Struttura di proteine

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Comparative (homology) modeling ● Allineamento sequenza struttura stampo (template) PAEP_HUMAN 21 IPQTKQDLELPKLAGTWHSMAMATNNISLMATLKAPLRVHITSLLPTPED 70 :.||.:.|::.|:||||:|:|||.::|||:....|||||::..|.||||. pdb1QG5 3 VTQTMKGLDIQKVAGTWYSLAMAASDISLLDAQSAPLRVYVEELKPTPEG 52 PAEP_HUMAN 71 NLEIVLHRWENNSCVEKKVLGEKTENPKKFKINYTVANEATLLDTDYDNF 120 :|||:|.:|||:.|.:||::.|||:.|..|||:....|:..:|||||..: pdb1QG5 53 DLEILLQKWENDECAQKKIIAEKTKIPAVFKIDALNENKVLVLDTDYKKY 102 PAEP_HUMAN 121 LFLCLQDTTTPIQSMMCQYLARVLVEDDEIMQGFIRAFRPLPRHLWYLLD 170 |..|::::..|.||::||.|.|....|||.::.|.:|.:.||.|:....: pdb1QG5 103 LLFCMENSAEPEQSLVCQCLVRTPEVDDEALEKFDKALKALPMHIRLSFN 152 PAEP_HUMAN 171 LKQMEEPC 178 ..|:||.| pdb1QG5 153 PTQLEEQC 160
Comparative (homology) modeling ● Copia delle coordinate del backbone, generazione delle catene laterali non identiche (il metodo piu' diffuso utilizza una libreria di rotameri)
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