Bioinformatik für Biochemiker - Applied Bioinformatics Group ...
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Sequenzlogos<br />
• Profile lassen sich auf einfache Weise mit Hilfe sogenannter<br />
Sequenzlogos visualisieren<br />
• Dabei zeichnet man an jeder Position der Sequenz die<br />
möglichen Buchstaben, wobei die Buchstabenhöhe<br />
proportional zum Informationsgehalt ist<br />
• Dadurch lassen sich die motivrelevanten Teile des Profils direkt<br />
ablesen<br />
• Beispiel:<br />
TATA-Box-<br />
Sequenzen aus<br />
Hefe<br />
Protein-Strukturvorhersage<br />
Problemdefinition:<br />
Gegeben Sequenz, finde Struktur<br />
...LGFCYWS...<br />
Proteinstruktur – Überblick<br />
Primärstruktur<br />
Sekundärstruktur<br />
Tertiärstruktur<br />
Quartärstruktur<br />
http://www.lecb.ncifcrf.gov/~toms/sequencelogo.html<br />
Sequenz: ...LGFCYWS...<br />
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