hemoglobinopatilerin mikroarray yöntemiyle belirlenmesi

More documents

Recommendations

Info

Şekil 3. α-Benzer globin genler. 2.1.3.2. β-Benzer globin genler 11.kromozomun kısa kolu üzerinde p14 bölgesinde bulunur. Genomda yaklaşık 50 kb’ lık yer tutar. 5’ uçtan başlayarak 3’ ucuna doğru ε , Gγ , Aγ , ψβ , δ ve β şeklinde sıralanmıştır 29 (Şekil 4). Şekil 4. β-Benzer globin genler. β lokusu üzerinde bulunan Gγ ile Aγ genleride yapısal olarak benzer protein ürünü vermektedir. Gama globin zincirlerinin bu iki geni 136.pozisyondaki aminoasit açısından farklılık gösterir. Gγ-globin zincirinde 136.aminoasit Glisin, Aγ globin zincirinde ise aynı pozisyonda Alanin bulunur. Aγ globin zincirinin ayrıca iki varyantı vardır. Bu 5
varyantlardan 75.aminoasitte Treonin içeren AγT, İzolösin içeren AγI olarak adlandırılır. AγT varyantı özellikle bazı ırksal gruplarda sık gözlenir. Fetal yaşamda total gama zincirlerinin %75’ini Gγ, %25’ini ise Aγ oluşturur. Doğum sonrası bu oran değişir ve erişkinde Aγ oranı %60’a yükselirken, Gγ oranı ise %40 civarına düşer. Epsilon, gama, delta ve beta zincirleri 146,alfa zincirleri ise 141 aminoasitten oluşurlar. Bu globinleri kodlayan genler ise 3 ekson ve 2 introndan meydana gelmektedir 29,30 . Globin zincirini şifreleyen dizilerin olduğu gen bölgelerine ekson, proteine dönüşmeyen dizileri içeren bölgelere ise intron denilmektedir. Translasyona uğramamasına rağmen 5’ ve 3’ bölgelerindeki diziler oldukça önemli olup gen ekspresyonunda rol oynarlar 29,30 . β-globin geni, β-globin zincirindeki 146 aminoasidi kodlamak için gerekli bilgiyi, 3 ekson, 2 intronda içerirken 5’ ve 3’ düzenleyici bölgeleride kapsayan yaklaşık 1,8 kb uzunluğunda gen bölgesine sahiptir 29,30 . β-benzer genlerinde ekson 1 ilk 30 aminoasiti, ekson 2 ise 74 (31–104) ve ekson 3 de 42 aminoasidi (105–146) kodlamaktadır, α genide ekson 1 de ilk 31 aminoasiti, ekson 2 (32–99) 67 aminoasit ve ekson 3 ise (100–141) 41 aminoasidi kodlamaktadır 29,30 . β-globin geninde oluşan mutasyonlar β-talasemiye, orak hücreli anemiye ya da diğer anormal hemoglobinlere neden olmaktadır 29,30 . 2.1.4. Normal Hemoglobinler Normal hemoglobinde 4 hem halkası 2 farklı globin zincirinden oluşur. Erişkinde normalde üç tip hemoglobin bulunur. Bu hemoglobinlerde hem halkası aynı olup, globin yapısı farklıdır 31 . Hb A: Normal bir erişkinde hemoglobin molekülünün yaklaşık %97’si Hb A’ dır. Hb A, iki α ve iki β globin zincirinden oluşur. α2β2 şeklinde gösterilir. α zincirleri 141 β zincirleri ise 146 aminoasitten oluşur. Erişkinlerde Hb A dışında iki minör hemoglobin grubu daha bulunur 31 . Hb A2: 2 α ve 2 δ globin zincirinden oluşur ve α2δ2 şeklinde gösterilir. Normal erişkinde %2–3 oranında bulunur. Hb A2 oranı β talasemi taşıyıcılarında yükselir. Unstable hemoglobinopatilerde ve megaloblastik anemilerdede bazen yükselir. Buna karşın demir eksikliği anemisinde ve sideroblastik anemilerde azalır 31 . 6
