Indlæg - CBS

FORSLAG TIL ONTOLOGI OG NYE DEFINITIONER TIL BE-
GREBER RELATERET TIL MOLECULAR STRUCTURE
I figur 4 vises et første udkast til en delontologi for molecular structure. Diagrammet
er fremstillet i begrebsmodelleringsmodulet i-Model, som er en del af terminologi-
og videnshåndteringsværktøjet i-Term, udviklet af DANTERMcentret. I diagrammerne
repræsenteres begreberne af bokse indeholdende systematiske notationer og de
foretrukne termer. For relationerne er der anvendt følgende signaturer:
FIGUR 4. Første udkast til ontologi for molecular structure
Ved en nærmere analyse af begrebernes karakteristiske træk, kunne dette første udkast
ændres til forslaget i figur 5. De fire niveauer for struktur, primary, secondary,
tertiary og quaternary structure bliver typisk brugt sammen til at beskrive en struktur.
Primary structure har den egenskab, at den definerer en sekvens af byggeklodser,
hvilket for proteinstruktur er rækkefølgen af aminosyrer. Dette gør, at dette begreb
adskiller sig fra de tre andre begreber ved at repræsentere en del af konstitutionen
(constitution) af en molekylær struktur snarere end en del af konformationen (conformation).
NORDTERM 2009, København 9.-12. juni 2009 43