[X ] = [X] exp -∆G R Curs 8-9 Cataliza chimica Studiile asupra ...

Regula lui Lipinski poate fi verificata pe diversi compusi. In figura anterioara sunt
calculati acesti parametri pentru aspirina, artemisinina (medicament care actioneaza
asupra unelor tulpini ale malariei), Ru-486 (compus care inhiba receptorii celulari ai
progesteronului si este folosit la intreruperea voluntara a sarcinii) si a amlodipinei
(substanta care blocheaza canalele de Ca 2+ ; folosit drept antihipertensiv-relaxeaza
muschii intinsi din peretele arterial, descrescand rezistenta periferica reducand astfel
presiunea sangvina).
5.Cataliza ionilor metalici
a. Cataliza electrofila.
In metalo-enzime ionii metalici joaca rol
de catalizator electrofilic, stabilizand sarcina
negativa care se formeaza. De exemplu, in cazul
carboxipeptidazei oxigenul carbonilic din
gruparea amidica a substratului este coordinat
cu ionul de zinc al enzimei. Coordinarea
polarizeaza legatura amidica la atacul nucleofil
si stabilizeaza intermediarul tetraedric. Formarea acestui tip de complex determina o
crestere a vitezei de reactie cu peste patru ordine de magnitudine.
b. Nucleofili la pH neutru.
Studii cinetice din chimia anorganica au dovedit faptul ca moleculele de apa care
se leaga de ionii metalici sunt potentiali agenti nucleofili. De exemplu, anhidraza
carbonica, o enzima care catalizeaza hidratarea CO2, are in interiorul situsului catalitic un
ion de zinc care este coordinat de trei cicluri imidazolice (provenite de la trei resturi de
histidina). Cel de-al patrulea ligand este o molecula de apa (pKa =7). Specia reactiva este
considerata a fi gruparea hidroxilica (provenita
din ionizarea apei) legata de ionul de zinc.
Mecanismul de actiune al anhidrazei carbonice