed on Model of Atmospheric Particles:
Analytical Development and Heterogeneous
Reaction with Ozone.
BFR 2007 Workshop, Amsterdam, Pays-Bas
57. Tuduri L., Mercury M., Montury M., Millet M.,
Briand O.
Passive samplers as a key tool to estimate
atmospheric exposure to pesticides on different
time scale.
SETAC Europe, Porto, Portugal
58. Wessel N., Akcha F., Le Dû-Lacoste M., Burgeot
T., Budzinski H., Cravedi JP.
Bioactivation of benzo[a]pyrene and fluoranthene
by Solea solea microsomes: implication in terms of
genotoxicity
34 th Aquatic Toxicity Workshop, Halifax, Nova
Scotia, Canada
116

2008
59. Budzinski H.
Couplage capteurs passifs et biotests de toxicité
pour la mise en évidence de composés présents en
phase dissoute.
Colloque ECOBIM, Bordeux, France
60. Budzinski H.
Nouvelles approches pour qualifier la
contamination chimique des milieux aquatiques :
échantillonneurs passifs et biotests.
5 ème Journées Techniques Eaux et Déchets, INSA
de Toulouse, France
61. Budzinski H.
Substances pharmaceutiques nouveaux
contaminants des systèmes aquatiques.
2 ème Congrès des sciences analytiques (CSA 2008),
Casablanca, Maroc
62. Budzinski H., Lardy-Fontan S., Soulier C.
Laboratory and field validation of POCIS for the
monitoring of pharmaceuticals and detergents in
French River Basin.
SETAC Europe 18 th Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
63. Cachot J., Winn R., Sundberg S., Norris M.,
Budzinski H., Le Ménach, Law M., Akcha F.
Wessel N., André V., Le Goff J., Pottier D., Vince
E., Vicquelin L.
Effets mutagènes et cancérogènes des HAP sur un
poisson modèle, le Médaka Japonais, Oryzias
latipes. II. Exposition par voie trophique.
Atelier International sur l’évaluation du stress
environnemental, ECOBIM 2008, Bordeaux,
France
64. Caquet T., Allenou J.P, Auffret M., Budzinski
H., Burgeot T., Delmas F., Dubernet J.F., Farcy E.,
Gabellec R., Heydorff M., Hitier B., Lagadic L.,
Mazella N., Madigou C., Menard D., Mondeguer
F., Morin B., Renault T., Roucaute M.
Presence and effect of pesticides along estuarine
continuums in the Bay of Vilaine area (Brittany,
France) .1. Background and general overview of
the programme.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
65. Caquet T., Mazella N., Delmas F., Budzinski H.,
Dubernet J.F., Allenou J.P., Gabellec R.
Presence and effect of pesticides along estuarine
continuums in the Bay of Vilaine area (Brittany,
France) .2. Monitoring of environmental
contamination.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
66. Cazaunau M., Budzinski H., Villenave E.
Preliminary study of atmospheric degradation of
PolyBrominated Diphenyl Ethers.
Society of Environmental Toxicology and
Chemistry (SETAC), Varsovie, Pologne.
67. Choubert J.M., Martin-Ruel S., Gabet V., Lardy
S., Miège C., Esperanza M., Budzinski H. Coquery
M.
Fate of Selected Priority and Emergent Pollutants
Through Municipal Activated Sludge
Process, IWA, Vienne Autriche
68. Coquery M., Miège C., Choubert J.M., Martin-
Ruel S., Gabet V., Lardy S., Esperanza M.,
Budzinski H.
Fate of selected pharmaceutical products and
hormones through municipal activated sludge
process.
KNAPPE Workshop, Nîmes, France
69. De Perre C., Lemenach K., Ibalot F., Budzinski
H., Parlanti E.
Interactions between Dissolved Organic Matter and
Organic Contaminants in aquatic environment.
14 th International Meeting of the International
Humic Substances Society (IHSS), Moscou – Saint
Petersbourg, Russie
70. Dévier M.H., Budzinski H.
Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) and
polybrominated diphenyl ethers (PBDEs) in
animals fed with fat recycled materials and their
rate of transfer from feeds to meat.
2 nd EuCheMS Chemistry Congress, Turin, Italie
71. Devillers J., Panaye A., Doucet J.P., Marchand-
Geneste N., Porcher J.M.
Androgen receptor ligand modeling: Current
situation and tasks for the future.
13 th International Workshop on Quantitative
Structure-Activity Relationships in Environmental
Toxicology, Syracuse, USA
72. Farcy E., Allenou J.P., Auffrey M., Budzinski
H., Burgeot T., Gabellec R., Gagnaire B., Heydorff
M., Lagadic L., Le Goic N., Mazella N., Menard
D., Mondeguer F., Renault T., Caquet T.
Presence and effect of pesticides along estuarine
continuums in the Bay of Vilaine area (Brittany,
France) .3. Biomarker responses in bivalves.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
73. Jacquet R., Miège C., Lardy S., Budzinski H.,
Coquery M.
Comparison of POCIS and SPMD for in situ
sampling of moderately hydrophobic molecules.
EMEC9, Girona, Espagne
117

74. Lenoble V., Loustau-Cazalet M., Garnier C.,
Mounier S., Pfeifer H.-R.
Determination of Arsenic/dissolved organic matter
interactions by voltametry and fluorescence.
2 nd International Congress: Arsenic in the
environment, Valencia, Espagne.
75. Lissalde S., Mazzella N., Delmas F., Mazellier P.
In situ calibration of the Polar Organic Chemical
Integrative Sampler and suggestion of a
performance reference compound.
18 th Annual Meeting of SETAC Europe, Varsovie,
Pologne
76. Lissalde S., Mazzella N., Delmas F., Mazellier P.
A Performance Reference Compound (PRC)
proposition to improve the time-weighted average
concentration estimates of herbicides with the
Polar Organic Chemical Integrative Sampler
(POCIS).
5 th European Conference on Pesticides and Related
Organic Micropollutants in the Environnement 11th
Symposium on Chemistry and Fate of Modern
Pesticides, Marseille, France
77. Nguyen Q., Mazellier P., De Laat J.
Effect of carbonate ions on the degradation of N-
containing compounds in TiO2 photocatalytic
systems.
9 th European Meeting of Environmental Chemistry,
Girone, Espagne
78. Szabó R., Gajda- Schrantz K., Dombi A.,
Mazellier P.
Photodegradation of pharmaceutical compounds.
9 th European Meeting of Environmental Chemistry,
Girone, Espagne
79. Tuduri L., Wang J., Briand O., Millet M.,
Montury M.
Development of Solid Phase Microextraction as a
passive sampler for atmospheric pesticides: lab and
field studies
5 th European Conference on Pesticides and Related
Organic Micropollutants in the Environment,
Marseille, France
2009
80. Auburtin G., Teigné D., Briand O., Delhomme
O., Dulaurent S., Millet M., Moesch C., Tuduri L.,
Racault L.
Development of an integrated method for the
estimate of the pesticides exposures in a nonagricultural
occupationally exposed population,
7 th International Conference on Air Quality -
Science and Application, Istanbul, Turquie.
81. Biré R., Bernard C., Budzinski H., Fessard V.,
Trousselier M., Créppy E., Amzil Z., Dréno J.P.,
Sautour B., Fontaine J.J., Krys S.
The National Program Arcachon: towards the
elucidation of the unexplained positive results in
the mouse bioassay observed in 2005 and 2006 as
part of the routine monitoring for lipophilic marine
biotoxins in shellfish harvested in the bay of
Arcachon.
ICMSS 2009, Nantes, France
82. Bravin M. N., Garnier C., Hinsinger P.
Root Mediated Alteration of Copper Lability in
Wheat Rhizosphere.
10 th International Conference on Biogeochemistry
of Trace Elements (ICOBTE), Chihuahua, Mexico.
83. Budzinski H. Tapie N., Soulier C.
Calibration and field evaluation of POCIS and
Chemcatcher passive samplers for the monitoring
of polar organic compounds in water.
IPSW 2009, Prague, République Tchèque
84. Budzinski H., Dévier M.H., Tapie N., Belles A.,
Soulier C.
Les échantillonneurs intégratifs : une stratégie
émergente pour la surveillance de la pollution
chimique des systèmes aquatiques.
ECOBIM 2009, Anse Saint-Jean, Canada
85. Cachot J., Vicquelin L., Leray-Forget J., Morin
B., Budzinski H.
Etude des effets des hydrocarbures aromatiques
polycycliques sur les premiers stades de
développement du médaka japonais.
ECOBIM 2009, Anse Saint-Jean, Canada
86. Capdeville M.J., Pardon P., Budzinski
Hernandez-Raquet G.
Development of a method for the multi-class
analysis of pharmaceuticals in sewage water.
Xenowac 2009, Paphos, Chypre
87. Jacquet R., Miège C., Soulier C., Budzinski H.,
Coquery M.
POCIS versus SPMD for in situ sampling of
estrogenic hormones, bêtablockers and
alkylphenols.
IPSW 2009, Prague, République Tchèque
88. Loison J.-C., Rio C., Caralp F., Flaud P.-M.,
Villenave E.
New Structure-Activity Relationships (SAR) for H
atom abstraction branching ratio for OH reaction
with alkenes and dienes.
European Geosciences Union General Assembly
2009, Vienne, Autriche
118

89. Morin B., Scelo A.L., Taberly J. Narbonne J.F.,
Clerandeau C., Daubèze., Bassères A., Davail B.
Réponses biochimiques et effets génotoxiques d’un
herbicide diquat, d’un adjuvant nonylphénol
polyéthoxylé et du cadmium sur la truite arc-en-ciel
en mésocosme.
ECOBIM 2009, Anse Saint-Jean, Canada
90. Narbonne J.F., Clerandeau, C., Daubèze, Morin
B., Scelo A.L., Davail-Cuisset B., Bassères A.
Approche multimarqueurs chez la truite exposée en
mésocosme dynamique à des contaminants
organiques et inorganiques.
ECOBIM 2009, Anse Saint-Jean, Canada.
91. Rio C., Loison J.-C., Caralp F., Flaud P.-M.,
Villenave E.
Branching ratios between the abstraction and
addition channels in the reactions of OH radicals
with monoterpenes.
European Geosciences Union General Assembly
2009, Vienne, Autriche
92. Vicquelin L., Leray-Forget J., Morin B.,
Budzinski H., Cachot J.
A new embryo-larval assay for toxicity assessment
of hydrophobic and sediment-associated pollutants
15 th International Symposium on Pollutant
Response In Marine Organism (PRIMO 15),
Bordeaux, France
93. Wessel N., Santos R., Menard D., Le Menach K.,
Buchet V., Le Bayon N., Loizeau V., Burgeot T.,
Budzinski H., Akcha F.
Relationship between PAH biotransformation as
measured by biliary metabolites and enzyme
activities, and genotoxicity in juveniles of sole
(Solea solea)
15 th International Symposium on Pollutant
Response In Marine Organism (PRIMO 15),
Bordeaux, France
Oral Presentations in National Meetings (COM)
2005
1. Cachot J., Le Goff J., Lacroix S., Le Ménach K.,
Briand M., Rocher B., Manduzio H., Peluhet L.,
Gallois J., Geffard O., Couteau J., Gricourt L.,
Augagneur S., Pottier D., André V., Lebailly P.,
Winn R., Budzinski H.
Analyse du risque génotoxique en estuaire de Seine,
données expérimentales.
Séminaire annuel porgramme Seine-Aval, Rouen,
France
2. Couteau J., Flaman J.-M., Urban P., Pompon D.,
Frébourg T., Leboulenger F., Cachot J
Construction d’une levure transgénique pour
l’évaluation du risque génotoxique et la
caractérisation des effets mutagènes dans
l’environnement.
Colloque de restitution du programme PNETOX,
Paris, France
3. Durou C., Mouneyrac C., Hummel H., Lardy S.,
Peluhet L., Togola A., Budzinski H., Amiard-
Triquet C.
Perturbations de la reproduction : des outils pour
une évaluation précoce de la dégradation de la
qualité du milieu estuarien et côtier.
6 ème CILO, Ecologie et Directive Cadre Européenne
sur l’eau, Vaux en Velin, France
4. Sanglar S., Loison J.-C., Villenave E.
Cinétique et mécanistique des premières étapes de
l’oxydation du phénol en phase gazeuse.
Réunion annuelle du groupe français de cinétique et
photochimie, Rennes, France
2006
5. Budzinski H., Villenave E.
Etude de l’oxydation de polluants organiques
associés aux particules atmosphériques :
développements analytiques, réactivité et toxicité :
Application aux composés aromatiques
polycycliques (CAP), aux poly-bromo-diphényléthers
(PBDE) et à leurs produits d’oxydation.
Inauguration de l’ISM, Bordeaux, France
6. Cachot J., Norris M., Law M., Budzinski H.,
Pottier D., Le Menach K., Lacroix S., André V.,
Gallois J., Winn R.
Evaluation of biological effects induced by chronic
exposure to a mixture of PAH on a fish model, the
Lambda cII Japanese Medaka. I. Embryo exposure.
Séminaire annuel du GDR IMOPHYS, La
Rochelle, France
7. Huguet A., Plantevin T., Parlanti E.
Procédés membranaires appliqués à l’étude de la
matière organique marine.
7 ème Symposium Jeunes Chercheurs SIGMA-
ALDRICH (SAJEC), Ballaruc Les Bains, France
8. Lardy S., Budzinski H
L'estuaire de la Seine : Un milieu chroniquement
contaminé par les alkylphénol-polyéthoxylés. Le
bilan de 5 années de suivi environnemental (2002-
2006).
Colloque Seine aval, Rouen, France
119

9. Le Du-Lacoste M., Budzinski H., Morin B.,
Akcha F., Burgeot T.
Intérêt du suivi des métabolites d’hydrocarbures
aromatiques polycycliques (HAP) comme outil de
diagnostic de l’exposition des organismes
aquatiques aux HAP. Relation expositiongénotoxicité.
31 ème Congrès de l’UOF (Union des Océanographes
de France), Nantes, France
10. Magnier A., Lesven L., Garnier C., Billon G.,
Mikkelsen Ø., Pižeta I., Ouddane B., Fischer JC.
An overview on solid electrodes for in situ analysis.
European North-West Symposium of Young
Scientists, Villeneuve d’Ascq, France
11. Quiniou F., Romeo M., Mouneyrac C., Gnassia-
Barelli M., Geffard A., Budzinski H.
Utilisation des biomarqueurs dans les stades
embryo-larvaires de bivalves marins comme outils
rapides et sensibles d’évaluation et de gestion du
risque chimique : étude in vitro et essai de
validation in situ.
31 ième Congrès de l’Union des Océanographes de
France « Santé et Environnement Marin » : Impact
de l’environnement marin sur la santé de l’homme,
des organismes et des écosystèmes marins. Nantes,
France
12. Ruiz E., Ausset P., Bedjanian Y., Budzinski H.,
Leoz-Garziandia E., Picaud S., Sportisse B.,
Villenave E., Wortham H.
Etude de l’évolution en zone aéroportuaire des suies
émises par les avions – Développements
expérimental et numérique.
Colloque PRIMEQUAL-APR, Avignon, France
13. Tapie N, Budzinski H., Daridan I., Le Ménach K.
Extraction de polluants organiques persistants :
l’extraction accélérée par solvant chauffé sous
pression, une méthode simple et efficace.
Forum Labo, Paris, France
14. Tapie N., Budzinski H.
Bioaccumulation des POP (Polluants organiques
persistants) dans les écosystèmes aquatiques :
application à l'estuaire de la Gironde.
31 ème Congrès de l’UOF (Union des Océanographes
de France), Nantes, France
15. Togola A., Budzinski H.
Mise en oeuvre des POCIS (Polar Organic
Compounds Integrative Sampler) pour l’étude des
substances pharmaceutiques.
Forum Labo, Paris, France
2007
16. Boukari S., Delmont A., Catastini C., Karpel N.,
Mazellier P.
Dosage de deux médicaments anticancéreux
(étoposide et méthotrexate) dans des eaux
résiduaires.
7ème Congrès International du Groupement de
Recherche Universitaire sur les Techniques de
Traitement et d'Epuration des Eaux, Pau, France
17. De Perre C., Budzinski H., Garnier C., Parlanti
E.
Application de la microextraction sur phase solide
à l’étude des interactions matière organique
dissoute – hydrocarbures aromatiques
polycycliques dans l’environnement aquatique.
8 ème Colloque du Groupe Français de l'IHSS : Rôle
et Fonction des Matières Organiques dans
l’Environnement, Lyon, France
18. Flaud P.M., Villenave E.
Etude des réactions du brome et du chlore
atomique avec le butanal.
Réunion annuelle du groupe français de cinétique et
photochimie, Marseille, France
19. Gonzalez J.L., Garnier C., Louis Y., Mounier S.
Evaluation du rôle de matière organique naturelle
sur la spéciation des contaminants chimiques
métalliques en milieu estuarien.
8 ème Colloque du Groupe Français de l'IHSS : Rôle
et Fonction des Matières Organiques dans
l’Environnement, Lyon, France
20. Huguet A., Parlanti E.
Procédés membranaires appliqués à l’étude de la
matière organique dissoute en milieux côtiers.
9 èmes Journées Francophones des Jeunes Physico-
Chimistes, Maubuisson, France
21. Huguet A., Plantevin T., Parlanti E.
Procédés membranaires appliqués à l’étude de la
matière organique dissoute en milieux côtiers.
8 ème Colloque du Groupe Français de l'IHSS : Rôle
et Fonction des Matières Organiques dans
l’Environnement, Lyon, France
22. Huguet A., Roux-De Balmann H., Casademont
E., Parlanti E.
Couplage de procédés membranaires pour l’étude
de la matière organique naturelle en milieux côtiers
23 ème Forum des Jeunes Océanographes, Arcachon,
France
23. Lardy-Fontan S., Budzinski H, Augagneur S.
Les contaminants émergents dans les systèmes
aquatiques. Présence, devenir et transferts aux
organismes biologiques. Le cas des substances
pharmaceutiques et des détergents.
Congrès ARET, Paris, France
120