Page 1 and 2: T.C. ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ SA
Page 3 and 4: TEŞEKKÜR Yüksek lisans eğitimim
Page 5 and 6: 2.2.1.2. Türkiye’de Görülen An
Page 7 and 8: 5. TARTIŞMA 72 6. SONUÇLAR 79 7.
Page 9 and 10: TABLOLAR DİZİNİ Tablo 1. Embriyo
Page 11 and 12: SİMGELER ve KISALTMALAR α Alfa β
Page 13 and 14: ABSTRACT The Determination of Hemog
Page 15 and 16: 20 tanesi Çukurova bölgesinde gö
Page 17: 2.1.2.Hemin Yapısı Hem grubu, 4 p
Page 21 and 22: 2.1.5. Hemoglobin Dönüşümleri H
Page 23 and 24: Hb S molekülü, Hb A’ nın β gl
Page 25 and 26: 2.2.1.1.2. Hb D Los Angeles (β 121
Page 27 and 28: 2.2.1.1.7. Hb D-İran (β 22 (B4) G
Page 29 and 30: 17 E-Saskatoon 22 Glu→ Lys GAA
Page 31 and 32: Tablo 5. β talasemi/anormal hemogl
Page 33 and 34: 2.2.2.1.1. β Talasemilerde Tanıml
Page 35 and 36: olmak üzere değişik bölgelerde
Page 37 and 38: 38 Poly A (TAA→TGA) 39 -290 bp de
Page 39 and 40: 2.3. Mikroarray Teknolojisi DNA, RN
Page 41 and 42: veya oligonükleotide dizilimler (D
Page 43 and 44: uzaklaştırmak için yıkama işle
Page 45 and 46: 3.1. Gereçler 3.1.1.Cihazlar 3. GE
Page 47 and 48: 3.2. Örnek Toplama Çukurova Üniv
Page 49 and 50: 3.Geliştirici B: 15 g Glisin, 0,1
Page 51 and 52: 3.3.1.5. Yüksek Basınçlı Sıvı
Page 53 and 54: 3.3.2.1.1. PCR Ürünleri Tanımlan
Page 55 and 56: 3.3.2.2. Mikroarray’in Çalışma
Page 57 and 58: 3.3.2.2.2.2. Yöntem Bir örnek iç
Page 59 and 60: 3.3.2.2.2.3.2. Yöntem 0,5XTBE tamp
Page 61 and 62: 5. Çipin üzerindeki yüksek tuz t
Page 63 and 64: 4. BULGULAR Bu tez çalışmasında
Page 65 and 66: HPLC yöntemiyle Hb D Los Angeles t
Page 67 and 68: genotipi. Mikroarray yöntemiyle Hb
Page 69 and 70:
Şekil 14. HbO Arab olgusunun HPLC
Page 71 and 72:
Şekil 15. Hb E Saskatoon mutasyonu
Page 73 and 74:
Şekil 16. Hb G Coushatto olgusunun
Page 75 and 76:
Mikroarray yöntemiyle Hb D İran t
Page 77 and 78:
4.2. Beta Talasemi Olguları 4.2.1.
Page 79 and 80:
Şekil 19. IVS I-110 mutasyonunun m
Page 81 and 82:
Şekil 21. IVS I-6 mutasyonunun mik
Page 83 and 84:
Şekil 23. Cd8 mutasyonunun mikroar
Page 85 and 86:
5. TARTIŞMA Hemoglobinopati ülkem
Page 87 and 88:
tespit edilememiştir. Mikroarray y
Page 89 and 90:
Aksoy ve arkadaşları Çukurova’
Page 91 and 92:
Günümüzde sıklıkla kullanılan
Page 93 and 94:
7. KAYNAKLAR 1. http://globin.csu.e
Page 95 and 96:
29. Weatherall D J,Clegg J B,Higgs
Page 97 and 98:
53. Kılınç Y: Hemoglobinopathies
Page 99 and 100:
81. Aksoy M:Abnormal hemoglobins an
Page 101:
ÖZGEÇMİŞ Adı Soyadı :Gönül
show all

hemoglobinopatilerin mikroarray yöntemiyle belirlenmesi

Create successful ePaper yourself

Delete template?

Save as template?