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segue Antibiotico Conc. (mg/kg) Sulfodiazina Sulfa metoxazolo Sulfapiridina Notiziario dei Metodi Analitici 20 n.1 (2012) Parametro testato Effetto a Condizioni Tempo (g) Metodo Rif. 10-100 Conta di batteri resistenti alla sulfadiazina Frequenza di geni di Aumento significativo Aumento Suolo limo-argilloso e limo-argilloso miscelato a letame contenente 32-61 Conta batteri coltivabili (MPN) Heuer & Smalla, resistenza sulfadiazina alla significativo sulfadiazina qPCR 2007 10 Attività ammonioossidativa Diminuzione 100 Respirazione basale del suolo Attività ammonioossidativa Diminuzione Diminuzione Suolo trattato letame con 32 Saggio attività microbica Kotzerke et al., 2008 Denitrificazione Leggera Diminuzione Profilo batterico con DGGE Variazione dell’intensità delle bande Prima DGGE 1-50 Diversità (Indici Shannon–Wiener) diminuita, poi recuperata dopo 48 g Suolo trattato glucosio con 48 Zielezny et al., 2006 Respirazione basale suolo Diminuzione significativa Saggio di respirazione del suolo >0,15 Frequenza dei geni di resistenza alla sulfadiazina (sul2) Influenza significativa Suolo trattato con letame contenente sulfadiazina 175 qPCR Heuer et al., 2008 1-100 Rapporto di copie genichesul2/16S rRNA Aumento di 1- 2 unità log Suolo trattato letame con 61 qPCR Heuer et al., 2009 20-500 500 PICT Proporzione funghi/batteri PLFA PICT Aumentodi un fattore 2 Aumento Aumento di un fattore 2 Suolo trattato con letame da maiali trattati con alfalfa o antibiotici Suolo non trattato 1-5 settimane PLFA/PICT Demoling et al., 2009 0,05-1,17 0,003-1,14 100-1000 Respirazione indotta con substrati Attività di riduzione Fe(III) Rapporto funghi/batteri Diminuita del 10% Diminuita del 10% Aumento significativo Suolo superficiale incontaminato trattato con paglia di mais o glucosio 1-2 ore 7 14 SIR/Fe (III) riduzione Carbonio microbico estratto con fumigazione e concentrazione di ergosterolo Thiel- Bruhn & Beck, 2005 segue a Comparato con trattamento senza antibiotico, se non indicato diversamente MPN = Most Probabile Number; qPCR = Real Time Polymerase Chain Reaction; DGGE = Elettroforesi su Gel in Gradiente Denaturante; PICT = Pollution-Induced Community Tolerance; PLFA = Analisi degli acidi grassi derivati dai fosfolipidi; SIR = Substrate Induced Respiration.
segue Antibiotico Conc. (mg/kg) Tetra cicline Tilosina sulfametazina + tilosina + clorotetra ciclina Parametro testato Rapporto G+/G− PLFA 5-500 Rapporto funghi/batteri PLFA 0,003-0,1 2000 2000 Batteri resistenti alle tetracicline Diversità della comunità microbica (numero di bande nei profili DGGE) Struttura comunità microbica (bande DGGE) 50-1500 PICT >50 10 10 % di CFU resistenti alla tilosina Respirazione indotta con substrato Tasso di crescita batterica Isolamento batteri antibioticodegradatori Degradabilità degli antibiotici (DT50) Notiziario dei Metodi Analitici Effetto a Condizioni Tempo (g) Diminuzione Suolo con o senza letame Aumento suino (ricco in 8 geni aventi settimane resistenza alle tetracicline) Aumento di CFU dopo trattamento con letame suino ma poi diminuito ai valori di controllo Diminuita ai gg 15 e 22, ma ritorno ai valori di controllo dopo 33 gg Alterata Aumento da 30% Aumento Aumento iniziale, poi diminuita dopo 25 gg, e ritorno ai valori di controllo dopo 95 gg Diminuita, con IC50 di 960 mg/kg Isolamento batterio degradante la sulfametazina (Microbacterium sp.) Aumentata per sulfametazina e per tilosina 21 Suolo trattato con letame suino contenente tetracicline Suolo sabbioso Suolo trattato con substrati Suolo con o senza alfalfa Suolo trattato a lungo termine Suolo trattato a lungo termine 8 mesi 2 mesi 60 95 2 10 anni 10 anni n.1 (2012) Metodo Rif. PLFA, qPCR Conta CFU Morfologia colonie, DGGE, utilizzo unica fonte di C Morfologia delle colonie, DGGE, utilizzo unica fonte di C PICT Isolamento batteri Hund-Rinke et al., 2004 Sengeløv et al., 2003 Westergaard et al., 2001 Müller et al., 2002 Demoling & Bååth, 2008 Topp et al., 2012 a Comparato con trattamento senza antibiotico, se non indicato diversamente PLFA = Analisi degli acidi grassi derivati dai fosfolipidi; qPCR = Real Time Polymerase Chain Reaction; CFU = Unità Formanti Colonia; DGGE = Elettroforesi su Gel in Gradiente Denaturante.
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