24. Le Dû-Lacoste M., Budzinski H., Morin B.,
Akcha F., Burgeot T.
Les métabolites d’hydrocarbures aromatiques
polycycliques (HAP) : outil de diagnostic de
l’exposition des organismes aquatiques aux HAP.
Relation exposition-génotoxicité.
Colloque annuel ARET, Maisons-Alfort, France
25. Mazellier P., De Laat J.
Cinétique de phototransformation de polluants
émergents en solution aqueuse diluée.
7ème Congrès International du Groupement de
Recherche Universitaire sur les Techniques de
Traitement et d'Epuration des Eaux, Pau, France
26. Miet K., Budzinski H. et Villenave E.
Réactivité hétérogène de NO 2 et O 3 avec le pyrène
et deux de ses dérivés adsorbés sur des particules
de silice.
Réunion annuelle du Groupe Français de Cinétique
et Photochimie, Marseille, France
2008
27. Budzinski H.
Les challenges actuels de la chimie
environnementale et le rôle de la spectrométrie de
masse.
JFSM 2008, Grenoble, France
28. Budzinski H., Lardy S., Le Ménach K., Togola
A., Augagneur S.
Couplage capteurs passifs et biotests de toxicité
pour la mise en évidence de composés présents en
phase dissoute.
Séminaire échantillonneurs passifs et méthodes
alternatives de prélèvement, Bordeaux, France
29. Cachot J.
Utilisation du médaka transgénique Lambda 310
pour l’évaluation de la génotoxicité des polluants
aquatiques.
7 ème journée d’animation scientifique transgénèse
poisson-modèle. INRA, Paris, France
30. Cachot J., Vicquelin L., Le Ménach K.,
Budzinski H.
Analyse de la toxicité globale et identification des
composés toxiques à risque dans l’estuaire de
Seine.
Projet TOXSEINE – Seine Aval 2008, Paris,
France
31. Caquet T., Allenou J.P., Auffret M., Budzinski
H., Burgeot T., Delmas F., Dubernet J.F., Farcy E.,
Gabellec R., Heydorff M., Hitier B., Lagadic L.,
Mazella N., Madigou C., Menard D., Mondeguer
F., Morin B., Renault T., Roucaute M.
Présence et effets des pesticides le long du
continuum eau douce – eau marine en estuaire de
Vilaine : présentation générale du programme,
contamination par les pesticides et évaluation du
risque écotoxicologique.
38 ème congrès du Groupe Français des Pesticides,
Brest, France
32. Cazaunau M., Budzinski H., Villenave E.
Etude préliminaire de la dégradation
atmosphérique des Poly Bromo Diphenyl Ethers
(PBDE).
Réunion annuelle du Groupe Français de Cinétique
et Photochimie, Strasbourg, France
33. Farcy E., Allenou J.P., Auffret M., Budzinski H.,
Burgeot T., Delmas F., Dubernet J.F., Heydorff M.,
Lagadic T., Mazzela N., Madigou C., Mondegeur
F., Morin B., Renault T., Menard D., Gabellec R.,
Roucaute M., Caquet T.
Présence et effets des pesticides le long du
continuum eau douce-eau marine en baie de
Vilaine: analyse de biomarqueurs chez trois
espèces de bivalves
Congrès Groupe Français des Pesticides, Brest,
France
34. Louis Y., Garnier C., Lenoble V., Omanović D.
A study of DNOM-Copper interactions in noncontaminated
estuary waters (Šibenik, Croatia) by
kinetic and equilibrium approach.
4 èmes Journées Franco-Italiennes de Chimie, Nice,
France.
35. Marchand-Geneste N., Thienpont A.
Master ST Chimie, spécialité Qualité Chimie de
l’Environnement (QUALENC).
Conférence Internationale des Responsables des
Universités et Institutions à dominante Scientifique
et technique d'Expression Française, Fès, Maroc
36. Narbonne J.F.
Les Pesticides on t’il des effets sur la santé
10 èmes entretiens de nutrition, Institut Pasteur, Lille,
France
37. Rio C., Flaud P.-M., Loison J.-C., Villenave E.
Etude cinétique des réactions de formation des
aérosols organiques secondaires : application à la
mesure du rapport de branchement des réactions
OH + terpènes.
Réunion annuelle du groupe français de cinétique et
photochimie, Strasbourg, France
121

38. Tuduri L., Wang J., Mauran S., Briand O., Millet
M., Montury M.
Echantillonnage passif des vapeurs de pesticides-
Etudes labos/terrains.
38 ème congrès du Groupe Français des Pesticides,
Brest, France
39. Lissalde S., Mazzella N., Mechin B., Delest B.,
Delmas F., Mazellier P. (2008)
Echantillonnage des pesticides dans les eaux et
validation in situ du Polar Organic Chemical
Integrative Sampler.
38 ème congrès du Groupe Français des Pesticides,
Brest, France
2009
40. Cachot J., Vicquelin L., Morin B., LeMenach K.,
Forget J., Budzinski H.
Etude des effets des HAP sur les embryons et larves
de Médaka japonais (O. latipes).
Séminaire annuel du GDR EXECO
41. De Perre C., Lemenach K., Ibalot F., Budzinski
H., Parlanti E.
Etude des interactions Hydrocarbures Aromatiques
Polycycliques (HAP) – Matière Organique
Dissoute (MOD) aquatique par Micro-Extraction
sur Phase Solide (SPME) et extinction de
fluorescence.
2 nd Séminaire organisé par le Réseau Matières
Organiques : Matières Organiques et
Environnement, Sainte-Maxime, France.
Poster Presentations in International Meetings
(AFF)
2005
1. Budzinski H., Mazeas O., Le Du M.
Exposure of marine organisms to Polycyclic
Aromatic Hydrocarbons (PAHs) : Use of PAH
metabolites to track the impact of oil spills in
relation to their toxicity
22 nd International Meeting on Organic
Geochemistry, Séville, Espagne
2. Budzinski H., Tapie N.
A fast and common sample preparation procedure
for the analysis of persistent organic pollutants
(PBDE, PCB and organochlorinated pesticides).
15 th Society of Environmental Toxicology and
Chemistry (SETAC)-Europe Annual Meeting,
Lille, France
3. Budzinski H., Tapie N.
Contamination of aquatic organisms of the Gironde
estuary (fish, crustaceans) by polychlorobiphenyls
(PCB) and polybrominated diphenyl ethers
(PBDE).
15 th Society of Environmental Toxicology and
Chemistry (SETAC)-Europe Annual Meeting,
Lille, France.
4. Budzinski H., Togola A.
Study of pharmaceuticals in aquatic environment :
application to a marine coastal system (Cortiou
Rocky inlet, Mediterranean coast, France).
15 th Society of Environmental Toxicology and
Chemistry (SETAC)-Europe Annual Meeting,
Lille, France
5. Budzinski H., Togola A.
Input of pharmaceuticals to a natural aquatic
system: study of the Blanquefort River (nearby
Bordeaux, France).
SETAC 15 th Annual Meeting, Lille, France.
6. Cachot J., Lacroix S., Peluhet L., Le Menach K.,
Geffard O., Budzinski H.
Identification of sediment-associated compounds
involved in the genotoxicity of the upper part of the
Seine estuary.
SETAC 15 th Annual Meeting, Lille, France
7. Cachot J., Law M., M. Norris M., Budzinski H.,
Winn R.
Utilization of the Lambda transgenic Medaka for
environmental studies, application to the sediments
of the Seine estuary (Normandy, France).
Aquatic Models of Human Disease Conference,
Athens, USA
8. Cailleaud K., Budzinski H., Souissi S., Maillet G.,
Rocher B., Forget-Leray J.
Proteomic response of a calanoid copepod
Eurytemora affinis to organic contaminants
exposure: a microcosm study.
13 th International Symposium on Pollutant
Responses in Marine Organisms (PRIMO 13),
Alessandrie, Italie
9. Cailleaud K., Budzinski H., Souissi S., Forget-
Leray J.
Seasonal variations of transfers of organic
contaminants from the water column to a calanoid
copepod, Eurytemora affinis : an in situ study of the
Seine Estuary.
9 th International Conference On Copepoda (ICOC),
Hammamet, Tunisie
122

10. Cailleaud K., Budzinski H., Souissi S., Forget-
Leray J.
Comparison between the swimming behavioural
response of male and female Eurytemora affinis
consecutive to injection of endocrine disruptor
compounds.
9 th International Conference On Copepoda (ICOC),
Hammamet, Tunisie
11. Carpy A., Lazartigues A., Marchand-Geneste N.
Molecular characterization of nicotinoid
insecticides and atomic models of imidacloprid
bound to nAChRs.
SETAC 15 th Annual Meeting, Lille, France
12. Davail-Cuisset B., Ceapa C., Lacomme S.,
Patriche N., Talpes M., Grecu I., Cristea V.
Hormonal level in immature stellate sturgeon,
Acipenser stellatus, following carp pituitary
injection.
5 th International Symposium on Sturgeon,, Ramsar,
Iran
13. Davail S., Guy G., Bernadet M.D., Andre J.M.,
Gontier K., Davail B, Hoo-Paris R.
Lipoprotein-lipase activity in two genotypes of
overfed ducks.
3 rd International Waterfowl Conference,
Guangzhou, China.
14. Devillers J., Budzinski H., Augagneur S., Le
Menach K., Decourtye A.
Honey bees as indicators of environmental
contamination by xenobiotics.15 th Society of
Environmental Toxicology and Chemistry
(SETAC)-Europe Annual Meeting, Lille, France
15. Douat-Casassus C., Marchand-Geneste N., Diezc
E., Gervois N., Jotereau F., Quideau S.
Design of new melana Mart-126-35 peptide
analogues.
1 er Symposium International des Biomolécules et
Composés Apparentés, Montpellier, France
16. Douat-Casassus C., Marchand-Geneste N., Diezc
E., Gervois N., Jotereau F., Quideau S.
Design and structure activity relationship study of
newmelanoma MART-1(26-35) peptide analogues.
6 th Tetrahedron Symposium, Bordeaux, France
17. Guillet V., Montury M.
Méthode micro-ondes/SPME pour quantifier des
résidus de pesticides dans les tomates.
35 e Congrès GFP, Marne-La-Vallée, France
18. Harner T., Blanchard P., Li Y.F, Yao Y., Tuduri
L., Waite D.T., Belzer W., Froude F., Murphy C.,
Poissant L., Sproull J.
Canadian Pesticide Air Sampling Campaign
40 th Annual Western Canada Trace Organic
Workshop, Winnipeg, Canada
19. Huguet A., Al Sid Cheikh M., Relexans S.,
Garnier C., Mounier S., Gonzalez J.L., Parlanti E.
Extraction of natural organic matter from marine
waters – fluorometric characterisation of the
isolated fractions.
22 nd International Meeting on Organic
Geochemistry, Seville, Espagne
20. Le Crâne J.-P, Rayez J.-C., Rayez M.-T.,
Villenave E.
Experimental and theoretical reinvestigation of the
CH 3 C(O)O 2 with HO 2 radical reaction.
The Changing Chemical Climate of the
Atmosphere, First European ACCENT Symposium,
Urbino, Italie
21. Maillet G., Cailleaud K., Budzinski H., Forget-
Leray J.
Use of acetylcolinesterase in Eurytemora affinis
(Copepoda) as a biomarker in Seine estuary,
France. Comparison of two methods: enzymatic
histochemistry and enzymatic activity assay.
13 th International Symposium on Pollutant
Responses in Marine Organisms (PRIMO 13),
Alessandrie, Italie
22. Masson M, Schäfer J, Blanc G, Parlanti E,
Coynel A, Lemaire E, Lavaux G, Lissalde J-P,
Bossy C. Long-term monitoring of SPM and trace
metals transport to the Bay of Biscay via the main
river systems of the Adour-Garonne Basin
(France).
EGU General Assembly, Vienne, Autriche
23. Parlanti E., Vacher L.
Fluorescence indexes: new criteria for the
characterisation of dissolved organic matter in
aquatic environments.
22 nd International Meeting on Organic
Geochemistry, Seville, Espagne
24. Parlanti E., Vacher L.
New criteria for the classification of dissolved
organic matter in aquatic environments.
1 st International Workshop on Organic Matter
Modelling, WOMM’05, Toulon, France
25. Parlanti E., Vacher L., Garnier C., Mounier S.,
Fevrier D., Relexans S., Ficht A., Olivier M.
Properties of natural dissolved organic matter in
the Seine Estuary (France).
22 nd International Meeting on Organic
Geochemistry, Seville, Espagne
26. Parlanti E., Vacher L., Schaeffer J., Blanc G.
Modifications of molecular size classes of dissolved
organic matter along the Gironde Estuary
(France).
1 st International Workshop on Organic Matter
Modelling, WOMM’05, Toulon, France
123

27. Rocher B., Manduzio H., Geffard O., Le Menach
K., Peluhet L., Augagneur S., Pottier D.,
Leboulanger F., Budzinski H., Cachot J.
Evidence for relationships between enzymatic
biomarker responses and pollution loads in mussel
species collected along a pollution gradient.
13 th International Symposium on Pollutant
Responses in Marine Organisms (PRIMO 13),
Alessandrie, Italie
28. Sanglar S., Raoult S., Rayez M.-T., Rayez J.-C.,
Lesclaux R., Loison J.-C., Villenave E.
Gas phase oxidation of phenol: kinetics,
thermochemistry and mechanism of initial steps
using both theoretical and experimental
approaches.
The Changing Chemical Climate of the
Atmosphere, First European ACCENT Symposium,
Urbino, Italie
29. Souissi S., Devreker D., Cailleaud K., Dur G.,
Bonnard A., Forget-Leray J., Budzinski H.
Life cycle strategies and physiological adaptation
of the copepod Eurytemora affinis : a candidate for
developing a bioindicator of water quality.
Plankton symposium, Figueira da Foz, Portugal
30. Togola A., Budzinski H., Rabiet M., Elbaz-
Poulichet F.
Study of pharmaceuticals substances in the case of
a Mediterranean watershed.
SETAC 15 th Annual Meeting, Lille, France
31. Vacher L., Parlanti E., Schaeffer J., Blanc G.
Modifications of dissolved organic matter along the
Gironde Estuary (France) - Impact on binding
properties.
22 nd International Meeting on Organic
Geochemistry, Seville, Espagne
2006
32. Bacqart T., Geffard O., Budzinski H., Le
Menach K., Dévier M.H.
Development of a new enzymatic tool in Mytilus sp
to detect PAH contamination: Analytical
developments and field study on French coast.
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
33. Budzinski H, Le Ménach K., Bacquart T.,
Geffard O.
Develoment of new enzymatic tool in mytilus sp to
detect PAH contamination: analytical
developments and field study on french coast.
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
34. Clerandeau C., Daubeze M., Bouchard B.,
Narbonne J.F.
Echelle Indiciaire Multimarqueurs : application au
« caging » de mollusques en estuaire lors d’un
développement de méthodologie de mesure
d’impact et de qualité de l’eau.
2 ième Colloque Euro-Méditerranéen de
biosurveillance des écosystèmes aquatiques :
aspects Protéomiques et génomiques, Sousse,
Tunisie
35. Devillers J., Laforie F., Marchand-Geneste N.,
Doré J.C., Poroikov V.
Endocrine disruption profile analysis of 11416
chemicals from chemometrical tools.
12 th International Workshop on Quantitative
Structure-Activity Relationships in Environmental
Toxicology, Lyon, France
36. Huguet A., Innocent C., Roux-De Balmann H.,
Parlanti E.
Concentration of Marine Organic Matter by
Reverse Osmosis and Electrodialysis.
13th Meeting of the International Humic
Substances Society, Karlsruhe, Allemagne
37. Lardy S., Budzinski H.
A comparative study of the state of contamination
of three french macrotidal estuaries by the
biodegradation metabolites of nonylphenolpolyethoxylates.
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
38. Le Dû M., Budzinski H., Morin B, Akcha F,
Burgeot T.
Exposure of marine organisms to polycyclic
aromatic hydrocarbons (PAHs): use of PAH
metabolites in monitoring programs for a better
understanding of PAH contamination.
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
39. Lesclaux R., Perraudin E., Budzinski H.,
Villenave E.
Atmospheric reactivity of polycyclic aromatic
hydrocarbons adsorbed on particles:
heterogeneous reaction with O 3.
The Routes for Organics Oxidation in the
Atmosphere and its Applications, Alpes d’Huez,
France
40. Lesclaux R., Le Crâne J.-P., Rayez J.-C., Rayez
M.-T., Villenave E.
Experimental and theoretical reinvestigation of the
CH 3 C(O)O 2 with HO 2 radical reaction.
The Routes for Organics Oxidation in the
Atmosphere and its Applications, Alpes d’Huez,
France
124

41. Lesven L., Garnier C., Billon G., Mikkelsen Ø.,
Pižeta I.
Trace metal analysis in polluted waters using
home-made gold-disk microelectrodes.
11th International Conference on Electroanalysis,
Bordeaux, France
42. Marchand-Geneste N., Carpy A.J.M.
Interactions between two neurotoxic insecticides,
imidacloprid and fipronil, and human nACh and
GABA A receptors: Potential risk on human health.
12 th International Workshop on Quantitative
Structure-Activity Relationships in Environmental
Toxicology, Lyon, France
43. Masson M., Blanc G., Schäfer J., Parlanti E.,
Coynel A., Dabrin A., Delsuc J., Lecoustumer P.
Copper addition in the freshwater reaches of a
macrotidal estuary (Gironde Estuary, France).
9 th International Estuarine Biogeochemistry
Symposium, Warnemünde, Allemagne
44. Narbonne J.F., Bourre J.M.
Benefits and Risks of consuming standard, free
range or Omega-3 enriched Eggs.
Nutrition and Food Safety: Evaluation of Risks and
Benefits,
Budapest, Hongrie
45. Parlanti E., Giraudel J.L., Roumaillac A., Banik
A., Huguet A., Vacher L.
Fluorescence and PARAFAC Analysis: New
Criteria for the Characterization of Dissolved
Organic Matter in aquatic Environments.
13 th Meeting of the International Humic Substances
Society, Karlsruhe, Allemagne
46. Quivet E., Flaud P.M., Budzinski H., Villenave
E.
Kinetics of the heterogeneous reaction of ozone
with Deca-Brominated Diphenyl Ether (BDE-209)
adsorbed on silica particles.
19 th international symposium on Gas Kinetics,
Orléans, France
47. Quivet E., Marrakchi Fayoumi M., Budzinski H.,
Villenave E.
Atmospheric fate of Deca-brominated diphenyl
ether (BDE-209) adsorbed on silica particles:
analytical development and preliminary
degradation kinetics
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
48. Sanglar S., Raoult S., Rayez M.-T., Rayez J.C.,
Loison J.C., Villenave E.
Gas phase oxidation of phenol: kinetics,
thermochemistry and mechanism of initial steps
using both theoretical and experimental
approaches.
19 th International Symposium on Gas Kinetics,
Orléans, France
49. Sekula J., Le Dû-Lacoste M., Le Menach K.,
Budzinski H.
Determination of Polycylic Aromatic Hydrocarbons
(PAH) metabolites by GC-MS/MS.
1st European Chemistry Congress, 10 th FECS
Conference, Budapest, Hongrie
50. Skogvold S.M., Mikkelsen Ø., Billon G., Garnier
C., Lesven L., Barthe J.-F.
Ag-Cu alloy electrodes, electrochemical properties
and some applications in voltammetry.
11 th International Conference on Electroanalysis,
Bordeaux, France
51. Tapie N., Budzinski H.
Bioaccumulation of POPs in pelagic food web of
the Gironde estuary (France).
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
52. Tapie N., Budzinski H.
Kinetics of bioaccumulation of PCBs, PBDEs and
PAHs.
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
53. Togola A., Budzinski H.
Development of Polar Organic Compounds
Integrative Sampler for study of pharmaceuticals.
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
54. Togola A., Budzinski H.
Study of pharmaceuticals in the Seine estuary:
Sources, behaviour and fate in aquatic
environments.
SETAC Europe 16 th Annual Meeting, La Haye,
Pays Bas
2007
55. Albinet A., Leoz-Garziandia E., Besombes J.-L.,
Budzinski H., Villenave E.
Study of atmospheric nitrated and oxygenated
polycyclic aromatic hydrocarbons in the Marseille
area.
14 th International Symposium of Mediterranean
Scientific Association of Environmental Protection,
Séville, Espagne
125

