利用实用生物信息学分析兔瘟基因组序列 - abc

二 、 VP60 的 结 构 预 测提 取 uniprot 中 的 审 核 过 的 RHDV 的 序 列 的 VP60 区 段 进 行 比 对 ,分 析 其 序 列 差 异 性 , 构 建 进 化 树 。序 列 :P27410: (strain Rabbit/Germany/FRG/1989)(Ra/LV/RHDV/GH/1989/GE) (RHDV-FRG)Q86119 :(strain AST89) (Ra/LV/RHDV/AST89/1989/SP)(RHDV-AST89)P27411 :(strain V-351) (Ra/LV/RHDV/V351/1991/CK)(RHDV-V351)Q89273 :(strain BS89) (Ra/LV/RHDV/BS89/1989/IT)(RHDV-BS89)Q86117 :(strain BS89) (Ra/LV/RHDV/BS89/1989/IT)(RHDV-BS89)其 中 Capsid protein VP60 为 577AA, 位 于 1768 – 2344 位