56. Baumgardner D., Popovicheva O., Gierens K.,
Miake-Lye R., Niessner R., Petters M., Puxbaum H.,
Suzanne J., Villenave E., Rossi M.
ASN: The Atmospheric Soot Network (ASN): a
resource for atmospheric modelers and
experimentalists alike.
European Geosciences Union General Assembly
2007, Vienne, Autriche
57. Budzinki H., Togola A., Lardy-Fontan S.
POCIS as a new water monitoring tool: A first
approach for pharmaceuticals and detergents.
Workshop SWIFT, Lille,France
58. Cailleaud K, Souissi S., Augagneur S., Lardy S.,
Budzinski H., Forget-Leray J.
Experimental study of the transfer and the effects of
potentially endocrine disrupting substances using
Eurytemora affinis as test organism.
PRIMO14, Florianopolis, Brésil
59. Cazaunau M., Budzinski H., Villenave E.
Preliminary Study of the Atmospheric Degradation
of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons.
Summer School ESF-ACCENT-CNRS-GEIA,
Surface Emissions and Prediction of Atmospheric
Composition Changes, Ile d’Oléron, France
60. Champeau O., Morin B., Bodian L., Nunes
Figueiredo C., Soler Ph., Ribera D., Saint-Denis M.
Genotoxicity biomarkers for monitoring soil
toxicity in the earthworm.
SETAC Europe 17 th Annual Meeting, Porto,
Portugal
61. Davail-Cuisset B., Lacomme S., Viaene E.,
Rouault T., Lepage M., Gonthier P., Williot P.
Hormonal profile in adult European sturgeon,
Acipenser sturio, adapted to hatchery conditions in
France.
8 th Int. Symp. Fish Reprod. Physiol., Saint-malo,
France
62. De Perre C., Budzinski H., Parlanti E.
Application of solid-phase microextraction to the
study of interactions between dissolved organic
matter and organic contaminants in aquatic
environment.
3 rd International Meeting on Organic Geochemistry,
Torquay, Royaume Uni.
63. Grosse M.-T., Deleuze H., Birot M., Lamotte M.
Porous polysiloxanes monoliths made by emulsion
polymerization.
4 ème congrès mondial de l'émulsion, Lyon, France
64. Huguet A., Ibalot F., Roux-De Balmann H.,
Casademont E., De Perre C., Parlanti E.
Membrane processes applied to the
characterization of marine organic matter.
3 rd International Meeting on Organic Geochemistry,
Torquay, Royaume Uni
126
65. Lardy-Fontan S, Coulon S, Le Menach K, Martin
Ruel S, Choubert J.M, Coquery M, Budzinski H.
Wastewater treatment plant faced to detergents and
pharmaceutical substances. What processes to
succeed in the decrease of their load to aquatic
systems?
Congrès EMEC, Inverness, Ecosse
66. Le Dû-Lacoste M., Budzinski H., Morin B.,
Akcha F., Burgeot T.
Biliary polycyclic aromatics hydrocarbons
(PAHs) metabolites: A diagnostic tool for exposure
of aquatic organisms to PAHs. Relation between
exposure and genotoxicity.
21 st International Symposium for Polycyclic
Aromatic Compounds, Trondheim, Norvège
67. Louis Y., Cmuk P., Omanović D., Garnier C.,
Lenoble V., Pižeta I., Mounier S.
Electrochemical behavior of copper complexes in
model electrolyte solutions and natural waters.
38 th CIESM Congress, Istanbul, Turquie
68. Marchand-Geneste N., Carpy A., Devillers J.,
Porcher J.M.
e-experimental endocrine disruptor binding assay
(e3dba) database.
4 rd International Symposium on Computational
Methods in Toxicology and Pharmacology
integrating Internet Resources, Moscou, Russie
69. Marchand-Geneste N., Rocher A.
Potential toxic risk of neurotoxic insecticide
metabolites on honeybees and human nervous
systems. A SAR investigation.
SETAC Europe 17 th Annual Meeting, Porto,
Portugal
70. Mazéas L., Vigneron V., Le-Ménach K.,
Budzinski H., Audic JM., Bernet N., Bouchez T.
Elucidation of nitrate reduction pathways in
anaerobic bioreactor using a stable isotopic
approach.
SIMSUG 2007, Newcastle, Royaume Uni
71. Mazellier P., De Laat J.
Kinetics of few emerging pollutants
phototransformation in dilute aqueous solution:
application to environmental and UV disinfection
processes.
8 th European Meeting of Environmental Chemistry,
Inverness, Ecosse
72. Mazellier P., Méïté L., De Laat J.
Photochemical transformation of emerging
pollutants: the example of selected hormones.
XXIII th International Conference on
Photochemistry, Cologne, Allemagne

73. Mazellier P., Nguyen Q. De Laat J.
Unexpected enhancement of pollutant degradation
by photocatalysis in the presence of bicarbonate
ions.
XXIII th International Conference on
Photochemistry, Cologne, Allemagne
74. Méïté L., Szabo R., Miet K., Budzinski H. et
Villenave E.
Heterogeneous reactivity of NO 2 and O 3 with
pyrene and two of its derivatives adsorbed on
atmospheric model particles, Surface emissions and
prediction of atmospheric composition changes.
Summer School ESF-ACCENT-CNRS-GEIA,
Surface Emissions and Prediction of Atmospheric
Composition Changes, Ile d’Oléron, France
75. Miet K., Budzinski H., Villenave E.
Heterogeneous reactivity of NO 2 and O 3 with
pyrene and two of its derivatives adsorbed on
atmospheric model particles.
21 th International Symposium on Polynuclear
Aromatic Compounds (ISPAC), Trondheim,
Norvège
76. Miet K., Budzinski H., Villenave E.
Heterogeneous reactivity of NO 2 and O 3 with
pyrene and two of its derivatives adsorbed on
atmospheric model particles.
Summer School ESF-ACCENT-CNRS-GEIA,
Surface Emissions and Prediction of Atmospheric
Composition Changes, Ile d’Oléron, France
77. Oulaanzi S., El Mrabet M., Dahchour A., Guillet
V., Montury M.
Determination of procymidone by on-line
microwave-assisted extraction coupled to
headspace solid-phase microextraction and gas
chromatography detection.
4 th MGPR International Symposium, Agadir, Maroc
78. Panaye A., Devillers J., Doucet J.P., Marchand-
Geneste N., Porcher J.M.
Decision trees for classification of endocrine
disruptors.
4 rd International Symposium on Computational
Methods in Toxicology and Pharmacology
integrating Internet Resources, Moscou, Russie
79. Quivet E., Marrakchi Fayoumi M., Cazaunau M.,
Le Menach K., Flaud P.M., Budzinski H.,
Villenave E.
Atmospheric fate of Deca-brominated diphenyl
ether (BDE-209) adsorbed on silica particles:
analytical development and degradation kinetics.
QUASIMEME Workshop on the Analysis of
Brominated Flame Retardants, Amsterdam, Pays-
Bas
80. Scelo A.L., Davail B., Morin B., Daubeze M.,
Clerandeau C., Basseres A., Narbonne J.F.
Biomarqueurs d’effets des substances CMR dans
les systèmes aquatiques : Approche en mésocosmes.
Congrès du Comité mixte Franco-Tunisien pour la
Coopération Universitaire, Tunis, Tunisie
81. Szabo R., Méïté L., Mazellier P., Gajda-Schrantz
K.
Phototransformation of the pharmaceutical
Naproxen in dilute aqueous solution.
XXIII th International Conference on
Photochemistry, Cologne, Allemagne
82. Waite D., Harner T., Cessna A., Tuduri L.,
Sproull J., Chau D., Slobodian J.
Comparison of atmospheric sampling rates by colocated
passive polyurethane foam (PUF) samplers
and high-volume PS-1 samplers for some currently
used pesticides.
SETAC Europe 17 th Annual Meeting, Porto,
Portugal
2008
83. Aït-Aïssa S., Brion F., Budzinski H., Casellas C.,
Garric J., Gomez E., Hinfray N., Minier C.,
Mouneyrac C., Noury P., Palluel O., Porcher J.M.
SURVAQUA: A French National program on the
evaluation of impacts of endocrine disruptors on
aquatic environment.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
84. Arnich N, Tard A, Leblanc JC, Le Bizec B,
Narbonne J.F., Maximilien R
Non Dioxin-Like PCBs: Overview of the French
Food Risk Assessment.
DIOXIN 2008, 2008 Birmingham, UK
85. Barjhoux I., Clerandeau C., Daubèze M., André
V., Ravanat JL., Morin B.
Lésions primaires de l’ADN et biomarqueurs
d’exposition chez la truite arc-en-ciel.
ECOBIM, Bordeaux, France
86. Briand O., Mauran S., Millet M., Montury M.,
Tuduri L., Wang J.
Air contamination and the inhalation exposure in
agricultural greenhouses: sampling and analysis of
gaseous pesticides by SPME-Gas Chromatography-
Tandem Mass Spectrometry.
International Symposium on Environmental
Analytical Chemistry, Gdansk, Pologne
87. Briand O., Millet M., Montury M., Tuduri L.,
Wang J.
The development of Solid Phase Microextraction as
a passive sampler for the determination of gaseous
pesticides in air.
International Symposium on Environmental
Analytical Chemistry, Gdansk, Pologne
127

88. Budzinski H., Le Dû M., Akcha F., Burgeot T.,
Morin B.
Biliary polycyclic aromatics hydrocarbons (PAHs)
metabolites: A diagnostic tool for exposure of
aquatic organisms to PAHs. Relationship between
exposure and genotoxicity.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
89. Capdeville M.J., Pardon P., Budzinski H.
Solid-phase extraction (SPE) and liquid
chromatography-tandem mass spectrometry
(LC/MS/MS) development for the multi-class
analysis of pharmaceuticals.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
90. Cazaunau M., Budzinski H., Villenave E.
Preliminary study of atmospheric degradation of
PolyBrominated Diphenyl Ethers.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
91. Crespo A., Budzinski H., Chodjai D., Moreau A.,
Le Menach K.
Screening of PAH contamination in the Arcachon
Bay.
XI th International Symposium on Oceanography of
the Bay of Biscay, San Sebastian, Espagne
92. Davail-Cuisset B, Scélo A.L., Bassères A.,
Narbonne J.F.
Hormones stéroïdes, vitellogénine et expression du
récepteur ovarien de la vitellogénine chez la truite
arc-en-ciel immature exposée au nonylphénol, au
diquat ou au cadmium in vivo.
ECOBIM, Bordeaux, France
93. Davail-Cuisset B, Scélo A.L., Bassères A.,
Narbonne J.F.
Sex steroid hormones, vitellogenin and vitellogenin
receptor expression in immature rainbow trout
exposed in vivo to nonylphenol, diquat or cadmium.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
94. De Perre C., Lemenach K., Budzinski H.,
Parlanti E.
Application of Solid-Phase Microextraction to
interactions between Dissolved Organic Matter and
organic contaminants in aquatic environment.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
95. Elkaim J., Morin B., Clerandeau C., Scelo A.L.,
Marchand-Geneste N.
Méthodes alternatives in silico et in vitro en
toxicology.
ECOBIM, Bordeaux, France
96. Farcy E., Auffret M., Lagadic L., Burgeot T.,
Allenou J.P., Delmas F., Dubernet J.F., Budzinski
H., Mazella N., Madigou C., Mondeguer F.,
Renault T., Gabellec R., Morin B., Heydorff M.,
Menard D., Roucaute M., Caquet Gonzalez J.,
Marchand-Geneste N.
Environmental monitoring of pesticide
contamination in the Vilaine estuary (France) :
biomarker responses in bivalves
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
97. Gonzalez J., Marchand-Geneste N.
Modélisation moléculaire des propriétés
structurales de l’ADN endommagé par des agents
cancérogènes.
ECOBIM, Bordeaux, France
98. Le Dû-Lacoste M., Loizeau V., Buchet V., Le
Bayon N., Budzinski H., Cravedi J.P Burgeot T.,
Akcha F.
In vitro and in vivo exposure of soles (Solea Solea)
to pyrene Benzo(a)pyrene and fluoranthene:
Metabolite identification and genotoxic effects.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
99. Louis Y., Garnier C., Lenoble V., Omanović D.,
Mounier S., Pižeta I.
Electrochemical study of major and trace metals
interactions with concentrated marine dissolved
organic matter.
1 st Regional Symposium on Electrochemistry of
South-East Europe, Crveni Otok, Rovinj, Istria,
Croatie
100. Miet K., Budzinski H. et Villenave E.
Atmospheric reactivity of Polycyclic Aromatic
Hydrocarbons and related compounds adsorbed on
particles.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
101. Narbonne J.F.
TOOL BOX for risk assessment of human exposure
to NDL-PCB.
PCB Workshop Iowa City, USA
102. Parlanti E., Al-Sid-Cheikh M., Ibalot F.,
Nicolau R., Mounier S.
Effect of river floods on marine organic matter
fluorescence.
AGU Chapman Conference on Organic Matter
Fluorescence, University of Birmingham,
Edgbaston, Birmingham, Royaume Uni
128

103. Parlanti E., Relexans S., Amouroux D., Bridou
R., Bouchet S., Etcheber H., Abril G.
Transformation processes of colloidal organic
matter at superficial sediment interfaces.
AGU Chapman Conference on Organic Matter
Fluorescence, University of Birmingham,
Edgbaston, Birmingham, Royaume Uni
104. Parlanti E., Vacher L., Huguet A., Wörz K.,
Ibalot F.
New criteria for the characterisation of fluorescent
dissolved organic matter in aquatic environments.
AGU Chapman Conference on Organic Matter
Fluorescence, University of Birmingham,
Edgbaston, Birmingham, Royaume Uni
105. Scélo A.L., Davail-Cuisset B., Morin B.,
Clérandeau C., Bassères A., Narbonne J.F.
Biochemical effects of contaminants on immature
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss): in vivo
compared to in vitro results.
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
106. Schummer C., Tuduri L., Contreras E., Wang
J., Mercury M., Millet M., Appenzeller B., Montury
M., Briand O., Wennig R.
Development and calibration of passive samplers
for the evaluation of human pesticides exposure in
indoor and outdoor air
18 th SETAC Europe Annual Meeting, Varsovie,
Pologne
107. Vicquelin L., Budzinski H., Leray-Forget J.,
Cachot J.
Embryotoxicité et tératogénicité du phénanthrène
chez le Medaka japonais (Oryzias latipes)
Atelier International sur l’évaluation du stress
environnemental,ECOBIM, Bordeaux, France
108. Vicquelin L., Budzinski H., Leray-Forget J.,
Cachot J.
Development of an embryo-larval assay using
Japanese Medaka (Oryzias latipes) for the
evaluation of hydrophobic substance toxicity.
1 st SETAC Europe Special Science Symposium,
Bruxelles, Belgique
2009
109. Barjhoux I., Clérandeau C., Daubèze M.,
Narbonne J.-F., Ravanat J.-L., André V., Morin B.
Biotransformation and genotoxicity of model
aquatic pollutants in rainbow trout
PRIMO 15, Bordeaux, France
110. Berrada S., Grasset J., Vicquelin L., Clerandeau
C., Morin B., Cachot J.
Genotoxic effect of cadmium and benzo(a)pyrene
on HepG2 and Japanese medaka larvae:
development of new emergent bioassays for toxicity
and risk assessment of genotoxicants.
PRIMO 15, Bordeaux, France
111. Cachot J., Sundberg-Jones S.E., Law M, Pottier
D., André V., Akcha F., Budzinski H., Winn R.
Comparison of toxic effects in fish exposed to PAHs
by direct- or food-transfer.
PRIMO 15, Bordeaux, France
112. Cailleaud K., Scelo A.-L., Davail-Cuisset B.,
Clerandeau C., Morin B., Daubeze M., Basseres A.,
Narbonne J.-F.
Comparison between invertebrate and diatom
community responses and biomarker responses in
outdoor mesocosms exposed to organic
contaminants.
PRIMO 15, Bordeaux, France
113. Capdeville M.J., Pardon P., Hernandez-Raquet
G., Budzinski H.
Solid-phase extraction and liquid chromatographytandem
mass spectrometry development for the
analysis of pharmaceuticals.
SETAC Europe 19 th Annual Meeting, Göteborg,
Suède
114. Capdeville M.J., Dabert P., Pardon P.,
Budzinski H.
Solid-phase extraction and liquid chromatographytandem
mass spectrometry development for the
analysis of antibiotics in manure.
SETAC Europe 19 th Annual Meeting, Göteborg,
Suède
115. Davail-Cuisset B, Clérandeau C., Daubèze M.
Following of growth and sexual development in
male and female oysters, Crassostrea gigas, in
Arcachon Basin, corelated to haemolymph sex
steroid levels.
PRIMO 15, Bordeaux, France
116. Dévier M.H., Peluhet L., Le Menach K.,
Budzinski H.
PAH and PBDE contents in animals fed with fat
recycled materials and their rate of transfer from
feeds to meat.
11 th JCF - Frühjahrssymposium, Essen, Allemagne
117. Di-Méglio N., David L., Budzinski H., Peluhet,
Tapie N., Ody D., Eynaudy A., Legavre T.
Fin Whale in Liguro-Provencal Mediterranean
Sea: a point of the population state, the distribution
and the habitat use.
23rd Conference of the European Cetacean Society,
Istanbul, Turquie
129

118. Flaud P.M., Loison J.C., Rayez M.T., Rayez
J.C., Villenave E.
Kinetics of chlorine-initiated oxidation reactions of
aldehydes.
ESF Introp Final Conference on Tropospheric
Chemistry, Portoroz, Slovénie
119. Gonzalez J., Marchand-Geneste N., Laguerre
M.
In silico high-throughput docking to design new
potent tyrosine kinase inhibitors.
2 nd meeting Young Researchers and Life Sciences,
Paris, France
120. Laroche J., Quiniou L, Riso R., Budzinski H.,
Cachot J., Minier C., Devaux A., Chérel Y.,
Burgeot T.
From the exposure to contaminants, to the
molecular and physiological responses: a multiestuaries
approach conducted on a flatfish
Platichthys flesus.
PRIMO 15, Bordeaux, France
121. Martinez-Gomez C., Lyons B., Thain J.E.,
Bayona J.M., Burgeot T., Budzinski H., Hylland
K.D.E., Thomas K
Toxicologically profiling the major oil types and
hazardous and noxious substances (HNS)
transported within EU waters: the TOXPROF
Project.
Face It, International Symposium, Leipzig,
Allemagne
122. Rio C., Gratien A., Budzinski H., Le Menach
K., Flaud P.-M., Villenave E.
Gaseous and particulate products from the
atmospheric OH-initiated oxidation of γ-terpinene
and d-limonene.
European Geosciences Union General Assembly
2009, Vienne, Autriche
123. Scelo A.-L., Davail-Cuisset B., Clerandeau C.,
Morin B., Daubeze M., Basseres A., Narbonne J.-F.
Biomarker responses and steroid levels in juvenile
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) exposed to
an herbicid, its nonylphenol polyethoxylate
adjuvant and cadmium.
PRIMO 15, Bordeaux, France
124. Soulier C., Martin-Ruel S., Choubert J.M.,
Jacquet R., Miège C., Coquery M, Le Ménach K.,
Augagneur S., Peluhet L., Budzinski H.
Use of passive sampler to follow the discharge of
organic micropollutants (priority and emerging
substances) from wastewater treatment plants into
surface water.
SETAC Europe 19 th Annual Meeting, Göteborg,
Suède
125. Tapie N., Vrana B., Murcia F., Budzinski H.
Calibration and field evaluation of POCIS and
Chemcatcher passive samplers for the monitoring
of polar pesticides in water.
SETAC Europe 19 th Annual Meeting, Göteborg,
Suède
126. Tapie N., Munaron D., Gonzalez J.L.,
Budzinski H.
Application of POCIS for the monitoring of
pesticides, pharmaceuticals and alkylphénols in
marine water.
SETAC Europe 19 th Annual Meeting, Göteborg,
Suède
127. Vicquelin L., Leray-Forget J., Morin B.,
Budzinski H., Cachot J.
Development of a fish embryo-larval assay for
hydrophobic compounds risk assessment.
SETAC Europe 19 th Annual Meeting, Göteborg,
Suède
128. Villenave E., Miet K., Cazaunau M., Budzinski
H., Cachot J.
Analytical developments, reactivity and toxicity of
polycyclic aromatic compounds associated to
atmospheric particles.
ESF Introp Final Conference on Tropospheric
Chemistry, Portoroz, Slovénie
Poster Presentations in National Meetings
2005
1. Grosse M.Th, Deleuze H., Birot M.
Phases Solides adsorbantes pour mesures
environnementales de BTEX atmosphériques.
Symposium Sigma-Aldrich des Jeunes Chimistes,
Lille
2. Le Crâne J.-P., Villenave E.
Revisite expérimentale de la réaction du radical
HO 2 avec CH 3 C(O)O 2 , Extension au radical
CH 3 CH 2 C(O)O 2 .
Réunion annuelle du groupe français de cinétique et
photochimie, Rennes, France
3. Lesven L., Garnier C., Mikkelsen Ø., Skogvold S.,
Pižeta I., Billon G.
Development of gold microelectrode for in situ
measurement in the sediment, Nos lits de rivières:
enfouissement definitive ou bombe à retardement?
Programme INTERREG III-STARDUST, Menen,
Belgique
130

4. Skogvold S., Mikkelsen Ø., Schrøder K., Lesven
L., Garnier C., Billon G.
Micro electrodes for use in voltammetric field
apparatus. Nos lits de rivières: enfouissement
définitif ou bombe à retardement ?
Programme INTERREG III-STARDUST, Menen,
Belgique
5. Togola A., Lardy S., Budzinski H.
Substances pharmaceutiques et detergents nonioniques
dans l’estuaire de la Seine.
CIRMAT, Rouen, France
2006
6. Amiard-Triquet C., Durou C., Amiard JC., Berthe
T., Billon G., Budzinski H., Damiens G., Debenay
JP., Deloffre J., Denis F., Denis L., Ferrero T., Gillet
P., Gnassia-Barelli M., Hummel H., Mouneyrac C.,
Ouddane B., Petit F., Poirier L., Quillet L., Roméo
M., Smith B., Sylvestre F., Thoumelin G.
Sediments: a key compartment for the assessment of
interactions between chemicals and biota in
estuaries.
Benthic Ecology Meeting (BEM), Québec, Canada
7. Bodin N., Budzinski H., Le Ménach K., Tapie N.
Effet de l’extraction des lipides sur les rapports
isotopiques stables (δ 13 C, δ 15 N) dans les tissus
biologiques : conséquences pour l’étude du devenir
des contaminants organiques dans les réseaux
trophiques.
31 eme Congrès annuel de l’Union des
Océanographes de France, Nantes, France
8. Cailleaud K., Souissi S., Budzinski H., Forget-
Leray J.
Recherche de nouveaux biomarqueurs
biochimiques en écotoxicologie par l’analyse du
protéome d’Eurytemora affinis. Identification des
protéines par CPL SM/SM et par western Blot.
Colloque Seine Aval, Rouen, France
9. Dévier M.H., Daridan I., Peluhet L., Le Menach
K., Budzinski H.
Développement de méthodes d’analyse des HAP et
PBDE dans les huiles et matières grasses recyclées
destinées à l’alimentation animale.
Forum Labo, Paris, France.
10. Garnier C., Mounier S., Lenoble V., Gonzalez
J.L., Seppecher P.
PROSECE: un nouveau logiciel pour modéliser les
propriétés complexantes de la matière organique
naturelle dissoute à l’aide d’un “chimio-type”.
1 er Séminaire sur Les Matières Organiques en
France : Etat de l’Art et Prospectives,
Carqueiranne, France
11. Huguet A., Parlanti E.
Concentration de la matière organique naturelle
marine par osmose inverse.
1er Séminaire sur Les Matières Organiques en
France : Etat de l’Art et Prospectives,
Carqueiranne, France
12. Huguet A., Parlanti E.
Procédés membranaires pour le fractionnement et
la concentration de la matière organique dans les
eaux marines.
MEMPRO 3 - Intégration des membranes dans les
procédés, Nancy, France
13. Le Dû M., Budzinski H., Le Menach K., Morin
B., Akcha F., Burgeot T.
Etude de la biotransformation des HAP chez les
organismes marins (poissons) – Relation
exposition-génotoxicité
GDR IMOPHYS, La Rochelle, France
14. Lenoble V., Garnier J.-M., Masion A., Garnier
C., Ziarelli F.
Couplage de différentes techniques analytiques
pour identifier les sites de complexation de
différentes matières organiques vis-à-vis du
cadmium.
1 er Séminaire sur Les Matières Organiques en
France : Etat de l’Art et Prospectives,
Carqueiranne, France
15. Magnier A., Lesven L., Garnier C., Mikkelsen
Ø., Pižeta I., Billon G., Ouddane B., Fischer J.C.
Development of home-made gold-disc
microelectrodes.
European North-West Symposium of Young
Scientists, Villeneuve d’Ascq, France
16. Miet K., Budzinski H., Villenave E.
Etude préliminaire de la réactivité hétérogène du
pyrène et du 1-hydroxypyrène adsorbés sur des
particules modèles.
Réunion annuelle du Groupe Français de Cinétique
et Photochimie, Nancy, France
17. Parlanti E., Vacher L.
Nouveaux critères de caractérisation des
modifications de la matière organique naturelle en
milieux côtiers.
1 er Séminaire sur Les Matières Organiques en
France : Etat de l’Art et Prospectives,
Carqueiranne, France
18. Parlanti E., Vacher L., Schäfer J., Blanc G.
Propriétés complexantes de la matière organique
naturelle vis-à-vis des métaux en milieux côtiers.
1 er Séminaire sur Les Matières Organiques en
France : Etat de l’Art et Prospectives,
Carqueiranne, France
131

19. Villenave E., Budzinski H.
Détermination des mécanismes d’oxydation des
hydrocarbures aromatiques polycycliques adsorbés
sur des aérosols de nature atmosphérique.
Colloque PRIMEQUAL-PREDIT, Strasbourg,
France
2007
20. Bodin N., Budzinski H., Le Menach K., Tapie N.
Développement d’une méthode d’extraction ASE
pour l’analyse simultanée des isotopes stables du
carbone (δ 13 C) et de l’azote (δ 15 N) dans les
organismes aquatiques
Congrès SFSM, Pau, France
21. Capdeville M.J., Pardon P., Augagneur S.,
Budzinski H.
Développement d’une méthode couplant UPLC et
spectrométrie de masse en tandem pour le dosage
d’antibiotiques présents à l’état de trace dans les
systèmes aquatiques.
Congrès SFSM, Pau, France
22. Danial-Fortain P., Gauthier T., Merdrignac I.,
Budzinski H.
Etude de la séparation par famille des résidus sous
vide pour étudier leur réactivité.
SFGP 2007, Saint-Etienne, France
23. De Perre C., Lemenach K., Budzinski H.,
Parlanti E.
Micro-Extraction sur Phase Solide couplée à la
Chromatographie en phase Gazeuse et à la
Spectrométrie de Masse appliquée à l’étude des
interactions Matière Organique Dissoute –
Contaminants Organiques.
Congrès SFSM, Pau, France
24. Huguet A., Roux-De Balmann H., Casademont
E., Parlanti E.
Développement d’une étape de dessalement par
électrodialyse pour la concentration de la matière
organique marine.
8 ème Colloque du Groupe Français de l'IHSS : Rôle
et Fonction des Matières Organiques dans
l’Environnement, Lyon, France
25. Lardy-Fontan S, Augagneur S, Budzinski H.
Méthodologies pour l’analyse des détergents :
alkylphénol-polyéthoxylés, dans des matrices
environnementales complexes.
Congrès SFSM, Pau, France
26. Lardy-Fontan S., Coulon S., Le Menach K.,
Martin Ruel S., Choubert J.-M., Coquery M.,
Budzinski H.
Présence et devenir de 2 classes de composés
organiques prioritaires dans les stations
d’épuration : les alkylphénol-polyéthoxylés et les
substances pharmaceutiques.
GRUTTEE, Pau, France
27. Le Dû-Lacoste M., Budzinski H., Le Menach K.,
Augagneur S.
Comparaison de stratégies analytiques mettant en
jeu des séparations chromatographiques et des
détections par spectrométrie de masse pour
l’analyse des métabolites d’hydrocarbures
aromatiques polycycliques (HAP) chez le poisson.
Congrès SFSM, Pau, France
28. Le Dû-Lacoste M., Budzinski H., Morin B.,
Akcha F., Burgeot T.
Les métabolites biliaires d’hydrocarbures
aromatiques polycycliques (HAP) : outil de
diagnostic de l’exposition des organismes
aquatiques aux HAP. Relation expositiongénotoxicité.
Colloque annuel ARET, Maisons-Alfort, France
29. Le Dû-Lacoste M., Budzinski H., Morin B.,
Akcha F., Burgeot T.
Exposure of marine organisms to polycyclic
aromatic hydrocarbons (PAHs): use of PAH
metabolites in monitoring programs for a better
understanding of PAH contamination.
GDR IMOPHYS, Nantes, France
30. Louis Y., Garnier C., Omanović D., Pižeta I.,
Lenoble V., Gonzalez J. L., Mounier S.
Analyse et modélisation des interactions
Cation/métaux traces-Matière Organique Naturelle
dissoute en milieu marin: intérêts de la pseudopolarographie.
8 ème Colloque du Groupe Français de l'IHSS : Rôle
et Fonction des Matières Organiques dans
l’Environnement, Lyon, France
31. Quivet E., Marrakchi Fayoumi M., Cazaunau M.,
Le Menach K., Flaud P.-M., Budzinski H.,
Villenave E.
Dégradation du Déca-Bromo-Diphenyl-Ether
(BDE-209) adsorbé sur des particules
atmosphériques modèles : développement
analytique et réaction hétérogène avec l’ozone.
Réunion annuelle du groupe français de cinétique et
de photochimie, Marseille, France
2008
32. Budzinski H.
Echantillonneurs passifs pour la Mesure des
Substances chimiques et de la TOXicité associée
dans l’eau et les effluents industriels
Colloque PRECODD, Montpellier, France
33. Budzinski H., Peluhet L., Tapie N., David L., Di-
Méglio N., Legavre T.
La contamination en PCB, PBDE et OCP: un
indicateur du niveau de contamination des
Rorquals communs de Méditerranée.
Stratégies de suivi de l'état des populations de
mammifères marins, La Rochelle, France
132

34. Capdeville M.J., Pardon P., Budzinski H.
Développement d'une méthode d'extraction par
SPE et d'analyse par chromatographie en phase
liquide couplée à un spectromètre de masse en
tandem (RRLC/MS/MS) pour le dosage de
substances pharmaceutiques dans des matrices
environnementales complexes
Journée de l’école doctorale des Sciences
Chimiques, Bordeaux, France
35. Capdeville M.J., Pardon P., Budzinski H.
Développement d'une méthode d'extraction sur
phase solide (SPE) et d'analyse par
chromatographie en phase liquide couplée à un
spectromètre de masse en tandem (RRLC/MS/MS)
pour le dosage de substances pharmaceutiques
multi-classes dans diverses matrices
environnementales
Congrès SFSM, Grenoble, France
36. De Perre C., Crespo A., Abou Mrad N., Le
Menach K., Jaber F., Parlanti E., Budzinski H.
Intérêt de la micro-extraction sur phase solide
couplée à la chromatographie en phase gazeuse et
à la spectrométrie de masse pour l’analyse des
hydrocarbures aromatiques polycycliques dans les
eaux.
Congrès SFSM, Grenoble, France
37. Le Dû-Lacoste M., Budzinski H., Morin B.,
Akcha F., Burgeot T.
Etude des phénomènes de
bioaccumulation/biotransformation des
Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques (HAP)
par les organismes aquatiques (poissons). Relation
exposition-génotoxicité.
Colloque PNETOX, Lille, France
38. Miet K., Budzinski H., Villenave E.
Réactivité atmosphérique des Hydrocarbures
Aromatiques Polycycliques et de leurs dérivés
adsorbés sur des particules.
Réunion Annuelle du Groupe Français de Cinétique
et Photochimie, Strasbourg, France
39. Murcia F., Tapie N., Auby I., Vrana B., Le
Menach K., Budzinski H.
Etude de la contamination du bassin d’Arcachon
par les pesticides.
Colloque ECOBIM, Bordeaux, France
2009
40. Budzinski H., Peluhet L., Tapie N., Legavre L.,
David L., Dimeglio N.
La contamination en PCB, PBDE et OCP: un
indicateur du niveau de contamination des
Rorquals communs de Méditerranée
10ème Séminaire du Réseau National Echouages :
Stratégies de suivi de l'état des populations de
mammifères marins, La Rochelle, France
133
41. De Perre C., Dorthe A.M., Lemenach K.,
Budzinski H., Parlanti E.
Plans d’expériences appliqués à l’étude des
interactions Hydrocarbures Aromatiques
Polycycliques (HAP) – Matière Organique
Dissoute (MOD).
2 eme Séminaire Réseau Matières Organiques :
Matières Organiques et Environnement, Sainte-
Maxime, France
42. Louis Y., Durrieu G., Zhao H., Heimbürger L.-
E., Garnier C., Omanović D., Lenoble V., Mounier
S., Pižeta I.
Caractérisation de la Matière Organique Dissoute
en zones estuariennes et marines peu eutrophisées.
2 eme Séminaire Réseau Matières Organiques :
Matières Organiques et Environnement, Sainte-
Maxime, France
43. Louis Y., Durrieu G., Zhao H., Garnier C.,
Mounier S., Omanović D., Pižeta I.
Rôle de la Matière Organique Naturelle Dissoute
sur la spéciation des métaux en milieu peu
eutrophisé.
21 ème journée de la chimie SFC PACA, Marseille,
France
44. Murcia F., Le Menach K., Pardon P., Augagneur
S., Armstrong N., Tapie N., Auby I., Budzinski H.
Approche multirésidus pour le suivi des pesticides
dans différents compartiments (eau – sédiment) de
l’environnement aquatique du bassin d’Arcachon.
Groupe Français des pesticides, Toulouse, France
45. Parlanti E., Vacher L., Huguet A., Wörz K.,
Ibalot F.
Critères de caractérisation de la matière organique
dissoute fluorescente en milieux aquatiques.
2 eme Séminaire Réseau Matières Organiques :
Matières Organiques et Environnement, Sainte-
Maxime, France
46. Parlanti E., Relexans S., Amouroux D., Bridou
R., Bouchet S., Etcheber H., Abril G.
Processus de transformation de la matière
organique colloïdale aux interfaces dans les
sédiments superficiels.
2 eme Séminaire Réseau Matières Organiques :
Matières Organiques et Environnement, Sainte-
Maxime, France
47. Poulenard J., Parlanti E., Lazzarotto J., Fanget
B., Perrette Y., Hustache J.C., Dorioz J.M.
Evolution saisonnière des caractéristiques
(spectrofluorescence, chromatographie
d’exclusion) des matières organiques dans les eaux
des Lacs perialpins (Annecy, Léman) et de leurs
affluents.
2 eme Séminaire Réseau Matières Organiques :
Matières Organiques et Environnement, Sainte-
Maxime, France

PhD Theses (year of PhD defense) (TM)
2005
1. Champeau O.
Biomarqueurs d’effet chez C. Fluminea : du
développement en laboratoire à l’application en
mésocosme.
Supervisor: Narbonne J.F.
2. De Boishebert V.
Ecriture des signatures chimiques des fraises par
analyse SPME-GC-MS des volatils : mise en
évidence de leur variabilité par les cartes autoorganisatrices
de Kohonen.
Supervisor: Montury M.
3. Dartiguelongue C.
Etude expérimentale et modélisation cinétique du
craquage thermique de composés aromatiques
soufrés en réacteur fermé inerte.
Supervisor: Budzinski H., Behar F. (IFP, Paris)
4. Busset C. (Université de Poitiers)
Réactivité des radicaux carbonate avec des
pesticides (phénylurée, triazines) en solution
aqueuse.
Supervisor: Mazellier P.
5. Couteau J.
Construction d’une souche de levure transgénique
pour la mesure de la génotoxicité
environnementale.
Supervisor: Cachot J.
6. Le Crâne J.-P.
Etude expérimentale de la réactivité de radicaux
issus de l’oxydation troposphérique des aldéhydes :
application aux réactions de terminaison des
processus de formation en chaîne de l’ozone.
Supervisor: Villenave E.
2006
7. Albinet A.
Hydrocarbures aromatiques polycycliques et leurs
dérivés nitrés et oxygénés dans l’air ambiant :
caractérisation physico-chimique et origine.
Supervisors: Leoz-Garziandia E. (INERIS),
Budzinski H., Villenave E.
8. Cailleaud K.
Utilisation du copépode Eurytémora affinis pour
étudier l’écodynamique et les effets biologiques des
principaux contaminants organiques (PCB, HAP,
Alkylphénols…) en estuaire de Seine.
Supervisor: Budzinski H.
9. Grosse M.-T.
Synthèse de polysiloxanes microcellulaires,
applications à l’analyse de polluants aromatiques
de l’atmosphère.
Supervisors: Lamotte M., Deleuze H. (50%/50%)
10. Tapie N.
Contamination des écosystèmes aquatiques par les
PCB et PBDE : Application à l’estuaire de la
Gironde.
Supervisor: Budzinski H.
11. Togola A.
Présence et devenir des substances
pharmaceutiques dans les écosystèmes aquatiques.
Supervisor: Budzinski H.
2007
12. Huguet A.
Mise au point de procédés membranaires pour
l'étude de la matière organique dissoute en milieux
côtiers.
Supervisor: Parlanti E.
13. Méité L. (Université de Poitiers)
Phototransformation de polluants organiques
émergents en solution aqueuse.
Supervisor: Mazellier P.
14. Nguyen T. (Université de Poitiers)
Dégradation photocatalytique de deux polluants
émergents : le diclofénac et la sulcotrione.
Supervisor: Mazellier P.
15. Sanglar S.
Etude cinétique de réactions du phénol et du
naphtalène d’intérêt en chimie de l’atmosphère et
en chimie interstellaire.
Supervisor: Villenave E., Loison J.-C.
16. Yelghi S.
Etude de la physiologie de la reproduction de
l’esturgeon étoilé, Acipenser stellatus durant la
période de reproduction dans le milieu naturel, en
Mer Caspienne.
Supervisor: Davail B.
2008
17. Miet K.
Etude expérimentale de la dégradation hétérogène
de Composés Aromatiques Polycycliques (CAP)
d’intérêt troposphérique.
Supervisors: Villenave E., Budzinski H.
18. Le Dû-Lacoste M.
Etude des phénomènes de biotransformation des
HAP chez les poissons. Relation expositiongénotoxicité.
Supervisor: Budzinski H.
134

19. Lardy S.
Etude des perturbateurs endocriniens dans les
systèmes aquatiques.
Supervisor: Budzinski H.
Post-docs and ATER (year of start)
2005
1. Bodin Nathalie
Etude des relations contaminants et réseau
trophique.
1 year ATER. Supervisor: Budzinski H.
2. Dévier Marie-Hélène
Etude de la relation entre contamination chimique
et l’état physiologique des animaux d’élevage.
2 years European Contract, FP6 Feeding Fats
Safety. Supervisor: Buddzinski H.
3. Quivet Etienne
Etude du devenir des polluants organiques
persistants dans l’atmosphère.
1 year CNRS post-doc. Supervisor: Villenave E.
2007
4. Bodin Nathalie
Etude expérimentale de la toxicité de
l’Hexachlorobenzène chez le bar Dicentrarchus
labrax
1 year Projet Région (sécurité sanitaire des aliments
en aquitaine) post doc. Supervisor : Budzinski H.
5. Wang Junxia
Développement de méthodologies de prélèvement
SPME pour les pesticides atmosphériques.
1 year AFSSET post doc. Supervisor: Tuduri L.
2008
6. Gratien Aline
Etude expérimentale des premières étapes de
l’oxydation de composés terpéniques
monoaromatiques dans la troposphère.
1 year ATER. Supervisor: Villenave E.
7. Menager Matthieu
Etude des interactions matière organique /
contaminants organiques dans les eaux naturelles.
1 year ATER. Supervisor: Budzinski H., Parlanti E.
8. Tapie Nathalie
Méthodes d’extraction intégratives pour l’Analyse
de la contamination organique
1 year post doc. Supervisor: Budzinski H.
2009
9. Piram Anne
Etude des contaminants émergents dans les milieux
aquatiques
1 year post doc. Supervisor: Buddzinski H.
10. Tapie Nathalie
Méthodes d’extraction intégratives pour l’Analyse
de la contamination organique. Application au
suivi du Bassin d’Arcachon et de l’estuaire de la
Gironde
1 year post doc. Supervisor: Budzinski H.
Invited Researchers ,Visitors
2007
1. Zetzsch Cornélius
Etude de l’oxydation par le radical OH des
composés aromatiques substitués.
1 month as invited Professor by the University of
Bordeaux.
2. Gagné Jean Pierre
Mise au point de techniques d’extraction et d’étude
de la matière organique dissolute (MOD) des eaux
naturelles
1 month
3. Meniconi Fatima (PETROBRAS)
Etude des métabolites des HAP
1 month
2008
4. Gagné Jean-Pierre
Mises au point de techniques d’extraction et
d’étude de la matière organique dissoute (MOD)
des eaux naturelles.
1 month as invited Professor by the University of
Bordeaux.
5. Vrana Branislav
Développement des recherché dans le domaine des
échantillonneurs passifs pour l’étude des
contaminants organiques
1 month as invited Professor by the University of
Bordeaux
2009
6. Vrana Branislav
Développement des recherché dans le domaine des
échantillonneurs passifs pour l’étude des
contaminants organiques
1 month as invited Professor by the University of
Bordeaux
7. Pequeno Liliane (PETROBRAS)
Etude des métabolites des HAP
1 month
135

Master Students
2005
1. Armel Mamouna, Master 2ème année en CME
Utilisation de la SPME/GC-MS pour l’analyse du
fipronil dans la cire d’abeilles
Supervisor : Valérie Guillet.
2. Rita Szabo, Master 2ème année en Chimie et
Microbiologie de l'Eau de l'Université de Poitiers
Phototransformation d’un anti inflammatoire non
stéroïdien : le Naproxen
Supervisor : Patrick Mazellier
3. Quynh Nguyen, Master 2ème année en Chimie et
Microbiologie de l'Eau de l'Université de Poitiers
Influence des ions hydrogenocarbonate sur la
dégradation photocatalytique du Diclofenac
Supervisor : Patrick Mazellier
4. Mohidine Marrakchi, Master ST Chimie 2ème
année parcours CME, Université Bordeaux 1
Etude expérimentale de la réactivité des polybromo-diphényl-éthers
(PBDE) d’intérêt en chimie
de l’atmosphère
Supervisors Eric Villenave et Hélène Budzinski
5. Killian Miet, Master ST Chimie 2ème année
parcours CME, Université Bordeaux 1
Etude de la réactivité du 1- hydroxypyrène d’intérêt
en chimie de l’atmosphère : développements
analytiques et réaction avec l’ozone
Supervisors Eric Villenave et Hélène Budzinski
6. Dimitri Legrave, Mater Chimie du Vivant et
Environnement
Développement du test comète pour la mesure des
dommages oxydatifs et des cassures de l'ADN chez
les organismes aquatiques
Supervisor Bénédicte Morin
7. Matthieu Cazaunau, Master 2ème année en CME
Relations de type Structure-Activité (QSARs et
SARs) appliquées aux perturbateurs endocriniens
xénobiotiques
Supervisor Nathalie Marchand-Geneste
8. Vanessa Guinle, Master 1ère année IUP
Statistique et Informatique décisionnelle, Université
de Toulouse
e3-dba (e–experimental endocrine disruptors
binding assays): une nouvelle base de données
postée sur le web
Supervisor Nathalie Marchand-Geneste
9. Emilie Viaene,Master 2 ème année en Systèmes
Ecologiques
Etude de l’impact de contaminants sur la synthèse
in vitro de la vitellogénine par les hépatocytes de
truite arc-en-ciel, Oncorhynchus mykiss
Supervisor Blandine Davail.
10. Aurélie Roumaillac, Master 2 ème année en
Chimie (Université Bordeaux 1)
Étude de la matière organique dissoute des eaux
naturelles par fluorescence 3D et traitement
mathématique du signal
Supervisor Edith Parlanti.
11. Guillaume Bernier, Master 2 ème année en Chimie
Moléculaire de l'Environnement (Université
Bordeaux 1)
Évaluation d’une méthode d’analyse des HAP par
fluorimétrie sur phase solide : application à la
contamination par les rejets pétroliers en milieu
marin et fluvial
Supervisor Michel Lamotte.
12. Maya al-Sid-Cheikh, Master 2 ème année en
Chimie Analytique Réactionnelle et Modélisation
en Environnement (Master CHARME - Université
du Sud Toulon Var)
Caractérisation par fluorescence 3D des apports de
matière organique naturelle dissoute sur le littoral
Méditerranéen
Supervisor Edith Parlanti.
13. Alexia Crespo, Master ST sciences de la Terre,
de l’Océan, de l’Aménagement et de
l’Environnement, Université de Bordeaux 1
Etude de la bioaccumulation des composés
organohalogénés (PCB, PBDE) par voie trophique
Supervisor Hélène Budzinski.
14. Sophie Lardy, Master ST Chimie parcours
Chimie Moléculaire de l'Environnement, Université
Bordeaux 1
La contamination des écosystèmes aquatiques par
les alkylphénols-polyéthoxylés
Supervisor Hélène Budzinski.
15. Marie Le Du, Master ST Chimie parcours
Chimie Moléculaire de l'Environnement, Université
Bordeaux 1
Etude des phénomènes de
bioaccumulation/biotransformation des
hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP)
par les organismes aquatiques (poissons) - Relation
exposition-génotoxicité
Supervisor Hélène Budzinski.
136

16. Johann Legrand, Master ST Systèmes
Ecologique parcours Fonctionnement et
Dysfonctionnment des systèmes aquatiques,
Université Bordeaux 1
Etude de la contamination des systèmes aquatiques
par les substances pharmaceutiques
Supervisor Hélène Budzinski.
2006
17. Caroline RIO, Master ST Chimie 2 ème année
parcours CME, Université Bordeaux 1
Etude préliminaire de la formation des aérosols
organiques secondaires d’intérêt en chimie de
l’atmosphère
Supervisors Eric Villenave et Hélène Budzinski.
18. Yohann Coulier, Master ST Chimie 2 ème année
parcours CME, Université Bordeaux 1
Développement d’un capteur rapide d’ozone
troposphérique
Supervisors Hervé Deleuze et Eric Villenave.
19. Maud Mercury, Master 2 ème année
Prélèvement et analyse de pesticides
atmosphériques par MicroExtraction sur Phase
Solide (SPME) –chromatographie en phase gazeuse
– spectrométrie de masse en tandem (GC/MS/MS) :
Etude préliminaire en serres agricoles
Supervisor Ludovic Tuduri.
20. Mathieu Scavennec, Master ST Chimie 2 ème
année parcours CME
Développement et utilisation du test comètes chez
la truite arc-en-ciel
Supervisor Bénédicte Morin.
21. Franck LAFORIE, Master 2 ème année en CME
Analyse du profil de perturbation endocrinienne de
11416 composés à l’aide de méthodes statistiques
Supervisor Nathalie Marchand-Geneste.
22. Matthieu Papillaud, Master 2 ème année en CMV
Vers la synthèse d’un vaccin contre le cancer de la
peau : synthèse d’un analogue peptidique et
conception de peptidomimes par modélisation
moléculaire
Supervisors Nathalie Marchand-Geneste, Laurent
Pouysegu et Stéphane Quideau.
23. Ludovic Vicquelin, Master 2 Biologie cellulaire,
Physiopathologie cellulaire et moléculaire,
Universités Rouen, Caen, Le Havre
Développement d’un test embryo-larvaire en
microplaque sur le médaka japonais Lambda cII
Supervisors Jérôme Cachot et Richard Winn
(University of Georgia).
24. Vanessa Mongenet, Master 2 ème année en
Environnement-Océanographie Littorale et
Hauturière (MASTER ENVOLH - Université
Bordeaux 1)
Caractérisation par fluorescence 3D des apports de
matière organique naturelle dissoute sur le littoral
Méditerranéen lors de fortes crues
Supervisor Edith Parlanti.
25. Chloé De Perre, Master 2 ème année en Chimie
(Université Bordeaux 1)
Étude des interactions Matière Organique
Colloïdale / Contaminants Organiques dans
l'environnement aquatique
Supervisors Edith Parlanti, Cédric Garnier et
Hélène Budzinski.
26. Marion-Justine Capdeville, Master 2 ème année-
Recherche (Université de Bordeaux 1)
Mise en place d’une approche T.I.E pour stéroïdes
et Alkylphénols
Supervisor Hélène Budzinski.
27. Pierre Danial-Fortin, Master 2 ème année en
Chimie (Université Bordeaux 1)
Étude de la réactivité des résidus pétroliers en
hydroconversion
Supervisor Hélène Budzinski, Thierry Gauthier
(IFP)
2007
28. Ludovic Vicquelin, Master 2 Biologie cellulaire,
Physiopathologie cellulaire et moléculaire,
Universités Rouen, Caen, Le Havre
Développement d’un test embryo-larvaire en
microplaque sur le médaka japonais Lambda cII
Supervisors Jérôme Cachot et Richard Winn
(University of Georgia)
29. Marine Faller, Master 2 ème année ArPaC
(Université du Havre)
Application de l’HS-SPME-GC et des réseaux de
neurones de KOHONEN à la caractérisation des
composés volatils du bois de chêne de tonnellerie –
Etude de l’influence de l’origine géographique
Supervisor Joël Lavergne (Société
COURVOISIER) et valérie Guillet.
30. Lydie Rance, Master 2 ème année en Chimie et
Microbiologie de l'Eau de l'Université de Poitiers
Phototransformation d’un antibiotique : le
Norfloxacin
Supervisor Patrick Mazellier.
137

31. Sophie Mauran, Master 2 ème année
Prélèvement et analyse de pesticides
atmosphériques par Microextraction sur Phase
Solide (SPME)- chromatographie en phase
gazeuse-spectrométrie de masse en tandem
(GC/MS/MS) et Microextraction sur Phase Solide
(Chromatographie Liquide Haute Performance-
Détecteur à barrettes de diodes (HPLC/DAD)
Supervisor Ludovic Tuduri.
32. Anaïs Rocher, Master 2 ème année en CME
Modélisation moléculaire des métabolites
d’insecticides nicotiniques et étude de leurs
interactions avec les récepteurs nAchR et GABA
Supervisor Nathalie Marchand-Geneste.
33. Géraud Pruvost, Master 2 ème année en
Environnement-Océanographie Littorale et
Hauturière (Master ENVOLH - Université
Bordeaux 1)
Étude par fluorescence des apports terrigènes et
anthropiques de matière organique
macromoléculaire dissoute dans le lagon sud-ouest
de la Nouvelle Calédonie
Supervisors Edith Parlanti et Cédric Garnier.
34. Sylvain Saubusse, Master 2 ème année en Chimie
(Université Bordeaux 1)
Développement de techniques séparatives pour le
fractionnement des macromolécules organiques
naturelles
Supervisor Edith Parlanti.
35. Fréderic Murcia, Master 2 ème année CME
(Université de Bordeaux 1)
Transfert sol-plante de contaminants emergents
Supervisor Hélène Budzinski.
36. Aurélia Moreau, Master 2 ème année
Océanographie et Environnement Marin
Etude des sources de HAP dans l’environnement
aquatique par l’utilisation de la composition
isotopique moléculaire
Supervisor Hélène Budzinski.
2008
37. Marlène Rouhet, Master STS Chimie 2 ème année
spécialité QUALENC, Université Bordeaux 1
Etude de la composition isotopique moléculaire
(δC13) comme traceur de source qualitatif et
quantitatif des hydrocarbures aromatiques
particulaires dans l’atmosphère
Supervisors Eric Villenave et Hélène Budzinski.
38. Jérémy Medina, Master STS Chimie 2 ème année
spécialité QUALENC, Université Bordeaux 1
Etude de la cinétique sur la réaction entre les
radicaux acétylperoxyles CH 3 C(O)O 2 et
hydroperoxyles HO 2 amenant à la formation
d’ozone et de radical hydroxyle
Supervisors Eric Villenave et Pierre-Marie-Flaud.
39. Iris Barjhoux, Master Sciences de la Terre et de
l’Environnement, Ecologie mention Systèmes
Aquatiques
Biomarqueurs d’exposition et effets génotoxiques
chez la truite arc-en-ciel
Supervisor Bénédicte Morin.
40. Judith Elkaim, Master 2 ème année en CME
Modélisation moléculaire des interactions
substances CMR/ récepteur aux estrogènes et
récepteur Ah. Toxicité comparée rat/homme et
rat/poisson
Supervisor Nathalie Marchand-Geneste et
Bénédicte Morin.
41. Morgane Derrien, Master 2 ème année en CME
(Université Bordeaux 1)
Mise au point de méthodes de caractérisation des
macromolécules organiques colloïdales des eaux
naturelles
Supervisors Edith Parlanti et Hélène Budzinski.
42. Coralie Soulier, Master 2 ème année en CME
(Université Bordeaux 1)
Développement d’un échantillonneur passif adapté
aux substances pharmaceutiques et aux
alkylphénols polyéthoxylés
Supervisor Hélène Budzinski.
43. Davy Chodjaï, Master 2 ème année en CME
(Université de Bordeaux 1)
Etude de la contamination du bassin d’Arcachon
par les Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques
Supervisor Hélène Budzinski.
44. Julie Gonzalez, Master 2 ème année en CME
Modélisation moléculaire des adduits HAP-ADN
Supervisor Nathalie Marchand-Geneste.
45. Christelle Dreuilhe, Master 2 ème année
professionnel en chimie, qualité environnement
Analyse des HAP et mise en œuvre d’une démarche
qualité
Supervisor Hélène Budzinski.
2009
46. Julie Grasset, Master Sciences de la Terre et de
l’Environnement, Ecologie mention Systèmes
Aquatiques
Développement du test micronoyau sur les stades
embryo-larvaire du médaka japonais
Supervisors Bénédicte Morin, Jérôme Cachot et
Souad Berrada.
47. Julien Filatreau, Master ST Chimie parcours
Chimie de l’Environnement et Qualité
Effets génotoxiques de polluants aquatiques sur un
poisson modèle : le médaka
Supervisors Jérôme Cachot et Bénédicte Morin.
138

48. Vanessa Leglise-Blanchard, Master 2 ème année en
NCV
Conception rationnelle de nouveaux peptidomimes
dans le développement d’un vaccin anti-mélanome
Supervisors Nathalie Marchand-Geneste et Céline
Douat-Casassus.
49. Anaïk Pichon, Master 2 Science de la Terre,
Environnement et Ecologie, spécialité
Fonctionnement et Dysfonctionnement des
Ecosystèmes Aquatiques
Etude des composés organiques potentiellement
génotoxiques dans le Bassin d’Arcachon. Cas
particulier des hydrocarbures aromatiques
polycycliques. Approche Chimie/Biologie
Supervisors Hélène Budzinski et Jérôme Cachot.
50. Line-Alexandra Gabaut, Master 2 ème année en
CMV (Université Bordeaux 1)
Mise au point d’un système de fractionnement par
flux force (A4F) avec détection par diffusion de
lumière multi angulaire (MALS) pour l’étude des
colloïdes dans les eaux naturelles
Supervisor Edith Parlanti.
51. Julien Noui, élève ingénieur de l’ENSCPB 3 ème
Année - Master 2 ème année en CMV (Université
Bordeaux 1)
Étude des interactions Matière Organique
Colloïdale / Contaminants Organiques dans
l'environnement aquatique
Supervisors Edith Parlanti et Hélène Budzinski.
52. Valeri Ondo Mambilo, Master 2 ème année
Analyse de pyréthrinoïdes par couplage
Chromatographie liquide Haute performance-
Spectrométrie de Masse
Supervisor Hélène Budzinski et Ludovic Tuduri.
53. Angel Belles, Master 2 ème année QUALENC
(Université de Bordeaux 1)
Développement et application des échantillonneurs
Supervisor Hélène Budzinski.
Awards, Prizes
2008
1. Budzinski H. : Chevalier de l’Ordre National du
Mérite
2009
2. Dévier M.H.: Poster Prize
11 th JCF - Frühjahrssymposium, Essen, Allemagne.
Patents
2007
1. Test FACIM.
Déclaration d’invention devant huissier à Le Havre
mars 2007. Co-inventeurs Jérôme Couteau et
Jérôme Cachot et François Leboulenger, LEMA
Université du Havre, Jean-Michel Flaman et
Thierry Frébourg, INSERM U614, Université de
Rouen (test de mutagénicité in vitro permettant
l’évaluation du potentiel mutagène de substances
pures, d’échantillons biologiques et
environnementaux et la caractérisation des spectres
de mutations induits).
139

Public Contracts (2005-2009)
Organism Project Title Project
Scientist
FEDER 2b-
Région Aquitaine
PNETOX
CNRS INSU
ECODYN
CNRS INSU
ECODYN
CR Aquitaine et
FEDER
CR Aquitaine et
FEDER
GDR
GIS Seine-Aval 3
GIS Seine-Aval 3
GIS Seine-Aval 3
GIS Seine-Aval 3
AI INRA-
IFREMER
Suivi des paramètres endocriniens
participant au contrôle de la reproduction de
l’esturgeon européen, Acipenser sturio, en
structure de conservation patrimoniale
Transfert, bioaccumulation,
biotransformation et effets des composés
aromatiques chez un copépode de l'estuaire
de Seine, Eurytemora affinis
Étude intégrée des transferts de
contaminants et de leur impact en milieu
côtier Méditerranéen
Etude pluridiscipliaire des mécanismes de
contamination des hydrosystèmes
continentaux et des zones rivulaires par les
métaux (Cd, Zn)
Dynamique des contaminants et du bouchon
vaseux sur le site fluvio-estuarien de la
Gironde, effets sur la composante
biologique primaire
Dynamique des contaminants et du bouchon
vaseux sur le site fluvio-estuarien de la
Gironde, effets sur la composante
biologique primaire
MONALISA - Rôle de la Matière
Organique Naturelle (MON) sur la
spéciation et la biodisponibilité des
contaminants en milieu côtier
Evaluation intégrée des effets des
contaminants à l’échelle individuelle et
populationnelle sur deux espèces de
bivalves, Dreissena polymorpha et Mytilus
edulis dans l’estuaire et l’embouchure de
Seine
Bioaccumulation et effet des contaminants
présents en estuaire de Seine sur le
comportement natatoire et le potentiel
reproducteur d'Eurytemora affinis
Bioaccumulation et effet des contaminants
présents en estuaire de Seine sur le
comportement natatoire et le potentiel
reproducteur d'Eurytemora affinis
Etude de la contamination de l'estuaire de la
Seine par les substances pharmaceutiques et
les alkylphénols
Impacts cellulaires et moléculaires des
pesticides chez la truite arc-en-ciel
(Oncorhynchus mykiss) : génotoxicité et
toxicogénomique
Duratio
n
B. Davail 2002-
2006
H. Budzinski
(Univ. Le
Havre coord.)
E. Parlanti
(USTV coord.)
E. Parlanti
(EPOC coord.)
H. Budzinski
(ECOBAG
coord.)
E. Parlanti
(ECOBAG
coord.)
E. Parlanti
(IFREMER
coord.)
2003-
2005
2003-
2005
2003-
2005
2003-
2006
2003-
2006
2003-
2007
J. Cachot 2004-
2005
H. Budzinski 2004-
2006
H. Budzinski
(Univ. Le
Havre coord.)
2004-
2006
H. Budzinski 2004-
2006
B.Morin
(IFREMER
coord.)
2004-
2006
Amount
(k€ HT)
101.2 15
24
10
32
51.6
10.4
29.6
30
45 8
40
Salary
Part
(k€HT)
84
140

Organism Project Title Project
Scientist
CNRS INSU
ECODYN
CR Aquitaine et
FEDER
CNRS INSU
ECODYN
GDR IFREMER -
INRA
MEEDDAT
PNETOX
Agence de l’Eau
Seine Normandie
CR Aquitaine
GIS Seine-Aval 3
MEEDDAT
PRIMEQUAL
FP6 STREP
Europe
INRA
Étude cinétique en milieu contrôlé des
processus de transformation et de transfert
du mercure avec la matière organique
colloïdale et les communautés bactériennes
aux interfaces de sédiments superficiels
Détection spectrophotométrique directe sur
phases solides adsorbantes d'hydrocarbures
benzéniques et aromatiques polycycliques
volatiles dans l'air
Programme DECIME: Dynamique et effets
biologiques ddes contaminants organique
dans le contexte d'intertidalité d'un
organisme sentinelle, Mytilus edulis
IMOPHYS – Intégration de réponses
moléculaires et physiologiques aux
contaminants chimiques en milieux cotiers
Relations de Type Structure-Activité (SARs
et QSARs) Appliquées aux Perturbateurs
Endocriniens Xénobiotiques
Evaluation des effets biologiques résultant
d’une exposition chronique à des mélanges
d’hydrocarbures aromatiques polycycliques
sur un poisson transgénique modèle, le
medaka japonais souche lambda cII
Etude du devenir des hydrocarbures
aromatiques polycyclciques (HAP) dans
l'environnement: phénomènes d'oxydation
biotiques et abiotiques
Evaluation des effets biologiques résultant
d’une exposition chronique à des mélanges
d’hydrocarbures aromatiques polycycliques
sur un poisson transgénique modèle, le
médaka japonais Lambda cII. Projet
Médaka
Evolution of aircraft soot in airport zones:
numerical and experimental developments
SWIFT: Screening methods for water data
information in support of the
implementation of the water framework
directive
Recherche de bioindicateurs moléculaires et
biochimiques pour la détection et
l'évaluation des effets des pesticides sur les
E . Parlanti
(Univ. UPPA
coord.)
Duratio
n
2004-
2006
M. Lamotte 2004-
2006
H. Budzinski
(Univ. Le
Havre coord.)
2004-
2006
H. Budzinski
(IFREMER cocoord.)
N. Marchand-
Geneste (CTIS
coord.)
2004-
2007
2004-
2007
Amount
(k€ HT)
10
61 43
30
16.3
J. Cachot 2005 13
H. Budzinski et
E. Villenave
J. Cachot 2005-
2006
E. Villenave
(ONERA
coord.)
H. Budzinski
(EMA coord.)
H. Budzinski
(Univ. UPPA
coord.)
micro-organismes du sol
INTERREG Programme Prestige: H. Budzinski
(Univ. UPPA
coord.)
INTERREG IIIA
Programme RETSA: Réseau thématique de
sécurité alimentaire
J.F. Narbonne
(CNTCV
Espagne
coord.)
2005 136
2005-
2007
2005-
2007
2005-
2007
2005-
2007
2005-
2007
33 0
59.6 18
34
57.5
24.6
Salary
Part
(k€HT)
37.8 22.7
40 16.3
141

Organism Project Title Project
Scientist
CR Aquitaine
CPER
CNRS INSU
PNCA
MEEDDAT
LITEAU
MEEDDAT
PNETOX
MEEDDAT
PNETOX
FP6 Europe
EPCA 2005 Analyses chimiques des
substances volatiles et des pesticides dans
l’air
Programme ORQUE: Observatoire de
recherche pour la qualité de l'environnement
Duratio
n
M.Montury 2005-
2007
H. Budzinski 2005-
2007
Atmospheric aerosols E. Villenave 2005-
2008
Etude de la contamination des estuaires de H. Budzinski 2005-
la Seine, de la Gironde et de l’Adour par les
2008
substances pharmaceutiques: présence,
devenir et impact toxicologique
Etude des phénomènes de
bioaccumulation/biotransformation des
hydrocarbures aromatiques polycycliques
par les organismes aquatiques (poissons) ;
Relation exposition-génotoxicité
Approche multi-estuaire des réponses des
populations d’huîtres creuses, Crassostrea
gigas et de flets Platichthys flesus à la
contamination chimique
Quality and safety of feeding fats obtained
from wastes or by-products from the food
chain. Programme Feeding fats safety
H. Budzinski 2005-
2008
H. Budzinski
(Univ. UBO
coord.)
H. Budzinski
(Univ
Barcelone
coord.)
2005-
2008
2005-
2008
INRA Qualité sanitaire des aliments en Aquitaine H. Budzinski 2005-
2008
Amount
(k€ HT)
84
380
25
43
66.8
15
182 109
173
Salary
Part
(k€HT)
ANR Blanche POPSTART: Study of the atmospheric
oxidation of organic pollutants adsorbed on
particles: analytical developments,
reactivity and toxicity
ESF-INTROP ASEFI 2006
Atmospheric soot environmental fate and
impact
E. Villenave
Coordinator
2005-
2009
E. Villenave 2006 18
214 88
ESF-INTROP Exchange Prgm "Chimie des aromatiques" E. Villenave 2006 1.5 1.5
SMIDDEST Etude de la contamination des anguilles de
l'estuaire de la Gironde par les
polychlorobiphényles (PCB)
H. Budzinski 2006 38.2
CG Lozère Ruche tronc/Ruche cadre M. Montury et 2006 5
V. Guillet
Agence de l’Eau Mise en place de l'approche TIE sur deux H. Budzinski 2006 9.6
Adour-Garonne stations du bassin Adour-Garonne
CNRS INSU
PNCA
Study of the termination reactions in the
ozone formation by the atmospheric
E. Villenave 2006-
2007
15
AFSSET
CR Aquitaine
oxidation of aldehydes
Développement de systèmes de prélèvement
passifs pour la mesure des pesticides dans
l’air
Qualité des Espaces Littoraux en Aquitaine
et Pays-Basque Espagnol : Flux de
Contaminants et Évolution du Trait de Côte.
L. Tuduri 2006-
2008
H. Budzinski
(Univ. UPPA
coord.)
2006-
2008
83 40
90
142

Organism Project Title Project
Scientist
PNRPE
MEEDDAT
ANR ECCO
INRA
AFSSET
BQR
CEMAGREF
IFREMER
CNRS-INSU
LEFE-CHAT
MAE
SURVAQUA - Evaluation de l’impact des
perturbateurs endocriniens sur les milieu
aquatiques
Réponse biologiques d’invertébrés à la
présence de pesticides, contaminants
majeurs du continuum milieu continentalmilieu
marin en estuaire de vilaine
Morbihan
VTC DANS LE FRUIT -Vitamine C dans
le fruit – 1 voie simple, des effets
complexes sur la texture, la composition et
la qualitée nutritionnelle du fruit
Contamination des milieux par des
molécules anticancéreuses provenant des
rejets hospitaliers et des traitements
ambulatoires
Dynamique des contaminants sur le littoral
aquitain
Analyse des polluants organiques présents
dans les effluents liquides (lixiviats) des
installations de stockage de dechets
Etude des Hydrocarbures Aromatiques
Polycycliques dans les maillons trophiques
de la chaîne alimentaire du merlu provenant
du golfe du lion
Study of the abstraction channel in the OHinitiated
oxidation of monoterpenes
Programme Hubert Curien Balaton
H. Budzinski
(INERIS
coord.)
H. Budzinski
(INRA coord.)
M.Montury, J.L
Giraudel
(INRA
Bordeaux
coord.)
P. Mazellier
(AFSSET
coord.)
(Hongrie)
INTERREG Programme Concert'Eau H. Budzinski
(ECOLAB,
Toulouse
coord.)
CR Poitou-
Charentes
AAP Excellence Environnementale,
« Modifications chimiques de polluants
organiques dans le bassin de Marennes-
Oléron. Toxicité des produits de
dégradation sur l’huître creuse.»
AFSSA Programme de recherche « Arcachon » :
Recherche des causes possibles des
mortalités des souris intervenues dans le
cadre de surveillance des toxines lipophiles
dans le bassin d’Arcachon en 2005 et en
2006
ANR PRECODD
ANR VMC
AMPERES : Analyse de Micropolluants
Prioritaires et Emergents dans les Rejets et
les Eaux Superficielles
Programme EEL-SCOPE: Ecotoxicological
and Economical Liability of ell exposed to
Seasonal and global change-induced O2 –
depletion and Pollution in Estuaries
Duratio
n
2006-
2008
2006-
2009
2006-
2009
Amount
(k€ HT)
14.2
26.9
6
2007 57 35
E. Parlanti 2007 20
H. Budzinski 2007 20
H. Budzinski 2007 15
E. Villenave 2007-
2008
P. Mazellier 2007-
2008
2007-
2009
P. Mazellier
(Univ. La
Rochelle
coord.)
H. Budzinski
(AFFSA
coord.)
H. Budzinski
(CEMAGREF
coord.)
H.Budzinski
(EPOC coord.)
2007 –
2010
2007-
2010
2007-
2010
2007-
2010
12
3,1
10
52,5
142
Salary
Part
(k€HT)
111 66.5
152 72
143

Organism Project Title Project
Scientist
ANR VMC
ANR SEST
ADEME
CNRS ERICHE
IFREMER
CR Aquitaine
FEDER
IFREMER
IFREMER
Programme SoleBEMOL-pop: Devenir et
effets des contaminants dans les sols :
réponse biologique à l’échelle de l’individu
et de la population
Programme DIPERPHA: Dynamique et
Impact des Pertubateurs endocriniens et des
composés Pharmaceutiques issus des
élevages agricoles
Programme DIPERPHA : Dynamique et
Impact des Pertubateurs endocriniens et des
composés Pharmaceutiques issus des
élevages agricoles
Caractérisation fine de la toxicité des HAP
vis-à-vis des embryons et larves de
poissons. Contribution à l'évaluation des
risques environnementaux associés à la
pollution chimique de l'estuaire de Seine
Programme ICON: Integrated assessment of
contaminants impacts on the North Sea
Porgramme ASCOBAR: Apports
scientifiques face à la problématique
conchylicole du Bassin d’Arcachon
Porgramme ASCOBAR: aussi projet
FEDER associé / opération PRESAGE
Utilisation d'échantillonneurs passifs pour
l'évaluation de la contamination des masses
d'eau dans le cadre de la DCE à la Réunion
Programme PEPS (Programme
d'échantillonnage passif pour la
surveillance): Utilisation d'échantillonneurs
passifs pour l'évaluation de la contamination
des masses d'eau dans le cadre de la DCE.
Suivi à "Grande échelle" pour certains
contaminants hydrophiles et métaux traces
UVED Module d'apprentissage pédagogique e-
learning sur le contrôle de la qualité et la
préservation des ressources en eau
MEEDDAT
PRIMEQUAL
CNRS ECCO
Cytrix
CR Aquitaine
GIP Seine-Aval
Study of the isotopic molecular composition
(δC13) as a source tracer of particulate-
PAHs in the atmosphere
Génération POP: Effets à long termes et
transgénérationnels d'une exposition au
polluants organiques persistants (POP)
durant les stades précoces du
développement chez le poisson
Programme AquiTox: Analyse de la toxicité
et identification des polluants chimiques à
risque dans le compartiment sédimentaire
de divers écosystèmes aquatiques aquitains
Programme Flash: Devenir des
antibiotiques, flux de gênes et de bactéries
antibiorésistantes en estuaire de Seine,
épidémiologie, exposition à l’homme
144
H.Budzinski
(IFREMER
coord.)
H.Budzinski
(INRA coord)
H.Budzinski
(INRA coord)
Duratio
n
2007-
2010
2007-
2010
2007-
2010
J. Cachot 2008 8
H. Budzinski 2008-
2010
H. Budzinski 2007-
(EPOC coord.) 2010
H. Budzinski 2007-
(EPOC coord.) 2010
H. Budzinski 2008-
2009
H. Budzinski
(IFREMER
coord.)
M.H. Dévier
(EMA coord.)
2008-
2009
2008-
2009
H. Budzinski 2008-
2010
H. Budzinski
(IFREMER
coord.)
2008-
2010
J. Cachot 2008-
2010
H. Budzinski
(Univ. Rouen
coord.)
2008-
2010
Amount
(k€ HT)
120
75 30
46.8
23
80
108
46.5
62.5
3
66
18
77.5
52
Salary
Part
(k€HT)

Organism Project Title Project
Scientist
GIP Seine-Aval
INERIS
FP7 ERA-Net
AMPERA
AFSSET
GIP Seine-Aval
BQR
CEMAGREF
INERIS
CNRS ECCO
Cytrix
ANR AAP Blanc
Chimie
ANR PRECODD
Programme ToxSeine: Analyse de la
toxicité globale et identification des
composés toxiques à risque dans l’estuaire
de Seine
Accompagnement de thèse (Nicolas
Creusot)
Programme TOXPROF: Determining the
toxicity profile of major oils transported in
the European maritime area to establish the
applicability of biological effects techniques
for risk assessment and management
Développement d’une méthode intégrée
pour l’estimation des expositions aux
produits phytosanitaires
Programme THALASSOTOK: Colonisation
et utilisation des habitats estuariens par les
poissons migrateurs thalassotoques :
approche comparative Seine-Gironde.
Mise en place d'une plate forme d'analyse
isotopique moléculaire
Analyse des alkylphénols dans des
échantillons de poissons
Caractérisation des molécules responsables
de la contamination de la rivière Dore à
l'aide de préleveurs passifs de type POCIS
Programme IMOTOX: Incidence de la
Matière Organique particulaire et colloïdale
sur l’impact TOXique des contaminants
organiques sur le copépode Eurytemora
affinis
Programme REACTING: Réactivité de
radicaux inorganiques en solution aqueuse
Programme EMESTOX: Echantillonneurs
passifs pour la mesure des substances
chimiques et de la toxicité associée dans
l’eau et les effluents industriels
DFG-CNRS-INSU Novel approaches in the understanding of
the oxidation mechanisms of
monoaromatics in the atmosphere
INTERREG
SUDOE
Programme AGUA FLASH:
Développement d'une méthode d'évaluation
des risques de dégradation des eaux dans les
bassins versants agricoles au cours de crues
transposable aux bassins versants de Sudoe
IFREMER - INRA GDR EXECO Exposition aux contaminants
chimiques et effets écotoxicologique le long
du continuum milieu continental - milieu
côtier
CR
Aquitaine/FEDER
DVDPOL : Déplacement, vaporisation et
dégradation des polluants organiques dans
les nappes souterraines
Duratio
n
J. Cachot 2008-
2010
H. Budzinski 2008-
2010
H. Budzinski 2008-
(NIVA, 2010
Norvège
coord.)
L Tuduri
(CNAM coord.)
H.Budzinski
(CEMAGREF
coord.)
2008-
2011
2008-
2011
Amount
(k€ HT)
67 12
15
25
37 4.5
16.5
H. Budzinski 2009 34.9
H. Budzinski 2009 7.8
H. Budzinski 2009 29.3
E . Parlanti
(Univ. UPPA
coord.)
P. Mazellier
Coordinator
H. Budzinsk
Coordinatori
2009-
2010
2009-
2011
2009-
2011
E. Villenave 2009-
2011
H. Budzinski
(ECOLAB
coord.)
2009-
2011
H. Budzinski 2009-
2011
H. Budzinski
(Bordeaux 3
coord.)
2008-
2012
15
Salary
Part
(k€HT)
234 137
254 99
130 86
51.8 20.9
21
167
145

Organism Project Title Project
Scientist
PNRPE
MEEDDAT
Programme PecMicMog: Les interactions
perturbateurs endocriniensmicroorganismes
et matières organiques,
moteurs de l'écodynamisme et de l'impact
des polluants au sein d'écosystèmes
épuratoires
Duratio
n
H. Budzinski 2009-
2011
CPER A2E : Aquitaine Analyse Environnement H. Budzinski
(Univ. Pau et
Bordeaux : cocoord.)
2008-
2012
INERIS Accompagnement de thèse (Joani Ringuet) E. Villenave 2008-
2011
Amount
(k€ HT)
65
1600
30
Salary
Part
(k€HT)
Industrial Contracts (2005-2009)
Organism
Europe CEFIC (Conseil
européen des industries
chimiques)
IFREMER
Courvoisier
SGS Multilab
Conseil Général 33
BIO-TOX
OTAN
TOTAL Pétrochemicals
TOTAL Pétrochemicals
Project Title
Investigation of the relationships
between persistance, bioaccumulation
potential and long term effects of
chemicals in the marine and terrestrial
environments
Etude par isotopes stables du réseau
trophique et de l'origine de la matière
sur plusieurs sites dans le golfe de
Guinée
Goût de Lumière
Analyse de la génotoxicité d’effluents
industriels
Suivi des opérations de dragages dans
le Bassin d'Arcachon: analyse des
HAP dans les sédiments
Recherche de nouveaux outils
d’évaluation des dangers des sols
pollués, des déchets ou des substances
chimiques - développement de tests
d’atteintes génotoxiques (test des
micronoyaux et test des comètes) chez
les annélides
Improvement of Pesticide Residue
Analysis using MAE and SPME
Techniques
Evaluation de la Cancérogénicité, la
Mutagénicité et la Reprotoxicité
(CMR) de substances pures ou en
mélanges chez la truite
Utilisation de biomarqueurs comme
indicateurs de la qualité de l'estuaire de
la Loire
Project
Scientist
H. Budzinski
(INIA Madrid
coord.)
H. Budzinski
M. Montury et
V. Guillet
J.Cachot
H. Budzinski
(Univ. UPPA
coord.)
B. Morin
M. Montury et
V. Guillet
J.F. Narbonne
J.F. Narbonne
Durati
on
2002-
2007
2004-
2005
2005-
2007
2006-
2007
2006-
2008
2006-
2008
2006-
2008
2006-
2008
2006-
2008
Amount
(k€ HT)
351 67
15 7
10
3
25.1
14
15
78 30
53.5 20
Salary
part
(k€
HT)
146

Organism
UPPA - UT2A
Europe CEFIC Euro
Chlor Akzo Nobel
Chemicals
PHYTOBOKAZ SARL
VEOLIA
ENVIRONNEMENT
IFP
Project Title
Suivi des opérations de dragages dans
le Bassin d'Arcachon: analyse des
HAP dans les sédiments
Experimental design to characterize
the Concentration Body Burden (CBB)
of HexaChlorobenzen (HCB) with
lethality as end point
Analyse de la chlordecone dans divers
échantillons de produits d'origine
végétale
Analyse de contaminants organiques
dans des eaux de station d'épuration
Étude de la réactivité des résidus
pétroliers en hydroconversion
Project
Scientist
H. Budzinski
Durati
on
2006-
2008
Amount
(k€ HT)
25.1
H. Budzinski 2007 20 8
H. Budzinski 2007 1.2
H. Budzinski
H. Budzinski
2007-
2009
2006-
2009
TOTAL Petrochemicals HAP huitres et sédiments Guadeloupe H. Budzinski 2007 17.1
CONCAWE
EPIDOR
TOTAL Pétrochemicals
France
WWF
DANONE
CEMAGREF
SIBA et SMURFIT
KAPPA
SIBA et SMURFIT
KAPPA
TOTAL Pétrochemicals
France
Photodegradation and phototoxicity of
polycyclic aromatic hydrocarbons in
relation with risk assessment
methodology: Application to aquatic
systems
Analyses des principaux polluants
organiques dans des sédiments et des
poissons
Caractérisation chimique et
toxicologique de la contamination de
mésocosmes dans le cadre d'un suivi
de l'impact d'une coupe pétrolière
Etude des cétacés en Méditerranée,
analyses chimiques
Dosage de contaminants organiques
dans des eaux embouteillées
Utilisation des moyens analytiques par
GC/MS et GC/ECD du CDTA
Etude du rejet à l'océan des effluents
traités, urbains et industriels, au wharf
de La Salie.PhaseI
Etude du rejet à l'océan des effluents
traités, urbains et industriels, au wharf
de La Salie: impact sur le milieu.
PhaseII
Analyse de produits pétroliers
H. Budzinski
H. Budzinski
H. Budzinski
H. Budzinski
2007-
2009
2008-
2009
2008-
2009
2008-
2010
15
30
13.4
10
22.9
26.7
H. Budzinski 2009 25
H. Budzinski 2009 14.4
H. Budzinski
H. Budzinski
H. Budzinski
2008-
2009
2009-
2011
2008-
2009
33.4
101.9
4
Salary
part
(k€
HT)
147

Science Administration and Management (2005-2009)
University Bordeaux 1
Science Administration
Doctoral School in Chemical Sciences
Member of the
E. Villenave
(EDSC)
Executive Board
2004 - …
Master S.&T. Chemistry, CME
Responsible
E. Villenave
(environmental molecular chemistry)
2004 - 2007
Master S.&T. Chemistry, QUALENC
Responsible
E. Villenave
(environmental chemistry and quality)
2008
Master S.&T. Chemistry, QUALENC
Responsible
N. Marchand-Geneste
(environmental chemistry and quality)
2009 - …
CPE Bordeaux 1 H. Budzinski 2006 - 2008
Licence Department (1 er cycle)
Licence Environmental Chemistry N. Marchand-Geneste 2003 - 2008
Licence Environmental Chemistry J. Cachot 2009 - …
Licence Industrial Chemistry B. Morin 2007 - …
Chemistry department
Doctoral School in Chemical Sciences
Council E. Villenave 2006 - 2009
Doctoral School in Environmental Sciences
Council H. Budzinski 2007 - …
Institute of Molecular Sciences
Scientific Executive Board, In charge of the relations with university
and doctoral school and chemistry department
E. Villenave 2007 - 2010
Institute Council (Elected member, representing the Professors) E. Villenave 2007 - 2010
Institute Council N. Marchand-Geneste 2007 - 2010
Institute Council K. Le Menach 2007-2010
Council of hygiene and safety E. Parlanti 2007-2010
Council of hygiene and safety P. Pardon 2007-2010
Council of hygiene and safety S. Augagneur 2007-2010
Communication committee S. Augagneur 2007-2010
Scientific Directory Board P. Pardon 2007-2010
Specialty and Selection Committees
31 e section B. Morin 2006-2008
31 e section N. Marchand-Geneste 2006-2008
31 e section H. Budzinski 2005-2008
66-67-68 e section B. Davail 2005-2008
IUT Périgueux-Bordeaux IV
Executive Board L. Tuduri 2006-2009
Head of the Institute J.L. Giraudel 2003-2009
Local Scientific Committees (« GIS », « Pôle de Compétitivité », « Région Aquitaine »)
Aquitaine ostreicole scientific council of oyster crisis H. Budzinski (Coordinator of Action 2
CSOA (Conseil Scientifique Ostréicole Aquitain) « contaminants » of ASCOBAR)
2007 - …
Aquitaine network of Coastal Research
RRLA (Réseau de Recherche Littoral Aquitain)
H. Budzinski 2008 - …
Food safety program (Sécurité sanitaire des Aliments) H. Budzinski 2004 - 2009
148

Other Universities
Selection Committees
Clermont-Ferrand
Saint-Etienne
Limoges
Poitiers
Patrick Mazellier (31 e )
Patrick Mazellier (32 – 33 - 62 e )
Patrick Mazellier (31 – 32 - 33 e )
Patrick Mazellier (31 – 32 e )
Agro-Paris-Tech H. Budzinski 2009
Brest H. Budzinski 2009
Member of the selection committee of the 31 section -
IUT Perigueux-Bordeaux IV
Member of the selection committee of the 31 section -
IUT Perigueux-Bordeaux IV
Member of the selection committee of the 31-32-33
sections (Reims)
Member of the selection committee of the 31e section
(Orléans)
H. Budzinski 2008
E. Villenave 2008
2009
2000 - 2008
2006 - 2008
2006 - 2008
E. Villenave 2009 - ...
E. Villenave 2005 - ...
National Committee University (CNU)
Section 31 H. Budzinski 2007-…
CNRS
National Committee
Comité National Section 13 P. Mazellier 2004 - 2008
Member of the Scientific Executive Board of CNRS INSU PNCA E. Villenave 2005 - 2007
Member of the Scientific Executive Board of CNRS INSU LEFE-CHAT E. Villenave 2007 - 2009
CNRS-INSU: direction In charge of atmospheric chemistry E. Villenave 2009 - …
CNRS Scientic Council of the department “Planete Univers” H. Budzinski 2007 - …
Scientific Council INSU (Institut National des Sciences de l’Univers) H. Budzinski 2007 - …
Scientific Council SIC (Section Surfaces - Interfaces -Continentales) H. Budzinski 2007 - …
INSU/CNRS : Programme ECCO Scientific Committee P.Garrigues 2003 - 2006
CNRS : Rencontre Jeunes Sciences et Citoyens
Scientific Committee,Chair Member(1996-2008)
P.Garrigues 2008
Specific scientific programme, GDR, INSU programmes
Europe
Member of the ESF-INTROP programme E. Villenave 2005 - 2009
Member of the ACCENT Network of Excellence E. Villenave 2005 - 2009
France
Member of Network ERICHE (réseau ERICHE (Evaluer et Réduire
l'Impact de la CHimie sur l'Environnement)
LPTC
H. Budzinski
2007 - 2010
149

Other Research Institute
National Committees
IRD Scientic Council (Institut de Recherche pour le Développement) H. Budzinski 2007-…
« Division Risques Chroniques » INERIS Scientific Council H. Budzinski 2007-…
ONEMA Scientific Council
(Office national de l'eau et des milieux aquatiques)
H. Budzinski 2008-…
IFREMER ECOREC Commission P.Garrigues 1998-2008
INERIS, Chair « Division Risques Chroniques » P.Garrigues 2002-2005
INERIS Scientific Advisory Board P.Garrigues 2006- …
Ministry of Research Programme RITEAU P.Garrigues 2000-2005
Ministry of the Environment Programme DETOX P.Garrigues 1996-2007
Région Rhônes Alpes
Programme « Environnement et Analyses » - Coordinateur
P.Garrigues 2003-2006
Région Rhônes Alpes
Programme CIBLE « Chimie et Sciences de l’Univers » - Coordinateur
P.Garrigues 2007- …
Specific scientific programme, GDR, INSU programmes
Europe
Co-founder and member of the international Atmospheric Soot Network (ASN) E. Villenave 2006-…
NORMAN Network associate member H. Budzinski 2009-…
France
Member of GDR IMOPHYS (INRA-IFREMER)
LPTC
2004-2007
Co-director of GDR IMOPHYS (INRA-IFREMER)
H. Budzinksi
Member of GDR Monalisa E. Parlanti 2004-2007
Member of GDR-I EXECO (INRA-IFREMER)
LPTC
2009-2012
Co-director of GDR-I EXECO (INRA-IFREMER)
H. Budzinksi
Boards of Scientific Societies
French Chemical Society
IHSS french chapter E. Parlanti 2006-2009
Réseau Matière Organique E. Parlanti 2005-2009
SFC – Division Chimie Physique H. Budzinski 2006-2007
SFC – Division Chimie Analytique H. Budzinski 2006-2007
IUPAC, Others
Elected president of ISPAC
International Society of Polycyclic Aromatic Compounds
H. Budzinski 2009-210
Editorial Board of Journals
Analytical and Bioanalytical Chemistry (ABC) (IF:3.3) P.Garrigues Editor
Environmental Science and Pollution Research (ESPR) (IF:2.4) P.Garrigues Subject Editor
Polycyclic Aromatic Compounds (PAC) (IF:0.7) P.Garrigues Editor in Chief
150

Meeting Organisation
National
Member of the Scientific Committee of the French Gas Kinetics Meeting E. Villenave Rennes 2005
Chair of the Scientific Committee of the French Gas Kinetics Meeting E. Villenave Paris 2009
Member of the Scientific Committee of the 38 th Pesticide French Group (GFP) H. Budzinski Brest 2008
Member of the Scientific Committee of the congress « Les Effluents liquides
Chambéry
H. Budzinski
des établissements de santé : Etat des lieux et perspectives de gestion »
2008
Member of the Scientific Committee of the 1 st French Organic Matter Network
Carqueiranne
E. Parlanti
Meeting
2006
Member of the Scientific Committee of the French IHSS Meeting E. Parlanti Lyon 2007
Member of the Scientific Committee of the 2 nd French Organic Matter
Sainte-Maxime
E. Parlanti
Network Meeting
2009
Co-organizer of thematic Workshop « Résidus de médicaments dans les
milieux aquatiques. Besoins et outils pour la surveillance, et évaluation des
risques » under the supervision of ONEMA
H. Budzinski Paris 2009
International
ASEFI 2006: Atmospheric Soot:
Environmental fate and impact
ECOBIM 2008
11 th International Conference on
Chemistry and the Environment
1 st European Chemistry Congress
E. Villenave Arcachon, France, 2006
H. Budzinski, Chair
P.Garrigues (Co-Chair)
P.Garrigues (Scientific Committee
and Session Convener)
2 nd European Chemistry Congress P.Garrigues (Scientific Committee)
PRIMO 15
Pollutant Responses in Marine Organisms
P. Garrigues, C. Minier (Chairs)
J. Cachot, B. Morin (Scientific
Committee)
Bordeaux, France, 15-16 mai
2008
Torun, Poland, September
2007
Budapest, Hungary,
September 2006
Torino, Italy, Septembre
2008
Bordeaux, France, May 17-
20, 2009
151

152

ANNEXE 2
Plan de formation 2011-2014
153

154

Université Bordeaux 1
Centre National de la Recherche Scientifique
UMR 5805 EPOC
Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et
Continentaux
PLAN DE FORMATION 2011-2014
DIRECTEUR : ANTOINE GRÉMARE
CORRESPONDANTS FORMATION : ISABELLE BILLY ET MICHEL CORNET
❏ Site de Talence • Avenue des Facultés - 33405 Talence Cedex France
Tél. 05 40 00 88 69 - Fax 05 40 00 33 16
❏ Site d’Arcachon • Station Marine, 2 rue du Professeur Jolyet - 33120 Arcachon France
Tél. 05 56 22 39 00 - Fax 05 56 83 51 04
155

156

Plan de Formation de l'UMR 5805 EPOC
I - PRÉSENTATION DE L'UNITÉ
L'UMR 5805 EPOC (Environnements et Paléoenvironnements Océaniques et Continentaux)
Directeur : Antoine GRÉMARE
Directeur-Adjoint : Thierry CORRÈGE
fait partie de l'Observatoire Aquitain des Sciences de l'Univers (OASU, directeur Francis GROUSSET)
qui comprend également une Unité Mixte de Services (UMS 2567) et l'UMR 5804 (Laboratoire
d'Astrophysique De Bordeaux, LAB ; Directeur : Patrick CHARLOT)
L'UMR EPOC est localisée sur deux sites :
- Le Site de Talence (Bâtiments de Géologie et de Chimie)
- Le Site d'Arcachon (Station Marine et futur site du Pôle Océanographique Aquitain, POA)
- En outre, des Services Communs et des plates formes techniques seront répartis sur les deux
sites.
Site de Talence
Par rapport au quadriennal précédent, EPOC va incorporer dans sa nouvelle mouture une équipe de
chimiste (le LPTC). En attendant les restructurations qui se feront à la création du POA, les personnels
présents sur le site de Talence sont localisés sur deux bâtiments, le B18 qui comprends les membres
d’EPOC relevant de l'UFR Sciences de la Terre et de la Mer, et le A12 qui comprends les chimistes de
l’équipe LPTC.
Site d'Arcachon : Station Marine (et futur POA)
Les personnels affectés à Arcachon relèvent actuellement de l'UFR des Sciences Biologiques. A la
création du POA, la situation évoluera vers une mixité des personnels entre les trois composantes.
L’UMR EPOC est organisée en sept équipes, et un service commun :
- TGM (Transferts Géochimiques des Métaux à l’interface continent océan) Responsable : Gérard
BLANC
- LPTC (Laboratoire de Physico et Toxico Chimie de l’environnement) Responsable : Hélène
BUDZINSKI
- EA (Ecotoxicologie Aquatique) Responsable : Jean-Charles MASSABUAU
- ECOBIOC (Ecologie et Biogéochimie des Ecosystèmes Côtiers. Responsable : Xavier de
MONTAUDOUIN
- METHYS (Modélisation, Expérimentation et Télédétection en Hydrodynamique Sédimentaire).
Responsable : Philippe BONNETON
- PALEO (Paléoclimats). Responsable : Xavier CROSTA
- SEDIMENTO (Sédimentologie). Responsable : Sébastien ZARAGOSI
157

II - COMPOSITION DE L'UMR
L'UMR EPOC compte 123 permanents titulaires sur ses deux sites de Talence et d’Arcachon.
- 52 enseignants-chercheurs,
- 22 Chercheurs,
- 49 personnels IATOS et ITA - Ingénieurs, Techniciens et Administratifs , dont 3 relevant de
l’OASU et postés à Talence.
L'UMR EPOC est complétée par des thésards (une quarantaine), ainsi que par un nombre fluctuant de
post-docs, d’ATER et de contractuels.
III - PRÉSENTATION SCIENTIFIQUE DE L'UNITÉ
L'UMR 5805 a pour mission d'acquérir de manière pérenne et en utilisant des méthodes scientifiques
rigoureuses, les données observationnelles qui permettent de comprendre l'état de notre environnement
au sens large du terme. Il s'agit d'appliquer les méthodes de la géologie, de la géochimie de la biologie,
de la chimie et de la physique à l'étude des environnements et des paléoenvironnements océaniques et
continentaux. La structuration de la recherche au sein d’EPOC se fait en trois grands axes thématiques :
- Axe 1 : Ecotoxicologie
- Axe 2 : Océanographie côtière
- Axe 3 : Géosciences marines
Pour mener à bien ses recherches, l’UMR a mis en place des plates-formes techniques. Ces platesformes
sont au nombre de sept (Expérimentation/accès terrain, Mesures physiques, Analyses
faunistiques, Chimie, Isotopie, Biologie moléculaire, Analyses des carottes sédimentaires). Elles
favoriseront l’interdisciplinarité par la mise en contact de scientifiques d’horizons différents autour
d’une approche et/ou d’une méthodologie.
Depuis de nombreuses années, l'UMR EPOC déploie des activités d'observation (coordination du
service : Benoît SAUTOUR) en support à la recherche fondamentale ou sur sollicitation d'agences
techniques ou de collectivités territoriales. Compte tenu de l'importance de l'enjeu des tâches
d'observation et de la nécessité de pérenniser et de valoriser ces activités, l'UMR EPOC est entrée dans
l'Observatoire Aquitain des Sciences de l'Univers (OASU).
158

IV - ETAT DES LIEUX DE LA FORMATION PERMANENTE
En raison de sa taille (plus de cent vingt permanents) et de sa localisation sur deux sites
géographiquement séparés (Talence et Arcachon), l'UMR 5805 s'est dotée de deux Correspondants de
Formation Permanente : Isabelle BILLY (IE MEN) pour Talence et Michel CORNET (IE CNRS) pour
Arcachon.
Le bilan des formation sur le plan de contractualisation précédent est présenté ci-dessous sous forme
d’un graphe, et de tableaux récapitulatifs.
BILAN DES FORMATIONS SUIVIES PAR LES PERSONNELS DE L'UMR D’OCTOBRE 2005
A JANVIER 2009
Techniques spécifiques/Technologie/Instrumentation
Intitulé Emploi Equipe Année
Atelier sonde CTD seabird pour SOMLIT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
E6
E4
2007
Camari 1 ITRF MENRT E6 2006
Capteurs et conditionneurs 1 ITA CNRS E3 2007
Habilitation électrique 1 ITRF MENRT E4 2007
Initiation à la chromatographie gazeuse
1 C CNRS
1 ITRF MENRT
E4
E4
2007
Initiation à la chromatographie liquide 1 ITA CNRS E4 2005
159

Techniques spécifiques/Technologie/Instrumentation
Intitulé Emploi Equipe Année
Journées thématiques PCB/PIC 1 ITA CNRS E3 2005
10 e rencontre des électroniciens du CNRS 1 ITA CNRS E3 2008
Labview (niveau 2) – programmation
avancée
ITA CNRS E3 2007
La métrologie de laboratoire 1 ITA CNRS E4 2007
Permis bateau côtier
Permis bateau fluvial
Permis E
Réseau des centres communs de
microscopie
1E-C MENRT
1 C CNRS
1 ITRF MENRT
1 C CNRS
1 ITRF MENRT
1 ITA CNRS
1 ITRF MENRT
E3
E4
SC
E4
SC
SC
SC
2006
2006
2006
2006
2009
2009
1 ITA CNRS E3 2007
Systèmes d’information géographique 1 ITRF MENRT SC 2007
Utilisation de carottiers à bord de navires
océanographiques
1 ITA CNRS
1 ITRF MENRT
SC
SC
2008
2008
Développement Linux embarqué 1 ITA CNRS E3 2008
Chef de plongée scientifique CAH / CPS 1 ITA CNRS SC 2006
Formation ISOTRAPIK 1 ITA CNRS E1 2009
Analyse/Traitement des données expérimentales/Statistiques
Intitulé Emploi Equipe Année
Excel perfectionnement – base de données 1 E-C MENTR E5 2006
Excel perfectionnement – calculs élaborés 1 E-C MENTR E5 2006
Les bases statistiques de la validation
analytique
1 PA CNAP
1 ITRF MENTR
E4
E6
2008
Logiciel METAMORPH 1 ITA CNRS E3
Notions fondamentales en statistiques
Formation statistiques pour le réseau
SOMLIT
160
1 E-C MENRT 1 1
ITRF MENRT
Informatique/bureautique
E3
E3
2008
2008
1 PA CNAP E4 2009
Intitulé Emploi Equipe Année
ACCESS Initiation 1 ITA CNRS E4 2006
Administration de ORACLE 9I 1 ITA CNRS SC 2005

Informatique/bureautique
Intitulé Emploi Equipe Année
Administration serveur LINUX (web) 1 ITA CNRS SC 2006
Adobe Photoshop perfectionnement 1 ITRF MENRT E6 2008
Aide à l’acquisition des données sur
machines piratées
1 ITA CNRS SC 2007
Capteurs et conditionneurs ITA CNRS E3 2007
Dreamweaver initiation 1 ITRF MENRT SC 2008
Dres 1 ITA CNRS SC 2007
Formation juridique pour les ASR 1 ITA CNRS SC 2008
In design initiation 1 ITRF MENRT E6 2007
Journées réseaux 1 ITA CNRS SC 2005
Mise en place d’une politique de sécurité 1 ITA CNRS SC 2008
Photoshop initiation 1 ITRF MENRT E6 2007
Politique de sécurité des systèmes
d’information
1 ITA CNRS SC 2008
Powerpoint 2007 1 ITRF MERNT E4 2009
Powerpoint 1 1 DR1 CNRS E6 2006
Powerpoint 2 1 DR1 CNRS E6 2006
Protocole d’authentification 1 ITA CNRS SC 2006
Réunion semestrielle des correspondants
sécurité
1 ITA CNRS SC 2005
Gestion financière et comptable
Intitulé Emploi Equipe Année
Formation des gestionnaires de laboratoire
Réunion d’information et d’échanges sur
LABINTEL
Service facturier
1 ITA CNRS
1 ITRF MENRT
SC
SC
2007
2006
1 ITA CNRS SC 2006
1 ITA CNRS
1 ITRF MENRT
SC
SC
2006
Hygiène et sécurité/Santé prévention
Intitulé Emploi Equipe Année
Attestation de formation aux premiers
secours
Initiation à la prévention des risques
professionnels
1 ITRF MENRT
1 E-C MENRT
1 ITRF MENRT
1 E-C MERNT
1 ITRF MENRT
1 E-C MENRT
161
E6
E5
SC
E4
E6
E7
2006
2008
2009
2009
2009

Hygiène et sécurité/Santé prévention
Intitulé Emploi Equipe Année
Nouvel arrêté de zonage en radioprotection 1 E-C MENRT E4 2008
PCR formation initiale (personne
compétente en radioprotection)
1 C CNRS
1 E-C MENRT
E7
E4
2006
2006
Premiers secours recyclage 1 ITRF MENRT E4 2007
Formation risques biologiques 1 ITRF MENRT E6 2009
Evacuation incendie
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITA CNRS
1 ITA CNRS
1 C CNRS
1 E-C MENRT
1 E-C MENRT
E4
E6
E7
E6
E4
E7
E6
SC
SC
SC
SC
SC
E6
E6
E7
2008
2009
2009
2009
2009
2009
2009
2009
2009
2009
2009
2009
2009
2009
2009
Sensibilisation à la radioprotection 1 ITRF MENRT E3 2008
Preventions secours civiques niveau1 1 E-C MENRT E3 2008
Formation membre Commission Hygiène
et Sécurité
1 ITRF MENRT E6 2009
Valorisation / Culture générale / Développement personnel
Connaissance de l’Université
Intitulé Emploi Equipe Année
162
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 E-C MENRT
SC
E6
E7
2007
2007
2008
Structure et fonctionnement de l’Université 1 ITRF MENRT SC 2008
Entrants journée nationale DR 15 1 ITA CNRS E4 2007
Entrants journée nationale DR 15 1 C CNRS E5 2008
Entrants journée régionale DR 15 1 ITA CNRS E4 2007
Entrants journée régionale DR 15
Jury de simulation
Préparation à la cessation d’activité
professionnelle
1 C CNRS
1 ITA CNRS
1 ITA CNRS
1 ITRF MENRT
E5
SC
SC
E6
2008
2006
2008
1 ITA CNRS E1 2008

Valorisation / Culture générale / Développement personnel
Intitulé Emploi Equipe Année
Préparation à l’épreuve orale des concours 1 ITA CNRS SC 2006
Préparation à l’épreuve orale des concours
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
E6
SC
2007
Rapport d’activité du concours interne 1 ITA CNRS E3 2007
Préparation du rapport d’activité 1 ITRF MENRT SC 2008
Rédaction d’un rapport d’activité 1 ITA CNRS SC 2006
Rédaction d’un rapport d’activité
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
1 ITRF MENRT
SC
E6
E4
2007
Réunion des correspondants de formation 1 ITRF MENRT E6 2008
Préparation à la cessation d’activité
1 DR CNRS E7
2009
professionnelle
2009
1 C CNRS
E5
Communication
Intitulé Emploi Equipe Année
Améliorer la qualité et l’efficacité des
relations professionnelles
Améliorer la traçabilité dans les projets de
recherche SPI
Comité de pilotage réseau des
administrateurs d’unités
Création d’un réseau régional des
administrateurs de labos
1 ITA CNRS SC 2005
1 C CNRS
1 ITRF MENRT
E3
E3
2007
1 ITA CNRS SC 2007
1 ITA CNRS SC 2007
Culture de projet 1 E-C MENRT E4 2006
Préparation à la prise de parole en public 1 ITRF MENRT E6 2005
Prendre la parole en public 1 ITA CNRS E3 2007
Bibliothèque
Intitulé Emploi Equipe Année
APOGEE 1 ITRF MENRT SC 2008
APOGEE session résultats 1 ITRF MENRT SC 2008
Atelier des réseaux de la documentation
scientifique
163
1 ITA CNRS SC 2005
Catalogage en format UNIMARC 1 ITRF MENRT SC 2008

Bibliothèque
Intitulé Emploi Equipe Année
Maniement du répertoire RAMEAU 1 ITRF MENRT SC 2008
Formation HAL 1 ITA CNRS SC 2008
WINIBW 1 ITRF MENRT SC 2008
Sensibilisation aux logiciels libres en
documentation
1 ITA CNRS SC 2007
Langues
Intitulé Emploi Equipe Année
1 ITA CNRS SC
Anglais
1 C CNRS E5 2006
Anglais intermédiaire 1 C CNRS E5
2006-
2005
Anglais confirmé 1 E-C MENRT E5 2006
Espagnol 1 ITA CNRS E7 2007
Portugais
1 C CNRS
1 E-C MENRT
E4
E4
2006
Qualité
Intitulé Emploi Equipe Année
L’amélioration continue au service de ses
pratiques professionnelles : vers la
démarche qualité en recherche
Démarche qualité pour le réseau SOMLIT
Rencontre du réseau qualité en recherche
1 ITFR MENRT
1 PA CNAP
1 ITFR MENRT
1 ITA CNRS
1 E-C MENRT
E6
E4
E6
SC
E4
E4
2006
2006
1 PA CNAP E4 2009
Ecoles thématiques
Intitulé Emploi Equipe Année
Exobiologie 1 C CNRS E6 2007
164

Les équipes listées sont les suivantes :
- E1 TGM
- E2 LPTC
- E3 EA
- E4 ECOBIOC
- E5 METHYS
- E6 PALEO
- E7 SEDIMENTO
- SC Services Communs
-
IV - Procédure d'élaboration du plan de formation de l'Unité
Ce plan a été élaboré par les correspondants de formation à partir d'une enquête auprès des personnels
par questionnaire adressé notamment aux responsables d'équipe et par des discussions individuelles.
V - Traduction de l'évolution de l'Unité en besoins de formation
Du fait de l’intégration du LPTC à EPOC, de la mise en place de plates-formes et de l’activité
croissante de l’UMR en matière d’observation, la demande en formation a évolué par rapport au
précédent quadriennal. Cependant, compte tenu de la tache de l’UMR EPOC, il est difficile de
présenter un bilan cas par cas, et nous présentons simplement un bilan sous forme de tableaux
contenant des indications de priorités.
165

VI - Traduction pédagogique des besoins en action de formation
Techniques spécifiques/Technologie/Instrumentation
Biologie
- Expérimentation animale
- Microscopie (électronique, confocale)
- Cytométrie en flux
- Maintenance et gestion HPLC
- Analyseur de sels nutritifs et sulfates AxFlow
- Formation FlowCam
- Formation PhytoCam
Les formations de biologie/génétique moléculaire sont une priorité pour les équipes de l'UMR :
- Amplification par PCR
- Empreintes moléculaires par RISA
- DGGE
- Mesure des activités bactériennes par hybridation fluorescente in situ (FISH)
Géologie
- ICPMS Haute résolution
- ICP optique
- Spectrométrie de masse
- Techniques de couplage ICPMS-HPLC
- Mesure de la silice biogène sur analyseur de type Technicon
- Mesure des isotopes stables de la silice sur IRMS-Kiel III
Chimie
- Spectrométrie de masse (quadripole, tof)
- Phénomènes de combustion
- Mesure de terrain en chimie de l'atmosphère
- Spectroscopie UV et fluo
- Fractionnement par flux croisés (Flow Field Fractionation, FFF)
- Détection par diffusion de lumière multiangles (MALLS)
- Analyse chromatographique par GC-MS/GC-ECD
- Technique de couplage spectrométrie de masseet chromatographie en phase gazeuse
- Méthodologie et techniques SPME et SBSE
- HPLC
- Mécanismes d'ionisation et de fragmentation en spectrométrie de masse ESI et APCI
Mécanique/Electricité
- Soudure
- Habilitation électrique
166

Techniques spécifiques/Technologie/Instrumentation
Electronique
- Bioacoustique
- CAO électronique
- Electronique des capteurs
- Instrumentation scientifique et technique des capteurs (LABVIEW)
- Télémesures via la rado ou le net
Imagerie numérique
- Analyse d'image, trajectographie
- Acquisition et traitement d'images fluorescentes
L'imagerie numérique et le traitement d'image constituent un thème fédérateur de l'UMR. L'évolution
rapide des matériels proposés sur le marché exige un suivi permanent des technologies se traduisant
par des besoins généraux mais aussi par des demandes plus pointues.
Informatique/Bureautique
- Formation Office 2007
- Logiciels de dessin (CorelDraw, Adobe Illustrator)
- Logiciel Endnote
- Recherches sur le Web (documentation, bibliographie)
- Logiciel Dreamweaver (édition de sites internet)
Analyse et traitement des données/Statistiques
- Bases de données (logiciel Access, …)
- Biostatistiques : analyses de variance (ANOVA) et de covariance (ANCOVA), ACP
- Logiciel Surfer
- Logiciel Arcview 9.0
- Logiciel PALM (modélisation)
- Formation "calcul parallèle"
- Logiciel Statistica, logiciel R
- Métrologie
- Programmation en langage Python
- Logiciel Matlab
Le traitement des données expérimentales et la modélisation constituent un thème fédérateur dans
l'UMR
Hygiène et sécurité/Santé-prévention
- Mise à jour des formations ACMOS
- Formation d'un maximum de personnes aux premiers secours et sensibilisation aux risques liés
aux activités des laboratoires
- Formation incendie
- Habilitation radioprotection (Renouvellement pour les personnes dont l'attestation arrive à
expiration)
- Habilitation à l'utilisation d'autoclave (stérilisation et destruction de déchets biologiques)
167

Gestion financière et comptable
- Marchés publics
Les besoins sont constants en ce qui concerne les formations/mises à niveaux mais des formations
sont proposées systématiquement lorsque de nouveaux logiciels sont mis en service.
Management/organisation/Qualité
- Sensibilisation à la démarche qualité
- Conception d'un projet de recherche scientifique ou technique
Soutien aux activités de terrain
- Plongée scientifique
- Permis bateau
Soutien aux activités pédagogiques
- Formation Apogée (modules "présentation" et "résultats")
- Connaissance de l'Université
Langues
Des formations en anglais/espagnol sont nécessaires à tous niveaux (anglais scientifique et technique
en particulier ; rédaction d'e-mails, explication de démarches aux chercheurs étrangers, accueil de
conférenciers, communications téléphoniques)
Réseaux de compétences professionnelles
Il est important pour l'UMR que la participation aux différents réseaux professionnels (Mécaniciens,
Electroniciens, Administrateurs Réseaux Informatiques, Microscopie électronique, Documentalistes,
Réseau ISOTRACE...) soit poursuivie pour assurer une mise à jour régulière des compétences et
maintenir un contact entre les spécialistes de ces domaines.
VIII - Offres de formation de l'Unité
Compte tenu des compétences acquise dans de nombreux domaines, l'UMR peut assurer des formations
internes destinées aux nouveaux entrants (SIG, Culture de cellules animales, modélisation…). Ces
compétences pourraient se transformer en offres de formation suivant les demandes et les moyens
disponibles.
IX - Suivi de la mise en place du plan de formation
Les correspondants de formation assurent le suivi administratif par co-signature des demandes après
vérification que ces dernières figurent dans le plan de formation et après avis du directeur de l'Unité.
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